Proefschrift Maastricht. / Met lit. opg. en samenvatting in het Nederlands.

Proefschrift Maastricht. / Met lit. opg. - Met samenvatting in het Nederlands.

Proefschrift Universiteit van Amsterdam. / Met bibliogr., lit. opg. - Met samenvatting in het Nederlands.

Proefschrift Rijksuniversiteit Limburg. / Ten dele eerder verschenen art. Gezamenlijk proefschrift (Med.) Maastricht van F.I. van Moppes en C.R. van den Hoogenband. Met samenvatting in het Nederlands.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-06-14T18:38:30Z No. of bitstreams: 1 278136.pdf: 7919442 bytes, checksum: e1924f3d495c1731f1b612c6737ebc9b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-14T18:38:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 278136.pdf: 7919442 bytes, checksum: e1924f3d495c1731f1b612c6737ebc9b (MD5) Previous issue date: 1997-08-22 / CAPES / Os Erythrinidae são um grupo de peixes Neotropicais com ampla distribuição na maioria das bacias hidrográficas da América do Sul e Central. Por suas características peculiares, os representantes dessa família foram muitas vezes utilizados como modelo em estudos envolvendo diferentes áreas da ictiologia. Entretanto, este grupo só foi propriamente reconhecido como uma unidade natural (grupo monofilético sensu Hennig, 1966) no início desta década. Aproximadamente 50 caracteres ( ou estados de caracteres) previamente propostos na bibliografia como "diagnósticos" (em um senso fenético) ou sinapomórficos dos Erythrinidae foram revistos no presente trabalho. Destes, apenas nove foram considerados válidos na delimitação dos Erythrinidae como um grupo natural, em um senso filogenético. Mais oito estados de caracteres derivados exclusivos dos Erythrinidae foram encontrados, somando 17 sinapomorfias para o grupo. Quatro estados de caracteres previamente propostos como ambíguos foram confirmados, e mais dois foram propostos. Ao final do trabalho apresenta-se uma diagnose revista da família Erythrinidae. / The Erythrinidae are a group of Neotropical fishes with a wide distribuition in most of South and Central American river drainages. Due to their own peculiar features, its members were several times used as models in studies regarding different areas of the ichthyology. However, this group was only properly recognized as a natural unit (monophyletic group sensu Hennig, 1966) in the early nineties. Approximately 50 characters (or characters states) previously hipothetized as "diagnostic" (in a phenetic sense) or synapomorphic for the Erythrinidae were revised during this work. Among these, only nine were considered valid in delimiting the Erythrinidae as a natural group, in a phylogenetic sense. Eight further derivate exclusives characters sates of the Erythrinidae were surveyed, making a total of 17 synapomorphy for this group. Four characters sates previously hypothetized as ambiguous were corroborated, and two more were proposed. This work concludes with a revised diagnosis of the Erythrinidae family.

Submitted by Thaís Chagas Barros (tthaisbarross@hotmail.com) on 2018-07-06T12:56:18Z No. of bitstreams: 1 Tese_Thais Barros.pdf: 1852111 bytes, checksum: 8184b869026578d5eba56d9984750935 (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-07-10T14:19:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 barros_tb_dr_jabo.pdf: 1852111 bytes, checksum: 8184b869026578d5eba56d9984750935 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-10T14:19:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 barros_tb_dr_jabo.pdf: 1852111 bytes, checksum: 8184b869026578d5eba56d9984750935 (MD5) Previous issue date: 2018-05-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O desenvolvimento de mudas de Eucalyptus spp. aferido por índices de qualidade ou de acúmulo de matéria seca depende do estado nutricional adequado. No entanto, a qualidade dos métodos para interpretação do estado nutricional de mudas clonais de eucalipto ainda não é conhecida. Objetivou-se avaliar a qualidade dos diagnósticos obtidos pelos métodos do nível crítico (NC), sistema integrado de diagnose e recomendação (DRIS) e composição da diagnose nutricional (CND) na avaliação do estado nutricional de mudas de Eucalyptus spp., frente a dois diferentes indicadores de produção. O banco de dados foi obtido de viveiros comerciais e de experimentos de calibração, tendo sete nutrientes (N, P, K, Mg, Ca, B e Fe) e quatro concentrações por nutriente, dispostos em blocos casualizados, com quatro repetições. O clone de Eucalyptus spp. utilizado nos experimentos foi o AEC 0144. As mudas da área experimental e dos viveiros comerciais totalizaram 222 mudas, nas quais, foram determinados os teores foliares dos nutrientes, a massa seca de planta inteira (MS) e calculado o Índice de Qualidade de Dickson (IQD). Nas parcelas experimentais realizou-se a acurácia dos diagnósticos, a partir da comparação do diagnóstico com a resposta da planta em função da adição do nutriente correspondente. Cinco medidas de acurácia foram usadas para testar a eficiência dos métodos diagnósticos: acurácia total, acurácia para deficiência e suficiência, razão de deficiência e razão de eficiência, e o incremento líquido na MS e no IQD. O desempenho dos métodos diagnósticos variou entre os métodos NC, DRIS e CND, como também entre os nutrientes estudados. Dado que o sistema de produção de mudas é, em grande parte, um sistema mais controlado e onde as variações ambientais são mínimas, e considerando que os diferentes métodos diagnósticos apresentaram desempenho distinto em relação a avaliação do verdadeiro estado nutricional das mudas de eucalipto, o método do NC deve ser o mais indicado para essa situação, seja pelo seu melhor desempenho em avaliar o estado nutricional para a maioria dos nutrientes, seja pela facilidade de sua implementação. / The efficiency of methods in adequately interpreting the nutritional status of Eucalyptus spp. clonal seedlings remains unknown. The aim was to evaluate the quality of diagnoses obtained using the critical level (CL), diagnosis and recommendation integrated system (DRIS) and compositional nutrient diagnosis (CND) methods to assess the nutritional status of Eucalyptus spp. seedlings, based on two different yield indicators. The data were obtained from commercial nursery and calibration experiments, using seven nutrients as treatments (N, P, K, Mg, Ca, B and Fe) and four concentrations per nutrient, arranged in randomized blocks, with four repetitions. The Eucalyptus spp. clone used in the experiments was AEC 0144. A total of 222 seedlings were obtained from the experimental area and commercial nurseries and the following were determined: leaf nutrient content, whole plant dry matter (DM) content and the Dickson quality index (DQI). Diagnostic accuracy in the experimental plots was ascertained by comparing the diagnosis with plant response as a function of adding the corresponding nutrient. Five measures of accuracy were used to test the efficiency of the diagnostic methods: total accuracy, accuracy for deficiency and sufficiency, deficiency ratio, efficiency ratio, and the net increase in in DM and DQI. The performance of diagnostic methods varied between CL, DRIS and CND, and among the nutrients studied. Given that the seedling production system is largely more controlled, where environmental variations are minimal, and considering that the different diagnostic methods exhibited distinct performance in terms of assessing the true nutritional status of eucalyptus seedlings, the CL method is the most indicated for this situation, due to its better performance in evaluating the nutritional status of most nutrients and easy implementation.

Objetivos: Principalmente nas regiÃes com maior carga de TB no mundo, ainda existe grande demora no recebimento dos exames diagnÃsticos de TB pelos pacientes. Pesquisadores da Rede Brasileira de Tuberculose desenvolveram e avaliaram o desempenho de um teste diagnÃstico para TB pulmonar: escore clÃnico Neural TB. O objetivo desse trabalho foi avaliar a efetividade do escore clÃnico Neural TB no diagnÃstico rÃpido de tuberculose pulmonar em unidade de referÃncia. MÃtodos: Foi realizado um ensaio clÃnico pragmÃtico, que recebeu intervenÃÃo diagnÃstica na segunda metade do projeto. Foram recrutados 351 pacientes com 18 anos de idade ou mais, com suspeita de TB pulmonar e aplicado o escore clÃnico Neural TB. Na primeira fase do estudo, os pacientes seguiram a rotina do Hospital. Na segunda fase, os pacientes tinham a coleta do escarro para baciloscopia antecipada de acordo com a classificaÃÃo pelo escore clÃnico. Para comparaÃÃo entre duas subpopulaÃÃes independentes foram utilizados o teste T-Student e o teste de Mann Whitney. Os resultados foram considerados significantes para um valor de p < 0,05. Foi calculada RazÃo de prevalÃncia e intervalo de confianÃa de 95%. A concordÃncia entre Escore e diagnÃstico de TB pulmonar foi realizada pelo Ãndice de Kappa. Resultados: Quando comparado ao diagnÃstico realizado atravÃs da baciloscopia do escarro, cultura do escarro ou diagnÃstico clÃnico-radiolÃgico em conjunto, o escore clÃnico Neural TB apresentou sensibilidade de 75,9%, especificidade de 48,8% e acurÃcia de 55%. O uso do escore clÃnico Neural TB foi capaz de diminuir o tempo entre a triagem e a leitura da lÃmina por baciloscopia em 1 dia (de 3,2 para 2,6 dias; p < 0,001). Apesar de diminuir o tempo para inÃcio do tratamento em mÃdia 4 dias com relaÃÃo ao grupo baseline (de 8,2 para 4 dias), essa diferenÃa nÃo foi estatisticamente significante (p = 0,166). ConclusÃes: O escore clÃnico pode ser uma ferramenta Ãtil na detecÃÃo de casos de TB pulmonar. Por sua simplicidade, nÃo necessita de equipamentos caros e complexos para sua execuÃÃo. Ao ser utilizado por um profissional treinado, o questionÃrio poderà gerar informaÃÃes sobre encaminhamentos ou pedidos de exames na abordagem do paciente sintomÃtico respiratÃrio, ou ainda ajudar na decisÃo sobre inÃcio do tratamento. / Objectives: Mainly in regions with the greatest TB burden in the world, there is still a delay for patients to receive the results of the diagnostic exams. Researchers from Rede Brasileira de Tuberculose developed and evaluated the performance of a diagnostic test for pulmonary TB: Neural TB clinical score. The objective of the present work is to evaluate the effectiveness of the Neural TB clinical score in the rapid diagnose of pulmonary tuberculosis in a reference unit. Methods: A pragmatic clinical essay with diagnostic intervention in the second half of the project was conducted. We recruited 351 patients aged 18 years or older, suspected of having pulmonary TB, and we applied the Neural TB clinical score to them. In the first phase of the essay, patients followed the routine of the Hospital. In the second phase, patients had collection of sputum samples for baciloscopy anticipated according to their classification by the score. T-Student test and Mann Whitney test were used to compare two independent subpopulations. Results were considered significant if p value < 0,05. Prevalence ratio and 95% confidence interval were calculated. Kappa index was used to measure conformity between the clinical score and pulmorary TB diagnostic. Results: Neural TB clinical score showed sensitivity of 75,9%, specificity of 48,8% and accuracy of 55% when compared to the diagnostic realised through sputum baciloscopy, sputum culture or clinical-radiological diagnostic altogether. The use of Neural TB clinical score was able to reduce time between patient screening and detection of organisms in a sputum sample slide in 1 day (from 3.2 to 2.6 days; p < 0.001). Although time until beginning the treatment was reduced 4 days in average when compared to the baseline group (from 8.2 to 4 days), this difference was not statistically significant (p = 0.166). Conclusion: The clinical score may be a useful tool for the detection of pulmonary tuberculosis cases. Because it is simple, it does not require expensive or complex equipment for its execution. As it is used by a trained professional, the questionnaire may produce information about referrals or test requests for the respiratory symptomatic patient, or even help in the decision of starting treatment.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T13:27:09Z No. of bitstreams: 1 Aricleia de Moraes Catarino.pdf: 1031221 bytes, checksum: 5bd0ffb507daa4b9b04ebd494fd2269c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T13:27:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Aricleia de Moraes Catarino.pdf: 1031221 bytes, checksum: 5bd0ffb507daa4b9b04ebd494fd2269c (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / The grapevine (Vitis spp.) belongs to the family of Vitaceae, being the botanical species V. vinifera L. and V. labrusca L. the most and widely cultivated, due to their products consumed as fresh fruits, jam, juices and wines. Despite the high economical importance, several factors may severely affect this crop, including the diseases caused by viruses. This study aimed to verify the incidence of virus present in commercial vineyards of two producing areas in Northeastern Brazil and evaluate the efficiency of some molecular methods for detecting and identifying viral species associated with grapevine. Materials showing or not symptoms were collected from grapevine genotypes in vineyards of Pernambuco, Paraiba, Bahia and Rio Grande do Sul, Brazil, and Locorotondo, Province of Bari, of the Puglia Region, Italy. The first part of the work was conducted at the Virology Laboratory of the Embrapa Uva e Vinho, RS, Brazil. For the identification of viral agents in the samples collected in Brazil, the extraction of total RNA was performed, cDNAs were obtained and tested by real time RT-PCR, using primers and probes specific for the following viruses: Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine leafroll-associated virus 2, 3 e 4 (GLRaV-2, -3 e -4), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine rupestris vein feathering virus (GRVFV) and Grapevine fanleaf virus (GFLV). DNA fragments, products of the RT-qPCR, corresponding to the CP gene of each virus were eluted, linked to pGEM-T Easy vector (Promega) and used to transform bacteria. The plasmid DNA was extracted from transformed bacterial colonies, confirming the presence of the cloned fragments, which were sequenced. The grapevine material collected in Locorotondo was processed at the Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante (CNR-IPSP) and at the Dipartimento di Scienze del Suolo, della Pianta e degli Alimenti, Università degli Studi “Aldo Moro”. In order to detect in multiplex test the most relevant viruses involved in the aetiology of fanleaf degeneration and the complexes of leafroll and rugose wood of grapevine, amplification techniques based on Allele Specific Primer Extension (ASPE) were tested by using the obtained cDNAs. The results showed that the techniques aggregate some advantages, such as reduction in time and relative simplicity of implementation, completely eliminating the use of toxic reagents, such as the ethidium bromide. The use of multiplex facilitates amplification of multiple targets in a single reaction, reducing the time and cost of the analyzes. / A videira (Vitis spp.) pertence à família Vitaceae, sendo as espécies botânicas V. vinifera L. e V. labrusca L. cultivadas em maior escala devido seus produtos, consumidos na forma de frutos in natura, geleias, sucos e vinhos. Apesar da grande importância econômica, vários fatores podem comprometer a produção desta cultura, incluindo as doenças causadas por vírus. O presente trabalho teve como objetivos verificar a incidência de vírus presentes em vinhedos comerciais de duas áreas produtoras do Nordeste do Brasil e avaliar a eficiência de alguns métodos moleculares para detecção e identificação de espécies virais associadas à videira. Amostras, apresentando ou não sintomas, foram coletados de genótipos de videira em propriedades situadas em Pernambuco, Paraíba, Bahia e Rio Grande do Sul, Brasil, e em Locorotondo, Província de Bari, Região da Puglia, Itália. A primeira parte do trabalho foi conduzida no Laboratório de Virologia da Embrapa Uva e Vinho, RS, Brasil. Visando a identificação dos agentes virais, nas amostras coletadas no Brasil, foram realizadas as extrações do RNA total, obtidos os cDNAs e testados por PCR em Tempo Real, empregando-se primers e sondas, específicos para os seguintes vírus: Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine leafroll-associated virus 2, 3 e 4 (GLRaV-2, -3 e -4), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine rupestris vein feathering virus (GRVFV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). Fragmentos de DNA, produtos da RTq-PCR, correspondentes ao gene da CP de cada vírus foram eluídos, ligados ao vetor pGEM-T Easy (Promega) e utilizados na transformação de bactéria. Foi extraído o DNA plasmidial das colônias bacterianas transformadas, confirmando-se a presença dos fragmentos clonados, os quais foram sequenciados. A segunda parte, realizada com o material coletado em Locorotondo, foi processada no Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante (CNR-IPSP) e no Dipartimento di Scienze del Suolo, della Pianta e degli Alimenti, Università degli Studi “Aldo Moro”. Foram utilizadas, a partir de cDNAs obtidos, técnicas de amplificação baseadas na Allele Specific Primer Extension (ASPE), visando detectar em teste multiplex os vírus mais relevantes envolvidos na etiologia da degenerescência e nos complexos do enrolamento das folhas e do lenho rugoso da videira. Os resultados obtidos mostraram que as técnicas agregam algumas vantagens, como a redução no tempo e relativa simplicidade de execução, eliminando completamente o uso de reagentes tóxicos, a exemplo do brometo de etídeo. O uso de multiplex facilita a amplificação de múltiplos alvos em uma única reação, reduzindo o tempo e o custo das análises.

Der Einsatz modularer Anlagen wird in der Prozessindustrie immer beliebter. Da Modulhersteller ihre Applikationen weitestgehend kapseln, um ihr Know-How zu schützen, müssen Strukturen und Applikationen entwickelt werden, die das Monitoring und die Diagnose auch im Rahmen der vorausschauenden Instandhaltung dieser Module ermöglichen. Die Implementierung solcher Funktionen in das übergeordnete Leitsystem der Gesamtanlage ist bei modularen Anlagen bislang ähnlich umständlich wie die Einbindung von Fremdkomponenten in ein Leitsystem. Um ein vollständiges modulares Anlagenkonzept erfolgreich zu etablieren, ist eine einfache Implementierung dieser Funktionalitäten somit unumgänglich. Im Rahmen dieses Beitrags wird daher untersucht, wie Strukturen und Applikationen zum Monitoring und Diagnose einfach in übergeordnete Systeme implementiert werden können. Hier wird auch betrachtet, welche dieser Informationen für Anlagenfahrer relevant, welche Funktionalitäten auf externe Systeme (z. B. eine Cloud) ausgelagert werden sollten und wie diese optimal dargestellt werden. Weiterhin wird ein Konzept zur Modularisierung von Plant Asset Management Funktionen vorgestellt, anhand dessen eine Strukturierung des NAMUR Open Architecture (NOA)-Kanals vorgenommen wird.

Diagnoser är ett sätt för samhället att beskriva och gränssätta vad som är normalt och socialt accepterat. Diagnos är även en social konstruktion som oftast utifrån ett samhällsperspektiv har en negativ inverkan. Människor sätter etiketter på de med diagnosen och oftast är det i negativ bemärkelse och man accepterar inte det avvikande beteendet som diagnosen förklarar. Syftet med denna studie är att ta reda på hur vuxna med diagnos upplever för- och nackdelar med sin diagnos. Med den kvalitativa metoden har semistrukturerade intervjuer genomförts. Tre personer har deltagit i studien och delat med sig om sina upplevelser kring deras neuropsykiatriska diagnoser. Alla tre har en ADHD-problematik, en har även diagnosen Asperger. Studiens resultat visar hur dessa upplever sina diagnoser och visar att de anser att det är bättre att få diagnosen än att leva i ovisshet av vad det är som gör att de beter sig på ett visst sätt. En av intervjupersonerna sa "Jag vet många som skäms över att de har det här och jag vet många som utnyttjar sin situation dessutom och det tycker jag inte om. För en diagnos är en diagnos. Det är en funktionsnedsättning men det handlar om vad du själv gör av den". / Diagnose is a way for society to describe and limit what is normal and socially acceptable. Diagnosis is also a social construction that often has a negative impact. People put labels on those with a diagnose and it is usually in a negative way and does not accept the deviant behavior that explains the diagnose. The purpose of this essay is to find out how adults with a diagnose experience benefits and cons of their diagnose. With the qualitative method has a semi-structured interviews been done. Three people have participated in the study and shared their experience about their neuropsychiatric diagnose. All three have a ADHD problem, one person have also been diagnose with Asperger. The result demonstrate how they feel about their diagnose and show that the belive it is better to be diagnose, than to live in uncertainty about what it is that make them behave in a certain way. One of the interviewed said "I know many who are ashamed that they have their diagnose and I also know who take advantage of their situation too, and that I don’t like. For a diagnose is a diagnose. It is a disability bit it’s about what you make of it"’