El presente trabajo de investigación propone la mejora del tratamiento de agua en la clínica Nefrolife Perú para optimizar el proceso de hemodiálisis en pacientes renales. Se realizó el diagnóstico del proceso de tratamiento de agua mediante mediciones en el que se observaron algunos parámetros fuera de su rango normal: conductividad 7 μS/cm, pH 7,7 y dureza 27 mg/L, averías en los equipos de producción de agua: Err3 en filtro ablandador 1 y Olf en Filtro de carbón activado los cuales interfieren y dañan el proceso, agregado a ello se conoció la contaminación microbiológica y de endotoxinas mediante el método SMEWW APHA AWWA-WEF, Part,3500-Na 23nd.Ed-Flame Emission photometric Method 2017 y tiras reactivas Watr Check TM2 resultando > 100 UFC/ml y > 0,25 UE/ml, basados en el diagnóstico se formuló la propuesta de mejora donde se determinó el porcentaje y volumen de utilización de los desinfectantes y se elaboró los procedimientos para la desinfección del sistema de tratamiento de agua, conllevando a un aumento en la producción de agua tratada de un 66,7% y reduciendo la contaminación química y bacteriana en casi la totalidad de sus parámetros; por último, se estableció formatos de control que servirán para monitorear y dar seguimiento de manera continua al sistema de agua tratada. Se evaluó el aspecto económico financiero con un TMAR de 30,4%, y se obtuvo un VAN de S/. 46,154 y un TIR de 65,4%; concluyendo en la viabilidad del proyecto en términos técnicos y económicos.

Foi investigada a utilização de Sistema Micelar de Duas Fases Aquosas (SMDFA) para remoção de lipolissacarídeos (LPS) de preparações contendo proteínas recombinantes de interesse farmacêutico, como a proteína verde fluorescente (GFPuv). Os SMDFA são constituídos por soluções de tensoativos contendo micelas e oferecem ambientes hidrofóbico e hidrofílico, que possibilitam seletividade na partição de biomoléculas de acordo com sua hidrofobicidade, permitindo a remoção de LPS contaminante. Neste trabalho, foi realizada a implementação do método para a quantificação de LPS em amostras contaminadas e a obtenção de LPS e GFPuv puros a partir de cultivo de E. coli recombinante. Além disso, foi estudada a influência do Triton X-114 na metodologia de quantificação de LPS, e a adição de MgSO4, CaCl2, KI e (NH4)2SO4 na partição de GFPuv e LPS puros em SMDFA. E ainda, realizou-se um planejamento experimental (22) para avaliar os maiores KGFPuv e %RECGFPuv. O homogeneizado celular de E. coli foi testado nas melhores condições obtidas com o planejamento experimental. E finalmente, o processo por cromatografia de afinidade por íons metálicos (IMAC) foi empregado para investigar a adsorção de LPS em matriz IDA-Ca2+. Conforme os resultados obtidos, o TX-114 causou elevada interferência no método cinético cromogênico, em função da similaridade desta molécula com os LPS. Os LPS apresentaram partição preferencial para a fase concentrada em micelas, com altos valores de remoção, %REMLPS>98,0%. Ao contrário, a GFPuv foi recuperada preferencialmente na fase diluída, na qual existe maior volume disponível, resultando em valores de KGFPuv>1. A adição de sais ocasionou diminuição nos valores KGFPuv, provavelmente por causa da carga negativa que GFPuv adquiriu nas condições avaliadas. Os resultados do planejamento experimental mostraram que a melhor condição de partição obtida foi na região do ponto central, 4,0% (p/p) a 60,0°C, com KGFPuv>10. O processo por IMAC apresentou as maiores capacidades de adsorção de LPS-IDA-Ca+2 nas condições de menor pH e maior força iônica 4,0 e 1,0 mol/L, respectivamente. O processo de purificação por SMDFA empregado para a remoção de LPS contaminante presente em meio fermentado contendo GFPuv, demonstrou ser eficiente em recuperar a biomolécula-alvo na fase diluída e separar o principal contaminante na fase rica em micelas. Portanto, pode ser empregado como primeira etapa para a remoção de altas concentrações de LPS na purificação de proteínas hidrofílicas como a GFPuv. / The Aqueous Two-Phase Micellar System (ATPMS) was investigated for endotoxin (LPS) removal from preparations containing recombinant proteins of pharmaceutical interest, such as the green fluorescent protein (GFPuv). These systems usually consist of micellar surfactants solutions and offer both hydrophobic and hydrophilic environments, providing selectivity to the biomolecules partitioning according to its hydrophobicity. In this work, the implementation of the method for LPS quantification in contaminated samples was accomplished, as well as the obtaining of pure LPS and GFPuv from recombinant E. coli. Furthermore, the influence of Triton X-114 in the methodology for LPS quantification was studied, as the addition of MgSO4, CaCl2, KI, and (NH4)2SO4 into the partition of pure GFPuv and LPS in ATPMS. In addition, a statistical design (22) was carried out to evaluate the highest KGFPuv and %RECGFPuv. The E. coli cell lysate was tested under optimum conditions obtained with the statistical design. And, finally, the process by ionmetal affinity chromatography (IMAC) was used to investigate the adsorption of LPS in IDA-Ca2+ matrix. The results showed that the TX-114 caused high interference in the kinetic chromogenic method, according to the similarity of this molecule to LPS. The LPS showed preferential partitioning to the micellerich phase, with high values of removal, %REMLPS>98.0%. In the other hand, the GFPuv was preferentially recovered in the micelle-poor phase, in which there is greater volume available resulting in values of KGFPuv>1. The addition of salts caused a reduction in the values KGFPuv, probably because of the negative charge that the GFPuv acquired at the conditions evaluated. The results of the statistical design showed that the best partitioning condition obtained was in the central point region, 4.0% (wt/wt) at 60.0°C, with KGFPuv>10. The process by IMAC showed the highest adsorption of LPS-IDA-Ca+2 capacities at the conditions of lower pH and higher ionic strength 4.0 and 1.0 mol/L, respectively. The purification process for the LPS contaminant removal from E. coli fermentation containing GFPuv by ATPMS proved to be efficient in the recovering of target biomolecule in the micelle-poor phase, and separating the main contaminant in the micelle-rich phase. Furthermore, this system can be exploited as the first step for removal of higher LPS concentrations from hydrophilics protein purification.

Este estudo clínico avaliou a quantidade de bactérias e endotoxinas, antes e após o tratamento endodôntico utilizando ativação ultrassônica de solução de hidróxido de cálcio e sua correlação com a indução de citocinas pró-inflamatórias por fibroblastos humanos. Vinte e três pacientes com dentes com periodontite apical primária foram submetidos ao tratamento endodôntico. O preparo químico-cirúrgico (PQC) foi realizado com instrumentos reciprocantes, utilizando NaOCl 2,5% durante o preparo e EDTA 17% para remoção do magma dentinário; complementado com a ativação ultrassônica de uma solução de hidróxido de cálcio. Os canais radiculares foram preenchidos com pasta de hidróxido de cálcio por 14 dias e obturados. Foram realizadas coletas microbiológicas dos canais antes (S1) e após o PQC (S2), após o protocolo de ativação ultrassônica (S3) e após a medicação intracanal (S4). As amostras foram analisadas por: PCR quantitativo (qPCR) utilizando iniciadores universais para quantificação de bactérias após extração de DNA; teste turbidimétrico de LAL para quantificação de endotoxinas; e ELISA para quantificação de citocinas (IL-1?, IL-6, CCL2) em cultura de fibroblastos humanos após indução com o conteúdo do canal radicular. Os dados foram analisados pelos seguintes testes estatísticos: teste de Wilcoxon e Q de Cochran para análise quantitativa de bactérias e endotoxinas; ANOVA e teste de Tukey, para quantificação dos níveis de citocinas; e teste de Pearson para correlação entre os níveis de endotoxinas e citocinas (todos com nível de significância de 5%). Bactérias e endotoxinas foram observadas em todas as amostras iniciais com uma mediana de 3,61 x 104 e 109 EU/ml, respectivamente. Após o preparo químico-cirúrgico, houve uma redução significativa (p <0,05) dos níveis de DNA bacteriano (mediana 7,84 x 103) e endotoxina (mediana 20,2 EU/ml). Entretanto, não houve redução de DNA bacteriano após as etapas seguintes. Com relação a endotoxina, houve redução significativa (p <0,05) após a medicação intracanal (9,58 EU/mL). Correlação positiva foi observado entre os níveis de endotoxina e a indução de citocinas pró-inflamatórias. Produção de IL-1?, IL-6, CCL2 foram observadas em todas as etapas do tratamento. Não houve diferença estatística dos níveis de IL-1 ? detectados nas diferentes amostras (p >0,05). Houve diminuição significativa de IL-6 e CCL-2 entre S1 e S2 (p <0,05). Entretanto, não houve redução dessas citocinas nas amostras S3 ou S4 em relação às amostras S2 (p >0,05). Conclui-se que o PQC foi eficaz na redução de bactérias e endotoxinas dos canais radiculares; enquanto a medicação intracanal influenciou apenas na redução de endotoxina. As amostras após o PQC induziram menores níveis de IL-6 e CCL-2 em fibroblastos humanos do que as amostras antes do tratamento endodôntico. Por outro lado, as demais etapas do tratamento não foram capazes de promover uma redução adicional dessas citocinas. / This clinical study analyzed bacteria and endotoxins levels before and after endodontic treatment using ultrasonic activation of a calcium hydroxide solution and an intracanal medication and its correlation with pro-inflammatory cytokines induction by human fibroblasts. Twenty-three patients with teeth with primary apical periodontitis were submitted to endodontic treatment. The root canal preparation of all the teeth was carried out with reciprocating files and 2.5% NaOCl during preparation; and 17% EDTA for smear layer removal, supplemented with the ultrasonic activation of a solution of calcium hydroxide. The root canals were medicated with calcium hydroxide for 14 days and then obturated. Microbiological sampling were performed before (S1) and after the root canal preparation (S2), after ultrasonic activation protocol (S3) and after intracanal medication (S4). The samples were analyzed by quantitative PCR (qPCR) using universal primers quantification of bacteria after DNA extraction; LAL turbidimetric test for detection and determination of endotoxin and ELISA for evaluate the cytokine production (IL-1?, IL-6, CCL2) by humam fibroblasts culture. Data was analyzed by Wilcoxon and Q cochran tests for the quantitative analysis of bacteria and endotoxins. ANOVA and tukey test, with significance level of 5%, were used for quantification of cytokine levels and Pearson\'s test for correlation between endotoxins and cytokine levels. Bacteria and endotoxins were observed in all initial samples with a median of 3.61 x 104 and 109 EU/ml respectively. After root canal preparation, there was a significant reduction (p<0,05) of bacterial DNA (median 7.84 x 103) and endotoxin (median 20.2 EU/ml). However, there was no reduction of bacterial DNA after following steps. Regarding endotoxin, there was a significant reduction (p <0.05) after intracanal medication (9.58 EU / mL), A positive correlation was observed between endotoxins and cytokine induction. Production of IL-1?, IL-6, CCL2 were observed in all stages of treatment.. There was no statistical difference between the presence of IL-1? in each step of the treatment (p >0.05). There was a significant decrease in the presence of the proinflammatory cytokine IL-6 and CCL-2 between the initial stage of endodontic treatment (S1) and the next step (S2) (p <0.05). However, in the following steps (S3 and S4) there was no reduction (p >0.05). It was concluded that the root canal preparation was effective in reducing bacteria and endotoxins, and intracanal medication only influenced in endotoxin reduction. Samples after the root canal preparation induced lower levels of IL-6 and CCL-2 in human fibroblasts than samples before endodontic treatment, whereas other stages of the endodontic treatment were not able to promote an additional reduction.

Bacillus thuringiensis subsp. israelensis é uma bactéria gram positiva, amplamente utilizada no controle de insetos Diptera, família Culicidae, tais como Aedes aegypti e Culex quinquefasciatus. O sequenciamento de genomas completos de estirpes de B. thuringiensis tem permitido a identificação e caracterização de proteínas inseticidas, assim como a realização de estudos de genômica comparativa, permitindo evidenciar diferenças funcionais e filogenéticas. Neste contexto, o presente estudo teve como objetivo realizar análises genômicas de quatro isolados de B. thuringiensis subsp. israelensis que apresentam diferentes toxicidades para larvas de A. aegypti e C. quinquefasciatus. O sequenciamento dos genomas dos isolados T0124, T0131, T0137 e T0139 foi realizado a partir da plataforma MiSeq-Ilumina, e a montagem e anotação foram feitas utilizando ferramentas do programa de bioinformática Geneious. As análises resultaram em cromossomos com tamanhos aproximados de 5.414 Kb, conteúdo G+C de 35,2% e 5.358 regiões codificantes. Com relação ao conteúdo extracromossomal, foram montados três plasmídeos menores de 5,4; 6,8 e 7,6 Kb, e três plasmídeos maiores de 127, 235 e 359 Kb para todos os isolados, e estes foram enumerados de 1 a 6. A anotação revelou que apenas os plasmídeos de número 4, que correspondem ao pBtoxis, possuem proteínas inseticidas, sendo elas Cry4Aa, Cry4Ba, Cry11Aa, Cry10Aa, Cyt1Aa, Cyt2Ba e Cyt1Ca. A análise comparativa entre os genomas demonstra que os cromossomos T0124, T0131, T0137 e T0139 apresentam sequências colineares e com 99% de identidade, e seus respectivos plasmídeos 1, 2, 3, 4, 5 e 6 compartilham todas as suas regiões codificantes, incluindo aquelas relacionadas a δ-endotoxinas. A comparação de sequências de enterotoxinas, metaloproteases e fosfolipases demonstra que estes também são conservados entre os genomas. Na análise filogenética, os cromossomos T0124, T0131, T0137 eT0139 agruparam-se juntamente com os genomas dos isolados AM65-52 e HD-789 disponíveis no GenBank, sugerindo uma estreita relação genética entre estirpes de B. thuringiensis subsp. israelensis. Os isolados T0124, T0131, T0137 e T0139 apresentam diferentes concentrações letais para larvas de A. aegypti e C. quinquefasciatus, e a adição de dados proteômicos aos dados genômicos, aqui obtidos, poderão auxiliar na compreensão destas diferenças de toxicidade. Contudo as análises comparativas entre os genomas dos isolados T0124, T0131, T0137 e T0139 mostram alto grau de conservação genética a nível de nucleotídeos de B. thuringiensis subsp. israelensis. / Bacillus thuringiensis subsp. israelensis is a gram-positive bacterium widely used to control insects of the order Diptera, such as Aedes aegypti (Diptera: Culicidae) and Culex quinquefasciatus (Diptera: Culicidae). The sequencing of complete genomes of B. thuringiensis strains has allowed the identification and characterization of insecticidal proteins, as well as the comparative genomic studies, allowing the identification of functional and phylogenetic differences. In this context, the present study aimed to perform genomic analysis of four isolates of B. thuringiensis subsp. israelensis having different toxicities for larvae of A. aegypti and C. quinquefasciatus larvae. Sequencing of genomes of the isolates T0124, T0131, T0137 and T0139 was performed from the MiSeq-Ilumina platform, and assembly and annotation were done using tools from the Geneious bioinformatics program. The analyzes resulted in chromosomes with approximate sizes of 5,414 Kb, G + C content of 35.2% and 5,358 coding regions. Regarding extrachromosomal content, three smaller plasmids of 5.4, 6.8 and 7.6 Kb, and three larger plasmids of 127, 235 and 359 Kb were assembled for all the isolates, and these were enumerated from 1 to 6. The annotation revealed that only the plasmids of number 4, corresponding to pBtoxis, possess insecticidal proteins, being Cry4Aa, Cry4Ba, Cry11Aa, Cry10Aa, Cyt1Aa, Cyt2Ba and Cyt1Ca. Comparative analysis between the genomes demonstrates that chromosomes T0124, T0131, T0137 and T0139 have collinear sequences and 99% identity, and their respective plasmids 1, 2, 3, 4, 5 and 6 share all of their coding regions, including those related to δ-endotoxins. Comparison of enterotoxin, metalloprotease and phospholipase sequences shows that these are conserved among the genomes. In the phylogenetic analysis, chromosomes T0124, T0131, T0137 and T0139 were grouped together with the genomes of the isolates AM65-52 and HD-789 available in GenBank, suggesting a close genetic relation between strains of B. thuringiensis subsp. israelensis. The isolates T0124, T0131, T0137 and T0139 present different lethal concentrations to larvae of A. aegypti and C. quinquefasciatus, and the addition of proteomic data to the genomic data obtained here may help to understand these differences in toxicity. However, the comparative analyzes between the genomes of isolates T0124, T0131, T0137 and T0139 show a high degree of genetic conservation at the nucleotide level of B. thuringiensis subsp. israelensis.

Foi investigada a utilização de Sistema Micelar de Duas Fases Aquosas (SMDFA) para remoção de lipolissacarídeos (LPS) de preparações contendo proteínas recombinantes de interesse farmacêutico, como a proteína verde fluorescente (GFPuv). Os SMDFA são constituídos por soluções de tensoativos contendo micelas e oferecem ambientes hidrofóbico e hidrofílico, que possibilitam seletividade na partição de biomoléculas de acordo com sua hidrofobicidade, permitindo a remoção de LPS contaminante. Neste trabalho, foi realizada a implementação do método para a quantificação de LPS em amostras contaminadas e a obtenção de LPS e GFPuv puros a partir de cultivo de E. coli recombinante. Além disso, foi estudada a influência do Triton X-114 na metodologia de quantificação de LPS, e a adição de MgSO4, CaCl2, KI e (NH4)2SO4 na partição de GFPuv e LPS puros em SMDFA. E ainda, realizou-se um planejamento experimental (22) para avaliar os maiores KGFPuv e %RECGFPuv. O homogeneizado celular de E. coli foi testado nas melhores condições obtidas com o planejamento experimental. E finalmente, o processo por cromatografia de afinidade por íons metálicos (IMAC) foi empregado para investigar a adsorção de LPS em matriz IDA-Ca2+. Conforme os resultados obtidos, o TX-114 causou elevada interferência no método cinético cromogênico, em função da similaridade desta molécula com os LPS. Os LPS apresentaram partição preferencial para a fase concentrada em micelas, com altos valores de remoção, %REMLPS>98,0%. Ao contrário, a GFPuv foi recuperada preferencialmente na fase diluída, na qual existe maior volume disponível, resultando em valores de KGFPuv>1. A adição de sais ocasionou diminuição nos valores KGFPuv, provavelmente por causa da carga negativa que GFPuv adquiriu nas condições avaliadas. Os resultados do planejamento experimental mostraram que a melhor condição de partição obtida foi na região do ponto central, 4,0% (p/p) a 60,0°C, com KGFPuv>10. O processo por IMAC apresentou as maiores capacidades de adsorção de LPS-IDA-Ca+2 nas condições de menor pH e maior força iônica 4,0 e 1,0 mol/L, respectivamente. O processo de purificação por SMDFA empregado para a remoção de LPS contaminante presente em meio fermentado contendo GFPuv, demonstrou ser eficiente em recuperar a biomolécula-alvo na fase diluída e separar o principal contaminante na fase rica em micelas. Portanto, pode ser empregado como primeira etapa para a remoção de altas concentrações de LPS na purificação de proteínas hidrofílicas como a GFPuv. / The Aqueous Two-Phase Micellar System (ATPMS) was investigated for endotoxin (LPS) removal from preparations containing recombinant proteins of pharmaceutical interest, such as the green fluorescent protein (GFPuv). These systems usually consist of micellar surfactants solutions and offer both hydrophobic and hydrophilic environments, providing selectivity to the biomolecules partitioning according to its hydrophobicity. In this work, the implementation of the method for LPS quantification in contaminated samples was accomplished, as well as the obtaining of pure LPS and GFPuv from recombinant E. coli. Furthermore, the influence of Triton X-114 in the methodology for LPS quantification was studied, as the addition of MgSO4, CaCl2, KI, and (NH4)2SO4 into the partition of pure GFPuv and LPS in ATPMS. In addition, a statistical design (22) was carried out to evaluate the highest KGFPuv and %RECGFPuv. The E. coli cell lysate was tested under optimum conditions obtained with the statistical design. And, finally, the process by ionmetal affinity chromatography (IMAC) was used to investigate the adsorption of LPS in IDA-Ca2+ matrix. The results showed that the TX-114 caused high interference in the kinetic chromogenic method, according to the similarity of this molecule to LPS. The LPS showed preferential partitioning to the micellerich phase, with high values of removal, %REMLPS>98.0%. In the other hand, the GFPuv was preferentially recovered in the micelle-poor phase, in which there is greater volume available resulting in values of KGFPuv>1. The addition of salts caused a reduction in the values KGFPuv, probably because of the negative charge that the GFPuv acquired at the conditions evaluated. The results of the statistical design showed that the best partitioning condition obtained was in the central point region, 4.0% (wt/wt) at 60.0°C, with KGFPuv>10. The process by IMAC showed the highest adsorption of LPS-IDA-Ca+2 capacities at the conditions of lower pH and higher ionic strength 4.0 and 1.0 mol/L, respectively. The purification process for the LPS contaminant removal from E. coli fermentation containing GFPuv by ATPMS proved to be efficient in the recovering of target biomolecule in the micelle-poor phase, and separating the main contaminant in the micelle-rich phase. Furthermore, this system can be exploited as the first step for removal of higher LPS concentrations from hydrophilics protein purification.

Este estudo clínico analisou os efeitos dos procedimentos endodônticos e da irrigação ultrassônica passiva (PUI) em bactérias e endotoxinas de canais radiculares. Cinquenta pacientes com dentes com periodontite apical primária foram divididos de forma randomizada em dois grupos: PUI (n=25) e irrigação convencional (IC) (n=25). O preparo químico-cirúrgico (PQC) foi realizado com instrumentos reciprocantes, utilizando-se NaOCl 2,5% durante o preparo; e EDTA 17%, para remoção do magma dentinário. Os canais radiculares foram preenchidos com pasta de hidróxido de cálcio por 14 dias e obturados. Foram realizadas coletas microbiológicas dos canais antes (S1) e após o PQC (S2), após os protocolos de irrigação (S3), após a medicação intracanal (S4) e após a reinstrumentação dos canais (S5). Durante o processamento das amostras, as coletas de 5 casos foram perdidas por fatores diversos. As amostras foram analisadas por PCR quantitativo para detecção e quantificação de bactérias e pelo teste turbidimétrico de LAL para detecção e determinação do nível de endotoxinas. Bactérias e endotoxinas foram observadas em 100% das amostras iniciais coletadas. Em ambos os grupos, houve diminuição significativa na concentração de endotoxinas entre uma etapa do tratamento e a etapa posterior (p<0,05). O mesmo foi observado quanto ao número de bactérias, exceto entre a remoção da medicação intracanal e a reinstrumentação antes da obturação (S5). A análise intergrupos demonstrou que, com relação às endotoxinas, não foram observadas diferenças significativas entre os grupos (p>0,05). Com relação à redução bacteriana, a PUI foi capaz de reduzir significativamente mais o número de bactérias do que a IC (p<0,05). A análise qualitativa dos resultados demonstrou que nenhuma das técnicas sobressaiu-se sobre a outra em relação à frequência de casos com leituras positivas, tanto para bactérias quanto para endotoxinas. Concluiu-se que a PUI foi mais eficaz do que a IC em reduzir o número de bactérias, mas não a quantidade de endotoxinas do canal radicular. Além disso, cada etapa do tratamento endodôntico foi capaz de reduzir tanto o número de bactérias quanto a quantidade de endotoxinas. / The aim of this clinical study was to compare the effects of passive ultrasonic irrigation (PUI) and intracanal medication with calcium hydroxide in bacteria and endotoxins from root canal. Fifty teeth with apical periodontitis were randomly divided into two groups according to the irrigation protocol: PUI (n = 25) and conventional irrigation (CI) (n = 25). The root canal preparation of all the teeth was carried out with reciprocating files and 2.5% NaOCl during preparation; and 17% EDTA for smear layer removal. The root canals were medicated with calcium hydroxide for 14 days. Microbiological sampling were performed before (S1) and after the preparation (S2) after irrigation protocols (S3), and after intracanal medication (S4 and S5). During the processing of the samples, five cases were lost for several factors. The samples were analyzed by real time PCR, for the detection and quantification of bacteria, and the turbidimetric LAL assay, for the detection and analysis of the endotoxin levels. Bacteria and endotoxins were observed in 100% of the initial samples. In both groups, there was a significant decrease in the concentration of endotoxins between one step and the subsequent step of treatment (p < 0.05). The same was observed for the number of bacteria, with the exception of the reinstrumentation after the removal of the medication (S5). The intergroup analysis showed no significant differences between groups in endotoxin reduction ( p > 0.05 ). PUI was able to reduce the number of bacteria significantly better than CI (p < 0.05). No significant statistical difference was observed between groups regarding the occurrence of cases wielding positive results for bacteria or endotoxin. It was concluded that PUI was more effective than CI in reducing the number of bacteria but not the amount of endotoxin in the root canal. Furthermore, each step of the endodontic therapy was effective in reducing both the number of bacteria as the amount of endotoxin.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-07-29Bitstream added on 2014-06-13T18:42:17Z : No. of bitstreams: 1 maekawa_le_dr_sjc.pdf: 1187305 bytes, checksum: 2d80ab639c955945003b165b56fe5fd6 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A proposta deste trabalho foi avaliar a efetividade dos extratos glicólicos de própolis e de gengibre, hidróxido de cálcio, clorexidina gel e associações como medicação intracanal (MIC) sobre Candida albicans, Enterococcus faecalis, Escherichia coli e endotoxinas em canais radiculares. Foram utilizadas 96 raízes de dentes unirradiculados que tiveram seus canais contaminados com suspensões dos microrganismos por 28 dias. Após a coleta de confirmação, os canais foram instrumentados com solução salina e divididas de acordo com a medicação intracanal utilizada: hidróxido de cálcio [Ca(OH)2] + solução salina; clorexidina gel 2% (CLX); Ca(OH)2 + CLX; própolis (PRO); PRO + Ca(OH)2; gengibre (GENG); GENG + Ca(OH)2; solução salina. Foram realizadas as seguintes coletas do conteúdo do canal radicular: coleta de confirmação (após 28 dias de contaminação), 1a coleta (imediatamente após a instrumentação), 2ª coleta (imediatamente após 14 dias da ação da MIC), 3ª coleta (7 dias após remoção da MIC). Para todas as coletas foram avaliadas: a) atividade antimicrobiana; b) quantificação de endotoxinas pelo teste cromogênico do lisado de amebócitos de Limulus. Os resultados foram submetidos aos testes estatísticos Kruskal-Wallis e Dunn (5%). Verificou-se que todas as MIC foram capazes de eliminar os microrganismos dos canais radiculares, entretanto, o Ca(OH)2 não foi capaz de eliminar completamente C. albicans e E. faecalis. Verificou-se que as MIC contendo Ca(OH)2 foram capazes de diminuir significativamente as endotoxinas dos canais radiculares, sendo semelhantes entre si e diferentes do grupo salina. As medicações CLX, PRO, GENG e salina foram semelhantes entre si. Conclui-se que todas as MIC foram capazes de eliminar os microrganismos do canal radicular e reduzir a quantidade de endotoxinas dos canais radiculares, entretanto, as MIC à base de hidróxido... / The purpose of this study was to evaluate the effectiveness of glycolic propolis and ginger extracts, calcium hydroxide, chlorhexidine gel and associations as intracanal medication (ICM) on Candida albicans, Enterococcus faecalis, Escherichia coli and endotoxins in root canals. Ninety-six roots of single-rooted teeth were contaminated with suspensions of the microorganisms for 28 days. After the confirmation collection, the canals were instrumented with saline and divided according to the intracanal medication used: calcium hydroxide [Ca(OH)2] + saline; 2% chlorhexidine gel (CLX); Ca(OH)2 + CLX; propolis (PRO); PRO + Ca(OH)2; ginger (GENG); GENG + Ca(OH)2; saline. Samples of the root canal content were performed in the following periods: confirmation collection (after 28 days of contamination), 1st collection (immediately after instrumentation), 2nd collection (immediately after 14 days of the action of ICM), 3rd collection (7 days after removal of the ICM). All samples were analyzed according to the following parameters: a) antimicrobial activity, b) quantification of endotoxins by the chromogenic Limulus amoebocyte lysate assay. The results were statistically analyzed by the Kruskal-Wallis and Dunn tests (5%). It was verified that all ICM were able to eliminate the microorganisms from the root canals; however, the Ca(OH)2 was not able to completely eliminate C. albicans and E. faecalis. It was verified that ICM containing Ca(OH)2 were able to significantly decrease endotoxins from the root canals, being similar to each other and to the saline group. The medications CLX, PRO, GENG and saline were similar to each other. It was concluded that all ICM were able to eliminate the microorganisms from the root canal and reduce the amount of endotoxins from the root canals. However, the ICM containing calcium hydroxide were more effective in neutralizing endotoxins

Submitted by ESTEBAN ISAI FLORES OROZCO null (esteban_cuacua@hotmail.com) on 2017-01-30T12:31:02Z No. of bitstreams: 1 Tese EIF Orozco 2016.pdf: 3857078 bytes, checksum: 8192b396024e2af0be54f979f7662431 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-02-02T18:44:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 floresorozco_ei_me_sjc.pdf: 3857078 bytes, checksum: 8192b396024e2af0be54f979f7662431 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-02T18:44:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 floresorozco_ei_me_sjc.pdf: 3857078 bytes, checksum: 8192b396024e2af0be54f979f7662431 (MD5) Previous issue date: 2016-12-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os objetivos do presente estudo foram: a) Verificar a carga microbiana e quantificar endotoxinas presentes nos canais radiculares de dentes com infecção endodôntica primária; b) Comparar a efetividade antibacteriana e sobre endotoxinas do preparo biomecânico com dois métodos de irrigação final: com ou sem irrigação ultrassônica passiva; c) Correlacionar sinais e sintomas com a microbiota presente e complexos bacterianos; d) Relacionar níveis de endotoxinas e carga microbiana com sinais e sintomas clinicos. Foram selecionados para o estudo 20 dentes uniradiculares, que apresentavam infecção endodôntica primária e lesão periapical, sendo estes submetidos a TCFC. Os canais foram preparados com sistema reciprocante e irrigação com NaOCl 2.5%, seguido de dois protocolos de irrigação final: com e sem uso de ultrassom. Todos os canais foram preenchidos com MIC com hidróxido de cálcio + soro fisiológico e após 14 dias foram obturados com cones de guta-percha e cimento AH Plus. Foram realizadas coletas do conteúdo do canal, logo após a abertura coronária (1ª Coleta); após PBM (2ª Coleta) e após limpeza final dos canais com NaOCl seguido de EDTA por 5 min (grupo sem PUI); ou irrigação com NaOCl + PUI e EDTA + PUI (3ª Coleta) (grupo com PUI) . Foram avaliados sinais/sintomas clínicos previo ao tratamento.O conteúdo das coletas foi analisado a partir de sondas de DNA pelo método de hibridização DNA-DNA checkerboard e foi realizado teste de avaliação da atividade antimicrobiana por cultura microbiológica. Alem disso foi realizado quantificação de endotoxinas pelo Lisado de Amebócitos de Limulus (LAL). E a volumetria dos canais foi feita através da TCFC utilizando o software Nemotec®. Os resultados foram submetidos a análise estatístico pelos testes Mann Whitney e teste ANOVA a dois fatores de medidas repetidas (5%). Valor de p < 0.05 foi considerado estatisticamente significante. Houve associação entre dor à percussão e complexos laranja principal e laranja periférico. Fístula foi associada ao complexo laranja principal e laranja periférico. Foi observada redução de bactérias após o tratamento endodôntico. Ao utilizar o método de hibridização DNA-DNA checkerboard, as bactérias mais prevalentes foram S. constellatus, E faecalis, F. nucleatum, P. gingivalis, P. melaninogenica e S. intermedius na primeira coleta. Os métodos de irrigação diminuíram número de espécies bacterianas comparado à coleta inicial. A irrigação ultrassônica passiva apresentou diferença estatística significativa sobre bactérias anaeróbias. PUI não apresento diferença significativa sobre bactérias aeróbias nem endotoxinas comparado com irrigação convencional. Concluiu-se que todos os canais apresentaram micro-organismos sendo que anaeróbios estiveram presentes em grande quantidade. Após preparo biomecânico do canal radicular e irrigação com PUI, houve redução significante da carga de micro-organismos anaeróbios. Os micro-organismos mais resistentes ao preparo biomecânico com e sem PUI foram S. constellatus , E. faecalis, S. intermedius e L. bucalis. Houve associação positiva entre sinais e sintomas clínicos com complexo laranja e com micro-organismos. Os níveis de endotoxinas diminuíram após o preparo biomecânico não foram inferenciados por PUI a irrigação convencional. / The objective of this study were: a) to check the microbial load and to quantify endotoxin present in the root canals of teeth with primary endodontic infection; b) to compare the effectiveness of bacteria and endotoxin reduction of the biomechanical preparation with final irrigation methods: with or without passive ultrasonic irrigation (PUI); c) to correlate signs and symptoms with the present microbiota and bacterial complexes; d) to relate endotoxin and microbial load levels with signs and symptoms before biomechanical preparation. Twenty single-root teeth were selected for the study, presenting primary endodontic infections and periapical lesion, which underwent CBCT. The canals were prepared with reciprocating system and irrigation with 2.5% NaOCl, followed by two final irrigation protocols: with and without ultrasound. All canals were filled with MIC with calcium hydroxide + saline and after 14 days were filled with gutta percha and AH Plus. Samples from the content of canal were harvested, after coronal opening (1st Sample); after PBM (2nd Sample) and after final cleaning of the canals with NaOCl followed by EDTA for 5 min (group without PUI); or irrigation with NaOCl + PUI and EDTA + PUI (3rd Sample) (group with PUI). The contents of the samples were analyzed from DNA probes by the DNA-DNA checkerboard hybridization method and a test was performed to evaluate the antimicrobial activity by microbiological culture. In addition, quantification of endotoxins by Limulus Amebocyte Lysate (LAL) was performed. The canal volumetry was assessed through the CBCT using Nemotec® software. The results were submitted to statistical analysis by Mann Whitney and repeated measures two-way ANOVA (5%). Value of p <0.05 was considered statistically significant. There was an association between pain at percussion and main orange and peripheral orange complexes. Fistula was associated with the main orange and peripheral orange complex. A reduction of bacteria was observed after endodontic treatment. When using the DNA-DNA checkerboard hybridization method, the most prevalent bacterias were S. constellatus, E faecalis, F. nucleatum, P. gingivalis, P. melaninogenica and S. intermedius in the first collection. Irrigation methods decreased number of bacterial species compared to initial collection. The passive ultrasonic irrigation presents statistically significant difference on anaerobic bacteria. PUI did not present significant difference on aerobic bacteria or endotoxins compared to conventional irrigation. In conclusion, all canals had microorganisms, and anaerobes were present in large quantities. The most frequent microorganisms were S. constellatus, E. faecalis, F. nucleatum SP, P. gingivalis e S. intermedius. After biomechanical preparation of root canal and irrigation with PUI, there was a significant reduction of the anaerobic microorganism load. The microorganisms most resistant to biomechanical preparation with and without PUI were S. constellatus , E. faecalis, S. intermedius e L. bucalis. There was a positive association between clinical signs and symtoms with orange complex and with microorganisms. Endotoxin levels decreased after biomechanical preparation, while not influenced by PUI in comparison to conventional irrigation.

Este estudo clínico analisou os efeitos dos procedimentos endodônticos e da irrigação ultrassônica passiva (PUI) em bactérias e endotoxinas de canais radiculares. Cinquenta pacientes com dentes com periodontite apical primária foram divididos de forma randomizada em dois grupos: PUI (n=25) e irrigação convencional (IC) (n=25). O preparo químico-cirúrgico (PQC) foi realizado com instrumentos reciprocantes, utilizando-se NaOCl 2,5% durante o preparo; e EDTA 17%, para remoção do magma dentinário. Os canais radiculares foram preenchidos com pasta de hidróxido de cálcio por 14 dias e obturados. Foram realizadas coletas microbiológicas dos canais antes (S1) e após o PQC (S2), após os protocolos de irrigação (S3), após a medicação intracanal (S4) e após a reinstrumentação dos canais (S5). Durante o processamento das amostras, as coletas de 5 casos foram perdidas por fatores diversos. As amostras foram analisadas por PCR quantitativo para detecção e quantificação de bactérias e pelo teste turbidimétrico de LAL para detecção e determinação do nível de endotoxinas. Bactérias e endotoxinas foram observadas em 100% das amostras iniciais coletadas. Em ambos os grupos, houve diminuição significativa na concentração de endotoxinas entre uma etapa do tratamento e a etapa posterior (p<0,05). O mesmo foi observado quanto ao número de bactérias, exceto entre a remoção da medicação intracanal e a reinstrumentação antes da obturação (S5). A análise intergrupos demonstrou que, com relação às endotoxinas, não foram observadas diferenças significativas entre os grupos (p>0,05). Com relação à redução bacteriana, a PUI foi capaz de reduzir significativamente mais o número de bactérias do que a IC (p<0,05). A análise qualitativa dos resultados demonstrou que nenhuma das técnicas sobressaiu-se sobre a outra em relação à frequência de casos com leituras positivas, tanto para bactérias quanto para endotoxinas. Concluiu-se que a PUI foi mais eficaz do que a IC em reduzir o número de bactérias, mas não a quantidade de endotoxinas do canal radicular. Além disso, cada etapa do tratamento endodôntico foi capaz de reduzir tanto o número de bactérias quanto a quantidade de endotoxinas. / The aim of this clinical study was to compare the effects of passive ultrasonic irrigation (PUI) and intracanal medication with calcium hydroxide in bacteria and endotoxins from root canal. Fifty teeth with apical periodontitis were randomly divided into two groups according to the irrigation protocol: PUI (n = 25) and conventional irrigation (CI) (n = 25). The root canal preparation of all the teeth was carried out with reciprocating files and 2.5% NaOCl during preparation; and 17% EDTA for smear layer removal. The root canals were medicated with calcium hydroxide for 14 days. Microbiological sampling were performed before (S1) and after the preparation (S2) after irrigation protocols (S3), and after intracanal medication (S4 and S5). During the processing of the samples, five cases were lost for several factors. The samples were analyzed by real time PCR, for the detection and quantification of bacteria, and the turbidimetric LAL assay, for the detection and analysis of the endotoxin levels. Bacteria and endotoxins were observed in 100% of the initial samples. In both groups, there was a significant decrease in the concentration of endotoxins between one step and the subsequent step of treatment (p < 0.05). The same was observed for the number of bacteria, with the exception of the reinstrumentation after the removal of the medication (S5). The intergroup analysis showed no significant differences between groups in endotoxin reduction ( p > 0.05 ). PUI was able to reduce the number of bacteria significantly better than CI (p < 0.05). No significant statistical difference was observed between groups regarding the occurrence of cases wielding positive results for bacteria or endotoxin. It was concluded that PUI was more effective than CI in reducing the number of bacteria but not the amount of endotoxin in the root canal. Furthermore, each step of the endodontic therapy was effective in reducing both the number of bacteria as the amount of endotoxin.

Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós-Graduação em Oceanografia Física, Química e Geológica, Instituto de Oceanografia, 2007. / Submitted by Cristiane Silva (cristiane_gomides@hotmail.com) on 2013-02-18T15:57:58Z No. of bitstreams: 1 2007_fabiana_gutierrez.pdf: 651273 bytes, checksum: 521f5497a65fcefafef6ef4795036615 (MD5) / Approved for entry into archive by Bruna Vieira(bruninha_vieira@ibest.com.br) on 2013-06-12T16:59:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_fabiana_gutierrez.pdf: 651273 bytes, checksum: 521f5497a65fcefafef6ef4795036615 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-12T16:59:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_fabiana_gutierrez.pdf: 651273 bytes, checksum: 521f5497a65fcefafef6ef4795036615 (MD5) Previous issue date: 2007 / Florações de cianobactérias têm sido freqüentemente encontradas nas águas do estuário da Lagoa dos Patos (RS). Um das principais cianobactérias de ocorrência local é o gênero Microcystis. As células de Microcystis têm tolerância a baixas salinidades, porém com o aumento abrupto da salinidade, as células podem sofrer lise. Muitas vezes, em função da hidrodinâmica local, essas florações de cianobactérias podem atingir a região da Praia do Cassino, possibilitando o contato com banhistas. Devido à natureza Gram-negativa da composição da parede celular das cianobactérias, esse contato com as células pode resultar em na ocorrência de casos de irritação epicutânea e reações alérgicas. O agente causador é o lipídeo A (endotoxina), encontrado no lipopolissacarídeo (LPS) da membrana externa das cianobactérias. Com o objetivo de detectar concentrações ambientais de LPS das florações de cianobactérias foi utilizado o método cromogênico cinético de ponto final do teste do Lisado do Amebócito de Limulus polyphemus (teste LAL). O teste LAL foi realizado em amostras de água de superfície coletadas nas regiões de São Lourenço do Sul, Praia do Laranjal (Pelotas), Museu Oceanográfico da FURG, Yacht Club do Rio Grande e Praia do Cassino (Rio Grande), entre os meses de dezembro de 2005 e março de 2006. Nestas amostras também foram estimados a abundância celular dos principais grupos do fitoplâncton, a concentração de clorofila-a, e medida a salinidade local no momento da coleta. Para avaliar a possível interferência dos sais nos resultados do teste LAL, também foram realizados cultivos da cianobactéria Microcystis crescendo em diferentes salinidades, onde também foram estimados a abundância celular, e as concentrações de clorofila-a, LPS e microcistinas. Os ajustes metodológicos realizados no teste LAL durante o trabalho resultaram em uma sensibilidade para sua aplicação nas amostras ambientais. As maiores concentrações de endotoxinas detectadas nas amostras ambientais (109,5 EU.mL-1, 71,8 EU.mL-1 e 93,7 EU.mL-1) se correlacionaram positivamente com as maiores abundâncias celulares (aproximadamente 600.000 células.mL-1, 400.000 células.mL-1 e 300.000 células.mL-1, respectivamente), todas com a presença da cianobactéria Microcystis. / Cyanobacterial blooms have been frequently observed in the waters of the Patos Lagoon estuary (RS). One of the main cyanobacterium of local occurrence is the genus Microcystis. The Microcystis cells present some tolerance to low salinity, but with the rapid salt increase the cells may suffer breakdown. Usually due to the local hydrodynamics these blooms may reach the recreational waters of the Cassino Beach, exposing swimming bathers to its contact. Due to the Gram-negative nature of the cyanobacterial cell membrane, this contact with the cells may result in case occurrences of epicutaneous irritation and allergic reactions. The causing agent is the lipid A (endotoxin), found on the lipopolysaccharide (LPS) of the external membrane of cyanobacteria. With the objective to detect environmental concentrations of LPS from cyanobacterial blooms, it was used the kinetic chromogenic endpoint method of the Limulus polyphemus Amebocyte Lisate test (LAL test). The LAL test was performed in surface water samples collected from the regions of São Lourenço do Sul, Laranjal Beach (Pelotas), FURG’s Oceanographic Museum, Yacht Club Rio Grande, and Cassino Beach (Rio Grande) betwen December 2005 and March 2006. In these samples it was also estimated the cellular abundance of the main phytoplanktonic groups, the chlorophyll-a concentration, and measured the local salinity. To evaluate the possible interference of salinity in the LAL test results, it was also cultivated the cyanobacterium Microcystis growing in different salinities. From these cultures it was estimate the cellular abundance, and chlorophyll-a, LPS and microcystin concentrations.. The methodological adjustments performed in the LAL test during this work resulted in a sensitivity for its application in environmental samples. The highest endotoxin concentrations detected in the environmental samples (109.5 EU.mL-1, 71.8 EU.mL-1 and 93.7 EU.mL-1) have positively correlated with the highest cell abundances (approximately 600,000 cells.mL-1, 400,000 cells.mL-1 and 300,000 cells.mL-1, respectively), all of them with the presence of the cyanobacteria Microcystis.