O presente estudo teve como objetivo avaliar o efeito da inoculação com rizóbio no estabelecimento, crescimento inicial e em alguns aspectos da dinâmica de N em folhas de leguminosas (Fabaceae) arbóreas nativas plantadas por semeadura direta no campo, em área de mata ciliar no Estado de São Paulo. Foi avaliada a emergência de plântulas (% em relação ao número de sementes plantadas) até os 3 meses após a semeadura (MAS) e o crescimento em altura aos 13 MAS. O fracionamento isotópico do N foliar também foi avaliado, pelo método da abundância natural do 15N, além da concentração de N e a razão C/N foliar. Acacia polyphylla foi usada como planta-referência não-fixadora de N2. Em relação ao desenvolvimento inicial, houve grande variação entre as espécies estudadas. Acacia polyphylla e Enterolobium contortisiliquum apresentaram taxa de germinação mediana e rápido crescimento. Mimosa bimucronata e Parapiptadenia rigida tiveram crescimento relativamente rápido, porém baixo potencial germinativo. Erythrina speciosa e Poecilanthe parviflora, com crescimento lento, apresentaram germinação elevada no campo. As espécies fixadoras de N2 mostraram &#948;15 N médio de 2,7&#8240;, enquanto que a referência Acacia polyphylla se mostrou cerca de 4,0&#8240; mais enriquecida em 15N . Erythrina speciosa e Ormosia arborea apresentaram os menores valores de &#948;15N, enquanto que Parapiptadenia rigida, enriquecida em 15N, mostrou estar obtendo N exclusivamente do solo. Poecilanthe parviflora, Mimosa bimucronata e Enterolobium contortisiliquum apresentaram valores intermediários de &#948;15N, com grande variação entre os indivíduos amostrados. A concentração de N nos tecidos foliares variou entre 1,5% e 3,6%. De forma geral, esta variável não mostrou relação direta com o &#948;15N das plantas. A menor razão C/N foi observada em Enterolobium contortisiliquum e Erythrina speciosa, seguida por M. bimucronata. Nas condições experimentais locais, as plantas não responderam à inoculação com rizóbio em nenhum dos parâmetros avaliados (estabelecimento, crescimento inicial, &#948;15N, concentração de N e razão C/N). As espécies de crescimento mais lento e com alta incidência de herbivoria observados no campo (E. speciosa e O. arborea) foram também as que apresentaram &#948;15N na faixa considerada como de ocorrência da fixação biológica de nitrogênio. Os resultados indicam, para as outras espécies, maior aquisição de N proveniente do solo. / The aim of this work was to assess the effect of rhizobia inoculation on the establishment, early growth and some aspects of N dynamics in direct-seeded native legume (Fabaceae) trees in a riparian zone of São Paulo State, Southeastern Brazil. Seedling emergency (% of total planted seeds) was evaluated until three months after sowing (MAS), and the height of the trees were measured at 13 MAS. Isotopic N fractionation was also assessed by the 15N natural abundance method, as well as foliar N content and C/N ratio. Acacia polyphylla was used as a non-N2-fixing reference plant. Acacia polyphylla and Enterolobium contortisiliquum grew most rapidly, with moderate germination rate. Mimosa bimucronata and Parapiptadenia rigida were fast-growing but with low establishment rate. Erythrina speciosa and Poecilanthe parviflora showed low growing rate, but high germination potential. The N2-fixers showed an average foliar &#948;15N of 2,7&#8240;, while the reference-plant was 4,0&#8240; more <sup15>N enriched. Erythrina speciosa and Ormosia arborea showed the lowest &#948;15N values. The high &#948;15N of Parapiptadenia rigida probably indicated that it is obtaining N exclusively from the soil. Poecilanthe parviflora, Mimosa bimucronata and Enterolobium contortisiliquum showed intermediate &#948;15N values, with strong variations among the sampled individuals. Foliar N concentrations varied from 1,5% to 3,6%. In general, N concentrations were not correlated with foliar &#948;15N . The lowest C/N ratio was observed on E. contortisiliquum and E. speciosa , followed by M. bimucronata. In this field trial conditions, rhizobia inoculation did not show differences in all surveyed parameters (establishment, early growth, foliar &#948;15N, total N content and C/N ratio of trees). The slow-growing species, E. speciosa and O. arborea , that also had a high herbivore attack observed in the field, showed foliar &#948;15N in the biological N2 fixation range. The results suggested, for the other species, a larger soil N acquisition.

Made available in DSpace on 2017-07-25T19:30:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Angelo Rafael Bini.pdf: 1115540 bytes, checksum: 5f12fb7c28e1eb476b199cd1f659030f (MD5) Previous issue date: 2015-08-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The adequate supply of nitrogen (N) is essential for obtaining high grain yields. However, use of high doses of N can reduce the efficiency of using the N and cause environmental contamination. The supply of N through biological fixation on corn and wheat may contribute to the sustainability of agricultural production. This study was carried out with the purpose of evaluate (i) the soil chemical attributes after seed inoculation with Azospirillum brasilense and the application of nitrogen in top dressing and (ii) plant nutrition, grain yield, nutrient uptake and N use efficiency in corn and wheat on the basis of seed inoculation with Azospirillum brasilense and nitrogen fertilization. The experiment was conducted in Ponta Grossa (PR) on a very loamy, kaolinitic, thermic Typic Hapludox (Oxisol) for 34 years under no-tillage. The experimental design used was a randomized block, in a split plot arrangement, with three replications. The plots were employed treatments with and without seed inoculation with Azospirillum brasilense and the subplots were applied four doses of nitrogen in the form of urea in corn (0, 80, 160 and 240 kg ha-1) and wheat (0, 40, 80 and 120 kg ha-1). Corn was cultivated after black oat and wheat was grown after corn. Soil samples collected at 0-10, 10-20 and 20-40 cm depths, after corn harvest, revealed no changes in pH and Al, Ca, Mg, K, P and S-SO42 - depending on the inoculation with Azospirillum, and it was observed increase in Mg content in the 10-20 cm layer in response to nitrogen fertilization. Seeds inoculation with Azospirillum did not affect the leaf contents of macronutrients in maize and wheat, and doses of nitrogen in increased levels of N, P and S in corn leaves, and N, K and Ca in the leaves wheat. The corn production was hampered by inoculation with Azospirillum without N fertilization and was favored by Azospirillum when the highest dose of N was applied (240 kg ha-1). In wheat crop, inoculation with Azospirillum increased grain yield in the treatments without N and 40 and 80 kg N ha-1, and depressed grain yield when the highest dose of N (120 kg ha-1) was applied cover. The nitrogen fertilization increased the productivity of maize and wheat grain, both in the absence and in the presence of inoculation with Azospirillum. Seeds inoculation with Azospirillum did not alter the nutrient uptake by corn and increased the extraction of P and S for the wheat crop. Nitrogen fertilization resulted in increased coverage in the extraction of N, P, Ca, Mg and S for corn, and K11 and S for wheat. Inoculation with Azospirillum favored the extraction of N for wheat crop only in the plots without N and application of the lower dose of N (40 kg ha-1) in coverage. The nitrogen fertilization increased the extraction of N for wheat crop with or without Azospirillum. Seeds inoculation with Azospirillum increased agronomic efficiency (EA) of nitrogen fertilization in corn and caused increase in the Partial Factor Productivity of N (FPPN) in wheat crop when the lowest dose of N (40 kg ha-1) was applied to cover. Inoculation of maize and wheat seeds with Azospirillum brasilense, associated with the adjustment of nitrogen fertilization, proved to be feasible capable to maximize grain yield crops in no-tillage system. / O fornecimento adequado de nitrogênio (N) é primordial para a obtenção de altos rendimentos de grãos de cereais. Entretanto, a utilização de elevadas doses de N pode reduzir a eficiência na utilização do N e causar problemas de contaminação ambiental. O fornecimento de N via fixação biológica nas culturas de milho e trigo pode contribuir para a sustentabilidade da produção agrícola. Este estudo foi realizado com o objetivo de avaliar (i) as alterações químicas do solo após a inoculação das sementes com Azospirillum brasilense e a aplicação de nitrogênio em cobertura e (ii) a nutrição das plantas, a produtividade de grãos, a extração de nutrientes e a eficiência de uso do N nas culturas de milho e trigo em função da inoculação das sementes com Azospirillum brasilense e da adubação nitrogenada em cobertura. O experimento foi realizado em Ponta Grossa (PR), em um Latossolo Vermelho distrófico textura muito argilosa há 34 anos sob plantio direto. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, em parcelas subdivididas, com três repetições. Nas parcelas, foram empregados os tratamentos sem e com inoculação das sementes com Azospirillum brasilense e, nas subparcelas, foram aplicadas quatro doses de N em cobertura, na forma de ureia, nas culturas de milho (0, 80, 160 e 240 kg ha-1) e trigo (0, 40, 80 e 120 kg ha-1). O milho foi cultivado após aveia preta e o trigo foi cultivado após o milho. Amostras de solo coletadas nas camadas de 0-10, 10-20 e 20-40 cm, após a colheita do milho, não revelaram alterações nos valores de pH e nos teores de Al, Ca, Mg, K, P e S-SO42- em função da inoculação com Azospirillum, tendo-se observado elevação nos teores de Mg na camada de 10-20 cm em resposta à adubação nitrogenada. A inoculação das sementes com Azospirillum não alterou os teores foliares de macronutrientes nas culturas de milho e trigo, e as doses de N em cobertura aumentaram os teores de N, P e S nas folhas do milho, e de N, K e Ca nas folhas de trigo. A produtividade do milho foi prejudicada pela inoculação com Azospirillum na ausência de adubação nitrogenada em cobertura e foi favorecida pelo Azospirillum quando a maior dose de N foi aplicada (240 kg ha-1). Na cultura do trigo, a inoculação com Azospirillum aumentou a produtividade de grãos nos tratamentos sem N e com 40 e 80 kg N ha-1, e deprimiu a produtividade de grãos quando a maior dose de N (120 kg ha-1) foi aplicada em cobertura. A adubação nitrogenada em cobertura aumentou a produtividade de grãos de milho e trigo, tanto na ausência como na presença de inoculação com Azospirillum. A 9 inoculação das sementes com Azospirillum não alterou a extração de nutrientes pela cultura do milho e aumentou a extração de P e S pela cultura do trigo. A adubação nitrogenada em cobertura ocasionou incremento na extração de N, P, Ca, Mg e S pelo milho, e de K e S pelo trigo. A inoculação com Azospirillum favoreceu a extração de N pela cultura do trigo somente nas parcelas sem N e com aplicação da menor dose de N (40 kg ha-1) em cobertura. A adubação nitrogenada em cobertura aumentou a extração de N pela cultura do trigo com ou sem Azospirillum. A inoculação das sementes com Azospirillum aumentou a eficiência agronômica (EA) da adubação nitrogenada em cobertura na cultura do milho e ocasionou incremento no Fator Parcial de Produtividade do N (FPPN) na cultura do trigo quando a menor dose de N (40 kg ha-1) foi aplicada em cobertura. A inoculação das sementes de milho e trigo com Azospirillum brasilense, associada com o ajuste da adubação nitrogenada em cobertura, mostrou-se viável para maximizar a produtividade de grãos das culturas em sistema plantio direto.

Cette thèse s’attache à la maximisation de la consommation du dioxyde de carbone par les microalgues. En effet, suite aux différentes problématiques environnementales actuelles liées principalement aux émissions importantes de gaz à effet de serre et notamment le CO2, il a été démontré que les microalgues jouent un rôle très prometteur pour la bio-fixation du CO2. Dans cette optique, nous nous intéressons à la mise en place d’une loi de commande robuste permettant de garantir des conditions opératoires optimales pour une culture de la microalgue Chlorella vulgaris dans un photobioréacteur instrumenté. Cette thèse repose sur trois axes principaux. Le premier porte sur la modélisation de la croissance de l’espèce algale choisie à partir d’un modèle mathématique traduisant l’influence de la lumière et de la concentration en carbone inorganique total. En vue de la commande, le deuxième axe est consacré à l’estimation de la concentration cellulaire à partir des mesures disponibles en temps réel du dioxyde de carbone dissous. Trois types d’observateurs ont été étudiés et comparés : filtre de Kalman étendu, observateur asymptotique et observateur par intervalles. Le dernier axe concerne l’implantation d’une loi de commande prédictive non-linéaire couplée à une stratégie d’estimation pour la régulation de la concentration cellulaire autour d’une valeur maximisant la consommation du CO2. Les performances et la robustesse de cette commande ont été validées en simulation et expérimentalement sur un photobioréacteur instrumenté à l’échelle de laboratoire. Cette thèse est une étude préliminaire pour la mise en œuvre de la maximisation de la fixation du dioxyde de carbone par les microalgues. / This thesis deals with the optimization of carbon dioxide consumption by microalgae. Indeed, following several current environmental issues primarily related to large emissions of CO2, it is shown that microalgae represent a very promising solution for CO2 mitigation. From this perspective, we are interested in the optimization strategy of CO2 consumption through the development of a robust control law. The main aim is to ensure optimal operating conditions for a Chlorella vulgaris culture in an instrumented photobioreactor. The thesis is based on three major axes. The first one concerns growth modeling of the selected species based on a mathematical model reflecting the influence of light and total inorganic carbon concentration. For the control context, the second axis is related to biomass estimation from the real-time measurement of dissolved carbon dioxide. This step is necessary for the control part due to the lack of affordable real-time sensors for this kind of measurement. Three observers structures have been studied and compared: an extended Kalman filter, an asymptotic observer and an interval observer. The last axis deals with the implementation of a non-linear predictive control law coupled to the estimation strategy for the regulation of the cellular concentration around a value which maximizes the CO2 consumption. Performance and robustness of this control law have been validated in simulation and experimentally on a laboratory-scale instrumented photobioreactor. This thesis represents a preliminary study for the optimization of CO2 mitigation strategy by microalgae.

Thesis (Ph. D.)--Joint Program in Oceanography/Applied Ocean Science and Engineering (Massachusetts Institute of Technology, Dept. of Earth, Atmospheric, and Planetary Sciences; and the Woods Hole Oceanographic Institution), 2013. / In title on title page, "[delta]" appears as lower case Greek letters. Cataloged from PDF version of thesis. / Includes bibliographical references. / The stable isotopes, [delta]¹⁵N and [delta]¹⁸O, of nitrite and nitrate can be powerful tools used to interpret nitrogen cycling in the ocean. They are particularly useful in regions of the ocean where there are multiple sources and sinks of nitrogenous nutrients, which concentration profiles alone cannot distinguish. Examples of such regions are "oxygen deficient zones" (ODZ). They are of particular interest because they are also important hot spots of fixed N loss and production of N₂O, a potent greenhouse gas. In order to interpret these isotope profiles, the isotope systematics of each process involved must be known so that we can distinguish the isotopic signature of each process. One of the important processes to consider here is nitrification, the process by which ammonium is oxidized nitrite and then to nitrate. This thesis describes numerous experiments using both cultures of nitrifying organisms as well as natural seawater samples to determine the oxygen isotope systematics of nitrification. These experimental incubations show that the accumulation of nitrite has a large effect on the resulting [delta]¹⁸ONO3. In experiments where nitrite does not accumulate, [delta]¹⁸ONO3 produced from nitrification is between -1 to l%o. These values will be applicable for the majority of the ocean, but the nitrite isotopic exchange will be important in the regions of the ocean where nitrite accumulates, such as the base of the euphotic zone and oxygen deficient zones. [delta]¹⁸ONO2 was developed as a unique tracer in this thesis because it undergoes abiotic equilibration with water [delta]¹⁸O at a predictable rate based on pH, temperature and salinity. This rate, its dependencies, and how the [delta]¹⁸ONO2 values can be used as not only biological source indicators but also indicators of age are described. This method was applied to samples from the primary nitrite maximum in the Arabian Sea, revealing that the dominant source and sinks of nitrite are ammonia oxidation and nitrite oxidation with an average age of 37 days. Finally, using the isotope systematics of nitrification as well as the properties of nitrite oxygen isotope exchange described in this thesis, the final chapter interprets multiisotope nitrate and nitrite profiles in the Costa Rica Upwelling Dome using a simple ID model. The nitrite isotopes showed that there were multiple sources of nitrite in the primary nitrite maximum including (1) decoupling of ammonia oxidation and nitrite oxidation, (2) nitrate reduction during assimilation and leakage of nitrite by phytoplankton. In the oxygen deficient zone and secondary nitrite maximum, there were equal contributions of nitrite removal from nitrite oxidation and nitrite reduction. This recycling of nitrite to nitrate through oxidation indicates that the percentage of reduced nitrate fully consumed to N2 gas is actually smaller than previous estimates. Overall, this thesis describes new nitrogen and oxygen isotopic tracers and uses them to elucidate the complicated nitrogen biogeochemistry in oxygen deficient zones. / by Carolyn Buchwald. / Ph.D.

Um sistema mais adequado de fixação interna no tratamento de fraturas mandibulares é essencial para um bom resultado. Foi realizado um estudo comparativo da utilização do sistema de fixação 2.0-mm locking com sistemas convencionais no tratamento de fraturas mandibulares. Para este estudo, 87 pacientes consecutivos com 134 fraturas mandibulares foram divididos aleatoriamente para receber placas 2.0-mm locking (n = 45) ou convencionais 2.0-mm ou 2.4-mm (n = 42) e tiveram um seguimento mínimo de 6 meses. Foram obtidos dados pessoais, presença de doenças sistêmicas, abuso de substâncias, etiologia, politraumatismo e as localizações. As fraturas foram classificadas com base no grau de deslocamento e de complexidade. Foi mensurada a amplitude da abertura bucal. Análises estatísticas foram feitas na comparação entre grupos (p<= 0,050). Houve maior faixa etária (p = 0,010) e mais distúrbios gerais (p< 0,001) no Grupo Locking. Houve maior gravidade das fraturas (p= 0,004) no Grupo Convencional. Houve diferença significante para a localização das fraturas (p = 0,009), com mais casos na região de corpo no Grupo Locking. Houve aumento progressivo dos valores da abertura bucal, com diferença significante em ambos os grupos (p<= 0,050), sendo que o convencional apresentou melhor recuperação (47,2 ± 8,9 mm). Um caso de complicação pós-operatória maior ocorreu no Grupo Locking (2,2%) e três casos no Grupo Convencional (7,1%). Foi observado que o sistema 2.0-mm locking mostrou melhores resultados clínicos, pois ocorreu apenas um caso de complicação maior, porém o grupo convencional mostrou recuperação mais rápida da abertura bucal e, que também foi constatado que o sistema 2.0-mm locking foi efetivo no tratamento de fraturas desfavoráveis que necessitariam do sistema 2.4-mm convencional. / A more adequate system of internal fixation in the treatment of mandibular fractures is essential for a good result. A comparative study of the use of the 2.0-mm locking fixation system with conventional systems in the treatment of mandibular fractures was performed. For this study, 87 consecutive patients with 134 mandibular fractures were randomized to receive 2.0-mm locking plates (n = 45) or conventional 2.0-mm or 2.4-mm plates (n = 42) and had a minimum follow-up of 6 months. Fractures were classified based on the degree of displacement and complexity. The amplitude of mouth opening was measured. Statistical analyses were performed to compare groups (p <= 0.050). There were older age (p = 0.010) and more substance abuse (p = 0.001) in the Locking group. There was more complex fractures (p = 0.017) and teeth in the fracture line (p = 0.044) in the conventional group. There was a significant difference for the location of fractures (p = 0.009), with more cases in the body region in the Locking group. There was a progressive increase in the values of mouth opening, with a significant difference in both groups (p <= 0.050), whereas the conventional group showed better recovery (47.2 ± 8.9 mm). A case of major postoperative complication occurred in the Locking Group (2.2%) and three cases in the conventional group (7.1%). The 2.0-mm locking system showed better clinical outcomes because there was only one case of major complications and was effective in the treatment of unfavorable fractures that would require the conventional system 2.4-mm but the group treated with conventional systems showed faster recovery of mouth opening.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-21T14:16:41Z No. of bitstreams: 1 Paulo Geovani Silva Martins.pdf: 3068367 bytes, checksum: a2b6a221541b1632f6a29c5025ee09e4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T14:16:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paulo Geovani Silva Martins.pdf: 3068367 bytes, checksum: a2b6a221541b1632f6a29c5025ee09e4 (MD5) Previous issue date: 2011-02-21 / Leguminosae is the third largest angiosperm family, with around 700 genera, of which the Mimosoideae subfamily comprehends 78 genera, with emphasis to Acacia, Mimosa and Inga. Mimosa caesalpiniifolia Benth., known as “sabiá” or “sansão do campo” is considered to be one of the most important native tree species of the Brazilian semiarid due to its multiuse capability, and high potential for degraded area recovery, since it fixes nitrogen in symbiosis with diazotrophic bacteria. Diazotrophic bacteria taxonomy has been changing due to joint use of phenotypic, physiologic and molecular tools. This work aimed to evaluate “sabiá” and its symbiotic bacteria diversity in five Northeastern municipalities. It was conducted from April, 2010 to March, 2011, at Pernambuco Federal Agricultural University and the Genome Laboratory of the Pernambuco Agronomic Institute. For “sabiá” phylogenetic studies, leaves from native or naturalized plants were collected at Crato, Gravatá, Itambé, Mossoró and Serra Talhada, with their genomic DNA extracted with a commercial kit. The intergenomic atpB-rcbL region of chloroplastic DNA was amplified and used to construct Bayesian Inference phylogenesis of the accesses. Soil samples were collected at the same time of plant collection, and “sabiá” plants were used as bait for rhizobial nodules using Leonard jars, at a greenhouse. Nodule bacteria were isolated and purified in YMA media with Congo Red, and morpho-physiologically characterized on YMA media with Bromothymol Blue. The isolates were later grown in liquid TY media for DNA extraction with a commercial kit. Amplifications were conducted with REP, ERIC and BOX primers, and 16S rDNA was amplified and sequenced. Intergenic atpB-rbcL chloroplast DNA sequences did not match any NCBI entry. CRATO 4 and SERRA TALHADA 20 accesses formed an external group indicated they may be genetically closer to a Mimosa ancestor. The high segregation of the species affected diversity within and among the different areas, and plant biogeography was not confirmed. Genomic fingerprinting of the 47 isolates had different patterns for REP, ERIC and BOX elements, but compilation of the results created the dendrogram with the most groups. The 16S rDNA sequences were blasted in GenBank, and the isolates had 68 to 99% similarity with Burkholderia strains. The phylogenetic tree constructed with the 16S rDNA, combined with sequences from strains recommended for legume inoculation, show these isolates to be diverse from the currently recommended. Isolates PE-MO01, PE-MO02 and PE-MO04 were the most different among the isolates. The lack of molecular phylogeny data for “sabiá” shows the need of using other taxonomic markers to evaluate this species diversity, and the 16S rDNA sequences confirm the Mimosa symbiosis preference for Burkholderia strains. / A família Leguminosae é a terceira maior família de angiospermas com aproximadamente 700 gêneros, dos quais a subfamília Mimosoideae compreende 78 gêneros, destacando-se Acacia, Mimosa e Inga. A espécie Mimosa caesalpiniifolia Benth., conhecida como sabiá ou sansão do campo, é considerada uma das espécies arbóreas nativas mais importantes do semiárido brasileiro por apresentar múltiplo uso e grande potencial para recuperação de áreas degradadas por fixar nitrogênio em simbiose com bactérias diazotróficas. A taxonomia das bactérias diazotróficas vem mudando pela utilização em conjunto de aspectos fenotípicos e fisiológicos e de ferramentas moleculares. Objetivou-se avaliar a filogenia de plantas de sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth.) e a diversidade e filogenia de suas bactérias simbióticas em cinco municípios nordestinos. O trabalho foi conduzido de abril de 2010 a março de 2011, na Universidade Federal Rural de Pernambuco e no Laboratório de Genoma do Instituto Agronômico de Pernambuco. Para os estudos filogenéticos do sabiá, folhas de plantas nativas ou naturalizadas foram coletadas em Crato, Gravatá, Itambé, Mossoró e Serra Talhada, e tiveram o DNA genômico extraído utilizando-se kit comercial. Foram realizadas amplificações da região espaçadora intergênica atpB-rcbL do genoma cloroplastidial que foram usadas para construir a Inferência Bayesiana da filogenia entre os acessos. Amostras de solo foram coletadas à mesma época das coletas das folhas e plantas de sabiá foram usadas como plantas-isca para obtenção de nódulos de rizóbios utilizando-se Vasos de Leonard, em casa de vegetação. As bactérias presentes nos nódulos foram isoladas e purificadas em meio YMA com Vermelho Congo e a caracterização morfofisiológica dos isolados foi realizada em meio YMA com Azul de Bromotimol. Posteriormente os isolados foram crescidos em meio TY líquido para extração do DNA com kit comercial. Foram realizadas amplificações com os oligonucleotideos BOX, ERIC e REP e amplificação e sequenciamento do 16S DNAr. As sequências do espaço intergênico cloroplastidial atpB-rbcL não corresponderam com qualquer outra sequência depositada no NCBI. Os acessos CRATO 4 e SERRA TALHADA 20 formaram um grupo externo indicando que podem ser as mais próximas geneticamente. A alta taxa de segregação da espécie influenciou na diversidade dentro e entre as diferentes áreas estudadas e a origem geográfica não determina a variação dos observados nos acessos das plantas estudadas. Os fingerprints genômico dos 47 isolados utilizando os elementos BOX, ERIC e REP apresentaram padrões de amplificações distintos, porém a compilação dos resultados criou o dendrograma com maior número de grupos. As sequências 16S DNAr foram comparadas no GenBank através do programa BLAST, e os isolados apresentam identidade variando entre 68 e 99% com estirpes do gênero Burkholderia. A árvore filogenética construída com as sequências da região 16S DNAr dos isolados, juntamente com as sequências da região 16S DNAr de estirpes tipo recomendadas para inoculação de leguminosas, indica que os isolados obtidos são geneticamente distintos das estirpes recomendadas. Os isolados PE-MO01, PE-MO02 e PE-MO04 destacaram-se por serem os mais distintos dentro do grupo de isolados. A escassez de dados de filogenia molecular da espécie Mimosa caesalpiniifolia Benth. revela a necessidade da utilização de outros marcadores taxonômicos para conhecimento da filogenia e da diversidade desta espécie e as sequências do gene 16S DNAr confirmam a preferência de simbiose entre espécies de leguminosas do gênero Mimosa com bactérias diazotróficas do gênero Burkholderia.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:43:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KerlisonPO_DISSERT.pdf: 1641521 bytes, checksum: 5f1078757c465e02ee64ce8aff96f794 (MD5) Previous issue date: 2012-12-18 / The aim of this study was to comparatively evaluate the mechanical strength of squared and rectangular 2.0 mm system miniplates comparing them to the standard configuration with 2 straight miniplates in stabilizing fractures in the anterior mandible. Ninety synthetic polyurethane mandible replicas were used in mechanical test. The samples were divided into six groups of three different methods for fixation. Groups 1, 2 and 3 showed complete fractures in symphysis, characterized by a linear separation between the medial incisor, and groups 4, 5 and 6 showed complete fractures in parasymphysis with oblique design. Groups 1 and 4 were represented by the standard technique with two straight miniplates parallel to each other. Groups 2 and 5 were stabilized by squared miniplates and groups 3 and 6 were fixed by rectangular design. Each group was subjected to a mechanical test at a displacement speed of 10 mm/min on a universal testing machine, receiving linear vertical load on the region of the left first molar. The values of the maximum load and when displacements reached 5 mm were obtained and statistically analyzed by calculating the confidence interval of 95%. Fixation systems using squared (G2) and rectangular (G3) miniplates obtained similar results. No statistically significant differences with respect to the maximum load and the load at 5 mm displacement were found when compared to standard method in symphyseal fractures (G1). In parasymphysis the fixation method using squared miniplates (G5) obtained results without significant differences regarding the maximum load and the load at 5 mm when compared to the standard configuration (G4). The fixation method using rectangular miniplates (G6) showed inferior results which were statistically significant when compared to the standard configuration (G4) for parasymphysis fractures. The mechanical behavior of the fixation methods was similar, except when rectangular miniplates were used. The fixation methods showed better results with statistical significance in symphyseal fractures / O prop?sito deste estudo foi avaliar comparativamente a resist?ncia mec?nica de miniplacas quadradas e retangulares do sistema 2.0 mm, comparando-as ? configura??o padr?o, com 2 miniplacas retas, na estabiliza??o de fraturas na regi?o anterior de mand?bula. Noventa r?plicas de mand?bulas de poliuretano foram utilizadas no ensaio mec?nico. As amostras foram divididas em 6 grupos com 3 m?todos de fixa??o do sistema 2.0 mm. Os grupos 1, 2 e 3 apresentavam fraturas sinfis?rias completas, caracterizadas pela separa??o linear entre os incisivos mediais, e os grupos 4, 5 e 6 apresentavam fraturas parassinfis?rias completas com desenho obl?quo. Os grupos 1 e 4 foram representados pelo m?todo padr?o, com 2 miniplacas retas, dispostas paralelamente entre si. Os grupos 2 e 5 tiveram as mand?bulas estabilizadas por meio de miniplacas quadradas e os grupos 3 e 6, pelas retangulares. Cada grupo foi submetido a um teste mec?nico realizado por meio de uma m?quina de ensaio universal, na velocidade de 10mm/minuto, recebendo carga vertical linear na regi?o de primeiro molar esquerdo. Os valores da carga m?xima e da carga com deslocamento pr?-estabelecido em 5 mm foram obtidos e submetidos ? an?lise estat?stica a partir do c?lculo do intervalo de confian?a de 95%. Os sistemas de fixa??o utilizando miniplacas quadradas (G2) e retangulares (G3) obtiveram resultados similares, sem diferen?as estatisticamente significativas em rela??o ? carga m?xima e ? carga no deslocamento de 5 mm, quando comparada ? configura??o padr?o (G1), nas fraturas sinfis?rias da mand?bula. Nas fraturas parassinfis?rias, o m?todo de fixa??o utilizando miniplacas quadradas (G5) obteve resultados sem diferen?as estatisticamente significativas no que se refere ? carga m?xima e ? carga no deslocamento de 5 mm, quando comparadas ? configura??o padr?o (G4). O m?todo de fixa??o utilizando as miniplacas retangulares (G6) obteve resultados inferiores, estatisticamente significantes, quando comparado ? configura??o padr?o (G4) nas fraturas parassinfis?rias. O comportamento mec?nico dos m?todos de fixa??o estudados foi similar, exceto nas fraturas parassinfis?rias, quando se utilizaram as miniplacas com a configura??o retangular. Os m?todos de fixa??o utilizados apresentaram melhores resultados, com signific?ncia, nas fraturas sinfis?rias

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-05T18:06:20Z No. of bitstreams: 2 Sampaio, Fernanda Bueno - 2013.pdf: 855102 bytes, checksum: 072ad37c90c900b69a5b7d188b872f7c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-05T18:06:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Sampaio, Fernanda Bueno - 2013.pdf: 855102 bytes, checksum: 072ad37c90c900b69a5b7d188b872f7c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The bean is a legume widespread throughout the country and an important source of protein in human food. Inoculation of legumes with rhizobia able to perform biological nitrogen fixation (BNF), has been widely discussed, based on studies indicating its feasibility for use in agriculture, since the BNF decreases partly environmental liabilities generated by high consumption of nitrogen fertilizer. The use of wild bean genotypes seeks greater diversity of rhizobia for isolation and study of the ability of BNF, which may result in greater specificity for symbiotic bean crop. The objective was to obtain and characterize the morphology and on the use of carbon sources captured populations of rhizobia in wild bean genotypes, soil from the states of Goiás, Minas Gerais and Paraná. Soil samples were collected from six areas in the depth of 0-20 cm for conducting chemical and physical analyzes and an test was conducted in a greenhouse in pots of 3 liters sterilized with 11 wild bean genotypes to obtain the isolates. Were obtained 523 isolates of rhizobia and selected 231 isolates, 76 of Goiás, Minas Gerais 99, and 56 of Paraná. A total of seven species of bacteria as reference strains, three of the genus Rhizobium tropici (SEMIA 4077, SEMIA 4080 and SEMIA 4088), three of the genus Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli (BR266, BR351 and BR281) and one of the genus Rhizobium multihospitium (R82), for comparison with the data obtained. The isolates were characterized morphologically and on the use of carbon sources. From the information similarity matrices were generated using Jaccard coefficient being generated for the states of Goiás, Minas Gerais and Paraná, similarity dendrograms by UPGMA clustering method, using the software NTSYS-pc, version 1.8. The 523 isolates were obtained from nodules of wild bean genotypes with the predominance of isolates that acidify the culture medium and fast growth, and the solos from Araucária and Prudentópolis produce greater amount of mucus that of Jussara, Nova Veneza, Uberlândia and Unaí. The rhizobia isolates obtained from soils of Goiás and Minas Gerais exhibit greater phenotypic diversity than those from soils of Paraná. Usage analysis of carbon sources revealed that rhizobia isolates obtained from soils of Goiás have higher metabolic diversity. Overall, the largest number of isolates grouped with the reference strains, especially with the inoculant strains used as the common bean (SEMIA 4080, SEMIA SEMIA 4088 and SEMIA 4077), indicating that these isolates have metabolic characteristics similar to these strains. / O feijoeiro é uma leguminosa bastante difundida em todo o território nacional e importante fonte de proteína na alimentação humana. A inoculação de plantas leguminosas com rizóbios, capazes de realizar a fixação biológica de nitrogênio (FBN), tem sido amplamente discutida, com base em estudos que indicam a sua viabilidade de utilização na agricultura, visto que a FBN diminui em parte o passivo ambiental gerado pelo elevado consumo de fertilizante nitrogenado. A utilização de genótipos silvestres de feijoeiro visa obter uma maior diversidade de rizóbios para isolamento e estudo da capacidade de FBN, o que poderá resultar em maior especificidade simbiótica para a cultura do feijoeiro. Objetivou-se obter e caracterizar morfologicamente e quanto ao uso de fontes de carbono isolados de rizóbios capturados em genótipos silvestres de feijoeiro, de solos oriundos dos Estados de Goiás, Minas Gerais e Paraná. As amostras de solo das seis áreas foram coletadas na profundidade de 0-20 cm para realização de análises químicas e físicas e foi realizado um ensaio em casa-de-vegetação, em vasos de 3 litros esterilizados, com 11 genótipos silvestres de feijoeiro para obtenção dos isolados. Foram obtidos 523 isolados de rizóbios, e selecionados 231 isolados, sendo 76 de Goiás, 99 de Minas Gerais e 56 do Paraná. Foram utilizadas sete espécies de bactérias como estirpes de referência, sendo três do gênero Rhizobium tropici (SEMIA 4077, SEMIA 4080 e SEMIA 4088), três do gênero Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli (BR266, BR351 e BR281) e uma do gênero Rhizobium multihospitium (R82), para fins de comparação com os dados obtidos. Os isolados foram caracterizados morfologicamente e quanto ao uso de fontes de carbono. A partir das informações foram geradas matrizes de similaridade usando coeficiente de Jaccard, sendo gerados para os estados de Goiás, Minas Gerais e Paraná, dendrogramas de similaridade pelo método de agrupamento UPGMA, usando o software NTSYS-pc, versão 1.8. Obteve-se 523 isolados de nódulos de genótipos silvestres de feijoeiro com predominância de isolados que acidificam o meio de cultivo e de crescimento rápido, sendo que os provenientes de solos de Araucária e Prudentópolis produzem maior quantidade de muco que os de Jussara, Nova Veneza, Uberlândia e Unaí. Os isolados de rizóbios obtidos de solos do estado de Goiás e Minas Gerais apresentam maior diversidade fenotípica do que aqueles oriundos de solos do Paraná. A análise de uso de fontes de carbono revela que os isolados de rizóbios obtidos de solos do estado de Goiás apresentam maior diversidade metabólica. De forma geral, o maior número de isolados agrupa com as estirpes referência, especialmente com as estirpes usadas como inoculante do feijoeiro comum (SEMIA 4080, SEMIA 4088 e SEMIA 4077), indicando que estes isolados apresentam características metabólicas semelhantes a estas estirpes.

INTRODUÇÃO: As fraturas diafisárias do fêmur e da tíbia encontram-se em destaque devido a sua elevada incidência e alto impacto econômico e social. A osteossíntese com uso da haste intramedular (HIM) é o procedimento cirúrgico de escolha. A infecção de sítio cirúrgico (ISC) relacionada a HIM é considerada uma complicação grave e de difícil tratamento. OBJETIVOS: 1. Determinar a incidência de ISC após a implantação de HIM para fixação de fraturas diafisárias de fêmur e tíbia. 2. Avaliar os possíveis fatores associados. MÉTODOS: Estudo prospectivo observacional do tipo coorte. Para definição de ISC, foram utilizados os critérios do CDC-NHSN. A incidência de ISC foi calculada como a relação entre o número de pacientes com ISC em relação ao número total de pacientes. Para avaliação dos potenciais fatores associados, foram analisados aqueles relacionados aos pacientes (idade, gênero, índice de massa corpórea, presença de focos ativos de infecção à distância, presença condições imunossupressoras, avaliação de estado físico segundo escore ASA, etilismo, tabagismo, uso de drogas ilícitas, politrauma, etiologia do trauma, tipo de fratura quanto à exposição óssea, classificação da fratura segundo Müller AO, classificação segundo Tcherne para as fraturas fechadas, classificação segundo Gustilo-Anderson para as fraturas expostas, permanência em outro serviço de saúde, uso prévio de fixador externo, antecedente de manipulação cirúrgica na topografia da fratura, uso de hemoderivados); dos fatores relacionados ao ambiente cirúrgico e ao ato operatório (classificação da ferida quanto ao potencial de contaminação, duração da cirurgia, tricotomia, possível contaminação intraoperatória, uso de antimicrobianos relacionados ao procedimento cirúrgico, uso de drenos, ocorrência de hipotermia ou hipóxia no período perioperatório, tipo de HIM utilizada, fresagem, necessidade de necessidade de reparo do revestimento cutâneo associado à topografia da fratura, uso de terapia por pressão negativa) e dos fatores relacionados à microbiota (colonização por S. aureus ou A. baumannii). RESULTADOS: 221 pacientes foram incluídos e completaram o período de 12 meses de seguimento. A incidência de ISC associada à osteossíntese com HIM foi de 11,8%. Na análise inicial por regressão logística não ajustada, os seguintes fatores apresentaram associação com ISC: etiologia do trauma relacionada a acidentes de carro e bicicleta, classificação Müller AO do traço da fratura 2 ou 3, uso prévio de fixador externo, cirurgias com maiores tempos de duração, uso de drenos, uso de terapia por pressão negativa e necessidade de reparo do revestimento cutâneo na topografia da fratura. Na análise ajustada por regressão logística múltipla, contudo, apenas o uso prévio de fixador externo e a necessidade de reparo do revestimento cutâneo mantiveram-se associados à ocorrência de ISC. CONCLUSÕES: A incidência de ISC associada à fixação de fraturas diafisárias de fêmur e tíbia com HIM foi de 11,8%. O uso prévio de fixadores externos e a necessidade de reparo do revestimento cutâneo na topografia da fratura foram fatores associados à ocorrência de infecção / BACKGROUND: Diaphyseal fractures of femur and tibia are prominent due to its high incidence and high economic and social impact. Intramedullary nailing (IN) is the surgical procedure of choice. Surgical site infection (SSI) related to this procedure is considered a difficult to treat complication. OBJECTIVES: Determine the incidence of SSI after IM in femoral and tibial diaphyseal fractures and evaluate possible risk factors. METHODS: Prospective observational cohort study. SSI was defined according to CDC-NHSN criteria. Incidence of SSI was calculated as the ratio between the number of patients with SSI and total number of patients. Analysis of potential risk factors included patients-related factors (age, gender, body mass index, active foci of infection, immunosuppressive conditions, ASA score, alcohol or illicit drug abuse, smoking, polytrauma, etiology of fracture, type of fracture if closed or open, classification of fracture according to Müller AO, Tcherne classification for closed fractures, to Gustilo-Anderson classification for open fractures, previous surgical manipulation, use of blood products); environmental and surgical-related factors (surgical wound classification, duration of surgery, hair removal, intraoperative contamination, antimicrobial use, presence of drains, hypothermia or hypoxia in the perioperative period, type of IN used, reaming, need for muscle or skin flap repair, use of negative pressure therapy) and microbiotarelated factors (S. aureus and A. baumannii colonization). RESULTS: 221 patients were included and completed the 12-month follow-up period. Incidence of SSI was 11.8%. In the initial analysis by unadjusted logistic regression, following factors were associated SSI: trauma etiology related to car and bicycle accidents, Müller AO classification of the fracture morphology groups 2 or 3, previous use of external fixator, surgeries with larger length of time, presence of drains, use of negative pressure therapy and need for muscle or skin flap repair. In the multiple logistic regression-adjusted analysis, previous use of external fixator and need for muscle or skin flap repair remained associated with SSI. CONCLUSIONS: Incidence of SSI associated with IN for femoral and tibial diaphyseal fractures was 11.8%. Previous use of external fixators and need for muscle or skin flap repair were factors associated with occurrence of infection

A eutrofização artificial é um dos maiores desafios da sociedade moderna em relação à manutenção dos usos múltiplos da água, portanto, é preciso estudar os mecanismos que influenciam a variação das características bióticas e abióticas dos reservatórios em resposta às interferências antrópicas, sobretudo ao incremento excessivo de nutrientes, nitrogênio e fósforo. Estes nutrientes afetam a produção da biomassa aquática e favorecem florações de cianobactérias. Diante dessa problemática, a presente pesquisa quantificou as taxas de fixação biológica de nitrogênio pelo fitoplâncton, considerando que algumas cianobactérias se beneficiam dessa habilidade competitiva para dominarem muitos ecossistemas aquáticos. Para isso, foram estudados três reservatórios subtropicais com diferentes graus de trofia no estado de São Paulo, totalizando oito amostragens entre 2013 e 2015. Além de variáveis abióticas e bióticas da água, foram utilizados dois métodos, um indireto e outro direto, para estimar as taxas de fixação: redução do acetileno e traçador isótopo 15N2. Os reservatórios de Itupararanga, Barra Bonita e Lobo foram classificados como eutrófico, hipereutrófico e supereutrófico, respectivamente. As maiores concentrações de nutrientes &#40;nitrogênio total Kjeldahl: 5.930 &#181;g &#47;L e fósforo total: 466 &#181;g &#47;L &#41; foram observadas no reservatório de Barra Bonita, no qual não foi detectada fixação significativa pela predominância de Microcystis aeruginosa, não fixadora de N2, que atingiu biovolume máximo de 110 mm3&#47;L. Em Itupararanga, nas coletas de outubro de 2013 e fevereiro de 2014, Cylindrospermopsis raciborskii e Anabaena sp. foram responsáveis pelas taxas de fixação, sendo que essa última apresentou maior frequência de heterócitos &#40;75%&#41;. No Lobo, Aphanizomenon sp. &#40;durante o inverno&#41;, C. raciborskii &#40;durante o verão&#41; e Lyngbya sp. &#40;fixadora noturna de N2&#41; realizaram a fixação em todas as amostragens, com exceção de fevereiro de 2014. Nos reservatórios de Itupararanga e no Lobo, mesmo em condições de excesso de nutrientes e elevadas relações N:P &#40;máximo de 564:1&#41;, as taxas de fixação atingiram 0,22 e 0,95 &#181;g&#47;L.h, que são consideradas elevadas quando comparadas a outros estudos em ambientes temperados. A comparação entre as metodologias sugeriu que o método direto, com o traçador 15N2, foi mais sensível que o indireto, da redução do acetileno. Entre as variáveis analisadas, a que mais influenciou a fixação foi a estrutura da comunidade fitoplanctônica &#40;e.g., características qualitativas, capacidade de fixação e presença de heterócito&#41;. As variáveis climatológicas &#40;precipitação e temperatura&#41; e hidrológica &#40;tempo de detenção hidráulico&#41;, juntamente com a disponibilidade de nutrientes e a possível competição entre espécies e grupos fitoplanctônicos, regularam a comunidade fitoplanctônica. A análise do processo de fixação no período diurno ou noturno permitiu inferir diferentes estratégias adaptativas das cianobactérias presentes nos ambientes estudados. Para os três reservatórios analisados, concluiu-se que a qualidade da água está comprometida devido à floração de cianobactérias potencialmente tóxicas e isso evidencia a necessidade de medidas de controle de estado trófico para garantir os usos múltiplos da água e a saúde pública. O processo de fixação pode representar uma parcela significativa de nitrogênio nos sistemas aquáticos e não foi inibido pelo excesso de nutrientes. / Artificial eutrophication is one of the greatest challenges of modern society in relation to the maintenance of the multiple uses of water, therefore it is necessary to study the mechanisms that influence the variation of biotic and abiotic characteristics of the reservoirs in response to anthropogenic interference, especially the increase of nutrients, nitrogen and phosphorus. Such nutrients affect the production of aquatic biomass and favor cyanobacteria. This research quantified the biological nitrogen fixation rates by the phytoplankton, considering that some cyanobacteria benefit from this competitive ability to dominate many Brazilian aquatic ecosystems. We studied three subtropical reservoirs with different trophic levels in the São Paulo State, Brazil, performing eight sampling campaigns between 2013 and 2015. In addition to the abiotic and biotic variables of water, two methods were used to estimate the fixation rates: acetylene reduction and tracer isotope 15N2. The reservoirs Itupararanga, Barra Bonita and Lobo were classified as eutrophic, hypertrophic and supereutrophic, respectively. The highest concentrations of nutrients &#40;Total Kjeldahl Nitrogen: 5.930 &#181;g&#47;L and total phosphorus = 466 &#181;g&#47;L&#41; were observed in the Barra Bonita Reservoir, where no fixation was detected due to the predominance of Microcystis aeruginosa, non-fixing cyanobacteria, with a maximum biovolume of 110 mm3&#47;L. In Itupararanga, in October 2013 and January 2014, Cylindrospermopsis raciborskii and Anabaena sp. were responsible for nitrogen fixation, the latter with greater frequency of heterocysts &#40;75&#37;&#41;. In Lobo, Aphanizomenon sp. &#40;during the winter&#41;, C. raciborskii &#40;during the summer&#41; and Lyngbya sp. &#40;night fixing N2&#41; fixation was detected in all samplings, except for February 2014. In the Itupararanga and Lobo Reservoirs, even with excess of nutrients and at high N:P ratios &#40;maximum of 564:1&#41;, the fixation rates reached 0.22 and 0.95 &#181;g&#47;L.h, which were high when compared to temperate environments. The comparison between the methodos indicated that the direct method, through the tracer 15N2, was more sensitive than the indirect method of the acetylene reduction. Considering the analyzed variables, phytoplankton community structure significantly influenced the nitrogen fixation &#40;e.g., qualitative aspects, N2 fixation capacity and presence of heterocysts&#41;. The climatological &#40;precipitation and temperature&#41; and hydrological &#40;hydraulic retention time&#41; variables, associated with the availability of nutrients and competition among species and phytoplankton groups, regulated the phytoplankton community in the reservoirs. The analysis of the nitrogen fixation during day or night periods allowed inferring different adaptive strategies of cyanobacteria. For the three reservoirs analyzed, it is concluded that the water quality is impaired due to the bloom of potentially toxic cyanobacteria and this highlights the need for trophic state control measures to ensure the multiple uses of water and public health. The fixation process can represent a significant part of nitrogen in aquatic systems and was not inhibited by excess nutrients.