Cette thèse a pour objectif de montrer que les paquets de représentations cohomologiques d’un groupe réductif classique quasi déployé, défini sur R, construits par J. Arthur coïncident avec les paquets précédemments définis de manière plus élémentaire et plus explicite par Adams et Johnson... / The aim of this thesis is to prove that the packets of cohomological representation of quasi-split classical groups, defined over R, by Arthur coincide with the packets defined previously in a more elementary way by Adams and Johnson...

L'évolution de la gastrite et des lésions précancéreuses suit une cascade de plusieurs étapes. Les modifications des tissus pathologiques affichent de faibles variations par rapport à la muqueuse normale d'un point de vue macroscopique. Même si certaines variations pourraient être identifiées, cela reste fortement subjectif. Le diagnostic classique des maladies de l'estomac est divisé en deux procédures. Le premier est une gastroendoscopie où l'estomac est visuellement exploré sous une lumière blanche. Le second est la biopsie pour l'analyse histologique. Cette procédure a une forte probabilité d'établir le diagnostic correct mais il dépend fortement de la sélection correcte des échantillons de tissus endommagés. Ce travail porte sur l'étude de la muqueuse gastrique par imagerie multispectrale. La contribution principale est l'étude clinique de l'imagerie multispectrale afin de différencier les pathologies mal diagnostiquées ou qui ne peuvent être diagnostiquées que par l'analyse histologique. A cet effet, nous avons effectué (1) une étude ex-vivo dans un modèle de souris de l'infection de Helicobacter pylori dans le but d'identifier les longueurs d'onde qui pourraient être utilisées pour le diagnostic. (2) Nous proposons deux prototypes compatibles avec les gastroendoscopes actuels pour acquérir des images multispectrales du tissu gastrique : le premièr est basé sur une roue à filtres et le second sur une caméra multispectrale avec sept canaux. De plus, (3) nous présentons une méthodologie pour identifier les tissus pathologiques, qui est basé sur des caractéristiques statistiques extraites des spectres acquis, classées en fonction de leur pouvoir discriminants et une classification supervisée, où nous cherchons la meilleure performance de trois algorithmes de classification: le plus proche voisin, un réseaux de neurones et une Support Vector Machine avec une évaluation de la performance rigoureuse en utilisant une validation de type Leave One Patient Out Cross Validation. Les résultats démontrent la pertinence de l’imagerie multispectrale comme un outil supplémentaire pour un diagnostic objectif. / The evolution of gastritis into precancerous lesions follows a cascade of multiplestages. The modifications of the pathological tissues display low variations with respect to normal mucosa from a macroscopical point of view. Even though some features could be identified, they remain strongly subjective. The current gold standard for diagnosis of gastric diseases is divided in two procedures. The first one is gastroendoscopy where the stomach is visually explored under white light. The second one is biopsy collection for histological analysis. This procedure has a high probability of establishing the correct diagnosis but it strongly depends on the accurate collection of samples from damaged tissues. This doctoral work focuses on the study of gastric mucosa by multispectral imaging. The main contribution is the clinical study of multispectral imaging to differentiate pathologies poorly diagnosed or that can only be diagnosed by histological analysis. For this purpose, we performed (1) ex vivo studies in a mice model of infection of Helicobacter pylori in order to identify the wavelengths which could be used for diagnosis. (2) We propose two prototypes compatible with current gastroendoscopes to acquire multispectral images from gastric tissue: the first one is based on a filter wheel and the second one on a multispectral camera with seven channels. Additionally, (3) we present a methodology to identify pathological tissues, which is based on statistical features extracted from the acquired spectra, ranked according to their discriminative power and a supervised classification, where we search for the best performance of three classification algorithms: Nearest Neighbor, Neural Networks and Support Vector Machine with a rigorous performance evaluation by using leave one patient out cross validation. The results demonstrate the relevance of multispectral imaging as an additional tool for an objective diagnosis.

L’auscultation des ouvrages en béton précontraint à l’aide de la post-tension pose un défi particulier puisque l’armature de précontrainte de même que les gaines de précontrainte sont noyées dans le béton et deviennent, par le fait même, difficilement accessibles pour inspection. L’état des armatures de précontrainte (présence de corrosion) de même que la qualité de l’injection au coulis de ciment des gaines (présence de vides de coulis) sont pourtant des indicateurs importants de la durabilité des ouvrages. Afin d’apporter un éclairage sur l’auscultation de tels ouvrages, la présente étude propose d’abord une revue de la littérature sur les méthodes d’évaluation non destructives et commente leur applicabilité dans le contexte des ouvrages précontraints. Suite à cette étude, la méthode de l’impact écho a été sélectionnée puis mise à profit pour l’auscultation de corps d’épreuve fabriqués en laboratoire ainsi que pour l’auscultation de portions de poutres de ponts démantelés. L’endoscopie, considérée comme une méthode semi-destructive, est venue en appui à la méthode de l’impact écho et a été utilisée sur les mêmes éléments de béton. Suite à la description du processus méthodologique utilisé et des échantillons de béton à disposition, un chapitre entier est dédié aux résultats typiques observés. Les conclusions de l’étude montrent que la pratique d’endoscopies sur les ouvrages précontraints est particulièrement bien adaptée à l’observation de vides de coulis dans les gaines de post-tension et à l’observation de l’état des câbles de précontrainte. Dans le cas de l'impact-écho l’étude a montré que, bien qu’il existe un potentiel de détection des vides de coulis, dans les situations de pièces massives et complexes du fait de la présence de multiples câbles, de la présence de dégradations ou d’imperfections géométriques, l’interprétation des résultats s’avère difficile. Le traitement des résultats (signaux) demande à être plus approfondi avant que la méthode impact écho puisse être utilisée de façon courante sur des éléments massifs. / Auscultation of post-tensioned concrete structures represents a particular challenge because the prestressing reinforcement as well as prestressing ducts are embedded in the concrete and become, thereby, mostly inaccessible to Inspection. However, the condition of the tendons (presence of corrosion) as well as the quality of the grout injection of the ducts (presence of voids) are important indicators of a structure durability. In order to shed light upon auscultation of post-tensioned structures, this study first proposes a review of the literature on nondestructive methods and discusses their applicability in the context of prestressed structure assessment. Based on the review, the impact echo method was selected and utilized for the auscultation of test bodies, manufactured in laboratory, as well as for the auscultation of dismantled post-tensioned bridge sampled beams. Endoscopy, considered a semi-destructive testing method, came in support to the impact echo method and was used on the same concrete test bodies or samples. Following the description of the methodology related to the two assessment methods and the description of the concrete samples available, an entier chapter is dedicated to typical experimental results. The findings of the study show that the practice of endoscopy is particularly well suited to the observation of injection voids or of the prestressed reinforcement state in the grouted ducts.. In the case of the impact-echo the study showed that, although there is a potential of grout void detections, in situations where massive and complex parts are involved (due to the presence of multiple cables, the presence of damage or geometrical imperfections), the interpretation of results is difficult. The treatment of the mesures (signals) needs to be further developed before the impact echo method can be used routinely on large elements.

Les filières d'Assainissement Non Collectif (ANC) du fait de leur intérêt technique et économique connaissent un développement important. A ce jour, les gestionnaires de ce type d'ouvrages cherchent à mieux comprendre les phénomènes régissant leur fonctionnement et tentent ainsi d'améliorer cette filière sur le plan de la durabilité, de la fiabilité et de l'optimisation en s'appuyant sur des recommandations scientifiquement étayées auxquelles les études menées dans ce travail s'attachent à répondre. Les principaux objectifs industriels et scientifiques de cette thèse étaient de mieux comprendre le fonctionnement de ces sytèmes et de développer une méthodologie de diagnostic de leur état par la mise au point d'outils et de méthodes adaptés à ce genre d'onvrage. Nous avons proposé dans ce travail une démarche originale d'estimation de la perméabilité saturée ou non d'un sol in situ. Cette démarche est basée d'une part sur des informations de résistance et de granulométrie obtenues par couplage de mesures pénétrométriques et endoscopiques et d'autre part sur la connaissance de la relation résistance densité obtenue dans une base de données de matériaux. Cette démarche a été validée au laboratoire et utilisée in situ. Nous avons aussi proposé une méthodologie de diagnostic basée sur l'utilisation conjointe d'outils non destructifs et rapides à mettre en oeuvre à partir de différentes études réalisées in situ tant sur des ouvrages réels que sur des ouvrages expérimentaux grandeur nature.

L'imagerie optique biomédicale est confrontée aux phénomènes d'absorption et de diffusion de la lumière par les tissus qui atténuent et brouillent le signal au cours de sa propagation. La Tomographie de Cohérence Optique (OCT) filtre les photons balistiques par interférométrie en lumière temporellement incohérente. En particulier, l'approche Plein Champ atteint une résolution de 1 µm, mais sa profondeur de pénétration ne dépasse pas 1 mm. Il est donc impossible d'imager les organes internes in vivo et in situ : il faut pour cela disposer d'un instrument doté d'un endoscope, ce qui n'avait pas été réalisé à ce jour. Nous proposons un système d'OCT Plein Champ avec endoscope flexible qui repose sur le couplage de deux interféromètres, l'un extérieur à la sonde et l'autre situé à l'extrémité de la sonde en contact avec le tissu. Ainsi la sonde est entièrement passive et le signal interférométrique qui la traverse n'est pas perturbé par l'environnement. Sa flexibilité lui permettrait d'imager des organes internes comme le colon. Cependant l'utilisation d'un faisceau de plusieurs milliers de fibres optiques fait apparaître un signal d'interférence parasite dû aux phénomènes de couplage inter-coeurs et inter-modes. Des solutions sont proposées pour s'en affranchir et permettre l'imagerie d'échantillons de tissus. En imagerie par endoscopie rigide deux systèmes sont comparés, avec un ou deux interféromètres, et une sonde composée de lentilles à gradient d'indice. Cette sonde peut imager directement au contact des zones comme la peau, ou en pénétrant l'organe à la manière d'une aiguille, par exemple dans le sein. Elle est assez performante pour être utilisée in vivo sur la peau.

Reproduction de : Thèse d'exercice : Médecine : Nancy 1 : 2006. / Titre provenant de l'écran-titre.

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Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-04-10T18:55:15Z No. of bitstreams: 1 VANESSA SENA CORREIA LIMA - DISSERTAÇÃO PPG-CEMat 2014..pdf: 2636512 bytes, checksum: 9ac482edb8899e0ace77f9887e1dd23e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-10T18:55:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VANESSA SENA CORREIA LIMA - DISSERTAÇÃO PPG-CEMat 2014..pdf: 2636512 bytes, checksum: 9ac482edb8899e0ace77f9887e1dd23e (MD5) Previous issue date: 2014-09-15 / Biomaterial é um termo usado para indicar os materiais que constituem as peças de implantes médicos, dispositivos extracorporais, e descartáveis que têm sido utilizados em medicina bem como em todos os aspectos de saúde do paciente. As aplicações dos biomateriais são muitas e variadas, incluindo desde dispositivos de uso prolongado, como veias e válvulas artificiais, a dispositivos de exames, como endoscópios. Endoscopia, que significa olhar por dentro, trata-se de uma especialidade médica que se utiliza de um equipamento chamado de endoscópio para diagnóstico e tratamento de enfermidades. Através da endoscopia podem-se diagnosticar enfermidades, efetuar biópsias de lesões, extrair corpos estranhos, realizar dilatações, fazer acompanhamentos após cirurgias, passar sondas ou cateteres, tratar sangramentos, retirar pólipos e acessar a via biliar para realizar procedimentos cirúrgicos. Os endoscópios flexíveis possuem em sua ponta flexível uma borracha conhecida como Fluoroelastômero Viton®. Os fluorelastômeros são elastômeros sintéticos fluorados, conhecidos como Borracha Fluorada para serviços em temperaturas elevadas e ambientes quimicamente agressivos. Baseado no exposto este trabalho teve como objetivo estudar o fluorelastômero Viton® utilizado no revestimento de ponteiras dos equipamentos endoscópicos. Foram verificadas três grupos de amostras de ponteiras de endoscópios constituídas de Viton® denominadas G, M e P, em sua forma virgem e tratadas com álcool etílico e HCl, ambos concentrados, onde estas amostras foram caracterizadas por Microscopia Óptica (MO), Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV), Espectroscopia na Região de Infravermelho com Transformada de Fourier (FTIR), Espectroscopia por Energia Dispersiva de raios X (EDS), Difração de raios X (DRX), Ensaio de Ângulo de Molhabilidade e Ensaio de Citotoxicidade. Verificou-se para todas as amostras (G, M e P) uma superfície com morfologia granulada e irregular, com presença de elementos contaminantes e imperfeições, com bandas características de fluorelastômeros, difratogramas amorfos típicos de elastômeros, caráter hidrofílico e toxicidade em meio celular exceto para a amostra M. Observou-se que o tratamento com álcool etílico não provocou alteração estrutural no fluorelastômero agindo apenas como eliminador de impurezas superficiais. O tratamento com HCl provocou alterações na morfologia e estrutura química do elastômero. Verificou-se a necessidade de adaptação da rota de produção deste fluorelastômero para utilização como biomaterial. Foi proposta a utilização de revestimentos a base siloxanos que possam aumentar a vida útil do fluorelastômero Viton®. / Biomaterial is a term used to indicate the materials constituting the parts of medical implants, extracorporeal devices, disposable and which have been used in medicine as well as in all aspects of patients' health. The applications of biomaterials are many and varied, ranging from extended use devices such as artificial valves and veins, the devices exams such as endoscopes. Endoscopy, which means looking inside, it is a medical specialty that uses a device called endoscope for diagnosis and treatment of diseases. By endoscopy can be diagnosed illnesses, perform biopsies of lesions, extracting foreign bodies, perform dilations, do follow ups after surgery, spend probes or catheters, to treat bleeding, remove polyps and access to the surgical procedures biliary. Flexible endoscopes have in your flexible rubber tip one known as Viton® fluoroelastomer. The fluoroelastomers are synthetic fluorinated elastomers, known as Rubber Fluorinated services to high temperatures and chemically aggressive environments. Based on the above this work was to study the Viton® fluoroelastomer coating used on tips of endoscopic equipment. Three groups of samples from the tips of endoscopes consist of Viton® called L, M and P, in its virgin form and treated with HCl and ethyl alcohol, both concentrated where these samples were characterized by Optical Microscopy (OM), Electron Microscopy Were Verified (SEM), Spectroscopy in the Region of Fourier Transform Infrared (FTIR) Spectroscopy Energy Dispersive X-ray (EDS), diffraction (XRD), test of Angle Wettability and Cytotoxicity Assay rays. It was found for all samples (L, M, P) and a surface irregular with granular morphology, presence of contaminants and imperfections, characteristic bands of fluoroelastomers, typical XRD of amorphous elastomers, hydrophilic, and toxicity in cell except for M. In the sample was observed that treatment with ethanol did not cause structural changes in the fluoroelastomer as scavenger only surface impurities. Treatment with HCl caused changes in the morphology and chemical structure of the elastomer. There was a need to adapt the production of fluoroelastomer route for use as a biomaterial. The use of coatings siloxanes base that can increase the life of Viton® fluoroelastomer was proposed.

La majorité des dispositifs de métrologie basés vision sont équipés de systèmes optiques stéréo ou de systèmes de mesure externes dits actifs. Les méthodes de reconstruction tridimensionnelle (Structure-from-Motion, Shape-from-Shading) applicables à la vision monoculaire souffrent généralement de l’ambiguïté d’échelle. Cette dernière est inhérente au processus d’acquisition d’images qui implique la perte de l’information de profondeur de la scène. La relation entre la taille des objets et la distance de la prise de vue est équivoque.Cette étude a pour objet l’estimation de l’échelle absolue d’une scène par vision passive monofocale. Elle vise à apporter une solution à l’ambiguïté d’échelle uniquement basée vision, pour un système optique monoculaire dont les paramètres internes sont fixes. Elle se destine plus particulièrement à la mesure des lésions en coloscopie. Cette procédure endoscopique (du grec endom : intérieur et scopie : vision) permet l’exploration et l’intervention au sein du côlon à l’aide d’un dispositif flexible (coloscope) embarquant généralement un système optique monofocal. Dans ce contexte, la taille des néoplasies (excroissances anormales de tissu) constitue un critère diagnostic essentiel. Cette dernière est cependant difficile à évaluer et les erreurs d’estimations visuelles peuvent conduire à la définition d’intervalles de temps de surveillance inappropriés. La nécessité de concevoir un système d’estimation de la taille des lésions coloniques constitue la motivation majeure de cette étude. Nous dressons dans la première partie de ce manuscrit un état de l’art synoptique des différents systèmes de mesure basés vision afin de positionner notre étude dans ce contexte. Nous présentons ensuite le modèle de caméra monofocal ainsi que le modèle de formation d’image qui lui a été associé. Ce dernier est la base essentielle des travaux menés dans le cadre de cette thèse. La seconde partie du manuscrit présente la contribution majeure de notre étude. Nous dressons tout d’abord un état de l’art détaillé des méthodes de reconstruction 3D basées sur l’analyse de l’information de flou optique (DfD (Depth-from-Defocus) et DfF (Depth-from-Defocus)). Ces dernières sont des approches passives permettant, sous certaines contraintes d’asservissement de la caméra, de résoudre l’ambiguïté d’échelle. Elles ont directement inspiré le système de mesure par extraction du point de rupture de netteté présenté dans le chapitre suivant. Nous considérons une vidéo correspondant à un mouvement d’approche du système optique face à une région d’intérêt dont on souhaite estimer les dimensions. Notre système de mesure permet d’extraire le point de rupture nette/flou au sein de cette vidéo. Nous démontrons que, dans le cas d’un système optique monofocale, ce point unique correspond à une profondeur de référence pouvant être calibrée. Notre système est composé de deux modules. Le module BET (Blur EstimatingTracking) permet le suivi et l’estimation conjointe de l’information de mise au point d’une région d’intérêt au sein d’une vidéo. Le module BMF (Blur Model Fitting) permet d’extraire de façon robuste le point de rupture de netteté grâce à l’ajustement d’un modèle de flou optique. Une évaluation de notre système appliqué à l’estimation de la taille des lésions coloniques démontre sa faisabilité. Le dernier chapitre de ce manuscrit est consacré à une perspective d’extension de notre approche par une méthode générative. Nous présentons, sous la forme d’une étude théorique préliminaire, une méthode NRSfM (Non-Rigid Structure-from-Motion) permettant la reconstruction à l’échelle de surfaces déformables. Cette dernière permet l’estimation conjointe de cartes de profondeurs denses ainsi que de l’image de la surface aplanie entièrement mise au point. (...) / Vision-based metrology devices generally embed stereoscopic sensors or active measurement systems. Most of the passive 3D reconstruction techniques (Structure-from-Motion, Shape from-Shading) adapted to monocular vision suffer from scale ambiguity. Because the processing of image acquisition implies the loss of the depth information, there is an ambiguous relationship between the depth of a scene and the size of an imaged object. This study deals with the estimation of the absolute scale of a scene using passive monofocal vision. Monofocal vision describes monocular system for which optical parameters are fixed. Such optical systems are notably embedded within endoscopic systems used in colonoscopy. This minimally invasive technique allows endoscopists to explore the colon cavity and remove neoplasias (abnormal growths of tissue). Their size is an essential diagnostic criterion for estimating their rate of malignancy. However, it is difficult to estimate and erroneous visual estimations lead to neoplasias surveillance intervals being inappropriately assigned. The need to design a neoplasia measurement system is the core motivation for our study. In the first part of this manuscript, we review state-of-the-art vision-based metrology devices to provide context for our system. We then introduce monofocal optical systems and the specific image formation model used in our study. The second part deals with the main contribution of our work. We first review in detail state of the art DfD (Depth-from-Defocus) and DfF (Depth-from-Defocus) approaches. They are passive computer vision techniques that enable us to resolve scale ambiguity. Our core contribution is introduced in the following chapter. We define the Infocus-Breakpoint (IB) that allows us to resolve scale from a regular video. The IB is the lower limit of the optical system’s depth of field. Our system relies on two novel technical modules: Blur-Estimating Tracking (BET) and Blur-Model Fitting (BMF). BET allows us to simultaneously track an area of interest and estimate the optical blur information. BMF allows us to robustly extract the IB by fitting an optical blur model to the blur measurement estimated by the BET module. For the optical system is monofocal, the IB corresponds to a reference depth that can be calibrated. In the last chapter, we evaluate our method and propose a neoplasia measurement system adapted to the constraints in colonoscopy examination. The last part of this manuscript is dedicated to a prospect of extension of our method by a generative approach. We present, as a preliminary study, a new NRSfM (Non-Rigid Structure-from-Motion) method allowing the scaled Euclidean 3D reconstruction of deformable surfaces. This approach is based on the simultaneous estimation of dense depth maps corresponding to a set of deformations as well as the in-focus color map of the flattened surface. We first review state-of-the-art methods for 3D reconstruction of deformable surfaces. We then introduce our new generative model as well as an alternation method allowing us to infer it.

La création d'informations 3D denses à partir d'images endoscopiques intraopératoires, ainsi que le calcul de la position relative de la caméra endoscopique, sont des éléments fondamentaux pour un guidage de qualité durant la chirurgie guidée par l'image. Par exemple, cela permet de superposer modèle pré-opératoire via la réalité augmentée. Cette thèse présente une approche pour l'estimation de ces deux information basées sur une approche de localisation et cartographie simultanées (SLAM). Nous découplons la reconstruction dense de l'estimation de la trajectoire de la caméra, aboutissant à un système qui combine la précision du SLAM, et une reconstruction plus complète. Les solutions proposées dans cette thèse ont été validées sur de séquences porcines provenant de différents ensembles de données. Ces solutions n'ont pas besoin de matériel de suivi externe ni d'intervention. Les seules entrées nécessaires sont les trames vidéo d'un endoscope monoculaire. / Recovering dense 3D information from intra-operative endoscopic images together with the relative endoscope camera pose are fundamental blocks for accurate guidance and navigation in image-guided surgery. They have several important applications, e.g., augmented reality overlay of pre-operative models. This thesis provides a systematic approach for estimating these two pieces of information based on a pure vision Simultaneous Localization And Mapping (SLAM). We decouple the dense reconstruction from the camera trajectory estimation, resulting in a system that combines the accuracy and robustness of feature-based SLAM with the more complete reconstruction of direct SLAM methods. The proposed solutions in this thesis have been validated on real porcine sequences from different datasets and proved to be fast and do not need any external tracking hardware nor significant intervention from medical staff. The sole input is video frames of a standard monocular endoscope.