Orientador: Antonio Carlos Quicoli / Dissertação (mestrado) - Universidade EStadual de Campinas, Instituto de Estudos da Linguagem / Made available in DSpace on 2018-07-16T06:02:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Romualdo_JonasdeAraujo_M.pdf: 2424614 bytes, checksum: 37c6000ca7463c60d8196da07e01ba5e (MD5) Previous issue date: 1975 / Resumo: Este trabalho tem como objetivo o exame de alguns aspectos sintáticos das sentenças comparativas do português, dentro do arcabouço teórico da gramática gerativo-transformacional, tal como está esboçado Por Chomsky (1965). São tomadas como ponto de partida algumas propostas feitas para o tratamento das sentenças comparativas do inglês, particularmente a proposta de Bresnan (1970). Essas propostas são confrontadas com os fatos do português, com o fim de se determinar sua: adequação ou não aos fatos considerados. É examinado se existem ou não argumentos favoráveis à análise de comparativas como estruturas subordinadas. É examinada também a dependência entre comparativas e advérbios de intensidade. Verificam-se as principais evidências em favor do tratamento de relativas e comparativas como estruturas 'muito próximas. Finalmente, é verificada a existência de dois tipos diferentes de sentenças comparativas: a comparativa assimilativa e a quantitativa / Abstract: Not informed. / Mestrado / Linguistica / Mestre em Linguística

O objetivo deste estudo foi caracterizar os pacientes que foram encaminhados por profissionais do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (HCFMRP-USP) ao Ambulatório de Psicologia, localizado dentro do Serviço de Psicologia da instituição. Durante o período de 2013 a 2016 o Ambulatório de Psicologia recebeu o total de 189 pacientes, que passaram pelo atendimento de triagem psicológica para a avaliação da elegibilidade do caso, ou seja, se a demanda apresentada pelo paciente e os sintomas psicológicos estavam de acordo com os critérios de inclusão estabelecidos pelo Ambulatório. Dos 110 pacientes que foram aceitos no Ambulatório, 58 estavam de acordo com os critérios de inclusão desta pesquisa. Para a caracterização sóciodemográfica utilizou-se a Entrevista de Anamnese Padrão do Ambulatório de Psicologia. Para a avaliação dos aspectos psicológicos e comportamentais utilizou-se o Inventário de Ansiedade de Beck (BAI), o Inventário de Depressão de Beck (BDI), Inventário de Sintomas de Estresse para Adultos de Lipp (ISSL), Inventário de Habilidades Sociais (IHS) e para avaliar a qualidade de vida utilizou-se o World Health Organization Quality of Life (WHOQoL-Bref). As análises foram conduzidas no software Statistical Package for the Social Science 20.0 (SPSS 20.0), foram realizados testes para verificar a existência de associação entre as variáveis sociodemográficas e os resultados obtidos nos instrumentos. A caracterização sociodemográfica identificou que 81% dos pacientes são mulheres, 46,6% possuem de 18 a 58 anos, 58,6% são procedentes de Ribeirão Preto, 58% possuem companheiro, 39,7% possuem de 10 a 14 anos de estudo e 62,% trabalham. As principais fontes de encaminhamento foram da Psicologia (22%) e das especialidades voltadas ao cuidado da saúde da mulher (19%). Em relação ao desfecho do atendimento psicológico, 54% ocorreram devido à alta por falta ou desistência do paciente. Quanto aos aspectos psicológicos e comportamentais, 46,6% apresentaram sintomas de ansiedade moderado e grave e 55,2% sintomas de depressão moderado e grave 55,2% e 89,7% possuem estresse. Houve o predomínio de déficit nas habilidades sociais nos fatores avaliados no IHS e a autossatisfação com a qualidade de vida foi avaliada como ruim por 43% dos pacientes. Esta pesquisa obteve dados relevantes para a melhoria no funcionamento do Ambulatório de Psicologia do HCFMRP/USP e por se tratar de um centro de atendimento de grande porte, que forma profissionais especializados, torna-se importante a produção e divulgação de conhecimentos na área. / The purpose of this study was to characterize those who were referred by professionals from the Clinic Hospital of the Medical School of Ribeirão Preto of the University of São Paulo (HCFMRP-USP) to the Ambulatory of Psychology, located within the Psychology Department of the institution. During the period from 2013 to 2016, the Ambulatory of Psychology received a total of 189 patients, who underwent psychological screening to assess the eligibility of the case, in other words, whether the patient\'s demand and the psychological symptoms were in agreement with the inclusion criteria established by the Ambulatory. Out of the 110 patients who were admitted to the outpatient clinic, 58 were in agreement with the inclusion criteria of this study. For the sociodemographic characterization the Interview of Standard Anamnesis of the Ambulatory of Psychology was used. For the evaluation of the psychological and behavioral aspects the Beck Anxiety Inventory (BAI), Beck Depression Inventory (BDI), Lipp´s Inventory of Stress Symptoms for Adults (ISSL), Social Skills Inventory (IHS) were used, and to evaluate the quality of life the World Health Organization of Life (WHOQoL-Bref) was used. The analyzes were conducted in the Statistical Package for Social Science 20.0 (SPSS 20.0) software, and tests were carried out to verify the existence of an association between sociodemographic variables and the results obtained in the instruments. The sociodemographic characterization identified that 81% of the patients are women, 46.6% are 18 to 58 years old, 58.6% are from Ribeirão Preto, 58% have a partner, 39.7% have 10 to 14 years of study and 62,% work. The main sources of referrals were from Psychology (22%) and specialties focused on women\'s healthcare (19%). Regarding to the outcome of psychological care, 54% occurred because of discharge due to lacks or patient\'s abandonment. Concerning the psychological and behavioral factors, 46.6% had symptoms of moderate and severe anxiety and 55.2% had moderate and severe depression symptoms, 55.2% and 89.7% had stress. There was an absolute predominance of deficit in social skills factors evaluated in the IHS, and self-satisfaction with quality of life was evaluated as \'poor\' by 43% of the patients. This research obtained relevant data for the improvement in the functioning of the Ambulatory of Psychology of HCFMRP/USP and because it is a large service center, which forms specialized professionals, it becomes important to produce and disseminate knowledge in the area.

Este trabalho parte do pressuposto de que investigar as linguagens e pensamentos envolvidos nos processos de criação científica, no processo de interpretação do cientista frente aos fenômenos da natureza, pode nos indicar como trabalhar a ciência em sala de aula de maneira que as características epistemológicas deste conhecimento sejam levadas em consideração. Com isto, este trabalho toma uma perspectiva epistemológica. Quando pensamos no ensino básico, em particular, temos a indicação de que uma das dificuldades enfrentadas pelos alunos está relacionada à formalização do conhecimento científico. Isto é ainda mais forte na física, uma vez que este conhecimento tem uma relação muito próxima com a matemática. Mas qual é o papel epistemológico da matemática para a física? O cientista é capaz de interpretar fisicamente a natureza somente usando linguagens e pensamentos formais, especialmente estruturados pela matemática? Nossa hipótese é que a resposta a essa questão é negativa. Encontramos nas ideias do psicólogo Jerome Bruner uma forma de encaminhar nossa discussão. A partir das ideias dele, e do nosso anseio por investigar se pensamentos e linguagens que não são estritamente formais desempenham papel importante na construção da física, levantamos a seguinte questão: Qual o papel das narrativas e da matemática na construção da física? Para delinear uma resposta possível a esta questão, tomamos como contexto da nossa pesquisa alguns \"capítulos\" da construção da Teoria da Relatividade Geral. Nossa investigação mostrou que experimentos mentais importantes no desenvolvimento desta teoria foram construídos a partir dos pensamentos narrativo e matemático. Entendemos que estes dois modos de pensamentos se apresentaram de maneira complementar no contexto estudado. / This work assumes that investigate the language and thoughts involved in scientific processes of creating, in the scientist process of interpretation facing the nature phenomena, can reveal how to work the science in the classroom so that the epistemological features of this knowledge are taken into account. Taking this into account, our work takes an epistemological perspective. When we think in high school, in particular, we have the indication that one of the difficulties faced by students is related to the formalization of scientific knowledge. This is even stronger in physics, which mathematics plays important role. But what is the epistemological role of mathematics to physics? The scientist is able to physically interpret nature only using formal languages and thoughts, especially structured by mathematics? Our hypothesis is that the answer to this question is negative. We find the psychologist Jerome Bruner ideas a way to send our discussion. From his ideas, and our longing to investigate whether thoughts and languages that are not strictly formal play an important role in building physics, raised the question: What is the role of narrative and mathematics in physical construction? To outline a possible answer to this question, we take as the context of our research some \"chapters\" of the construction of the General Theory of Relativity. Our investigation has shown that important thought experiments in the development of this theory were built from the narrative and mathematical thoughts. We understand that these two modes of thought presented in a complementary manner in the context studied.

Estudos de perturbações em sistemas gravitacionais no âmbito da Relatividade Geral vêm sofrendo grandes desenvolvimentos nos últimos anos, especialmente em face da evolução dos modernos detectores de ondas gravitacionais. Abordamos neste trabalho as perturbações de diferentes cenários. Principiamos com a métrica de Vaidya, utilizada para descrever espaços-tempos esfericamente simétricos e dependentes do tempo. Nossas simulações mostraram que as freqüências dos modos quasi-normais (MQN\'s) apresentam um novo efeito inercial para variações rápidas da função de massa, retornando depois ao comportamento adiabático. Em seguida, apresentamos um modelo para a evaporação de mini buracos negros por radiação de Hawking inspirado no cenário de criação destes objetos em aceleradores de partículas, previsto pelas novas teorias com dimensões extras. Nosso modelo, baseado na métrica de Vaidya n-dimensional, tornou possível a análise de MQN\'s resultando na possibilidade de se obter os parâmetros relevantes do buraco negro, como a sua massa inicial e o número de dimensões extras, a partir de medições experimentais. Finalmente, realizamos um estudo sobre uma nova solução denominada gravastar, proposta como um modelo alternativo para o estágio final de estrelas com grande massa. Obtivemos limites para os parâmetros da solução e verificamos a sua estabilidade frente a perturbações axiais, concluindo positivamente a respeito da possibilidade de se distinguir entre buracos negros e gravastares com base no seu espectro de MQN\'s. / Perturbative studies of gravitational systems in General Relativity have gone through big developments in the last years, especially due to the evolution of the modern gravitational wave detectors. We consider in this work different perturbations in different scenarios. Firstly we consider the Vaidya metric, mainly used to describe time-dependent spherically symmetric spacetimes. Our simulations show that the frequencies of the quasinormal modes (QNM\'s) present a new inertial effect for rapidly varying mass functions, returning afterwards to the adiabatic behavior. Next we present a model for evaporating mini black holes in particle accelerators, in the context of the new gravity models with extra dimensions. With our model, based on the n-dimensional Vaidya metric, we are able to perform a QNM analysis which results in the possibility of obtaining the parameters of the black hole, such as its initial mass and the number of extra dimensions, from the experimental measurements. Finally, we present a study of a new solution, the gravastar, proposed as an alternative model for the end state of massive stars. We obtain bounds for the parameters of the solution and verify its stability against axial perturbations. Our results indicate that the gravastar\'s QNM spectrum can indeed be used to distinguish a black hole from a gravastar.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-01T15:01:05Z No. of bitstreams: 1 TES_LISIANI_SAUR_COMPLETO.pdf: 5532574 bytes, checksum: 990865e2748aa19880737e88991ec082 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T15:01:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TES_LISIANI_SAUR_COMPLETO.pdf: 5532574 bytes, checksum: 990865e2748aa19880737e88991ec082 (MD5) Previous issue date: 2017-01-12 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul (FAPERGS) / Post-traumatic stress disorder (PTSD) is a neuropsychiatric condition related to exposure to a traumatic event. It is clinically characterized by several debilitating symptoms including frequent re-experiencing of the traumatic event, avoidance bahavior, hypervigilance, and cognitive and mood changes among others. Not all individuals exposed to severe traumatic experiences develop PTSD. This psychopathology affects a vulnerable subpopulation of individuals confronted with a stressful experience that exceeds their capacity to cope. In this sense, it has been argued that PTSD can be considered a fear-related disorder. Thus, the brain regions most widely studied in this psychopathology are the prefrontal cortex, the hippocampus and the amygdala, because they are related to the storage and consolidation of new memories including emotional memories, such as fear and anger. Due to the complex clinical presentation of PTSD and its very variable symptoms, it is considered a condition to treat. Ketamine is an NMDA receptor antagonist that has shown promising effects in the treatment of depression. However, because it produces dissociative and psychotic effects, there is a concern this drug might be related with increased PTSD symptoms. One of the most widely used animal models to mimic the behavioral and neurochemical changes of PTSD is the inescapable footshock. In the first part of this study, we observed significant behavioral and histological changes caused by exposure to footshock. Animals with PTSD exhibited longer freezing bouts when re-exposed to the same aversive context, as well as increased pellet production. In addition, important changes were observed in astrocytes from the hippocampal CA1 region of these animals, such as decreased astrocytic density, ramification and fewer primary processes. Furthermore, the polarity of the astrocytes was also changed when compared to control animals. In the second part of this study, we analyzed the effects of ketamine on this animal model. Since not all animals have the same response during the re-exposure to aversive environment, that is, the animals have individual differences in their susceptibility to traumatic stress, we decided to separate the animals with PTSD into two groups: those with an extreme behavioral response (EBR) and those with a minimal behavioral response (MBR). Furthermore, the glucose metabolism and the BDNF levels in the frontal cortex, hippocampus and amygdala were analyzed 8 and 9 days after PTSD induction, respectively. BDNF levels were analyzed through biochemical assays and glucose metabolism was analyzed by 18F-FDG-microPET, which measures the glucose uptake in tissues, in other words, the metabolic demand. We observed that animals with PTSD classified as EBR showed an increase in freezing behavior and the treatment with ketamine worsened that behavioral response, that is, the ketamine worsened the PTSD symptoms. However, no changes were observed in BDNF levels or glucose metabolism. These results demonstrate that footshock as an animal model of PTSD induced significant behavioral and astrocytic alterations. We also observed that ketamine worsened the PTSD symptoms and that, as is the case with humans, not all individuals that are exposed to a traumatic stress develop PTSD. However, this animal model does not seem to be related to long-term changes in BDNF levels or glucose metabolism. / O transtorno do estresse p?s-traum?tico (Post-Traumatic Stress Disorder - PTSD) ? uma doen?a neuropsiqui?trica relacionada ? exposi??o a um acontecimento traum?tico. O PTSD ? caracterizado clinicamente por uma s?rie de sintomas debilitantes incluindo a reviv?ncia frequente do evento traum?tico, fuga de est?mulos associados ao trauma, hipervigil?ncia, mudan?as de cogni??o e humor entre outros. Nem todos os indiv?duos expostos a graves experi?ncias traum?ticas desenvolvem PTSD, esta psicopatologia afeta uma subpopula??o de indiv?duos vulner?veis cuja exposi??o a uma experi?ncia estressante excede sua capacidade de adapta??o. Neste sentido, foi argumentado que o PTSD pode, pelo menos em parte, ser um dist?rbio relacionado ao medo. Assim, as regi?es encef?licas mais amplamente estudadas nesta psicopatologia s?o o c?rtex pr?-frontal, o hipocampo e a am?gdala, pois s?o regi?es relacionadas com os processos de armazenamento e consolida??o de novas mem?rias incluindo mem?rias emocionais, tais como de medo e raiva. Devido ? complexa apresenta??o cl?nica do PTSD e a sua sintomatologia muito vari?vel esta ainda ? uma doen?a classificada como de dif?cil tratamento. A cetamina ? um f?rmaco antagonista de receptores NMDA que tem demonstrado promissores efeitos no tratamento da depress?o, entretanto, por ser uma droga que produz efeitos dissociativos e psic?ticos, existe a preocupa??o de que esta droga possa estar relacionada com o aumento dos sintomas do PTSD. Um dos modelos animais mais amplamente utilizados para mimetizar as altera??es comportamentais e neuroqu?micas do PTSD ? o choque inescap?vel ?nico. Na primeira parte do trabalho observamos importantes altera??es comportamentais e histol?gicas provocadas pela exposi??o ao choque nas patas. Os animais com PTSD apresentaram um maior comportamento de ?freezing? quando reexpostos ao mesmo contexto aversivo, bem como maior produ??o de bolos fecais. Al?m disso, importantes altera??es foram observadas nos str?citos da regi?o CA1 do hipocampo destes animais como: diminui??o na densidade, arboriza??o e quantidade de processos prim?rios. Ademais, a polaridade astrocit?ria tamb?m foi alterada em rela??o aos animais controle. Na segunda parte do trabalho analisamos os efeitos da cetamina sobre este modelo animal. Como nem todos os animais apresentam a mesma resposta durante a reexposi??o ao contexto aversivo, ou seja, os animais apresentam diferen?as individuais na sua susceptibilidade ao estresse traum?tico, n?s decidimos separar os animais com PTSD em dois grupos: aqueles que apresentaram uma resposta comportamental exagerada (Extreme Behavioral Response - EBR) e aqueles que apresentaram uma resposta comportamental m?nima (Minimal Bahavioral Response - MBR). Al?m disso, o metabolismo da glicose e os n?veis de BDNF no c?rtex frontal, hipocampo e am?gdala foram analisados oito e nove dias ap?s a indu??o do PTSD, respectivamente. Os n?veis de BDNF foram analisamos atrav?s ensaios bioqu?micos e o metabolismo da glicose foi analisado por meio do 18FFDG- microPET que avalia o consumo da glicose nos tecidos. Observamos que os animais com PTSD classificados como EBR apresentaram um aumento no comportamento de freezing e que o tratamento com cetamina piorou a resposta comportamental, ou seja, a cetamina agravou os sintomas do PTSD. Entretanto, nenhuma altera??o foi observada nos n?veis de BDNF e no metabolismo da glicose. Estes resultados demonstram que o choque nas patas, como modelos de PTSD em animais, induz importantes altera??es comportamentais e astrocit?rias. Observamos tamb?m que a cetamina piora os sintomas do PTSD e que, tal qual observado em humanos, nem todos os indiv?duos expostos a um estresse traum?tico desenvolvem os sintomas. Contudo, este modelo experimental de PTSD parece n?o estar relacionado com altera??es de longo-prazo nos n?veis de BDNF e metabolismo da glicose.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-29T13:54:15Z No. of bitstreams: 1 DIS_MAURICIO_BOFF_DE_AVILA_COMPLETO.pdf: 2632464 bytes, checksum: 1a170d33bfad88ea8a7aba65cb0f4bea (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-29T13:54:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DIS_MAURICIO_BOFF_DE_AVILA_COMPLETO.pdf: 2632464 bytes, checksum: 1a170d33bfad88ea8a7aba65cb0f4bea (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-29T13:54:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_MAURICIO_BOFF_DE_AVILA_COMPLETO.pdf: 2632464 bytes, checksum: 1a170d33bfad88ea8a7aba65cb0f4bea (MD5) Previous issue date: 2017-03-20 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Microorganisms, in general, are the major agents of disease in humans. Data from the Brazilian Ministry of Health show bacterial diseases as the main causes of death in the country. In the therapy of these organisms, antibiotics are considered the most successful chemotherapy methods of 21st century medicine, as they represent the first, and only, line of combat against bacterial diseases. The development of new antibiotic drugs is becoming increasingly necessary, as bacterial resistance rates become higher each year. At this point, shikimate pathway is attractive to this type of research, since it is considered an essential pathway for the maintenance of these organisms in the environment, besides being absent in animals. The pathway is responsible for the formation of chorismate, precursor of aromatic amino acids (Phe, Trp and Tyr), folic acid and ubiquinones in the groups of organisms that presents it. The third reaction of the shikimate biosynthetic pathway is performed by the enzyme DHQD. In this step the reversible dehydration of the DHQ molecule is performed aiming to transform into 3-dehydroshikimate, the focus reaction of this study. In the search for new DHQD inhibitors, docking simulations were performed against the three-dimensional structure of a target protein, since it is a process that seeks to find, among possible orientations/conformations of a ligand in the active site, the one that presents the lower binding energy and, consequently, greater affinity. In addition to the docking simulations, machine learning methods were used to formulate polynomial scoring functions, based on the MVD scoring functions, which were able to predict protein/binder affinity. At the end of all the simulations and tests carried out throughout the project, we conclude that the Polscore56 equation was the most skilled to predict the affinity between the active site of DHQD and tested compounds. For this polynomial, the results of test set (? = 0,900; p-value = 0,037), AUC (74,686%), EF1 (540) and EF2 (159,23) were, in most of the categories evaluated, the best, confirming the formulated hypotheses on the equation and indicating it for further studies with the enzyme. / Microrganismos, em geral, apresentam-se como os principais agentes de doen?as em seres humanos. Dados do Minist?rio da Sa?de Brasileiro demonstram doen?as bacterianas como as principais causas de morte no pa?s. Na terap?utica desses organismos, os antibi?ticos s?o considerados os m?todos quimioter?picos de maior sucesso da medicina do s?culo XXI, pois representam a primeira, e ?nica, linha de combate contra doen?as bacterianas. O desenvolvimento de novas drogas antibi?ticas torna-se cada vez mais necess?rio, uma vez que os ?ndices de resist?ncia bacteriana se tornam mais altos a cada ano. Nesse ponto, a rota metab?lica do chiquimato ? atraente a esse tipo de pesquisa, por ser considerada uma via essencial para a manuten??o desses organismos no ambiente, al?m de estar ausente em animais. A via ? respons?vel pela forma??o do corismato, precursor de amino?cidos arom?ticos (Phe, Trp e Tyr), ?cido f?lico e ubiquinonas nos grupos de seres vivos onde est? presente. A terceira rea??o da via biossint?tica do chiquimato ? realizada pela enzima DHQD. Nesse passo ? realizada a desidrata??o revers?vel da mol?cula DHQ visando transform?-la em 3-desidrochiquimato, rea??o foco desse estudo. Na busca por novos inibidores de DHQD foram realizadas simula??es de docking de pequenos ligantes contra a estrutura tridimensional de uma prote?na alvo, pois ? um processo onde se visa encontrar, entre as poss?veis orienta??es/conforma??es de um ligante no s?tio ativo, aquela que apresenta a menor energia de liga??o e, consequente, maior finidade. Al?m das simula??es de docking, foram realizados m?todos de Aprendizagem de M?quina na formula??o de fun??es escores polinomiais, a partir de fun??es escores presentes no MVD, que fossem capazes de prever a afinidade entre prote?na/ligante. Ao final de todas as simula??es e testes realizados ao longo do projeto, chegamos ? conclus?o de que a equa??o Polscore56 apresentou-se como a mais h?bil para prever a afinidade entre o s?tio ativo de DHQD com compostos testados. Para esse polin?mio os resultados de test set (? = 0,900; p-value = 0,037), AUC (74,686%), EF1 (540) e EF2 (159,23) foram, na maioria das categorias avaliadas, os melhores, confirmando as hip?teses formuladas sobre a equa??o e indicando-a para estudos posteriores com a enzima.

Submitted by PPG Biologia Celular e Molecular (bcm@pucrs.br) on 2017-07-24T18:23:29Z No. of bitstreams: 1 RAFAEL_SANGUINETTI_CZEPIELEWSKI_TES.pdf: 5487109 bytes, checksum: 88dbb99b9597e08253e2832cc01ccfce (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-07-25T17:50:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RAFAEL_SANGUINETTI_CZEPIELEWSKI_TES.pdf: 5487109 bytes, checksum: 88dbb99b9597e08253e2832cc01ccfce (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-25T18:00:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RAFAEL_SANGUINETTI_CZEPIELEWSKI_TES.pdf: 5487109 bytes, checksum: 88dbb99b9597e08253e2832cc01ccfce (MD5) Previous issue date: 2016-03-18 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Tumor microenvironment and inflammatory diseases promote alterations in our immune system along with their development. Several molecules are implicated in this modulation and are therefore considered therapeutic targets. Gastrin-releasing peptide (GRP) is produced in tumors where it promotes cellular proliferation. It is also correlated with chronic diseases, as in rheumatoid arthritis and asthma, and in the acute condition of sepsis. Recently, our group found a direct GRP action over neutrophils, promoting migration. This work aimed to study the interface between GRP-producing tumors and the recruitment of immune cells, as well as extend the cellular studies about neutrophil activation and migration processes promoted by the peptide. In tumors, we observed that a lung adenocarcinoma cell line does not proliferate in response to GRP. Yet, it is induced to migrate when exposed to the peptide, indicating a potential role for GRP in metastasis of this type of cancer. In our tumor immunology studies, we established a novel in vivo model by overexpressing GRP in a melanoma cell line (B16F10). We observed the augment of infiltrating inflammatory monocytes in the tumor microenvironment of these tumors. In parallel, we verified that reactive oxygen species production and migration in response to GRP is dependent of the NADPH oxidase complex. GRP stimulation promotes an intense activation, which culminates in neutrophil extracellular traps (NETs) release. In addition, the GRP receptor (GRPR) antagonist RC-3095 presented anti-inflammatory potential, inhibiting neutrophil migration towards IL-8 and reducing the extent of acetaminophen-induced liver damage. This effect was due to motility alterations in infiltrating neutrophils within the tissue and reduction of cell adhesion molecules. The results presented herein demonstrate the wide panorama of GRP?s interactions in tumor and immune biology. / O microambiente tumoral e as doen?as inflamat?rias promovem altera??es nas c?lulas do nosso sistema imune ? medida que progridem. Diversas mol?culas est?o envolvidas nessa modula??o, e por isso s?o alvos terap?uticos. O pept?deo liberador de gastrina (GRP) ? produzido por tumores, onde promove prolifera??o celular. Este tamb?m est? correlacionado com doen?as cr?nicas como a artrite reumatoide e asma, e em doen?as agudas, como a sepse. Recentemente, nosso grupo descobriu a??o direta do GRP em neutr?filos, promovendo indu??o de migra??o. O presente trabalho se prop?s a estudar a interface entre tumores produtores de GRP e o recrutamento celular, assim como aprofundar os estudos celulares sobre os processos de ativa??o e migra??o de neutr?filos promovidos pelo pept?deo. Em tumores, observamos que uma linhagem de adenocarcinoma pulmonar n?o prolifera quando exposto ao GRP, por?m ? induzida a migrar quando exposta ao pept?deo, estabelecendo um potencial papel deste na promo??o de met?stases para esse tipo tumoral. Na interface da imunologia tumoral, atrav?s do desenvolvimento de um modelo in vivo de superexpress?o de GRP em melanoma murino (B16F10), observamos que esse aumento do GRP induz a infiltra??o de mon?citos inflamat?rios no microambiente tumoral. Em paralelo, verificamos que a produ??o de esp?cies reativas de oxig?nio e a migra??o em dire??o ao GRP s?o dependentes do complexo NADPH oxidase. Esse est?mulo promove ativa??o intensa, culminando na produ??o de redes extracelulares de neutr?filos (NETs). J? o antagonista do seu receptor, GRPR, apresentou potencial antiinflamat?rio, sendo capaz de inibir a migra??o neutrof?lica via modula??o de IL-8 e reduzindo a extens?o da les?o hep?tica induzida por paracetamol (acetaminofeno), alterando a motilidade dos neutr?filos no tecido e a express?o de mol?culas de ades?o. Assim, os resultados aqui apresentados demonstram um panorama amplo da fun??o do GRP na biologia tumoral e no sistema imune.

Submitted by PPG Biologia Celular e Molecular (bcm@pucrs.br) on 2017-07-11T14:38:07Z No. of bitstreams: 1 NATALIA_ELTZ_SILVA_DIS.pdf: 1036979 bytes, checksum: 23cdf77b8842f9e9ade0b13e6f7bc111 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-07-28T17:40:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 NATALIA_ELTZ_SILVA_DIS.pdf: 1036979 bytes, checksum: 23cdf77b8842f9e9ade0b13e6f7bc111 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-28T17:47:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 NATALIA_ELTZ_SILVA_DIS.pdf: 1036979 bytes, checksum: 23cdf77b8842f9e9ade0b13e6f7bc111 (MD5) Previous issue date: 2017-03-08 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Aging-related diseases are becoming more common. Alzheimer's disease (AD), the most prevalent form of dementia, includes as initial symptoms cognitive deficits that are attributed to the toxic effects of amyloid? peptide (A?) that accumulates in senile plaques and neurofibrillary tangles composed of hyperphosphorylated tau protein. The amyloid cascade initially proposed to explain the effects of A? pointed to the plaques as the most toxic form of the A? molecule responsible for neuronal dysfunction and death. Recently, several evidences point to the increased toxicity of the soluble forms of the peptide. A better understanding of the dynamics of amyloid aggregation, clearance and toxic potential of the soluble versions may foster significant advances in the understanding AD mechanisms and the identification of potential targets for AD therapies. In this study we used the zebrafish as a model. 24-hour embryos received intracerebroventricular injection of human A?1-42 prepared to have different aggregation potentials: monomeric, oligomeric and plaqueforming. At 5 days post-fertilization (dpf), quantification of A?1-42 levels demonstrated a remnant increase in peptide levels in the animals injected with the solution that favored plaque formation. After monitoring for embryotoxic and teratogenic effects, 5dpf the animals were also evaluated in relation to general physiological aspects and their cognitive ability. Although the injection did not significantly impact animal survival or exploratory ability, the oligomeric solution induced specific cognitive deficits in relation to the vehicleinjected control. Together these results support the revised version of the amyloid cascade in which, although the presence of plaques corresponds to a greater accumulation of A?1- oligomeric forms may induce significant neurotoxic effects and result in cognitive deficits specially at disease?s early stages. / Com o envelhecimento da popula??o, doen?as relacionadas com o envelhecimento v?m se tornando mais comuns. A Doen?a de Alzheimer (DA), a forma prevalente de dem?ncia, inclui como sintomas iniciais deficit cognitivos que s?o atribu?dos a efeitos t?xicos de pept?deo ?- amiloide (A?) que se acumula em placas senis e emaranhados neurofibrilares constitu?dos pela prote?na tau hiperfosforilada. A cascata amiloide inicialmente proposta para explicar os efeitos do A? apontava para as placas de dep?sito de A?1-42 como a forma t?xica da mol?cula respons?vel pela disfun??o e morte neuronal. Recentemente diversas evid?ncias apontam para a toxicidade das vers?es sol?veis do pept?deo antes da agrega??o em placas. O melhor entendimento da din?mica de agrega??o do amiloide, limpeza e potencial t?xico das vers?es sol?veis pode permitir significativos avan?os no conhecimento dos mecanismos da doen?a e a identifica??o de potenciais alvos para terapias da DA. Neste estudo utilizamos o tele?steo zebrafish como modelo para a caracteriza??o destes processos. Embri?es com 24 horas receberam inje??o intracerebroventricular de A?1-42 humano preparado de forma a ter diferentes potenciais de agrega??o: monom?rica, oligom?rica e formadora de placas. Ao atingirem 5 dias p?s-fertiliza??o (dpf), a quantifica??o dos n?veis de A?1-42 demonstrou um aumento remanescente dos n?veis do pept?deo nos animais injetados com a solu??o que favorecia a forma??o de placas. Ap?s monitorarmos eventuais efeitos embriot?xicos e teratog?nicos, ao atingirem 5dpf, os animais foram tamb?m avaliados em rela??o a aspectos fisiol?gicos gerais e sua capacidade cognitiva. Embora a inje??o n?o tenha impactado significativamente a sobreviv?ncia dos animais ou a capacidade explorat?ria, a inje??o da solu??o oligom?rica induziu deficit cognitivos espec?ficos em rela??o ao controle injetado com ve?culo. Juntos, estes resultados suportam a vers?o revisada da cascata amiloide na qual, embora a presen?a de placas corresponda a um maior ac?mulo de A?1-42, a presen?a de vers?es oligom?ricas pode induzir efeitos neurot?xicos significativos e resultar em deficit cognitivos, especialmente nos est?gios iniciais da doen?a.

Submitted by PPG Biologia Celular e Molecular (bcm@pucrs.br) on 2018-02-26T11:20:29Z No. of bitstreams: 1 FERNANDA_ROSA_SAWITSKI_TES.pdf: 5519043 bytes, checksum: d8234f6f341fd9d5f2c4a39db88b714c (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2018-02-26T20:03:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FERNANDA_ROSA_SAWITSKI_TES.pdf: 5519043 bytes, checksum: d8234f6f341fd9d5f2c4a39db88b714c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-26T20:08:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FERNANDA_ROSA_SAWITSKI_TES.pdf: 5519043 bytes, checksum: d8234f6f341fd9d5f2c4a39db88b714c (MD5) Previous issue date: 2017-11-07 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Genes related to externally visible characteristics (EVC) present a great importance for the prediction of skin and eye colors in humans. In this study, we tested the ability of a set of SNPs in pigment-related genes to predict skin and eye colors in an admixed south Brazilian population. First, we used the Cinderella - Tiana - Snow White model to analyze the allelic distribution of eight biallelic SNPs in pigment-related. Cinderella and Tiana patterns have respectively low and high melanin content in skin and eyes; Cinderella has white skin and blue eyes (low melanin content; LMC) and Tiana has dark skin and eyes (high melanin content; HMC). Comparative investigation between frequencies of genetic variants in Cinderella-Like versus Tiana-Like subjects may indicate which polymorphic variant is associated with melanin synthesis in skin and eyes. Coordinately, studies with Snow White-Like subjects may be informative to reveal any tissue-specific expression, since these individuals have both white skin (LMC) and dark eyes (HMC). Based on allele frequencies of different human popullations, allele ?L? was used for the alleles associated with low melanin content populations (Cinderela-like subjects), and allele ?H? was used for the alleles associated with high melanin content populations (Tiana-like subjects). Allelic distribution of eight SNPs showed that 100% of Cinderella- like subjects (N= 73) had less than eight H alleles, and 82% of Tiana-Like subjects (N= 61) had eight or more H alleles. The AUC (Area Under the Receiver Operating Characteristic Curve) value was 0.99, and the calculation of PGL (Pathway Genetic Load) and GP (Genetic Probability) showed that the SNP set presented 93% and 91% concordance between DNA genotype and phenotypes, respectively. Factorial discriminant analyses (FDA) performed in the Snow White group (light skin and dark eyes; N= 116) showed an association between SNPs rs16891982 (SLC45A2), rs8045560 (MC1R), rs1426654 (SLC24A5), rs2733832 (TYRP1), and rs1042602 (TYR) and the Cinderella cluster for skin phenotype, and an association between SNPS rs4778138 (OCA2), rs12913832 (HERC2), and rs916977 (HERC2) and the Tiana cluster for eye phenotype. Lastly, we studied 436 South Brazilian subjects with different skin and eye colors to construct a multinomial logistic regression model able to predict phenotype. The model was tested in 40 random subjects to measure the efficiency of the prediction. The data presented 93% concordance between the predicted and the observed phenotype, showing the successful phenotype prediction of the model in South Brazilian individuals. This is important since Brazil has an ethnically mixed population in which genomic structure may favor epistatic and pleiotropic effects not observed in populations that are more homogeneous. The analyses presented here are an important contribution to forensic DNA phenotyping scenario. / Os genes relacionados a caracter?sticas externamente vis?veis (EVC) apresentam grande import?ncia para a previs?o de cores de pele e olho em humanos. Neste estudo, testamos a capacidade de um conjunto de SNPs em genes relacionados ? s?ntese de pigmento melanina para prever cores de pele e olho em uma popula??o sul-brasileira. Inicialmente, utilizamos o modelo Cinderela - Tiana - Neve Branca para analisar a distribui??o al?lica de oito SNPs bial?licos associados ? produ??o da melanina. Os padr?es Cinderela e Tiana possuem respectivamente baixo e alto conte?do de melanina na pele e nos olhos; Cinderela tem pele branca e olhos azuis (baixo conte?do de melanina, LMC) e Tiana tem pele e olhos escuros (alto conte?do de melanina, HMC). A investiga??o comparativa entre frequ?ncias de variantes gen?ticas em indiv?duos com Cinderela-Like versus Tiana-Like pode indicar qual variante polim?rfica est? associada ? s?ntese de melanina na pele e nos olhos. De forma coordenada, os estudos com indiv?duos Branca de Neve-Like podem ser informativos para revelar a express?o tecido-espec?fica, uma vez que esses indiv?duos t?m pele branca (LMC) e olhos escuros (HMC). Com base em frequ?ncias de alelos de diferentes popula??es humanas, o nome alelo "L" foi utilizado para os alelos associados a popula??es de baixo conte?do de melanina (indiv?duos Cinderela-Like) e o nome alelo "H" foi utilizado para os alelos associados a popula??es de alto conte?do de melanina (Indiv?duos Tiana-Like). A distribui??o al?lica de oito SNPs mostrou que 100% de indiv?duos com Cinderela-Like (N= 73) tinham menos de oito alelos H e 82% de indiv?duos Tiana-Like (N= 61) tinham oito ou mais alelos H. O valor AUC (Area Under the Receiver Operating Characteristic Curve) foi de 0,99 e o c?lculo de PGL (Pathway Genetic Load) e GP (Probabilidade Gen?tica) mostrou que o conjunto de SNP apresentou concord?ncia de 93% e 91% entre gen?tipo e fen?tipo, respectivamente. As an?lises discriminantes fatoriais (FDA) realizadas no grupo Branca de Neve-Like (pele clara e olhos escuros; N= 116) mostraram associa??o positiva entre SNPs rs16891982 (SLC45A2), rs8045560 (MC1R), rs1426654 (SLC24A5), rs2733832 (TYRP1) e rs1042602 (TYR) e o cluster de Cinderela para o fen?tipo da pele, e associa??o positiva entre SNPS rs4778138 (OCA2), rs12913832 (HERC2) e rs916977 (HERC2) e o cluster Tiana para o fen?tipo dos olhos. Por fim, estudamos 436 sujeitos sul-brasileiros com diferentes cores de pele e de olhos para construir um modelo de regress?o log?stica multinomial capaz de prever o fen?tipo. O modelo foi testado em 40 indiv?duos aleat?rios para medir a efici?ncia da predi??o. Os dados apresentaram concord?ncia de 93% entre o fen?tipo previsto e observado, mostrando a previs?o fenot?pica bem-sucedida do modelo em indiv?duos sul-brasileiros. Isso ? importante, uma vez que o Brasil tem uma popula??o etnicamente mista, na qual a estrutura gen?mica pode favorecer os efeitos epistaticos e pleiotr?picos n?o observados em popula??es mais homog?neas. As an?lises aqui apresentadas s?o uma importante contribui??o para a ?rea da fenotipagem por DNA.

Submitted by PPG Biologia Celular e Molecular (bcm@pucrs.br) on 2018-03-06T18:10:51Z No. of bitstreams: 1 ANDRESSA_VON_WURMB_HELRIGUEL_LEITE_DIS.pdf: 1584575 bytes, checksum: 5f9a44ec42089e160df54cc84eaadb9a (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2018-03-07T14:04:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ANDRESSA_VON_WURMB_HELRIGUEL_LEITE_DIS.pdf: 1584575 bytes, checksum: 5f9a44ec42089e160df54cc84eaadb9a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-07T14:11:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ANDRESSA_VON_WURMB_HELRIGUEL_LEITE_DIS.pdf: 1584575 bytes, checksum: 5f9a44ec42089e160df54cc84eaadb9a (MD5) Previous issue date: 2017-08-25 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Tomato (Solanum lycopersicum) cultures are frequently attacked by many pathogens, leading to yield losses. Among the pathogens, the fungus Alternaria solani (?Early blight? disease) can cause significant yield reductions and decreases the fruit quality. Due to the high susceptibility of tomato to fungal pathogens, the agricultural practices include the intensive use of agrochemicals, which may result in fruits with high levels of residual pesticides and higher production costs. The promotion of plant defense system represents an additional tool for disease control and plant growth management. Some rhizobacteria have been shown the ability to affect plant development and modulate plant defense against pathogens. Among those bacteria, the genus Streptomyces is able to synthesize molecules that directly interfere with growth, through auxin and ACC deaminase production, and indirectly, through antibiotics and siderophores synthesis. The aim of this work was to select Streptomyces (CLV04, CLV05 and CLV07) with the ability to promote seed germination and plant growth, as well as improve tomato plant resistance against A. solani. Results showed that CLV07 delayed the initial seed germination, but it did not impair the final germination process. However, CLV04, CLV05 and CLV07 reduced the early root and shoot growth. All these rhizobacteria produced high auxin levels. CLV07 was efficient for inducing plant resistance against A. solani. Furthermore, all CLVs showed antagonism by competition, decreasing the A. solani growth. Taking together all results, Streptomyces tested were deleterious for seed and initial plant growth, but CLV07 showed a potential to be used for inducing plant resistance. However, the inoculation of these rhizobacteria on seeds is not recommended. / O tomateiro (Solanum lycopersicum) ? constantemente atacado por diversos pat?genos, levando a perdas de produtividade. Dentre os principais pat?genos, destaca-se o fungo Alternaria solani que causa a doen?a ?pinta-preta? (?Early blight?), capaz de reduzir a produ??o e/ou levar ? forma??o de frutos de baixa qualidade. Devido ? grande susceptibilidade do tomateiro a pat?genos, as pr?ticas agr?colas incluem o uso intensivo de agroqu?micos que resultam, frequentemente, em tomates com altos n?veis residuais de pesticidas. A promo??o do crescimento e da defesa vegetal utilizando microrganismos representa uma ferramenta para o manejo do tomateiro. Dentre as diversas rizobact?rias com capacidade de modular o crescimento e a defesa vegetal, o g?nero Streptomyces vem se destacando. Estas bact?rias s?o capazes de sintetizar mol?culas que interferem tanto diretamente no crescimento, como a auxina e a ACC desaminase, quanto indiretamente, atrav?s da produ??o de antibi?ticos e sider?foros. Pretendeu-se, neste trabalho, selecionar isolados de Streptomyces (CLV04, CLV05 e CLV07) com capacidade de promover a germina??o e o crescimento de plantas de tomate, al?m de aumentar a resist?ncia vegetal contra A. solani. Os resultados demonstram que o CLV07 causou retardo na germina??o, mas n?o reduziu a taxa final de germina??o. Apesar das rizobact?rias CLV04, CLV05 e CLV07 produzirem elevados n?veis de auxina, elas causaram a redu??o do crescimento tanto da raiz quanto da parte a?rea de pl?ntulas de tomate cultivadas in vitro. O CLV07 foi eficiente na promo??o da defesa de plantas de tomate contra A. solani. Todas as rizobact?rias apresentaram antagonismo por competi??o, reduzindo o crescimento do mic?lio do fungo A. solani. Considerando todos os resultados, as diferentes bact?rias Streptomyces foram prejudiciais ? germina??o e ao crescimento inicial de pl?ntulas de tomate. Desta forma, n?o ? recomend?vel a utiliza??o destas bact?rias em sementes e pl?ntulas jovens. Contudo, o CLV07 apresenta potencial para ser utilizado para a indu??o de resist?ncia de plantas de tomate contra o pat?geno A. solani.