Visando conhecer as relações entre o ambiente da ·ilha Rasa e a população de papagaio-de-cara-roxa (Amazona brasiliensis) foram estudados alguns aspectos reprodutivos, a qualidade ambiental, a disponibilidade alimentar e o tamanho da população. Para tanto, monitorou-se a atividade reprodutiva dos ninhos localizados na ilha Rasa; verificou-se o grau de alteração da estrutura florestal mais utilizada na nidificação; verificou-se a sazonalidade das espécies vegetais utilizadas na dieta alimentar da espécie; e, utilizando método de contagem estimou-se a população que utiliza a ilha Rasa como dormitório e local de forrageamento. Obteve-se uma alta concentração de ninhos na ilha Rasa. Foram 58 ninhos localizados e 120 atividades reprodutivas monitoradas em cinco estações reprodutivas (1998 2002), indicando a relevância deste sítio reprodutivo para a espécie. A maioria dos ninhos (97%) estava em Floresta Ombrófila Densa das Terras Baixas. Como a área ocupada para nidificação vem sofrendo exploração seletiva de árvores nativas, tal atividade irá comprometer este sítio reprodutivo. Outro fator limitante da reprodução é o elevado índice de predação de ovos e filhotes. Recomendam-se ações de fiscalização preventivas para conter a retirada de espécies arbóreas e estudos de densidade populacional dos principais predadores do papagaio-de-cara-roxa para um melhor entendimento da relação predador-presa, visando propor medidas de manejo. Entre as espécies arbóreas utilizadas pelo papagaio, o guanandi deve ser considerado como uma espécie-chave. Esta espécie serve como abrigo, fornece alimento e disponibiliza cavidades propícias para a nidificação. Desta forma, recomenda-se um estudo comparado da densidade populacional do guanandi na ilha Rasa e em outras áreas de ocorrência de papagaio para avaliar se a disponibilidade dessa espécie é suficiente para a manutenção da população do papagaio-de-cara-roxa nesta ilha. Entre os itens conhecidos na dieta alimentar do papagaio-de-cara-roxa foi verificado que 43 (N=68; 63%) encontram-se nas formações vegetais da ilha Rasa. Foi possível realizar oito contatos visuais de casais ou bandos em forrageamento no período da manhã. As espécies utilizadas neste processo alimentar foram guanandi (Calophyllum brasiliense), mangue-do-mato (Clusia criuva) e caúna (Ilex sp). Concluí-se que ilha Rasa apresenta suporte alimentar para a espécie. Recomenda-se a continuidade das pesquisas de registro alimentar, além de aprofundar as observações sobre a fenologia das principais espécies utilizadas na dieta alimentar do papagaio-de-cara-roxa. Na contagem no dormitório registrou-se o menor grupo de indivíduos no mês de janeiro (150 indivíduos), o maior no mês de abril (735 indivíduos). A população que utiliza a ilha durante o dia variou entre os meses analisados, e a média estimada foi de 430 indivíduos. Recomenda-se um monitoramento constante para acompanhar tais flutuações da população de papagaio-de-cara-roxa que utiliza a ilha como dormitório e local de forrageamento. Esse estudo deve estar associado às variações sazonais e ambientais da ilha Rasa, tais como fenologia da vegetação, comportamento reprodutivo, ações antrópicas, índice de predação e variações climáticas, para se entender as variações do tamanho da população.

Los aditivos alimentarios presentan un papel importante en la industria moderna y generalmente, son empleados para preservar la calidad, características y seguridad de los alimentos. Sin embargo, la utilización inadecuada de los mismos o excediendo los límites establecidos implican un riesgo para la salud del consumidor. Debido a esto, en los últimos años, se han desarrollado un gran número de métodos analíticos para su cuantificación. Algunos de estos métodos son laboriosos y consumen tiempo de análisis, mientras que otros necesitan instrumentos de elevado costo o tienen limitaciones de sensibilidad y selectividad. En este trabajo de Tesis Doctoral se propone implementar nuevos métodos analíticos para la determinación de dichas especies en alimentos, contribuyendo así al control de calidad de los mismos. En una primera etapa, se desarrolló un sistema automatizado utilizando la metodología de análisis por inyección en flujo (FIA) con detección turbidimétrica, para la determinación de ciclamato. La reproducibilidad, velocidad de muestreo y sensibilidad obtenidas son aceptables. Su aplicación fue probada con éxito en endulzantes de mesa, gaseosas y jugos de fruta, ambos dietéticos, sin tratamiento previo de las muestras, lo que significa una ventaja adicional. El método fue validado frente al método oficial propuesto por la AOAC. Como segundo trabajo de Tesis, se desarrolló un método analítico para la determinación de sacarina y acesulfame-K, utilizando espectros de absorción molecular y calibración multivariada (PLS-1) como herramienta quimiométrica. Este método se aplicó a muestras endulzantes comerciales (líquidos y sólidos) y jugos de fruta en polvo que contenían aspartamo en su composición. Los resultados obtenidos fueron satisfactorios. El método fue validado a través del uso de muestras enriquecidas obteniéndose muy buenos porcentajes de recuperación y es una buena alternativa, para la determinación de sacarina y acesulfame-K ya que es simple, rápido y no se necesita realizar un tratamiento previo de las muestras. Posteriormente, se propuso la determinación de ácido ascórbico y azúcares totales en muestras de jugos de fruta comerciales y naturales de naranja y pomelo. Los azúcares son moléculas no absorbentes mientras que el ácido ascórbico exhibe bandas de absorción en la zona UV del espectro electromagnético. Además, estas especies presentan un comportamiento diferente cuando se las somete a radiación UV. Para llevar a cabo la determinación, se diseñó un sistema FIA donde se detecta, en una primera inyección de la muestra, el ácido ascórbico. Luego, se realiza una segunda inyección de muestra la cual es sometida a radiación UV lo cual provoca la desaparición de la señal del ácido ascórbico y la aparición de una señal debida a la oxidación de los azúcares. El método fue validado a través del uso de muestras enriquecidas obteniéndose muy buenos porcentajes de recuperación. Finalmente, se desarrolló un método analítico para la determinación de amarillo ocaso, amaranto y tartrazina empleando espectros de absorción molecular y Resolución Multivariada de Curvas optimizado con Mínimos Cuadrados Alternados (MCR-ALS), como herramienta quimiométrica. El método se aplicó a muestras de gaseosas, aguas saborizadas y bebidas hidratantes y fue validado a través de un ensayo de recuperación y mediante materiales de referencia, obteniéndose resultados satisfactorios. El método desarrollado es simple, rápido, de bajo costo y es una buena alternativa para la cuantificación de colorantes en alimentos. / Additives play an important role in the modern industry. They are used to preserve the quality, characteristics and safety of foods. Nevertheless, an inadequate use of them implies a risk for the health of the consumer. In the last years, a great number of analytical methods have been developed for quantitative determination of dyes. Some of them are laborious and time consuming, whereas others need a very expensive instrumentation or have certain limitations on sensitivity and selectivity. Thus, new analytical methods for additives determination were implemented in this Doctoral Thesis. A flow injection turbidimetric method for determination of cyclamate in low calorie soft drinks and sweeteners, without pre-treatment, was proposed. It was based on the oxidation of the sulphamic group of cyclamate, to sulphate by adding sodium nitrite. Then, a precipitate of sulphate was obtained when the barium chloride was added, in presence of poly (vinyl alcohol) (PVA) and perchloric acid medium, at 30C. The analytical signal was measured at 420 nm. A linear range between 0.015 and 0.120 % (w/v) was obtained and the calibration curve was S = (7.792 0.179) C − (0.114 0.012), R2 = 0.999. A reproducibility of 5.9 % was obtained from nine calibration graphs that were carried out during different days and in different conditions (standard solution, reagents solution, etc.). The detection and quantification limits were 0.006 and 0.02 % (w/v), respectively, the sample throughput 45 h−1 (by considering the wash cycle and the time consuming to eliminate the clean solution from the system). The obtained results agree with the obtained by the standard method. A simple and rapid analytical procedure for determination of saccharin (SAC) and acesulfame-K (AC-K) based on UV-Vis measurements and partial least squares (PLS) was proposed. Thus, an experimental design at levels 2 and 15 mg L−1 of SAC and 2 and 20 mg L−1 of AC-K were applied. Owing to the real samples usually contain SAC and AC-K combined with aspartame (ASP), this interference was also included in the model. The procedure for simultaneous determination of SAC and AC-K in sweeteners and fruit juice powders, without any separation step to remove ASP, was successfully applied. The method was validated by using spiked samples, and the obtained recoveries were satisfactory. A FIA method for determination of ascorbic acid and total sugars was developed. This method was based on the different behaviors of the analytes when they were submitted to UV radiation. The flow-injection system includes a simple ultraviolet photoreactor for the on-line photodegradation of the analytes. The first injection of the sample was for ascorbic acid determination at 300 nm. Then a second injection of the sample was exposed to the UV light for five minutes in order to determine total sugars at 268 nm and the absorption band of ascorbic acid disappeared for action of the radiation. The proposed method was used for the determination of ascorbic acid and total sugars in commercial and natural fruit juices samples. The method was validated by using spiked samples with recoveries in the range 96.4 and 108.3 % for ascorbic acid and 91.0 and 113.2 % for total sugars. Finally, an analytical method for Sunset Yellow, Amaranth and Tartrazine determination, based on UV-Vis measurements and Multivariate Curve ResolutionAlternating Least Squares (MCR-ALS), was proposed. The method was applied to soft drinks, flavored waters and energy drinks. The method was validated by preparing reference samples in the laboratory and its concentration was determining by High Performance Liquid Chromatography (HPLC). The developed method is simple, fast and inexpensive; it is a good alternative for determining dyes in foods.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / En este trabajo se inicia un banco genético del gato güiña (Oncifelis guigna), felino endémico de Chile y Argentina en peligro de extinción. Líneas de células fibroblásticas obtenidas desde una biopsia dérmica extraída de la oreja de un ejemplar güiña y cultivada bajo condiciones adecuadas de temperatura y CO2, fueron congeladas con nitrógeno líquido (-196ºC), permitiendo preservar su información genética para futuras investigaciones en clonación heteroespecífica como alternativa biotecnológica para la reproducción de especies en peligro. Además, la sobrevida y proliferación celular de cultivos fibroblásticos de tres gatos domésticos (Felis domesticus), especie en la que ya se han logrado crías viables por medio de estas técnicas, son comparados con el cultivo del gato güiña, determinando así la factibilidad de su uso en el medio nacional. Se describe el cariotipo de la güiña muestreada, aportando con información no disponible para la especie y de valor en una segunda etapa experimental.

Memoria para optar al título de Geógrafo / Los extensos registros de presencia de especies arbóreas al exterior del territorio chileno, presentan una oportunidad para desarrollar metodologías que implican el uso de diversas bases de datos extranjeras de registros de especies. En la presente investigación se analizan y modelan los patrones de distribución espacial de las especies arbóreas presentes en los territorios de Chile y Argentina, evaluando el grado de protección (representatividad) de estas en las áreas protegidas del territorio chileno. A partir de la creación de una base de datos actualizada de registros de presencia, en conjunto con un set de variables bioclimáticas, fueron elaborados diversos modelos de distribución de especies, mediante la técnica Maxent; que permiten tanto una caracterización descriptiva de la distribución potencial, como la evaluación de la representatividad, de las especies arbóreas consideradas. Los resultados obtenidos permiten establecer una clara diferencia entre modelar con registros en ambos países, es decir, tomando en cuenta el rango total de distribución de las especies, y por lo tanto, reflejando de forma más completa el nicho ecológico de estas, en desmedro de los modelos basados en una división político-administrativa, que restringen la distribución considerablemente. Además, los modelos integrados, presentarían más altos índices de representatividad, ya que consideran zonas limítrofes que los modelos restringidos no alcanzan a incorporar, debido a sus limitaciones. A pesar de esto, se identifican algunas especies arbóreas, la mayoría en categorías de amenaza, por debajo de la meta de conservación, lo que reafirma las deficiencias existentes en el actual sistema de áreas protegidas en Chile.

Orientador: Celso Luis Marino / Coorientador: Douglas Silva Domingues / Banca: Ivan de Godoy Maia / Banca: Marie-Anne Van Sluys / Banca: Maria Lucia Carneiro Vieira / Banca: Nathalia de Setta Costa / Resumo: Os retrotransposons com LTR (long terminal repeats) (LTR-RTEs) são os componentes mais abundantes nos genomas vegetais. Eles são divididos em duas superfamílias, Copia e Gypsy, de acordo com a ordem dos domínios internos e com a similaridade das sequências. São conhecidos pela sua natureza ubíqua e plasticidade, o que os leva a serem explorados como ferramentas para o desenvolvimento de marcadores moleculares, utilizando-se assim o padrão de inserção dos LTR-RTEs para geraçã o de polimorfismos. As famílias de LTR-RTEs apresentam número de cópias variável dentro de um mesmo genoma, mas a amplificação de poucas famílias pode contribuir com grandes diferenças de tamanho entre genomas próximos. Em plantas do gênero Eucalyptus existem poucos estudos relacionados aos LTR-RTEs, que geralmente limitam-se a análises em bancos de dados privados. Este trabalho tem como objetivo a caracterização de LTR-RTEs transcricionalmente ativos pertencentes as superfamílias Copia e Gypsy, encontrados no genoma de eucalipto. A partir de análises preliminares de bioinformática, um total de nove famílias de LTR-RTEs foram identificadas; os elementos da superfamília Copia foram classificadas em cinco linhagens e elementos da superfamília Gypsy foram divididos em três linhagens. As análises in silico no genoma draft de Eucalyptus grandis identificaram que as famílias caracterizadas possuem entre 38 e 290 cópias. Os LTR-RTEs foram utilizados para o desenvolvimento de marcadores moleculares IRAP, REMAP e RBIP, que foram avaliados em cinco espécies de eucalipto. Dezesseis primers IRAP foram avaliados e um total de 1521 fragmentos foram gerados, com 321 fragmentos polimórficos, em um intervalo de 250 a 2500 bp e uma média de 19,01 fragmentos amplificados por primer. Vinte e oito combinações de primers REMAP foram avaliadas e geraram 1910 fragmentos, dos quais 492 são polimórficos, em um intervalo de 200 a 1250 bp, com uma média de ... / Abstract: Long Terminal Repeat Retrotransposons (LTR-RTEs) are the most abundant component of plant genomes. They are divided into two superfamilies, Copia and Gypsy, based on coding domain order and sequence similarity. As dynamic and ubiquitous entities in plant genomes, marker systems based in LTR-RTEs were developed to exploit LTR-RTEs insertion pattern polymorphism. In most angiosperm genomes, LTR-RTEs families have a wide range of copy number, but the amplification of a few families individually contribute to a large fraction of the genome. LTR-RTEs were scarcely studied in the Eucalyptus genus, with most findings derived from global analyses of private genomic databases. The aim of this work is to characterize transcriptionally active Copia and Gypsy LTR-RTEs in Eucalyptus sp genomes. After preliminary bioinformatics analyses, a total of 9 full-length LTR-RTEs families were classified into five Copia and three Gypsy lineages. BLAT analysis in Eucalyptus grandis draft genome identified that these elements have between 38 and 290 copies. These LTR-RTEs were used to develop IRAP, REMAP and RBIP markers, which were evaluated in five Eucalyptus species (Eucalyptus brassiana, E. grandis, Eucalyptus saligna, Eucalyptus tereticornis and Eucalyptus urophylla). Sixteen IRAP primers produced 321 polymorphic fragments from a total of 1521 bands, ranging from 250 to 2500 bp, with an average of 19.01 bands amplified per IRAP primer. Twenty-eight REMAP primer combinations produced 1910 bands. 492 of them were polymorphic, ranging from 200 to 1250 bp. An average of 13.64 REMAP bands was scored per primer. Our results showed that the genetic similarity assessed by both IRAP and REMAP markers did not reflect molecular phylogenetic analysis. Nonetheless, these markers are useful for the assessment of genetic diversity the individual level and population analysis. We developed RBIP markers for three site-specific ... / Doutor

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Memoria para optar al Título Profesional de Ingeniero en Recursos Naturales Renovables / Las especies exóticas invasoras (EEI) son aquellas que estando fuera de su rango de distribución, producen daños económicos, ambientales, y/o a la salud. Cuando una EEI avanza, la posibilidad de control se reduce, ya que costos e impactos aumentan. Así, un sistema de bioseguridad para prevenir las EEI es la medida más costo-efectiva para manejar esta problemática. Se desarrolló un estudio en el Archipiélago Juan Fernández (AJF) para evaluar la introducción potencial de especies exóticas (EE) y elaborar recomendaciones para su prevención. Mediante entrevistas semi-estructuradas a representantes del sector privado, se describieron rutas de ingreso potencial de determinadas EE y se estimó su riesgo de introducción a través de un índice. De manera paralela, se diagnosticó el conocimiento sobre la biodiversidad del AJF en el sector transporte y turismo, y finalmente se elaboraron recomendaciones para prevenir la introducción de EE. Se identificaron nueve puntos de conexión aérea y marítima hacia el AJF. Dos navieras presentaron el mayor riesgo de introducir EE. Chaqueta amarilla (Vespula germanica), caracoles, y plantas (semillas) arrojaron el mayor riesgo de ser introducidos, principalmente debido a su baja detectabilidad y/o abundancia en el origen de las rutas de transporte. Representantes de empresas de turismo y transporte demostraron reconocer varias especies endémicas y valorar aquellas que implican ingresos económicos e identidad local. Reconocieron las EEI como la principal amenaza para la conservación, y la mayoría participaría de capacitaciones sobre los impactos y gestión de las EEI. Las recomendaciones propuestas avanzarían principalmente el fortalecimiento de marcos legales e institucionales, y el incremento de conciencia ciudadana y compromisos del sector público. A partir de los resultados se concluye que: 1) existe un desafío en describir más detalladamente el flujo de bienes hacia el archipiélago y entre islas; 2) la calificación del riesgo de introducción de EE mediante un índice es útil para estandarizar los diagnósticos sobre este tema, y priorizar acciones para EE específicas; 3) el conocimiento sobre la biodiversidad debe fortalecerse en relación a los impactos de EEI; 4) las recomendaciones propuestas deben implementarse de manera complementaria, inter-institucional y con el sector privado.

Las deficiencias nutricionales de las presas vivas usadas como primer alimento exógeno en el cultivo de larvas de peces marinos hacen necesaria la suplementación de las dietas con nutrientes que satisfagan los requerimientos de las larvas. Los liposomas constituyen una herramienta con gran potencial ya que pueden formularse con nutrientes hidrosolubles disueltos en su fase acuosa y liposolubles inmersos en el ambiente lipofílico entre las cadenas de ácidos grasos de los fosfolípidos. Este estudio valora el empleo de liposomas para suministrar nutrientes a larvas de peces marinos a través de dos vías. La primera plantea la vehiculación de nutrientes a larvas de peces a través de la bioencapsulación de liposomas ricos en nutrientes esenciales en nauplios de Artemia. La segunda alternativa está relacionada con la administración directa a las larvas mediante inmersiones de éstas en suspensiones de liposomas ricos en nutrientes. Liposomas como enriquecedores de ArtemiaEl estudio se inicia con un análisis preliminar sobre la integridad de los liposomas en condiciones de enriquecimiento de Artemia. Los resultados indican que los liposomas liberan parte de las sustancias disueltas en su fase acuosa interna. En cuanto a la estabilidad química, los resultados muestran que los liposomas son menos susceptibles a la peroxidación que otros enriquecedores convencionales. Por último, el estudio sobre el cambio de tamaño de los liposomas durante el enriquecimiento indica que no muestran alteraciones importantes que puedan comprometer su rendimiento como producto enriquecedor.A la vista de estos resultados preliminares, se escogieron unas formulaciones de liposomas para su utilización en el enriquecimiento de Artemia en ácidos grasos esenciales (EFAs), vitaminas (A y C) y aminoácidos. La mejora del contenido en EFAs de nauplios de Artemia se llevó a cabo con liposomas formulados con fosfolípidos marinos. Los resultados muestran que estos liposomas pueden igualar los contenidos de EFAs de los nauplios enriquecidos con productos comerciales de uso habitual. Además, se presenta un protocolo óptimo de utilización para maximizar los niveles de EFAs en los nauplios.Como ya se ha comentado anteriormente, los liposomas poseen una estructura que permite la inclusión, junto a los fosfolípidos, de otros nutrientes esenciales como las vitaminas y los aminoácidos. Los resultados revelan la capacidad de liposomas para aumentar el contenido en vitamina A de los nauplios. En cuanto a la vehiculación de nutrientes hidrosolubles, los experimentos realizados muestran que los liposomas unilamelares tienen una escasa eficacia enriquecedora en este tipo de sustancias. No obstante, los liposomas de tipo multilamelar exhibieron una mayor eficacia logrando aumentar los niveles de metionina (hidrosoluble) libre de los nauplios en comparación a nauplios tratados con metionina simplemente disuelta.El estudio sobre la utilización de liposomas como enriquecedores de Artemia se completa con la realización de experimentos de alimentación larvaria. Estos ensayos demuestran la posibilidad de utilizar nauplios enriquecidos con liposomas como alimento de larvas de peces marinos sin que se observen diferencias en la supervivencia y el crecimiento obtenidos con respecto a tratamientos con un producto comercial de eficacia contrastada.Suministro directo de nutrientes a larvas mediante liposomasSe realizaron inmersiones de larvas de peces con liposomas ricos en nutrientes esenciales. Los resultados evidencian la posibilidad de tratar larvas de peces marinos con liposomas formulados con nutrientes esenciales de naturaleza diversa sin detrimento de la supervivencia de los animales. Sin embargo, la utilidad de esta vía de administración de nutrientes no ha sido demostrada a pesar de los numerosos mecanismos de interacción larva-liposoma implicados. La utilización de nutrientes marcados, así como la determinación de índices de condición nutricional que constaten las ventajas nutricionales derivadas de la incorporación de los nutrientes liposomados, se vislumbran como líneas futuras de investigación. / Nutritional deficiencies of live preys used as first exogenous feeding in the rearing of marine fish larvae make necessary the supplementation of the diets with certain nutrients in order to fulfill the requirements of the fish. In most cases, larval nutrition studies have been focused on the essential fatty acid demands, but other compounds as phospholipids, vitamins and free amino acids have been proposed as crucial elements in the early development stages of several species of marine fish. The present study assesses the use of liposomes, phospholipid vesicles enclosing an internal aqueous space, for the delivery of both lipophilic and hydrophilic nutrients to marine fish larvae. Two different administration ways were studied. Firstly, liposomes were used as an enrichment product of live preys. Secondly, a direct system was assessed by immersing marine fish larvae in liposome suspensions.Bioencapsulation of liposomes in Artemia naupliiSeveral liposome formulations were employed for the enrichment of Artemia nauplii in some essential nutrients such as fatty acids, vitamins and amino acids. Liposomes formulated with marine phospholipids demonstrated the improvement of the essential fatty acid content in the nauplii, and an optimal protocol of use with this product was established. Additionally, our results showed that liposomes are useful tools for the enrichment of Artemia in both liposoluble (vitamin A) and hydrosoluble compounds (methionine).Immersion of marine fish larvae in liposome suspensionsA novel technique to transfer nutrients to fish larvae consists of the immersion of larvae in liposomated substances, obviating their bioencapsulation in the live preys and avoiding their consequent metabolic activity over the administered substances. Several studies were carried out with the purpose of detecting the incorporation of lipophilic (EFA) and hydrophilic (ascorbate and methionine) nutrients into marine larvae by means of liposome baths. Results would indicate a low entry of liposomated nutrients into the larvae, although analyses seem to reflect slightly higher average contents of EFA and ascorbate nutrient in larvae treated with liposomes compared to control non-treated larvae. These results could be confirmed optimizing the experimental designs.

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-28Bitstream added on 2015-03-03T12:06:25Z : No. of bitstreams: 1 000807323_20160228.pdf: 863780 bytes, checksum: f9edab5c1d353f33385731e8fc06aa46 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-29T12:16:26Z: 000807323_20160228.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-29T12:17:25Z : No. of bitstreams: 1 000807323.pdf: 3263368 bytes, checksum: e50d8228791f0d071b3e2c640b0eefa9 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Os retrotransposons com LTR (long terminal repeats) (LTR-RTEs) são os componentes mais abundantes nos genomas vegetais. Eles são divididos em duas superfamílias, Copia e Gypsy, de acordo com a ordem dos domínios internos e com a similaridade das sequências. São conhecidos pela sua natureza ubíqua e plasticidade, o que os leva a serem explorados como ferramentas para o desenvolvimento de marcadores moleculares, utilizando-se assim o padrão de inserção dos LTR-RTEs para geraçã o de polimorfismos. As famílias de LTR-RTEs apresentam número de cópias variável dentro de um mesmo genoma, mas a amplificação de poucas famílias pode contribuir com grandes diferenças de tamanho entre genomas próximos. Em plantas do gênero Eucalyptus existem poucos estudos relacionados aos LTR-RTEs, que geralmente limitam-se a análises em bancos de dados privados. Este trabalho tem como objetivo a caracterização de LTR-RTEs transcricionalmente ativos pertencentes as superfamílias Copia e Gypsy, encontrados no genoma de eucalipto. A partir de análises preliminares de bioinformática, um total de nove famílias de LTR-RTEs foram identificadas; os elementos da superfamília Copia foram classificadas em cinco linhagens e elementos da superfamília Gypsy foram divididos em três linhagens. As análises in silico no genoma draft de Eucalyptus grandis identificaram que as famílias caracterizadas possuem entre 38 e 290 cópias. Os LTR-RTEs foram utilizados para o desenvolvimento de marcadores moleculares IRAP, REMAP e RBIP, que foram avaliados em cinco espécies de eucalipto. Dezesseis primers IRAP foram avaliados e um total de 1521 fragmentos foram gerados, com 321 fragmentos polimórficos, em um intervalo de 250 a 2500 bp e uma média de 19,01 fragmentos amplificados por primer. Vinte e oito combinações de primers REMAP foram avaliadas e geraram 1910 fragmentos, dos quais 492 são polimórficos, em um intervalo de 200 a 1250 bp, com uma média de ... / Long Terminal Repeat Retrotransposons (LTR-RTEs) are the most abundant component of plant genomes. They are divided into two superfamilies, Copia and Gypsy, based on coding domain order and sequence similarity. As dynamic and ubiquitous entities in plant genomes, marker systems based in LTR-RTEs were developed to exploit LTR-RTEs insertion pattern polymorphism. In most angiosperm genomes, LTR-RTEs families have a wide range of copy number, but the amplification of a few families individually contribute to a large fraction of the genome. LTR-RTEs were scarcely studied in the Eucalyptus genus, with most findings derived from global analyses of private genomic databases. The aim of this work is to characterize transcriptionally active Copia and Gypsy LTR-RTEs in Eucalyptus sp genomes. After preliminary bioinformatics analyses, a total of 9 full-length LTR-RTEs families were classified into five Copia and three Gypsy lineages. BLAT analysis in Eucalyptus grandis draft genome identified that these elements have between 38 and 290 copies. These LTR-RTEs were used to develop IRAP, REMAP and RBIP markers, which were evaluated in five Eucalyptus species (Eucalyptus brassiana, E. grandis, Eucalyptus saligna, Eucalyptus tereticornis and Eucalyptus urophylla). Sixteen IRAP primers produced 321 polymorphic fragments from a total of 1521 bands, ranging from 250 to 2500 bp, with an average of 19.01 bands amplified per IRAP primer. Twenty-eight REMAP primer combinations produced 1910 bands. 492 of them were polymorphic, ranging from 200 to 1250 bp. An average of 13.64 REMAP bands was scored per primer. Our results showed that the genetic similarity assessed by both IRAP and REMAP markers did not reflect molecular phylogenetic analysis. Nonetheless, these markers are useful for the assessment of genetic diversity the individual level and population analysis. We developed RBIP markers for three site-specific ...

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario. / El visón americano (Neovison vison) es un mustélido introducido en Chile en la década de 1930, y actualmente se encuentra distribuido entre la Región de la Araucanía y la Región de Magallanes. En el Santuario de la Naturaleza Carlos Anwandter (SNCA), esta especie aparece mencionada hace más de 15 años, sin embargo, no han existido estudios que permitan dilucidar los posibles impactos predatorios del visón en tal área protegida. Con este objetivo se monitorearon 19 sitios a lo largo de todo el Santuario durante los años 2014 y 2016, entre los meses de agosto y enero, recopilando heces del visón e identificando los fragmentos de sus presas. Además, en el caso de las aves, las plumas encontradas al interior de las heces del visón fueron manipuladas según el método de Day (1966) para confirmar la presencia del cisne de cuello negro en la dieta de este mustélido. A su vez las presencias de heces con aves, sirvieron para determinar a través de modelos lineales generalizados (regresión logística), qué variables espaciales y temporales predicen mejor el consumo de aves por parte del visón americano en el SNCA. Se recopilaron un total de 455 heces de visón, mostrando una variación significativa en los dos años de monitoreo, con un aumento en el consumo de presas terrestres en la segunda temporada (2 = 12,589; g.l. = 4; p = 0,01347). También hubo variación estacional, consumiendo más mamíferos en invierno, y más crustáceos en primavera-verano (2 = 27,066; g.l. = 8; p < 0,001), y variación espacial, con diferencia en la dieta en los distintos sectores de la unidad (2 = 76,448; g.l. = 16; p < 0,001). Se confirmaron 19 presencias de cisne de cuello negro en las heces del visón, representando sólo el 3,3% del total de presas. Sin embargo, esto pudo deberse a un sesgo en el método diagnóstico que no permitió tener una óptima sensibilidad en el resultado. El modelo que mejor predice el consumo de aves por parte del visón, es el que incluye la mayor abundancia de aves en los distintos sectores del SNCA y la mayor cobertura de totorales en un área de 1000 metros de radio desde el sitio de muestreo Los nidos y polluelos contabilizados tuvieron poco valor predictor. Con estos resultados, se pretende colaborar en la gestión del SNCA, identificando los sectores más críticos a la depredación de aves y así colaborar en el control de esta especie introducida en esta área silvestre protegida (ASP) de una manera más efectiva / The American mink (Neovison vison) is a mustelid introduced in Chile in the 1930’s, and at present is distributed between the Araucania and Magallanes regions. In the Carlos Anwandter Nature Sanctuary (SNCA) this species was first reported more than 15 years ago, but at present no studies about mink predatory impact upon biodiversity exist in this protected area. To determine the mink diet in the Sanctuary and the effect of different variables we monitored 19 sites in the Sanctuary during two years between August and January, collecting mink scats and identifying prey presence. In the case of birds, feathers detected in the scats were analyzed to confirm the presence of the Black-necked swan (Cygnus melancoryphus) by using the Day method (1966). We tested of presence of bird prey on mink’s diet presented spatial and temporal variation by using generalized linear models (logistic regressions) and Akaike information criterion (AICc). We collected 455 total scats of American mink in the Sanctuary observing a significant variation between the two years of study, detecting a higher consumption of aquatic and semi-aquatic preys during the first year, and an increased a consumption of terrestrial preys in the second year (2 = 12,589; g.l. = 4; p = 0,01347). We also observed a seasonal variation with a higher mammals diet presence during winter, and more consumption of crustaceans during spring-summer (2 = 27,066; g.l. = 8; p < 0,001), and spatial variation, with shifts in the diet through the distinct sectors of the unit (2 = 76,448; g.l. = 16; p < 0,001). From all mink scats analyzed, we only confirmed 19 presence of Black-necked swan representing 3,3% of the total preys. Nevertheless, this low value could be due to a low sensitivity of the detection method used to identify at a fine-scale level of bird species. The best model to predict the presence of birds in mink scats was positively associated to the abundance of birds at the mink scat location and a higher cover of emergent vegetation in an area of 1000m. ratio from the site of scat collection. The number of nests and chicks presented a low predictor value. Based in our results, we identified important recommendations for mink management of the Sanctuary and the control of the predatory impact of the mink in waterfowl birds