Orientador: Carlos Camargo Alberts / Banca: Fernando Frei / Banca: Beatriz de Mello Beisiegel / Resumo: Entre os grupos de vertebrados, os mamíferos carnívoros têm sido utilizados como espécies-alvo em diversos projetos ambientais. Atualmente, apresentam populações pequenas e muitas vezes em declínio classificados com algum grau de ameaça de extinção, consequência das alterações na paisagem causadas pelas atividades humanas. No Brasil, atualmente, a maior causa da diminuição das populações de mamíferos carnívoros é a redução ou perda de habitat ocasionada pela expansão agrícola, pecuária, exploração mineral e urbanização. A predação por onças-pardas tem sido documentada em diversas regiões e, como consequência, a perseguição a esses animais é fortemente observada. A fim de identificar os fatores que poderiam estar associados às predações aos rebanhos domésticos por onças-pardas no oeste do Estado de São Paulo, realizamos entrevistas com produtores rurais, utilizando para isso questionários semiestruturados, abordando características das propriedades, do manejo e da paisagem. Realizamos 54 entrevistas e identificamos propriedades que passaram por eventos de predação nos últimos oito anos. Bovino foi o grupo de animais mais frequentemente predado. Através da Regressão Logística, foi possível obter um modelo de previsão de ataques com 83% de concordância entre estimado e observado, onde o número de suínos e a distância do rio para a sede, presentes em cada propriedade, foram positivamente relacionados aos casos de predação. Através das análises das Redes Neurais Artificiais, foi possível especular a presença de um ciclo predador-presa ocorrendo entre o puma concolor e uma presa ainda desconhecida. Práticas de manejo adequadas podem reduzir significativamente as perdas de animais domésticos e assim reduzir possíveis conflitos humanos com predadores selvagens / Abstract: Among the vertebrate groups, carnivorous mammals have been used as target species in several environmental projects. Currently they present small and often declining populations, classified as with some degree of threat of extinction, consequence of the changes in landscape caused by human activities. In Brazil, the major current cause of the decline in carnivorous mammal populations is the reduction or loss of habitat caused by agricultural expansion, livestock farming, mineral exploration, and urbanization. Predation by pumas has been documented in several regions and as a consequence the chase of these animals is strongly observed. In order to identify the factors that could be linked to domestic herds predation by pumas in the west of São Paulo State, we conducted interviews with rural producers, using semi-structured questionnaires, addressing properties characteristics, management and landscape. We have made 54 interviews and identified some rural properties that experienced predation events in the last eight years. Bovines was the group most frequently predated. Throught the Logistic Regression, it was possible to get a model of prediction of attacks with 83% of agreement between estimated and observed, where the number of swines and the distance from the river to the principal house present in each property was positively related to predation cases. Through the analysis of Artificial Neural Networks it was possible to speculate the presence of a predator-prey cycle occurring between the puma concolor and a prey still unknown. Appropriate management practices can significantly reduce the losses of domestic animals and thus reduce possible human conflicts with wild predators / Mestre

Objetivou-se estudar efeitos negativos do transporte ao confinamento e do período de adaptação neste, assim como avaliar a presença de bactérias possivelmente patogênicas na nasofaringe durante este processo. Foram empregados 48 bovinos machos da raça Nelore, com 372 ± 27 kg de peso corpóreo, os quais viajaram ao confinamento, em caminhões-gaiola, em torno de 167 km, com duração de 4 h. Os mesmos foram pesados na saída, chegada e 48 h após. Amostras de sangue da veia jugular e swab da nasofaringe foram obtidos nos mesmos momentos e no 10º d, com exceção da saída. Para a obtenção do swab foi empregado zaragatoa acoplada à pinça Allis, ambas com 15 cm. O volume globular (VG) foi analisado no sangue total e a partir dessa variável foi calculado o déficit de volume plasmático (DVP). No soro foram determinados os teores de albumina e globulinas, calculando-se sua relação. O material do swab foi semeado em ágar sangue de carneiro (5%) com base Columbia e ágar McConkey e alíquotas desta cultura foram submetidas à técnica MALDI-TOF MS. Para a identificação bacteriana pelo espectro proteico, foi utilizado o programa BioTyper™. As colônias bacterianas identificadas pelo MADI- TOF MS como pertencentes a família Pasteurellaceae foram submetidas à identificação pelo sequenciamento parcial do gene 16S rRNA. Dessa família foi isolada, pela primeira vez no Brasil, apenas Mannheimia varigena em 31,2 % dos animais, no dia da chegada ao confinamento, desaparecendo em seguida. Identificaram-se também bactérias do gênero Bacillus ssp., que inibe o crescimento do gênero Mannheimia spp., principalmente dos animais negativos (93,7%) e em menor frequência (46,7%) dos positivos. Bovinos positivos à M. varigena perderam percentualmente mais peso (p = 0,045) durante a viagem que os negativos, não existindo diferença na 48ª h (p = 0,117). Quanto mais leve foi o bovino maior foi a sua perda de peso (p < 0,0001) e seu grau de desidratação (p = 0,005) durante a viagem, recuperando essa última variável parcialmente durante a adaptação. Nesse período a desidratação espelhou positivamente o peso perdido (r = 0,65). A viagem e a adaptação estimularam a produção de globulinas, em especial nos positivos no 10º d (p =0,023). A desidratação identificada foi de grau leve em 20% dos animais e moderada em 17,8%. O DVP identificou melhor o grau de desidratação que o VG. O estresse do transporte e a adaptação não foram suficientes para desencadear quadros respiratórios nas reses positivas para M. varigena. / This survey studied the negative effects of transportation and adaptation of steers shipped to a feedlot, as well analyzed the presence of possible pathogenic bacteria in the nasopharyngeal during these events. Forty-eight male Nellore steers (372 ± 27 kg B.W.) travelled 167 km in trucks to the feedlot, for 4 h. The cattle was weighted on the departure, arrival and 48 h later. Jugular blood samples and swab of the nasopharyngeal were collected on the same schedule, but the departure, and on the 10th d. The nasopharyngeal samples were obtained with the use of a swab attached to an Allis clamp, both with 15 cm length. The globular volume (GV) was measured in the total blood and from this variable, the plasma volume deficit (PVD) was calculated. Serum albumin and globulin, as well its ratio were also determined. The swab was plated onto sheep blood agar (5%), Columbia base and MacConkey agar, and samples of this culture were analyzed by a MALDI-TOF MS technique. For bacterial identification by the protein mass spectrum biomarker a BioTyper™ program was used. The colonies identified as Pasteurellaceae family were submitted for identification by partial sequencing of gene 16S rRNA. From this family was isolated, by the first time in Brazil, Mannheimia varigena in 31.2% of the steers, on the arrival, which disappeared thereafter. Bacteria from the genus Bacillus, which inhibits the genus Mannheimia, were also identified in the negative (93.7%) and less frequently (46.7%) in positive steers. Positive cattle to M. varigena lost more weight during the shipment than the negatives (p = 0.045), but no difference was found at the 48th h (p = 0.117). The lighter the steer, the greater the lost of weight (p < 0.0001) and the degree of dehydration (p = 0.005), recovering partially the hydration at the 48th h. During adaptation, the higher the dehydration, the bigger the weight loss (r =0.65). The trip and adaptation enhanced the globulin levels, mainly in the positive steers at day 10 (p= 0.023). The degree of dehydration was light in 20% of the animals and moderate in another 17.8 %. The PVD identified better the the degree of dehydration rather than VG. The stress of transport and adaptation was not enough to trigger respiratory disease in the positive steer to M. varigena.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-08-16T20:18:08Z No. of bitstreams: 1 ArianeMagdaBorges_DISSERT.pdf: 12278232 bytes, checksum: 8b7266317e6813508dd366a9539815d2 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-08-17T23:19:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ArianeMagdaBorges_DISSERT.pdf: 12278232 bytes, checksum: 8b7266317e6813508dd366a9539815d2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-17T23:19:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ArianeMagdaBorges_DISSERT.pdf: 12278232 bytes, checksum: 8b7266317e6813508dd366a9539815d2 (MD5) Previous issue date: 2015-04-30 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / As habita??es rurais das fazendas de criar da microrregi?o do Serid? potiguar, constru?das no s?culo XIX, tornam-se refer?ncia pelo seu car?ter vernacular, isto ?, estas edifica??es, al?m de terem reconhecida relev?ncia para a identidade da regi?o, s?o adaptadas ?s condicionantes do lugar nos mais diversos aspectos (econ?micos, culturais, construtivos, f?sicos, etc.), e consistem em espa?os de prote??o em rela??o ?s caracter?sticas hostis do clima semi?rido. Levando em considera??o a premissa supracitada, surge o seguinte questionamento: Que caracter?sticas das casas de fazendas de criar do s?culo XIX do Serid? potiguar s?o preponderantes para que sejam espa?os de prote??o em rela??o ao clima semi?rido? No intuito de responder ? indaga??o, a presente pesquisa tem por objetivo identificar quais as particularidades das casas de fazenda do Serid? que contribuem para adaptabilidade destas edifica??es ao clima semi?rido, como ambientes de prote??o; e contribuir para a??es de valoriza??o do patrim?nio arquitet?nico em quest?o. Para tanto, foram adotados procedimentos divididos em duas etapas. Primeiro foram identificadas as caracter?sticas recorrentes nas edifica??es estudadas por meio de um estudo tipol?gico realizado a partir dos invent?rios existentes (DINIZ, 2008; FEIJ?, 2002; IPHAN, 2012). Para a defini??o do tipo trabalhou-se com o conceito que mescla a tipologia anal?tica de Durand que identifica as semelhan?as e diferen?as para classificar edifica??es, tendo o car?ter de levantamento hist?rico e de documenta??o arquitet?nica, com a defini??o proposta por Argan (1963) de que a tipologia n?o ? definida a priori, mas na dedu??o a partir de uma s?rie de casos ilustrativos que tenham analogia formal e funcional entre si. Em seguida, trabalhou-se com uma amostra de cinco tipos diferentes entre si, definidos pela possibilidade de acesso ao interior das casas, proximidade a outros exemplares, bom estado de conserva??o e preserva??o. As fazendas contempladas foram: Pitombeiras, Agenus e Garrotes, no munic?pio de Acari; e no munic?pio de Caic?, Palma e Penedo. A segunda etapa consistiu no levantamento arquitet?nico, registro fotogr?fico, modelagem tridimensional digital (visando a amplia??o da documenta??o e registro existente); e no monitoramento t?rmico ao longo de aproximadamente um dia representativo em cinco casas de fazenda, relacionando o desempenho t?rmico das casas com suas caracter?sticas individuais. As vari?veis escolhidas para an?lise do monitoramento se baseiam no modelo de conforto t?rmico adaptativo (SPAGNOLO e DE DEAR, 2003 apud NEGREIROS, 2010). As caracter?sticas das casas foram analisadas conforme o atendimento ?s estrat?gias de condicionamento t?rmico passivo recomendadas pela Norma NBR 15220 (ABNT, 2005), para a zona bioclim?tica 7 onde se inserem os munic?pios de Caic? e Acari. A an?lise das temperaturas operativas das casas revelou que durante mais de 90% das horas do dia os ambientes encontram-se dentro da faixa de conforto. Tendo sido o desempenho t?rmico melhor nas casas de fazenda que tiveram maior grau de atendimento ?s estrat?gias bioclim?ticas recomendadas. Nos ambientes (normalmente a cozinha e c?modos de p?s-direitos baixos, expostos ? radia??o Oeste) que ainda apresentaram horas de desconforto, o conforto t?rmico pode ser alcan?ado com movimenta??o de ar de aproximadamente 1,0 m/s. / The farm?s rural dwellings of creation from the Serid? Potiguar microregion, built in the nineteenth century, became a reference by its vernacular character, i.e. these buildings, besides having recognized relevance to the identity of the region, they are adapted to the conditions of the place in many aspects (economic, cultural, construction, physical, et.) and consist in protective spaces in relation to hostile characteristics of Serid??s climate. Considering the above premise, the following question arises: What characteristics of the nineteenth century Serid? Potiguar?s cattle farms are crucial for them to be a protective space in relation to the semiarid climate? In order to answer the question, this research aim to identify which particularities of the Serid??s farmhouses that contribute to adaptability in these buildings to semiarid climate, as protection environments; and contribute to the stock valuation of the architectural heritage concerned. Therefore, procedures were adopted divided into two stages. Were first identified the recurring characteristics in the studied buildings, through typological study performed from existing inventories (DINIZ, 2008; FEIJ?, 2002; IPHAN, 2012). To define the type it worked up with the concept that merges Durand?s analytical typology that identifies the similarities and differences to classify buildings, having the character of historical survey and architectural documentation, with the definition proposed by Argan (1963) that the type is not defined a priory, but the deduction from a number of illustrative cases which have formal and functional similarity with each other. Then worked up in a sample of five different types with each other, defined by the possibility of access to the interior of the houses, proximity to other copies, good state of conservation and preservation. The contemplated farms were: Pitombeiras, Agenus e Garrotes in Acari?s town, and the municipality of Caic?, Palma and Penedo. The second stage consists of the architectural survey, photographic record, digital three-dimensional modeling (aiming to expand the existing documentation and registration) and thermal monitoring over approximately a representative day in five farmhouses, relating the thermal performance of the houses with their individual characteristics. The selected variables for analysis monitoring are based on the thermal comfort adaptive model (SPAGNOLO and DE DEAR, 2003 apud NEGREIROS, 2010). The characteristics of the houses were analyzed as meeting the passive thermal conditioning strategies recommended by NBR 15220 (ABNT, 2005), for the bioclimatic zone 7 where the municipalities of Caic? and Acari are located. The house?s analysis of the operating temperatures revealed that 90% of the times of day the environments are within the comfort range. The farmhouses, which had a higher degree of compliance with recommended bioclimatic strategies, had the best thermal performance. In environments (usually the kitchen and rooms with low ceiling heights, exposed to west radiation) which still had discomfort hours, the thermal comfort can be reached with air movement approximately 1,0 m/s.

A mastite bovina é comprovadamente um dos maiores problemas atuais da pecuária leiteira no Brasil e no mundo, acarretando ônus aos produtores, à indústria e ao consumidor final. Numa propriedade leiteira do município de Taquara, Rio Grande do Sul, Brasil, diversas medidas terapêuticas e higiênico-sanitárias foram introduzidas com o objetivo de monitorar sua influência sobre a produção leiteira e a etiopatogenia dos agentes envolvidos nos casos de mastite. No início dos trabalhos, em 1990, mais de 70% dos animais apresentavam pelo menos um quarto mamário com mamite clínica, sendo que ao final do estudo, em 2002, nenhum caso clínico da enfermidade foi relatado, tendo sido eliminado completamente agentes como Streptococcus agalactiae, Arcanobacterium pyogenes e Nocardia spp. O conjunto de medidas introduzidas elevou a produção/dia da propriedade em mais de 600%, melhorando a qualidade genética e sanitária do rebanho. Apesar de ainda existirem casos esporádicos de mamite subclínica, as mudanças favoreceram na identificação de problemas ou falhas no processo, possibilitando medidas rápidas e eficazes de controle e tratamento. / The bovine mastite is one of the largest problems of dairy herds in Brazil and all over the world, resulting in losses to producers, to industry and the final consumer. In a dairy herd of the district of Taquara, Rio Grande do Sul, Brazil, several therapeutic and hygienicsanitary measures were introduced with the objective of monitoring the influence on the milking process and the etiopatogeny of the agents involved in cases of mastitis. In the beginning of the study, in 1990, more than 70% of the animals presented at least one mammary quarter with clinical mastitis, and at the end of the study, in 2002, no clinical cases of the illness was related, having been completely eliminated agents as Streptococcus agalactiae, Arcanobacterium pyogenes and Nocardia spp. The group of introduced measures elevated the production of the property, per day, in more than 600%, improving the genetic and sanitary quality of the flock. In spite of sporadic cases of subclinical mamitis that still exist, the measures provided a support in the identification of problems or flaws in the process, making possible fast and effective action of control and treatment.

Orientador: José Buratini Júnior / Resumo: Na produção in vitro (IVP), trabalha-se com uma população de oócitos heterogênea em relação ao estágio da maturação nuclear que estes oócitos se encontram, mais especificamente o estágio de vesícula germinativa (GV), uma vez que estes são obtidos de folículos em diferentes estágios de desenvolvimento. Visto que essa heterogeneidade impacta nos resultados da IVP, torna-se necessário que os processos de seleção de oócitos e de maturação in vitro sejam adequados e articulados, para que ocorra o desenvolvimento da competência oocitária para subsequente desenvolvimento. Neste estudo, objetivou-se avaliar a população de ovócitos obtida de folículos antrais grandes, testando a hipótese de que folículos dominantes saudáveis conteriam oócitos com grau intermediário de compactação da cromatina (oócitos em GV2). Em seguida, avaliou-se a população de oócitos obtida em dia aleatório do ciclo estral após OPU e testou-se o efeito de protocolo de sincronização combinando aspiração de folículos e tratamento com FSH para homogeneizar a população e controlar a qualidade dos oócitos. Os resultados sugerem que folículos dominantes saudáveis são predominantemente compostos por oócitos com níveis intermediários de compactação da cromatina e que protocolos de sincronização de aspiração do folículo combinadas ao tratamento com FSH podem ser úteis para controlar a qualidade do oócito para OPU / IVP. / Abstract: In vitro production (IVP), a heterogeneous oocyte population is employed in relation to the stage of nuclear maturation that these oocytes are found, more specifically the germinal vesicle (GV) stage, once they are obtained from follicles in different stages of development. Since this heterogeneity impacts the results of IVP, it is necessary that the processes of oocyte selection and in vitro maturation are adequate and articulated, so that occurs development of oocyte competence for subsequent development. The objective of this study was to evaluate the oocyte population obtained from large antral follicles, testing the hypothesis that healthy dominant follicles would contain oocytes with an intermediate degree of chromatin compaction (GV2 oocytes). Then we evaluated the population of oocytes obtained at random day of the estrous cycle after OPU and tested the synchronization protocol combining follicle aspiration and FSH treatment to homogenize the population and control the quality of oocytes. The results suggest that healthy dominant follicles are predominantly composed of oocytes with intermediate levels of chromatin compaction and that follicle aspiration synchronization protocols combined with FSH treatment may be useful to control oocyte quality for OPU / IVP. / Mestre

Orientador: Mateus José Rodrigues Paranhos da Costa / Coorientador: Aline Cristina Sant'Anna / Resumo: O objetivo desta tese foi avaliar os efeitos do acesso de vaqueiros à informação sobre boas práticas de manejo de gado de corte na a qualidade do manejo, o temperamento e o bem-estar dos bovinos. Os objetivos específicos foram: 1) Contribuir para uma maior compreensão da relação entre a interação humano-animal, temperamento, resposta ao estresse e performance reprodutiva de novilhas nelore submetidas ao protocolo de inseminação artificial em tempo fixo; 2) Avaliar o potencial impacto do treinamento de vaqueiros em boas práticas de manejo sobre as atitudes e a qualidade de manejo dos mesmos e o bem-estar do gado; 3) Comparar fazendas onde todos os vaqueiros foram treinados com fazendas onde alguns foram treinados e fazendas onde ninguém foi treinado e; 4) Estudar se a qualidade do manejo do gado deteriora ao longo de um dia de trabalho. Para o primeiro objetivo específico, um total de 571 novilhas foram usadas para avaliar dois indicadores de temperamento (a velocidade de saída - VS e o escore composto de reatividade REA), cinco indicadores de interação humano animal (manejo negativo - MN, acidentes - ACIDENTES, defecação e micção - DEF-MIC, comportamentos indesejados - CI e tempo de entrada - TE) e a sujidade na região perineal - SUJIDADE. Todos esses indicadores foram avaliados no dia d0, d7 e d11 de um protocolo de inseminação a tempo fixo. Adicionalmente, dois indicadores de estresse (cortisol - CORT e relação neutrófilo: linfócito - N:L) foram avaliados em uma sub-amostra... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this thesis was to assess the effects of the stockpeople access to information about good beef cattle handling practices on the quality of handling, cattle temperament and welfare. The specific objectives were: 1) To further contribute to the understanding of the relationships between human-animal interactions, temperament, stress response, and reproductive performance of Nellore heifers submitted to a FTAI protocol; 2) To evaluate the potential impacts of handling skills training on good practices of cattle handling on stockpeople' attitudes and behavior, and cattle welfare; 3) To compare farms where all stockpeople were trained, to farms where only some where trained, and farms where none where trained and, 4) To study whether the quality of cattle handling deteriorates as the working day time passes. For the first specific objective, a sample of 571 heifers was used to assess two temperament traits (flight speed - FS and the composite reactivity score - RS), five human-animal interaction traits (negative handling - NH, Accidents - ACCIDENT, Defecation-urination - DEF-URI, Undesirable behavior - UB and Entrance time - ET), and perineal region dirtiness - DIRTINESS. All variables were assessed on d0, d7 and d11 of a FTAI protocol. Additionally, two physiological indicators of stress (cortisol - CORT and neutrophil:lymphocyte ratio - N:L) were recorded in a subsample of 99 heifers on d0 and d11. The occurrence of NH was associated with the occurrence of ACCID... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

O estresse térmico causa prejuízos para a atividade leiteira. É possível selecionar animais para tolerância ao calor, uma vez que existe variação genética de características produtivas quando avaliadas em diferentes ambientes climáticos. Para uma correta avaliação genética em função de diferentes ambientes, a utilização de modelos que se ajustem aos dados é fundamental. Ao mesmo tempo, ferramentas genômicas podem auxiliar nos processos de avaliação e seleção genética para tolerância ao calor. Nesse contexto, foram desenvolvidos dois estudos. No primeiro, objetivou-se estudar as funções de variância de características de produção e qualidade do leite em relação a um índice de temperatura e umidade (THI), ajustadas por polinômios de Legendre de ordens dois a sete, avaliar qual função melhor se ajusta aos dados e compreender como os componentes de variância e os coeficientes de herdabilidade se comportam em função do THI. Para isso, foram utilizadas 74.470 informações de produção de leite (PROD, kg/dia), escore de células somáticas (ECS), porcentagens de gordura (GOR), proteína (PROT), lactose (LACT), caseína (CAS) e perfil de ácidos graxos (saturados - SAT; insaturados - INSAT; monoinsaturados - MONO; poli-insaturados - POLI; ácido palmítico - C16:0; ácido esteárico - C18:0; e ácido oléico - C18:1) de 5.224 vacas da raça Holandesa avaliadas por meio de modelos de regressão aleatória em 167 valores distintos do THI. À exceção de POLI, houve variação em todos os componentes de variância ao longo do THI para todas as características. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,07 a 0,43. Para PROD, GOR, LACT, ECS, SAT e C16:0, as estimativas de herdabilidade diminuíram com o aumento do THI e para CAS, MONO, INSAT e C18:1, aumentaram. Para PROT e C18:0 as estimativas de herdabilidade foram maiores em valores intermediários do THI e menores nos extremos. No segundo estudo, objetivou-se estimar o efeito de marcadores SNP (polimorfismos de nucleotídeo único) sobre as características PROD, CAS, ECS, SAT e INSAT e estimar o valor genético genômico (GEBV) considerando dois valores de THI, um representando o conforto térmico e outro o estresse térmico. Os valores genéticos dos animais para os dois ambientes foram usados como fenótipos nos estudos de associação genômica (GWAS). Foram utilizados genótipos de 1.157 vacas para 60.671 marcadores SNP. Para as análises genômicas, foram utilizadas somente vacas com fenótipo e genótipo. Foi utilizado o método GBLUP (melhor predição linear não-viesada genômica) sob abordagem bicaracterística para realizar o GWAS. Com objetivo de comparar os ambientes, foram considerados os 55 SNP de maior variância aditiva explicada para cada situação e 10% dos animais com maiores valores genéticos genômicos. Em geral, os SNP apresentaram poucas diferenças em suas variâncias aditivas explicadas quando comparados em ambiente de conforto e estresse térmico. Com relação aos valores genéticos genômicos, houve reclassificação dos animais para PROD (correlações 0,90 e 0,90), CAS (correlações 0,88 e 0,86), SAT (correlações 0,88 e 0,87) e INSAT (correlações 0,97 e 0,97). Para ECS, apenas um animal foi reclassificado entre os ambientes (correlações 1,00). O primeiro estudo permitiu avaliar os componentes de variância ao longo de todo o gradiente ambiental. Por sua vez, o segundo estudo permitiu avaliar a variância individual dos marcadores moleculares, complementando o estudo genético das características. Mesmo que pequenas, foi possível verificar diferenças genéticas entre os animais entre os ambientes considerados. / Heat stress causes damage to dairy farming activities. It is possible to select animals for heat tolerance, because there is genetic variation of productive traits when evaluated in different climatic environments. For a correct genetic evaluation according to different environments, the use of models that fit to the data is fundamental. At the same time, genomic tools can aid in the evaluation and genetic selection processes for heat tolerance. In this context, two studies were developed. In the first, the aim was to study the variance functions of milk production and quality traits in relation to a temperature and humidity index (THI), adjusted by Legendre polynomials of orders two to seven, to evaluate which function best fits the data and understand how the variance components and heritability coefficients behave as a function of THI. For this, records of milk yield (MY), somatic cell score (SCS), percentage of fat (FP), protein (PP), lactose (LP), casein (CP) and acid fatty acids (saturated - SAT, unsaturated - UNSAT, monounsaturated - MONO, polyunsaturated - POLY, palmitic acid - C16:0, stearic acid - C18:0; and oleic acid - C18:1) from 5,224 Holstein cows and evaluated using random regression models in 167 different levels of THI were used. With the exception of POLY, there was variation in all variance components along the THI for all traits. Estimates of heritability ranged from 0.07 to 0.43. For MY, FP, LP, SCS, SAT and C16:0, estimates of heritability decreased with increasing THI and for CP, MONO, UNSAT and C18:1 increased. For PP and C18:0, heritability estimates were higher in intermediate THI values and lower at the extremes. In the second study, the objective was to estimate the effect of SNP markers on traits MY, CP, SCS, SAT and UNSAT and to predict the genomic breeding values (GEBV) using these effects, considering two levels of THI: a thermal comfort and an heat stress. The breeding values of the animals for the two environments were used as phenotypes for the genomic wide association studies (GWAS). Genotypes of 1,157 cows to 60,671 SNP markers were used. The GBLUP method (genomic best linear unbiased prediction) was used under a bitrait approach to perform GWAS. With the aim of comparing the environments, the 55 SNP with the greater variance explained for each situation and the 10% animals with the greater GEBV were used. Differences were observed in the variance explained by SNP between the comfort and heat stress environment. There was a re-rankink of animals considering the GEBV for MY (correlations 0.90 and 0.90), CP (correlations 0.88 and 0.86), SAT (correlations 0.88 and 0.87) and UNSAT (correlations 0.97 and 0.97). For SCS, only one animal was reclassified between the environments (correlations 1.00). The first study allowed to evaluate the components of variance along the entire environmental gradient. In turn, the second study allowed to evaluate the individual variance of the molecular markers, complementing the genetic study of the traits. Although small, it was possible to verify genetic differences among the animals among the considered environments.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agroecossistemas, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-25T20:28:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 298034.pdf: 2238319 bytes, checksum: c5cebbe99385f479ccc189671d418039 (MD5) / Foram estudadas as características quali-quantitativas da carcaça dos bovinos da raça Crioula Lageana em comparação à raça Nelore sob condições ambientais do planalto catarinense. O estudo também apresenta os resultados obtidos a partir do levantamento das medidas corporais de fêmeas da raça Crioula Lageana e sua influência sobre aspectos reprodutivos, bem como, a influência das épocas de parição sobre o intervalo entre partos em regime de criação baseado em campo nativo do planalto sul catarinense. Em relação às características de carcaça avaliaram-se 24 machos inteiros de 18 a 24 meses de idade, sendo 12 da raça Crioula Lageana e 12 Nelore. Os animais foram mantidos em campo nativo "palha fina" durante um período de 90 dias e suplementados com sal proteinado. Posteriormente, foram introduzidos em pastagem anual de inverno composta por centeio, aveia e azevém, onde permaneceram 74 dias até o abate. Com relação às características estudadas, a análise multivariada e a ANOVA indicaram que a raça Crioula Lageana foi superior à Nelore em escore de marmoreio (2,66 vs. 1,41); área de olho de lombo (65,33 vs. 58,58 cm²; gordura subcutânea (7,25 vs. 5,70 mm). Entretanto, a raça Nelore obteve maior rendimento de quarto traseiro (167,36 vs. 154,75 kg); quarto dianteiro (107,44 vs. 92,43 kg) e traseiro serrote (139,1 vs. 124,51 kg). Para os cortes comerciais a análise indicou que a raça Crioula Lageana obteve maior peso médio para: entrecôte (Longissimus thoracis) (4,063 vs. 3,510 kg). A raça Nelore obteve maiores rendimentos nas peças de coxão mole (Semimembranosus) (9,829 vs. 8,222 kg); lagarto (Semitentinosus) (2,578 vs. 2,144 kg) e picanha (Biceps femoris) (1,303 vs. 1,06 kg). Quanto às correlações estudadas verificou-se correlação positiva entre AOL e Lombo (Longissimus dorsi) (0,555); AOL e filé mignon (Psoas major) (0,553); AOL e coxão mole (Semimembranosus) (0,583); traseiro serrote e filé mignon (Psoas major) (0,812); traseiro serrote e lagarto (Semitentinosus) (0,491); traseiro serrote e entrecôte (Longissimus thoracis) (0,604); traseiro serrote e picanha (Biceps femoris) (0,755). No estudo das características reprodutivas foram avaliadas 43 fêmeas da raça Crioula Lageana. Observou-se que o intervalo entre partos foi influenciado de maneira significativa em função das estações do ano (épocas de parição). Em relação ao número de partos, não foi identificada influência significativa sobre o intervalo entre partos, no entanto, houve uma tendência de redução nos intervalos com o aumento do número de partos. A partir dos dados de medidas corporais verificou-se a formação de dois grupos morfológicos distintos, no entanto, não foram encontradas correlações significativas entre as medidas corporais: comprimento do pescoço, dorso e corpo, largura do peito e da garupa, circunferência torácica e no flanco, altura de garupa e de cernelha e o intervalo entre partos. A única característica que influenciou de maneira significativa o intervalo entre partos foi o comprimento de garupa. Conclui-se que em relação às características de carcaça que a raça Crioula Lageana apresentou algumas características qualitativas superiores à Nelore. No entanto, apresentou menor rendimento de carcaça (%) e menores pesos para a maioria dos cortes comercias estudados, o que pode ser atribuído ao maior peso de carcaça do Nelore, pois proporcionalmente os seis cortes analisados compunham 9% da carcaça nos novilhos da raça Crioula Lageana e 8,35% nos animais Nelore. A área de olho de lombo (AOL) e o traseiro serrote se apresentaram como bons indicadores para estimar o rendimento dos cortes comerciais estudados. No que ser refere ao estudo dos aspectos reprodutivos verificou-se que sob regime de criação a base de campo nativo a estação de primavera apresenta-se como a melhor época de parição para redução do intervalo entre partos.

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As caracter?sticas avaliadas foram: peso corporal ao nascimento (PN), pesos corporais aos 120, 205, 365, 450 e 550 dias de idade (P120, P205, P365, P450 e P550) e per?metros escrotais PE205, PE365, PE450 e PE550, al?m dos escores de avalia??o visual da conforma??o corporal (E ? estrutura corporal, P ? precocidade, M ? musculosidade, U ? umbigo, R ? ra?a, A ? aprumos e S - sexualidade). Os componentes de (co)vari?ncias foram estimados por modelo animal, uni e bi caracter?stica usando a infer?ncia bayesiana e assumindo modelo linear para os dados com distribui??o cont?nua e modelo limiar para as caracter?sticas com distribui??o discreta. As m?dias a posteriori para a herdabilidade direta, obtidas por an?lises unicaracter?sticas, foram: 0,38 (PN); 0,45 (P120), 0,41 (P205), 0,39 (P365), 0,40 (P450), 0,43 (P550), 0,15 (PE205), 0,62 (PE365), 0,32 (PE450), 0,60 (PE550), 0,33 (E), 0,30 (P), 0,32 (M), 0,38 (U), 0,34 (R), 0,39 (A) e 0,46 (S). As tend?ncias gen?ticas e fenot?picas indicam que houve evolu??o nos valores gen?ticos e fenot?picos dos animais ao longo dos anos. As correla??es gen?ticas estimadas entre peso corporal ? desmama (P205), peso corporal ajustado aos 450 dias de idade (P450), estrutura corporal (E), precocidade (P) e musculosidade (M) e as demais caracter?sticas foram positivas variando de m?dia a alta magnitude. Os resultados sugeriram que sele??o com base em pesos corporais ? desmama e aos 450 dias de idade, e escores visuais de estrutura corporal, precocidade e musculosidade resultaria como resposta direta ou correlacionada ? sele??o, em animais mais pesados em todas as idades, com maiores per?metros escrotais e com incremento nos escores visuais. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2014. / ABSTRACT The objective was to estimate the (co) variance and genetic associations for characteristics such as body weights, scrotal circumference, and visual appraisal scores in Guzerat cattle. Data of animals born between 1960 and 2013 in five Brazilian states, registered in the ABCZ (Brazilian Association of Zebu Breeders) were utilized. Evaluated characteristics were: body weight at birth (BWB); body weight at 120, 205, 365, 450, and 550 days of age (BW120, BW205, BW365, BW450, and BW550); scrotal circumference (SC) at day 205, 365, 450, and 550; and visual scores of body conformation (E - body structure, P - precocity, M - muscularity, U - umbilicus, R - breed, A - angulation and S - sexuality). The (co) variances were estimated by animal model, uni- and bi-characteristic using the Bayesian inference and assuming a linear model to the data with continuous distribution and threshold model for characteristics with discrete distribution. The a posteriori average for direct heritability obtained by univariate analysis were: 0.38 (BWB); 0.45 (BW120), 0.41 (BW205), 0.39 (BW365), 0.40 (BW450), 0.43 (BW550), 0.15 (SC205), 0.62 (SC365), 0.32 (SC450), 0.60 (SC550), 0.33 (E) 0.30 (P), 0.32 (M), 0.38 (U), 0.34 (R) 0.39 (A) and 0.46 (S). The genetic and phenotypic trends indicate an evolution in genetic and phenotypic values ??of animals over the years. Genetic correlation estimates between body weight at weaning (BW205), adjusted body weight at 450 days of age (BW450), body structure (E), precocity (P) and muscularity (M) and other characteristics were positive, ranging from average to high magnitude. The results suggested that selection based on body weight at weaning and 450 days of age, and visual scores of body structure, precocity and muscularity would result in direct response or correlated with selection in heavier animals at all ages, with greater SC and improved visual scores.

Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar a qualidade e a uniformidade das características de qualidade da carne bovina comercializada no município de Porto Alegre, especialmente das carnes com marcas comerciais.