• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 1800
  • 160
  • 67
  • 63
  • 63
  • 54
  • 44
  • 42
  • 20
  • 20
  • 20
  • 19
  • 10
  • 7
  • 1
  • Tagged with
  • 2034
  • 945
  • 828
  • 380
  • 331
  • 269
  • 248
  • 244
  • 237
  • 236
  • 217
  • 213
  • 197
  • 189
  • 168
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
51

Método de discretização de variáveis para redes bayesianas utilizando algoritmos genéticos

Lima, Mariana Dehon Costa e January 2014 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T18:04:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 327126.pdf: 885886 bytes, checksum: 75231cd2c02dd6ae8e60fb0d058ec67d (MD5) Previous issue date: 2014 / Rede Bayesiana é uma técnica de classificação vastamente utilizada na área de Inteligência Artificial. Sua estrutura é composta por um grafo acíclico direcionado usado para modelar a associação de variáveis categóricas (qualitativas). Entretanto, em casos onde existem variáveis numéricas no domínio, uma pré discretização é geralmente necessária. Nesta dissertação, é apresentada uma discretização heurística para Redes Bayesianas que procura padrões nos dados e os divide de acordo com os padrões encontrados. Esses padrões são identificados por dois eventos que são otimizados por uma busca através do Algoritmo Genético. Esses dois eventos mudam de acordo com a base de dados, tornando a discretização proposta mais flexível para lidar com diferentes domínios de aplicação. O método de discretizaçãao proposto foi testado em duas situações distintas: quando a variável de saída é qualitativa (classificação) e também quando a variável de saída é quantitativa e é necessário estimar o seu valor médio e desvio-padrão. Para casos em que a saída é qualitativa foram utilizados duas bases de dados: Iris Flower e Wine. Em ambas as bases de dados a acurácia do método proposto foi superior quando comparada com outros dois métodos da literatura: um que discretiza as variáveis por frequência e outro por tamanho de classes. Para representar os casos em que variável de saída é quantitativa, foi utilizada uma base de dados real com dados de perfuração de poços de petróleo com o objetivo de estimar a taxa média de perfuração de broca. Nesses casos, é feito a estimação do valor de saída através da média da distribuição de probabilidade. O método proposto obteve um erro inferior na estimação quando comparado tanto com o método que discretiza por frequência quanto com o método que discretiza por tamanho. Com os resultados, a conclusão é que o método pode discretizar as variáveis quantitativas através das identificações dos eventos que desviam de um intervalo intermediário nos dados, seja para cima (pico) ou para baixo (vale). Também foi observado que o método está ligado a um problema de otimização global quando todas as variáveis quantitativas são discretizadas ao mesmo tempo.<br> / Abstract : Bayesian Network (BN) is a classification technique widely used in Artificial Intelligence. Its structure is a DAG (direct acyclic graph) used to model the association of categorical variables. However, in cases where the variables are numerical, a previous discretization is usually necessary. In this dissertation, we show a heuristic discretization for Bayesian Networks that search for data patterns and divide the data according to them. These patterns are identified by two events: peak and valley being optimized by a search through the Genetic Algorithm. These two events change according to the database, making the proposed method a exible discretization to handle difierent application domains. The Peak-Valley Discretization Method proposed was tested two different situations: only classification when the output variable is qualitative and also estimating the mean value and the standard deviation when the output variable is quantitative. Considering the cases where the output is quantitative, two databases where used: Iris Flower and Wine. The accuracy in both of them was superior with the proposed method when compared with two other methods from the literature: one that discretizes the variable by frequency and one that does that by class' size. To represent the cases where the output variable is quantitative, was used a real data of oil wells perforation with the objective of estimating the average perforation rate. In such cases, the estimation is done by the average of the output value distribution of probability. The proposed method achieved a lower error in the estimation when compared with the method of frequency discretization and with the method that discretizes by size. With the results, the conclusion is that the method can properly discretize the quantitative variables by identifying events that deviate from expected results within the knowledge domain, whether up (peak) or down (valley). It was also observed that the method brings a problem of global optimization when discretizing all quantitative variables simultaneously. The problem of global optimization was treated by a Genetic Algorithm.
52

A Influência de manobras de válvulas na identificação do fator de atrito em tubulações de rede de distribuição de água / The Influence valves maneuvers in friction factor identification in network of pipes distribution of water

Viana, Francisco Marques 03 December 2014 (has links)
VIANA, F. M. A Influência de manobras de válvulas na identificação do fator de atrito em tubulações de rede de distribuição de água. 2014. 83 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Civil: Recursos Hídricos) – Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2014. / Submitted by Marlene Sousa (mmarlene@ufc.br) on 2015-04-14T11:46:39Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_fmviana.pdf: 1240444 bytes, checksum: 72d961658030c40a9102b8831248d885 (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa(mmarlene@ufc.br) on 2015-04-16T13:56:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_fmviana.pdf: 1240444 bytes, checksum: 72d961658030c40a9102b8831248d885 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-16T13:56:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_fmviana.pdf: 1240444 bytes, checksum: 72d961658030c40a9102b8831248d885 (MD5) Previous issue date: 2014-12-03 / An important advance in the hydraulic network modeling was the calibration through this is possible to know the behavior of the physical characteristics of the network, which is of great importance in decision-making. In this work we will use the reverse transient method applied with genetic algorithm for calibration of friction factors pipes of a water distribution network through simulations from the variation of parameters as the number of chromosomes, number of generations, passing a point mutation and simple, we measured quantity, and different types of maneuvering valve (sudden and soft). The simulations were divided into instances, wherein each solution found by computational model was evaluated by an objective function based on square difference between observed and calculated results for the transient loads in (s) node (s) monitored (s). The analyzes of the solutions shown as the inverse method, the algorithm genetic and the choice of its parameters influence the final result. Through cases, it was observed that for the studied networks, no use simply alone increase values ​​of the parameters of the genetic algorithm in order to improve the efficiency of method. As this is an inverse method, a specific combination of friction factor was generated from the average of these solutions under the same parameters in ten successive applications of genetic algorithm (processing). The results reported for hydraulic loads in (s) node (s) monitored (s) were very close considered the actual loads (Observed), in some parts of pipes values ​​for the friction force and considered close to real. The efficiency of the results was measured by Function Objetiv / Um avanço importante na modelagem de rede hidráulica foi a calibração, através desta é possível conhecer o comportamento das características físicas da rede, sendo esta de grande importância nas tomadas de decisão. Neste trabalho vamos utilizar o método transiente inverso aplicado com algoritmo genético, para calibração dos fatores de atritos das tubulações de uma rede de distribuição de água por meio de simulações a partir da variação de parâmetros como: número de cromossomos, número de gerações, cruzamento de um ponto e mutação simples, quantidade de nós medidos, e diferentes tipos de manobras de válvulas (brusca e suave). As simulações foram divididas em casos, onde cada solução encontrada pelo modelo computacional foi avaliada por uma função objetiva, baseada na diferença quadrática entre resultados observados e calculados para as cargas transientes no(s) nó(s) monitorado(s). As análises das soluções encontradas demonstram como o método inverso, o algoritmo genético e a escolha de seus parâmetros influenciam o resultado final. Por meio dos casos, observou-se que para as redes estudadas, não adianta simplesmente aumentar isoladamente os valores dos parâmetros do algoritmo genético no intuito de melhorar a eficiência do método. Como se trata de um método inverso, uma combinação específica de fator de atrito foi gerada a partir da média das soluções obtidas, sob os mesmos parâmetros, em dez aplicações sucessivas do algoritmo genético (processamentos). Os resultados apresentados para as cargas hidráulicas no(s) nó(s) monitorado(s) foram bem próximas das cargas consideradas reais (observadas), tendo em alguns trechos das tubulações valores para a força de atrito bem próximos dos considerados reais. A eficiência dos resultados encontrados foi medida por meio da Função Objetiva.
53

Otimização de Risers de materiais compósitos / Optimization of composite Risers

Silva, Rafael Fernandes da 31 August 2012 (has links)
SILVA, R. F. Otimização de Risers de materiais compósitos. 2012. 96 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Civil: Estruturas e Construção Civil) – Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Marlene Sousa (mmarlene@ufc.br) on 2015-08-10T16:53:44Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_rfsilva.pdf: 5963052 bytes, checksum: 8a942160f8a3333a4b3fb8c0cf3ad64f (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa(mmarlene@ufc.br) on 2015-08-11T11:44:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_rfsilva.pdf: 5963052 bytes, checksum: 8a942160f8a3333a4b3fb8c0cf3ad64f (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-11T11:44:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_rfsilva.pdf: 5963052 bytes, checksum: 8a942160f8a3333a4b3fb8c0cf3ad64f (MD5) Previous issue date: 2012-08-31 / The depletion of oil and gas reserves has increasingly led to the search of deepwater fields. Most of recent oil and gas discoveries in Brazil occurred in deepwater fields. However, using steel risers for deepwater application is not always feasible, due to its high weight. In such enviroments, the traditional extraction and production risers made of steel tend to become expensive, due to increased top tension which overburdens the plataform. Fiber reinforced composite materials, being lighter, present interesting characteristics for offshore applications, such as high specific strength and stiffness, high corrosion resistance, good thermal insulation, high structural damping properties, and fatigue resistance. Thus, the application of composite risers is an interesting alternative to deepwater oil fields. The design of laminated composite risers is very difficult since the strength and stiffness of these components depend on the number of layers and the material, thickness, and orientation of each layer. Thus, the use of the conventional trial-and-error strategy is not adequate and it is necessary to apply optimization techniques. In this work, optimization techniques are applied to optimize composite catenary risers. the design variables are the thickness, the orientation and material of each layer. A multi-objective formulation is adopted to minimize the weight, cost and maximize the buckling safety factor of the composite riser. The optimization model includes strength and stability constraints and considers multiple load cases. The global analysis of the riser is carried out using the catenary equations and the stress computation in the critical locations is performed using the Classical Lamination Theory (CLT) and the theory of thin-walled tubes. It is important to note that, due to manufacture constraints, the design variables can only assume discrete values. Therefore, a genetic algorithm is used for optimization since it can easily handle discrete variables. In addition to classical genetic operators, as crossover and mutation, this algorithm also includes operators specially designed to handle laminate structures, such as layer swap and layer deletion. The proposed formulation is applied in the design optimization of composite catenary risers with different water depths and top angles. Numerical examples show that the proposed methodology is very robust / Materiais compósitos reforçados por fibras têm sido cada vez mais empregados devido a suas altas relações rigidez/peso e resistência/peso, além de outras vantagens, como alta resistência à corrosão, bom isolamento térmico, excelente amortecimento e resistência à fadiga. Por isso, estes materiais têm sido aplicados na fabricação de tubos para o transporte de fluidos em diversas indústrias, como por exemplo, a petroquímica. A exploração e produção de petróleo e gás em águas profundas tornam necessário o uso de plataformas flutuantes conectadas ao poço por dutos (flowlines) e risers, que quando feitos de aço, se tornam menos atrativos devido ao seu elevado peso. Nessas condições, requerem-se mecanismos capazes de suportar as altas tensões desenvolvidas no topo, sendo que tais mecanismos só podem ser acomodados por plataformas maiores e mais caras. Além disso, torna-se necessário também o uso de mais flutuadores visando suportar o peso total do sistema, encarecendo também o projeto. Diante de tais fatos, tem-se estudado a viabilidade do emprego de risers de materiais compósitos na exploração em águas ultra-profundas. Devido ao grande número de parâmetros envolvidos, tais como o número de camadas e o material, a espessura e o ângulo de orientação das fibras de cada camada, o projeto de estruturas de compósitos laminados é mais complexo que o de aço. No caso dos risers, acrescentam-se ainda as várias condições de carregamento e ambientais que tornam o processo de projeto tradicional de tentativa e erro inadequado. Uma solução apenas satisfatória não explora, em geral, o potencial que os compósitos apresentam de se adaptarem às solicitações da forma mais eficiente possível. Esse trabalho tem como objetivo desenvolver uma metodologia e ferramentas computacionais para o pré-dimensionamento de risers de material compósito via técnicas de otimização. São consideradas como váriaveis de projeto as espessuras, as orientações das fibras e os materiais de cada lâmina. Peso, custo e um fator de segurança são adotados como função objetivo. Restrições de resistencia, estabilidade e fabricação avaliadas. O riser é análisado usando um modelo de catenária inextensível. Um Algoritmo Genético com operadores específicos para estruturas laminadas é empregado
54

Resistência de videiras ao míldio

Muniz, Jaqueline Nogueira January 2017 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-10-03T04:17:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348732.pdf: 1781969 bytes, checksum: 0f07f5bdc6d9c073d363acb1e97aa593 (MD5) Previous issue date: 2017 / A mesorregião serrana de Santa Catarina tem se destacado na produção de vinhos finos e espumantes. No entanto, a região apresenta elevada precipitação pluviométrica, o que favorece o aparecimento de doenças, como o míldio, que constituem um risco para a viticultura e podem reduzir substancialmente a produtividade. A região do Trentino Alto Adige na Itália é famosa pela produção de vinhos finos, entretanto a utilização de variedades europeias por todo o território torna-se um foco de ataque por míldio também. Nas últimas décadas diferentes genótipos e variedades de videiras resistentes ao míldio foram desenvolvidos, entretanto existe a preocupação de que o patógeno possa ter evoluído com o passar dos anos e com a criação de novas variedades. Neste sentido, o objetivo principal do presente estudo foi avaliar no Brasil os efeitos dos loci de resistência Rpv1 e Rpv3 (individual e piramidados) sobre o progresso da doença de Plasmopara viticola durante todo o ciclo vegetativo e reprodutivo dos genótipos do programa de melhoramento genético da UFSC Curitibano; e na Itália o principal objetivo foi avaliar as diferenças moleculares entre isolados de míldio coletados na região do Trentino Alto Adige e determinar se existem diferentes níveis de agressividade nos genótipos e variedades estudados. As plantas da população UFSC-2012-1 foram selecionadas e divididas em quatro grupos de resistência: 1) Nenhum loci de resistência; 2) Apenas Rpv1; 3) Apenas Rpv3 e 4) Rpv1 + Rpv3. A gravidade da doença foi monitorada durante as estações 2014/2015 e 2015/2016. Foram construídas curvas de progresso da doença do míldio e foram comparadas as epidemias de cada grupo de resistência utilizando quatro medidas epidemiológicas: início da aparência dos sintomas (BSA), tempo para atingir a gravidade máxima da doença (TRMDS), gravidade máxima da doença (Smax) e área sob a doença Curva de progresso (AUDPC). 41 marcadores SSR foram utilizados na análise genética de sete isolados de Plasmopora viticola. Doze variedades / genótipos hospedeiros foram utilizados para as inoculações cruzadas com quatro isolados de P. viticola. Os hospedeiros foram divididos em dois grupos: susceptível (SUS) e resistente ou parcialmente resistente (R ou PAR) a P. viticola, contendo diferentes QTLs conferindo resistência a P. viticola (Rpv). A escala OIV-452-1 foi utilizada em discos foliares para avaliar a resistência dos genótipos ao patógeno. Nos genótipos do programa de melhoramento da UFSC Curitibanos, os grupos contendo apenas um dos loci de resistência revelaram apenas resistência parcial a P. viticola; contudo, quando os loci foram piramidados, o controle do progresso da doença foi completo. Na Itália, a comparação molecular e fenológica de isolados de míldio coletados em diferentes vinhedos da região mostrou que existem diferenças genéticas entre eles e sua agressividade em diferentes genótipos de Vitis também foram demonstrados.<br> / Abstract : The mountainous region of Santa Catarina has been excelling at the production of fine and sparkling wines. However, the region presents high rainfall, which favors the emergence of diseases that are a risk to viticulture and can substantially reduce productivity. The region of Trentino, Alto Adige in Italy, is famous for the production of fine wines. Conversely, the use of grape varieties throughout the territory has become a focus of attack by mildew. In the last decades, different mildew resistant genotypes and varieties of vines have been developed; notwithstanding, there is concern that the pathogen may have evolved over the years with the creation of new varieties. In this sense, the main objective of the present study was to evaluate, in Brazil, the effects of resistance loci Rpv1 and Rpv3 ? individual and pyramidal ? on the progress of Plasmopara viticola disease throughout the vegetative and reproductive cycles of the genotypes in the breeding program UFSC Curitibanos. In Italy, the main objective was to evaluate the molecular differences between isolates collected in the Trentino Alto Adige region, and to determine if there are different levels of aggression in the genotypes and varieties studied. The plants of the UFSC-2012-1 population were selected and divided into four resistance groups: 1) No resistance loci; 2) Rpv1 only; 3) Only Rpv3 and 4) Rpv1 + Rpv3. The severity of the disease was monitored during the 2014/2015 and 2015/2016 seasons. Progress curves for mildew disease were constructed and the epidemics of each resistance group were compared using four epidemiological measures: symptom onset (BSA), time to maximum disease severity (TRMDS), maximum disease severity ( Smax) and area under the Disease Progress Curve (AUDPC). The use of 41 SSR markers was implemented in the genetic analysis of seven isolates of Plasmopora viticola. In total, 12 host varieties / genotypes were used for cross inoculation with four isolates of P. viticola. The hosts were divided into two groups: susceptible (SUS) and resistant or partially resistant (R or PAR) to P. viticola, containing different QTLs, which confer resistance to P. viticola (Rpv). The OIV-452-1 scale was used in leaf discs to evaluate the resistance of the genotypes to the pathogen. In the breeding program genotypes of UFSC Curitibanos, groups containing only one of the resistance loci revealed only partial resistance to P. viticola; however, when the loci were pyramided, full control of the disease progress was attained. In Italy, the molecular and phenological comparison of mildew isolates collected from different vineyards in the region, revealed the existence genetic differences between them ? and their aggressiveness in different genotypes of Vitis were also demonstrated.
55

'' Filogeografia de golfinhos rotadores (Stenella longirostris Gray, 1828) no litoral brasileiro a partir de marcadores mitocondriais''.

VOLPI, T. A. 28 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:38:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_5776_VOLPI 2012_Filogeografia Stenella longirostris_PPGBT_CEUNES_oficial_PROTEGIDO.pdf: 2949344 bytes, checksum: fa95887e37083748152e7197a8a96914 (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 / Cetáceo. Marcadores genéticos. Genética de populações.
56

Algoritmos geneticos em problemas de programação não linear continua

Cortes, Maria Bernadete de Sousa January 1996 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnologico / Made available in DSpace on 2016-01-08T20:32:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 1996 / Apresenta um método computacional, baseado no paradigma dos algoritmos genéticos, ou seja, uma técnica robusta para solucionar problemas de programação não linear contínua. Um método misto onde se empregam técnicas de simulated annealing, gradiente, para evitar a convergência prematura para mínimos ou máximos locais. O método proposto generaliza este tipo de algoritmo misto para métodos genéticos: o resultado é um método numérico de características análogas ao da perturbação do gradiente onde os termos aleatórios impedem a convergência para o mínimo local e aumentam a velocidade de convergência. Mostra como os métodos mistos podem ser derivados do método genético: os métodos de descida em geral podem ser considerados como sendo de tipo genético e métodos mistos podem ser obtidos por escolhas particulares das definições de regras do algoritmo genético.
57

Um modelo de calculo dos preços instaneos no suprimento de energia eletrica utilizando algoritmos geneticos e o Metodo de Monte Carlo

Villarroel Davalos, Ricardo January 1997 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnologico / Made available in DSpace on 2016-01-08T21:56:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 1997 / Modelo matemático e computacional que revê o cálculo dos "Spot Prices" horários da eletricidade com a incorporação das características não lineares e "pontos válvula" na função custo das unidades de geração de energia elétrica. Consistindo no cálculo apropriado dos custos marginais do sistema de geração, através do Algoritmo Genético Proposto (AGP), visando eliminar as dificuldades apresentadas pela aplicação dos métodos clássicos. Adotam-se conceitos associados ao mercado livre de energia para estimular a eficiência dos sistemas elétricos de potência. Este sistema é representado através do fluxo linearizado de potência ativa e constitui a ferramenta básica para a avaliação do custo das perdas do sistema de transmissão e para a distribuição espacial dos preços. São calcutados e avaliados os "Spot Prices" horários da eletricidade do sistema global e por barra, através do Método de Simulação Monte Carlo. O uso do modelo proposto é ilustrado através de uma aplicação com o "Sistema Teste de Confiabilidade do IEEE" RTS-IEEE.
58

Otimização de parâmetros de materiais de atrito de sistemas de freio usando algoritmos genéticos

Gonçalves, Jeferson January 2004 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Mecânica. / Made available in DSpace on 2012-10-21T21:46:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 204948.pdf: 5539429 bytes, checksum: 765bd1fd4e0067a42baf4da7fc367f12 (MD5) / Este trabalho tem por objetivo criar quatro funções que representem os comportamentos dos seguintes parâmetros de um material de atrito, a partir de sua composição: custo, ruído global, desgaste médio e atrito médio. A ferramenta escolhida para criar as funções é o delineamento fatorial de experimentos. Criadas estas funções, propôs-se uma função objetivo, que será o parâmetro de controle para um algoritmo de otimização, na forma de um aplicativo computacional. O algoritmo em questão foi desenvolvido usando Algoritmos Genéticos. Uma vez criadas as funções e o algoritmo, sua eficiência e convergência foram testadas. Garantidas a eficiência e a convergência do algoritmo, o mesmo foi usado para produzir uma série de materiais de atrito. As propostas de materiais de atrito foram confeccionadas e testadas utilizando-se procedimentos reconhecidos pelas grandes empresas fabricantes de materiais de atrito. De posse dos resultados experimentais, foram verificados os erros obtidos em relação aos resultados previstos pelo aplicativo. Os erros e as imprecisões dos métodos aplicados foram descritos e explorados. Diretrizes para as correções e para os avanços futuros foram estabelecidas.
59

Algoritmos genéticos

Mole, Vilson Luiz Dalle January 2002 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação. / Made available in DSpace on 2012-10-19T22:42:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 188790.pdf: 950320 bytes, checksum: 1bd92621c53fa691f3e779d757acccd2 (MD5) / O trabalho desenvolvido consta da proposição, teste e análise de resultados, de uma estrutura de paralelização para algoritmos genéticos. A estrutura proposta está baseada em um conjunto de populações cooperantes que evoluem em paralelo, onde a troca de material genético, entre as populações, se processa através de indivíduos migrantes. A estrutura para implementação baseia-se na tecnologia de orientação a objetos, sendo que a mesma pressupõem a exploração do paralelismo de máquina através das redes de computador, bem como a exploração do paralelismo local - máquinas multiprocessadas - pela utilização de threads. O trabalho descreve os resultados obtidos com um protótipo construído para simular toda a estrutura proposta. Neste, o paralelismo de máquina foi simulado através de programação concorrente, com a utilização de threads. Os resultados obtidos demonstram a viabilidade da proposta e indicam a necessidade de novas pesquisas buscando testar a estrutura em modo real, sobre um ambiente distribuído.
60

Caracterização da proteina LaRbp38: mapeamento do domínio de interação com ácidos nucléicos e identificação de possíveis proteínas parceiras

Perez, Arina Marina [UNESP] 19 February 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-19Bitstream added on 2014-06-13T20:33:39Z : No. of bitstreams: 1 perez_am_me_botib.pdf: 10680809 bytes, checksum: b87b752e56e77d065385e0c67b7da6a0 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O presente trabalho teve por objetivo mapear os domínios de interação da proteína LaRbp38 (RNA binding protein 38 KD) de Leishmania amazonensis com ácidos nucléicos e a identificação de proteínas parceiras que formassem possíveis complexos com ela nos telômeros do parasita. LaRbp38 é uma proteína exclusiva de protozoários tripanosomatídeos, entre os quais estão os agentes etiológicos da leishmaniose, uma doença endêmica presente em diversas regiões do Brasil. Novos casos da doença vêm aumentando progressivamente, principalmente entre indivíduos imunocomprometidos e por isso a Organização Mundial da Saúde tem incentivado a busca de novos alvos para desenvolver drogas que eliminem eficazmente o parasita. LaRbp38 é uma proteína codificada por um gene nuclear, que parece exercer diferentes funções nas maquinarias de replicação nuclear e mitocondrial. Foi primeiramente descrita como proteína estabilizadora de RNA mitocondrial e parece estar envolvida com a replicação de DNA mitocondrial. Em Leishmania, LaRbp38 também interage in vivo com DNA mitocondrial, com seqüências ricas em GT e com DNA telomérico simples e dupla fita. A análise estrutural da proteína não indica a presença de nenhum domínio canônico de interação a ácidos nucléicos. Para dar inicio aos experimentos, a primeira estratégia foi desenhar mutantes delecionais da proteína de L. amazonensis (LaRbp38) de forma que cada um representa uma sobreposição do outro. Cada mutante, nomeados mut1, mut2, mut3, mut4 e mut5, foram subclonados em vetor de expressão bacteriano para produção de polipeptídios recombinantes. Em seguida os polipeptídios foram purificados e testados em western blotting, que mostra tanto LaRbp38 quantos os 5 mutantes sendo reconhecidas pelo soro antLLaRbp38. Ensaios in vitro de interação proteína-DNA (EMSA), usando DNA telomérico simples fita Te11, dupla fita... / Recent results demonstrated that Rbp38 is a protein exclusively expressed in trypanosomatid parasites, which includes the genus Leishmania. Rbp38 is a multifunctional protein exerting functions in the kinetoplast, such as the stabilization of mitochondrial RNAs and in the nucleus, as a protein that binds in vivo kDNA, the double-stranded (LaTel) and the G-rich telomeric DNAs (Tel1). The trypanosomatid Rbp38 does not share sequénce or functional/structural similarities with any other protein deposited in the public data bank. The present work has the aim of mapping the boundaries of the DNA-binding domain of LaRBP38, since using the available in silico tools, we were not able to define any known nucleic acid binding domain in this protein. Therefore, we constructed truncated overlapping mutants of LaRbp38 in order to map the boundaries of its DNA binding domain. These mutant proteins were expressed in a bacterial system and were produced in high amounts as shown by SDS-PAGE and Western blotting analyses. Electrophoretic mobility shift assays (EMSA) were done in order to test the ability of each mutant to bind in vitro the G-rich telomeric DNA, double-stranded telomeric DNA and kDNA. EMSA and competition assays confirmed that LaRbp38 has at least one DNA binding domain (DBD), centrally located, between amino acid residues 141 and 235. This DBD, interacts with distinct affinities with ali DNAs tested. Our results suggested that this binding domain has at least two extensions one towards the N-terminus of mut2 (aa 95 and 141), which showed binding affinity to LaTel and kDNA and other towards the C-terminus of mut3 (aa 235 to283) that strongly interacted with kDNA. However, we can not discard that others parts of the protein may also contribute to these interactions. Other controversial point about LaRbp38 is whether this protein has nuclear and mitochrondrial subcelular localization... (Completo abstract click electronic access below)

Page generated in 0.0445 seconds