Thèse ou mémoire avec insertion d'articles / La manière historique de prouver l'efficacité d'un taureau repose principalement sur ses filles reproductrices, ce qui prend généralement plusieurs années avant de savoir s'il s'agit d'un taureau d'élite ou non. Cette situation bénéficierait de notre capacité à identifier des marqueurs prédictifs dès le plus jeune âge des taureaux. La recherche de biomarqueurs pour l'amélioration/prédiction de la fertilité des vaches laitières est un trait économique important. La méthylation de l'ADN et le petit ARNs non-codant dans le spermatozoïdes ont été signalés comme étant hérités par la progéniture et le phénotype spécifique intermédiaire. Par conséquent, le modèle de méthylation de l'ADN et le petit ARN non codant dans les gamètes mâles sont peut-être corrélés avec le phénotype du taureau et pourraient également être hérités par la progéniture, nous émettons donc l'hypothèse que la méthylation de l'ADN et le petit ARN non codant dans le sperme du taureau sont associés à la fertilité du taureau et pourraient également être transmis à la future fille via la fécondation, influençant ainsi la fertilité de la fille. Pour identifier les épi-biomarqueurs associés à la fertilité et valider notre hypothèse, nous avons utilisé la plateforme de séquençage de nouvelle génération (NGS) et nous avons comparé le spermatozoïdes de taureau en fonction de l'indice de fertilité du taureau et de l'indice de fertilité de la fille, qui pourraient être utilisés comme critères de phénotype de fertilité. Nous avons déterminé les taureaux ayant une fertilité élevée par rapport à ceux ayant une fertilité plus faible et les filles ayant une fertilité élevée par rapport à celles ayant une fertilité plus faible. Nous avons ensuite utilisé leur spermatozoïdes pour une analyse NGS et avons identifié la méthylation de l'ADN et les petits ARN non codants qui sont associés à la fertilité des taureaux et des filles. Au total, 450 et 252 sites 5'-Cytosine-phosphate-Guanine-3' (CpG) différentiellement méthylés ont été sélectionnés pour être associés à la fertilité des taureaux et des filles, respectivement. Les 10 DMRs les plus significatifs en corrélation avec la fertilité du taureau et la fertilité de la fille ont également été examinés en fonction du classement de la valeur P et du seuil de différence de méthylation. Plus intéressant encore, 67 gènes présentant au moins une région différentiellement méthylée ont été identifiés comme se chevauchant entre la fertilité du taureau et la fertilité de la fille. Parmi ces gènes, les groupes de gènes les plus enrichis sont les familles de récepteurs gustatifs et olfactifs nés dans le sperme, y compris OR5M9, OR8K64, OR7A126 et TAS2R1, qui ont été signalés comme étant impliqués dans la fécondation ou interaction spermatozoïde-ovocyte. En outre, 12 tsRNA nés dans le sperme (11 régulés à la baisse, 1 régulé à la hausse) étaient liés à la fertilité des taureaux et 19 tsRNA (11 régulés à la baisse, 8 régulés à la hausse) étaient liés à la fertilité des filles (q +1.5, moyenne de base>50). En outre, 6 miARN nés dans le sperme (2 régulés à la hausse, 4 régulés à la baisse) et 35 miARN (27 régulés à la hausse, 8 régulés à la baisse) sont corrélés avec la fertilité des taureaux et la fertilité des filles séparément (p50, log2 foldchange >+1. 5), deux miARN (miR-2385-5p (régulé à la baisse) et miR-98 (régulé à la hausse)) sont significativement associés (p50, changement log2fold>+1,5) à la fertilité des taureaux et des filles. En conclusion, la méthylation de l'ADN et les petits ARN non codants associés à la fertilité des bovins dérivés du sperme ont été identifiés et ont un grand potentiel pour être utilisés dans la prédiction de la fertilité des bovins, fournissant un outil d'élevage complémentaire aux réalisations génétiques existantes. Par ailleurs, cette étude apporte également de nouvelles connaissances sur l'héritage épigénétique paternel intergénérationnel chez les animaux domestiques / The historical way to prove a bull mainly relies on their siring daughters, which usually takes several years to know whether they are an elite bull or not. This situation would benefit from our ability to identify predictive markers in bulls’ early age. As an important economic trait, searching biomarkers for dairy cattle fertility improvement/prediction is meaningful. Sperm-born DNA methylation and small non-coding RNA had been both reported to be inherited by the offspring and intermediate specific phenotype. Therefore, the DNA methylation pattern and small non-coding RNA in male gametes are possibly correlated with the bull phenotype and might also be inherited by the offspring, so we hypothesize that the DNA methylation and small non-coding RNA in bull sperm are associated with bull fertility, and also might be able to pass to the future daughter via fertilization, therefore, influence the daughter fertility. To identify fertility-associated epi-biomarkers and validate our hypothesis, we used the Next generation sequencing (NGS) platform, and we contrasted bull semen by the bull fertility index and daughter fertility index, which could be used as the fertility phenotype criteria. We classified the bulls with high vs. low fertility and high daughter vs. low daughter fertility. Then we used their semen for NGS analysis and identified DNA methylation and small noncoding RNA that are associated with bull and daughter fertility. In total, 450 and 252 differentially methylated 5'—Cytosine—phosphate—Guanine—3' (CpG) sites had been screened to be associated with bull and daughter fertility, respectively. The top 10 significant bull fertility and daughter fertility correlated Differentially methylated regions (DMRs) were also screened according to P-value ranking and methylation difference threshold. More interestingly, 67 genes that present at least one differentially methylated region were identified to overlap between bull fertility and daughter fertility. Among these genes, the most enriched gene clusters are the sperm-born taste and olfactory receptors families, including OR5M9, OR8K64, OR7A126, and TAS2R1, which had been reported to be involved in sperm-oocyte interactions. Besides, 12 sperm–born tsRNAs (11 down-, 1 upregulated) were linked to bull fertility and 19 tsRNAs (11 down-, 8 up-regulated) were linked to daughter fertility (q+1.5, base mean>50). Furthermore, 6 sperm-born miRNAs (2 up, 4 down-regulated) and 35 miRNAs (27 up, 8 down-regulated) are correlated with bull fertility and daughter fertility separately (p50, log2foldchange>+1.5), two miRNAs (miR-2385-5p (down-regulated) and miR-98 (up-regulated)) are significantly associated (p50, log2foldchange>+1.5) with bull and daughter fertility. In conclusion, sperm-derived bovine fertility-associated DNA methylation and small noncoding RNAs have been identified, which have great potential to be used for cattle fertility prediction, providing a complementary breeding tool to the existing genetic achievements. Meanwhile, this study also contributes new knowledge to the paternal epigenetic intergenerational inheritance in domestic animals.

En 2014, la Belgique a fêté les 50 ans de l'accord bilatérale entre la Belgique et le Maroc qui organisait les migrations de travailleurs marocains afin de faire face au manque de main d'œuvre belge, principalement pour le travail dans les mines. De migration temporaire en regroupement familial, la population d'origine marocaine est aujourd'hui l'une des minorités ethniques les plus importantes du pays. Dans un contexte où l’intégration des populations immigrées et issues de l’immigration occupe une place importante dans le débat public en Europe occidentale, les comportements de fécondité de ces populations sont un indicateur, parmi d’autres, d’une potentielle intégration. On entend beaucoup de préjugés sur la fécondité des étrangers, mais quels sont réellement les comportements de fécondité des populations d’origine marocaine en Belgique ?Quels sont les facteurs sociaux et contextuels qui expliquent la convergence ou non de ces comportements avec ceux de la population locale de référence ?C’étaient les questions de départ de ce travail et la réalité s’est avérée nettement plus complexe que le préjugé « les étrangers font beaucoup d’enfants ».Premièrement, ce travail confirme que la cause des écarts de fécondité entre les populations d’origines différentes est principalement sociale et non culturelle. Dès lors, la prise en compte des caractéristiques socio-économiques dans l’analyse de la fécondité des populations immigrées ou issues de l’immigration est indispensable. Deuxièmement, la temporalité des évènements aboutissant à la constitution de la famille est déterminante sur le nombre d’enfants réalisés à terme. Que ce soit à travers l’âge à la migration pour les individus de première génération ou l’âge au mariage pour la deuxième génération, la temporalité des évènements semble jouer un rôle majeur sur le modèle familial qu’un individu voudra reproduire. En effet, dans un contexte migratoire où l’individu est confronté à des modèles familiaux contradictoires, cette temporalité tend à avantager une ou plusieurs sources de socialisation par rapport à d’autres. Par conséquent, la diversité des temporalités vécues observée au sein de la population d’origine marocaine entraine une hétérogénéité en terme de nombre d’enfants particulièrement forte pour cette population.Troisièmement, une différence de fécondité existe entre la population marocaine vivant dans l’agglomération anversoise en celle vivant à Bruxelles. Les grandes familles (quatre enfants et plus) sont plus fréquentes à Anvers. Cela serait lié à l’origine plus souvent rurale de la diaspora marocaine vivant dans cette agglomération. Par ailleurs, la recherche s’est également intéressée à l’effet de quartier sur l’hétérogénéité des comportements de fécondité afin d’apporter des réponses documentées à la question de l’impact de la concentration géographique au centre des débats sur la mixité, sociale et culturelle, supposée améliorer la coexistence de populations d’origines différentes et surtout favoriser l’ascension sociale et l’« intégration » des populations étrangères défavorisées. Les modèles multiniveaux développés dans la thèse ne peuvent rejeter cette hypothèse car les variables contextuelles ont un effet significatif. Toutefois, l’effet de quartier est extrêmement réduit et est, surtout, nettement inférieur à un quelconque effet de la situation socio-économique de la personne. D’autant plus que les entretiens menés avec des femmes de deuxième génération marocaine ont mis en évidence la faiblesse des contacts sociaux dans le voisinage, quel qu’il soit. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Dans les troupeaux laitiers, le succès de l'insémination artificielle dépend, en grande partie, de la qualité de la semence. D est important de disposer de techniques analytiques fiables permettant d'évaluer la qualité de la semence. Actuellement, aucun paramètre pris isolément n'est corrélé de façon satisfaisante à la fertilité. L'évaluation multiparamétrique de la semence est une option intéressante pour améliorer l'efficacité des tests de fertilité. Ce mémoire porte sur la caractérisation, via la cytometric en flux, des spermatozoïdes bovins cryopréservés. Différents paramètres ont été étudiés tels que la viabilité, l'activité mitochondriale, l'intégrité de la membrane acrosomale, le pH intracellulaire, le Ca2+ intracellulaire et celui emmagasiné dans la cellule. Ces paramètres ont été évalués postdécongélation et suite à cinq heures d'incubation en présence ou non d'héparine comme inducteur de la capacitation. Pour chacune des conditions, on a étudié les effets et les interactions de chacun des paramètres et leur relation avec la fertilité in vivo.

Thèse diffusée initialement dans le cadre d'un projet pilote des Presses de l'Université de Montréal/Centre d'édition numérique UdeM (1997-2008) avec l'autorisation de l'auteur. / In spite of considerable research on Kenya’s fertility, questions remain. This dissertation examines three of these issues - the national and sub-national trend patterns in the country’s fertility and related proximate determinants, factors in the transitions to second and third conceptions, and the determinants of contraceptive use. Results, presented below, are based upon data which comprised five sample surveys conducted between 1977 and 2003 among women of reproductive age, as well as a community and health facility survey implemented in 1999. First, an exploratory analysis of trends in fertility and its proximate determinants shows that a pattern of later family formation and of a higher level of fertility control is associated with the more modernized and developed regions (urban areas and rural Central Province). Secondly, using survival analysis, the relative hazards of transition to the second and third conceptions for the 12-year periods during which fertility fell rapidly (1977-1989) and the pace of decline reduced (1991-2003) are compared. Among the findings, although child survival has significant effects during both periods, its influence is more pronounced during the recent period. Thirdly, multivariate analysis of the determinants of contraceptive use shows that motivation for fertility control is significant, while access to family planning services is not. That proximity to family planning services might nevertheless be important is shown by the significance of exposure to family planning messages, many of which are often communicated from the health facilities. This dissertation makes contributions in three areas. One, it confirms the dichotomy in the pattern of fertility change and its proximate determinants in the country, not so much along the usual rural-urban separation, but rather between urban areas and rural Central versus the rest of rural Kenya. Two, it shows that the decreased pace of the fertility transition in Kenya, including constant fertility over 1998-2003, might be associated with the rise in infant and child mortality since the 1990s. Three, it shows the significance of education, motivation for fertility control, and exposure to media messages about family planning in contraceptive use, thereby pointing out where policy and program effort should be directed in order to sustain the fertility transition. / Malgré de nombreuses études consacrées à la problématique de la transition de fécondité au Kenya, des questions subsistent. Cette thèse traite de trois d’entre elles : les tendances de la fécondité et ses déterminants proches, les facteurs liés au passage à la deuxième et à la troisième grossesse, et les déterminants de l’utilisation de la contraception. Les données proviennent de cinq enquêtes menées dans ce pays entre 1977 et 2003, auprès de femmes d’âge reproductif, ainsi que d’une étude, conduite en 1999, au niveau communautaire et de centres de santé. Les résultats montrent d’abord une tendance au mariage tardif et à un niveau plus élevé de contrôle de la fécondité dans les régions les plus modernisées et les plus développées (les villes et les zones rurales de la région de la Province Central). Deuxièmement, dans la comparaison des 12 années durant lesquelles la fécondité, mesurée par l’indice de fécondité, s’est réduite (1977- 1989) et celles où le pas de sa baisse a ralenti (1991-2003), on note une augmentation des effets relatifs de la mortalité infantile pendant la deuxième période. Troisièmement, la régression multi variée utilisée pour l’analyse des déterminants proches de l’utilisation de la contraception fait ressortir le rôle important de la motivation pour le contrôle de la fécondité. Bien que l’accès aux services de planification familiale ne constitue pas un facteur significatif en soi, il pourrait jouer néanmoins un rôle dans la mesure où les résultats montrent que l’exposition aux messages de planification familiale (généralement offerts dans les centres de santé) a un effet significatif. La contribution de cette thèse s’articule autour de trois aspects. Premièrement, elle montre une opposition dans les changements de la fécondité et de ses déterminants entre 1977 et 2003, non pas entre les zones urbaines et rurales comme d’habitude, mais plutôt entre zones urbaines et partie rurale de la Province Central d’une part et le reste du Kenya d’autre part. Deuxièmement, le ralentissement de la baisse de la fécondité, y compris le niveau stable observé entre 1998 et 2003, est probablement lié à la hausse, depuis les années quatre-vingt dix, de la mortalité infantile. Troisièmement, cette thèse confirme le rôle significatif de la scolarisation, de la motivation pour le contrôle des naissances, et de l’effet positif des messages sur l’usage des méthodes de planification familiale, montrant ainsi les domaines dans lesquels doivent intervenir les politiques et programmes afin de maintenir la transition de fécondité.

Thèse diffusée initialement dans le cadre d'un projet pilote des Presses de l'Université de Montréal/Centre d'édition numérique UdeM (1997-2008) avec l'autorisation de l'auteur.

Chez le mammifère, la production d'ovocytes s'arrête pendant la vie foetale. À la naissance, les femelles possèdent un nombre fini d'ovocytes. Mais ce dogme a été remis en question en 2004 alors que des chercheurs ont montré que chez la souris adulte, la néo-ovogénèse était possible (Johnson et al, 2004). En 2005, ces chercheurs ont démontré que des cellules souches de la moelle osseuse étaient capables de coloniser l'ovaire afin de former de nouveaux ovocytes (Johnson et al, 2005). Dans cet ouvrage nous montrons que la néo-ovogenèse chez des souris adultes de type SCID et PU.1 knockout ne se produit pas. Cependant la transplantation de moelle osseuse restaure la fertilité des souris SCID traitées en chimiothérapie. De plus, en greffant du cortex ovarien bovin foetal sous la capsule rénale de souris SCID, nous avons montré que la néo-ovogénèse semble ne pas se produire chez le bovin.

La reproduction chez la reine de l’abeille domestique (Apis mellifera L.) se fait par copulation avec plusieurs faux-bourdons (polyandrique) lors d’un vol nuptial à l’extérieur de la colonie. Des problèmes de fertilité des reines abeilles sont rapportés et une défaillance de la production et la qualité du sperme des faux-bourdons est mise en cause. Ce projet vise à évaluer l’influence de la lignée génétique, de l’âge du faux-bourdon ainsi que du moment dans la saison sur la production et la qualité du sperme des faux-bourdons dans les colonies d’abeilles du Québec. Les résultats montrent que l’âge et le moment dans la saison influencent la maturité et la production de sperme. Une meilleure compréhension des facteurs influençant l’élevage des faux-bourdons au sein de la colonie d’abeille permettra d’optimiser la fécondation des reines en maximisant la qualité des mâles produits. / Honeybee (Apis mellifera L.) reproduction is polyandrous: the queen obtains millions of sperm by mating with several drones outside the colony. Since queen fertility problems have been reported, it is important to investigate the variations that exist in drone semen production and quality. The main objective of this project was to assess the influence of breeding line, drone age and breeding timing in the season on semen production and quality. Results showed that drone age and breeding timing are the most influential factors. A better understanding of factors influencing drone rearing within a honeybee colony will ensure optimum honeybee queen mating by maximising the quality of males.

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal

La présente étude s’intéresse aux popula-tions installées en Irlande avant l’arrivée du christianisme (aux environs du Ve siècle de notre ère), et plus précisément aux bâtisseurs des tombes à couloirs du Néolithique ainsi qu’aux Celtes. L’omniprésence d’une com-posante féminine symbolique dans les pay-sages pré-chrétiens (qu’ils soient naturels, mégalithiques ou littéraires) est au centre de cette analyse, qui prend en considération le caractère matrifocal des sociétés archaïques et en évalue l’impact sociétal et rituel chez les Celtes. La thèse examine la spécificité de la perception des reliefs et l’expression sym-bolique de la représentation. Cette dernière se traduit chez les populations du Néolithique par une féminisation du paysage au travers des modifications délibérées de lieux naturels ou la création de sites clefs (tels que Brú na Bóinne ou Loughcrew). Nous montrons aussi que cette perception de l’espace comme fé-minin fut relayée chez les Celtes par la créa-tion de mythes mettant en scène des figures féminines divines ou évhémérisées transfonc-tionnelles. Le rapprochement proposé entre les créa-tions de ces deux groupes humains distants de plusieurs millénaires (de - 3500 à 700) vise à montrer qu’il existe dans les deux cas conception similaire de la terre d’Irlande comme féminine. Pour ce faire, la thèse met en relation plusieurs disciplines. La confron-tation des documents archéo-mythologiques révèle une continuité chronologique dans les représentations qui est liée à l’assimilation de l’héritage culturel indigène par les Celtes venus du continent. Nous avançons l’idée que l’osmose entre ces deux cultures a donné naissance à une identité celte insulaire unique, fortement ancrée dans la terre d’Irlande. / This study deals with the peoples who settled in Ireland before the coming of Chris-tianity (around the 5th century C.E.), and more precisely with both the builders of pas-sage tombs dating from the Neolithic period and the Celts. The analysis revolves around the omnipresence of a symbolical feminine element in pre-Christian landscapes (be they natural, megalithic or literary) and takes into account the matrifocal nature of these ancient communities, assessing its impact on Celtic societies and rituals. A specific apprehension of the natural features and its symbolic repre-sentation will be examined here. The latter is expressed by the Neolithic peoples through feminine sexual attributes they deliberately added to natural places or through the promi-nent sites they built (such as Brú na Bóinne or Loughcrew). It will also be shown that such a feminine perception of the Irish land-scape was taken up by the Celts, who created myths involving transfunctional or euhemer-ised goddess figures. Bringing together the creations of these two peoples separated by several millennia (from 3,500 B.C.E. to 700 C.E.) aims at showing that they shared a similar feminine vision of Ireland. To do so, several fields will be considered. Confronting archaeo-mythological documents will highlight actual chronological consistency in representation. This is linked to the continental Celts’ assim-ilation of the indigenous cultural heritage. We believe that the blending of these two cultures led to a unique insular Celtic identity which is deeply rooted in the land of Éire.