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Composição específica e distribuição da fauna de caranguejos de água doce (Crustacea: Decapoda: Brachyura) no estado de Roraima, Brasil

Costa , Francinéia Zanetti da 03 March 2016 (has links)
Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-06-21T18:27:39Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Finalizada Francinéia Zanetti da Costa.pdf: 3094928 bytes, checksum: 53f240dc2910dbac73cbae6740903604 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T18:27:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Finalizada Francinéia Zanetti da Costa.pdf: 3094928 bytes, checksum: 53f240dc2910dbac73cbae6740903604 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-03 / Instituto de Amparo a Ciência, Tecnologia e Inovação de Roraima - IACTI-RR / The state of Roraima is drained in almost its entire surface by the watershed of the Branco River. This drainage has diverse aquatic habitats still poorly known from the scientific point of view. This study aimed to survey the specific composition and geographical distribution of freshwater crab fauna from Roraima. The survey was based on specimens deposited in the crustacean collections of the Museu Integrado de Roraima (MIRR), Boa Vista, and the Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Manaus. In addition, samples were taken in ten municipalities (Amajari, Bonfim, Cantá, Caracaraí, Caroebe, Normandia, Pacaraima, São Luiz do Anauá, São João da Baliza, and Rorainópolis) covering regions of “Lavrado”, forests, flooded forests and upland areas and low elevations. The collection of crabs was performed using dip net with 1 mm mesh, sampling all habitats of the streams, such as the submerged litter, aquatic vegetation, edges of ravines, hollows of submerged tree truncks, trying to cover all microhabitats possibly occupied by crabs. Traps were also used (locally known as "Covo"), with dead bait and commercial cat food. A total of eleven species of crabs were recorded from Roraima: four of Trichodactylidae: Moreirocarcinus laevifrons, Poppiana dentata, Sylviocarcinus pictus and Valdivia serrata; and seven of Pseudothelphusidae: Fredius beccarii, Fredius estevisi, Fredius fittkaui, Fredius platyacanthus, Fredius stenolobus, Kingsleya ytupora and Kingsleya latifrons. Additionally, identification keys are provided to families, genera and species, as well as geographic distribution maps for each species. Among these, Moreirocarcinus laevifrons, Fredius beccarii, Fredius fittkaui, and Kingsleya ytupora are recorded for the first time in Roraima; additionally, Fredius beccarii is recorded for the first time from Brazil. / O estado de Roraima é banhado em quase toda a sua superfície pela bacia hidrográfica do rio Branco, a qual apresenta uma diversidade de habitats aquáticos ainda pouco conhecida do ponto de vista científico. Esse trabalho teve como objetivo realizar o levantamento da composição específica e da distribuição geográfica da fauna de caranguejos de água doce em Roraima. O levantamento teve como base os espécimes depositados no acervo carcinológico das coleções do Museu Integrado de Roraima (MIRR), Boa Vista, e do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Manaus. Além disso, foram realizadas coletas em dez municípios (Amajari, Bonfim, Cantá, Caracaraí, Caroebe, Normandia, Pacaraima, São Luiz do Anauá, São João da Baliza e Rorainópolis), abrangendo regiões de lavrado, florestas, florestas alagadas e áreas de altas e baixas elevações. Para a captura dos caranguejos foi utilizado puçá, com 1 mm de malha, percorrendo trechos dos igarapés, amostrando principalmente a serapilheira submersa, vegetação aquática, margens das barrancas, tocos de paus submersos, procurando-se abranger todos os microhabitats eventualmente ocupados pelos caranguejos. Foram utilizadas ainda armadilhas de espera, tipo “covo”, com isca morta e ração comercial para gatos. Foi registrado um total de onze espécies de caranguejos em Roraima, sendo quatro da família Trichodactylidae: Moreirocarcinus laevifrons, Poppiana dentata, Sylviocarcinus pictus e Valdivia serrata, e sete da família Pseudothelphusidae: Fredius beccarii, Fredius estevisi, Fredius fittkaui, Fredius platyacanthus, Fredius stenolobus, Kingsleya ytupora e Kingsleya latifrons. Adicionalmente, são fornecidas chaves de identificação para as famílias, gêneros e espécies, assim como os dados e mapas de distribuição geográfica para cada espécie. Dentre as espécies encontradas, Moreirocarcinus laevifrons, Fredius beccarii, Fredius fittkaui e Kingsleya ytupora são registradas pela primeira vez em Roraima; além disso, Fredius beccarii é registrada pela primeira vez para o Brasil.
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Dinâmica populacional do caranguejo dulcícola Dilocarcinus pagei Stimpson, 1861 (Brachyura, Trichodactylidae), na represa da Usina Hidrelétrica de Furnas/Marimbondo, Icém, SP

Davanso, Thiago Maia [UNESP] 24 February 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-24Bitstream added on 2014-06-13T21:00:34Z : No. of bitstreams: 1 davanso_tm_me_botib.pdf: 1534994 bytes, checksum: 04b1389988efb58bd1dab049208a8c7f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A dinâmica populacional de Dilocarcinus pagei foi investigada enfocando os seguintes aspectos: maturidade sexual morfológica, maturidade gonadal, proporção sexual, período reprodutivo e recrutamento. Os animais foram coletados mensalmente, com a utilização de peneiras e/ou manualmente no período de outubro/05 a setembro/07, na represa da Usina Hidrelétrica de Furnas/Marimbondo, município de Icém, região noroeste do Estado de São Paulo (20°19’40,0”S e 49°10’18,1”N). A maturidade sexual morfológica foi calculada empregando-se o estudo do crescimento relativo e a maturidade gonadal por meio do LC50. A proporção sexual foi investigada tanto mensalmente como no número de indivíduos distribuídos por classes de tamanho (χ 2=2,261E-05; χ 2=2,26071E-05). Para os períodos reprodutivo e de recrutamento, as fêmeas denominadas maduras (gônadas desenvolvidas, fêmeas ovígeras e com juvenis) e os juvenis foram analisados mensalmente e associados aos fatores ambientais monitorados. Um total de 1.000 indivíduos foram obtidos, sendo 567 machos e 433 fêmeas. Destas, 4 eram ovígeras (FO) e 35 portavam juvenis (FF). Dentre as relações biométricas utilizadas para determinação da maturidade sexual morfológica, a mais significativa para os machos foi entre a largura da carapaça (LC) e o comprimento do própodo do quelípodo (CP), enquanto que em fêmeas foi entre LC e a largura do abdome (LA). A partir destas, estimou-se o valor de 28,7mm para os machos e 24,2mm para as fêmeas. Os valores de LC50 (mm), apesar de próximos, mostraram um maior tamanho para as fêmeas, sendo 39,2mm para os machos e 39,9mm para as fêmeas. Esta diferença, provavelmente, está relacionada à uma estratégia reprodutiva das fêmeas em aumentar a quantidade de ovócitos maduros armazenados na cavidade cefalotorácica. A proporção sexual diferenciada para os meses e, para as classes de tamanho... / The population dynamics of Dilocarcinus pagei was investigated focusing the following aspects: morphological sexual maturity, gonadal maturity, sex ratio, reproductive and recruitment period. The animals were collected monthly, using seive and/or manually during the period from October 5 to September 7, in Furnas dam Furnas/Marimbondo Hydroelectric Plant, in the city of Icém, northwest region of the State of São Paulo (20°19’40,0”S e 49°10’18,1”N). Sexual and morphological maturity was calculated using the study of relative growth and gonadal maturity through the CW50. The sex ratio was investigated both monthly and in the number of individuals distributed by size classes (χ 2=2,261E-05; χ 2=2,26071E-05). For reproductive and recruitment periods, females denominated mature (developed gonadas, ovigerous females and with juveniles) and juveniles were analyzed monthly and associated to environmental factors. A total of 1.000 animals were collected, being 567 male and 433 female. Among females, 4 were ovigerous (OF) and 35 carried juveniles (FF). Among biometrical relationships used to determine the morphological sexual maturity, the most significant for the male was between the carapace length (CL) and the cheliped propodus length (CPL), while in the female was between CL and the abdomen length (AL). From these relationships, we estimated the value of 28,7mm for the male, and 24,2mm for the female. The CW50(mm) values, although near, demonstrated a larger size for the female, being 39,2mm for the male, and 39,9mm for the female. This difference probably is related to a reproductive strategy of the female to increase the quantity of mature oocytes storaged in the carapace cavity. The sexual proportion differentiated for months and for size classes can be related to differential growing, mortality index, food restriction, behavior differences, migration, and the usage... (Complete abstract click electronic access below)
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Dinâmica populacional do caranguejo dulcícola Dilocarcinus pagei Stimpson, 1861 (Brachyura, Trichodactylidae), na represa da Usina Hidrelétrica de Furnas/Marimbondo, Icém, SP /

Davanso, Thiago Maia. January 2011 (has links)
Orientador: Rogerio Caetano da Costa / Banca: Adilson Fransozo / Banca: Gustavo Luis Hirose / Resumo: A dinâmica populacional de Dilocarcinus pagei foi investigada enfocando os seguintes aspectos: maturidade sexual morfológica, maturidade gonadal, proporção sexual, período reprodutivo e recrutamento. Os animais foram coletados mensalmente, com a utilização de peneiras e/ou manualmente no período de outubro/05 a setembro/07, na represa da Usina Hidrelétrica de Furnas/Marimbondo, município de Icém, região noroeste do Estado de São Paulo (20°19'40,0"S e 49°10'18,1"N). A maturidade sexual morfológica foi calculada empregando-se o estudo do crescimento relativo e a maturidade gonadal por meio do LC50. A proporção sexual foi investigada tanto mensalmente como no número de indivíduos distribuídos por classes de tamanho (χ 2=2,261E-05; χ 2=2,26071E-05). Para os períodos reprodutivo e de recrutamento, as fêmeas denominadas maduras (gônadas desenvolvidas, fêmeas ovígeras e com juvenis) e os juvenis foram analisados mensalmente e associados aos fatores ambientais monitorados. Um total de 1.000 indivíduos foram obtidos, sendo 567 machos e 433 fêmeas. Destas, 4 eram ovígeras (FO) e 35 portavam juvenis (FF). Dentre as relações biométricas utilizadas para determinação da maturidade sexual morfológica, a mais significativa para os machos foi entre a largura da carapaça (LC) e o comprimento do própodo do quelípodo (CP), enquanto que em fêmeas foi entre LC e a largura do abdome (LA). A partir destas, estimou-se o valor de 28,7mm para os machos e 24,2mm para as fêmeas. Os valores de LC50 (mm), apesar de próximos, mostraram um maior tamanho para as fêmeas, sendo 39,2mm para os machos e 39,9mm para as fêmeas. Esta diferença, provavelmente, está relacionada à uma estratégia reprodutiva das fêmeas em aumentar a quantidade de ovócitos maduros armazenados na cavidade cefalotorácica. A proporção sexual diferenciada para os meses e, para as classes de tamanho... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The population dynamics of Dilocarcinus pagei was investigated focusing the following aspects: morphological sexual maturity, gonadal maturity, sex ratio, reproductive and recruitment period. The animals were collected monthly, using seive and/or manually during the period from October 5 to September 7, in Furnas dam Furnas/Marimbondo Hydroelectric Plant, in the city of Icém, northwest region of the State of São Paulo (20°19'40,0"S e 49°10'18,1"N). Sexual and morphological maturity was calculated using the study of relative growth and gonadal maturity through the CW50. The sex ratio was investigated both monthly and in the number of individuals distributed by size classes (χ 2=2,261E-05; χ 2=2,26071E-05). For reproductive and recruitment periods, females denominated mature (developed gonadas, ovigerous females and with juveniles) and juveniles were analyzed monthly and associated to environmental factors. A total of 1.000 animals were collected, being 567 male and 433 female. Among females, 4 were ovigerous (OF) and 35 carried juveniles (FF). Among biometrical relationships used to determine the morphological sexual maturity, the most significant for the male was between the carapace length (CL) and the cheliped propodus length (CPL), while in the female was between CL and the abdomen length (AL). From these relationships, we estimated the value of 28,7mm for the male, and 24,2mm for the female. The CW50(mm) values, although near, demonstrated a larger size for the female, being 39,2mm for the male, and 39,9mm for the female. This difference probably is related to a reproductive strategy of the female to increase the quantity of mature oocytes storaged in the carapace cavity. The sexual proportion differentiated for months and for size classes can be related to differential growing, mortality index, food restriction, behavior differences, migration, and the usage... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Variabilidade genética e morfológica em populações de Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 (Brachyura, Trichodactylidae) no Brasil / Genetic and morphological variability in populations of Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 (Brachyura, Trichodactylidae) at Brazil.

Carvalho, Edvanda Andrade Souza de 29 October 2013 (has links)
O caranguejo de água doce Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 apresenta uma considerável variabilidade morfológica, aliada a uma ampla distribuição geográfica e ocupação de ambientes costeiros e continentais. Tal variabilidade tem gerado, em alguns casos, dúvidas quanto à delimitação da espécie. O presente trabalho tem como objetivo averiguar se as populações de T. fluviatilis apresentam divergências morfológicas e genéticas compatíveis com o nível intraespecífico avaliando-se a hipótese de validade deste táxon. Para isto, foi realizada a análise da variabilidade genética entre as populações e uma revisão taxonômica. O material analisado foi obtido por meio de coletas, visitas e empréstimos de coleções carcinológicas do Brasil. Foram analisados caracteres descritos na literatura e obtidas sequências parciais dos genes mitocondriais 16S rRNA e citocromo c oxidase subunidade I (COI). Dentre os caracteres morfológicos analisados alguns tiveram muita variação, enquanto outros se mostraram bem informativos para alguns grupos. O resultado da análise molecular mostrou a formação de clados internos com altas divergências genéticas entre eles, tanto para o gene 16S quanto para o COI. Além disso, a espécie T. petropolitanus foi alocada entre os clados reconhecidos morfologicamente como T. fluviatilis. Tais estruturações genéticas, aliada ao polimorfismo morfológico, mostraram claramente que a espécie reconhecida morfologicamente como T. fluviatilis não forma um grupo monofilético, podendo ser considerada um complexo de espécies, que precisa de ajustes taxonômicos consideráveis. / The freshwater crab Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 presents a considerable morphological variability, as well as a wide geographical distribution and occupancy of coastal and continental environments. Such variability has generated, in some cases, doubts concerning the species delimitation. The present work aims to investigate whether the populations of T. fluviatilis exhibit morphological and genetic divergence compatible with the intraspecific level, assessing the hypothesis of validity of this taxon. Therefore, we have performed the analysis of genetic variability among populations and a taxonomic revision. The material analyzed was obtained from field expeditions, visits and loans from carcinological collections. We analyzed morphological characters described in the literature as well as obtained partial sequences of the 16S rRNA and cytochrome c oxidase subunit I (COI) mitochondrial genes. Some morphological characters analyzed had a wide variation, while others were well informative for some groups. The results of molecular analysis showed the formation of internal clades with high genetic divergence among them, both for 16S and COI. Moreover, the species T. petropolitanus was allocated among clades recognized morphologically as T. fluviatilis. Such genetic structuration and morphological polymorphism clearly indicate that the species morphologically recognized as T. fluviatilis does not form a monophyletic group. Therefore, it must be considered as a species complex, which claims for huge taxonomic adjustments.
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Variabilidade genética e morfológica em populações de Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 (Brachyura, Trichodactylidae) no Brasil / Genetic and morphological variability in populations of Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 (Brachyura, Trichodactylidae) at Brazil.

Edvanda Andrade Souza de Carvalho 29 October 2013 (has links)
O caranguejo de água doce Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 apresenta uma considerável variabilidade morfológica, aliada a uma ampla distribuição geográfica e ocupação de ambientes costeiros e continentais. Tal variabilidade tem gerado, em alguns casos, dúvidas quanto à delimitação da espécie. O presente trabalho tem como objetivo averiguar se as populações de T. fluviatilis apresentam divergências morfológicas e genéticas compatíveis com o nível intraespecífico avaliando-se a hipótese de validade deste táxon. Para isto, foi realizada a análise da variabilidade genética entre as populações e uma revisão taxonômica. O material analisado foi obtido por meio de coletas, visitas e empréstimos de coleções carcinológicas do Brasil. Foram analisados caracteres descritos na literatura e obtidas sequências parciais dos genes mitocondriais 16S rRNA e citocromo c oxidase subunidade I (COI). Dentre os caracteres morfológicos analisados alguns tiveram muita variação, enquanto outros se mostraram bem informativos para alguns grupos. O resultado da análise molecular mostrou a formação de clados internos com altas divergências genéticas entre eles, tanto para o gene 16S quanto para o COI. Além disso, a espécie T. petropolitanus foi alocada entre os clados reconhecidos morfologicamente como T. fluviatilis. Tais estruturações genéticas, aliada ao polimorfismo morfológico, mostraram claramente que a espécie reconhecida morfologicamente como T. fluviatilis não forma um grupo monofilético, podendo ser considerada um complexo de espécies, que precisa de ajustes taxonômicos consideráveis. / The freshwater crab Trichodactylus fluviatilis Latreille, 1828 presents a considerable morphological variability, as well as a wide geographical distribution and occupancy of coastal and continental environments. Such variability has generated, in some cases, doubts concerning the species delimitation. The present work aims to investigate whether the populations of T. fluviatilis exhibit morphological and genetic divergence compatible with the intraspecific level, assessing the hypothesis of validity of this taxon. Therefore, we have performed the analysis of genetic variability among populations and a taxonomic revision. The material analyzed was obtained from field expeditions, visits and loans from carcinological collections. We analyzed morphological characters described in the literature as well as obtained partial sequences of the 16S rRNA and cytochrome c oxidase subunit I (COI) mitochondrial genes. Some morphological characters analyzed had a wide variation, while others were well informative for some groups. The results of molecular analysis showed the formation of internal clades with high genetic divergence among them, both for 16S and COI. Moreover, the species T. petropolitanus was allocated among clades recognized morphologically as T. fluviatilis. Such genetic structuration and morphological polymorphism clearly indicate that the species morphologically recognized as T. fluviatilis does not form a monophyletic group. Therefore, it must be considered as a species complex, which claims for huge taxonomic adjustments.
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ISOLAMENTO E CARACTERIZAÇÃO DE MICROSSATÉLITES EM AEGLA LONGIROSTRI (CRUSTACEA, DECAPODA, ANOMURA) / ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF MICROSATELLITE MARKERS FROM Aegla Longirostri (CRUSTACEA, DECAPODA, ANOMURA)

Roratto, Paula Angélica 27 February 2007 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Aeglidae is the only freshwater anomuran family. Fossil evidences relate a marine origin for aeglids. However, genus Aegla invaded the freshwater environment of southern South America, becoming endemic and widespread in that Neotropical region. Besides, the group is widely diversified, consisting of approximately 70 recognized species. Despite the species richness, aeglids have experienced progressive habitat loss and reduction in their populations due to the steam environments alterations. In order to enable future works on Aegla diversity, this study proposed to develop microsatellite markers for Aegla longirostri. Because of their high polymorphism, such molecular markers have been widely used for establishing genetic structure, dynamic and relationship within and among populations. A total of 42 true microsatellite loci was isolated from the library enriched for (CA)n repeats, besides 17 chimeric sequences attained from technical artifacts. The repeats ranged from 3 to more than forty units. However, primer pairs could be developed for thirteen sequences. Successful PCR amplifications were obtained for loci AlCA135 and AlGA138 up to the moment. This microsatellite loci have been screening in 15 individuals of a population from the central region of Rio Grande do Sul State, Brazil, where that species is endemic, in order to evaluate polymorphism. The other developed primer pairs are still undergoing optimization. These markers are promising for investigating population genetic structure for this species. Besides, they revealed cross-species amplification when tested with Aegla uruguayana. Chimeric PCR products attained in this study, which correspond to 29% of the captured sequences, were object of a deep study about artifacts in microsatellite isolation. Moreover, it was proposed a mechanism to explain their formation and implications. / Aeglidae é a única família de crustáceos anomuros cujos representantes vivos são habitantes exclusivos de água doce. A origem marinha do grupo é evidenciada pelos registros fósseis. Entretanto, o gênero Aegla conquistou o ambiente dulcícola na região temperada do sul da América do Sul onde é endêmico, amplamente distribuído e diversificado, constituindo-se de aproximadamente 70 espécies descritas. Apesar da riqueza de espécies, os eglídeos têm sido vítimas de progressiva perda de habitat e declínio populacional devido à degradação dos ecossistemas límnicos sul-americanos. Visando possibilitar trabalhos futuros voltados à avaliação da diversidade do gênero, este estudo propôs o desenvolvimento de marcadores microssatélites para Aegla longirostri. Devido ao seu alto grau de polimorfismo, estes marcadores têm sido amplamente utilizados para avaliação de estrutura populacional, dinâmica e relações entre e dentro de populações dos mais variados organismos. Foram obtidos 42 locos verdadeiros de microssatélites com a construção de uma biblioteca genômica enriquecida com microssatélites (CA)n para A. longirostri, além de 17 seqüências quiméricas oriundas de artefatos da técnica. As repetições encontradas variaram de três a mais de 40 unidades. Desse total, 13 permitiram a projeção de primers. Condições ideais de amplificação foram estabelecidas para os locos AlCA135 e AlGA138 até o momento, os quais estão sendo testados em 15 indivíduos de uma população da região central do estado do Rio Grande do Sul, onde esta espécie é endêmica, para avaliação do polimorfismo. Testes de amplificação seguem sendo feitos para os demais locos desenvolvidos. Estes marcadores são promissores para investigação de estruturação genética em populações desta espécie. Além disso, estes locos apresentaram amplificação cruzada positiva quando testados para a espécie Aegla uruguayana. Para as seqüências quiméricas obtidas, as quais correspondem a 29% do total capturado, sugeriu-se um mecanismo para explicar sua causa e avaliaramse as implicações deste evento em construções de biblioteca genômica enriquecida com microssatélites.
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AMPLIFICAÇÃO CRUZADA DE LOCOS DE MICROSSATÉLITES EM CRUSTACEA DECAPODA / CROSS-AMPLIFICATION OF MICROSATELLITE LOCI IN CRUSTACEA DECAPODA

Silva, Tális de Oliveira 29 April 2008 (has links)
Aeglidae Dana (1852) are anomuran crabs which occur exclusively in freshwater. The genus Aegla consists of 63 species and subspecies restricted to the southern South America. Highly sensitive molecular markers can help to elucidate some evolutionary features of the genus. Microsatellite markers are excellent molecular markers because they can reveal fine details of the genetic structure of a population. However, microsatellite isolation employs a laborious and expensive methodology. An alternative approach to the isolation procedure is the utilization of microsatellite markers previously developed for close species. The closer the phylogenetic relationship between two species, the more probable is the conservation of the loci and the successful cross-amplification. The present study aimed to test the crossamplification of microsatellite loci developed for two species of the family Aeglidae in other decapod crustaceans and to verify their potential for application in further studies on population genetics. Primers developed for microsatellite loci previously isolated from Aegla longirostri (AlCA135 and AlCA138) and Aegla uruguayana (Au05) were tested in seven species of the family Aeglidae, Aegla camargoi, Aegla leptodactyla, Aegla plana, Aegla platensis, Aegla spinipalma, Aegla violacea and Aegla sp.n., besides in Emerita brasiliensis (Anomura: Hippidae), Pachycheles laevidactylus (Anomura: Porcellanidae) and Trichodactylus panoplus (Brachyura: Trichodactylidae). DNA was extracted using traditional procedures. DNA samples were submitted to the Polymerase Chain Reaction (PCR) using the primers cited. The PCR products were electrophoresed in 6% polyacrylamide gels, at 100V for 24 hours. The gels were silver-stained and the band patterns were analyzed. The microsatellite markers could be transferred only within the genus Aegla, and the locus AlCA135 presented the greatest rate of success in cross-species transfer. Cross-amplification between families within the infra-order Anomura, as well as between the infra-order Anomura and Brachyura was not possible, indicating that these microsatellite loci are not conserved in distantly related species. Notwithstanding, the evaluated loci present potential for utilization within the family Aeglidae and new tests, using optimized PCR conditions, should improve the success rate in cross-amplification. / Aeglidae Dana (1852) são caranguejos que pertencem a Infraordem Anomura e são exclusivos de água doce. O gênero Aegla é constituído por aproximadamente 63 espécies, sendo restrito ao sul da América do Sul. O emprego de marcadores moleculares altamente sensíveis pode auxiliar no entendimento de aspectos evolutivos e da diversidade do gênero. Os microssatélites são excelentes marcadores moleculares que podem revelar detalhes da estrutura genética de uma população. Entretanto, o isolamento de microssatélites é uma técnica cara e trabalhosa. A utilização de locos de microssatélites previamente desenvolvidos para espécies próximas é uma alternativa ao isolamento. Quanto mais próxima a relação filogenética entre duas espécies, maior a probabilidade de conservação das seqüências e de amplificação cruzada utilizando primers heterólogos. O objetivo deste estudo foi testar a amplificação cruzada de locos de microssatélites desenvolvidos para duas espécies de Aeglidae em outros crustáceos e verificar o seu potencial para aplicação em estudos de genética de populações. Primers desenvolvidos para locos de microssatélite previamente isolados de Aegla longirostri (AlCA 135 e AlCA 138) e Aegla uruguayana (Au05) foram testados em outras sete espécies da família Aeglidae, Aegla camargoi, Aegla leptodactyla, Aegla plana, Aegla platensis, Aegla spinipalma, Aegla violacea, Aegla sp.n. e também em Emerita brasiliensis (Anomura: Hippidae), Pachycheles laevidactylus (Anomura: Porcellanidae) e Trichodactylus panoplus (Brachyura: Trichodactylidae). O DNA foi extraído utilizando o método tradicional de fenol-clorofórmio. As amostras de DNA foram submetidas a uma Reação em Cadeia de Polimerase (PCR) com os primers citados. Os produtos da PCR foram submetidos à eletroforese em gel de poliacrilamida 6% a 100V por 24 horas. Os géis foram corados com nitrato de prata e os padrões de banda foram analisados. Observou-se transferência dos marcadores microssatélites somente dentro do gênero Aegla, e o loco AlCA135 foi o que apresentou maior índice de sucesso na amplificação cruzada. Não foi observada amplificação cruzada entre famílias dentro da infraordem Anomura e nem entre as infraordens Anomura e Brachyura, indicando que esses locos de microssatélites não se encontram conservados em espécies distantemente relacionadas. Entretanto, os locos avaliados apresentam potencial de utilização dentro da família Aeglidae e novos testes, otimizando as condições de PCR, poderão melhorar os índices de sucesso de amplificação cruzada.
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Population biology of the freshwater crab Trichodactylus petropolitanus in the Córrego da Mina, Caçapava, SP: environmental monitoring from animal population studies / Biologia populacional do caranguejo de água doce Trichodactylus petropolitanus no Córrego da Mina, Caçapava, SP: monitoramento ambiental a partir de estudo de populações de animais

Fabrízio Alves Venâncio 01 March 2005 (has links)
The freshwater crab Trichodactylus petropolitanus (Göldi, 1886), is an endemic Brazilian species with occurrence in the States of Minas Gerais, Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná and Santa Catarina, being its distribution widely coincident with the domain of the almost extinct Mata Atlântica forest. Besides its importance in the trofic web of lotic systems (rivers and streams), few is known on the Brazilian freshwater crabs biology. Knowing of basic requirements of fauna and the specific traits of each system and microhabitat can generate subsides for the establishment of management plans and environmental monitoring. On this way, the present study aim to generate information on the population biology aspects and about the microhabitat inhabiting by T. petropolitanus in a little stream (231037S e 454128W) localized in a farmland at Caçapava city, SP. Monthly samples were carried out from February 2003 to January 2004 during day time. The crabs were found associated to boundary vegetation of the stream, principally, among the Hedychium coronarium rhizomes, an aquatic macrophyte considered an alien and invasive of degraded environments. Some biological aspects of these crabs were detected in the present work as differential behavior (younger individuals are more actives during day time), differential growth rate between males and females being that males reach the sexual maturity in smaller size (15┤18mm carapace width) than females (> 21mm CW). Highest abundance of the species were observed in the warmer and rainner months of the year, period that could be concentrate the reproductive activities due to large availability of water and wetlands in the area. As conclusion of this work, could be say that the population of T. petropolitanus on the study area presents in equilibrium and the alien and invasive macrophytes could be serving as ecological tool to the biodiversity maintenance of streams and rivers, contributing to the establishment of new niches. / O caranguejo de água doce Trichodactylus petropolitanus (Göldi, 1886), é uma espécie endêmica do Brasil com ocorrência nos Estados de Minas Gerais, Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná e Santa Catarina, sendo que sua distribuição coincide amplamente com os domínios da quase extinta Mata Atlântica. Apesar de sua importância na cadeia trófica de sistemas lóticos (rios e riachos), pouco se conhece sobre a biologia dos caranguejos de água doce no Brasil. O conhecimento das necessidades básicas da fauna e as características peculiares de cada sistema e microhabitat ocupado podem gerar subsídios para o estabelecimento de planos de manejo e monitoramento ambiental. Dessa forma, o presente trabalho visa gerar informações sobre aspectos da biologia populacional e sobre o microhabitat ocupado por esta espécie em um pequeno riacho (231037S e 454128W), localizado em zona rural do município de Caçapava, SP. Coletas mensais foram realizadas de fevereiro de 2003 a janeiro de 2004 no período diurno. Estes caranguejos foram encontrados junto à vegetação marginal do córrego, principalmente entre os rizomas de Hedychium coronarium (lírio-do-brejo), uma macrófita aquática introduzida e considerada invasora de ambientes degradados. No presente trabalho foi detectado alguns aspectos da biologia destes caranguejos como: comportamento diferencial (jovens são mais ativos durante o dia), taxas de crescimento diferencial entre os sexos, sendo que machos alcançam a maturidade sexual (15┤18mm LC) em tamanhos menores que as fêmeas (> 21mm LC). Maior abundância da espécie foi observada nos meses mais quentes e chuvosos do ano, período em que pode estar concentrada as atividades reprodutivas devido à maior disponibilidade de água e áreas alagadas junto ao córrego. Como conclusão do presente trabalho, pode-se dizer que a população de T. petropolitanus apresenta-se estável no local de estudo e as macrófitas aquáticas parecem estar servindo de ferramenta ecológica para a manutenção da biodiversidade de rios e riachos, contribuindo para o estabelecimento de novos nichos.

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