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Populações microbianas e antagonismo de actinobactérias sobre rizóbios em solos do semiárido / Microbial populations and antagonistic effect of actinobacteria on rhizobia in semiarid soilsLima, José Vinícius Leite January 2017 (has links)
LIMA, José Vinícius Leite. Populações microbianas e antagonismo de actinobactérias sobre rizóbios em solos do semiárido. 2017. 81 f. Tese (Doutorado em Ecologia e Recursos Naturais)-Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by ELAINE PEREIRA (ellainec.pereira@gmail.com) on 2017-09-19T17:31:18Z
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Previous issue date: 2017 / The structure of the communities living in the soil is driven by various mechanisms and the ecological interactions established between the living organisms. In the same way, the components of the microbiota present harmonic or non-harmonic relationships, for example, between actinobacteria and rhizobia. Interspecific competition among microorganisms occurs when many species require the same resources, and the negative effect on the availability of common resources adversely affects the others. In this context, the objective of this study was to quantify the microbial population in the soil and leaf litter in the vegetation of the caatinga and carrasco in the Brazilian semiarid region (Chapter I) and to characterize and evaluate the antagonistic effect of actinobacteria on rhizobia (Chapter II). The soil samples were collected at the Ecological Station of Aiuaba (Aiuaba, Ceará), characterized by the vegetation of caatinga and carrasco. In chapter I, the population density of the microbial community was evaluated by sampling of soil and litter in the vegetation of caatinga and carrasco at the Aiuaba Ecological Station. The microorganisms were isolated from the soil samples in flasks containing 0.8% saline solution and cultured, after consecutive dilutions, in culturing media specific to cultivable populations of total bacteria, actinobacteria, cellulolytic bacteria, phosphate solubilizing bacteria and fungi. Population estimation was then performed by standard counting on plates and the values were expressed in CFU.g-1. The microbial populations from the soil and leaf litter differed each other quantitatively and in the two vegetations, but in general were greater in the leaf litter. Thus, the knowledge of the population structure of the microbial community can be extended to the semiarid soils. In Chapter II, the strains of actinobacteria isolated in the first study were characterized and tested for “in vitro” inhibitory effect on strains of rhizobia also isolated from semiarid soils. The actinobacteria were purified in their respective culture medium (CDA medium). The strains were characterized for their color and morphology of the colonies, tolerance to pH levels, production of melanin and use of carbon sources. The “in vitro” antagonism of actinobacteria on rhizobia was evaluated in Petri dish containing yeast mannitol agar (YMA) medium by the
formation of inhibition zone. The actinobacteria and rhizobia that had greater antagonistic effect or did not presented inhibition zones were molecularly identified. Sixty strains were identified in seven genera of actinobacteria in which had tolerance to variations in pH, low melanin production and generalist use of carbon sources. It was also observed “in vitro” antagonism of actinobacteria species, standing out the genus Streptomyces, on strains of Rhizobium tropici, Bradyrhizobium yuanmingense and two other rhizobia strains not identified. This is the first work that addresses this ecological interaction between microorganisms of the Brazilian semiarid region and reveals the occurrence of new species related to this negative interaction. Thus, the presence of antagonism among these organisms may lead to “in vivo” studies, contributing to future agricultural and/or ecological uses. / A estrutura das comunidades que vivem no solo é direcionada por vários mecanismos e as interações ecológicas estabelecidas entre os organismos. Da mesma forma, os componentes da microbiota apresentam relações harmônicas ou não entre si, como por exemplo, entre actinobactérias e rizóbios. A competição interespecífica entre os micro-organismos acontece quando muitas espécies procuram pelos mesmos recursos, e o efeito depressor que cada uma tem na disponibilidade dos recursos comuns afeta adversamente os outros. Neste contexto, teve-se como objetivo neste estudo quantificar em região semiárida a população microbiana no solo e serrapilheira nas fisionomias vegetais de caatinga e carrasco (Capítulo I) e caracterizar e avaliar o efeito antagônico de actinobactérias sobre rizóbios do semiárido (Capítulo II). O estudo foi realizado na Estação Ecológica de Aiuaba (Aiuaba, Ceará) caracterizada pelas fisionomias de caatinga e carrasco. No capítulo I, avaliou-se a densidade populacional da comunidade microbiana por meio
de coleta de amostras do solo e serrapilheira nas fisionomias vegetais de caatinga e carrasco na Estação Ecológica de Aiuaba. Os micro-organismos foram isolados das amostras em solução salina 0,8% e cultivados, após diluições seriadas, em meios de cultura específicos para populações cultiváveis de bactérias totais, actinobactérias, bactérias celulolíticas, bactérias solubilizadoras de fosfato e fungos. Em seguida foi realizada a contagem das populações pela contagem padrão em placas usando a técnica de espalhamento em superfície, e os valores foram expressos em UFC.g-1. As populações microbianas oriundas do solo e serrapilheira diferiram quantitativamente entre elas e nas duas fisionomias vegetais, mas no geral foram maiores na serrapilheira. Dessa forma, pode-se ampliar o conhecimento da estrutura populacional da comunidade microbiana em solos de clima semiárido. No capítulo II, caracterizaram-se as cepas de actinobactérias isoladas das populações obtidas do primeiro estudo e testou-as para efeito inibidor in vitro sobre estirpes de rizóbios também oriundas de solos semiáridos. As actinobactérias foram purificadas
no seu respectivo meio de cultura (meio CDA). As cepas foram caracterizadas quanto a atributos cromogênicos e morfológicos, para tolerância a níveis de pH, na produção de melanina e uso de fontes de carbono. O antagonismo das actinobactérias in vitro sobre rizóbios foi avaliado em meio de cultura ágar manitol levedura (YMA) pela formação de halo de inibição em placa de Petri. Em seguida, as actinobactérias e rizóbios que tiveram maior efeito antagônico ou que não formaram halo inibidor foram caracterizadas molecularmente. Foram obtidas 60 cepas identificados em sete gêneros de actinobactérias que tiveram tolerância a variações de pH, baixa produção de melanina e uso generalista de fontes de carbono. Foi observado antagonismo in vitro com formação de halo inibidor de espécies de actinobactérias, com destaque para o gênero Streptomyces, sobre os rizóbios Rhizobium tropici, Bradyrhizobium yuanmingense e outras duas estirpes não identificadas. Este é o primeiro trabalho que aborda essa relação ecológica em micro-organismos do semiárido e revela a ocorrência de novas espécies relacionados com essa interação negativa. Com isso, confirma-se a presença de antagonismo entre esses organismos que pode direcionar estudos de certificação in vivo, contribuindo para futuros usos agrícolas e/ou ecológicos.
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Embriogênese somática indireta e fusão interespecífica de protoplastos em Coffea / Indirect somatic embryogenesis and interspecific fusion of protoplasts in CoffeaCordeiro, Antônio Teixeira 01 October 1998 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-04T17:09:50Z
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Previous issue date: 1998-10-01 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Esta pesquisa foi conduzida com o objetivo de verificar a exeqüibilidade da fusão protoplástica interespecífica como ferramenta no melhoramento parassexual em Coffea. Para tanto, pretendeu-se a introgressão das resistências aos nematóides Meloidogyne incognita e M. exigua, do cultivar canéfora Apoatã, nos genótipos arábicas diplóide DH 3 e tetraplóides Catimor e Catuaí Amarelo. Com vistas à obtenção dos protoplastos, foi dado início a suspensões celulares embriogênicas a partir de calos friáveis embriogênicos induzidos de explantes foliares. Posteriormente foram estudadas, nas suspensões celulares Apoatã e DH 3 , as cinéticas do crescimento e do rendimento protoplástico em função do tempo pós-subcultura, bem como as condições de digestão enzimática da parede celular de seus agregados celulares. Foram realizados, ainda, estudos para a seleção dos heterofusionados. Embora todos os genótipos testados tenham reagido favoravelmente à formação de tecido embriogênico friável, apenas os arábicas DH 3 e Catuaí Vermelho requereram a ação conjunta de auxina e citocinina. Os demais Apoatã, Catimor e Catuaí Amarelo reagiram mais favoravelmente quando o regulador de crescimento foi apenas a citocinina BAP. As maiores freqüências de explantes com calos friáveis verificadas para os genótipos canéfora Apoatã e arábicas DH 3 , Catimor, Catuaí Amarelo e Catuaí Vermelho foram, respectivamente, 80, 60, 40, 40 e 20%. A diferenciação embriogênica dos agregados celulares, em cultura líquida, rendeu cerca de 241.000, 72.870 e 121.760 embriões g -1 MF de agregados celulares Apoatã, Catimor e DH 3 , respectivamente. As suspensões celulares Apoatã e DH 3 revelaram, imediatamente após a subcultura, uma fase exponencial de crescimento celular até um ponto de inflexão, a partir do qual as taxas de crescimento reduziram progressivamente para atingir um peso de matéria fresca dos agregados celulares assintótico. Coincidentemente, os menores rendimentos protoplásticos foram observados para tempos pós-subcultura superiores àquele do ponto de inflexão. A pré-plasmólise, a seleção dos agregados celulares de diâmetro inferior a 1 mm e a adição de cisteína 0,83 mM, durante a digestão enzimática, não interferiram no rendimento protoplástico das suspensões celulares Apoatã e DH 3 , ao contrário das concentrações das enzimas pectinases e celulase. De maneira geral, o rendimento protoplástico Apoatã, sempre inferior àquele DH 3 , foi maior quando as duas pectinases, pectoliase e macerozima, estiveram associadas à celulase, as três nas maiores concentrações testadas. Os 12 meios de cultivo de protoplastos testados não permitiram distinguir os protoplastos parentais Apoatã e DH 3 em nível de crescimento dos microcalos. Alternativamente, os inibidores metabólicos iodoacetamida e rodamina, nas respectivas concentrações de 2 e de 0,9 mM, mostraram-se eficazes em inibir a regeneração dos protoplastos parentais em microcalos. Seu aproveitamento permitiu a realização de 23 ensaios de eletrofusão interespecífica, cujos produtos, aparentemente justificados pela complementação metabólica, encontram-se em desenvolvimento com vistas à diferenciação embriogênica e regeneração de plantas. Esta última permitirá análises para verificação do potencial da fusão protoplástica no melhoramento parassexual em Coffea. / The aim of the present work was to evaluate the feasibility of interspecific protoplast fusion as a tool in the parassexual improvement in Coffea. Introgression of nematode resistance from Coffea canephora cv. Apoatã was attempted in diploid (DH 3 ) and tetraploid (Catimor and Catuaí Amarelo) C. arabica genotypes by protoplast fusion. Protoplasts were isolated from embryogenic cell suspensions initiated from leaf explants-derived friable embryogenic calli. For Apoatã and DH 3 cell suspensions the kinetics of growth and protoplast yield was evaluated as affected by the intervals of subcultures and the conditions of enzymatic digestion of the cell walls of their small cell aggregates. Investigations aiming at selection of protoplast heterofused-derived cell aggregates were also accomplished. All genotypes studied reacted favorably to the formation of friable embryogenic calli. C. arabica genotypes, DH 3 and Catuaí Vermelho, however, required the use of both auxin and cytokinin. Conversely, Apoatã, Catimor and Catuaí Amarelo presented similar morphogenetic responses when induction media were supplemented with BAP only. Frequencies of friable embryogenic calli of 80, 60, 40, 40 and 20% were obtained for Apoatã, DH 3 , Catimor, Catuaí Amarelo and Catuaí Vermelho, respectively. Embryogenic differentiation from cell aggregates, in liquid culture, produced about 241.000, 72.870 and 121.760 embryos g -1 FW for Apoatã, Catimor and DH 3 , respectively. Immediately to the subculture, Apoatã and DH 3 cell suspensions revealed a typical sigmoidal growth curve. Coincidentally, the lowest protoplast yields were observed for post-subculture intervals above the inflection point. The pre-plasmolysis, the size of the aggregates (smaller than 1 mm diameter) and the addition of cysteine 0.83 mM, during the enzymatic digestion, did not affect protoplast yield of Apoatã and DH 3 cell suspensions, unlike the concentrations of the pectinases and cellulase enzymes. In general, protoplast yields of Apoatã were always inferior to that DH 3 . High yields were achieved when the two pectinases (pectolyase and macerozyme) were combined to cellulase, at the highest tested concentrations. The twelve protoplast culture media tested did not allow any distinction between parental protoplasts Apoatã and DH 3 , at microcalli growth stages. Alternatively, the metabolic inhibitors iodoacetamide and rhodamine, at the concentrations 2 and 0.9 mM, respectively, were effective in inhibiting microcalli formation from cultured parental protoplasts. Its use allowed the accomplishment of 23 independent interspecific electrofusion assessments whose products led to the development of embryogenic differentiation. Further work will be carried out in order to characterize the putative heterofused regenerants and to examine the potential of somatic hybridization as a tool for parassexual improvement in Coffea. / Tese importada do Alexandria
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Influência da população de plantas, doses de nitrogênio e controle de doenças na produção e qualidade de grãos e sementes de arroz irrigado / Effect of plant densities, nitrogen levels and diseases control on grain yield and quality of irrigated riceMarzari, Victor 26 April 2005 (has links)
The objective of this study was to evaluate the effect of plant densities, nitrogen levels and foliar diseases control on grain yield and seed quality of irrigated rice. An experiment was conducted in Santa Maria RS Brazil, during 2003/2004 growing season aiming to evaluate the effects, plant populations, nitrogen levels and fungicide application on grain yield (Chapter I) and seed quality (Chapter II) of irrigated rice. Were evaluated grain yield and seed quality under three plant densities (150, 265 and 380 plants m-2), five nitrogen levels (0, 40, 80, 120 and 160 kg ha-1) with and without fungicide application. There was no triple interaction among the parameters evaluated. Higher plant populations resulted in fewer tillers per plant and seeds per panicle increasing interspecific competition and grain yield was not significantly affect as result os yield components compesation. Nitrogen increased seed yield up to 97 kg ha-1 wich was not affected by plant population and an hanced the nutritional quality as result of increased protein content. Diseases control had a positive effect on grain yield and quality as well as of the rice seeds by reducing its incidence and increased germination percentage. / Com o objetivo de avaliar a influência da população de plantas, doses de nitrogênio e controle de doenças sobre a produção e qualidade de grãos e sementes de arroz irrigado foi conduzido um experimento em campo na Universidade Federal de Santa Maria, RS, no ano agrícola 2003/2004. Avaliou-se a produtividade (Capítulo I) e a qualidade de grãos e sementes (Capítulo II) em função de três populações de plantas (150, 265, 380 plantas m-2), cinco doses de nitrogênio (0, 40, 80, 120 e 160 kg ha-1 de N) e o controle ou não de doenças da parte aérea. Para todas as avaliações realizadas não se verificou interação tríplice. O incremento da população de plantas diminui o número de colmos por planta e o número de grãos por panícula aumentando a competição interespecífica. A produtividade não é influenciada pela população de plantas de 150 a 380 plantas m-2, pois os componentes da produção se compensam. A aplicação de nitrogênio contribui incrementando a produção até 97 kg ha-1 de N, não sofrendo influência da população de plantas, bem como melhorando a qualidade nutricional do produto, pois se verifica um aumento no teor de proteína com o aumento da dose de N. O controle de doenças influencia positivamente a produção e qualidade de grãos e sementes de arroz através da redução da incidência e elevação do poder germinativo de sementes de arroz.
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Estrutura de comunidades de aves em remanescentes de Floresta Estacional Decidual na região do Vale do Rio Paranã - GO e TO / Ecologia de comunidades de aves do Vale do Rio Paranã - GO e TOMartins, Flávia de Campos January 2007 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2007. / Submitted by Luis Felipe Souza (luis_felas@globo.com) on 2008-12-12T17:36:23Z
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Tese_2007_FlaviaMartins.pdf: 931803 bytes, checksum: fc999341d9392992ad91f98ffedc721f (MD5) / A comunidade biológica pode ser definida como um conjunto de espécies que ocorrem em um mesmo lugar, conectados uns aos outros por suas relações de alimentação e outras interações. Uma das hipóteses mais utilizadas para explicar padrões na estruturação das comunidades é a competição interespecífica. Assim, as comunidades estruturadas por interações competitivas devem apresentar algum
limite de similaridade no uso de recursos que possa garantir a coexistência das espécies. Os objetivos gerais do trabalho são estudar e analisar a comunidade de aves no vale do Rio Paranã, GO e TO, com ênfase na floresta estacional decidual e testar a hipótese da similaridade limitante (MacArthur e Levins,
1967), que prediz que entre as espécies em uma comunidade deve haver um limite máximo na similaridade morfológica, ou seja, na utilização dos recursos. Foram amostradas com redes de neblina três
áreas de cerrado (sentido restrito) e uma de floresta estacional decidual. Capturaram-se 734 indivíduos de 102 espécies, como resultado de um esforço amostral de 4879.5 horas-rede. As espécies mais abundantes
na floresta estacional decidual de São Domingos, GO, foram Basileuterus flaveolus, Dendrocolaptes platyrostris, Thamnophilus punctatus e Sittasomus griseicapillus; no cerrado de Alvorada do Norte, GO, Columbina picui e C. squammata; no cerrado de São Domingos Amazilia fimbriata e T. punctatus e no cerrado de Paranã, TO, A. fimbriata e Elaenia chiriquensis. A comunidade com maior índice de densidade
foi a do cerrado de Paranã, nessa comunidade observou-se também o maior número de nectarívoros e frugívoros. Nos remanescentes de floresta estacional decidual de São Domingos registraram-se 134
espécies de aves, com base nos dados obtidos e no trabalho de Lopes (2004), das quais 72% têm alguma dependência de habitats florestais. No espaço morfométrico as aves insetívoras do sub-bosque, diurnas e
residentes em floresta estacional decidual, mostraram segregação morfológica e ecológica. Separaram-se no espaço morfológico espécies maiores com bicos grossos e compridos. As categorias alimentares mais significantes na ordenação das espécies foram Formicidae, Coleoptera, outros Hymenoptera e Hemíptera. Na taxocenose de arapaçus verificou-se uma maior sobreposição ecológica entre Dendrocolaptes platyrostris e Xiphorhynchus guttatus e entre Lepidocolaptes angustirostris e Campylorhamphus trochilirostris. Possivelmente entre esses pares de espécie ocorrem divergências em outras dimensões ecológicas, na seleção de hábitat e micro-hábitat, no forrageamento. Em ambas as comunidades, as características morfológicas não foram diferentes significativamente dos valores esperados em
comunidades aleatórias, não corroborando com a hipótese da similaridade limitante. As comunidades analisadas não demonstram uma estruturação com base na segregação por competição de recursos. Fatores históricos e evolutivos podem ter contribuído mais essencialmente para a estruturação das comunidades.
___________________________________________________________________________________ ABSTRACT / A community can be defined as a group of species that live in the same place, conected by feeding relationships and other interactions. One hypothesis used to explain community structure patterns is that of interspecific competition. Communities structured by competition must have a limit in terms of the similarity in resource utilization, which should guarantee the coexistence of the different species. The objectives of this study were: (1) to study and analyze the bird communities in the Cerrado biome of the
Paranã river valley, GO and TO, especialy in dry forests; and (2) to test the similarity limiting hypothesis (MacArthur and Levins, 1967), that suggests that there is a maximum threshold in the morphological similarity among species, that is, in the associated use of resources. Mist nets were used in three areas of cerrado and in one of dry forest. A total of 734 individuals from 102 species were caught, as a result of 4879.5 net-hours. The highest species density in the dry forests of São Domingos, GO, were for the
species: Basileuterus flaveolus, Dendrocolaptes platyrostris, Thamnophilus punctatus and Sittasomus griseicapillus. In the cerrado area, Alvorada do Norte, GO, the most abundant species were Columbina
picui and C. squammata. In the cerrado of São Domingos, the highest species densities were for Amazilia fimbriata and T. punctatus and in the cerrado of Paranã, TO, A. fimbriata and Elaenia chiriquensis. The highest density index occurred for the Paranã cerrado community, and a higher occurrence of
nectarivorous and frugivorous species was also recorded. In the dry forest fragments 134 birds were captured (this study and based upon Lopes (2004)). Of these, 72% are dependent upon forest habitats. Analyses show that the insectivorous, understory birds in the dry fores are ecologically and morphologically segregated in their morphometric space, and larger-bodied species with larger and longer
beaks were separated from other species. The feeding categories of greater significance were Formicidae, Coleoptera, other Hymenoptera and Hemiptera. For the woodcreeper community we verified a higher
ecological overlap between Dendrocolaptes platyrostris and Xiphorhynchus guttatus and between Lepidocolaptes angustirostris and Campylorhamphus trochilirostris. It is possible that between these paired species there occur other differences in ecological parameters, habitat and micro-habitat selection, and in foraging. The communities evaluated to not exhibit a structural organization based upon segregation due to competition for resources. Historical and evolutionary factors may have contributed in
a signficant manner toward the structural organization of these communities.
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Avaliação experimental da ocorrência de competição contemporânea entre espécies endêmicas de lagartos das dunas do Médio São Francisco, Ba.Gomes, Alexander Silveira January 2005 (has links)
p. 1-36 / Submitted by Santiago Fabio (fabio.ssantiago@hotmail.com) on 2013-04-10T19:35:49Z
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Previous issue date: 2005 / A existência de competição interespecífica está associada à sobreposição no uso de recursos limitados por espécies e à redução na disponibilidade de recurso para uma espécie pelo uso de recursos ou a apropriação antecipada por uma outra. Interações competitivas podem produzir um padrão de uso diferencial de recursos pelas espécies envolvidas, como aquele previamente detectado entre Tropidurus psammonastes (Tropiduridae) e Eurolophosaurus divaricatus (Tropiduridae) e Cnemidophorus sp n (Teiidae), espécies endêmicas de lagartos das dunas de Ibiraba, Bahia. Para testar as hipóteses de que a presença de T. psammonastes reduz a densidade local das outras duas espécies (o que indicaria existência de competição contemporânea forte) e o padrão de uso de micro-hábitat das mesmas (o que indicaria existência de competição contemporânea, embora fraca), realizei um experimento de campo com duração de 76 dias durante um período do ano em que o potencial para interações competitivas é alto (i.e., entre o final de seca e início das chuvas). Manipulei a densidade de T. psammonastes pela remoção de seus indivíduos de quatro unidades amostrais experimentais, avaliando o efeito sobre as outras duas espécies em comparação a quatro unidades amostrais não alteradas. Na situação controle, o padrão de uso de micro-hábitat das espécies foi o mesmo descrito em um estudo realizado entre 1995 e 1996 na mesma área. As situações controle e experimental foram comparadas através de testes de randomização (MRPP) com base nos dados totais e da última metade do experimento. Não detectei diferença significativa das densidades entre as unidades amostrais controle e experimentais para nenhuma das duas espécies, indicando que, caso estivesse ocorrendo competição, ela não foi suficientemente forte para gerar efeitos de curto prazo. Não detectei diferenças dos padrões de uso multivariado de 2micro-hábitat pelas espécies entre controle e experimento. Como as disponibilidades de micro-hábitat não variaram entre tratamentos, esse resultado indica que não fui capaz de detectar mesmo interações competitivas fracas entre T. psammonastes e as demais espécies. Um estudo anterior refutou a hipótese de que o padrão diferencial de uso de recursos por essas espécies pode ser explicado por inércia filogenética. O presente estudo corroborou o padrão de uso de micro-hábitat descrito anteriormente para as espécies, sugerindo que ele não é estocástico, e refutou a hipótese de que o padrão deriva de competição contemporânea. Desse modo, esse conjunto de evidências sugere que o padrão observado pode derivar de interações ecológicas competitivas passadas, o que, embora não testável, é plausível visto que as espécies envolvidas são endêmicas das dunas, apresentando distribuição geográfica restrita. / Salvador
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Introgressão de resistência a tospovírus no tomateiro cultivado por meio de cruzamentos interespecíficos / Introgression of tospovirus resistance in cultivated tomatoes through interspecific crossesGuimarães, Lúcio Mauro of Silva 31 January 2002 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-10T17:38:43Z
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Previous issue date: 2002-01-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Plantas dos acessos de Lycopersicon peruvianum (LA 444/1-19, LA 371-20, PI 126444-3, PI 126928-2, PI 126944-6 e PI 126944-12) e de L. chilense (LA 130-5 e LA 2753-11) que possuem resistência de amplo espectro a tospovírus foram utilizadas no cruzamento com a cultivar Moneymaker (L. esculentum) para produção de híbridos interespecíficos, visando a introgressão dessa resistência no tomateiro cultivado. Para superar as barreiras interespecíficas verificadas nestes cruzamentos utilizou-se o cultivo in vitro de sementes imaturas em meio de cultura Murashige & Skoog (MS). Obtiveram-se cinco híbridos do cruzamento L. esculentum x LA 130-5, quatro do cruzamento L. esculentum x LA 2753-11, quatro do cruzamento L. esculentum x LA 371-20, cinco do cruzamento L. esculentum x LA 444/1-19, um do cruzamento L. esculentum x PI 126944-6 e um do cruzamento L. esculentum x PI 126944-12. Não se obteve nenhuma planta dos cruzamentos entre L. esculentum e os acessos PI 126444 e PI 126928, mesmo utilizando-se o cultivo in vitro de semente imatura. Todos os híbridos foram auto-incompatíveis e apresentaram características morfológicas intermediárias aos seus progenitores. A natureza híbrida das plantas F 1 foi confirmada utilizando-se um marcador molecular CAPS. Alguns dos híbridos foram propagados mediante o processo de estaquia e inoculados para avaliação da resistência com isolados de tospovírus, pertencentes às espécies Tomato spotted wilt virus - TSWV, Groundnut ringspot virus GRSV e Tomato chlorotic spot virus - TCSV. Os híbridos foram submetidos a duas inoculações via extrato foliar tamponado, realizadas num intervalo de sete dias. Apenas os híbridos do cruzamento L. esculentum x LA 371-20 e L. esculentum x PI 126944-6 foram resistentes aos três isolados utilizados. Os demais híbridos foram resistentes aos isolados das espécies GRSV e TCSV, mas suscetíveis ao isolado da espécie TSWV. Os híbridos foram retrocruzados com a cultivar Moneymaker para obtenção de populações de retrocruzamento (RC). Populações RC 1 para os híbridos L. esculentum x LA 130-5, L. esculentum x LA 2753-11, L. esculentum x LA 371-20 e L. esculentum x LA 444/1-19 foram obtidas utilizando-se também o cultivo in vitro de sementes imaturas, obtendo- se um total de 99 plantas RC 1 . Estas plantas foram autofecundadas e novamente retrocruzadas com a cultivar Moneymaker, gerando populações RC 1 F 2 e RC 2 , respectivamente. O estudo da herança da resistência em uma população RC 1 F 2 derivada de L. peruvianum LA 371-20 indicou que a resistência originária dessa fonte é condicionada por um gene dominante, sendo efetiva contra três espécies de tospovírus (TSWV, TCSV e GRSV). A análise genética dessa progênie com um marcador molecular CAPS ligado ao gene Sw-5 demonstrou que o gene de resistência derivado do acesso LA 371-20 é um alelo do loco Sw-5 ou um gene proximamente ligado. / Accessions of Lycopersicon peruvianum (LA 444/1-19, LA 371-20, PI 126444-3, PI 126928-2, PI 126944-6, PI 126944-12) and L. chilense (LA 130-5, LA 2753-11) that possess wide spectrum tospovirus resistance were used in crosses with the cultivar Moneymaker (L. esculentum) for production of interspecific hybrids, seeking the introgression of this resistance into cultivated varieties. The interspecific barriers in these crossings were overcome by cultivating immature seeds in Murashige & Skoog medium. Hybrids were obtained from crosses ́Moneymaker ́x LA 130-5; ́Moneymaker ́x LA 2753-11; ́Moneymaker ́x LA 371-20; ́Moneymaker ́ x LA 444/1-19; ́Moneymaker ́ x PI 126944-6 and ́Moneymaker ́ x PI 126944-12. Seeds derived from crosses between ́Moneymaker ́and accessions PI 126444 and PI 126928 did not germinated or produced abnormal seedlings. All hybrids were self-incompatible and displayed morphological characteristics intermediate to their progenitors. The hybrid nature of the F 1 plants was also confirmed by molecular marker analysis. Cuttings from some of the hybrids were inoculated with virus isolates, belonging to the species Tomato spotted wilt virus - TSWV, Groundnut ringspot virus - GRSV and Tomato chlorotic spot virus - TCSV. Only the cuttings from ́Moneymaker ́x LA 371-20 and ́Moneymaker ́x PI 126944-6 hybrids were resistant to all isolates. The others hybrids were resistant to GRSV and TCSV, but susceptible to the TSWV isolate. The hybrids were backcrossed to ́Moneymaker ́ for production of backcross populations (RC). RC 1 populations were obtained for ́Moneymaker ́ x LA 130-5, ́Moneymaker ́x LA 2753-11, ́Moneymaker ́ x LA 371-20 and ́Moneymaker ́ x LA 444/1-19. The RC 1 plants were selfed and again backcrossed to ́Moneymaker ́ to obtain RC 1 F 2 and RC 2 populations, respectively. Inheritance studies of the resistance in a population RC 1 F 2 derived from LA 371-20, showed that the resistance of this accession is conditioned by a dominant gene effective against three tospovirus species (TSWV, TCSV and GRSV). Genetic analysis of this progeny with a molecular CAPS marker linked to Sw-5, demonstrated that the gene derived from LA 371-20 is allelic to Sw-5 or a tightly linked gene. / Dissertação importada do Alexandria
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Interação entre Sorgo Sacarino e plantas daninhas / Interaction between Sweet Sorghum and weedsGiancotti, Paulo Roberto Fidelis [UNESP] 21 December 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-12-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O sorgo sacarino (Sorghum bicolor) é caracterizado por conter elevados teores de açúcares fermentescíveis em seu colmo, sendo considerado atualmente de alto potencial para compor a matriz energética nacional, ao produzir álcool durante a entressafra da cultura da cana-de-açúcar. A interferência das plantas daninhas é um dos fatores de maior importância durante a condução de uma lavoura. Uma vez que pouco tem sido estudado sobre esse tipo de sorgo, especificamente, estudos da interação entre as plantas daninhas e a cultura do sorgo sacarino são muito bem-vindas no desenvolvimento da agricultura energética. Os objetivos do trabalho foram: (I) determinar os períodos de interferência e índices fitossociológicos da comunidade infestante da cultura do sorgo sacarino; (II) analisar o desenvolvimento inicial de sorgo sacarino sob alta infestação de plantas daninhas; (III) estudar o efeito do exsudado do sorgo sacarino em outras espécies de plantas e avaliar o extrato radicular de uma potencial planta estimuladora da produção de sorgoleone pelo sorgo; (IV) avaliar o efeito supressor de restos culturais de sorgo sacarino sobre as plantas daninhas. Para o primeiro objetivo, os tratamentos consistiram de períodos crescentes da cultura em convivência e controle da comunidade infestante, em duas safras; sendo avaliada a biometria e a produção comercial do sorgo sacarino, além da determinação de índices fitossociológicos da comunidade infestante (densidade, dominância e importância relativa das espécies daninhas, além dos índices de diversidade e equitabilidade da comunidade). Em vasos, foi instalado o experimento para avaliar o terceiro objetivo, no qual híbridos de sorgo sacarino foram submetidos à presença de cinco plantas daninhas em alta densidade; sendo avaliadas as características morfofisiológicas do sorgo sacarino e a massa seca acumulada pela cultura e pelas plantas daninhas. Os estudos sobre a alelopatia foram realizados em laboratório, utilizando diferentes metodologias de química analítica, além de bioensaios avaliando a atividade de exsudados de híbridos de sorgo sacarino sobre germinabilidade e o desenvolvimento de plântulas teste e o crescimento de coleóptilo de trigo. No estudo do efeito supressor de restos culturais de sorgo sacarino, este foi comparado, no campo, com outros tipos de coberturas, e avaliada a reinfestação da comunidade infestante por meio de estudos fitossociológicos e a avaliação do banco de sementes do solo. Durante a produção de colmos de sorgo sacarino, a densidade de plantas daninhas foi o fator determinante para a importância das mesmas dentro da comunidade infestante, uma vez que o desenvolvimento e acúmulo de biomassa destas foram suprimidos pela competição estabelecida pela cultura. O sorgo sacarino se mostrou extremamente competitivo no campo, sendo que a interferência das plantas daninhas não acarretou em redução da produtividade da cultura, em duas safras. A supressão das plantas daninhas proporcionada pelos restos culturais da cultura de sorgo sacarino se equiparou a da cobertura de mucuna-cinza, suprimindo as plantas daninhas no campo por, pelo menos, quatro meses, durante a época seca. Em vasos, quatro plantas daninhas tiveram sua massa seca reduzida pela presença de sorgo sacarino, mesmo em reduzida densidade; além disso, o sorgo foi insensível à presença de três espécies daninhas presentes em alta densidade. Os bioensaios não apresentaram o esperado resultado de inibição alelopática do exsudado de sorgo sacarino sobre plantas teste. Devido ao elevado coeficiente de variação, a produção de sorgoleone pelo sorgo submetido ao extrato de A. theophrasti, não apresentou resultados conclusivos. / Sweet sorghum (Sorghum bicolor) is featured by the high level of fermentable sugars present in its stalk. The crop is currently considered of high potential to compose the national energetic system, by producing alcohol during the sugarcane off season. The weed interference is one of the most important factors during a crop management. Because not too much have been studied about sweet sorghum, studies about the interaction between weeds and sweet sorghum crop are very welcome for the development of the bioenergy nationwide. The aim of this research were: (I) determine the periods of weed interference and the phytosociological indexes of the weed community on the sweet sorghum crop; (II) analyze the initial growth of sweet sorghum under high weed infestation; (III) study the effect of the sweet sorghum root exudate in other plant species and also evaluate the root extract of an potential stimulant plant on the production of sorgoleone by sorghum; (IV) evaluate the suppressive effect of sweet sorghum crop residues on weeds. For the first objective, the treatments were composed by increasing periods of weed presence and weed absence at two crop seasons; when it was evaluated the sweet sorghum biometry and yield, besides the determination of phytosociological indexes of the weed community (the relative indexes of density, dominance and importance, and the weed community indexes of diversity and equitability). In pots, it was carried out an assay in order to evaluate the third aim, in which hybrids of sweet sorghum were submitted to the presence of five weed species in higher density. It was evaluated the morphophysiological features of sweet sorghum and the dry mass of both crop and weeds. The studies about allelopathy were carried out in laboratory, using different methods of analytical chemistry. Bioassays was carried out in order to evaluate the activity of exudates of sweet sorghum hybrids on test plants seed germinability and seedling development. In the study of the suppressor effect of sweet sorghum residues, it was compared at field with other cover crops and it was evaluated the reinfestation of the weed community by phytosociological studies and seed soil bank evaluation. During the sweet sorghum crop, the weed density was the determinant factor for the weed importance in the weed community, once the weed development and dry mass accumulation were suppressed by the competition established by the crop. The sweet sorghum showed an extremely competitive behavior on field and the interference of weeds did not cause yield loss, in two crop seasons. The weed suppression provided by the sweet sorghum crop residues was similar to the one provided by Mucuna pruriens, controlling the weeds on field for at least four months, during the dry season. In pots, four weed species had their dry mass reduced by the presence of sweet sorghum, even in lower density of the crop. Besides that, the sweet sorghum was insensitive to the presence of three weed species that were present in higher density. The bioassays didn’t show the expected result of allelopathic inhibition of sweet sorghum exudate on test plants. Due to the high coefficient of variation, the production of sorgoleone by sorghum subjected to root extract of A. theophrasti, did not show conclusive results. / FAPESP: 2012/11464-5
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Conservação da Agrobiodiversidade: saberes e estratégias da Agricultura Familiar na AmazôniaMartins, Ayrton Luiz Urizzi 28 March 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-03-28 / The conservation of agrobiodiversity in environmental systems in the Amazon is being
promoted by the family farmers through strategies involving a complex network of
organizations and social interactions. This role is extremely important and essential for
sustainability in agriculture but has remained in invisibility by the policymakers. This study
aimed to analyze the agrobiodiversity conservation strategies adopted by farmers in the Upper
Solimões River. This research attempt to analyze the cognitive strategies expressed in local
knowledge relative to change of agroecosystems landscapes and inter and intraspecific
diversity of crops. The characterization of the strategies, processes and labor relations in the
local family farming was also intended. The study was realized with farmers in Comunidade
São José, at Assentamento Agroextrativista – PAE, Aramaçá Island, Benjamin Constant, AM.
In this study, it was adopted the Multiple Case Study model with the dialectic of systemic
complexity as a theoretical framework which is capable of providing the necessary
epistemological instrumental to the study. For understand the relationships between biological
diversity and cultural diversity, based on own values and meanings of each culture were used
to search the Ethnobiology and Ethnoecology methodological principles. The complexity and
heterogeneity of Aramaçá Island impose high degree of risk and uncertainty on São José
farmers. It’s requiring strategies to know, select and conserve varieties of adapted plants at
circumstances. Therefore, conservation of agricultural diversity in family agroecosystems is a
complex process of knowing and acting of the farmer. By confirming the agricultural
diversity conserved by these forms of production, the study also highlighted the importance of
the homegardens as conservation areas of intraspecific variability, and the interspecific sites.
The articulation between the different forms of social kinship and work relations among
families establish complex systems in networks, with each type of relationship driven in space
/ time required. Agricultural diversity and the knowledge associated with it are generated,
evaluated and improved by each family, however, the appropriation happens collectively
through these social local networking. In sharing networks were identified key family units in
the dynamics of seed flow in São José, the nodal families, also called nodal farmers. The
knowledge richness articulated in the agrobiodiversity conservation strategies is a strong
evidence of the São José family farmers to conserve and confirm the view that the action
strategy requires a cognitive strategy. / A conservação da agrobiodiversidade em sistemas ambientais na Amazônia está sendo
promovida pelos agricultores familiares por meio de estratégias que envolvem uma rede
complexa de organizações e interações sociais. Este papel é extremamente importante e
essencial para a sustentabilidade na agricultura, mas se mantem na invisibilidade aos
formuladores de políticas públicas. O estudo teve por objetivo analisar as estratégias de
conservação da agrobiodiversidade adotadas pelos agricultores familiares no Alto Rio
Solimões. Para tanto, buscou-se descrever as estratégias cognitivas expressas no saber local
com respeito às dinâmicas das paisagens dos agroecossistemas e da diversidade inter e
intraespecíficas das espécies cultivadas, além de caracterizar as estratégias, processos e
relações de trabalho nas agriculturas familiares locais. O estudo foi realizado com agricultores
familiares na localidade denominada por Comunidade São José, pertencente ao Projeto de
Assentamento Agroextrativista - PAE Ilha do Aramaçá, situado na Ilha de mesmo nome,
município de Benjamim Constant, AM. Adotou-se o modelo de Estudo de Casos Múltiplos
tendo a dialética da complexidade sistêmica como referencial teórico capaz de fornecer o
instrumental epistemológico necessário ao estudo. Com o intuito de melhor entender as interrelações
entre a diversidade biológica e a diversidade cultural, com base nos valores e
significados próprios de cada cultura, foram utilizados na pesquisa os preceitos metodológicos
da Etnobiologia e da Etnoecologia. A complexidade e heterogeneidade da Ilha do Aramaçá
impõem aos agricultores familiares de São José elevado grau de riscos e incertezas exigindo,
por parte desses, estratégias que permitam conhecer, selecionar e conservar variedades de
plantas adaptadas e adequadas a um conjunto de circunstâncias. Portanto, a conservação da
diversidade agrícola nos agroecossistemas familiares constitui um complexo processo de
conhecer e agir do agricultor. Ao ratificar a diversidade agrícola conservada por essas formas
de produção, o estudo evidenciou ainda a importância das roças enquanto espaços de
conservação da variabilidade intraespecífica, e os sítios da interespecífica. A articulação entre
as diferentes modalidades de relações sociais de parentesco e trabalho entre as famílias
estabelecem complexos sistemas em redes, sendo cada modalidade de relação acionada no
espaço/tempo necessário. A diversidade agrícola e os saberes a ela associados são gerados,
avaliados e melhorados por cada família, no entanto, a apropriação dos mesmos se dá
coletivamente por meio dessas redes sociais locais. Nas redes de compartilhamento foram
identificadas unidades familiares chaves na dinâmica do fluxo de sementes em São José, as
famílias nodais, também denominados de agricultores nodais. A riqueza de saberes
articulados nas estratégias de conservação da agrobiodiversidade é uma forte evidência da
intenção dos agricultores familiares de São José para conservar e confirma a visão de que a
estratégia de ação requer uma estratégia cognitiva.
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Técnicas multivariadas de morfometria geométrica são capazes de discriminar a forma dos crânios de Trachycephalus atlas Bokermann, 1966 e Trachycephalus nigromaculatus Tschudi, 1838 (Anura, Hylidae)? /Comelli, Ana Beatriz Alarcon January 2020 (has links)
Orientador: Ivan Sergio Nunes Silva Filho / Resumo: Trachycephalus atlas e Trachycephalus nigromaculatus são espécies da família Hylidae, Ordem Anura, que são morfologicamente semelhantes entre si. Apesar de T. atlas ser relatada em sua maioria em ambientes do Bioma Caatinga e T. nigromaculatus ocorrer em regiões costeiras da Mata Atlântica e interioranas em matas de galeria do Cerrado, ambas foram registradas em ambientes com fitofisionomia vegetal de transição de Mata Atlântica e Caatinga, especialmente no estado da Bahia. Devido à sua semelhança morfológica, não existe uma característica conspícua que ajude na diagnose destas espécies. Suas diferenças aparecem no canto e no girino. Neste estudo examinamos essas duas espécies utilizando a morfometria geométrica para analisar as variações da forma do crânio e determinar se essas variações são diagnósticas, encontrando amparo em dados estatísticos robustos. A morfometria geométrica (MG) tem sido empregada para resolver uma variedade de questões do mais amplo contexto de ecologia e evolução. Foram examinados 160 exemplares de coleções representativas das espécies, perfazendo o maior número possível de localidades registradas. Os crânios dos indivíduos foram fotografados em vista dorsal e lateral e 17 marcos anatômicos (landmarks) foram selecionados e digitalizados de acordo com a representatividade em estruturas homólogas da área craniana de todos os exemplares. Para as análises de morfometria geométrica foi utilizado o método de sobreposição de Procrustes com as coordenadas do... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Trachycephalus atlas and Trachycephalus nigromaculatus are species of the family Hylidae, Order Anura, which are morphologically similar to each other. Although T. atlas is mostly reported in environments of the Caatinga Biome and T. nigromaculatus occurs in coastal regions of the Atlantic Forest and inlands of Cerrado, both were recorded in environments with transition vegetation phytophysiognomy of the Atlantic Forest and Caatinga, especially in the state of Bahia. Due to its morphological similarity, there is no conspicuous characteristic that helps in the diagnosis of these species. Their differences appear in the call and the tadpole. In this study we examine these two species using geometric morphometry to analyze variations in the shape of the skull and determine whether these variations are diagnostic, finding support in more robust statistical data. Geometric morphometry (GM) has been used to solve a variety of issues in the broadest context of ecology and evolution. The sample consisted of 160 specimens of representative collections of the species, sampling the largest possible number of registered locations. The skulls of the individuals were photographed in dorsal and lateral views and 17 anatomical landmarks were selected and digitized according to the representativeness in homologous structures of the cranial area of all the specimens. For the analysis of geometric morphometry, the Procrustes superimposition method with the coordinates of the milestones for the ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Interação entre Cylindrospermopsis raciborskii e Microcystis aeruginosa: implicações no crescimento de culturas e na produção de microcistinas / Interaction between Cylindrospermopsis raciborskii and Microcystis aeruginosa: implications in cultures growth and microcystins productionSantos, Paulo Vagner dos 18 June 2009 (has links)
Cianobactérias desempenham importante papel ecológico em diversos ecossistemas terrestres e aquáticos. Contudo, tornam-se problema de saúde pública quando biossintetizam compostos secundários tóxicos, denominados cianotoxinas, as quais podem atuar sobre diversos organismos. Sistemas aquáticos impactados favorecem o desenvolvimento destes microrganismos, que podem tornar-se dominantes em função dos diversos mecanismos que lhes conferem vantagens adaptativas em relação aos demais grupos fitoplanctônicos. Muitas vezes, elas apresentam-se sob forma de florescimento, cuja toxicidade varia de acordo com espécies e cepas que o compõem. Apesar das cianobactérias Cylindrospermopsis raciborskii e Microcystis aeruginosa formarem florações, terem potencial tóxico, serem competitivas e estarem presentes em diversos reservatórios, é desconhecido o efeito da interação entre elas na produção de microcistina. Para esclarecer esta questão, nesta pesquisa, foi estudada a interação entre cepas de C. raciborskii e M. aeruginosa visando: caracterizar o cultivo das espécies em monocultura e cultura mista; verificar se o caráter tóxico das cepas favoreceu a competição; mensurar a microcistina de M. aeruginosa e avaliar o efeito da interação sobre esta variável. Em salas climatizadas de cultivo (22ºC, fotoperíodo 12h, 60 \'mü\'mol photon/\'M POT.2\'.s) experimentos de interação foram realizados em culturas batch compostas por três tratamentos: (1) monocultura de M. aeruginosa, (2) monocultura de C. raciborskii, (3) cultura mista de M. aeruginosa e C. raciborskii. Foram realizadas análises da densidade e biovolume dos organismos, da velocidade específica de crescimento (\'mü\') e tempo de duplicação (Td) e da concentração de microcistinas, clorofila-a e nutrientes. A interação reduziu em até 22% a \'mü\' das linhagens estudadas. Tanto C. raciborskii quanto M. aeruginosa apresentaram vantagem competitiva em pelo menos um dos ensaios e, no caso de linhagem tóxica de M. aeruginosa, verificou-se que o seu caráter tóxico favoreceu a competição da espécie com linhagem atóxica de C. raciborskii. Além disso, M. aeruginosa elevou em até 53% a síntese de microcistina ao interagir com C. raciborskii. Este processo poderia se relacionar a três principais mecanismos: competição por interferência, produção de alelopáticos e comunicação química. Estudos de balanços genéticos dos florescimentos bem como da possível comunicação química existente entre cianobactérias são ferramentas investigativas importantes que poderão ajudar no aprimoramento da prevenção e manejo de florações tóxicas. / Cyanobacteria play important ecological role in many terrestrial and aquatic ecosystems. However, they become a public health problem when synthesize secondary toxic compounds, known as cyanotoxins, which may act on several organisms. Impacted aquatic systems favor their growth and these microorganisms can become dominant due to mechanisms that confer them adaptive advantages in relation to other phytoplanktonic groups. Frequently, cyanobacteria can form water blooms, whose toxicity varies according to their species and strains composition. Although the cyanobacteria Cylindrospermopsis raciborskii and Microcystis aeruginosa can form blooms, have toxic potential, are competitive and present in several reservoirs, it is unknown the interaction effect between them in the production of microcystins. To solve this question, the interaction among strains of C. raciborskii and M. aeruginosa was studied to: characterize the culture of the species in monoculture and mixed culture; check whether the character of toxic strains favored the competition; measure microcystin concentration produced by M. aeruginosa and evaluate interaction effect on this variable. In climatized growth room (22°C, 12h photoperiod, 60 \'mü\'mol photon/\'M POT.2\'.s) four interaction experiments composed by three treatments were performed in batch cultures: (1) monoculture of M. aeruginosa, (2) monoculture of C. raciborskii, (3) mixed culture of M. aeruginosa and C. raciborskii. Density and biovolume, specific growth rate (\'mü\'), doubling time (Td) and concentration of microcystin, chlorophyll-a and nutrients analyses were performed. The interaction reduced up to 22% the of studied strains. Both C. raciborskii and M. aeruginosa presented competitive advantage in at least one of the tests. In the case of toxic strain of M. aeruginosa, it was found that its toxic character favored the competition with non-toxic strain of C. raciborskii. Furthermore, M. aeruginosa increased by 53% the synthesis of microcystin while interacting with C. raciborskii. This process could be related to three main mechanisms: interference competition, communication and production of allelopathic chemicals. Genetical balance studies of blooms as the possible chemical communication existing among cyanobacteria are important investigative tools that might help prevention and management improvement of toxic blooms.
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