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Diversidade genética entre genótipos de soja e estabelecimento de coleções nucleares e de melhoramento para teores de óleo e de proteína / Genetic diversity among soybean and establishing of nuclear and breeding collections for oil and protein contents

Silva, Alisson Santos Lopes da 29 February 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-09-15T11:32:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3004941 bytes, checksum: 89b867d49d37280ee8347b0689e68d9f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-15T11:32:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3004941 bytes, checksum: 89b867d49d37280ee8347b0689e68d9f (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A presença de variabilidade genética entre as cultivares de soja é fator determinante para o sucesso de programas de melhoramento da cultura. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética entre genótipos de soja, estabelecer coleções nucleares e definir estratégias para extração de coleções de melhoramento para teores de óleo e de proteína. A caracterização dos acessos ocorreu por meio de 21 caracteres morfoagronômicos avaliados em experimentos conduzidos em dois locais, utilizando o delineamento de blocos aumentados (DBA). A estimação da diversidade foi realizada por meio do método de agrupamento UPGMA utilizando como medida de dissimilaridade a distância Euclidiana média. No estabelecimento das coleções nucleares utilizou-se inicialmente a estratégia que definiu um número de indivíduos que representasse a média e a variância de todas as características quantitativas, calculada na população original de cada local. A formação dessas coleções aconteceu mediante alocação de acessos tomados ao acaso do conjunto de genótipos analisados. Foram avaliados os impactos das coleções nucleares na manutenção da média e variância original. A estruturação de coleções de melhoramento foi realizada seguindo a estratégia de estratificação dos acessos em relação ao ciclo total e seleção destes, dentro de cada estrato de ciclo, com alta média para cada caractere em questão e divergentes. As análises estatísticas foram realizadas por meio do Programa Computacional GENES. Foi possível verificar variância genética significativa, ao nível de 5% de probabilidade pelo teste F para a maioria dos caracteres quantitativos avaliados no local 1. No local 2 sete dos caracteres apresentaram diferença significativa. Na matriz de dissimilaridade para os dados quantitativos, a distância Euclidiana entre os acessos variou de 0,3753 a 3,2529 no local 1, e de 0,3679 a 3,4008 no local 2. No local 1 os pares de acessos mais divergentes e mais similares foram o BAGSUFV106/BAGSUFV36 (dii’= 3,2529) e BAGSUFV157/BAGSUFV159 (dii’= 0,3753) respectivamente. No local 2 o par BAGSUFV48/BAGSUFV16 (dii’= 3,4008) foram os mais dissimilares e BAGSUFV59/BAGSUFV16 (dii’= 0,4211) os mais similares. Para o conjunto de caracteres qualitativos, os pares de acessos mais divergentes e similares foram os BAGSUFV38/BAGSUFV75 (dii’= 298,0604) e BAGSUFV2/BAGSUFV22 (dii’= 7,9876), respectivamente. O método de agrupamento UPGMA proporcionou a formação de 57 grupos, sendo trinta destes, composto por apenas um acesso. O número de acessos determinado para compor a coleção nuclear de cada local foi de 80 genótipos. Destes 80, a porcentagem de acessos comuns aos dois ambientes foi de apenas 48,75%. A coleção nuclear do local 1 não foi capaz de representar a variância original somente para o caráter número de hastes laterais. No local 2 a manutenção das variâncias originais não verificada para os caracteres diâmetro do hipocótilo, número hastes laterais e anglo de acamamento. Para as características qualitativas as classes formato do folíolo lanceolado estreito e hábito de crescimento prostrado foram as únicas não representadas pela coleção nuclear do ensaio 1 e 2, respectivamente. Na estruturação da coleção de melhoramento houve uma tendência, no local 1, da alocação de genótipos com maiores teores de óleo e proteína no grupo de ciclo tardio. Já no local 2 esta tendência ocorreu para os genótipos pertencentes ao grupo de ciclo médio. Analisando cada ciclo de maturação verificou-se que o genótipo BAGSUFV23, para o caractere teor de óleo, foi coincidente em ambos os locais. O mesmo ocorreu para os genótipos BAGSUFV17 e BAGSUFV15, em relação ao teor de proteína. Para o ciclo médio o genótipo comum para teor de óleo foi o BAGSUFV50 e para proteína o BAGSUFV82. No grupo do ciclo tardio foi verificado o maior número de genótipos coincidentes para o teor de óleo, sendo eles: BAGSUFV131, BAGSUFV115, BAGSUFV33 e BAGSUFV53. Neste grupo não houve acessos comuns para o caractere teor de proteína. Conclui-se que existe diversidade genética entre os acessos de soja avaliados, foi possível obter coleções nucleares para cada local e, a estratégia adotada se mostrou eficientes na estruturação das coleções de melhoramento. / The presence of genetic variability among soybean cultivars is a decisive factor for the success of crop improvement programs. The objective of this study was to evaluate the genetic diversity among soybean genotypes, establish nuclear collections and define strategies to extract improvement collections for oil and protein content. The characterization of the accessions occurred through 21 morphoagronomic characters evaluated in experiments conducted in two locations, using the augmented block design (DBA). The estimation of diversity was performed using the UPGMA grouping method, using as measure of the dissimilarity the average Euclidean distance. In the establishment of core collections was used initially the strategy that has defined a number of individuals who represent the mean and the variance of all quantitative characteristics, calculated on the original population of each location. The formation of these collections happened through the allocation of acesses taken at random from the set of analyzed genotypes. It was evaluated the impacts of nuclear collections in maintaining of the mean and original variance. The structure of the improvement collections was carried out following the strategy of the stratification of the acesses in relation to the total cycle and selection of these, within each stratum of the cycle, with a high average for each trait in question and divergent. The statistical analyzes were performed using the Genes Computational Program. It was possible to verify significant genetic variance at 5% probability by the F test for most quantitative traits evaluated at the location 1. On site 2, seven of the characters showed significant difference. In dissimilarity matrix for quantitative data, the Euclidean distance between accessions ranged from 0,3753 to 3,2529 on site 1, and from 0,3679 to 3,4008 on site 2. In the site 1 the pairs of the acesses more divergent and more similar were BAGSUFV106 / BAGSUFV36 (dii'= 3,2529) and BAGSUFV157 / BAGSUFV159 (dii'= 0,3753), respectively. In the site 2, the pair BAGSUFV48 / BAGSUFV16 (dii'= 3,4008) were the most dissimilar and BAGSUFV59 / BAGSUFV16 (dii' = 0,4211) the most similar. For the set of the qualitative characters, the pairs of the acesses more divergent and similars were BAGSUFV38 / BAGSUFV75 (dii'= 298,0604) and BAGSUFV2/BAGSUFV22 (dii'= 7,9876), respectively. The UPGMA grouping method provided the formation of 57 groups, where thirty of these,being composed of just one access. The number of acesses determined to compose the core collection of each site was 80 genotypes. From these 80, the percentage of common accesses to both environments was only 48,75%. The nuclear collection of the site 1 was not able to represent the original variance only to the character number of lateral rods. In the site 2 the maintenance of the original variances was not checked for the characters of hypocotyl diameter, number of side rods and angle of lodging. For the qualitative characteristics, the classes leaflet format narrow lanceolate and prostrate growth habit were the only ones that was not represented by the core collection of test 1 and 2, respectively. In structuring the collection of the improvement there was a trend, in place 1, of the allocation of genotypes with higher levels of oil and protein in the group of late cycle. Already in site 2, this trend occurred for genotypes belonging to the average cycle group. Analyzing each maturation cycle it was found that the BAGSUFV23 genotype, to the oil content character, was similar in the both locations. The same was true for BAGSUFV17 and BAGSUFV15 genotypes in relation to the protein content. For the mean cycle, the common genotype for oil content was BAGSUFV50 and to the protein the BAGSUFV82 genotype. In the group of the late cycle it was found the largest number of matching genotypes to the oil content, as follows: BAGSUFV131, BAGSUFV115, BAGSUFV33 and BAGSUFV53. In this group there was not common access to the protein content character. It is concluded that there is genetic diversity among the accessions evaluated of soybean, it was possible to obtain nuclear collections for each site and, the strategy adopted proved effective in the structuring of improving collections.
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Tolerância ao estresse hídrico mediada pela proteína BiP de soja em plantas transgênicas de tabaco / The binding protein (BiP) is an important component of endoplasmic reticulum stress response of cells

Vaez, Juliana Rocha 31 July 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-10-05T14:02:26Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1221381 bytes, checksum: 8b7948dee7d4e851c051f3d03e863dcb (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-05T14:02:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1221381 bytes, checksum: 8b7948dee7d4e851c051f3d03e863dcb (MD5) Previous issue date: 2003-07-31 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A proteína de ligação (BiP) é um importante componente de resposta ao estresse no retículo endoplasmático (RE). Tem sido demonstrado que níveis elevados de BiP em tabaco transgênico de linhagens senso conferem tolerância à tunicamicina, um inibidor de glicosilação, durante a germinação e tolerância ao déficit hídrico durante o crescimento das plantas. Para avaliar a função protetora de BiP contra estresses abióticos, linhagens homozigotas T3 expressando o gene BiP da soja na orientação senso e anti-senso, foram obtidas através de análises de segregação do loco do T-DNA das gerações T2 e T3. Sob déficit hídrico progressivo, níveis de BiP em folhas de linhagens transgênicas com a orientação senso estão correlacionados com a manutenção da turgidez de broto e do conteúdo de água, independentemente do grau de intensidade do estresse. Contudo, o efeito protetor da superexpressão de BiP contra estresse hídrico não é perdido na expressão do cDNA de BiP da geração T4 das linhagens homozigotas anti-senso. A suscetibilidade das linhagens anti-senso ao déficit hídrico foi similar aos controles, plantas não-transformadas. Esse resultado pode indicar que ocorreu seleção natural dos transformantes com baixa expressão do gene anti- senso nas gerações subseqüentes. O caráter essencial dos genes BiP pode levar a uma pressão seletiva para o silenciamento do gene anti-senso. A função de BiP na tolerância contra estresses do RE foi investigada na geração T3 de plantas transgênicas senso e anti-senso de N. tabacum. Aparentemente, a superexpressão constitutiva de BiP não atenuou a letalidade ocasionada pela inibição da glicosilação pela tunicamicina nas concentrações de 0,6 a 1,0 μg/mL. Nessas condições, a tunicamicina inibe a indução de brotos mais eficientemente em plantas superexpressando BiP do que nas selvagens. Análises de immunoblottings detectaram aumento no nível de BiP nas concentrações de tunicamicina de 0,8 e 1,0 μg/mL. A indução de BiP foi coordenada com o acúmulo de um produto de degradação de 25-28 kDA, indicando a existência de uma co-regulação entre a via de resposta a proteínas mal dobradas (UPR) e o sistema de degradação de proteínas associadas ao RE em células de plantas. O aumento no nível de BiP em discos foliares transgênicos senso foi similar ao observado em controles após o tratamento com tunicamicina. Entretanto, o tratamento de discos foliares senso não promoveu acúmulo adicional de BiP nem do produto de degradação de 25-28 kDa. Tais resultados evidenciam que o nível de BiP pode atuar como sensor para ativação de resposta a estresses em plantas. Portanto, elevados níveis de BiP em células de plantas inibem a ativação da via UPR e podem evitar a ativação do sistema ERAD. / The binding protein (BiP) is an important component of endoplasmic reticulum stress response of cells. Elevated levels of BiP in sense transgenic tobacco (Nicotiana tabacum L. cv Havana) lines have been shown to confer tolerance to the glycosylation inhibitor tunicamycin during germination and tolerance to water deficit during plant growth. In order to further examine the protective function of BiP against abiotic stresses, homozygous T3 lines constitutively expressing a soybean BiP gene in the sense and antisense orientation were obtained by following the segregation of the T-DNA locus in the T2 and T3 generations. Under progressive drought, the leaf BiP levels in the sense transgenic lines correlated with the maintenance of the shoot turgidity and water content, regardless of stress intensity. Nevertheless, the protective effect of BiP overexpression against water stress was not disrupted by expression of an antisense BiP cDNA construct in the T4 generation of homozygous anti-sense lines. In fact, the susceptibility of the antisense lines to water deprivation was similar to the untransformed, control plants. This result may indicate the occurrence of natural selection for low antisense gene expression in the subsequent generations. The essential character of BiP genes may lead to a selective pressure towards antisense gene silencing. The BiP-mediated tolerance against ER stressors was also investigated in the T3 generations of N. tabacum sense and antisense transgenic plants. Apparently constitutive overexpression of BiP did not attenuate the lethality caused by inhibition of protein glycosylation at 0,6 to 1,0 μg/mL of tunicamycin In fact, under this condition, tunicamycin inhibited the induction of shoots more efficiently in BiP overproducers than in wild type plants. Analysis of control disc leaves by immunoblottings detected a significant increase in BiP protein levels at 0,8 and 1,0 μg/mL of tunicamycin. The induction of BiP was coordinate with the accumulation of a 25-28 kDA specific degradation product of the protein, suggesting the existence of co- regulation between the activation of BiP synthesis via UPR (unfolded protein response ) and its specific degradation, probably via ERAD (ER-associated protein degradation) in plant cells. The enhanced level of BiP in the sense transgenic disc leaves was similar to that observed in wild type cells after treatment with tunicamycin. Nevertheless, treatment of sense disc leaves with tunicamycin did not promote an additional accumulation of BiP and did not cause accumulation of the 25-28 kDa specific degradation product. Taken together, these results suggest that the BiP levels may act as an ER sensor for activation of plant ER stress response. Therefore, elevated levels of BiP in plant cells inhibit activation of the unfolded protein pathway and, in turn, may prevent activation of the ERAD system upon accumulation of unfolded protein in the ER. / Dissertação importada do Alexandria
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Otimização multinivel de vigas de concreto armado via algoritmos genéticos

Oliveira, Lucas Façanha de 28 August 2014 (has links)
OLIVEIRA, L. F. Otimização multinivel de vigas de concreto armado via algoritmos genéticos. 2014. 114 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Civil: Estruturas e Construção Civil)-Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2014. / Submitted by Hohana Sanders (hohanasanders@hotmail.com) on 2017-09-20T12:28:54Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_lfoliveira.pdf: 3872314 bytes, checksum: 4a52a82189a45962a4d10c4529bfcf51 (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa (mmarlene@ufc.br) on 2017-09-20T12:31:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_lfoliveira.pdf: 3872314 bytes, checksum: 4a52a82189a45962a4d10c4529bfcf51 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-20T12:31:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_lfoliveira.pdf: 3872314 bytes, checksum: 4a52a82189a45962a4d10c4529bfcf51 (MD5) Previous issue date: 2014-08-28 / Reinforced concrete is a composite material that has extensive application in the construction market. It is estimated that 11 billion tons of concrete per year are used in the world. The reinforced concrete beams are structural elements that have applications in buildings, homes, bridges, etc. and are designed via traditional method of trial and error, following standard recommendations concerning to the strength, stability, rigidity and durability. After a predimensioning, run up iterative cycles of analysis and design. In designing, a requirement is used to define the project and the rest are checked. Modifications and stopping are controlled by the designer. In the optimum design method, on the other hand, a criterion of performance is set up (cost, weight, strength, etc.) and the best combination of variables is searched that satisfies all regulatory criteria and results in design with the best performance. In general, it uses cost as a performance measure and the works are distinguished by the nature of design variables and the inclusion of details of armor. The objective of this work is to formulate a model of optimization on two levels to minimize the cost of reinforced concrete beams. In the first level (global) the cost is minimized with the dimensions of the sections (discrete) and the areas of longitudinal reinforcement (continuous) as variables and constraints like strength (ULS), deformation (SLS) and ductility are considered. The detailed transverse reinforcement is already designed at this level. Strategies to include the cost of the armor cuts and anchoring without defined bar sizes are suggested. At the second level (local) the steel lowest volume of arrangement of longitudinal reinforcement is searched, considering the cuts and anchoring. The variables describe the topology of the bars in the sections and restrictions of good design practice, and geometric compatibility are checked. The linear analyzes are performed with classical beam finite element using the software FAST program and the optimization models are solved using genetic algorithm from the software BIOS. The GA parameters are calibrated with test examples and literature’s application examples are made. The sensitivity of the solution is studied for varying cost parameters of the objective function. / O concreto armado é um material compósito que possui uma extensa aplicação no mercado da construção civil. Estima-se que sejam utilizados 11 bilhões de toneladas de concreto por ano no mundo. As vigas em concreto armado são elementos estruturais que possuem aplicações em edifícios, residências, viadutos, entre outros e são projetadas via método tradicional de tentativa e erro, atendendo requisitos de norma relativas à resistência, estabilidade, rigidez e durabilidade. Após um pré-dimensionamento, executam-se ciclos iterativos de análise e dimensionamento. No dimensionamento, um requisito é usado para definir o projeto e os demais são verificados. Modificações e a parada são controladas pelo projetista. No método de projeto ótimo, por sua vez, busca-se a combinação de variáveis com o melhor desempenho em relação a um dado critério (custo, peso, resistência, entre outros) e busca-se a melhor combinação de variáveis que satisfaz todos os critérios normativos e resulte no projeto com o melhor desempenho. Em geral, usa-se o custo como medida de desempenho e os trabalhos se diferenciam pela natureza das variáveis de projeto e pela inclusão dos detalhes de armadura que podem elevar exponencialmente a complexidade do problema. O objetivo deste trabalho é formular um modelo de otimização para minimização do custo de vigas de concreto armado, que detalhe a disposição da armadura na seção de concreto de forma simplificada. Tal problema, levando-se em consideração as variáveis relativas ao detalhamento da seção, possui uma grande complexidade, por isso, dividiu-se o modelo em dois níveis. No primeiro nível (global), minimiza-se o custo com as dimensões das seções (discretas) e as áreas de armadura longitudinais (contínuas) como variáveis, e consideram-se restrições de resistência (ELU), deformação (ELS) e ductilidade. A armadura transversal já é detalhada neste nível. Estratégias para incluir no custo da armadura o efeito dos cortes e ancoragens sem as bitolas definidas são sugeridas. No segundo nível (local) busca-se o arranjo de armaduras longitudinais, considerando os cortes destas, com o menor volume. As variáveis descrevem a topologia das barras nas seções e restrições de boas práticas de projeto e de compatibilidade geométrica são verificadas. As análises lineares são realizadas com elementos finitos clássicos de viga utilizando o programa FAST e os dois modelos de otimização são resolvidos usando o algoritmo genético do programa BIOS. Os parâmetros do AG são calibrados com exemplos testes e são feitas aplicações a exemplos da literatura. A sensibilidade da solução é estudada para variação de parâmetros de custos da função objetivo.
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Associação de fatores de risco cardiovascular e polimorfismo de apoE com mortalidade em idosos longevos : uma coorte de 18 anos

Vivian, Lilian January 2012 (has links)
Contexto: Doenças crônicas como as cardiovasculares e demências são mais frequentes na população idosa, especialmente na faixa etária acima dos 80 anos. A despeito desta evidência, são poucos os estudos delineados com indivíduos longevos. E frequentes são os resultados indefinidos ou inversos quando avaliados. Esta lacuna no conhecimento é dificultada pela complexidade de fatores ambientais e genéticos que influenciam a progressão das doenças crônicas. Especificamente, os níveis de pressão arterial e colesterol e o alelo 4 da apolipoproteína E (apoE) tem efeitos divergentes nos idosos longevos comparados aos idosos jovens. O objetivo deste estudo é investigar a relação entre o polimorfismo do gene da apoE e a mortalidade por doença cardiovascular e demência em idosos longevos que vivem em comunidade e avaliar a sobrevida de acordo com este polimorfismo e fatores de risco cardiovascular. Métodos: Uma amostra de 74 idosos com 80 anos ou mais da coorte do Projeto Veranópolis foi selecionada para genotipagem da apoE. Na linha de base, foram coletadas variáveis antropométicas, dosagens sanguíneas de glicose e lipídeos, pressão arterial e variáveis de estilo de vida como tabagismo, consumo de álcool e atividade física. O seguimento médio da coorte foi 16,4 anos e total de 18 anos. As causas de morte foram classificadas de acordo com a CID-10 em cardiovasculares e demenciais. A Escala Bayer de Atividades da Vida Diária foi aplicada aos cuidadores dos idosos para avaliar demência. A sobrevida dos portadores dos genótipos da apoE foi comparada através do método de estimação da curva por Kaplan-Meier e o modelo de azares proporcional da Regressão de Cox foi utilizado na descrição dos fatores associados à mortalidade geral. Resultados: A frequência gênica da apoE presente na amostra foi: 4,1% 2; 85,1% 3 e 10,8% 4. E a frequência genotípica: 1,4% E2E2; 5,4% E2E3; 71,6% E3E3 e 21,6% E3E4. Para a comparação dos desfechos foram formados 2 grupos: portadores do genótipo apoE3E3 (53 idosos) e portadores do genótipo apoE3E4 (16 idosos). A expectativa de vida média foi de 92,3 anos (IC95% 91,2-93,5). Diferenças significativas entre os genótipos foram encontradas com relação à idade média de entrada na coorte, índice de massa corporal e pressão arterial diastólica. Encontramos uma tendência para que os níveis de colesterol total e LDL-colesterol fossem maiores no grupo E3E4. Não encontramos associação entre desfechos de morbidade (AVC, IAM e ICC) ou mortalidade entre os genótipos. Para a amostra no geral, os fatores significativamente associados à mortalidade foram: tabagismo, atividade física, pressão arterial sistólica (PAS), pressão de pulso (PP) e diabetes mellitus. O risco de morte em indivíduos fumantes e ex-fumantes foi 2,83 vezes (IC95% 1,00-7,98) do risco em não fumantes. Indivíduos que praticavam atividade física vigorosa (≥4.000 kcal/semana) tiveram uma redução no risco de óbito em 54% (IC95% 10%-77%). Para o aumento de 1mmHg na PAS ou na PP houve uma redução de 2% (IC95% 1%-3%) no risco de morte. Os idosos diabéticos tiveram 3,43 (IC95% 1,03-11,50) vezes o risco de óbito dos não diabéticos. Conclusão: Não foi encontrada associação entre os dois genótipos da apoE mais frequentes na população e mortalidade cardiovascular ou sobrevida em idosos longevos. Em toda a amostra, os fatores de risco significativamente associados à mortalidade foram tabagismo e diabetes mellitus. Atividade física vigorosa, PAS e PP maiores foram considerados fatores de proteção para mortalidade geral.
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O polimorfismo Val158Met do gene COMT e TDAH : um estudo de suscetibilidade genética e farcogenética

Oliveira, Angélica Salatino de January 2011 (has links)
O transtorno de déficit de atenção e hiperatividade (TDAH) é uma doença psiquiátrica de etiologia complexa, muito comum em crianças e adolescentes. Caracteriza-se pelos sintomas de desatenção, hiperatividade e impulsividade, além de uma alta taxa de comorbidade com transtornos disruptivos do comportamento. Em relação a sua neurobiologia, uma hipótese atualmente aceita é de que crianças com TDAH apresentam um déficit funcional significativo do córtex pré-frontal, com um aparente desequilíbrio de catecolaminas. A enzima Catecol-O-metiltransferase (COMT) atua na degradação de catecolaminas na fenda sináptica e é responsável pela maior parte da degradação de dopamina no córtex pré-frontal. Dessa forma, esta enzima age diretamente no balanço dopaminérgico e noradrenérgico. O polimorfismo Val158Met do gene COMT ocasiona uma troca de aminoácidos, afetando sua termoestabilidade enzimática. Estudos indicam que esta variação enzimática da COMT tem um papel relevante na heterogeneidade fenotípica encontrada no TDAH, podendo estar envolvida no surgimento de transtornos disruptivos do comportamento. Em relação ao tratamento, o fármaco comumente prescrito é o metilfenidato. Este medicamento parece agir diretamente no aumento dos níveis de catecolaminas na fenda sináptica, através do bloqueio do transportador de dopamina e de noradrenalina. Devida a ação direta da COMT na degradação de catecolaminas e a importância do nível desses neurotransmissores na melhora da sintomatologia do TDAH, fazse também necessário o conhecimento sobre o possível efeito farmacogenético do gene no transtorno. Um total de 473 crianças foram genotipadas para o polimorfismo Val158Met. O diagnóstico de TDAH e suas comorbidades foi realizado através de três estágios, previamente descrito na literatura. Dentre esses pacientes, 251 satisfizeram os critérios de inclusão para participar do estudo farmacogenético. Variáveis que poderiam atuar como potenciais confundidores foram analisadas. As dosagens de metilfenidato foram aumentadas até não haver mais melhora clínica ou até existirem efeitos adversos significativos (doses acima de 0,3 mg/kg/dia). A medida dos sintomas foi baseada na Escala de Swanson, Nolan e 4 Pelham versão IV, e aplicada pelos psiquiatras (sem o conhecimento dos genótipos dos pacientes) antes do tratamento e no primeiro e terceiro mês de tratamento Pacientes com o genótipo Val/Val mostraram uma taxa 12% maior de transtornos disruptivos do comportamento quando comparados com indivíduos portadores do alelo Met (2 = 5,729, p = 0,017, OR = 1,62). De acordo com o teste farmacogenético, foi encontrado um efeito significante do tempo de tratamento (n = 112; F2,231 = 5,35, p = 0,005) e do gene COMT (F1,148 = 5,02, p = 0,027) na melhora clínica dos escores de oposição. Além disso, também foi vista uma interação significante entre a presença do alelo Met e o tempo de tratamento nos escores de oposição nesse período (F2,229 = 6,40, p = 0,002). Nossos resultados indicam que existe uma diferença significante na presença de transtorno disruptivo do comportamento em crianças com TDAH, de acordo com o genótipo do polimorfismo Val158Met. O genótipo Val/Val parece predizer a presença desse comportamento antissocial em crianças com TDAH. Além disso, nosso estudo farmacogenético mostrou um efeito prejudicial do genótipo Val/Val na melhora clínica dos sintomas de oposição em meninos com TDAH tratados com metilfenidato. / Attention-Deficit Hyperactivity Disorder (ADHD) is a common psychiatric condition that affects children and adolescents worldwide. This disorder is defined by symptoms of inattention and hyperactivity/impulsivity. Comorbidity with other disorders, such as Disruptive Behaviour Disorders (DBD) is very common. Regarding ADHD‟s neurobiology, there is a hypothesis that children with ADHD have prefrontal cortex (PFC) deficits with inadequate catecholamine transmission. The enzyme catechol-O-methyltransferase (COMT) degrades catecholamines and it has been suggested that it plays a key role in prefrontal cortical functioning. COMT accounts for most of the degradation of dopamine in the PFC. The Val158Met polymorphism is functional. It affects the thermostability of the protein. Several studies suggest that this variation in COMT has a relevant role in ADHD heterogeneity, and it can lead to emergence of DBD. Methylphenidate (MPH) is the most widely used drug to treat ADHD. The effect of MPH on catecholaminergic pathways results in an improvement of the PFC functioning by blockade of dopamine and norepinephrine transporters. Due to action of COMT in catecholaminergic balance, it is necessary to know about the pharmacogenetic effect of COMT in ADHD. A sample of 473 children with ADHD was genotyped for the Val158Met polymorphism. A consensus diagnosis of ADHD with or without comorbidity was achieved through a three-stage process, as previously described in the literature. Around these patients, 251 children with ADHD fulfilled inclusion criteria to participate in the pharmacogenetic study. Potential confounders were evaluated. Dosages of short-acting MPH were augmented until no further clinical improvement was detected or until there were significant adverse events (MPH dose always > 0.3 mg/kg/day). The outcome measure was the parent-rated oppositional subscale of the Swanson, Nolan and Pelham Scale – version IV. The scale was applied by child psychiatrists blinded to genotype at baseline and in the first and third months. Patients homozygous for Val allele showed a higher frequency of DBD (+ 12%) than Met allele carriers (2 = 5.729, p = 0.017, OR = 1.62). We detected 6 significant improvement in SNAP-IV oppositional scores from baseline to the first and three months of treatment (n = 112; F2,231 = 5.35, p = 0.005). A significant effect of the presence of Met allele during three months of treatment (F1,148 = 5.02, p = 0.027), and a significant interaction between the Met allele and treatment over time for the SNAP-IV oppositional scores during this period of treatment (F2,229 = 6.40, p = 0.002) were both observed. Therefore, our results indicate that there is a significant difference in the presence of disruptive behavior disorders in children with ADHD according to Val158Met genotype. This antisocial behavior in children with ADHD seems to be predicted by Val/Val genotype in COMT gene. Moreover, pharmacogenetic results suggest an effect of the COMT genotype on the trajectory of ODD symptoms improvement with MPH treatment in boys with ADHD.
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Polimorfismo do complexo de repetições (TG)n(TA)n(CA)n do gene da enzima 3 -hidroxiesteróide desidrogenase tipo II e risco de câncer de próstata : análise de uma amostra da população do Rio Grande do Sul

Fontanive, Tiago Oselame January 2011 (has links)
Introdução: Diferentes estudos sugerem que a diidrotestosterona (DHT) exerce um importante papel na carcinogênese prostática. A incompleta inativação ou a baixa degradação da DHT na próstata pode levar ao acúmulo de DHT, e talvez, aumento da ação androgênica. A enzima 3 beta-hidroxiesteróide desidrogenase tipo II (HSD3B2) é responsável pela inativação da DHT na próstata. Neste estudo, um complexo polimórfico de repetições dinucleotídicas (TG)n(TA)n(CA)n no gene HSD3B2 foi avaliado em relação ao risco do desenvolvimento do câncer de próstata. Métodos: Amostras de sangue foram coletadas de 169 indivíduos com câncer de próstata e 161 de indivíduos controle. A análise do polimorfismo no gene HSD3B2 foi realizada utilizando PCR para amplificar a região do polimorfismo, os produtos de PCR foram analisados através de eletroforese Capilar. Os alelos do polimorfismo (TG)n(TA)n(CA)n foram dicotomizados em curto (≤285) e longo (>285). Resultados: Um total de 36 alelos, que variam de 267 pb a 361 pb de tamanho foram genotipados em nosso estudo. O alelo com o comprimento de 285 pb foi o mais frequente, representando 36,4% de todos alelos genotipados, sendo seguido pelo alelo 288 pb e 337 pb, representando 17,3% e 15,4%, respectivamente. Na análise de risco, não foi verificado diferença significativa entre os diferentes genótipos em relação ao grupo câncer e controle em relação ao risco no desenvolvimento do câncer de próstata, bem como em relação a sua distribuição nos diferentes grupos (p > 0,05). Conclusões: Estes resultados sugerem que não há correlação na amostra estudada entre o número de repetições do polimorfismo HSD3B2 e o risco de câncer de 9 próstata. Outros dados clínicos, tais como idade, níveis de testosterona total e livre também não estiveram associados com o polimorfismo no presente estudo. / Background: Different studies suggest that dihydrotestosterone (DHT) plays an important role in prostate carcinogenesis. The incomplete inactivation or low degradation of DHT in the prostate can lead to its accumulation, and probable increased androgen action. The enzyme 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type II (HSD3B2) is responsible for the inactivation of DHT in the prostate. A complex polymorphic dinucleotide repeat (TG)n(TA)n(CA)n in the HSD3B2 gene was evaluated against the risk of developing prostate cancer. Methods: Blood samples were collected from 169 individuals with prostate cancer and 161 control individuals. The analysis of the HSD3B2 gene polymorphism was performed using PCR to amplify the region of polymorphism; the PCR products were analyzed by Capillary electrophoresis. The alleles of the polymorphism (TG)n(TA)n(CA)n were dichotomized into short (≤ 285) and long (> 285). Results: A total of 36 alleles varying from 267 pb to 361 pb were genotyped in our study. The 285 pb allele was the most frequent representing 36.4% of all genotyped alleles, followed by 288 pb and 337 pb, representing 17.3% and 15.4%, respectively. In the risk analysis, there were no significant differences between the different genotypes in relation to cancer and control group in relation to risk in the development of prostate cancer and compared distribution in different groups (p > 0.05). Conclusion: These results suggest that there is no correlation in the sample between the number of repetitions of the HSD3B2 polymorphism and risk of prostate 11 cancer. Other clinical data such as age and levels of total and free testosterone are not associated with polymorphism in this study.
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Caracterização citogenética e morfológica em uma coleção de acessos de Paspalum nicorae parodi / Cytogenetic ans morphological characterization of a collection of Paspalum nicorae Parodi accessions

Reis, Camila Aparecida de Oliveira dos January 2008 (has links)
Paspalum nicorae Parodi é uma espécie forrageira, perene, apomítica, com uma alta tolerância ao pastejo. Este trabalho faz parte de um projeto mais amplo de melhoramento da espécie, em andamento no Departamento de Plantas Forrageiras e Agrometeorologia da UFRGS. Neste trabalho foram analisados o número cromossômico, o comportamento meiótico, a fertilidade do pólen e realizada a caracterização morfológica de diversas populações naturais. A análise citogenética foi feita em 53 acessos, todos tetraplóides, com 2n=40 cromossomos (n=20). Todos os acessos apresentaram algum tipo de anormalidade meiótica, com freqüências variáveis de configurações cromossômicas com a presença de irregularidades como quadrivalentes, trivalentes e univalentes em diacinese e metáfase I, além de outras irregularidades como pontes e retardatários nas anáfases e telófases. A viabilidade de pólen foi alta, variando de 88,99% a 95,06% (média de 91,78%), o que é esperado em apomítico pseudogâmico. Quanto à análise morfológica, dos 53 acessos avaliados 35,84% apresentaram 100% de pêlos nas folhas, 73,58% bainha verde, 54,71% nervura central esbranquiçada e 50,94% hábito decumbente. Os 52 acessos analisados para cor de folha, foram classificados como 76,92% de cor verde, 13,45% amarelo esverdeado e 9,62% verde acinzentado pelo método da cartela e pelo colorímetro foram classificados como 59,62% acinzentado, 32,69% acinzentado amarelo, 5,77% amarelo e 1,92% acinzentado escuro. O comprimento de racemos variou de 9,4cm a 1,3cm (média de 3,54cm) e a quantidade de racemos variou de 1 a 6 (48,72% dos acessos apresentaram 4 racemos na inflorescência) para os 39 acessos analisados. Comprimento e a largura da folha foram medidos em 52 acessos: o comprimento variou de 36,13cm a 13,06cm (média de 26,91cm) e a largura variou de 0,67cm a 0,36cm (média de 0,53cm). Foram avaliados 53 acessos, com relação à altura, que variou de 115,7cm a 29,0cm (média de 50,2cm). Embora não haja variabilidade no número cromossômico, existe variabilidade citogenética no nível de associações cromossômicas, assim como uma alta variabilidade morfológica entre os acessos analisados. / Paspalum nicorae Parodi is a perennial apomictic forage species, with grazing tolerance. This work is part of a wider genetic breeding project of this species, in development at the Departamento de Plantas Forrageiras e Agrometeorologia, UFRGS. In the present work, analyses of chromosome numbers, meiotic behaviour, pollen fertility and a morphological chatacterization were performed in several natural populations. Cytogenetic analysis of 53 accessions showed that all of them were tetraploid, with 2n=40 chromosomes (n=20) and presented some kind of meiotic abnormalities, with varying chromosome configurations and irregularities such as quadrivalentes, trivalents and univalents at diakinesis and metaphase I, besides other abnormalities as bridges an laggards at anaphases and telophases. Pollen viability was high, ranging from 88.99% to 95.06% (average 91.78%), what is expected in a pseudogamous apomictic. Regarding morphological analyses, from the 53 accession evaluated, 35.84% presented 100% of hairs in the leaves, 73.58% green sheath, 54.71% whitish central venation and 50.94% decumbent habit. The 52 accessions analysed for leaf colour were classified as 76.92% green, 13.45% greenish yellow and 9.62% as greyish green by the table of colors standard method and by the colorimeter as 59.62% greyish, 32.69% greyish yellow, 5,77% yellow and 1.92% dark greyish. Raceme length ranged from 9.4cm to 1.3cm (average 3,54cm) and number of racemes from 1 to 6 (48.72% of the 39 accessions analysed had 4 racemes. Leaf length and width were measured in 52 accessions: length ranged from 36.13cm to 13.06cm (average 26.91cm) and width ranged from 0.67cm to 0.36cm (average 0.53cm). Fifty three accessions were evaluated regarding height, which ranged from 115.7 cm to 29.0cm (average 50.2cm). Despite no variability in chromosome number, there is cytogenetic variability in chromosome associations, as well as a high morphological variation among the accessions analysed.
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Progresso genético de híbridos de milho (Zea mays L.) na segunda safra ao longo de uma década /

Médice Junior, Helder January 2018 (has links)
Orientador: Gustavo Vitti Môro / Resumo: A quantificação do progresso genético é o ponto-chave para definir o sucesso de um programa de melhoramento. O conhecimento dos ganhos obtidos direcionará a estratégia do programa, orientando as tendências e decisões que o melhorista deve adotar para os próximos ciclos seletivos. Objetivou-se, com este trabalho, quantificar o progresso genético da produtividade de híbridos de milho, ao longo de uma década. Estes, por sua vez, foram avaliados nas segundas safras, entre 2004 e 2013, nas regiões Centro e Sul do Brasil, para a característica produtividade de grãos e umidade. O estudo do progresso foi dividido em duas regiões, sendo elas Centro e Sul. Um total de 245 ambientes, contendo 308 híbridos, com 115 testemunhas. Ao todo, 193 experimentais foram avaliados. Os ensaios foram conduzidos em delineamento de blocos ao acaso, com duas repetições, sendo as parcelas experimentais compostas por 4 linhas de 5 metros de comprimento, com espaçamento de 0,90 m entre linhas, para os anos de 2005 a 2011 e, após 2012, a parcela foi composta de 4 linhas de 4 m com 0,50 m entre linhas. O progresso genético para o melhor híbrido experimental na região Centro do Brasil foi de -0,39%, com média de produtividade de 6.616 kg ha-1. Para a região Sul, o progresso foi de -0,75%, com produtividade média de 6.808 kg ha-1. Pôde-se quantificar o progresso genético para a segunda safra de milho nas regiões Centro e Sul do Brasil. Mais estudos precisam ser realizados a fim de que se entendam os demais car... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Quantifying the genetic progress is the key point to define the success of a breeding program. The knowledge of the obtained gains will direct the program strategy, guiding the trends and decisions that the researcher must adopt for the next cycles of selection. The aim of this study was to quantify the genetic progress of corn hybrids over a decade. Corn hybrids were assessed in the second crops between 2004 and 2013 in the central and southern regions of Brazil for the traits grain yield and humidity. The study of progress was divided into two regions, i.e. Central and South, and had a total of 245 environments, containing 308 hybrids with 115 controls. In total, 193 experimental studies were assessed. The tests were conducted in a randomized block design with two replications and experimental plots composed of four rows of 5 m long and interrow spacing of 0.90 m for 2005 to 2011. After 2012, the experimental plot was composed of four rows of 4 m long and interrow spacing of 0.50 m. The genetic progress for the best experimental hybrid in the Central region of Brazil was −0.39%, with an average productivity of 6,616 kg ha−1. For the South region, progress was −0.75%, with an average productivity of 6,808 kg ha−1. The genetic progress for the second corn crop was quantified in the Central and South regions of Brazil. Further studies need to be carried out in order to understand other traits, besides productivity. / Mestre
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Busca de associações de polimorfismos nos receptores de hipocretina com fenótipos do sono em voluntários sadios e insones da cidade de São Paulo / Insomnia and Polymorphisms in hypocretin receptors: search for association in a Brazilian population sample

Oliveira, Lhoyane de Moraes [UNIFESP] 30 January 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-07-22T20:49:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-01-30. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-11T03:26:34Z : No. of bitstreams: 1 Publico-Mestrado%20-%20Lhoyane%20de%20Moraes%20Oliveira.pdf: 1350089 bytes, checksum: d6660f748e3e65f1d952f87916135466 (MD5) / Dois processos regulam o ciclo sono/vigília: um circadiano e um homeostático. As hipocretinas (peptídeos neurotransmissores) estão envolvidas na regulação homeostática deste ciclo. A ausência ou redução no funcionamento do sistema hipocretinérgico acarreta em sonolência excessiva, por esta característica, propõe-se que a hiperatividade deste sistema pode resultar em episódios de hipervigília e insônia. As hipocretinas 1 e 2 possuem receptores específicos, amplamente distribuídos no cérebro. No gene do HcrtR1 foi descrito um polimorfismo que ocorre na posição G1222A e no gene do HcrtR2 há uma substituição na posição G922A, ambos provocam mudança de aminoácido. No presente trabalho estes polimorfismos foram analisados a fim de buscar associação com a insônia. Para obtenção dos parâmetros polissonográficos e confirmação da queixa dos pacientes, cento e cinqüenta e sete indivíduos (83 insones) foram submetidos à polissonografia e coleta de amostra de sangue periférico realização de PCR/RFLP. Entretanto, não foram observadas associações entre os polimorfismos estudados (G1222A no receptor 1 de hipocretina e G922A no receptor 2 de hipocretina) e a insônia nesta amostra. As freqüências genotípicas foram acompanhadas de acordo com o esperado para o equilíbrio Hardy-Weinberg usando a análise do χ 2, comparações da variância dos parâmetros de sono individuais foram feitas com os testes estatísticos apropriados. O programa estatístico Statistica 6.1 (StatSoft, Inc.) foi usado para todas as análises. / Hypocretin system has been described as one of the more important neurotransmission system to be involved in the waking process. Lack of function of this system, by mutations or neuron death, leads to pronounced excessive sleepiness in mammals. It is proposed that a hyperactive hypocretin system can result in hyper arousal episodes and insomnia. The hypocretins 1 and 2 bind to two known receptors widely distributed in the brain. In the present we sought to analyze whether polymorphisms in both receptors 1 and 2 are associated with insomnia. We have enrolled 83 insomnia patients, confirmed the complain with polysomnographic recordings and compared the frequencies of the hypocretins receptors polymorphisms with healthy controls with no sleep disorder confirmed by two nights of sleep recording. Our results show no association of any of the polymorphisms in both receptors with insomnia. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Efeito da progesterona no ciclo celular de células endometriais de mulheres com endrometriose pélvica portadoras do polimorfismo progins / Progesterone effect on the cell cycle control in endometrial cells from women with endometriosis harboring the PROGINS polymorphism

D'Amora, Paulo [UNIFESP] 28 October 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-07-22T20:49:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-10-28. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-11T03:25:27Z : No. of bitstreams: 1 Publico-00247.pdf: 1617465 bytes, checksum: 6e919e998ed655de4a47c93b6fab5445 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Alterações no endométrio vêm sendo implicadas na etiopatogenia da endometriose. Dentre os diversos distúrbios já identificados na mucosa uterina destacam-se os regulados pela progesterona, o que implica, de alguma forma, que uma resistência do endométrio ao hormônio pode estar envolvida na gênese da doença. O efeito da progesterona é regulado principalmente por duas isoformas de seu receptor (PRA e PRB) e uma alteração genética (polimorfismo), denominada PROGINS, no gene que codifica este receptor, leva ao desbalanço na expressão dessas subunidades, acarretando alterações enotípicas já detectadas em enfermidades hormônio-dependentes. Em trabalho anterior realizado em nosso laboratório, identificamos que, mulher com esta alteração tem cerca de duas vezes mais chances de desenvolver endometriose. Frente aos dados de que alterações endometriais estão envolvidas na etiopatogenia da endometriose, de que estas alterações são decorrentes da resistência deste tecido a ação da progesterona e de que o polimorfismo PROGINS, prevalente em mulheres com a doença possa estar relacionado à causa desta resistência, nos propusemos, no presente estudo, a avaliar alterações no ciclo celular de células endometriais em cultivo (genotipadas para o polimorfismo PROGINS), de mulheres com e sem endometriose, após tratamentos com estradiol e progesterona. Para tanto foi obtido tecido endometrial das pacientes durante cirurgia videolaparoscópica. Após a cirurgia as pacientes foram divididas, segundo o achado cirúrgico e de acordo com a detecção do polimorfismo PROGINS, em três grupos: pacientes com endometriose, com e sem o polimorfismo PROGINS (E+Alu e E-Alu) e outro formado por mulheres nas quais não foram evidenciadas alterações pélvicas, não portadoras do referido polimorfismo (CP-Alu). Este tecido foi processado para cultura celular e subseqüentemente analisado no que se refere à funcionalidade do receptor de progesterona relacionada aos processos de proliferação celular, apoptose e progressão no ciclo celular. Nossos resultados mostraram que as células de pacientes com endometriose apresentaram diminuição da resposta à progesterona, com conseqüente aumento na proliferação celular com progressão descontrolada do ciclo celular, viabilidade celular sustentada e diminuição da taxa de morte celular por apoptose, especialmente no grupo de portadoras do polimorfismo PROGINS, em comparação ao grupo de não portadoras e grupo controle. Devido à importância da ação da progesterona no endométrio de pacientes com endometriose, nosso estudo apresenta evidências de que o polimorfismo PROGINS possa estar relacionado com a patogênese da endometriose. / FAPESP: 04/09810-6 / CAPES: 130538/2006-3 / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações

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