Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-20Bitstream added on 2014-06-13T19:44:24Z : No. of bitstreams: 1 rocha_lb_dr_jabo_prot.pdf: 6975580 bytes, checksum: 02ebdfaf49b41f3ea78cb0bfdae5765d (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os bovinos são divididos em dois grandes grupos, taurinos e zebuínos, cuja divergência genética é de aproximadamente 250 mil anos. Apesar da proximidade filogenética, os grupos respondem de maneira diferente ao teor de energia da dieta. No presente estudo objetivou-se validar o uso do microarranjo BLO+ para estudos de expressão gênica em zebuínos e comparar a expressão gênica no músculo LD de NEL e ANG alimentados com a dieta AE e BE. Oito ANG e oito NEL foram divididos em duas baias e receberam a dieta BE por 28 dias e na seqüência a dieta AE pelo mesmo período. Após cada período, coletou-se amostras do músculo LD, das quais extraíu-se o RNA para os estudos de expressão gênica usando microarranjos. Foram expressos 9.552 e 8.664 genes em ANG e NEL, sendo que 98% dos genes expressos em NEL também foram expressos em ANG, indicando uma alta similidaridade entre as sondas do microarranjo e os transcritos de NEL. Identificaram-se 546 genes DE para ANG e 440 para NEL. Realizou-se a análise funcional desses conjuntos de genes e observou-se diferenças nas categorias funcionais mais representativas entre as raças entre as dietas. A dieta AE estimula de forma mais acentuada a expressão de genes envolvidos no crescimento e desenvolvimento muscular em ANG, enquanto a dieta BE estimula de forma mais acentuada a expressão de genes que codificam proteínas relacionadas à captação de nutrientes endógenos em NEL. Os resultados obtidos sugerem que o microarranjo BLO+ pode ser usado em estudos de expressão gênica com zebuínos e indicam que o nível nutricional da dieta afeta diferentemente a expressão gênica no músculo LD de taurinos e zebuínos. / Bovines are divided in two large groups, taurine and zebuine, whose genetic divergence is estimated as 250,000 years before present. Despite of phylogenetic proximity, these groups respond differently to diet energy level. The current study aimed to validate the BLO+ microarray use in zebuine gene expression experiments and evaluate gene expression in LD muscle from NEL and ANG fed with AE and BE diets. Eight ANG and NEL animals were separated in two pens and received BE diet during 28-days period; following animals were fed with AE diet for the same period. After each period, samples from LD muscle were collected, of which RNA was extracted to proceed with gene expression experiment using microarrays. Were expressed 9,552 and 8,664 genes in ANG and NEL, where 98% of expressed genes in NEL were also expressed in ANG, indicating a high similarity between microarray probes and NEL transcripts. Statistical analysis identified 546 genes differentially expressed for ANG and 440 for NEL. These gene groups were submitted to functional analysis and differences in overrepresented functional categories were observed between breeds and diets. AE diet stimulates further the expression of genes related to muscle growth and development in ANG, while BE diet stimulates further the expression of genes involved in endogenous nutrients uptake in NEL. The results obtained suggest that BLO+ microarray can be used in zebuine gene expression studies and indicate that nutritional level of diet affects the differential gene expression in LD muscle from taurine and zebuine beef cattle.

Abstract: This work aimed: to estimate the genetic variability to growth characters and the wood density; to estimate the genetic value of superior trees; to characterize by molecular markers (RAPD e SSR), three groups of individuals - superiors, intermediates and inferiors, selected with multi-effects index; to verify the effect of thinning on progeny trial relating it to parameters genetics; to estimate the gain expected through the use of IME, aiming to turn the progeny trial in a seedling seed orchard and/or to supply material to establish a clonal seed orchard; to give subsidies to genetic breeding program of this species. The results were: a) a genetic variation verified on the traits was few expressive; b) the thinning showed perspectives to these progenies trial to be explored as a seed orchard by seedling and/or clonal; c) the heritability estimates had presented low magnitude and little variation through time; d) the correlations between characters dbh, height and volume was high, and low for wood density and form. The path analysis coefficient was useful to know to correlation among the studied trait, with volume being largely determined by height and little influence by dbh; e) the Mahalanobis generalized distance and the assemble of progenies by Tocher's method gave important information to future breeding programs about hybridization or backcross; f) the multi-effect index applied to dbh, on D situation, showed higher gains than the selection within and among progenies, and the best option the selection up to five plants per progenies because to permit higher gains and keep genetic diversity close to a selection within and among progenies; g) the characterization using molecular markers evidenced homogeneity between the groups of superiors, intermediates and inferiors individuals. / Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Coorientador: Edson Seizo Mori / Alexandre Magno Sebbenn / Miguel Luiz Menezes Freitas / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-07-26Bitstream added on 2014-06-13T21:00:08Z : No. of bitstreams: 1 silva_jm_me_ilha.pdf: 744004 bytes, checksum: a46600146851ee56b85f98515c789195 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / This work aimed: to estimate the genetic variability to growth characters and the wood density; to estimate the genetic value of superior trees; to characterize by molecular markers (RAPD e SSR), three groups of individuals - superiors, intermediates and inferiors, selected with multi-effects index; to verify the effect of thinning on progeny trial relating it to parameters genetics; to estimate the gain expected through the use of IME, aiming to turn the progeny trial in a seedling seed orchard and/or to supply material to establish a clonal seed orchard; to give subsidies to genetic breeding program of this species. The results were: a) a genetic variation verified on the traits was few expressive; b) the thinning showed perspectives to these progenies trial to be explored as a seed orchard by seedling and/or clonal; c) the heritability estimates had presented low magnitude and little variation through time; d) the correlations between characters dbh, height and volume was high, and low for wood density and form. The path analysis coefficient was useful to know to correlation among the studied trait, with volume being largely determined by height and little influence by dbh; e) the Mahalanobis generalized distance and the assemble of progenies by Tocher's method gave important information to future breeding programs about hybridization or backcross; f) the multi-effect index applied to dbh, on D situation, showed higher gains than the selection within and among progenies, and the best option the selection up to five plants per progenies because to permit higher gains and keep genetic diversity close to a selection within and among progenies; g) the characterization using molecular markers evidenced homogeneity between the groups of superiors, intermediates and inferiors individuals.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2017-08-30T10:51:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatianne Piza Ferrari Abreu - 2014.pdf: 3603386 bytes, checksum: a40d79ec7974327b452379ba2fc94097 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-09-15T13:17:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatianne Piza Ferrari Abreu - 2014.pdf: 3603386 bytes, checksum: a40d79ec7974327b452379ba2fc94097 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-15T13:17:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatianne Piza Ferrari Abreu - 2014.pdf: 3603386 bytes, checksum: a40d79ec7974327b452379ba2fc94097 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-03-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Micrurus lemniscatus is a South American coral snake species, popularly known as “coral verdadeira”. It is widely distributed in Seasonally Dry Forests (SDF), Gallery Forests and Rainforests. The Tertiary events and the climatic oscillations of the Quaternary affected the distribution of these ecosystems altering, in turn, the distribution of animals associated to these habitats. We hypothesize that the forest expansion and contraction cycles caused by climate fluctuations may have influenced the current distribution and genetic structure of M. lemniscatus. This study aimed to study the evolutionary relationships and patterns of divergence among M. lemniscatus lineages and infer the historical biogeographic events that influenced the distribution and genetic variation. Twenty-nine individuals of M. lemniscatus were sampled from 16 localities in the states of Tocantins, Bahia, Goiás, Alagoas, Mato Grosso, Maranhão, Pará and Amazônia. Three mitochondrial regions (COI, 16S and ND4L) were sequenced, and together generated a fragment of 1595 bp and 23 different haplotypes. The analyses showed a very ancient lineage divergence ~ 4.5 Myr and high genetic differentiation among localities (FST=0.932; p<0.01), suggesting a limited gene flow among geographical regions. The demographic analyzes and neutrality tests indicated that there is no sign of expansion and that populations have constant size (Tajima’s D = 0.521; p = 0.763 and Mismatch distribution = 0.009; p= 0.779). In the analysis of the evolutionary relationship between haplotypes (by median-joining network method), no relationship between lineage and geographical space was found, suggesting incomplete lineage sorting. The results corroborate and give evidence that populations of M. lemniscatus were distributed in a more continuous region in the past, and the current distribution of this species may be the result of the reduction and separation of the geographical scope of their distribution, rather than having itself been an expansion event. This may be the result of cycles expansion of SDF and retraction of the rainforests during the cool and dry phases of the Quaternary. / Micrurus lemniscatus é uma espécie de cobra coral verdadeira sul-americana. Essa espécie possui uma ampla distribuição, ocorrendo em vários tipos de hábitats, incluindo Floresta Estacional Decidual e Semidecidual (FED), Matas de Galeria e Florestas Úmidas. No passado, os eventos do Terciário e as oscilações climáticas no Quaternário provavelmente influenciaram o padrão de distribuição dessas florestas, alterando a distribuição dos organismos associados à esses habitats. Hipotetiza-se que, os ciclos de expansão e retração florestal causados pelas flutuações climáticas podem ter influenciado a atual distribuição e estruturação genética de M. lemniscatus. Este trabalho teve por objetivo avaliar os padrões e relações evolutivas das linhagens genéticas de M. lemniscatus e compreender quais foram os eventos históricos biogeográficos que influenciaram a distribuição e a variação genética atual. Foram utilizados 29 amostras de indivíduos de M. lemniscatus de 16 localidades dos Estados de Tocantins, Bahia, Goiás, Alagoas, Mato Grosso, Maranhão, Pará, e Amazônia. Três regiões mitocondriais (COI, 16S e ND4L) foram sequenciadas, e juntas geraram um fragmento de 1595 pb e 23 diferentes haplótipos. As análises evidenciaram uma divergência bem antiga de linhagens, ~4,5 milhões de anos atrás e uma alta diferenciação genética entre as localidades (FST=0,932; p<0,01), o que sugere um fluxo gênico limitado entre essas regiões. As análises demográficas e testes de neutralidade indicaram que não há sinal de expansão e que as populações possuem tamanho constante (D de Tajima= 0,521; p= 0,763 e Distribuição de Mismatch= 0,009; p= 0,779). Na análise de relação evolutiva entre os haplótipos (pelo método median-joining network), não foi encontrada relação entre as linhagens e o espaço geográfico, sugerindo arranjo incompleto de linhagens. Os resultados corroboram e dão evidências de que as populações de M. lemniscatus eram distribuídas em uma região mais contínua no passado, e a atual distribuição desta espécie pode ser o resultado da redução e separação da abrangência geográfica de sua distribuição, ao invés de ter ocorrido propriamente um evento de expansão. Isso pode ser resultado dos ciclos de expansão das FED e retração das florestas úmidas durante as fases mais frias e secas do Quaternário.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T13:50:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Flávio Pereira dos Santos - 2017.pdf: 4123017 bytes, checksum: 3f5d1dc9faa05160c24e891d9367a220 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T13:51:22Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Flávio Pereira dos Santos - 2017.pdf: 4123017 bytes, checksum: 3f5d1dc9faa05160c24e891d9367a220 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T13:51:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Flávio Pereira dos Santos - 2017.pdf: 4123017 bytes, checksum: 3f5d1dc9faa05160c24e891d9367a220 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is widely cultivated in Brazil, which is the first biggest producer and consumer in the world. The knowledge about the genetic divergence across landraces is very useful for breeders, once it allows them to organize the genetic resources and explore the genetic variability available. The genetic analysis can be done predicting similarities or dissimilarities coefficients that are estimated by morphological differences between accessions. The objective of this study was to identify the diversity across the accessions of common bean that were collected in Goiás State (Brazil), available in Embrapa Rice and Beans’ germplasm bank, through morphological descriptors and agronomic information. The experimental material was composed by 156 common bean accessions. Two experiments were performed, one of them in a greenhouse (morphologic characterization) and the other one in the field (yield evaluation). The experiment in the greenhouse was conducted using two vases with three seeds each one per accessio), without experimental design. The experiment conducted in the field was done under Federer’s Augmented Blocks design, with four blocks of 43 plots (39 accessions + 4 checks). The accessions were characterized by 39 morpho-agronomic qualitative descriptors and ten quantitative descriptors. The quantitative variables were converted in multicategorical variables. The 39 morpho-agronomic qualitative and the ten quantitative descriptors were transformed in binary variables by creating 236 fictitious variables. Though, the similarity matrix was built, using the model proposed by Harrison, which was converted in a dissimilarity matrix. Then the cluster analysis was performed by UPGMA method. The accessions 101 (Rosinha) x 145 (Pintado)) and 120 (Dobra morro) x 152 (Doidão ou bonitão), were the most divergent, because they showed the lowest similarities value, 0,11. The biggest divergences were observed in accession 152, with the similarity coefficients between 0,11 and 0,52. No redundant accessions were found. The pair 86 (Paraná) x 103 (Amarelinho). showed the biggest similarity (0,84). The accessions were clustered in 17 groups, with cophenetic correlation coefficient equal to 0,75, that was significat by Mantel’s test (P < 0,001).The number of accession per group varied from 43 to one. Four groups with only one accessions were formed, which showed the lowest similarities coefficients. No significance was observed for grain yield a mong the accessions, nor between the accession and the commercial checks. / O feijão (Phaseolus vulgaris L.) é uma cultura amplamente difundida no Brasil, que é o maior produtor e consumidor mundial. O conhecimento da diversidade genética entre as cultivares tradicionais é útil aos melhoristas, por permitir melhor organização dos recursos genéticos e maior aproveitamento da diversidade genética disponível. A análise de divergência genética pode se dar por métodos preditivos, quantificada por medidas de similaridade ou dissimilaridade estimadas com base em diferenças morfológicas. O objetivo deste trabalho foi identificar a existência de diversidade entre os acessos de feijoeiro comum coletados no Estado de Goiás, pertencentes ao Banco de Germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão, por meio de descritores morfológicos e informações agronômicas. O material experimental foi formado por 156 acesso de feijoeiro comum coletados no Estado de Goiás. Foram montados dois experimentos um e casa de vegetação (caracterização morfológica) e um em campo (avaliação de produção). No ensaio em casa de vegetação foram utilizados dois vasos com três sementes por acesso, sem delineamento experimental. O experimento em campo foi conduzido em delineamento experimental em blocos aumentados de Federer com 4 blocos, cada um contendo 43 parcelas (39 acessos + 4 testemunhas). Os acessos foram caracterizados com base em 39 descritores morfoagronômicos qualitativos e dez quantitativos. As variáveis quantitativas foram convertidas em variáveis multicategóricas. Tanto os 39 descritores morfoagronômicos qualitativos, quanto os dez quantitativos foram transformados em variáveis binárias resultando em 236 variáveis fictícias. Então foi obtida uma matriz de similaridade, utilizando o modelo de Harrison, que foi convertida em matriz de dissimilaridade; em seguida aplicou-se a análise de agrupamento pelo método UPGMA. Os acessos mais divergentes foram os 101 (Rosinha) x 145 (Pintado) e 120 (Dobra morro) x 152 (Doidão ou bonitão), que apresentaram o menor valor de similaridades 0,11. As maiores divergências foram observadas no acesso 152, com similaridades variando de 0,11 a 0,52. Não foram encontrados acessos redundantes. A maior similaridade foi de 0,84 entre o par de acessos 86 (Paraná) x 103 (Amarelinho). Pela análise de agrupamento os acessos foram agrupados em dezessete grupos, com coeficiente de correlação cofenética (CCC) de 0,75, significativo pelo teste de Mantel (P < 0,001). O número de acessos por grupo variou de 43 a um. Verificou-se a formação de quatro agrupamentos constituídos por apenas um acesso, que apresentaram os menores coeficientes de similaridade. Para produtividade não foi detectada diferença significativa entre acessos e nem entre estes e as testemunhas comerciais.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:45:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:46:24Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-15T13:46:24Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-09-15 / The success of plant breeding programs depends on the choice of progenitors capable of producing progeny with desired characteristics, which are the raw material for the genetic selection. This study aimed to evaluate the combining ability of two groups of genitors, composed of 12 genotypes of rice, selected based on the high grain yield performance in each location (Goiania and Boa Vista), and their respective crosses, through complete diallel cross scheme without reciprocals, in two generations (F2 and F7). The experimental design was a randomized blocks, and it were evaluated the traits grain yield (PG) and days to flowering (DF), and estimated the varietal effect ( ̂), the average heterosis, varietal heterosis ( ̂ ) and specific heterosis ( ̂ in every generation, and for each group, the general combining ability ( ̂ ) of the parents. Significant differences were detected among the parents of both groups, for both traits, and were considered the most promising for the selection of new inbred lines, the combinations involving genitors with the highest values and positive effects of ̂ For PG trait in Goiânia, it were identified Canela Curta, Maninjau, Epagri 108 and Diamante, and in Boa Vista, the best genotypes were BRS Jaburu, BG90-2, Mearim, BRS Biguá and Chililica. For the DF trait in Goiânia, the genitors showing a decrease in the number of days to flowering and increased ̂ were Araguaia, CT11632, IRAT 122, Pratinha Branco and TOx 503, while for Boa Vista it were TOx 514, BRS Jaburu, Itaqui , BG90-2, BRS Biguá and IR54R. The use of SSR markers to infer the potential success of a certain hybrid combination, both in F2 and F7 generation, has not been indicated for the group of genitors evaluated. / O sucesso de programas de melhoramento de plantas autógamas depende da escolha de genitores capazes de produzir progênies com características desejadas. Dessa forma, este estudo teve como objetivo avaliar o potencial de dois grupos, de Goiânia e Boa Vista, com 12 genitores de arroz, e seus respectivos cruzamentos, por meio de cruzamentos dialélico completo sem os recíprocos, em duas gerações (F2 e F7), quanto às características agronômicas, em delineamento em blocos ao acaso. Para a os caracteres produção de grãos (PG) e dias até o florescimento (DF), foram avaliados: o efeito varietal ( ̂), a heterose média, a heterose varietal ( ̂ ) e a heterose específica ( ̂ em cada geração, e para cada grupo, obteve a estimativa da capacidade geral de combinação (gi) dos genitores. Foram detectadas diferenças significativas entre os genitores, de ambos os grupos, quanto às características agronômicas avaliadas, e foram consideradas mais promissoras, para a seleção de novas linhagens, as combinações envolvendo os genitores com as maiores magnitudes e efeitos positivos de ̂ para o caráter PG, em Goiânia foram Canela Curta, Maninjau, Epagri 108 e Diamante, além de serem os genitores mais produtivos. Para o caráter DF, os genitores que apresentaram as estimativas no sentido de diminuir o caráter, isto é, os mais precoces foram Araguaia, CT11632, IRAT 122, Pratinha Branco e TOx 503. Para o dialelo de Boa Vista teve como destaque os genitores BRS Jaburu, BG90-2, Mearim, BRS Biguá e Chililica, os quais apresentaram maiores magnitudes ̂ e efeitos positivos para o caráter PG. Quanto ao efeito ̂ para o caráter DF, os genitores TOx 514, BRS Jaburu, Itaqui, BG90-2, BRS Biguá e IR54R apresentaram efeitos negativos, reduzindo o caráter

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:06Z No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The guaraná (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native plant valued by Amazonian peoples, especially by Sateré-Maue tribe in northern Amazon region on the border with the state of Pará. Research shows that guaraná has stimulating and therapeutic properties that make it an important input for chemical refrigerants, pharmaceutical, and cosmetics. The aim of the study was to evaluate genetic, estimate variance components for morphological characteristics, and production of guaraná progenies. In the experiment conducted in the city of Maués-Am / EMBRAPA were evaluated 36 progenies brothers guaraná means in experimental design of randomized blocks with two replications and six plants per plot for agronomic characters and fruit yield (g.plant-1.year-1) arranged in two rows of three plants, spaced 5 m x 5 m. The analysis of quantitative character production (g.plant-1.year-1) was based on the average production over six years. The average of the best individual production was 28,355 g.plant-1.year-1, which is ten times higher than the state average productivity. Progenies have enough genetic diversity for selection of progeny and senior individuals with controlled crossings or intercross could generate a base population with high productivity and sufficient genetic diversity increases the likelihood of recovery of superior genotypes. / O guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma planta nativa valorizada pelos povos Amazônicos, especialmente pela tribo Sateré- Maué no norte da região Amazônica, na fronteira com o estado do Pará. As pesquisas mostram que o guaraná tem propriedades estimulantes e terapêuticas o que o tornam um importante insumo para as indústrias químicas de refrigerantes, farmacêuticas, e cosméticos. O objetivo do estudo foi avaliar valores genéticos, estimar componentes de variância para caracteres morfoagronômicos, e da produção de progênies de guaranazeiro. No experimento conduzido na cidade de Maués-Am/EMBRAPA, foram avaliadas 36 progênies de meios irmãos de guaranazeiro em delineamento experimental de blocos ao acaso com duas repetições e seis plantas por parcela para os caracteres agronômicos e produção de frutos (g.planta-1.ano-1) dispostas em duas fileiras de três plantas, no espaçamento de 5 m x 5 m. A análise do caráter quantitativo Produção (g.planta-1.ano-1) foi baseado na média da produção ao longo de seis anos. A média da produção do melhor indivíduo foi de 28.355 g.planta-1.ano-1, que é dez vezes maior do que a produtividade média estadual. As progênies apresentam diversidade genética suficiente para a seleção de progênies e de indivíduos superiores que com cruzamentos controlados ou intercruzamentos poderiam gerar uma população base com alta produtividade e diversidade genética suficiente aumentando a probabilidade de recuperação de genótipos superiores.

A obtenção de híbridos de milho está relacionada com o aumento de produtividade dessa cultura. Para isso, normalmente são realizados cruzamentos entre linhagens de diferentes grupos heteróticos, que são determinados pelos melhoristas de forma que seja maximizada a divergência entre eles. A escolha dos genitores a serem cruzados pode ser facilitada pelo uso de cruzamentos dialélicos. Os modelos usados para a análise dos dialélicos permitem a estimação de parâmetros úteis para a seleção dos genitores e o estabelecimento de grupos heteróticos, sendo que os efeitos genéticos normalmente podem ser considerados como aleatórios. A forma tradicional de análise inclui tais efeitos na matriz de incidência dos efeitos fixos e emprega o método dos mínimos quadrados ordinários, o que impossibilita a análise usando a metodologia dos modelos mistos. Os objetivos deste trabalho foram comparar os resultados das análises dialélicas obtidas considerando o modelo fixo e o modelo misto e avaliar a eficiência do melhor preditor linear não viesado (BLUP) para predição de cruzamentos não realizados entre linhagens de milho, utilizando informações de marcadores moleculares RFLP para a estimação da matriz de parentesco. Foram considerados dados de 80 híbridos interpopulacionais e 20 testemunhas comerciais, avaliados em um látice 10 x 10 em três locais. Esses híbridos foram obtidos pelo cruzamento entre 8 linhagens do grupo heterótico BR-105 e 10 do grupo BR-106, as quais foram genotipadas com marcador RFLP. A análise dialélica foi realizada segundo a metodologia que considera o modelo genético como fixo e usa o método dos mínimos quadrados ordinários, e também usando a metodologia de modelos mistos, assumindo que a capacidade geral de combinação (CGC) dos dois grupos heteróticos e a capacidade específica de combinação (CEC) representam efeitos aleatórios. Além disso, foi avaliada a predição de híbridos simples não realizados, com base na matriz de covariâncias genéticas entre o híbrido não realizado e os híbridos preditores, usando as informações do marcador RFLP. Como todos os híbridos foram obtidos, foi simulada a retirada de cada um deles do conjunto, sendo sua performance predita a partir dos 79 restantes. Os resultados mostraram que, na comparação entre as análises dialélicas obtidas com as duas metodologias, embora os valores da CGC das linhagens da população BR-106 e da CEC tenham baixa correlação entre as duas metodologias (r=-0,11 e r=-0,06, respectivamente), a classificação dos híbridos mais produtivos sofre poucas alterações (r=0,99) e não causa dificuldades na seleção. A eficiência do BLUP para predição de cruzamentos não realizados entre linhagens de milho, utilizando informações de marcadores moleculares para a estimação da matriz de parentesco, mostrou a existência de moderada correlação entre os valores dos BLUP’s da produção de grãos e os valores preditos a partir dos híbridos observados restantes (r=0,35), o que indica que essa metodologia tem capacidade em predizer a estimativa de valores não observados, porém com alguma imprecisão. Os mesmos resultados foram observados entre as capacidades específicas de combinação observadas e as preditas (r=0,30). Conclui-se que a metodologia de modelos mistos pode ser usada, desde que com ressalvas, dada as correlações moderadas. / The obtainment of maize single crosses is related with increasing in productivity. To do so, inbred lines derived of different heterotic groups are crossed. These groups are established in such a way that the genetic divergences among them are maximized. Using diallel crosses can facilitate the choice of the inbred lines to be crossed. The models used to perform these analyses allow estimating genetic parameters that are useful in the selection of parental lines and in determining the heterotic groups. In these models, generally, the genetic effects are considered as random. However, these analyses are usually performed considering these effects in the matrix of fixed effects, and obtaining the parameter estimates according to the ordinary least squares method, making impossible using mixed linear models theory. The aims of this research were to compare the results of diallel analyses obtained by using fixed and mixed models, and evaluate the efficiency of the best linear unbiased predictor (BLUP) in predicting non-realized single crosses. Eighty interpopulation hybrids and twenty commercial checks were evaluated in a 10 x 10 lattice design with two replications located in three environments. These single crosses were obtained by crossing eight and ten inbred lines from BR-105 and BR-106 heterotic groups, respectively. These eighteen lines were genotyped by using RFLP molecular markers and then the coefficient of parentage among them was estimated. The genetic parameters general (GCA) and specific (SCA) combining abilities were estimated through diallel analyses, considering the linear model as fixed and using the ordinary least squares as the estimation method. Besides, GCA and SCA were predicted using BLUP and assuming the genetic effects as random. Besides, the prediction of non-realized single crosses was evaluated. To do so, each one of the 80 realized hybrids was predicted based on information of the others 79 single crosses and using the genetic variance-covariance matrix estimated using RFLP information. According to the results, it was found poor correlation between estimatives and predictions obtained considering the model as fixed or mixed, for GCA within BR-106 population (r=-0.11) and for SCA (r=-0.06). However, the ranking of the single crosses for productivity did not change (r=0.99) and did not make selection process more difficult. The efficiency of BLUP in predicting unrealized single crosses was moderated since the correlation between observed and predicted values was r=0.35, indicating some imprecision in these predictions. Similar results were obtained when comparing observed and predicted SCAs (r=0.30). It was possible to conclude that BLUP can be useful in diallel analyses and in prediction of single crosses, but some caution have to be account since the correlations presented moderate values.

Submitted by Jadson Francisco de Jesus SILVA (jadson@uefs.br) on 2018-02-22T21:50:40Z No. of bitstreams: 1 PREDI??O DE PAR?METROS GEN?TICOS E INCREMENTO DA QUALIDADE DEFINITIVO.pdf: 1627949 bytes, checksum: 31c34b863f924737f87f81fa9f625403 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-22T21:50:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PREDI??O DE PAR?METROS GEN?TICOS E INCREMENTO DA QUALIDADE DEFINITIVO.pdf: 1627949 bytes, checksum: 31c34b863f924737f87f81fa9f625403 (MD5) Previous issue date: 2017-03-17 / The study aimed to estimate genetic parameters and genetic variability, as well as to determine the correlations among fruit variables associated with production and pulp quality attributes in pumpkin progenies. In 2013, the parameters and prediction of progeny gains allowed the ranking of the best individuals in 10 progenies from self pollination. In 2015 the divergence was determined, selecting genotypes for qualitative and quantitative characteristics, and studying the correlations among fruit variables associated with production and pulp quality attributes in 11 evaluated genotypes. In 2013, the REML/BLUP analysis allowed the ranking considering all variables evaluated indicating the individuals 10/1/1, 10/2/12 and 6/1/3 as more promising, being the first two of ?piriform? format, and the third of "moranga" format. In 2015, it was found great variability in the progenies evaluated and similarity among progenies C. moschata 1, C. moschata 3, C. moschata 4 and C. moschata 8. The promising progenies for fruit mass and ?-carotene were C. Moschata 4 and C. moschata 7 for advances aiming to increase of production and the nutritional characteristics of the fruit. Estimates of carotenoid contents generated by the Hue angle are only valid for contrasting genotypes due to the grouping of genotypes with carotenoid content four times higher than ?Jacarezinho? cultivar. The variables explained 98% of the variation in the basic variable in the path analysis and four variables can be used for direct selection aiming to increase of fruit mass. / O estudo objetivou obter estimativas de par?metros gen?ticos e de variabilidade gen?tica, bem como determinar as correla??es entre vari?veis do fruto associadas ? produ??o e atributos de qualidade da polpa em prog?nies de ab?bora. Em 2013, os par?metros e a predi??o de ganhos gen?ticos permitiram o ranqueamento dos melhores indiv?duos em 10 prog?nies provenientes de autofecunda??es. Em 2015 determinou-se a diverg?ncia, sendo feita a sele??o de gen?tipos para caracteres qualitativos e quantitativos, al?m de estudar as correla??es entre vari?veis do fruto associadas ? produ??o e atributos de qualidade da polpa em 11 gen?tipos avaliados. Em 2013, a an?lise via REML/BLUP possibilitou o ranqueamento considerando todas as vari?veis avaliadas indicando os indiv?duos 10/1/1, 10/2/12 e 6/1/3 como mais promissores, sendo os dois primeiros de formato ?piriforme? e o terceiro de formato ?moranga?. Em 2015, constatou-se grande variabilidade nas prog?nies avaliadas e similaridade entre as prog?nies C. moschata 1, C. moschata 3, C. moschata 4 e C. moschata 8. As prog?nies promissoras para massa do fruto e ?-caroteno foram C. moschata 4 e C. moschata 7 para avan?os visando aumento da produ??o e das caracter?sticas nutricionais do fruto. As estimativas dos teores de carotenoides geradas pelo ?ngulo Hue somente s?o v?lidas para gen?tipos contrastantes devido ao agrupamento de gen?tipos com teores de carotenoides quatro vezes maiores em rela??o a cultivar Jacarezinho. As vari?veis explicaram 98% da varia??o ocorrida na vari?vel b?sica na an?lise de trilha e quatro vari?veis podem ser utilizadas para a sele??o direta visando aumento da massa do fruto.

This study had as objective to estimate the genetic divergence among sugarcane genotypes by means of morphoagronomical characters and molecular markers, and to verify the relation between these procedures. An experiment was conducted in Rio Largo, AL, using a randomized block design with four repetitions. The multivariated analysis of Principal Components, the genetic divergence based on the Mahalanobis 2 ii' D Generalized Distance, and the Average Euclidean Distance Standardized were used for the analysis of the quantitative characters. Based on these distances, a grouping analysis was performed by the More Distant Neighbor method and the UPGMA method, besides Tocher for 2 ii' D . Jaccard coefficient and UPGMA grouping were used in the evaluation of the genetic divergence by molecular markers and morphologic characters. The inconsistency as to formation of different groups between the Standardized Average Euclidean Distance and 2 ii' D of Mahalanobis characterize these two estimates as measures of different dissimilarity. In the same way, the grouping techniques by the More Distant Neighbor method and by UPGMA show graphical dispersions that are not coincident, with differences in relation to the number of groups and in the grouping pattern, while the grouping by UPGMA and obtained by Tocher showed the same agreements. The 2 ii' D Distance of Mahalanobis corresponded to the Principal Components technique, by showing the same groups made by Tocher and UPGMA, obtained from 2 ii' D . However, these techniques did not indicate agreement with the Standardized Average Euclidean Distance. The correlation between the genetic divergence through morphologic characters and estimated by molecular markers was significant, however, from average magnitude (r = 0,47), indicating to be complementary measurements. There was not significant correlation for the divergence obtained through quantitative characteristics with the morphologic characters and molecular markers obtained by the different estimators, as well as between Standardized Average Euclidean Distance and the Mahalanobis 2 ii' D , which indicates clearly that there is no relation between these estimates. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho teve como objetivos a estimação da divergência genética entre genótipos de cana-de-açúcar, por meio de caracteres morfoagronômicos e marcadores moleculares, e verificar a relação entre esses procedimentos. Foi conduzido um experimento em Rio Largo, AL, utilizando o delineamento em blocos casualisados com quatro repetições. Para a análise dos caracteres quantitativos foi utilizada a análise multivariada de Componentes Principais, divergência genética a partir da Distância Generalizada 2 ii' D de Mahalanobis e Distância Euclidiana Média Padronizada. Com base nestas distâncias, realizaramse análise de agrupamento pelo método Hierárquico do Vizinho mais Distante e método UPGMA, além de Tocher para 2 ii' D . Na avaliação da divergência genética por meio de marcadores moleculares e caracteres morfológicos, utilizou-se o coeficiente de Jaccard e agrupamento UPGMA. As inconsistências quanto à formação de diferentes grupos entre a Distância Euclidiana Média Padronizada e a Distância 2 ii' D de Mahalanobis caracterizam estas duas estimativas como medidas de dissimilaridade distintas. Da mesma forma as técnicas de agrupamento pelo método do Vizinho mais Distante e por UPGMA evidenciam dispersões gráficas não coincidentes, com diferenças quanto ao número de grupos e ao padrão de agrupamento, ao passo que o agrupamento por UPGMA e obtido por Tocher apresentaram a mesma concordância. A Distância 2 ii' D de Mahalanobis correspondeu à técnica de Componentes Principais, por apresentarem os mesmos grupos formados por Tocher e UPGMA, obtidos a partir de 2 ii' D . No entanto, estas técnicas não indicaram concordância com a Distância Euclidiana Média Padronizada. A correlação entre a divergência genética através de caracteres morfológicos e a estimada por marcadores moleculares foi significativa, porém, de média magnitude (r = 0,47), indicando serem medidas complementares. Não houve correlação significativa para a divergência obtida por meio de características quantitativas com os caracteres morfológicos e marcadores moleculares, obtida pelos diferentes estimadores, assim como, entre a Distância Euclidiana Média Padronizada e a 2 ii' D de Mahalanobis, o que indica claramente não existir qualquer relação entre estas estimativas.