The number of Pheasant-tailed Jacana (Hydrophasianus chirurgus) in Taiwan has been reduced and habitats decreased because of human activities in many years. From a conservation perspective, the genetic diversity of this bird became an important subject. The control region in mitochondrial DNA was used as a gene marker to investigate the genetic variation amoung populations of Hydrophasianus chirurgus from Taiwan, Goungdong, and Thailand. An 1182-bp nucleotide sequence was amplified from 34 individuals. Six variable sites and seven haplotypes were found in the control region, and the observed haplotypes were similar in all samples. Low genetic divergence and high degree of gene flow were estimated among three populations. However, this conclusion need more samples of individuals to be proved.

Submitted by SEBASTIÃO SOARES DE OLIVEIRA NETO null (neto.soliver@gmail.com) on 2017-08-14T19:21:28Z No. of bitstreams: 1 Oliveira Neto, S. S. - Dissertação.pdf: 1803281 bytes, checksum: e617e725a28292660d7b2535bb1546b1 (MD5) / Approved for entry into archive by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com) on 2017-08-22T16:48:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 oliveiraneto_ss_me_bot.pdf: 1803281 bytes, checksum: e617e725a28292660d7b2535bb1546b1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-22T16:48:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 oliveiraneto_ss_me_bot.pdf: 1803281 bytes, checksum: e617e725a28292660d7b2535bb1546b1 (MD5) Previous issue date: 2017-07-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A mamoneira (Ricinus communis L.) é uma oleaginosa da família das Euforbiáceas que disseminou-se por varias regiões do mundo devido a sua fácil propagação e adaptação. O principal produto negociado no mercado internacional é o óleo de rícino e o Brasil é o segundo maior fornecedor desse produto. O melhoramento vegetal visando à obtenção de novas cultivares e híbridos de mamoneira é primordial para o sucesso econômico da cultura, pois, o plantio de materiais mais produtivos, resistentes à doenças e que permitem o uso de mecanização traz maior retorno econômico para os produtores. O objetivo do presente estudo foi realizar a caracterização agromorfológica, avaliar a divergência genética e a reação ao mofo cinzento de 58 acessos de mamoneira coletados em diferentes regiões do Brasil. Realizou-se a criação de um banco de sementes de mamoneiras selvagens através de coletas em diversas regiões do Estado de São Paulo, Sul de Minas Gerais e na capital do Rio Grande do Norte. As sementes foram levadas para o Departamento de Produtividade e Melhoramento Vegetal da Faculdade de Ciências Agronômicas (FCA) em Botucatu – SP para beneficiamento e realização de testes preliminares (vigor, germinação e teor de óleo). Os acessos pré-selecionados foram semeados e caracterizados através de 31 descritores morfológicos. Foram coletados racemos desses materiais para testar a reação e a resistência ao mofo cinzento da mamoneira no Laboratório de Entomologia e Fitopatologia da Embrapa Meio Ambiente em Jaguariúna-SP conforme metodologia específica. Os dados obtidos nas avaliações foram submetidos à análise de variância, análise de similaridade pelo método hierárquico do vizinho mais próximo e análise de componentes principais. A maior porcentagem de germinação (98,67%) foi obtida pelos acessos BTC5, SAP1 e SBS2. Foram selecionados como fonte de resistência ao mofo cinzento da mamoneira, os acessos SM2, SAP4, SM1, SBS2, SJC2, BOIT1, CBJ1, BOF2, BTC5 e CJ4. O acesso BOC1 foi considerado o mais divergente. Os acessos SM2, SM1, SBS2, CJ4, BTC4, CJ3, CJ1, CBJ1, CJ6, SAP2, SAP1 e SAP4 possuem características agromorfológicas de interesse comercial e são promissores para constituírem uma coleção de germoplasma em programas de melhoramento genético da mamoneira. / Castor bean (Ricinus communis L.) is an an Euphorbiaceae family oilseed that has spread to various regions of the world due to its easy propagation and adaptation. Brazil is the second largest castor oil supplier, the main product traded in the international market. Plant breeding to generate cultivars and hybrids more productive, resistant to diseases, allowing the use of mechanization of castor bean can drive this crop for the economic success, generating producer's profit. Our aim was to perform the agro-morphological characterization, evaluate genetic divergence and gray mold reaction of 58 accessions of castor bean collected in different regions of Brazil. A wild castor bean seed bank was created through collections in several São Paulo State regions, South of Minas Gerais and in the capital of Rio Grande do Norte. Processing and preliminary tests (vigor, germination and oil content) were performed at the Department of Productivity and Plant Breeding from Faculty of Agronomic Sciences (FCA) in Botucatu, SP, Brazil. Preselected accessions were sown and characterized by 31 morphological descriptors. Castor bean racemes were tested to gray mold reaction and resistance in the Laboratory of Entomology and Phytopathology, Embrapa Meio Ambiente in Jaguariúna-SP, Brazil. Variance analysis, similarity by the nearest neighbor hierarchical method and principal components analysis was performed on all data obtained. BTC5, SAP1 and SBS2 showed the highest germination percentage (98.67%). SM2, SAP4, SM1, SBS2, SJC2, BOIT1, CBJ1, BOF2, BTC5 and CJ4 were selected as the resistance source of the castor bean gray mold while BOC1 was the most divergent. SM2, SM1, SBS2, CJ4, BJC4, CJ3, CJ1, CBJ1, CJ6, SAP2, SAP1 and SAP4 have agro-morphological characteristics of commercial interest and they are promising to constitute a germplasm collection in castor bean breeding programs.

Discerning the basis of phenotypic and genotypic differences within and between taxa is crucial for understanding the evolution of species, subspecies or varieties and races. In this dissertation, I have presented three studies, which use morphological characters and genetic Amplified Fragment Length Polymorphisms (AFLPs) to differentiate cytotypes, populations and species of the genus Xanthisma. The first study is aimed at clarifying the species status of Haplopappus ravenii, which has been considered to be a separate species by some taxonomists and a race of Xanthisma gracile by other researchers. Considering the morphological species concept and the genotypic cluster definition of a species, there was insufficient distinction in either dataset to support these taxa as distinct species. It was found that H. ravenii is more appropriately classified as a a cytotype or a race of X. gracile. In the second study, the genetic structure of X. gracile was quantified across populations occupying distinct habitat types (desert, grasslands, and pinyon juniper woodlands) in order to test the hypothesis of local adaptation and to determine the potential for intraspecific divergence. Samples from desert habitats showed higher genetic divergence than samples in the other two habitats. This study is indicative of local adaptation of populations and that changes in climate and habitat play a very important role in the genetic differentiation of plant systems. The third study evaluated the taxonomy of Xanthisma spinulosum and three of its subspecies that co-occur in Arizona. Herbarium specimens representative of the three subspecies were used to test for significant morphological and genetic divergence that would support their recognition. The morphological characters originally utilized by taxonomists who named these taxa were not significantly different among the three taxa. This finding was further supported by the molecular data, suggesting the presence of one contiguous species. This dissertation aims at stressing the importance of taxonomic status and understanding the role that environment can play on shaping differentiation between taxa.

Thesis (MSc (Botany and Zoology))--University of Stellenbosch, 2010. / ENGLISH ABSTRACT: It is thought that a large proportion of the great variety of floral structures in flowering plants reflect adaptations to different biotic pollen vectors. Divergence in flower traits and pollinators is linked to speciation. Pollinator-driven speciation is thought to have played a large role in the spectacular floral diversity found in South African Iridaceae and the genus Tritoniopsis is a particularly good example of this. This study focuses on Tritoniopsis revoluta, a pink irid occurring in the Swartberg and Langeberg Mountains, as well as Potberg Mountain. I tested the hypothesis that variation in flower tube-lengths of Tritoniopsis revoluta are related to the geographic distribution of pollinators and the variation of their tongue lengths. It was determined that this species is highly variable in respect to corolla tube-length and is pollinated by different fly species across its range. Also, the tongue-lengths of the fly pollinators corresponded almost exactly with the tube-length of the flowers they were pollinating in each population. In some populations, where long-proboscid flies were absent, bees were observed visiting T. revoluta flowers. This presents evidence for pollinator-driven floral variation within a single plant species, and most of this vast diversification in floral morphology has probably been driven by morphological variation found within a single fly family. In one population I found variable tube-lengths which appeared to exhibit a bimodal distribution of corolla tubelengths. I hypothesized that the two Tritoniopsis revoluta ecotypes at this population are pollinated by two different pollinators, leading to assortative mating, and ultimately strong inter-ecotype incompatibility. Tritoniopsis revoluta is self-incompatible and exists as two discrete entities (morphotypes) at the Gysmanshoek Pass site, and these entities differ in tubelength, color, nectar volume and sugar content. These morphotypes were not pollinated by long-proboscid flies, but seems to represent a recent shift to pollination by Amegilla bees. However, ecotypes are not reproductively isolated as short and long flowers can produce offspring, rather tube-length differences are possibly maintained through spatial separation. To compliment the correlatory data between flower tube-lengths and pollinator tongue-lengths, I used molecular tools (chloroplast markers and AFLPs) to elucidate the patterns of tube-length evolution in Tritoniopsis revoluta. I aimed to determine the directionality and frequency of transitions between tube-length categories. Tube-length transitions would be suggestive of flower morphology being labile, and together with the tube-tongue length correlation it suggests pollinator shifts may drive the changes in tube length. Character state reconstructions using tube-length as character determined that four evolutionary transitions to shorter tube-length categories and two transitions to longer categories occurred. I also tested whether morphological divergence between populations corresponds to patterns of divergence from neutral genetic markers. Population genetic structure in this system showed that the different populations of T. revoluta are vicariant and tube-length differences between them could have evolved through selection. / AFRIKAANSE OPSOMMING: Dit is ‘n algemene gedagte dat die groot verskeidenheid blom strukture in die angiosperme dui op aanpassings tot verskillende biotiese stuifmeel draers. Die diverse blom strukture in baie van die groot Kaapse genera kan verduidelik word deur aanpassings tot veranderinge in bestuiwings-sisteme. ‘n Aantal studies hieroor stel voor dat bestuiwers nie net die veranderinge in blom morfologie bewerkstellig nie, maar ook ‘n rol speel in die aanpassende uiteenlopendheid van blomplant kenmerke. Spesiasie bewerkstellig deur bestuiwers het moontlik ‘n groot rol gespeel in die blom-diversiteit wat gevind word in die Suid-Afrikaanse Iridaceae familie, en die genus Tritoniopsis is ‘n baie goeie voorbeeld hiervan. Hierdie studie fokus spesifiek op Tritoniopsis revoluta, ‘n pienk iris wat voorkom in die Swart- en Langeberge, asook by Potberg. Die hipotese dat die variasie in buis-lengtes van T. revoluta verwant is aan die geografiese verspreiding van bestuiwers en die variasie in hul tong-lengtes is hier getoets. Dit is bepaal dat hierdie spesie groot variasie toon in terme van buis-lengtes en bestuif word deur verskillende vlieg spesies regoor sy verspreiding. Die tong-lengtes van hierdie vlieë korrespondeer ook met die buis-lengtes van die blomme wat hul bestuif in elkeen van die T. revoluta populasies. In sommige van die populasies, waar lang-tong vlieë afwesig was, is bye wat die T. revoluta blomme besoek, opgemerk. Hierdie resultate lewer bewyse vir die hipotese dat bestuiwers blom morfologie kan beïnvloed; die interessante hiervan is dat die variasie in buis-lengtes in hierdie spesie heel moontlik te danke is aan die morfologies variasie wat gevind word in ‘n enkele lang-tong vlieg familie. In een van die populasies het ek ‘n bimodale verspreiding van buis-lengtes gevind. ‘n Logiese afleiding is dat hierdie twee verskillende buislengtes – ekotipes – deur twee verskillende bestuiwers besoek word, en dat dit lei tot sterk onversoenbaarheid tussen ekotipes. Tritoniopsis revoluta is nie instaat tot self-bestuiwing nie en die twee ekotipes verskil in terme van buis-lengtes, kleur, nektar volume en suiker inhoud. Kort- en lang-buis blomme word nie eksklusief bestuif deur lang-tong vlieë in die Gysmanshoek Pas nie, maar word in die algemeen ook bestuif deur bye van die genus Amegilla. Die twee ekotipes is in staat om te reproduseer met mekaar, so die buis-lengte verskille word moontlik in stand gehou deur hul geografiese skeiding. Om die korrelasie analise tussen blom buislengtes en vlieg tong-lengtes te komplimenteer, het ek molekulêre tegnieke (chloroplast merkers en AFLPs) gebruik om die patrone van buis-lengte evolusie in Tritoniopsis revoluta duidelik te maak. Ten eerste het ek bepaal of verkortings en verlengings van buis-lengtes een keer in die verlede gebeur het, of as meermalige gebeurtenisse. Meermalige veranderinge in buis-lengtes kan moontlik dui op verskuiwings tussen verskillende bestuiwers, asook taksonomiese verdelings wat korrespondeer met bestuiwer veranderinge. Ek het ook bepaal of die buis-lengte verskille in die verskillende populasies toegeskryf kan word aan seleksie prosesse. Deur buis-lengte as karakter te gebruik, het ek karakter-status rekonstruksies gedoen en bepaal dat vier ewolutionêre transisies na korter buis-lengte kategorieë, en twee transisies na langer kategorieë plaasgevind het. Populasie genetiese struktuur in die sisteem dui daarop dat T. revoluta populasies geïsoleer is deur afstand. Die konklusie wat ek trek gebasseer op hierdie resultate is dat verskille in buis-lengtes in hierdie sisteem moontlik ontstaan het as gevolg van die verskillende bestuiwers wat aktief is in die verskillende T. revoluta populasies, en dat natuurlike prosesse nie die hoofrol spelers in hierdie sisteem is ten opsigte van buis-lengte evolusie nie.

Resumo: O objetivo do presente trabalho foi caracterizar a morfologia de frutos, sementes e desenvolvimento pós-seminal e estudar a divergência genética entre árvores matrizes de Carapa guianensis Aublet., em duas populações naturais no Amapá, uma em Mazagão e outra em Macapá, por meio de caracteres biométricos de frutos e sementes, processo germinativo, desenvolvimento inicial de plântulas e teor de óleo. Na descrição morfológica utilizou-se estereomicroscópio para observação das características externas dos frutos, sementes e plântulas nas diversas fases de desenvolvimento pós-seminal. A divergência genética foi avaliada pela análise de agrupamento, através do algoritmo de Tocher e do método UPGMA (Unweighted Pair Group Using an Arithmetic Average), obtido a partir da matriz de dissimilaridade pela Distância Euclidiana. Para verificação da importância relativa de cada variável para a divergência genética utilizou-se a análise de Componentes Principais. Os frutos de C. guianensis são cápsulas septífragas, secas, deiscentes, pluriloculares, polispérmicas e subglobosas. As sementes são grandes, angulosas e convexas na região dorsal. A germinação é do tipo hipógea-criptocotiledonar e as plântulas apresentam metáfilos paripinados, hipocótilo pequeno, epicótilo glabro, sublenhoso, com duas a seis gemas axilares protegidas por catáfilos. Nos dois métodos de agrupamento as 25 árvores matrizes foram distribuídas em cinco e seis grupos, respectivamente, em Mazagão e Macapá. Oito (50%) e 12 (75%) dos 16 caracteres avaliados, repectivamente, em Mazagão e Macapá, foram considerados de pequena importância para a divergência. Dos caracteres mais importantes para a divergência, a massa de sementes, a largura de frutos e o teor de óleo foram comuns nas duas localidades. Há grande variabilidade entre as árvores matrizes de C. guianensis ...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of the work was the morphological characterization of the fruits, the seeds, the post-seminal development and to evaluate the genetic divergence among mothers trees of Carapa guianensis of two natural populations located in Amapá, one in Mazagão and another in Macapá, through biometric traits of fruits and seeds, oil production, germination process and formation of the seedlings. To morphological description, the external characteristics of the fruits, the seeds and the seedlings in various stages of postseminal development were observed in a stereomicroscopy. The genetic divergence was evaluated using clusters analysis, by the algorithm of Tocher and method of UPGMA (Unweighted Pair Group Using an Arithmetic Average), obtained by the Euclidian Distance. To verify the relative importance of each variable for divergence was applied the analysis of Principal Components. The fruit of C. guianensis is a septicidal capsule, drought, dehiscent, plurilocular, polyspermic and subglobose. The seeds are large, angulate and convex in the back. The germination is hypogeal cryptocotilar and the seedlings have pinnate metaphylls, small hipocotyl, glabrous epicotyl, subwoody, with two or six axillary buds protected by cataphylls. In clusters analysis the 25 mother trees were distributed in five and six groups, respectively, in Mazagão and Macapá. Eight (50%) in Mazagão and 12 (50%) in Macapá of 16 characters evaluated were considered of presented lower importance for genetic divergence. The more important characters to the study of genetic divergence were the fresh mass of the seeds, fruit width and oil content, common in both locations. The great variability among mother trees of C. guianensis and the genetic divergence studies can xvii possibility the identification of mother trees to seed collection for use in conservation and improvement programs. / Orientador: Rinaldo Cesar de Paula / Coorientadora: Fabíola Vitti Môro / Coorientador: Fabiano Cesarino / Banca: Miguel Luiz Menezes Freitas / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Mestre

Existem poucas informações relacionadas com a comparação de populações de soja derivadas de cruzamentos com diferentes níveis de divergência genética (DG). Os objetivos deste trabalho foram comparar o desempenho de duas populações de soja derivadas de genitores com baixa e alta DG. Foram realizados dois cruzamentos com genitores diferindo quanto à divergência genética baseada em marcadores moleculares AFLP: baixa DG (IAC-12 x IAC-100) e alta DG (EMBRAPA-60 x EMGOPA-315). Para cada cruzamento foram obtidas 100 progênies F2:3, que foram avaliadas experimentalmente em três ambientes e, posteriormente, selecionadas as 25 progênies mais produtivas. Em seguida foram obtidas 10 linhas puras F5:7 de cada uma das 25 progênies, originando aproximadamente 250 linha puras de cada cruzamento. No ano agrícola 2012/13 foram conduzidos os experimentos de avaliação, utilizando um delineamento em parcelas subdivididas, onde as progênies foram alocadas nas parcelas e as linhas puras dentro de progênies nas subparcelas, e as parcelas arranjadas em um látice balanceado 5x5 (seis repetições). As subparcelas foram constituídas de linhas de 2 m, espaçadas de 0,5 m, contendo 30 plantas após o desbaste. Os caracteres avaliados foram: número de dias para a maturação (DM), altura das plantas na maturação (AM), acamamento (AC) e produção de grãos (PG). A partir da análise de variância foram estimados os seguintes parâmetros para cada cruzamento: média geral, amplitude de variação das médias das linhas puras dentro de progênies, variância genética entre linhas puras dentro de progênies (?^2l/p ), variância fenotípica entre médias de linhas puras dentro de progênies (?^2/ F (l/p) ), coeficiente de herdabilidade entre médias de linhas puras (h ^2/X(l/p) ) e resposta esperada com seleção (Rs). Para todos os caracteres, as médias gerais foram maiores para o cruzamento de maior DG. Para PG, AM e DM as estimativas das variâncias genéticas entre linhas puras dentro de progênies F5:7 foram maiores no cruzamento de maior DG, bem como as amplitudes de variação das médias das linhas puras. Consequentemente, a resposta esperada com seleção entre médias de linhas puras dentro de progênies para PG foi 47,6% maior, em média, bem como a proporção de linhas puras de alta produção, para o cruzamento de maior DG. Os resultados deste trabalho indicam que o uso das medidas de divergência baseada em marcadores moleculares AFLP na escolha de genitores para cruzamentos pode ser uma ferramenta útil para reduzir o número de cruzamentos e, consequentemente, aumentar a eficiência da seleção para produção de grãos em soja. / There is limited information in relation to comparison of populations derived from crosses with different levels of genetic divergence (DG) in soybeans. This work was carried out to compare the performance of two soybean populations derived from parents with low and high DG. From two two-way crosses of soybeans with different levels of AFLP molecular marker genetic divergence (DG): low DG (IAC-12 x IAC-100) and high DG (EMBRAPA-60 x EMGOPA-315), one hundred F2:3 progenies were evaluated in three environments and then selected the 25 high yielding progenies. Ten inbred lines were derived in the generation F5:7 from each of 25 high yielding progeny giving rise to approximately 250 inbred lines for each cross. Evaluation trials were carried out in the 2012/13 growing season, using a split plot design, where progenies were allocated in the plots and inbred lines within progenies in the subplots, and plots arranged according to a 5x5 balanced lattice (six replications). Subplots consisted of 2 m rows spaced by 0.5 m, with 30 plants after thinning. The following traits were recorded: number of days to maturity (DM), plant height at maturity (AM), lodging (AC) and grain yield (PG). The following parameters were estimated: general mean, amplitude of variation of inbred lines within progenies means, genetic variance of inbred lines within progenies ( ?^2 l/p ), phenotypic variance on inbred lines within progenies mean basis ( ?^ 2 F(l/p) ), heritability coefficients on inbred line mean basis ( h ^2 X(l/p) ) and expected response to selection (Rs) on inbred line mean basis. For all traits, general means were higher for the high DG cross. For PG, AM and DM, genetic variance among inbred lines within F5:7 progenies were higher for the high DG cross, as well as the amplitude of variation of inbred line means. As a result, expected response to selection for grain yield (PG) was 47.6% higher, on average, as well as the proportion of high yielding inbred lines for the high DG cross. General results indicate that the use of genetically divergent parents based on AFLP molecular markers for choosing parents for crossings can be useful to reduce the number of crossings, and thus, to improve the efficiency of selection for grain yield in soybeans.

O caranguejo de água doce Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 apresenta uma considerável variabilidade morfológica, aliada a uma ampla distribuição geográfica e ocupação de ambientes costeiros e continentais. Tal variabilidade tem gerado, em alguns casos, dúvidas quanto à delimitação da espécie. O presente trabalho tem como objetivo averiguar se as populações de T. fluviatilis apresentam divergências morfológicas e genéticas compatíveis com o nível intraespecífico avaliando-se a hipótese de validade deste táxon. Para isto, foi realizada a análise da variabilidade genética entre as populações e uma revisão taxonômica. O material analisado foi obtido por meio de coletas, visitas e empréstimos de coleções carcinológicas do Brasil. Foram analisados caracteres descritos na literatura e obtidas sequências parciais dos genes mitocondriais 16S rRNA e citocromo c oxidase subunidade I (COI). Dentre os caracteres morfológicos analisados alguns tiveram muita variação, enquanto outros se mostraram bem informativos para alguns grupos. O resultado da análise molecular mostrou a formação de clados internos com altas divergências genéticas entre eles, tanto para o gene 16S quanto para o COI. Além disso, a espécie T. petropolitanus foi alocada entre os clados reconhecidos morfologicamente como T. fluviatilis. Tais estruturações genéticas, aliada ao polimorfismo morfológico, mostraram claramente que a espécie reconhecida morfologicamente como T. fluviatilis não forma um grupo monofilético, podendo ser considerada um complexo de espécies, que precisa de ajustes taxonômicos consideráveis. / The freshwater crab Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 presents a considerable morphological variability, as well as a wide geographical distribution and occupancy of coastal and continental environments. Such variability has generated, in some cases, doubts concerning the species delimitation. The present work aims to investigate whether the populations of T. fluviatilis exhibit morphological and genetic divergence compatible with the intraspecific level, assessing the hypothesis of validity of this taxon. Therefore, we have performed the analysis of genetic variability among populations and a taxonomic revision. The material analyzed was obtained from field expeditions, visits and loans from carcinological collections. We analyzed morphological characters described in the literature as well as obtained partial sequences of the 16S rRNA and cytochrome c oxidase subunit I (COI) mitochondrial genes. Some morphological characters analyzed had a wide variation, while others were well informative for some groups. The results of molecular analysis showed the formation of internal clades with high genetic divergence among them, both for 16S and COI. Moreover, the species T. petropolitanus was allocated among clades recognized morphologically as T. fluviatilis. Such genetic structuration and morphological polymorphism clearly indicate that the species morphologically recognized as T. fluviatilis does not form a monophyletic group. Therefore, it must be considered as a species complex, which claims for huge taxonomic adjustments.

Resumo: A variabilidade genética é um dos fatores mais importantes para o melhoramento de plantas, a partir do qual será conduzido todo o processo seletivo. Essa variabilidade pode ser ampliada através da utilização de cruzamentos múltiplos e melhor explorada sob diferentes métodos de condução das populações segregantes. O objetivo do presente trabalho foi detectar variabilidade através de estimativas de parâmetros genéticos em genótipos derivados do avanço de gerações por três diferentes métodos de condução: Single Seed Descent (SSD), Single Pod Descent (SPD) e Genealógico (Pedigree). O experimento foi conduzido em casa de vegetação climatizada e na área experimental do Departamento de Produção Vegetal da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Unesp-Jaboticabal. O delineamento utilizado foi o de blocos aumentados, onde foram avaliados 324 genótipos de soja na geração F7 previamente desenvolvidos no Programa de Melhoramento de Soja da FCAV/UNESP, oriundos de cruzamentos biparentais, quádruplos e óctuplos. Foram obtidas estimativas de variâncias, herdabilidades e ganhos genéticos para os três tipos de cruzamentos nos três métodos. Pela análise de divergência foram agrupados os genótipos mais similares para cada método. Os métodos SSD e SPD foram os mais promissores para aumentos de variabilidade nos três tipos de cruzamentos. O método genealógico promoveu as maiores estimativas de herdabilidade e os maiores ganhos genéticos. Os genótipos de cruzamentos quádruplos foram os que mais se agruparam / Abstract: Genetic variability is one of the most important factors for plant breeding, which lead the selective process. This variability can be enlarged by multiple crosses and explored under different breeding methods on segregate populations. Thus, the aim of this work was to detect variability using genetic parameters estimates in genotypes obtained by different methods: Single Seed Descent (SSD), Single Pod Descent (SPD) e Pedigree. The experiment was conducted in a greenhouse, under controlled conditions, and in the experimental field of Crop Production Department at Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Unesp-Jaboticabal. Augmented blocks was used as the experimental design. 324 soybean genotypes in generation F7 from FCAV Soybean Breeding Program, derived from 2-way, 4-way and 8-way crosses, were evaluated. Variance, heritability and genetic gains estimates were obtained for the three types of crosses on three methods. By divergence analysis, most similar genotypes were grouped for each method. SSD and SPD methods were the most promising for variability increases. Pedigree method has promoted the higher estimates for heritability and genetic gains. Genotypes from four-way crosses were highly grouped / Orientadora: Maria Aparecida Pessôa da Cruz Centurion / Coorientador: Marcelo Marchi Costa / Banca: João Carlos de Oliveira / Banca: Ivana Marino Bárbaro / Mestre

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 StefesonBM_TESE.pdf: 501527 bytes, checksum: 94d141004aa016dc604cc1543577c5ee (MD5) Previous issue date: 2015-03-20 / Melon (Cucumis melo L.) is a species economic importance to Brazilian northeast, especially in Mossoró-Assú agropolo. The study of genetic diversity allows in the preliminary selection of individuals with superior characteristics to produce hybrids with the high heterotic in breeding programs. The objective of this study was to evaluate the genetic divergence among 46 melon genotypes for 22 physicochemical and agronomic quantitative variables, evaluated by techniques artificial neural networks. Two experiments were conducted in Horta Experimental Department of Plant Sciences at the Universidade Federal Rural do Semi-Árido - UFERSA in the Mossoró, State of Rio Grande do Norte, in the periods 12/09/2006 to 05/12/2006 and 15/08/2007 to 17/10/2007. Through the techniques of artificial neural networks, was found four groups for both experiments, but also to average of two years. A discriminant analysis was used to check the consistency of groups formed and it was observed that considering the 22 variables, there was 100% hit, that is, for the discriminant function all genotypes were classified correctly. In addition was also observed distances between groups and group 1 was significantly distant from all other groups, more distant, genetically, Group 3. Group 2 are different with respect to group 3 and group similar to 4. The group 3 shows similarity to group 4. And so we suggest possible crosses between accessions 2, 13, 15, 16, 17, 27, 33, 36, 40, 43, 46 that would be most promising for new populations of work. Artificial neural networks have proved viable as a method of analysis of genetic divergence in melon and genetic divergence was found for all groups, and with that you can get new crossings in order to obtain improved populations / O meloeiro (Cucumis melo L.) é uma espécie de grande importância econômica para o nordeste brasileiro, em especial no agropólo Mossoró-Assú. O estudo da divergência genética possibilita uma seleção preliminar de indivíduos com características superiores para obtenção de híbridos com maior efeito heterótico para serem introduzidos em programas de melhoramento genético. O objetivo deste trabalho foi avaliar a divergência genética entre 46 acessos de meloeiro para 22 variáveis quantitativas físico-químicas e morfoagronômicas, avaliados por meio da aplicação das técnicas de Redes Neurais Artificiais. Foram conduzidos dois experimentos na Horta Experimental do Departamento de Ciências Vegetais da Universidade Federal Rural do Semi-árido - UFERSA, no município de Mossoró, Estado do Rio do Grande do Norte, nos períodos de 12/09/2006 a 5/12/2006 e de 15/08/2007 a 17/10/2007. Por meio das técnicas de Redes Neurais Artificiais, verificou-se a formação de quatro grupos para ambos os experimentos, como também para a média dos dois anos. Analisando os grupos constituídos das médias de 2006 e 2007. Em todos os grupos as variáveis do fruto foram as que obtiveram as maiores dispersões. Uma análise de discriminante foi utilizada para verificar a consistência dos grupos formados e observou-se que considerando as 22 variáveis houve 100% de acerto, isto é, para a função discriminante todos os acessos foram classificados corretamente. Adicionalmente também foi observada as distâncias entres os grupos, e o grupo 1 foi significativamente distante de todos os outros grupos, porém mais distante, geneticamente, do grupo 3. O grupo 2 é divergente em relação ao grupo 3 e similar ao grupo 4. O grupo 3 apresenta similaridade em relação ao grupo 4. E desta forma sugerimos possíveis cruzamentos entre os acessos 2, 13, 15, 16, 17, 27, 33, 36, 40, 43, 46 que seriam os mais promissores para novas populações de trabalho. As redes neurais artificiais se mostraram viáveis como método da análise da divergência genética no meloeiro e foi encontrada divergência genética para todos os grupos estudados, e com isso pode-se obter novos cruzamentos com o intuito de obter populações melhoradas

Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2017-03-20T12:38:16Z No. of bitstreams: 1 PDF - Silmara Chaves de Souza.pdf: 14719856 bytes, checksum: 942ba44676fe8c8a24488354c5e17317 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2017-03-22T15:19:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Silmara Chaves de Souza.pdf: 14719856 bytes, checksum: 942ba44676fe8c8a24488354c5e17317 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-22T15:19:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Silmara Chaves de Souza.pdf: 14719856 bytes, checksum: 942ba44676fe8c8a24488354c5e17317 (MD5) Previous issue date: 2017-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Knowledge of the genetic diversity available in the sisal germplasm collection is essential for breeding programs, so it is imperative to obtain as much information as the characteristics related to the species. Morphoagronomic and molecular data when analyzed mainly together are determinants for studies of genetic divergence between accessions. The objective of this study was to evaluate the genetic divergence present in the Agave accessions of the Embrapa Cotton Germplasm Active Collection by means of morphoagronomic and molecular data. Thirty-seven Agave accessions were kept in the experimental field in Monteiro-PB and the following characteristics were evaluated: leaf number (NFO), plant height (ALT), leaf length (CFO), leaf weight , Dry weight (PFIF), dry fiber weight (PFIS), fiber length (CFI), presence of border spikes (PEB), tillering (PF) and resistance to folding (DR). Ten ISSR (Inter Sample Sequence Repeat) oligonucleotides were used for molecular analyzes. The data were interpreted as qualiquantitative for the morphoagronomic and qualitative binary characters for the molecular markers. The agronomic data were submitted to analysis of variance and the means comparison was done by the Scott-Knott test at 5% probability. The dissimilarity measurements were obtained by Gower distance for the morphoagronomic data and by the Jaccard coefficient for the molecular data. The sum of the matrices of dissimilarity of the morphoagronomic and molecular data was made; and the grouping was done by the hierarchical UPGMA method and Tocher optimization. The agronomic characteristics presented high genetic variability among the sisal accessions. IAC accesses were the ones that presented the least distance between them, indicating a possible narrow genetic base and high degree of kinship. Hybrids Kenya and RN as the most similar accesses and the access Tatuí 2 the most divergent, being indicated for possible crossings. The results obtained in this study will support the crop improvement program, which may allow the appearance of superior materials. / O conhecimento da diversidade genética disponível na coleção de germoplasma de sisal é fundamental para os programas de melhoramento, para tanto é imprescindível se obter o máximo de informações quanto às características relacionadas à espécie. Dados morfoagronômicos e moleculares quando analisados principalmente em conjunto são determinantes para estudos de divergência genética entre acessos. Objetivou-se, com este trabalho, avaliar a divergência genética presente nos acessos de Agave da Coleção Ativa de Germoplasma da Embrapa Algodão por meio de dados morfoagronômicos e moleculares. Trinta e sete acessos de Agave são mantidos no campo experimental em Monteiro-PB e foram avaliadas quanto as seguintes características: número de folhas (NFO), altura da planta (ALT), comprimento de folha (CFO), peso da folha (PFO), peso da mucilagem fresca (PMF), peso da mucilagem seca (PMS), peso da fibra fresca (PFIF), peso da fibra seca (PFIS), comprimento da fibra (CFI), presença de espinhos nas bordas (PEB), perfilhamento (PF) e resistência ao dobramento (RD). Dez oligonucleotídeos ISSR (Inter Sample Sequence Repeat) foram utilizados para as análises moleculares. Os dados foram interpretados como qualiquantitativos para os caracteres morfoagronômicos e qualitativos binários para os marcadores moleculares. Os dados agronômicos foram submetidos à análise de variância e a comparação de médias foi feita pelo teste de Scott-Knott a 5% de probabilidade. As medidas de dissimilaridade foram obtidas por meio da distância de Gower para os dados morfoagronômicos e pelo coeficiente de Jaccard para os dados moleculares. Foi feita a soma das matrizes de dissimilaridade dos dados morfoagronômicos e moleculares; e o agrupamento foi feito pelo método hierárquico UPGMA e de otimização de Tocher. As características agronômicas apresentaram elevada variabilidade genética entre os acessos de sisal. Os acessos IAC foram os que apresentaram menor distância entre si, indicando possível base genética estreita e alto grau de parentesco. Os Híbridos Quênia e RN como os acessos mais similares e o acesso Tatuí 2 o mais divergente, sendo indicados para possíveis cruzamentos. Os resultados obtidos neste estudo darão suporte ao programa de melhoramento da cultura, podendo possibilitar o aparecimento de materiais superiores.