Submitted by Milena Dias (milena.dias@ufpe.br) on 2015-03-10T19:42:03Z No. of bitstreams: 2 Tese Liliane Amorim.pdf: 4605349 bytes, checksum: e4e99a641965d895f55abc2588099e43 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-10T19:42:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Liliane Amorim.pdf: 4605349 bytes, checksum: e4e99a641965d895f55abc2588099e43 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / CAPES / Culex quinquefasciatus é vetor de muitos agentes etiológicos de doenças humanas, incluindo Wuchereria bancrofti, o parasita que causa a filariose linfática, uma doença endêmica no Estado de Pernambuco (PE), Brasil. A elevada densidade deste mosquito pode causar problemas secundários que têm impacto na saúde e qualidade de vida das pessoas expostas; por isso, o controle desta espécie é importante. O objetivo do trabalho foi identificar se existem e quais são os mecanismos de resistência a inseticidas químicos e a diversidade genética de populações naturais de Culex quinquefasciatus coletadas em PE. As avaliações foram feitas por meio de bioensaios, ensaios bioquímicos para mensurar a atividade das enzimas de detoxificação e ensaios moleculares para estimar a frequência da mutação presente no gene da acetilcolinesterase (ace-1), associada à resistência a organofosforados (OPs) e carbamatos (CMs). A diversidade genética das populações foi avaliada utilizando 16 marcadores microssatélites. Ovos de Culex foram coletados em seis municípios de PE: Olinda (Peixinhos e Alto da Conquista), Recife (Água Fria), Jaboatão dos Guararapes, Ipojuca, Glória do Goitá e Santa Cruz do Capibaribe. Os resultados mostraram que apenas a população proveniente de Santa Cruz do Capibaribe (SC) apresentou alteração na susceptibilidade (RR = 7,2 vezes), com nível de resistência moderado ao temephos, enquanto as outras populações analisadas não mostraram alteração na susceptibilidade ao inseticida. Quanto aos testes bioquímicos, apenas em SC foi observado um aumento na atividade de todas as esterases estudadas e indícios de insensibilidade da acetilcolinesterase. A frequência da mutação G119S no alelo de resistência ace-1 (G119S) foi de 0,11 em SC e zero nas outras populações. O número de alelos por locus variou entre 2 e 15. Alguns desses alelos foram exclusivos de algumas localidades. O percentual de variabilidade genética encontrado foi maior dentro das populações do que entre as populações e os resultados indicam excesso de heterozigotos. Estes dados mostram que embora não haja programas nacionais para o controle de Culex, esta espécie apresenta mecanismos de resistência que estão sendo mantidos em populações naturais como um resultado da exposição acidental ao inseticida, o que poderia prejudicar as ações de controle que podem ser implantadas no futuro.

Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-04-15T13:27:10Z No. of bitstreams: 2 Tese_Final_Versão_Digital.compressed.pdf: 9380334 bytes, checksum: a0e694616d8c750ce997b137fc9cd7ac (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-15T13:27:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Final_Versão_Digital.compressed.pdf: 9380334 bytes, checksum: a0e694616d8c750ce997b137fc9cd7ac (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-03-15 / CNPq / Os papilomavírus (PV) formam um grupo altamente diverso que infectam mamíferos, aves e répteis. Entre esses vírus, o papilomavírus bovino (BPV) tem grande importância veterinária, causando lesões cutâneas e mucosas em gado e outros animais, que podem progredir para câncer. Portanto, estudar a diversidade de BPV que infectam os rebanhos brasileiros se torna relevante. Deste modo, esse estudo objetivou desenvolver uma nova abordagem computacional baseada em entropia para selecionar regiões genômicas filogeneticamente informativas dos PV, assim como avaliar e discutir a diversidade de tipos de BPV que infectam rebanhos da região Nordeste do Brasil. Para isto, a complexidade informacional de cada região genômica foi calculada e aquelas com baixa entropia foram selecionadas para inferência filogenética. Foram coletadas amostras de lesões cutâneas de bovinos do Nordeste do Brasil. O DNA foi extraído, amplificado e os produtos foram sequenciados. Foi possível identificar regiões claramente homólogas que são conservadas entre os diferentes PV. As análises também revelaram a presença de 11 diferentes tipos de BPV nas amostras, assim como prováveis novos tipos e subtipos de BPV. Estes resultados indicam que a entropia pode, com sucesso, selecionar bons marcadores genômicos para inferência filogenética. Além disso, eles adicionam um conhecimento significativo sobre a incidência e diversidade dos BPV que infectam o gado brasileiro. Em conjunto, estes conhecimentos podem ser utilizados para o desenvolvimento de novos sistemas de diagnóstico, mais eficazes no controle da papilomatose bovina.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-27T15:03:54Z No. of bitstreams: 1 Sarah Jacqueline Cavalcanti da Silva.pdf: 1503583 bytes, checksum: c734d13d83c04a3ed6233a8268b3bee8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T15:03:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sarah Jacqueline Cavalcanti da Silva.pdf: 1503583 bytes, checksum: c734d13d83c04a3ed6233a8268b3bee8 (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The incidence and severity of diseases caused by begomoviruses has increase rapidly in many areas of the world, including Brazil, where they are limiting factors to tomato and common bean production. Begomoviruses are also associated with a wide range of weed plants which in some cases act as inoculum sources for cultivated plants. It is believed that begomoviruses infecting weed hosts can be horizontally transferred to crop plants and that in the new host they will rapidly evolve by recombination and pseudorecombination, giving rise to novel species. Acting as reservoirs these plants can play a relevant role in viral epidemics in several crops species. The study of plant virus epidemics is greatly facilitated when a population genetics approach is employed. The first step to study viral population is to define their genetic structure, which refers to their degree of variability. Knowledge of the dynamics of genetic variability is essential to understand the potential of the population to evolve, which directly affects the durability of disease management strategies based on the deployment of resistance genes. Studies to understand the genetic structure and dynamics of begomovirus populations in wild reservoirs and the possible effects on epidemics in crop species are scarce. Thus, the aim of this study was to determine the species diversity and population genetic structure of begomoviruses infecting weeds in Northeastern Brazil, as a step towards assessing their role as begomovirus reservoirs. Weed samples belonging to the family Fabaceae and Capparaceae displaying typical symptoms of begomovirus infection were collected in Alagoas (AL), Bahia (BA), Paraíba (PB), Pernambuco (PE) and Sergipe (SE) states from May/2005 to July/2010. A total of 59 leguminous weeds including 42 samples of Macroptilium spp. and 23 samples of Cleome affinis (fam. Caparaceae) were collected. Total DNA was extracted from the samples and full-length begomovirus genomes were amplified and cloned by rolling circle amplification. Clones were completely sequenced and the sequences were used for comparisons with previously described begomoviruses, for phylogenetic analysis and for the determination of the genetic structure of viral populations. Sequence comparisons indicated the presence of six begomoviruses in leguminous weeds (five in Macroptilium spp.), four of them representing novel species. Sequence features indicate that all four novel species are typical New World, bipartite begomoviruses which clustered with Brazilian begomoviruses in the phylogenetic tree. In contrast, only one begomovirus was found infecting C. affinis, suggesting low species diversity in this host phylogenetic reticulate analysis was used to detected possible recombination events in begomovirus populations in leguminous weeds and C. affinis. Putative recombination events were confirmed by RDP3 package analysis. We detected recombination events in Macroptilium yellow spot virus (MaYSV) and Cleome leaf crumple virus (ClLCrV) populations. Analysis of the genetic structure of these virus populations indicates a high degree of genetic variability in both cases. Mutation and recombination are important processes involved in the high genetic variability found in MaYSV and ClLCrV populations. Together, these results suggest that Macroptilium spp. and Cleome affinis can be important begomovirus reservoirs. / A incidência e severidade de doenças causadas por begomovírus (família Geminiviridae) têm aumentado rapidamente em muitas áreas do mundo, incluindo o Brasil, onde são fatores limitantes à produção de feijão e tomateiro. Begomovírus são também associados a uma ampla gama de plantas daninhas e silvestres, as quais em alguns casos podem atuar como fonte de inóculo para plantas cultivadas. Acredita-se que begomovírus que infectam plantas daninhas podem ser transferidos horizontalmente para plantas cultivadas, e que no novo hospedeiro eles podem evoluir rapidamente por meio de recombinação e pseudo recombinação, dando origem a novas espécies. Atuando como reservatórios, estas plantas podem desempenhar um importante papel nas epidemias virais em várias culturas. O estudo de epidemias de vírus de plantas é grandemente facilitado quando uma abordagem baseada em genética de populações é empregada. O primeiro passo para estudar populações virais é definir sua estrutura genética, o que se refere ao seu grau de variabilidade genética. O conhecimento da dinâmica da variabilidade genética é essencial para entender o potencial das populações para evoluir, o que afeta diretamente a durabilidade de estratégias de manejo da doença baseadas na resistência do hospedeiro. Estudos para entender a estrutura genética e dinâmica de populações de begomovírus em plantas daninhas e possíveis efeitos sobre epidemias em espécies cultivadas são escassos. Dessa forma, o objetivo desse estudo foi determinar a diversidade e estrutura genética de begomovírus que infectam plantas daninhas no Nordeste do Brasil, como passo para avaliar seu papel como reservatório de begomovírus. Plantas daninhas pertencentes às famílias Fabaceae e Capparaceae com sintomas típicos de infecção por begomovírus foram coletadas nos estados de Alagoas (AL), Bahia (BA), Paraíba (PB), Pernambuco (PE) e Sergipe (SE) de maio de 2005 a julho de 2010. Um total de 59 amostras de fabáceas, incluindo 42 amostras de Macroptilium spp., e 23 amostras de Cleome affinis (fam. Capparaceae) foram coletadas. DNA total foi extraído a partir das amostras e genomas completos dos begomovírus foram amplificados e clonados por amplificação por círculo rolante. Os clones foram completamente sequenciados e as sequências foram usadas para comparações com begomovírus previamente descritos, para análise filogenética e para determinação da estrutura genética das populações virais. Comparações de sequências indicaram a presença de seis begomovírus em fabáceas (cinco em Macroptilium spp.), incluindo quatro representando novas espécies. As características das sequências indicam que todas as novas espécies são begomovírus bissegmentados típicos do Novo Mundo que agruparam com begomovírus brasileiros na árvore filogenética. Em contraste, apenas uma espécie de begomovírus foi encontrada infectando plantas de Cleome affinis, sugerindo um baixo grau de diversidade de espécies nessa hospedeira. Filogenia reticulada foi usada para detectar possíveis eventos de recombinação nas populações begomovírus em fabáceas e em C. affinis. Esses prováveis eventos de recombinação foram confirmados por análise no programa RDP3. Foram detectados eventos de recombinação ocorrendo naturalmente nas populações de Macroptilium yellow spot virus (MaYSV) e Cleome leaf crumple virus (ClLCrV). A análise da estrutura genética das populações de MaYSV e ClLCrV indica um alto grau de variabilidade genética em ambos os casos. Mutação e recombinação são importantes processos envolvidos na alta variabilidade genética encontrada nas populações desses vírus. Em conjunto, os resul

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-07-03T13:04:37Z No. of bitstreams: 1 Rejane Rodrigues de Oliveira.pdf: 1165760 bytes, checksum: 80f04a5414f3c6a357ac1aa597c0719c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-03T13:04:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rejane Rodrigues de Oliveira.pdf: 1165760 bytes, checksum: 80f04a5414f3c6a357ac1aa597c0719c (MD5) Previous issue date: 2012-12-27 / Aiming at studying the structure of population and demography of Murciano-Granadina goat breed, 24,444 data on pedigree, from Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina – CAPRIGRAN, were analyzed. In order to set population structure the following population data were analyzed: complete generations; complete generation equivalent; effective number of founders (fe); effective number of ancestors (fa); inbreed coefficient (F-statistics) and average relatedness coefficient (AR). The conclusion was that the levels of genetic variability in the studied population of Murciano-Granadina goat breed were in satisfactory level, allowing its utilization in programs of genetic improvement and conservation of genetic resources. As for demographic census, quantitative data were studied regarding: number of males and females; medium generation intervals (GI); effective number (Ne). The conclusion was that low depth of pedigrees limits getting more precise parameters. Smaller herds presented sex rate under recommended and the medium GI observed (2.77 years) demonstrates that population is under intense improvement work that can compromise genetic variability in the future. / Com o objetivo de estudar a estrutura de populações e a demografia da raça caprina Murciano-Granadina, foram avaliadas 24.444 informações de pedigree, pertencentes ao banco de dados da Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina - CAPRIGRAN. Para compor a estrutura da população, foram avaliados os seguintes parâmetros populacionais: número de gerações completas; número de gerações equivalentes; número efetivo de animais fundadores (fe); número efetivo de ancestrais (fa); coeficiente de consanguinidade (estatísticas F de Wright) e coeficiente médio de parentesco (AR), concluindo-se que a existência de variabilidade genética nas populações estudadas da raça caprina Murciano-Granadina da Espanha encontra-se em níveis satisfatórios, permitindo sua utilização em programas de melhoramento e de conservação de recursos genéticos. Para o censo demográfico, foram analisadas informações quantitativas sobre número de macho e fêmeas; intervalo médio de gerações (IG); tamanho efetivo da população (Ne), resultando na baixa profundidade dos pedigrees limitante na obtenção de parâmetros mais acurados e mais precisos. Os rebanhos menores apresentaram taxa sexual inferior ao recomendado, ao passo que o IG médio observado (2,77 anos) demonstra que a população está sob intenso trabalho de melhoramento genético, o que pode comprometer a variabilidade genética no futuro.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-07-28T13:40:34Z No. of bitstreams: 1 Adeneide Candido Galdino.pdf: 2622020 bytes, checksum: 9526fdf5729ce9c44d786085305b8758 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-28T13:40:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Adeneide Candido Galdino.pdf: 2622020 bytes, checksum: 9526fdf5729ce9c44d786085305b8758 (MD5) Previous issue date: 2014-02-17 / The animal production systems in semiarid region are basically extensive and often with animals above the carrying capacity of native pastures resulting in genetic erosion of several species due to overgrazing prevailing in the region. We evaluated the occurrence of Stylosanthes spp in municipalities the semiarid of Pernambuco in 2010-2011 aiming to preserve genetic diversity and multiply the obtained materials. Sampling was performed in 11 representative cities of goat and sheep in the semiarid region of Pernambuco : Serra Talhada, Sertânia, Floresta, Tupanatinga , Bom Jardim , Caetés , Petrolina , Santa Cruz , Santa Cruz Capibaribe , Jataúba and Parnamirim where plants Stylosanthes sp. were collected as well as soil samples for determining the fertility and physical. An experiment of seed germination testing the effect of different heat treatments and light conditions on germination and seedling development of Stylosanthes scabra Vogel was performed. The treatments consist of soaking in water at 100ºC for 0, 20, 40 and 60 seconds and subsequently germinated under light and dark. The experimental design was completely randomized in a 4x2 factorial scheme with four scarification treatments and two light conditions, with 12 replications, each repeat composed of 50 seeds. Another experiment was conducted to evaluate doses indolbutyric acid (IBA ) and thickness of cuttings for vegetative propagation of Stylosanthes scabra Vogel. Cuttin two thicknesses fine ( 2.0 ± 0.5 mm) and coarse (4.0 ± 0.5 mm) and five concentrations of IBA ( 0, 1, 2, 3, and 4g L1 in hydroalcoholic solution). The experimental design was completely randomized with three replications and each plot consisting of 15 cuttings. The factors that determined the occurrence of the genus was the type of soil, and the majority occur in Planossolo and Oxisol with approximately 84.3%. Besides the type of soil characteristics such as average temperature, precipitation, concentration of Ca and Mg and clay percentage were crucial to identify the occurrence of the plant in the municipalities evaluated. In relation to the germination test water in 100º C for 40 s was more efficient in breaking dormancy of Stylosanthes scabra Vogel. favoring greater length and root weight (1.88 and 7.31 g cm) and greater shoot length. Regarding IBA greater length, root weight and mass of shoots with application of 2gL-1 being the best combination for the vegetative propagation of Stylosanthes scabra Vogel was observed 2 g L- 1 IBA in thick piles, because a larger proportion of rooted cuttings. / Os sistemas de produção animal na região semiárida são basicamente extensivos e muitas vezes com lotação animal acima da capacidade de suporte das pastagens nativas acarretando em erosão genética de diversas espécies devido ao superpastejo prevalecente na região. Avaliou-se a ocorrência de Stylosanthes spp. em municípios do semiárido de Pernambuco no período de 2010-2011 objetivando preservar a diversidade genética e multiplicar os materiais obtidos. As coletas foram realizadas em 11 municípios representativos da Caprino-ovinocultura no semiárido de Pernambuco: Serra Talhada, Sertânia, Floresta, Tupanatinga, Bom Jardim, Caetés, Petrolina, Santa Cruz, Santa Cruz do Capibaribe, Jataúba e Parnamirim onde foram coletadas plantas de Stylosanthes spp, bem como solo da área de coleta para determinação de fertilidade e física do solo. Foi realizado um experimento de germinação de sementes testando o efeito de diferentes tratamentos térmicos e condições de luminosidade na germinação e desenvolvimento de plântulas de Stylosanthes scabra Vogel. Os tratamentos compostos por embebição em água a 100 ºC por 0, 20, 40 e 60 segundos e, posteriormente, germinadas em condições de claro e escuro. O delineamento utilizado foi inteiramente casualizado em esquema fatorial 4x2, com quatro tratamentos de escarificação e duas condições de luminosidade, com 12 repetições, sendo cada repetição composta por 50 sementes. Um outro experimento foi realizado objetivando avaliar doses de Ácido Indolbutírico (AIB) e espessuras de estacas na propagação vegetativa de plantas de Stylosanthes scabra Vogel. Foram testadas duas espessuras de estaca, fina (2,0±0,5 mm) e grossa (4,0±0,5 mm) e cinco concentrações de AIB (0, 1, 2, 3 e 4 g L-1 em solução hidroalcoólica). O delineamento utilizado foi inteiramente casualizado com três repetições, sendo cada parcela experimental composta por 15 estacas. O fator que determinou a ocorrência do gênero foi o tipo do solo, sendo a maior ocorrência registrada no Planossolo e Latossolo com aproximadamente 84,3%. Além do tipo de solo características como temperatura média, precipitação, concentração de Ca e Mg e percentual de argila foram determinantes para identificar a ocorrência da planta nos municípios avaliados. Em relação ao teste de germinação, a utilização de água a 100 ºC por 40 segundos foi mais eficiente na quebra de dormência de sementes de Stylosanthes scabra Vogel. favorecendo maior comprimento e massa de raiz (1,88 cm e 7,31 g), bem como maior comprimento da parte aérea. Em relação às doses de AIB foi observado maior comprimento, peso de raízes e massa das brotações com aplicação de 2 g L-1, sendo a melhor combinação para a propagação vegetativa de Stylosanthes scabra Vogel. 2 g L-1 de AIB em estacas grossas, pois apresentaram maior proporção de estacas enraizadas.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-07-28T13:57:53Z No. of bitstreams: 1 Thaysa Rodrigues Torres.pdf: 2441475 bytes, checksum: 5014b988018bc9664fd152173ddf674c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-28T13:57:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thaysa Rodrigues Torres.pdf: 2441475 bytes, checksum: 5014b988018bc9664fd152173ddf674c (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Evaluate the effect of genetic group on the behavior and performance of pregnant sows raised outdoors in semi-arid northeast. Its 30 pregnant sows, divided into three genetic groups:three- cross animals ( large white x Landrace x Pietran ), ½ blood ( x duroc Pietran ) and animals without defined breed standard ( native ) were used production data were evaluated : gain weight during pregnancy, gain in backfat thickness, average litter weight at birth and piglet , average piglet weight and litter weaning, daily gain of piglets and litter, weight loss during lactation , and consumption food, as well as climate and physiological variables. The results showed that the behavior was no significant effect of genetic group for walking and leisure variables (sun, pool and shade). Regarding the behavior of ingesting water or food, as well as the physiological activities related to urination and defecation animals had a similar behavior regardless of breed. Behavioral patterns throughout the day with time spent consuming feed were influenced by hour throughout the day, as well as genetic groups. The amounts related to rectal temperature between treatments showed no significant difference for matrices. Increased levels of climatic thermoregulation interfere in animals, especially considering the wind velocity, which showed a negative correlation, indicating that as the temperature increased animal significantly increased their respiratory rate, decreasing with increasing wind speed, and this mechanism regulating the animal realized it was fundamental. Among the evaluated blood parameters, only cortisol and creatinine showed significant differences. The indexes showed significant difference. A three -cross matrices and crossbred Duroc x Pietran have less predisposition to fat accumulation compared to the group of native arrays. Concludes is that the genetically improved gilts when subjected to outdoor conditions in Pernambuco backcountry adapt well since preventive measures are taken to avoid and / or minimize stress, native animals tend to have a better performance when created with correct management. / Avaliou-se o efeito do grupo genético sobre o comportamento e desempenho de marrãs suínas gestantes criadas ao ar livre no semiárido nordestino. Foram utilizadas 30 marrãs gestantes, divididas em três grupos genéticos: animais three-cross (large white x landrace x pietran), ½ sangue (duroc x pietran) e animais sem padrão de raça definido (nativos).foram avaliados dados zootécnicos: ganho de peso durante a gestação; ganho em espessura de toucinho; peso médio da leitegada e do leitão ao nascimento; peso médio do leitão e da leitegada ao desmame; ganho de peso diário do leitão e da leitegada; perda de peso durante a lactação; e consumo de alimento, bem como as variáveis climáticas e fisiológicas. Os resultados do comportamento revelaram que houve efeito significativo do grupo genético para as variáveis andando e ócio (sol, piscina e sombra). Quanto ao comportamento de ingerir água ou ração, bem como as atividades fisiológicas referentes à micção e defecação os animais tiveram um comportamento similar independente do grupo genético. Os padrões comportamentais ao longo do dia com o tempo gasto consumindo ração foram influenciados pelas horas ao longo do dia, bem como pelos grupos genéticos. Os valores referentes à temperatura retal entre os tratamentos não apresentaram diferença significativa para as marrãs. O aumento dos índices climáticos interferiu na termoregulação dos animais, especialmente considerando a velocidade do vento, que apresentou uma correlação negativa, demonstrando que a à medida que a temperatura aumentava o animal aumentava significativamente sua frequência respiratória, diminuindo quando a velocidade do vento aumentava, esse mecanismo de regulação que o animal realizou foi fundamental. Entre os parâmetros sanguíneos avaliados, apenas o cortisol e a creatinina apresentaram diferença significativa. Os índices zootécnicos apresentaram diferença significativa. A marrãs three-cross e mestiças de duroc x pietran apresentam menor predisposição de acumulo de gordura quando comparadas ao grupo de marrãs nativas. Conclui-se que as marrãs melhoradas geneticamente quando submetidas a condições ao ar livre no sertão pernambucano adaptam-se bem desde que sejam tomadas medidas preventivas para evitar e/ou minimizar o estresse, animais nativos tendem a apresentar uma melhor desempenho quando criados com manejo correto.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-12-18T13:50:32Z No. of bitstreams: 1 Ana Kelly dos Santos Maia.pdf: 2230603 bytes, checksum: 2977bc5e48caa440b9f32ae7437e4195 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-18T13:50:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Kelly dos Santos Maia.pdf: 2230603 bytes, checksum: 2977bc5e48caa440b9f32ae7437e4195 (MD5) Previous issue date: 2017-07-21 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) is a native fruit tree of Brazil, widely distributed in the cerrado and coastal boards. It produces tasty, nutritious and widely used fruits, with great potential for economic exploration. However, the natural populations of H. speciosa are undergoing an intense process of genetic erosion as a result mainly of expansion of agricultural frontier and cities, without study on diversity and genetic structure of populations. The lack of such information is limited to the adoption of efficient collect and conservation of genetic resources. The objective of this work was to analyze the diversity and genetic structure, as well as to infer the phylogeographic patterns of the natural populations of H. speciosa on Northeast Coastal Boards of Brazil. Microsatellite or SSR (six loci) and cpDNA (trnH-psbA region) markers were used to estimate the genetic diversity indexes and to get phylogeographic inferences of four natural populations of H. speciosa (96 individuals) sampled in the States of Maranhão, Paraíba, Pernambuco and Sergipe. The species showed moderate genetic structuring (FST = 0.095) with greater genetic diversity within populations (83%) than among populations (17%). The FST values for the pair of populations showed the smallest genetic differentiation between Paraíba x Pernambuco (0.015) and a larger between Maranhão and Pernambuco (0.142). It was observed that the Maranhão population had larger differentiation among four one. In general, for the populations studied, the fixation index was zero or negative (-0.082). A cpDNA analysis revealed six haplotypes and the Sergipe population presents a greater diversity of haplotypes, showing a haplotype in common with the States of Paraíba and Pernambuco. The population of Maranhão presents haplotypes exclusive. A spatial molecular variance analysis revealed two groups with high genetic structure (FST = 0.898 and FCT = 0.899), with 89.92% of the variation between the groups. This information on diversity and genetic structure are important subsidies for optimizing ex-situ and in-situ conservation of the genetic resources of mangabeira on studied region and for search of pre-breeding research of this species. / A mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) é uma frutífera nativa do Brasil, amplamente distribuída no cerrado e nos tabuleiros costeiros. Produz frutos saborosos, nutritivos e de ampla utilização, com grande potencial para exploração econômica. Entretanto, as populações naturais de H. speciosa estão sofrendo intenso processo de erosão genética devido à especulação imobiliária e a expansão da fronteira agrícola, sem que tenha sido realizado estudo sobre a diversidade e estrutura genética. A carência de tais informações limita a adoção de estratégias eficientes de coleta e de conservação dos recursos genéticos. O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade e estrutura genética, bem como inferir os padrões filogeográficos das populações naturais de H. speciosa nos Tabuleiros Costeiros do Nordeste do Brasil. Marcadores microssatélites ou SSR (seis loci) e cpDNA (região trnH-psbA) foram utilizados com sucesso para estimar os índices de diversidade genética e inferências filogeofráficas de quatro populações naturais de H. speciosa (96 indivíduos) nos Estados do Maranhão, Paraíba, Pernambuco e Sergipe. A espécie mostrou moderada estruturação genética (FST=0,095) com maior variabilidade genética dentro de populações (83%) do que entre populações (17%). Os valores de FST para as populações combinadas aos pares mostrou que a menor diferenciação genética foi entre Paraíba x Pernambuco (0,015), e a maior diferenciação entre Maranhão x Pernambuco (0,142). Observou-se que a população Maranhão foi a que mais divergiu das demais. No geral, para as populações estudadas o índice de fixação foi nulo ou negativo (-0,082). A análise do cpDNA revelou seis haplótipos sendo que a população de Sergipe apresentou maior diversidade de haplótipos e um haplótipo em comum com os Estados da Paraíba e Pernambuco. A população do Maranhão apresentou haplótipos exclusivos. A análise de variância molecular espacial revelou dois grupos com elevada estruturação genética (FST = 0,898 e FCT = 0,899), com 89,92% da variação entre os grupos. Tais informações de diversidade e estrutura genética constituem importantes subsídios para aperfeiçoar a conservação ex situ e in situ dos recursos genéticos da mangabeira na região estudada e para pesquisas de prémelhoramento genético dessa espécie.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-08-29T14:00:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 857048 bytes, checksum: c7bcf222c766535b9be418b403ebedb5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-29T14:00:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 857048 bytes, checksum: c7bcf222c766535b9be418b403ebedb5 (MD5) Previous issue date: 2018-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O maracujazeiro azedo (Passiflora edulis Sims.) pertence à família Passifloraceae e ao gênero Passiflora, sendo a América tropical seu centro de origem. O Brasil destaca-se no cenário mundial como maior produtor, propiciando o interesse de cultivo da espécie, porém se faz necessário o desenvolvimento de cultivares que possuam desempenho superior às já existentes. O programa de melhoramento de maracujazeiro da Universidade Federal de Viçosa desenvolve continuamente genótipos superiores por meio de cruzamentos entre indivíduos contrastantes como premissa de obter cultivares comerciais que atendam aos interesses do mercado. Nesse estudo, objetivou-se caracterizar molecularmente as cultivares comerciais de maracujazeiro azedo utilizadas no Brasil e progênies elite advindas do programa de melhoramento da Universidade Federal de Viçosa - UFV, além de obter informações sobre indivíduos contrastantes e verificar a possível ocorrência de variabilidade genética entre e dentro das cultivares/progênies avaliadas. Foram utilizadas 14 cultivares comerciais advindas de nove programas de melhoramento e 14 progênies elite do programa de melhoramento da UFV. Para cada cultivar/progênie coletou-se dados de sete plantas. Foram testados 12 primers microssatélites, dos quais 10 amplificaram e apresentaram polimorfismo. Foram identificados 26 alelos, com media de 2,6 alelo/loco. As analises de diversidade mostraram que a heterozigosidade observada é menor que a esperada e que o conjunto das cultivares/progênies possui coeficiente de endogamia positivo. Observou-se a formação de três grupos a partir da construção do dendrograma, onde foi possível discriminar quase todos os indivíduos das cultivares/progênies. / The passion fruit (Passiflora edulis Sims.) belongs to the family Passifloraceae and to the genus Passiflora, being tropical America its center of origin. Brazil stands out in the world scenario as a major producer, favoring the interest of cultivating the species, but it is necessary to develop cultivars that perform better than those already existing. The passion fruit breeding program of the Federal University of Viçosa continually develops superior genotypes through crosses between contrasting individuals as a premise to obtain commercial cultivars that meet market interests. The objective of this study was to characterize the commercial cultivars of passion fruit cultivars used in Brazil and elite progenies from the breeding program of the Federal University of Viçosa - UFV, as well as obtaining information on contrasting individuals and verifying the possible occurrence of genetic variability between within the evaluated cultivars / progenies. Fourteen commercial cultivars from nine breeding programs and 14 elite progenies from the UFV breeding program were used. For each cultivar / progeny data were collected from seven plants. Twelve microsatellite primers were tested, 10 of which amplified and showed polymorphism. 26 alleles were identified, with a mean of 2.6 allele / locus. The diversity analyzes showed that the observed heterozygosity is lower than expected and that the set of cultivars / progenies has a positive inbreeding coefficient. It was observed the formation of three groups from the construction of the dendrogram, where it was possible to discriminate almost all the individuals of the cultivars / progenies.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4416_1.pdf: 690757 bytes, checksum: 6e1d8fd2843b82ae7a0a60b516bd6c3c (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2002 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Foram analisadas vinte linhagens de Beauveria bassiana isoladas de diferentes regiões e hospedeiros, quanto ao perfil de DNA, através da análise da região ITS do rDNA, de RAPD e Intron, para avaliação da diversidade genética e auxílio na caracterização. A região ITS1-5.8s-ITS2 do rDNA foram digeridas com as enzimas Eco RI, Dra I, Msp I e Hae III, onde a Eco RI e Dra I não apresentaram sítio de restrição e a Hae III e Msp I não apresentaram polimorfismo entre as linhagens, confirmando a espécie estudada. Para RAPD foram selecionados cinco primers OPX17, OPW4, OPW7, OPW19, 0PW20, que produziram um total de 442 bandas. Os dados obtidos foram submetidos à análise estatística pelo programa NTSYS.PC e construída uma matriz de similaridade utilizando o coeficiente de Jaccard, que gerou um dendrograma através do método de agrupamento UPGMA. A similaridade foi em torno de 70%. A análise do dendrograma mostrou a formação de quatro grupos, onde não houve correlação com o hospedeiro ou origem geográfica, embora duas linhagens isoladas de Nezara viridula e duas de Deois flavopicta tenham mostrado maior nível de similaridade. Os dados obtidos pela análise de Intron, mostraram o aparecimento de cinco grupos

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-01-25T15:47:23Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-01-25T15:47:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-25T15:47:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2016-12-07 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Turtles are freshwater turtles belonging to the Pleurodira suborder, are included in the family Chelidae that at present is represented by 56 species. The genus Phrynops endemic to South America has four nominal species: Phrynops geoffroanus, P. hilarii, P. tuberosus and P. williamsi, the first species has the largest geographical distribution among all representatives of the family Chelidae. It is distributed from the south of Venezuela to the north of Argentina. Considering its wide geographical distribution, several authors have indicated the possible existence of a complex of species that will be divided into distinct entities. The only reappraisal of the genus Phrynops occurred in the early 2000s. Between 2010 and 2015, 223 specimens from all regions of Brazil, north, north-east, central-west, southeast and south were collected covering much of their geographic distribution currently known. The samples were collected using a variety of collecting methods such as "hoop traps" traps, trammel nets, hooks, and sanders. Morphometric and molecular data (mitochondrial genes, nuclear - genomic data) have been important tools to help delineate distinct evolutionary lineages and their respective geographical distribution boundaries. Using mtDNA sequencing of the 16S, Cytochrome b and Cytochrome oxidase I genes with the aim of studying and revealing the genetic diversity patterns of P. geoffroanus to test the existence of cryptic diversity. Through genetic analysis using concatenated data of the mitochondrial genes it was possible to observe the distinction of four lineages. Morphological data also helped to distinguish clusters formed by the morphometric forms of the specimens studied. We suggest the existence of cryptic diversity in P. geoffroanus that may possibly be fractionated in other taxonomic entities. / Os cágados são quelônios de água doce pertencentes a subordem Pleurodira, estão incluídos na família Chelidae que atualmente está representada por 56 espécies. O gênero Phrynops endêmico da América do Sul possui quatro espécies nominais: Phrynops geoffroanus, P. hilarii, P. tuberosus e P. williamsi, a primeira espécie apresenta a maior distribuição geográfica entre todos os representantes da família Chelidae. Distribuindo-se desde o sul da Venezuela ao norte da Argentina. Considerando sua ampla distribuição geográfica diversos autores tem indicado a possível existência de um complexo de espécies que será fracionado em entidades distintas. A única reavaliação do gênero Phrynops ocorreu no início dos anos 2000. Entre os anos de 2010 e 2015 foi coletado 223 espécimes provenientes de todas as regiões do Brasil, norte, nordeste, centro-oeste, sudeste e sul abrangendo grande parte de sua distribuição geográfica atualmente conhecida. As coletas foram realizadas utilizando diversos métodos de coleta como armadilhas do tipo covo “hoop traps”, malhadeiras “trammel nets”, anzóis (esperas) e malhadeiras. Dados morfométricos e moleculares (genes mitocondriais, nucleares – dados genômicos) tem sido ferramentas importantes para auxiliar na delimitação de linhagens evolutivas distintas e os seus respectivos limites de distribuição geográfica. Utilizando sequenciamento do mtDNA dos genes 16S, Citocromo b e Citocromo oxidase I com o intuito de estudar e revelar os padrões de diversidade genética de P. geoffroanus para testar a existência de diversidade críptica. Através de análises genética utilizando dados concatenados dos genes mitocondriais foi possível observar a distinção de cinco linhagens. Dados morfológicos também auxiliaram na distinção de agrupamentos formados pelas formas morfométricas dos espécimes estudados. Sugerimos a existência de diversidade críptica em P. geoffroanus que possivelmente venha ser fracionado em outras entidades taxonômicas.