Made available in DSpace on 2014-06-12T15:52:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5024_1.pdf: 448901 bytes, checksum: 4d971b7e87c950e13777aa7be6ce24c9 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003 / Vários relatos da literatura revelam ser a prevalência de Entamoeba dispar maior do que Entamoeba histolytica nos indivíduos que vivem no Nordeste brasileiro, a partir de estudos utilizando Enzyme Linked Immnosorbent Assay (ELISA), imunodifusão em gel e zimodemos. Este trabalho consistiu em determinar a prevalência dessas formas de amebas mediante o uso de detecção imunocoprológica de antígeno específico para E. histolytica e Reaction Chain Polimerase (PCR) do DNA genômico extraído de trofozoitos cultivados de amostras de fezes. A presença de amebas tetranucleadas foi investigada em 1437 amostras de fezes de indivíduos vivendo em Macaparana, cidade da zona da mata norte de Pernambuco; em 346 amostras de escolares com idades de 3 a 14 anos morando em uma favela do Recife e em 109 amostras de imunodeprimidos (104 HIV positivos e 05 transplantados) atendidos no Hospital das Clínicas da UFPE (2002 e 2003). Dessas amostras, 59 (4.1%) e 45 (13%) foram positivas para aquelas coletadas das populações de Macaparana e das crianças do Recife, respectivamente, enquanto que nenhuma foi positiva para as obtidas dos imunodeprimidos. Todas as amostras foram negativas para a presença de adesina galactose específica de E. histolytica, inclusive as amostras dos pacientes imunosuprimidos. As amostras com amebas tetranucleadas cultivadas em meio de Robinson foram positivas para trofozoítos em 31 daquelas coletadas das populações de Macaparana e 21 das de Recife. A partir da amplificação por PCR de seqüências espécie-específicas de DNA genômico, extraído desses trofozoítos, foi possível identificar E. dispar em 23 e 19 amostras dos habitantes de Macaparana e das crianças do Recife, respectivamente, enquanto que nenhuma amplificação foi observada para E. histolytica. As demais amostras (08 e 02 paraMacaparana e Recife, respectivamente) foram negativas para ambas as espécies. Estes resultados corroboram aqueles previamente descritos que mostravam a prevalência de E. dispar (ameba não patogênica) nestas populações. Ademais, validam o emprego do kit imunocoprológico como alternativa a PCR na identificação de E. dispar e E. histolytica. Finalmente, o polimorfismo genético das cepas de E. dispar das amostras coletadas da população de Macaparana e de crianças do Recife foi investigado com o uso de marcadores moleculares específicos para E. dispar, Dsp1/Dsp2 e Dsp5/Dsp6. Das 42 amostras analisadas, 39 amplificaram os loci 1-2 e 5-6. O dendrograma resultante desta análise revelou uma alta variabilidade entre os isolados para esta região. Entretanto, uma comparação entre as freqüências dos produtos de amplificação para as duas localidades, através de teste de Qui-quadrado, mostrou que a incidência de uma banda obtida do locus 5-6, foi significativamente diferente entre Recife e Macaparana, evidenciando a potencialidade desta técnica para abordar questões relativas à distribuição geográfica

Amebiasis is a severe infection caused by the protozoan parasite Entamoeba histolytica (Schaudinn, 1903). This species is morphologically indistinguishable from Entamoeba dispar (Brumpt, 1925), considered to be non-pathogenic and unable to cause invasive illness. The differentiation between these two species by immunological and molecular biology techniques is important to determine the epidemiological situation, therapeutic intervention, and profilaxis of invasive amebiasis. The aim of this study was to discriminate infection caused by E. histolytica and E.dispar in schoolchildren population in the city of Maceió, Alagoas. A cross-sectional study was carried out among 1,003 students in state public schools. Stool examination by sedimentation technique was conducted in order to evaluate frequency of enteroparasites, and for screening of students infected with E. histolytica/E. dispar complex. Positive exams for Entamoeba cysts were further submitted to antigen detection assay by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and polymerase chain reaction (PCR), for specific diagnosis of the infection. Frequency of intestinal parasites among the examined population was high, being detected 54.8% (550/1,003) students harbouring at least one species of helminth or protozoan parasites. Most of the students families (57.5%), belonged to class D economic level according to the Brazilian Economic Classification Criteria. Of the total assessed 83.1% had an income ≤ 1 minimum wage and lived in households with 2-5 residents. Polymerase chain reaction (PCR) was standardized extracting DNA from the stool using Stool Kit PSP (Invitek ®). The primers selected by in silico analysis based on virtual performance for amplification of E. histolytica and E. dispar were p11plus/p12plus and p13plus/p14plus, respectively. The prevalence of amebiasis among schoolchildren diagnosed by ELISA was 3.0% (30/1,003) and by PCR 2.8% (28/1,003), but the difference was not statistically significant (p> 0.05). The overall prevalence of E. dispar in schoolchildren was 5.0% (50/1,003). Both techniques (ELISA and PCR) were appropriate for differential diagnosis of E. histolytica and E. dispar. However, ELISA has advantages such as its rapid and easy execution. The results indicates the importance of specific diagnostic techniques for amoebiasis detection in the population. / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A amebíase é uma infecção severa que tem como agente etiológico o protozoário Entamoeba histolytica (Schaudinn, 1903). Esta espécie é morfologicamente indistinguível da Entamoeba dispar (Brumpt, 1925), considerada apatogênica, incapaz de provocar a forma invasiva da doença. A diferenciação entre as duas espécies através de técnicas de diagnóstico imunológico e de biologia molecular, é fundamental para determinação da situação epidemiológica da amebíase, estabelecimento da conduta terapêutica adequada, e consequentemente prevenção da doença invasiva. O objetivo do presente estudo foi discriminar a infecção causada pela E. histolytica e E. dispar na população de escolares da cidade de Maceió, Alagoas. Para tal, realizou-se um estudo de corte transversal, com 1.003 estudantes da rede pública estadual de ensino da cidade. Foi realizado exame de fezes, pelo método de sedimentação espontânea, para avaliação da frequência das parasitoses intestinais, e para a triagem dos escolares infectados pelo complexo E. histolytica/E. dispar. Os exames positivos para cistos de Entamoeba foram posteriormente submetidos à pesquisa de antígeno pelo ensaio imunoenzimático (ELISA) e reação em cadeia da polimerase (PCR), para o diagnóstico específico da infecção. A frequência de enteroparasitos entre os examinados foi elevada, sendo identificados 54,8% (550/1.003) escolares infectados por pelo menos uma espécie de helminto ou protozoário. A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi padronizada utilizando para extração do DNA das fezes o Kit Stool PSP (Invitek®). Os iniciadores selecionados através da análise in silico pelo bom desempenho virtual para amplificação da E. histolytica e da E. dispar, foram p11plus/p12plus e p13plus/p14plus, respectivamente. A prevalência da amebíase nos escolares diagnosticada pelo ELISA foi de 3,0% (30/1.003) e na PCR 2,8% (28/1.003), não existindo diferença significativa entre as percentagens de infectados (p>0,05). A prevalência geral da E. dispar nos escolares foi de 5,0% (50/1.003). Ambas as técnicas (ELISA e PCR) se mostraram adequadas para diagnóstico diferencial da E. histolytica e E. dispar. No entanto, o ELISA apresenta a vantagem ser de rápida e simples execução. Os resultados apresentados indicam a necessidade da utilização de técnicas de diagnóstico específico para detecção de casos amebíase na população.

As doenças respiratórias são consideradas um sério problema de sanidade, causando grandes perdas econômicas devido aos altos índices de morbidade e mortalidade, sendo responsáveis por 10 a 40% das mortes em animais adultos e por 17% das mortes durante o período perinatal. O objetivo deste trabalho foi determinar a ocorrência de agentes e buscar associações entre agentes e a broncopneumonia e a associação de sinais clínicos com os agentes presentes. Foram avaliados clinicamente e os dados coletados em ficha própria 96 animais de dois rebanhos da região de Bragança Paulista e Mococa ambas no Estado de São Paulo. Sangue total e lavado traqueobrônquico instilado em haste flexível e o restante da alíquota criopreservada, foram colhidos em animais jovens e adultos, com e sem raça definida e a ocorrência dos principais agentes etiológicos virais (BVDV, VSRB e BoHV) e bacterianos (Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida e micoplasma sp.) causadores de broncopneumonia em bovinos foram pesquisadas. Dos cultivos bacterianos específicos, as aliquotas criopreservada apresentaram 12/96 amostras positivas para mollicutes enquanto os cutivos utilizando as hastes foram 11/96 amostras positivas para P. multocida. No cultivo da P. multocida também foram encontradas Bacillus sp., Staphylococcus sp., Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Pseudomonas aeruginosa e Klebsiella pneumoniae sem que houvesse a ocorrência de M. haemolytica. PCR foi utilizada para detectar a classe mollicutes (68/96) e as espécies M. bovis (2/68), M. dispar (26/68) e M. mycoides subsp. mycoides (0/68). A técnica de vírus neutralização mostrou os seguintes resultados: 31/56 animais soreagentes para BVDV, 35/57 com BoVH e 54/58 com VSRB. Para análise estatística foi utilizado o teste do qui-quadrado em blocos ao acaso. Houve associação entre a presença de broncopneumonia em animais com BVDV (P=0,080) e com P. multocida (P=0,076). Animais da raça holandesa foram associados a presença de broncopneumonia (p= 0,095). Jovens com menos de 12 meses foram associados a presença de mollicutes (P=0,0177). A presença de som submaciço a percussão do gradil toráxico foi associado a ausência de mollicutes (P=0,025). A ausência de M. dispar foi associado a presença de sibilo (P=0,076) e de estertor úmido (P=0,046) na ausculta pulmonar. Houve uma chance maior de 5,5 vezes de apresentar tosse na presença de P. multocida enquanto na sua ausência hà uma maior chance dos animais apresentarem secreção mucosa (7,3) e mucopurulento (5,8), som submaciço (9,6), crepitação fina (13) e estertor úmido (5). Houve associação entre a ausência de M. bovis e a presença de som claro a percussão do gradil toráxico dos bovinos examinados. / Respiratory diseases are considered a serious problem of sanity, causing huge economic losses due to high rates of morbidity and mortality, accounting for 10-40% of deaths in adults and 17% of deaths during the perinatal period. The objective of this study was to determine the occurrence of agents and seek associations between agents and bronchopneumonia and the association of clinical signs with these agents. They were evaluated clinically and data collected in own record 96 animals of two herds of Bragança Paulista region and Mococa both in São Paulo. Whole blood and washed tracheobronchial were harvested in young and adult animals, Holstein and undefined breed and the occurrence of major viral etiologic agents (BVDV, BRSV and BoHV) and bacterial (Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida and Mycoplasma sp.) causing bronchopneumonia in cattle were surveyed. The specific bacterial cultures showed positive samples Mollicutes 12/96 and 11/96 samples positive for P. multocida. In the cultivation of P. multocida were also found Bacillus sp., Staphylococcus sp., Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and there was no occurrence of M. haemolytica. PCR was used to detect the class Mollicutes (68/96) and the species M. bovis (2/68), M. dispar (26/68) and M. mycoides subsp. mycoides (0/68). The virus neutralization technique showed the following results: 31/56 animals BVDV positive, 35/57 and 54/58 with BoVH with BRSV. Statistical analysis was performed using the chi-square test in blocks. There is an association between bronchopneumonia in animals and the presence of BVDV (p = 0.080) and P. multocida (P = 0.076). Holstein animals were associated with the presence of bronchopneumonia (p = 0.095). Calves under 12 months were associated with the presence of Mollicutes (P = 0.0177). The sound submassive present during percussion of the thoracic cage was associated with the absence of Mollicutes (P = 0.025). The absence of M. dispar was associated with presence of wheezing (P = 0.076) and wet rattle (P = 0.046) in lung auscultation. There was a greater chance of 5.5 times to present cough in the presence of P. multocida as in its absence there is a greater chance of the animals show mucous secretion (7.3) and mucopurulent (5.8), submassive sound (9.6 ), thin crackling (13) and wet rattle (5). There was an association between the absence of M. bovis and the presence of clear sound of chest cage percussion of the examined cattle.

As doenças respiratórias são consideradas um sério problema de sanidade, causando grandes perdas econômicas devido aos altos índices de morbidade e mortalidade, sendo responsáveis por 10 a 40% das mortes em animais adultos e por 17% das mortes durante o período perinatal. O objetivo deste trabalho foi determinar a ocorrência de agentes e buscar associações entre agentes e a broncopneumonia e a associação de sinais clínicos com os agentes presentes. Foram avaliados clinicamente e os dados coletados em ficha própria 96 animais de dois rebanhos da região de Bragança Paulista e Mococa ambas no Estado de São Paulo. Sangue total e lavado traqueobrônquico instilado em haste flexível e o restante da alíquota criopreservada, foram colhidos em animais jovens e adultos, com e sem raça definida e a ocorrência dos principais agentes etiológicos virais (BVDV, VSRB e BoHV) e bacterianos (Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida e micoplasma sp.) causadores de broncopneumonia em bovinos foram pesquisadas. Dos cultivos bacterianos específicos, as aliquotas criopreservada apresentaram 12/96 amostras positivas para mollicutes enquanto os cutivos utilizando as hastes foram 11/96 amostras positivas para P. multocida. No cultivo da P. multocida também foram encontradas Bacillus sp., Staphylococcus sp., Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Pseudomonas aeruginosa e Klebsiella pneumoniae sem que houvesse a ocorrência de M. haemolytica. PCR foi utilizada para detectar a classe mollicutes (68/96) e as espécies M. bovis (2/68), M. dispar (26/68) e M. mycoides subsp. mycoides (0/68). A técnica de vírus neutralização mostrou os seguintes resultados: 31/56 animais soreagentes para BVDV, 35/57 com BoVH e 54/58 com VSRB. Para análise estatística foi utilizado o teste do qui-quadrado em blocos ao acaso. Houve associação entre a presença de broncopneumonia em animais com BVDV (P=0,080) e com P. multocida (P=0,076). Animais da raça holandesa foram associados a presença de broncopneumonia (p= 0,095). Jovens com menos de 12 meses foram associados a presença de mollicutes (P=0,0177). A presença de som submaciço a percussão do gradil toráxico foi associado a ausência de mollicutes (P=0,025). A ausência de M. dispar foi associado a presença de sibilo (P=0,076) e de estertor úmido (P=0,046) na ausculta pulmonar. Houve uma chance maior de 5,5 vezes de apresentar tosse na presença de P. multocida enquanto na sua ausência hà uma maior chance dos animais apresentarem secreção mucosa (7,3) e mucopurulento (5,8), som submaciço (9,6), crepitação fina (13) e estertor úmido (5). Houve associação entre a ausência de M. bovis e a presença de som claro a percussão do gradil toráxico dos bovinos examinados. / Respiratory diseases are considered a serious problem of sanity, causing huge economic losses due to high rates of morbidity and mortality, accounting for 10-40% of deaths in adults and 17% of deaths during the perinatal period. The objective of this study was to determine the occurrence of agents and seek associations between agents and bronchopneumonia and the association of clinical signs with these agents. They were evaluated clinically and data collected in own record 96 animals of two herds of Bragança Paulista region and Mococa both in São Paulo. Whole blood and washed tracheobronchial were harvested in young and adult animals, Holstein and undefined breed and the occurrence of major viral etiologic agents (BVDV, BRSV and BoHV) and bacterial (Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida and Mycoplasma sp.) causing bronchopneumonia in cattle were surveyed. The specific bacterial cultures showed positive samples Mollicutes 12/96 and 11/96 samples positive for P. multocida. In the cultivation of P. multocida were also found Bacillus sp., Staphylococcus sp., Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and there was no occurrence of M. haemolytica. PCR was used to detect the class Mollicutes (68/96) and the species M. bovis (2/68), M. dispar (26/68) and M. mycoides subsp. mycoides (0/68). The virus neutralization technique showed the following results: 31/56 animals BVDV positive, 35/57 and 54/58 with BoVH with BRSV. Statistical analysis was performed using the chi-square test in blocks. There is an association between bronchopneumonia in animals and the presence of BVDV (p = 0.080) and P. multocida (P = 0.076). Holstein animals were associated with the presence of bronchopneumonia (p = 0.095). Calves under 12 months were associated with the presence of Mollicutes (P = 0.0177). The sound submassive present during percussion of the thoracic cage was associated with the absence of Mollicutes (P = 0.025). The absence of M. dispar was associated with presence of wheezing (P = 0.076) and wet rattle (P = 0.046) in lung auscultation. There was a greater chance of 5.5 times to present cough in the presence of P. multocida as in its absence there is a greater chance of the animals show mucous secretion (7.3) and mucopurulent (5.8), submassive sound (9.6 ), thin crackling (13) and wet rattle (5). There was an association between the absence of M. bovis and the presence of clear sound of chest cage percussion of the examined cattle.

The study of biological invasions is not only essential to regulate their vast potential for ecological and economical harm, they offer a unique opportunity to study adaptive evolution in the context of recent range expansions into novel environments. The North American invasion of the gypsy moth, Lymantria dispar L., since its introduction in 1869 to Massachusetts, has expanded westward to Minnesota, northward to Canada, and southward to North Carolina. Fluctuating range dynamics at the southern invasive edge are heavily influenced by heat exposure over their optimal (supraoptimal) during the larval stage of development. We coupled genomic sequencing with reciprocal transplant and laboratory-rearing experiments to examine the interactions of phenotypic, genetic, and environmental variation under selective supraoptimal regimes. We demonstrate that while there is no evidence to support local adaptation in the fitness-related physiological traits we measured, there are clear genomic patterns of adaptation due to differential survival in higher temperatures. Mapping of loci identified as contributing to local adaptation in a selective environment and those associated with phenotypic variation highlighted that variation in larval development time is partly driven by pleiotropic loci also affecting survival. Overall, I highlight the necessity and inferential power gained through replicating environmental conditions using both phenotypic and genome-wide analyses.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-07T12:40:29Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoEpidemiologicoAmebiase.pdf: 672147 bytes, checksum: c79be901d2d8e5217f47c8d1f43d0318 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-07T15:11:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoEpidemiologicoAmebiase.pdf: 672147 bytes, checksum: c79be901d2d8e5217f47c8d1f43d0318 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-07T15:11:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudoEpidemiologicoAmebiase.pdf: 672147 bytes, checksum: c79be901d2d8e5217f47c8d1f43d0318 (MD5) Previous issue date: 2005 / CESUPA - Centro Universitário do Pará / A epidemiologia da amebíase está sendo reavaliada desde que a E. histolytica (patogênica) foi considerada espécie distinta de E. dispar (não patogênica). Neste estudo, investigou-se a freqüência da amebíase em uma amostra de residentes do Pará por diferentes técnicas de diagnóstico e avaliou-se a patogenia do parasito. Os participantes (n = 845) forneceram material fecal e destes, 191 foram entrevistados quanto aos sintomas de diarréia, cólicas intestinais, constipação, náuseas e vômito. Foram também analisados 8 exsudatos de pacientes com suspeita de amebíase hepática. As amostras foram observadas sob microscopia de luz e a confirmação de E. histolytica feita a partir da pesquisa de antígenos. Um total de 98 amostras fecais e todos os exsudatos foram semeados em meio Pavlova para isolamento e posterior caracterização bioquímica e molecular (identificação de espécie e genotipagem). Isolados de outras regiões do Brasil foram também genotipados. A positividade obtida foi de 29,35% (248/845) e não houve correlação com a faixa etária. A microscopia revelou baixa sensibilidade (45,26%; 74/334), porém elevada especificidade (87,03%; 260/334) quando comparada ao ELISA. Houve relação significativa (OR 4,4026) entre a presença de sintomas e a positividade no ELISA, sendo a diarréia (58,82%) e a cólica intestinal (58,82%) os sintomas mais relatados. Nenhum exsudato foi positivo no exame a fresco, porém 7 foram positivos no ELISA. Obteve-se 22 isolados de material fecal e a caracterização da HE foi possível em 13, dos quais 7 E. histolytica e 6 E. dispar. O DNA de 22 isolados e dos exsudatos foram testados para identificação molecular de espécie e genotipagem. Do total, 16 cultivos (9 cepas mistas, 4 E. dispar e 3 E. histolytica) e 5 exsudatos (todos E. histolytica) amplificaram na PCR. A genotipagem identificou adicional positividade para E. histolytica em um exsudato e revelou diferentes polimorfismos de comprimento para o locus 1-2 de E. histolytica e E. dispar do Pará e de outras regiões do Brasil e um caso de co-infecção por diferentes genótipos de E. dispar. Nossos resultados revelam que a amebíase invasiva é um importante problema de saúde pública em nossa população e grande variedade de genótipos de E. histolytica contribuem para a doença no Brasil. / The amebiasis epidemiology had been evaluated since the E. histolytica (pathogenic) was differentiated from E. dispar (non-pathogenic). In this study, it had investigated the amebiasis frequency in residents from Pará using different diagnostic techniques and evaluated the parasite pathogenesis. All participants (n = 845) had given their fecal material and from them, 191 were asked about the symptoms of diarrhea, abdomen pain, constipation, nausea and vomit. We had also analyzed 8 liver exudates from patients suspected of hepatic amebiasis. All samples were examined by microscopy and the E. histolytica confirmation was done by antigen detection (E. histolytica Test. TechLab). Of the total, 98 fecal samples and all exudates were cultured in Pavlova medium for parasite isolation and biochemical characterization and molecular (species identification and genotyping of the locus 1-2). Strains from other Brazil regions were also genotyped. The positive rate for E. histolytica found was 29.35% (248/845) and there was no correlation with age. The sensitivity of the microscopy method was low (45.26% - 74/334) and the specificity high (87.03% - 260/334) when compared to the ELISA test. The correlation between presence of symptoms and ELISA positive results was significant (OR 4.4026) with the diarrhea and abdominal pain being the most reported. None of the exudate samples was positive under the microscopy, but 7 of them were ELISA positive. We had success in culturing only 22 fecal samples. The characterization of HE was possible only for 13 isolates, from which, 7 were E. histolytica and 6 E. dispar. The DNA of the 22 isolates and all exudates were tested by PCR for the species identification and genotyping. Of the total, 16 strains (9 mixed, 4 E. dispar and 3 E. histolytica) and 5 exudate had amplified at the PCR. The genotyping had identified additional positivity for E. histolytica in one exudate and showed different length polymorphisms for the locus 1-2 de E. histolytica and E. dispar of Pará and other Brazil regions and one case of co-infection by different genotypes of the E. dispar. Our results had showed that the invasive amebiasis is an important public health problem within the Amazonian population and that the high genotype variability of E. histolytica contribute for the maintenance of this disease in Brazil.

Underdiagnosis of intestinal parasites in patients with diarrhea A compilation from the Swedish public health authority indicates that infections caused by Cryptosporidium spp. increased in Sweden from 47 cases in 2004 to 594 cases in 2016 and Giardia intestinalis causes around 1300 infections per year. The primary aim of this study was to investigate the prevalence of parasites in patients with diarrhea. Furthermore, the study investigated whether samples taken with E-swab could be analyzed with real-time polymerase chain reaction (PCR) for detection of Cryptosporidium spp., Dientamoeba fragilis, Entamoeba histolytica/dispar and G. intestinalis rather than Sodium acetate-acetic acid-formaline fixative (SAF-fixative). Prevalence of parasites in fecal samples was collected from 200 samples from patients with bacterial issue ordered. For evaluation of E-swab, 22 frozen, unfixed samples that were positive for intestinal parasites was used. Twelve positive E-swab samples was used as comparative positive controls. This was analyzed using real-time PCR. Bacteria was counted for 9.5% of the infections whilst parasites counted for 14% of the infections. The conclusion was that E-swab could replace SAF-fixative in the diagnosis of intestinal parasites and that there is that an underdiagnosis of intestinal parasites. Keywords: Cryptosporidium spp, Dientamoeba fragilis, Entamoeba histolytica, Entamoeba dispar, Giardia intestinalis, real-time PCR, E-swab, prevalence.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2015-06-22T17:06:27Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_InvestigacaoPrevalenciaAmebiase.pdf: 998371 bytes, checksum: 9fbcc3b63ed1bd45a04c6848805b8dc9 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2015-06-25T13:29:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_InvestigacaoPrevalenciaAmebiase.pdf: 998371 bytes, checksum: 9fbcc3b63ed1bd45a04c6848805b8dc9 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-25T13:29:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_InvestigacaoPrevalenciaAmebiase.pdf: 998371 bytes, checksum: 9fbcc3b63ed1bd45a04c6848805b8dc9 (MD5) Previous issue date: 2012 / A amebíase é uma infecção causada pela Entamoeba histolytica e considerada uma importante causa de morbi-mortalidade no mundo. Estudos relatam uma prevalência elevada da amebíase em regiões tropicais, principalmente em comunidades que vivem em precárias condições sanitárias. O estudo epidemiológico da amebíase tem sido reavaliado desde que a E. histolytica, forma patogênica, foi distinta da E. dispar, forma não patogênica. O objetivo desta pesquisa foi estimar a prevalência de E. histolytica na população de escolares da rede municipal da cidade de Imperatriz (MA). Realizou-se um estudo de corte transversal que envolveu 405 escolares. As amostras foram analisadas através de exame parasitológico, pelo método de sedimentação espontânea, para triagem das amostras positivas para o complexo E. histolytica/E .dispar. Os exames positivos para o complexo E. histolytica/E. dispar foram posteriormente submetidos à reação em cadeia da polimerase (PCR) para diferenciação das espécies. Na PCR foi utilizado para amplificação inicial de um fragmento de 1076 pb, um conjunto de primers externo E1 e E2, seguida por uma PCR Multiplex usando os primers Eh-L/Eh-R e Ed-L/Ed-R para amplificação da E. histolytica e E. dispar, respectivamente. Não foi diagnosticado pela PCR amostras positivas para E.histolytica. A prevalência da E. dispar na população de escolares foi de 2,7% (11/405). A PCR se mostrou importante ferramenta para o diagnóstico diferencial das Entamoebas. Porém, estudos de prevalência da amebíase devem ser impulsionados em população com características diferenciadas, a fim de contribuir de forma efetiva para definir a situação epidemiológica desta infecção na cidade de Imperatriz. / Amoebiasis is an infection caused by Entamoeba histolytica and an important cause of morbidity and mortality worldwide. Studies have reported a high prevalence of in tropic amebiasis al regions, especially in communities living in poor sanitary conditions. The epidemiological study of amoebiasis has been reevaluated since E. histolytica, pathogenic form, was distinct from E. dispar, non-pathogenic form. The aim of this study was to estimate the prevalence of E. histolytica in the population of the municipal city Imperatriz (MA). We conducted a cross-sectional study involving 405 students. By the screening of the complex E. histolytica / E.dispar parasitological examination was performed using the sedimentation method. The positive samples for E.histolytica/ E.dispar complex were subjected to polymerase chain reaction (PCR) for species differentiation. For initial amplification by the PCR we used a outer primer set E1 and E2 that amplified a 1076 bp fragment and followed by a multiplex PCR using inner primer set Ed-L/Ed-R and Eh-L/Eh-R E.histolytica and E.dispar respectively. No sample showing positivity for E. histolytica The prevalence of E.dispar in the population was 2.7% (11/405). The PCR proved important tool for the differential diagnosis of Entamoebas. However, studies on the prevalence of amoebiasis should be conducted in population with different characteristics, in order to contribute effectively to define the epidemiological situation of this infection in Imperatriz city.

Biological invasions are major threats to any nation’s economy and biodiversity. To detect new biological incursions of some species biosecurity agencies deploy pheromone sentinel traps for targeted species at high risk sites such as airports, seaports and transitional facilities. A good example is the gypsy moth surveillance program in New Zealand. Following the detection of an incursion by an unwanted organism, ground-based searches to locate the source can be very expensive, but are essential to identify the introduction pathway and to increase the chances of success eradicating the unwanted organism. In such circumstances, the possibility of better targeting the search for the source of the incursion using a modelling approach is worthy of investigation A stochastic mechanistic model to hindcast moth flight from a recapture location to the release location was developed based on insect behaviour in response to wind and pheromones. The model was composed of two main processes, 1) downwind dispersal, assumed to result from an appetitive behaviour, indicated by an analysis of a previous mark-release-recapture experiment on painted apple moth (Teia anartoides, Walker) and, 2) anemotaxic dispersal inspired by pheromone anemotaxis theory but up-scaled from a fine-scaled behaviour model to a 2 m scale. A genetic algorithm was used to fit some model parameters. A specialised fitness function was developed to allow the genetic algorithm to identify parameters that resulted in models that reflected both the spread and density patterns in the trapping data. The resulting function allowed the stochastic model results to be compared with the inherently stochastic trapping data. The resulting individual based model simulates the spatio-temporal dispersal pattern of painted apple moth recorded during a previous mark-release-recapture experiment. While the proposed model is shown to have limitations with respect to accuracy and precision it is also demonstrated to greatly improve biosecurity incursion response capability, by more efficient targeting of search effort for the proximal source of an incursion.