Thesis (Ph.D.)--University of Adelaide, Dept. of Soil and Water, 2002? / Bibliography: leaves 172-197.

Thesis (M.Sc.) - Carleton University, 2006. / Includes bibliographical references (p. 137-151). Also available in electronic format on the Internet.

Orientador: Alexandre Magno Sebbenn / Resumo: A presente dissertação de mestrado é composta por uma seção introdutória, seguida de uma revisão da literatura a qual antecede os três capítulos subsequentes. O primeiro capítulo aborda um conjunto de revisões de conhecimentos científicos contemporâneos sobre os efeitos da exploração madeireira em florestas tropicais e as práticas madeireiras utilizadas no Brasil, quais têm se demonstrado insuficientes para garantir a sustentabilidade tanto na produção genética quanto na produção madeireira. O segundo capítulo é um “primer note” descrevendo a identificação de 402 loci putativos (polimorfismos de nucleotídeo único – SNPs, inserções / deleções - INDELs) para Ipe (Handroanthus sp.), destinado à estudos de genética de populações, filogeografia e DNA fingerprinting. O último capítulo discute a viabilidade de DNA fingerprinting para espécies do gênero Handroanthus. Esse traz a análise da diversidade genética, diferenciação genética de populações de Handroanthus sp., bem como entre os países de origem das amostras, análises de auto atribuição de genótipos e testes de atribuição de madeira ao local de origem. / Mestre

‘Jardin de Granville’ ‘est une variété de rose moderne dédiée à des applications cosmétiques en lien avec ses propriétés intéressantes permettant de lutter contre les mécanismes inflammatoires et oxydants au niveau cutané. L’objectif principal de cette thèse a consisté à établir la cartographie moléculaire de ‘Jardin de Granville’. Pour cela, un procédé standardisé de récolte et d’extraction a été développé afin d’accéder au contenu moléculaire le plus exhaustif possible des différents organes de la plante. Des méthodes complémentaires d’analyse, allant de l’HPTLC, à l’HPLC-DAD-DEDL et jusqu’à l’UHPLC-HRMS, ont été mises en oeuvre pour réaliser les empreintes chromatographiques des extraits et en identifier les principaux constituants. Ces méthodes ont été choisies de plus en plus spécifiques et précises, de façon à apporter une graduation dans le niveau d’informations apportées. Plus de 120 molécules ont pu être caractérisées dans les différents extraits. Le deuxième objectif résidait dans la mise en évidence des marqueurs phytochimiques spécifiques à la variété en comparant ses empreintes moléculaires à celles des deux variétés parents. Deux méthodes de comparaison des profils ont été développées. La première met en jeu des analyses statistiques telles que l’ACP, la CAH et l’ANOVA qui permettent de comparer l’ensemble des extraits. La seconde effectue la soustraction des chromatogrammes d’extrait deux à deux et donne accès à un niveau d’informations plus ciblé. Ces deux approches ont conduit à l’identification de composés différenciant chaque type d’organes ce qui pourra servir d’outils dans la valorisation de certaines parties de la plante. Des marqueurs potentiels plus spécifiques à ‘Jardin de Granville’ ont pu être mis en évidence ce qui démontre la capacité des méthodes développées à différencier le contenu phytochimique de variétés de rose très proches. / The modern rose variety ‘Jardin de Granville’, possesses proven activities against skin cell inflammatory and oxidant mechanisms and is devoted to cosmetic applications. The main goal of this study was to establish the molecular fingerprint of the different organs of ‘Jardin de Granville’. In this way, a standardized process for plant harvesting and sample extraction was developed giving access to the most exhaustive molecular fingerprint possible of the different organs. Several complementary analytical methods were implemented through HPTLC, HPLC-DAD-ELSD and UHPLC-HRMS, enabling to achieve the chromatographic fingerprint of the different organs and to identify the main constituents. These methods were selected to have increasing specificity and accuracy to bring progressive information on the molecule structure. Thus, more than 120 compounds were characterized in the different extracts. The second objective consisted in identifying specific phytochemical markers of the variety by comparing its fingerprint to those obtained from its two rose plant parents. In this way, two approaches were developed. The first one involves statistical analysis like PCA, HAC and ANOVA and allows comparing the whole sample chromatograms. The second approach performs extract chromatogram subtractions two by two and gives more detailed information. Both comparative methods led to the identification of the differential compounds existing between the different organ types which could be used to valuate some plant parts in particular. Some ‘Jardin de Granville’ specific markers were highlighted showing the method capacity to distinguish very close rose varieties, by comparing their molecular content.

Submitted by BÁRBARA ROCHA VENANCIO null (b.rvenancio@outlook.com) on 2017-06-01T12:26:01Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Bárbara Rocha Venancio_2017.pdf: 1455087 bytes, checksum: 52124957d6d5433b1fb34b032cc3d9c5 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-06-02T13:19:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 venancio_br_me_ilha.pdf: 1455087 bytes, checksum: 52124957d6d5433b1fb34b032cc3d9c5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T13:19:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 venancio_br_me_ilha.pdf: 1455087 bytes, checksum: 52124957d6d5433b1fb34b032cc3d9c5 (MD5) Previous issue date: 2017-04-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A presente dissertação de mestrado é composta por uma seção introdutória, seguida de uma revisão da literatura a qual antecede os três capítulos subsequentes. O primeiro capítulo aborda um conjunto de revisões de conhecimentos científicos contemporâneos sobre os efeitos da exploração madeireira em florestas tropicais e as práticas madeireiras utilizadas no Brasil, quais têm se demonstrado insuficientes para garantir a sustentabilidade tanto na produção genética quanto na produção madeireira. O segundo capítulo é um “primer note” descrevendo a identificação de 402 loci putativos (polimorfismos de nucleotídeo único – SNPs, inserções / deleções - INDELs) para Ipe (Handroanthus sp.), destinado à estudos de genética de populações, filogeografia e DNA fingerprinting. O último capítulo discute a viabilidade de DNA fingerprinting para espécies do gênero Handroanthus. Esse traz a análise da diversidade genética, diferenciação genética de populações de Handroanthus sp., bem como entre os países de origem das amostras, análises de auto atribuição de genótipos e testes de atribuição de madeira ao local de origem. / The present master dissertation is composed by an introductory section, followed by a review of literature, which prefaces the three subsequent chapters. The first chapter of this dissertation is a review assembly contemporary scientific knowledge about the effects of the forest logging in tropical rainforests and the actual logging practices used in Brazil, which seems insufficient to ensure sustainability in both genetic and timber production aspects. The second chapter is a primer note describing the identification of 402 putative loci (single nucleotide polymorphisms –SNPs; and insertion/deletions- INDELs) for Ipe (Handroanthus sp.), intended to help population genetics, phylogeography and DNA fingerprinting studies. The last chapter discuss the feasibility of DNA fingerprinting for Handroanthus species. It brings genetic diversity analysis, genetic differentiation of Handroanthus sp. sample-populations, as well as among countries, self-assignment and timber assignment tests analysis.

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-04-08T12:53:20Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Nathália Leite.pdf: 1163803 bytes, checksum: ed3fcb6e6b34f0c3e3452518a29c3263 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-08T12:53:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Nathália Leite.pdf: 1163803 bytes, checksum: ed3fcb6e6b34f0c3e3452518a29c3263 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / CNPq / O presente estudo foi realizado com os objetivos de identificar acessos de feijão-caupi tolerantes ao caruncho (C. maculatus) e caracterizar esses acessos a nível molecular, em conjunto a acessos de V. unguiculata ssp. cylindrica e V. radiata, por meio de marcadores DAF (DNA Amplification Fingerprinting) e ISSR (Inter Simple Sequence Repeat), visando identificar parentais promissores para futuros trabalhos de melhoramento, bem como para mapeamento, pela associação com o nível de resposta ao caruncho. Para identificação da tolerância ao caruncho em feijão-caupi, 27 acessos foram avaliados em ensaios de laboratório, utilizando-se o Delineamento Experimental Inteiramente Casualizado. Para cada acesso, uma amostra com 30 grãos de feijão-caupi foi infestada com cinco casais de caruncho com até 24 h de idade, sendo os resultados obtidos submetidos à análise estatística e suas médias comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. Para as duas variáveis estudadas, o acesso INHUMA comportou-se como suscetível, enquanto os acessos PATATIVA e MNC99-537F-4 apresentaram-se tolerantes para ambas as variáveis. Os demais acessos testados apresentaram comportamento intermediário, o que não os diferencia em relação à INHUMA, PATATIVA e MNC99-537F-4. Na caracterização molecular dos acessos, 25 primers geraram um total de 239 amplicons, dos quais 163 foram polimórficos. Os fragmentos amplificados foram incluídos em uma matriz de dados para análise pelo método de Neighbor-Joining. No fenograma obtido, V. radiata e V. unguiculata ssp. cylindrica assumiram uma posição basal isolada dos subgrupos formados, enquanto que os acessos de V. unguiculata subdividiram-se em dois grupos, nos quais os acessos contrastantes quanto à tolerância ao caruncho se distribuíram em subgrupos distintos, o que evidencia a existência de diferenças genéticas significativas entre alguns candidatos. Nesse sentido, os resultados obtidos demonstraram que os ensaios de tolerância ao caruncho associados à aplicação de marcadores moleculares foram capazes de identificar genótipos contrastantes de feijão-caupi promissores para aplicação em trabalhos de melhoramento vegetal, bem como para a geração de populações segregantes adequadas ao mapeamento genético.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:53:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5192_1.pdf: 788582 bytes, checksum: 9c493ee2ba6857656c0a20883bb05c1f (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / A relação biológica de leveduras industrialmente importantes do complexo Saccharomyces sensu stricto causa equívoco na correta identificação das leveduras. Por isso, este trabalho apresenta a técnica de PCR - fingerprinting com diferentes marcadores que identificaram com eficiência as verdadeiras espécies do complexo Saccharomyces sensu stricto e indicaram os híbridos naturais isolados de processos industriais. Linhagens tipo, linhagens comerciais de vinho e leveduras isoladas de vinho artesanal foram submetidas à análise de PCR - fingerprinting usando oligonucleotídeos únicos (SPAR) e análise de restrição de genes ribossomais e estruturais. Todas as seis espécies reconhecidas do complexo Saccharomyces sensu stricto foram discriminadas e erros na taxonomia anterior das leveduras de vinho foram observados. Além disso, estes marcadores SPAR mostraram a complexidade da constituição híbrida dos isolados industriais. O uso de marcadores SPAR pode ajudar na identificação de leveduras isoladas da indústria e do meio ambiente dentre uma das seis espécies do complexo Saccharomyces sensu stricto e seus híbridos interespecíficos, e na reclassificação de linhagens depositadas em coleções de leveduras. Embora este conjunto de marcadores falhe em determinar a contribuição de parentais no processo de hibridização, pode eficientemente traçar a dispersão de leveduras híbridas que foram originadas em eventos simples de hibridização. O padrão único gerado pelos marcadores SPAR foi bastante eficiente no monitoramento da população de leveduras durante o processo de fermentação industrial e pode detectar a aproximação de leveduras híbridas em cada meio ambiente

Orientador: Marcos Nogueira Eberlin / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-05T22:32:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Araujo_AlexssanderShigueru_M.pdf: 1968140 bytes, checksum: 0d036f92f1c6b65bc08f48a9c3b500ef (MD5) Previous issue date: 2005 / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-05-11T15:41:27Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Um Método de Web Fingerprinting baseado em Atributos relaci.pdf: 5647311 bytes, checksum: 2fa1d2fa1e9866efc5d985ca75224f14 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-05-11T15:41:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Um Método de Web Fingerprinting baseado em Atributos relaci.pdf: 5647311 bytes, checksum: 2fa1d2fa1e9866efc5d985ca75224f14 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-11T15:41:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Um Método de Web Fingerprinting baseado em Atributos relaci.pdf: 5647311 bytes, checksum: 2fa1d2fa1e9866efc5d985ca75224f14 (MD5) Previous issue date: 2018-04-02 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Web fingerprinting is the process in which a user is, with high likelihood, uniquely identified by the extracted features from his/her device, generating a fingerprint. In order to be effective, the method must generate a stable fingerprint, and therefore it is necessary to employ discriminatory attributes with low volatility, capable of providing the same characteristics over the time. There are a variety of proposed techniques, but not all of them are capable of generating a stable fingerprint. In this work it is proposed, designed and evaluated a Web Fingerprinting method that aims to employ features that provide characteristics related to the devices’ hardware. One of the ways to achieve this objective is through the use of technologies such as HTML5 and the Web Audio API. Theses are promising technologies for Web Fingerprinting methods because they provide features related to the devices’ hardware, which reduces the extracted fingerprint’s mutability and increases the number of target devices in which the method can be executed, since HTML5 is adopted by default in the most popular web browsers. As results, it was found that the HTML5 Canvas and the Web Audio API, when employed with other attributes related to the hardware characteristics of the device, converges to a web Fingerprinting method capable of uniquely identify several users (with 90,34% of accuracy). In addition, it was found that grouping weaker attributes with more relevant ones allows the Web Fingerprinting method to extract more characteristics than to use just relevant attributes. / Web Fingerprinting é o processo no qual um usuário é, com alta probabilidade, identificado de forma única a partir das características extraídas de seu dispositivo, gerando uma chave identificadora (fingerprint). Para um método que gere um fingerprint ser eficaz é necessário obter respostas estáveis, o que implica em empregar atributos discriminatórios com baixa volatilidade. Em outras palavras, atributos capazes de fornecer as mesmas características sobre os dispositivos ao longo do tempo. Há uma diversidade de técnicas propostas na literatura, mas nem todas são capazes de gerar um fingerprint estável. Nesta dissertação é proposto, projetado e avaliado um método de Web Fingerprinting que busca utilizar características relacionadas ao hardware dos dispositivos. Uma das formas de alcançar esse objetivo é empregar HTML5 Canvas e Web Audio API, tecnologias promissoras por serem capaz de fornecer características relacionadas ao hardware do dispositivo, o que reduz a mutabilidade do fingerprint extraído e aumenta o número de dispositivos-alvo em que o método pode ser aplicado. Como resultado, constatou-se que o emprego do HTML5 Canvas e da Web Audio API, em conjunto como outros atributos cujas características são relativas ao hardware do dispositivo, permite identificar, de forma única, com 90,34% de precisão, diversos usuários. Além disso, percebeu-se que agrupamento de atributos mais fracos com os mais discriminatórios permite extrair mais características do que utilizar atributos discriminatórios de forma isolada.

M.Sc. / Invasive species are a considerable threat to ecosystems globally, especially on islands where species diversity can be relatively low. Understanding the drivers of invasion is the first step towards an adequate management plan. Although Darwin’s naturalisation hypothesis has fuelled our understanding in this regard, several studies provided mixed results, suggesting that invasion success might be context-dependent. The main objectives of this study are two-fold: (1) testing Darwin hypothesis on Robben Island, and (2) investigating the relative role of invasive alien plants on phylogenetic diversity (PD) loss in native community. I sampled extensively the flora of the island, and using a Bayesian analysis, I reconstructed its phylogeny based on two plastid DNA loci, rbcLa and matK. I also surveyed a total of 127 plots of 50 x 50 m (i.e. local communities) where species presence/absence was recorded. Analysing phylogenetic patterns of the native and invasive floras at both regional (phylogeny level) and smaller scales (plots level), I found that invasive species are, on average, more distantly related to the native communities, giving strong support to the hypothesis tested. Furthermore I found that native communities have accumulated lower PD than alien communities; and that local communities are more overdispersed than expected. These findings suggest that competitive interactions might be the major ecological forces shaping plant communities, with the possibility of alien being higher competitors than native, and therefore decreasing native plant diversity. The implications of these findings for the recovery of native plants are also discussed. Key words: Invasion biology - Darwin’s naturalisation hypothesis - Phylogenetic diversity - Community structure - Conservation - Robben Island, South Africa.