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Processamento de amostras fecais e desenvolvimento da tecnica de analises de imagens por computador, para o diagnostico das enteroparasitoses / Processing of samples feces and development of the technique of analyses of images for computer, for the diagnosis of the enteroparasitoses

Gomes, Jancarlo Ferreira, 1960- 29 August 2008 (has links)
Orientador: Alexandre Xavier Falcão / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T18:50:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gomes_JancarloFerreira_D.pdf: 2024129 bytes, checksum: eeb77aec9d0bc9546a0141b794a17319 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: No presente trabalho, averiguamos sobre processamentos de amostra fecal, desenvolvimento e avaliação de um sistema de computador para análise de imagem parasitária. Observamos que a etapa de processamento de fezes consistiu a etapa crítica, mas, essencial para o fornecimento de estruturas parasitárias limpas, com reduzida quantidade de microimpurezas fecais, ao sistema de análise por computador. Algumas técnicas parasitológicas convencionais, utilizando ou não kits comerciais, foram estudadas, e a de TF-Test (Three Fecal Test) apresentou menor teor de microimpurezas no final de processamento fecal. Todavia, este teor de microimpurezas era ainda muito grande, sendo ainda inadequado para análise computacional. Modificações foram introduzidas à técnica de TF-Test, com coloração dos componentes do sedimento fecal, utilizando um corante desenvolvido à base de Lugol, e seguido por degradação alcalina de microimpurezas, com uma solução clarificadora, previamente padronizada. Assim, a técnica de TF-Test Modificada contribuiu para o fornecimento de parasitos com poucas microimpurezas. O desenho do protótipo do sistema computacional para a análise de imagens incorporou: a técnica de TFTest Modificada; um microscópio óptico adaptado a uma bomba sucção peristáltica para conduzir uma alíquota de suspensão fecal processada à uma lâmina ou câmara tubular, onde estruturas parasitárias ou não apareciam em imagem; uma câmera digital; um monitor de vídeo para regulagem e captura de imagens; e um computador. Um banco de imagens foi construído, após coletas de amostras fecais foram efetuadas previamente em 4 regiões diferentes (Campinas, Botucatu, Avaré e Piraju) do estado de São Paulo, onde as enteroparasitoses são prevalentes. Os procedimentos de biossegurança e controle de qualidade contribuíram para que a perda da amostra fecal fosse pequena, não ultrapassando de 8%. Foi obtido um total de 16 espécies parasitárias, constituídos de helmintos e protozoários, e estes proveram uma coleção de 1.126 imagens ao computador. Ademais, o banco de imagens foi formado por informações adquiridas de 5.626 componentes parasitários e não parasitários, assim como, de dados sobre suas características de forma, textura e cor. A análise computacional baseou-se em um sistema de pipeline de técnicas de processamento de imagens, incluindo o uso de uma técnica denominada de Image-Foresting Transform (IFT). O pipeline consistiu em técnicas de segmentação de imagens para separar estruturas parasitárias e impurezas do fundo das imagens; em técnicas de extração para codificar características da forma, da cor e da textura dos parasitos; e em técnicas de reconhecimento e delineamento de imagens, visando distinguir parasitos de microimpurezas, de acordo com suas características próprias. A técnica de análise de imagens por computador (CIA) foi avaliada em comparação com a técnica de TF-Test Modificada de microscopia óptica, demonstrando alta sensibilidade de 95,3%, especificidade de 96,4%, e eficiência de 96,2 %. O conceito de concordância observada entre as duas técnicas estudadas foi de Quase Perfeito, em virtude do índice kapa (k) ter sido elevado, de 0,88. Esta técnica demonstrou ser altamente reprodutível, quando se ensaiaram em 10 diferentes ocasiões. Os achados deste trabalho apresentam perspectivas para industrialização do protótipo aqui desenvolvido, causando impacto na área de Saúde Pública, pois, no exame de fezes para população, há uma forte demanda de um sistema de automatização para detecção de enteroparasitos / Abstract: In the present study, we investigated on fecal sample processings, development and evaluation of a computer system for parasite image analysis. We observed that the fecal processing step was critical, but, essential for providing clean parasite structures, with reduced amount of fecal microdebris, to the system of computer analysis. Several conventional parasitologic techniques, using or not commercial kit, were studied, and TF-Test (Three Fecal Test) showed lower rate of microdebris at the end of fecal processing. However, this microdebris rate was still great, being unsuitable for computer analysis. The TF-Test technique was modified by staining the fecal sediment components, with a Lugol-based stain, followed by an alkaline degradation of fecal microdebris, using a clarifyer solution. So, the modified TF-Test technique became capable to supply parasite structure with little fecal microdebris. The prototype design of the computer system for the image analysis incorporated: the modified TF-Test technique; a optical microscope coupled to a peristaltic suction pump for leading an aliquot of processed fecal suspension to the tubular slide or chamber, where the parasite structures or microdebris appeared in tridimensional images; a digital camera; a video monitor to calibrate and capture images; and a computer. An image database was formed, after collecting fecal samples from prevalent regions (Campinas, Botucatu, Avaré and Piraju) of the State of São Paulo for enteroparasitosis. The total fecal sample loss was low, being less than 8%, since biosecurity and laboratory quality control protocols were frequently checked. A total of 16 parasite species were identified, consisting of helminths and protozoans, which provided a collection of 1.126 parasite images to the computer. Moreover, the image database was formed by information acquired from 5.626 parasite and nonparasite components, in addition to data on their shape characteristics, texture and color. The computational analysis was based on a pipeline of image processing techniques, including the use of a technique known as Image-Foresting Transform (IFT). The pipeline consisted of: a technique for image segmentation, in order to separate parasites and microdebris from background image; a technique for feature extraction to encode shape, color and texture characteristics of parasites; and techniques for pattern recognition and delineation, permitting to distinguish parasites from microdebris, according to their own features. The technique of computer image analysis (CIA) was evaluated in comparison with the optical microscope technique, named modified TF-Test, demonstrating a high sensitivity of 95,3%, specificity of 96,4% and efficiency of 96.2%. The agreement between two techniques was ranked as Almost Perfect, since the kappa (k) index has been high as much as 0.88. This technique proved to be reproducible, in a study, in which the assay was repeated 10 times, in different occasions. Our findings present good perspectives for the industrial production of the here developed prototype, causing impact on the Public Health area, since, in the fecal examination of the population, there is a strong demand for an automated system of enteroparasite detections / Doutorado / Doutor em Parasitologia
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Eletroestimulação, biofeedback e associação de eletroestimulação com biofeedback no tratamento da incontinencia fecal

Mergulhão, Melissa Eichenberger Alves 10 June 2004 (has links)
Orientador: Juvenal Ricardo Navarro Goes / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T01:14:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mergulhao_MelissaEichenbergerAlves_M.pdf: 6053409 bytes, checksum: f6f4ceb9229c4e46eb9fa5a3d2b24f1d (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: defecação é função privada e sua ocorrência, num momento ou local Índesejável, pode ser constrangedora, ocasionando uma condição de alienação social. A ÍncontÍnência fecal apresenta baixa morbidade; pode estar associada à depressão, ao pessimismo e à dimÍnuição da auto-estima, levando à limitação das atividades da vida diária. Dentre as várias causas da ÍncontÍnência fecaI, a multiparidade e o parto vaginal são considerados fatores de risco significativos. Como opções de tratamento conservador para a ÍncontÍnência fecal tem-se a cÍnesioterapia clássica, o biofeedback e a eletroestimulação, dos quais espera-se aumento do tônus da musculatura esfincteriana e conscientização sensório-motora, permitÍndo ao paciente maior controle sobre sua defecação. o objetivo deste estudo foi comprovar a eficácia da eletroestimulação neuromuscular em pacientes multíparas com ÍncontÍnência fecaI, em estudo comparativo com o tratamento pelo biofeedback isolado ou deste associado à eletroestimulação. Foram estudadas 25 doentes multíparas portadoras de ÍncontÍnência fecaI, e estas foram divididas, mediante sorteio, em três grupos: oito doentes foram submetidas à eletroestimulação; oito, foram tratadas com o emprego da eletroestimulação com biofeedback e nove foram submetidas ao biofeedback. As doentes foram avaliadas pelos seguÍntes parâmetros: manometria anorretal, escore do índice funcionaI clínico de ÍncontÍnência fecaI e questionário de qualidade de vida e tempo de urgência de evacuação, perda de fezes durante o repouso, durante atividades da vida diária, perda de fezes andando, durante esforço leve, moderado, Íntenso e perda de fezes sem perceber, pré e póstratamento. Foi considerada também a estimativa de melhora e o grau de satisfação com o tratamento. O estUdofoi prospectivo e randomizado. A análise dos dados demonstrou diferença estatisticamente significativa entre o pré e pós-tratamento, Índependentemente do grupo estudado, nas variáveis referentes à área sob o traçado da contração voluntária, escore do índice funcional da ÍncontÍnência fecaI, ao escore da qualidade de vida, tempo de urgência de evacuação, perda de fezes durante repouso,duranteatividadesda vidadiária,perdade fezesandando,perdade fezesduranteo esforço moderado e perda de fezes sem perceber. Houve correlação estatisticamente significativa entre o pré e pós-tratamento no grupo de biofeedback, quando se comparou o valor da pressão anal média da contração voluntária máxima. Já a pressão anal média de repouso, a capacidade de sustentação e a perda de fezes durante esforço intenso não apresentaram nenhuma diferença com significância estatística. Os resultados obtidos neste estudo permitem concluir que a eletroestimulação é eficaz no tratamento da incontinência fecal em doentes multíparas, quando aplicada isoladamente ou em associação com tratamento pelo biofeedback. Estatisticamente não foi constatada superioridade entre os métodos / Abstract: Defecation is a private function and its occurrence at an undesirable moment or place can be embarrassing and lead to a condition of social alienation. Although fecal incontinence does not present a high mortality rate, it causes social and moral perturbations which are difficult to solve. It is an embarrassing condition with important socioeconomic repercussions. It can be associated with depression, pessimism and a drop in the patient self-esteem, leading to restrictions in day-to-day activities. Among the several causes of fecal incontinence, multiparity and vaginal delivery has been implicated as a significant causal factor. Options for the conservative treatment of fecaI incontinence include classical cinesiotherapy, biofeedback and electrostimulation ITomwhich the increase ofthe sphincter muscle tonus as well as of sensorial awareness are expected, resulting in a better defecation control. The aims ofthis study were to prove the efficiency ofneuromuscular electrostimulation in patients with fecal incontinence in comparison with patients treated by biofeedback and patients treated with electrostimulation plus biofeedback. In order to get a homogeneous group, twenty-five females and muhiparas patients sufIering ITom fecal incontinence were allocated to three groups to be submitted to treatment; 8 patients underwent electrostimulation, 8 patients underwent electrostimulation plus biofeedback and 9 patients were submitted to biofeedback alone. The patients were evaluated by anorectal manometry, by a clinical functional index of fecal incontinence, by a questionnaire about their quality of life, time of evacuation urge, loss of feces during rest hours, daily activities , walking, during light, moderate or intense efIort as well as loss of feces without noticing pre- and post-treatment. The patient's evaluation of their improvement and satisfaction degree has also been analyzed. This study was prospective and randomized. The Analysis of the data demonstrated statistically significant difIerences independent of the group assessed between the pre- and post-treatment scores of functional index of fecal incontinence, the quality of life assessments, the area under graphic traces of voluntary squeeze and the times of urgency of evacuation, loss of feces during rest hours, daily actives, waIking, during light or moderate or effort as well as 10ss of feces with out noticing. There was a statistically significant correlation between the pre- and post-treatment in the biofeedback group when comparing the mean anal pressure of maximum voluntary squeeze. However, the mean resting anal pressure and the capacity of sustentation and the 10ss of feces during intense effort did not present any significant difference. The results obtained in the present study enabled us to conclude that electrostimulation is as . etlicacious as biofeedback in the treatment of fecal incontinence, without giving a statistically significant difference between the two methods / Mestrado / Pesquisa Experimental / Mestre em Cirurgia
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Distribuição sazonal e abundancia relativa de dipteros simbovinos na região de Itu, SP

Silva, Silvana Maria de Souza e 26 November 1993 (has links)
Orientador : Angelo Pires do Prado / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-18T20:44:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_SilvanaMariadeSouzae_M.pdf: 5550557 bytes, checksum: 2fc3619d8f7755103c7a36c0ff94ff30 (MD5) Previous issue date: 1993 / Resumo: A dipterofauna simbovina se constitue em importante agente de degradação das placas de fezes produzidas pelos bovinos, facilitando a reciclagem de material nutriente para o solo e o melhoramento da pastagem. Além disso ocorrem importantes interações entre seus respectivos membros, tais como competição predação e interferência, que podem explicar o controle natural de determinadas espécies-pragas, como a mosca- do - chifre ( Haematobia irritans, L.), uma das primeiras colonizadoras das placas de fezes bovinas. Dessa forma, o conhecimento da dipterofauna associada as fezes é um importante elemento no manejo adequado não só do esterco para o controle de pragas, como também do uso de produtos quimicos (inseticidas e helminticidas), de amplo espectro, devido ao seu impacto ambiental. Fezes intactas de gado bovino foram coletadas em uma fazenda, na região de Itu, SP. e os dipteros contados e identificados. Foram identificadas 17 familias, sendo 06 da subordem Nematocera e 11 da Cyclorrhapha, num total de 32 espécies, o número máximo de individuos por placa foi 1652 e o número minimo 07. Grande número de familias apresentaram sazonal idade marcada, enquanto que as famílias Sepsidae, Sphaeroceridae, Muscidae e Sarcophagidae tiveram grande frequencia e abundancia ao longo do periodo de coleta. A grande diversidade e abundência dos dipteros simbovinos, demonstram a importancia desse grupo dentro da estratégia do controle biolbgico e no processo da degradação da massa fecal / Abstract: The dung fly fauna, constitute an important agent of degradation of undisturbed cattle droppings, by promoting the recycling of soil nutrients and pasture restauration. In this process usually important interactions occur among its members, such as competition, predator-prey relationships, and interferences, wich may be used as control of pest species, such the horn fly (H. irritans, L.), ane of the first to colonize cattle dropping. Therefore, a knowledge of the dynamics of cattle dung fauna is an important element for appropriate management not only of the excrement, but also of pest species. Three undisturbed pats were collected weekly, from a farm in the vicinity of Itu, SP. The flies were collected, counted and identified. Seventheen dipteran families and 32 species were identified, being 06 Nematocera and 11 Cyclorrhapha. The largest number found in the pat was 1652 and the smallest was 07. The majority of families showed a seasonal pattern, whereas a few were frequent and abundant during all year (Sepsidae, Sarcophagidae, Muscidae, Sphaeroceridae). The diversity and relative abundance of cattle dung Diptera, showed the importance of this group in strategies of biological control, and in the process of dung pat degradation / Mestrado / Parasitologia / Mestre em Ciências Biológicas
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Alguns aspectos epidemiologicos de geohelmintos em amostragem da população de Paulinia, SP

Anaruma Filho, Francisco 26 August 1994 (has links)
Orientador: Luiz Candido de Souza Dias / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-19T13:04:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnarumaFilho_Francisco_M.pdf: 4285849 bytes, checksum: 38ae3cc6f5193f6414152251a0549e4a (MD5) Previous issue date: 1994 / Resumo: O município de Paulínia, São Paulo, é considerado como um modelo em termos de saúde pública dentre os municípios brasileiros. É um dos maiores pólos petroquímicos nacionais, e possui a sexta renda per capita nacional. Abriga o Centro de Saúde Escola da UNICAMP em suas unidades de saúde. Sua população foi estimada pelo censo do mGE (1991) em 36.629 habitantes, com 1 médico para cada 779 habitantes e a mortalidade infantil é de 16,5/1000. A falta de dados recentes de geohelmintíases e a raridade de censos coprológicos no país, levou-nos a realizar um inquérito por meio de amostragem aleatória nesta cidade. Foram visitadas 166 residências, sendo colhidas amostras de fezes em 101. Executaram­se exames quantitativos e qualitativos em 360 indivíduos de ambos os sexos e de todos os grupos etários. As condições sanitárias de cada habitação foram avaliadas por meio de questionário. Cada pessoa que forneceu fezes foi submetida a questionário individual. As técnicas de exames de fezes foram: Kato-Katz, Willis, Rugai e Harada-Mori. O índice geral de prevalência por todos os métodos foi 17,5%. O sexo masculino foi o mais acometido, na faixa etária de 10 a 20 anos.(73%). A prevalência pelo método de Kato-Katz foi 12,2%, obtendo-se 43 indivíduos infectados, predominando os ancilostomatídeos (37,2%). Pelo método de Willis, o índice de prevalência foi de 9,2%, sendo os ancilostomatídeos (63,6%) os mais frequentes. Pelo método de Rugai observamos 18 indivíduos parasitados apenas por larvas de Strongyloides stercoralis. Pelo método de Harada-Mori, diagnosticaram-se apenas larvas de Necator americanus. As maiores intensidades de infecção foram encontradas nos portadores de Ascaris lumbricoides e nos indivíduos do sexo feminino na faixa etária de 1 a 5 anoS'.Nos ancilostomatídeos só detectaram-se infecções leves; as infecções apenas ocorreram a partir dos 10 anos de idade, predominando no homem. Por meio de testes estatísticos houve, dependência de geohelmintíase nos seguintes casos: sexo; renda familiar; número de indivíduos por residência; nas diferentes áreas (bairros) de atuação do Centro de Saúde Escola; quando o indivíduo parasitado tinha contato com o solo no trabalho e na escola e nas diferentes profissões. As baixas prevalências e o predomínio de intensidades de infecções leves refletem a boa qualidade do serviço de Saúde Pública neste município / Mestrado / Parasitologia / Mestre em Ciências Biológicas
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Excreção de patógenos e inocuidade das carcaças de bovinos alimentados com silagem de grãos úmidos de destilaria

Nunes, Letícia Borges January 2018 (has links)
Orientador: Roberto de Oliveira Roça / Resumo: O objetivo deste estudo foi determinar a excreção de patógenos e inocuidade da carcaça de bovinos alimentados com diferentes níveis de silagem inoculada de grãos úmidos de destilaria desengordurados (WDG). Um total de 100 bovinos machos não castrados, 50% Angus e 50% Nelore, foram divididos aleatoriamente entre quatro dietas (N = 25) compostas por diferentes níveis de silagem de WDG (0, 15, 30 e 45% da matéria seca dietética). Amostras de fezes foram colhidas por meio de suabe da junção reto anal, 15 dias antes do abate, para determinar as ocorrências e quantificação de Escherichia coli produtora de toxina Shiga (STEC), E. coli enteropatogênica (EPEC) e Salmonella spp. por meio da técnica qPCR. Também foram colhidas, 52 dias antes do abate, amostras de fezes de cada animal do piso do curral, logo após defecação, as quais foram submetidas a análises físico-químicas. Logo após o abate, a ocorrência e a contagem de indicadores higiênicos e sanitários, E. coli não patogênica, coliformes totais e bactérias aeróbias mesófilas, assim como, a ocorrência de STEC, EPEC e Salmonella spp., foram determinados a partir de amostras colhidas por meio de esponja da superfície das carcaças das regiões do coxão, flanco, peito e pescoço. Os resultados quantitativos foram submetidos a análises de variância e os dados binários foram submetidos a análises logísticas com razão de chances. Todas as análises estatísticas foram realizadas no software estatístico SAS 9.4 considerando um nível de signifi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this study was to determine the pathogen excretion and carcass safety of cattle fed different levels of inoculated silage from degreased wet distillery grains (WDG). A total of 100 male, 50% Angus and 50% Nelore male bulls were randomly divided into four diets (N = 25) composed of different levels of WDG silage (0, 15, 30 and 45% of dietary dry matter) . Stool specimens were collected by rectal anal junction swab 15 days prior to slaughter to determine the occurrences and quantification of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC), E. coli enteropathogenic (EPEC) and Salmonella spp. by the qPCR technique. Samples of faeces from each animal on the corral floor were also collected, 52 days before slaughter, immediately after defecation, which were submitted to physical-chemical analysis. Immediately after slaughtering, the occurrence and counting of hygienic and sanitary indicators, non-pathogenic E. coli, total coliforms, and mesophilic aerobic bacteria, as well as the occurrence of STEC, EPEC and Salmonella spp., were determined from samples collected by medium of the surface of the carcasses of the regions of the tail, flank, chest and neck. The quantitative results were submitted to analysis of variance and the binary data were submitted to logistic analyzes with odds ratio. All statistical analyzes were performed in SAS 9.4 statistical software considering a significance level of 5%. The results showed that there was no difference between treatments fo... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Determinação dos níveis de porfirinas fecais por espectroscopia de fluorescência em indivíduos com câncer de próstata / Determination of faecal porphyrin levels by fluorescence spectroscopy in individuals with prostate cancer

Gotardelo, Daniel Riani 18 March 2019 (has links)
Modelos experimentais de câncer de próstata demonstraram níveis aumentados de protoporfirina IX (PpIX) no sangue e nas fezes de camundongos, fazendo com que a quantificação dessa molécula pudesse ser aventada para a identificação desse tipo de tumor. Nesse estudo do tipo caso-controle, a autofluorescência de porfirinas em fezes humanas foi analisada usando espectroscopia de fluorescência em pacientes com câncer de próstata e controles. Dados sociodemográficos, amostras sanguíneas para determinação dos níveis de PSA (antígeno prostático específico) e amostras de fezes para quantificação de porfirinas foram obtidas após consentimento dos pacientes. Recrutaram-se 18 pacientes em amostra calculada a partir dos estudos de referência. Realizou-se varredura para encontrar o melhor pico espectrofotométrico a partir de diversas diluições acetona/fezes. Primeiramente, 3 mililitros de acetona de grau analítico foram adicionados a 0,3 gramas de fezes e a mistura foi macerada e centrifugada a 4.000 rotações por minuto durante 15 minutos. O sobrenadante foi analisado espectroscopicamente. Os espectros de emissão a 550-750 nm foram obtidos excitando as amostras a 405 nm. Variáveis sociodemográficas foram analisadas e evidenciaram homogeneidade entre os grupos estudados. Um contraste significativo entre as amostras de indivíduos normais e oncológicos foi estabelecido na região espectral de 670-675 nm (p = 0,000127), o que corresponde a um aumento significativo de porfirinas fecais em pacientes com câncer. Não houve correlação estatisticamente significativa entre os níveis de PSA e as porfirinas fecais (R = -0,0221). Neste estudo preliminar realizado em seres humanos, os resultados mostram um método simples e não invasivo para avaliar as porfirinas fecais, que têm o potencial de funcionar como um biomarcador tumoral em pacientes com câncer de próstata. Essa abordagem poderia aumentar a sensibilidade e a especificidade do teste de PSA. / Experimental models of prostate cancer have demonstrated increased levels of protoporphyrin IX (PpIX) in the blood and faeces of mice. Hence, the quantification of these autofluorescent molecules could be hypothesized to be a potential marker for this type of tumour. In this case-control study, the autofluorescence of porphyrins in human faeces from patients with prostate cancer and control subjects was analysed using fluorescence spectroscopy. Socio-demographic data, blood samples for determination of PSA levels and faeces samples for quantification of porphyrins were obtained after consent of the patients. Eighteen patients were recruited in a sample calculated from the reference studies. Scanning was performed to determine the best spectrophotometric peak from various acetone/faecal dilutions. First, 3 mL of analytical-grade acetone was added to 0.3 g of faeces, and the mixture was macerated and centrifuged at 4000 rpm for 15 min. The supernatant was analysed spectroscopically. The emission spectra from 550 to 750 nm were obtained by exciting the samples at 405 nm. Socio-demographic variables were analyzed and showed homogeneity among the groups studied. A significant difference between the samples from control and cancer subjects was established in the spectral region of 670675 nm (p = 0.000127), which corresponds to a significant increase in faecal porphyrins in patients with cancer. There was no statistically significant correlation between PSA levels and faecal porphyrins (R = -0,0221). In this preliminary study conducted in humans, the results show a simple and non-invasive method to assess faecal porphyrins, which have the potential to function as a tumour biomarker in patients with prostate cancer. This approach has improved sensitivity and specificity over PSA testing.
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Avaliação da ocorrência de fatores de virulência em estirpes de Escherichia coli em fezes de cães errantes / Evaluation of the occurence of virulence factors in Escherichia coli in faeces of wandering dogs

Sydow, Anna Catharina Maia Del Guercio von 26 August 2005 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo isolar e identificar os microrganismos aeróbicos e a frequência de isolamento de Escherichia coli patogênica ao homem em fezes de cães sem sintomas de colibacilose e assim averiguar a participação do cão como fonte de infeção de colibacilose humana. No período de setembro de 2002 a outubro de 2004, foram coletadas 220 amostras de fezes de animais capturados pelos CCZ de Guarulhos, Cotia e Barueri, cidades do Estado de São Paulo. O método de coleta foi através de swabs estéreis profundamente ao intestino dos animais anestesiados, mantidos sob refrigeração e em caldo BHI. As bactérias foram isoladas por semeadura em Mac Conkey, ágar sangue e Sabouraud. Houve crescimento de microrganismos em 100% delas. Foram isolados os seguintes microrganismos: 120 (54,54%) estirpes de E. coli em cultura pura e 76 (34,54%) estirpes em associação com outros agentes, Proteus mirabilis (2,27%), Klebsiella pneumoniae (2,27%), dentre outros microrganismos. Deve-se ressaltar ainda o isolamento de leveduras (Candida albicans) em associação com outros agentes a partir de 05 (2,27%) amostras de swabs retais. Uma vez isoladas, seus genes de virulência foram detectados por PCR. De um total de 196 estirpes de E. coli isoladas, 123 (62,75%) apresentaram um ou mais dos fatores de virulência estudados. Dessas 196 estirpes, 16 (8,16%) foram positivas para afa, 54 (27,55%) foram positivas para sfa, 38 (19,38%) foram positivas para pap, 66 (33,67%) foram positivas para aer, 31 (15,81%) foram positivas para cnf, 13 (6,63%) foram positivas para hly, 01(0,51%) foi positiva para VT2 e nenhuma das linhagens foi positiva para LT, STa e STb. Os cães aparentemente sadios, sem sintomas de colibacilose, poderiam estar participando da cadeia epidemiológica como reservatórios de E. coli uropatogênica ao homem, pois os genes encontrados com maior número foram aer, sfa e pap presentes em infecções extraintestinais, mais especificamente infecções urinárias. Os cães podem participar como reservatório de estirpes de E. coli resistentes a antimicrobianos. Das amostras de E. coli testadas, 85,64% apresentaram resistência à Cefalotina e 0% de resistência à Norfloxacina. Há a necessidade de mais pesquisas sobre o modo de transmissão das E. coli patogênicas entre o cão e o homem e dos fatores de virulência uropatogênicos encontrados com maior frequência tais como aer, sfa e pap. / The objective of the present study was to isolate and identify aerobic microorganisms and the isolation frequency of E. coli pathogenic to man in faeces of dogs without colibacillosis symptoms and thus to verify the participation of dog as a source of human colibacillosis infection. In the period between September 2002 to October 2004, 220 samples of faeces were collected from animals captured by the CCZ of Guarulhos, Cotia and Barueri, cities in the São Paulo state. The collection method used was barren swabs deeply to the intestine of anesthetized animals, which were kept under refrigeration and in a BHI broth. The bacteria were isolated through sowing in Mac Conkey, agar blood and Sabouraud. In 100% of them there was microorganism growth. The following microorganisms were isolated: 120 (54.54%) E. coli lineages in pure culture and 76 (34.54% lineages in association with other agents, Proteus mirabilis (2,27%), Klebsiella pneumoniae (2.27%,) amongst other microorganisms. The isolation of yeasts (Candida Albicans) in association with other agents from 05 (2.27%) rectal samples swabs must be emphasized. Once isolated virulence genes were detected by PCR. Of a total of 196 isolated lineages of E.coli, 123 (62.75%) presented one or more of the studied virulence factors. Of these 196 lineages, 16 (8.16%) were positive for afa, 54 (27.55%) positive for sfa, 38 (19.38%) positive for pap, 66 (33.67%) positive for aer, 31 (15.81%) positive for caf, 13 (6.63%) positive for hly, 01 (0.51%) positive for VT2 and none of the lineages were positive for LT, Sta and STb. Apparently healthy dogs, without colibacillosis symptoms could be participating in the epidemiological chain as an E. coli reservoir uropathogenic to man, as the genes found with high frequency were aer, sfa and pap present in extraintestinal infections, more specifically urinary infections. The dogs can participate as a reservior of E. coli lineages resistant to antimicrobials. Of the E. coli samples tested, 85,64% presented resistance to Cefalotina and 0% resistance to Norfloxacina. More research is needed on how the transmission of pathogenic E. coli between the dog and man happens and also on the uropathogenic virulence factors found more frequently, such as aer, sfa and pap.
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Avaliação da função reprodutiva de fêmeas de peixe-boi da Amazônia (Trichechus inunguis, Natterer, 1883), mantidas em cativeiro, por meio da extração e dosagem de esteróides fecais / Reproductive assessment in captive females of Amazonian manatees (Trichechus inunguis, Natterer, 1883), by fecal steroid extraction and quantification

Nascimento, Cláudia Carvalho do 25 June 2004 (has links)
Neste estudo avaliou-se a função reprodutiva de fêmeas de peixe-boi da Amazônia (Trichechus inunguis) mantidas em cativeiro no Laboratório de Mamíferos Aquáticos do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (n=4) e no Centro de Preservação e Pesquisas de Mamíferos Aquáticos - Manaus Energia S.A. (n=2), por meio da extração e quantificação de progestinas e estrógenos fecais. As amostras fecais foram colhidas duas vezes por semana durante doze meses, foram liofilizadas e processadas de acordo com o protocolo adaptado de Schwarzenberger et al (1991). Realizou-se a validação dos radioimunoensaios em fase sólida, progesterona e 17β-estradiol para o uso em extratos fecais de peixe-boi da Amazônia. A duração média do ciclo ovariano (± EPM) definido por dois picos consecutivos de estrógenos fecais foi de 22,49 ± 1,26. A fase de estro teve duração média de 6,4 ± 0,45. Para verificar se as fêmeas mantidas em cativeiro apresentavam o padrão reprodutivo sazonal dos peixes-bois de vida livre sugerido por Best (1982), avaliou-se a influência das fases do ciclo hidrológico dos rios da bacia Amazônica. Não foi observada diferença estatística nas concentrações de progestinas fecais ao longo das fases do ciclo hidrológico, porém verificou-se que durante a fase de cheia apresentaram concentrações de estrógenos fecais superiores às outras fases, corroborando com os dados sugeridos por Best (1982). Com os resultados obtidos nesse estudo, pretende-se ampliar os conhecimentos sobre a fisiologia reprodutiva do peixe-boi da Amazônia, fornecendo mais uma ferramenta de estudo para auxiliar pesquisas e manejo reprodutivo, tendo como objetivo final a conservação da espécie. / This study has evaluated the reproductive function of six females of the Amazon manatee (Trichechus inunguis) kept in captivity at the Aquatic Mammals Laboratory - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (n=4) and Centro de Preservação e Pesquisa de Mamíferos Aquáticos-Manaus Energia S/A (n=2) through extraction and quantification of fecal estrogens and progestins. Fecal samples were obtained twice a week for 12 months. Validation of the solid phase radioimmunoassay for progesterone and 17β-estradiol was performed for using on Amazon manatees fecal extracts. Ovarian cycle mean duration (± SEM), defined by two consecutive peaks of fecal estrogens, was 22,49 ± 1,26 days. Mean estrous phase duration was 6,4 ± 0,45 days. To verify if the captive females showed the same seasonal reproductive pattern of wild manatees suggested by Best (1982), the influence of the hydrological cycle of the Amazon River Basin was analyzed. There was no statistical difference on the fecal progestins between phases, but during the flood phase it was verified that the estrogen fecal concentrations were increased, corroborating with Best (1982).These results show that the improvement of the non-invasive techniques for reproductive assessments increase the knowledge of reproductive physiology and is an important tool for scientific research, reproductive management, and species conservation.
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Comunicação química por meio das fezes e da urina e comportamento social em gatos domésticos (Felis silvestris catus L.) / Chemical communication via feces and urine and social behaviour in the domestic cat (Felis silvestris catus L.)

Troncon, Elisa Kefalás 21 March 2006 (has links)
Os gatos domésticos podem ser utilizados como modelo no estudo da Família Felidae, pois não atingem grandes proporções físicas, são encontrados em altas densidades populacionais por todo o mundo e compartilham com felinos selvagens grande variedade de marcações odoríferas. A transferência de odores entre os gatos e o meio ambiente ocorre por contatos corporais e eliminação de excretas, sendo urina e fezes importantes carreadores de informação química em quase todos os mamíferos terrestres, facilitando as interações sociais entre os indivíduos. O objetivo do presente estudo foi analisar aspectos do comportamento de gatos domésticos, com destaque para a comunicação química, via fezes e urina, entre estes animais, bem como para as relações entre estes aspectos e sua estrutura social intra-específica. Foram utilizados gatos domésticos (Felis silvestris catus), sem raça definida, de ambos os sexos, incluindo filhotes, juvenis e adultos, sendo estes castrados com um ano de idade, mantidos em alta (0,3 animais/m2) ou em baixa densidade populacional (0,04 animais/m2). A coleta dos dados comportamentais de eliminação de fezes e urina foi realizada utilizando-se o método amostral “animal focal". Foram registrados o número de movimentos e o tempo gasto para cavar um buraco no solo (antes do animal defecar ou urinar), o número de movimentos e o tempo gasto para enterrar as fezes ou urina, e se houve verificação olfativa dos excrementos. Foram registrados os locais onde os animais depositavam suas excretas e foram comparados os comportamentos destes longe ou perto dos locais de descanso e alimentação, na área de alta densidade populacional. Foram, também, comparados os comportamentos dos animais nas duas áreas de estudo. Quanto à organização social, foram registrados quais indivíduos estavam dormindo ou descansando em contato físico direto com outros indivíduos, nas duas áreas. Além disso, foram registrados os locais (caixas) ocupados pelos animais para descanso, em função da altura. Os resultados mostraram que os animais executam número maior de movimentos (com os membros anteriores) e gastam maior tempo para enterrar suas fezes, se comparados à urina. As fêmeas mostram esforço maior do que os machos, após a eliminação das fezes, o que pode indicar uma estratégia para a proteção dos filhotes. Em alta densidade populacional, os animais dedicam maior esforço para enterrar suas fezes, se comparados aos que vivem em baixa densidade. Quanto às verificações olfativas, as fezes são verificadas mais freqüentemente do que a urina, em machos e fêmeas, tanto em alta quanto em baixa densidade populacional. Em alta densidade, tanto os machos quanto as fêmeas depositam suas fezes longe, enquanto depositam sua urina perto dos locais utilizados para descanso e alimentação. Quanto à organização social, a alta densidade populacional parece propiciar maior número de contatos físicos direto entre os animais, do que a baixa densidade. Além disso, os animais preferem ocupar as caixas localizadas em posições mais altas do que as caixas mais baixas, e alguns animais restringem sua ocupação às caixas altas ou baixas, o que pode indicar uma estratificação social, de acordo com a posição hierárquica do animal no grupo. / Domestic cats may be used as a model for the study of the Felidae family, since they do not reach greater physical proportions, are found in high population densities all over the world and share with wild felids a variety of scent marks methods. Odor transference between cats and the environment occurs through corporal contacts and elimination of feces and urine, which seem to be important carriers of chemical information in almost all terrestrial mammals, thus facilitating social interactions between individuals. The aim of the present study was to analyze aspects of the behavior of domestic cats, with emphasis in chemical communication through feces and urine between animals, and the relationships between these aspects and their intraspecific social structure. The study was carried out in domestic cats (Felis silvestris catus) from both sexes, without defined race, including kittens, youthful and adults neutered with nearly one year old; animals were kept in high (0,3 animals/m2) or in low population density (0,04 animals/m2). The collection of the behavioral data for elimination of feces and urine was carried out using the “focal animal" method. The number of movements and the time spent to dig a hole in the ground (before the animals defecate or urinate), the number of movements and the time spent to bury their feces or urine, and whether olfative verification of the excrements was or not performed were carefully recorded. Recordings also involved the places where the animals deposited their excrements and the behavior patterns farther or closer to the places used for rest and feeding were compared, in the area of high population density. Also, the two areas of study were compared regarding animal behavior. As far as social organization is concerned, it was recorded which individuals were sleeping or resting in direct physical contact with other individuals, in both areas of study. Moreover, the places (boxes) used by the animals for resting, in function of their height, were also recorded. Results show that animals execute a greater number of forelimb movements and spend more time to bury feces, when compared to urine. Females show more effort after the elimination of feces than males, which may indicate a strategic behavior for the kitten protection. Animals dedicate more effort to bury feces in high population density, when compared to low population density. Regarding olfative verifications, feces are verified more frequently than urine, for both males and females, not only in high but also in low population density. In high population density, males and females deposit feces farther and urine closer to the places used for rest and feeding. As far as social organization is concerned, high population density seems to propitiate greater number of direct physical contacts between animals than low population density. Moreover, animals show predilection for occupying boxes located in higher positions, than the lower ones, and some animals restrict their occupation to either the high or the low boxes, which may indicate some degree of social stratification in the group, according to animal hierarchical position.
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Minerais orgânicos e fitase como redutores do poder poluente de dejetos suínos / Organic mineral and phytase as reducer of the pig manure pollutant power

Caniatto, Amanda Raquel de Miranda 08 April 2011 (has links)
Este estudo teve como objetivo avaliar a utilização da enzima fitase e de minerais orgânicos (Cu e Zn) na dieta de suínos visando a redução do poder poluente dos dejetos. Foram utilizados 16 suínos com idade média de 68 dias, alocados na câmara climática, em gaiolas de metabolismo para coleta de fezes e urina. Os animais foram mantidos em duas faixas de temperaturas ambientais: conforto térmico e estresse térmico, e submetidos aos tratamentos: controle (T1); suplementação com minerais orgânicos (T2); suplementação com fitase (T3); suplementação com minerais orgânicos e fitase (T4). As fezes e a urina foram analisadas quanto à concentração de P, N, Na, K, Cu, Zn, Ca. Mensurou-se também temperatura retal e superficial dos animais, volume de fezes e urina excretadas, assim como o consumo de água e ração. Observou-se que o estresse térmico afetou a temperatura retal e superficial, além do volume de fezes excretadas (P<=0,05). A excreção de Zn e Ca foram reduzidas com a utilização da enzima fitase, enquanto que o Cu e Zn orgânicos beneficiaram o Zn, Ca e P (P<=0,05). O estresse térmico aumentou significativamente a excreção de Cu, enquanto a de Na foi reduzida (P<=0,05). Embora não tenha ocorrido interação na atuação da enzima fitase e dos minerais orgânicos, estes aditivos contribuíram com a redução da excreção de minerais. / This study aimed to evaluate the use of phytase and organic minerals (Cu and Zn) in pig diets in order to reduce the power of polluting waste. Sixteen pigs at the age of 68 days, were allocated in metabolism studies cages for collection of feces and urine, in a climatic chamber. The animals were kept in two tracks of ambient temperatures: thermal comfort and heat stress, and subjected to the treatments: control (T1); organic minerals supplementation (T2); phytase supplementation (T3); organic minerals and phytase supplementation (T4). Feces and urine were analyzed for P, N, Na, K, Cu, Zn and Ca concentrations. It was also measured rectal temperature, body surface temperature, feces and urine volume and the food and water consumption. The results had shown that heat stress affected the rectal and superficial temperature, and excreted feces volume (P<=0,05). The Zn and Ca excretion were reduced with the phytase use, whereas organic Cu and Zn benefited Zn, Ca and P (P<=0,05). The heat stress significantly increased Cu excretion, while Na was reduced (P<=0,05). Although there was no interaction on the activity of phytase and organic minerals, these additives contributed to the excretion reduction of minerals.

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