Estudo retrospectivo de 80 casos de pneumonia por Pneumocystis jirovecii (PCP), diagnosticados no Laboratório de Micologia, Santa Casa-Complexo Hospitalar – Porto Alegre (RS), de agosto de 1984 à janeiro de 2006. Dos 80 pacientes, 23 (36,3%) já tinham diagnóstico de Aids; 40 (50%) tiveram diagnóstico de infecção pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV) concomitantemente com o diagnóstico de PCP. O fator predisponente mais encontrado foi a linfopenia associada à síndrome da imunodeficiência adquirida (Aids), com mediana da dosagem de CD4+ 36,5 células/mm3. Os achados clínicos mais frequentes foram tosse (81,3%), febre e dispnéia (76,3%). Na radiologia de tórax 92,5% apresentavam infiltrado pulmonar intersticial. Os diagnósticos foram feitos por fibrobroncoscopia com lavado broncoalveolar em 67,5%. Apenas 11,6% dos pacientes com Aids faziam uso de terapia antiretroviral; e apenas 6,3% de todos os pacientes do estudo faziam profilaxia para pneumocistose. O tratamento da PCP constituiu de sulfametoxazol-trimetoprim (SMX+TMP) em 92,3%. A maior incidência de PCP foi entre pacientes infectados pelo HIV (86,3%). Os pacientes apresentaram uma mortalidade de 34,3%, e 74,1% naqueles que necessitaram de ventilação mecânica. Complicações ocorreram em 40% dos casos, aumentando os dias de internação e de outras medicações com aumento de custo do tratamento. / The present study is based on a retrospective research of 80 cases with Pneumocystis jirovecii pneumonia (PCP), diagnosed at the Mycology Laboratory - Santa Casa Complexo Hospitalar Porto Alegre (RS), from August 1984 to January 2006. Out of those 80 patients, 23 (36.3%) had diagnosis of AIDS, 40 (50%) were diagnosed with infection by human immunodeficiency virus (HIV) concomitantly with PCP diagnosis. The most common predisposing factor was lymphopenia associated with AIDS, with a median dose of CD4 + 36.5 cells/mm3. The clinical manifestations most frequent were cough (81.3%), fever and dyspnea (76.3%). Chest x-ray findings had interstitial pulmonary infiltrates in 92.5%. The diagnoses were made by bronchoscopy with bronchoalveolar lavage in 67.5% samples. Only 11.6% of patients with AIDS received antiretroviral therapy, and only 6.3% of all patients received prophylaxis for PCP. The treatment for PCP was trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP + SMX) in 92.3% of patients. The highest incidence of PCP was among HIVinfected patients (86.3%). The mortality rate were 34.3% and 74.1% in those who required mechanical ventilation. Complications occurred in 40% of cases, increasing days of hospitalization and other medications, which increased the cost of treatment.

Introdução. A colonização pelo Pneumocystis jirovecii foi demonstrada em diversos grupos, como pacientes imunossuprimidos pela infecção do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV), pacientes com doenças pulmonares crônicas e gestantes. Alguns estudos têm sugerido que os profissionais de saúde podem tornar-se colonizados após contato com pacientes com a pneumonia por Pneumocystis (PcP). Objetivos. Identificar a colonização pelo P. jirovecii, através de técnicas moleculares, em profissionais de saúde que apresentam contato ocupacional com pacientes com PcP no Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Verificar a duração desta colonização. Analisar as variáveis clínico-demográficas dos pacientes com PcP que podem estar relacionadas à transmissão do P. jirovecii ao profissional de saúde. Métodos. Foi realizada uma nested-PCR para a detecção do P. jirovecii no lavado de orofaringe de 27 profissionais expostos a pacientes com PcP (médico; enfermeiro; técnico/auxiliar de enfermagem) e de 36 profissionais administrativos, no período de janeiro a agosto de 2008. As amostras de lavado da orofaringe foram obtidas na primeira, segunda e oitava semana após o contato com um paciente para avaliar o início e a duração da colonização pelo P. jirovecii. A nested-PCR utilizou os primers pAZ-102-A e pAZ-H no primeiro round e pAZ 102-X e pAZ 102-Y no segundo, para a amplificação da grande subunidade do RNA ribossômico mitocondrial (mtLSUrRNA) do microorganismo. Foram coletados os dados clínicos e demográficos dos pacientes com PcP através da revisão dos prontuários médicos. Resultados. A colonização pelo P. jirovecii foi observada em 33,3% (9/27) dos profissionais expostos, com uma duração que variou entre uma a duas semanas após o contato inicial com o paciente. Entre os profissionais não-expostos, foram identificados somente dois colonizados entre 36 indivíduos (p <0,05). Não foi identificada associação entre as características clínicas e demográficas dos pacientes com PcP e a colonização dos profissionais de saúde. Conclusões: Os profissionais de saúde em contato com os pacientes com PcP apresentaram uma taxa de colonização superior aos indivíduos não expostos. Este achado é sugestivo de uma transmissão nosocomial do microorganismo. Os profissionais de saúde podem constituir importante reservatório e fonte de infecção do fungo a outros pacientes.

Introdução. A colonização pelo Pneumocystis jirovecii foi demonstrada em diversos grupos, como pacientes imunossuprimidos pela infecção do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV), pacientes com doenças pulmonares crônicas e gestantes. Alguns estudos têm sugerido que os profissionais de saúde podem tornar-se colonizados após contato com pacientes com a pneumonia por Pneumocystis (PcP). Objetivos. Identificar a colonização pelo P. jirovecii, através de técnicas moleculares, em profissionais de saúde que apresentam contato ocupacional com pacientes com PcP no Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Verificar a duração desta colonização. Analisar as variáveis clínico-demográficas dos pacientes com PcP que podem estar relacionadas à transmissão do P. jirovecii ao profissional de saúde. Métodos. Foi realizada uma nested-PCR para a detecção do P. jirovecii no lavado de orofaringe de 27 profissionais expostos a pacientes com PcP (médico; enfermeiro; técnico/auxiliar de enfermagem) e de 36 profissionais administrativos, no período de janeiro a agosto de 2008. As amostras de lavado da orofaringe foram obtidas na primeira, segunda e oitava semana após o contato com um paciente para avaliar o início e a duração da colonização pelo P. jirovecii. A nested-PCR utilizou os primers pAZ-102-A e pAZ-H no primeiro round e pAZ 102-X e pAZ 102-Y no segundo, para a amplificação da grande subunidade do RNA ribossômico mitocondrial (mtLSUrRNA) do microorganismo. Foram coletados os dados clínicos e demográficos dos pacientes com PcP através da revisão dos prontuários médicos. Resultados. A colonização pelo P. jirovecii foi observada em 33,3% (9/27) dos profissionais expostos, com uma duração que variou entre uma a duas semanas após o contato inicial com o paciente. Entre os profissionais não-expostos, foram identificados somente dois colonizados entre 36 indivíduos (p <0,05). Não foi identificada associação entre as características clínicas e demográficas dos pacientes com PcP e a colonização dos profissionais de saúde. Conclusões: Os profissionais de saúde em contato com os pacientes com PcP apresentaram uma taxa de colonização superior aos indivíduos não expostos. Este achado é sugestivo de uma transmissão nosocomial do microorganismo. Os profissionais de saúde podem constituir importante reservatório e fonte de infecção do fungo a outros pacientes.

Introdução. A colonização pelo Pneumocystis jirovecii foi demonstrada em diversos grupos, como pacientes imunossuprimidos pela infecção do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV), pacientes com doenças pulmonares crônicas e gestantes. Alguns estudos têm sugerido que os profissionais de saúde podem tornar-se colonizados após contato com pacientes com a pneumonia por Pneumocystis (PcP). Objetivos. Identificar a colonização pelo P. jirovecii, através de técnicas moleculares, em profissionais de saúde que apresentam contato ocupacional com pacientes com PcP no Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Verificar a duração desta colonização. Analisar as variáveis clínico-demográficas dos pacientes com PcP que podem estar relacionadas à transmissão do P. jirovecii ao profissional de saúde. Métodos. Foi realizada uma nested-PCR para a detecção do P. jirovecii no lavado de orofaringe de 27 profissionais expostos a pacientes com PcP (médico; enfermeiro; técnico/auxiliar de enfermagem) e de 36 profissionais administrativos, no período de janeiro a agosto de 2008. As amostras de lavado da orofaringe foram obtidas na primeira, segunda e oitava semana após o contato com um paciente para avaliar o início e a duração da colonização pelo P. jirovecii. A nested-PCR utilizou os primers pAZ-102-A e pAZ-H no primeiro round e pAZ 102-X e pAZ 102-Y no segundo, para a amplificação da grande subunidade do RNA ribossômico mitocondrial (mtLSUrRNA) do microorganismo. Foram coletados os dados clínicos e demográficos dos pacientes com PcP através da revisão dos prontuários médicos. Resultados. A colonização pelo P. jirovecii foi observada em 33,3% (9/27) dos profissionais expostos, com uma duração que variou entre uma a duas semanas após o contato inicial com o paciente. Entre os profissionais não-expostos, foram identificados somente dois colonizados entre 36 indivíduos (p <0,05). Não foi identificada associação entre as características clínicas e demográficas dos pacientes com PcP e a colonização dos profissionais de saúde. Conclusões: Os profissionais de saúde em contato com os pacientes com PcP apresentaram uma taxa de colonização superior aos indivíduos não expostos. Este achado é sugestivo de uma transmissão nosocomial do microorganismo. Os profissionais de saúde podem constituir importante reservatório e fonte de infecção do fungo a outros pacientes.

Le genre Pneumocystis désigne un groupe de champignons opportunistes présentant une étroite spécificité d'hôte. Il détermine lors d'immunodépression sévère une infection pulmonaire grave, la pneumonie à Pneumocystis (PPC). La transmission de Pneumocystis par voie aérienne d'un hôte développant une PPC à un hôte susceptible a été démontrée à l'aide des modèles murins. Les travaux menés chez la souris ont montré également que des sujets immunocompétents colonisés par Pneumocystis murina peuvent transmettre le champignon à des souris immunodéprimées qui développeront une PPC ultérieurement. Les individus colonisés par Pneumocystis sp., ainsi que ceux développant une PPC, participeraient au réservoir du champignon. La survenue de cas groupés de PPC en milieu hospitalier est en faveur de la transmission interindividuelle de Pneumocystis jirovecii (P.jirovecii) chez l’homme. La détection de l'ADN de P.jirovecii dans l'air exhalé par les patients développant une PPC suggère que cette transmission se fait par voie aérienne. La caractérisation des populations infectées par P.jirovecii et la caractérisation génotypique du champignon au sein de son réservoir humain constituent la base de ce travail de recherche. Nous avons montré que la prévalence de la colonisation par P.jirovecii est faible chez les patients atteints de mucoviscidose et suivis dans notre CHU. La participation de ces patients au réservoir de P.jirovecii à Brest serait donc marginale. Cette faible prévalence pourrait être le reflet d'une faible circulation du champignon dans les communautés humaines dans notre région. Nous avons évalué le dosage du ß-1,3-D glucane sérique pour dépister les populations infectées. Ce dosage couplé à la détection de P.jirovecii dans les prélèvements respiratoires par la microscopie et la PCR, permet de différencier les patients développant une PPC et les patients présentant une colonisation pulmonaire par P.jirovecii. De plus, les premières données sur le ß-1,3-D glucane au cours de la primo-infection chez le nourrisson ont été obtenues.En termes de caractérisation de P.jirovecii dans notre région, l'analyse du locus dihydropteroate synthase (DHPS) a montré que: i) le lieu habituel de résidence plutôt que le lieu de diagnostic de l’infection à P.jirovecii serait un facteur prédictif d’infection par un mutant, ii) P.jirovecii pourrait circuler en France d’une région à une autre via des voyageurs infectés, iii) la prévalence de mutants potentiellement résistants chez les patients vivant effectivement à Brest était de 0%. L'analyse des séquences des "internal transcribed spacers" (ITS) 1 et 2 de P. jirovecii conforte l'hypothèse que les patients développant une PPC et les patients colonisés sont infectés par des populations fongiques présentant des caractéristiques identiques. Tous les patients, quelle que soit la présentation clinique de leur infection, constitueraient un réservoir unique et commun de P.jirovecii. Les travaux de génotypage ont constitué l'étape préalable nécessaire à l'analyse de cas groupés d'infections à P.jirovecii survenus chez des patients transplantés rénaux au CHU de Brest. Nous avons apporté des données originales sur le rôle des patients colonisés en tant que source potentielle de P. jirovecii dans un contexte d'acquisition et de transmission nosocomiales du champignon. Par ailleurs, la concordance partielle ou complète des génotypes ITS et DHPS dans les couples "prélèvements d'air–LBA" réalisés chez des patients développant une PPC est compatible avec l’exhalation du champignon et sa diffusion aérienne dans l’environnement hospitalier. Ces données apportent des arguments pour l'application de mesures de prévention des infections nosocomiales à P. jirovecii. Les précautions "gouttelettes" recommandées par la Société Française d'Hygiène Hospitalière devraient être appliquées a minima aux patients développant une PPC. Nous proposons leur extension aux patients colonisés par le champignon. / The genus Pneumocystis represents a group of opportunistic fungi that show strong host specificity. It is the cause of severe pneumonia (Pneumocystis Pneumonia [PCP]) in immunocompromised subjects. Pneumocystis transmission from a host with PCP to another susceptible host via the airborne route has been demonstrated in rodent models. Moreover, it has been established that Pneumocystis murina can be transmitted from immunocompetent mice, transiently colonized by the fungus, to immunocompromised susceptible mice that subsequently develop PCP. Colonized subjects and those developing PCP may be part of the fungus reservoir. Reports of PCP case cluster in hospital strongly suggest that Pneumocystis jirovecii (P.jirovecii) transmission in humans may also occur. P.jirovecii DNA detection in the air surrounding PCP patients is consistent with the transmission of P.jirovecii via the airborne route.Our goals were to characterize human populations infected with P.jirovecii and to characterize P.jirovecii within its human reservoir. We showed that P.jirovecii was rarely involved in pulmonary colonization in patients with cystic fibrosis monitored in the Brest Hospital. Thus this patient population was not part of the human reservoir of the fungus in our region (Brittany, Western France). This low prevalence of colonization may reflect a low level of P.jirovecii circulation within human communities in Brittany. In order to improve the identification of patients infected with P.jirovecii, we evaluated ß-1,3-D glucan detection in serum samples. We showed that serum ß-1,3-D glucan levels combined with P.jirovecii detection in pulmonary samples using microscopic examination and a PCR assay make it possible to distinguish between PCP and pulmonary colonization. Moreover the first data on ß-1,3-D glucan levels during primary infection were obtained.In order to characterize P.jirovecii in our region, we performed the typing of P.jirovecii isolates from infected patients monitored at Brest hospital, using the dihydropteroate synthase (DHPS) and the internal transcribed spacer (ITS) 1 and 2 locus analysis. DHPS typing showed that i) the usual city of patient residence rather that the city in which the diagnosis of P.jirovecii infection has been made is a predictor of mutants, ii) mutants can be imported from one region to another through infected visitors, iii) the prevalence of mutants potentially resistant to sulfonamides was 0% in patients who effectively lived in the Brest geographic area. Results of ITS analysis in PCP patients and colonized patients are consistent with the hypothesis that these 2 patient groups are infected with similar P.jirovecii populations. All infected patients, whatever their clinical presentation, may be part of a common and unique reservoir of the fungus. We investigated an outbreak of P.jirovecii infections in 18 renal transplant recipients using the same typing method combined with patient encounter analysis. The results provided evidence of the role of colonized patients as potential sources of P.jirovecii. The same typing method was applied to pairs of pulmonary samples and room air samples of PCP patients. Full or partial matches of P.jirovecii types in pulmonary and air sample pairs were observed. These results are consistent with P.jirovecii exhalation by PCP patients in their close environment. These data support arguments for applying droplet precautions, at least to PCP patients, to prevent P.jirovecii transmission, as recommended by the "Société française d'hygiène hospitalière". We suggest extending droplet precautions to colonized patients to achieve the prevention of P.jirovecii nosocomial infections.

Introdução O Pneumocystis jirovecii causa uma grave infecção oportunista nos pacientes imunossuprimidos. Como o P. jirovecii é específico do ser humano, o reservatório deve ser constituído pelos indivíduos que apresentam a pneumonia ou a colonização pelo fungo. A colonização foi estudada somente em grupos específicos (pacientes infectados pelo vírus HIV, pacientes com doenças pulmonares crônicas, crianças com a primoinfecção pelo microorganismo, entre outros) e não foi ainda comprovada a colonização de indivíduos adultos saudáveis na população em geral. A distribuição do reservatório do P. jirovecii na comunidade, portanto, não é conhecida. Objetivos Estudar a colonização pelo P. jirovecii na comunidade da região geográfica de abrangência da Unidade Básica de Saúde (UBS) do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA). Determinar a prevalência da colonização; investigar a associação entre dados clínicos ou demográficos e colonização; verificar se adultos saudáveis são colonizados pelo P. jirovecii. Material e métodos Foram selecionados aleatoriamente 405 indivíduos que residem na área atendida pela UBS/HCPA. O lavado de orofaringe e os dados clínicos e demográficos foram coletados no decorrer do ano de 2010. A presença do P. jirovecii no lavado de orofaringe foi investigada através de uma nested-PCR que amplifica a grande subunidade do RNA ribossômico mitocondrial (mtLSUrRNA), a qual foi realizada no Centro de Pesquisa Experimental do HCPA. Os dados obtidos foram submetidos às análises estatísticas univariada e multivariada. Resultados A colonização pelo P. jirovecii foi observada em 7,7% (31/405) dos indivíduos. A análise estatística univariada demonstrou que a presença do fungo está associada ao tabagismo, à doença respiratória crônica e à idade (as crianças e os idosos apresentam-se mais colonizados que os adultos e adolescentes). Na análise multivariada, o tabagismo e a idade foram variáveis cuja associação com a colonização foi independente. Dentre os indivíduos colonizados, três eram adultos saudáveis. Conclusões Uma prevalência de 7,7% (31/405) de colonização entre os indivíduos da população foi identificada. O tabagismo e a idade (crianças e idosos) estão associados à colonização na análise multivariada, o que confirma evidências prévias. Entre os indivíduos colonizados, cerca de 10% (3/31) são pessoas adultas e saudáveis, um grupo que este estudo revela como parte do reservatório do fungo. A prevalência de colonização identificada no estudo, distribuída em diferentes indivíduos da população, sugere que um grande reservatório do P. jirovecii é dinâmico e é mantido através da transmissão do fungo entre os habitantes da região. / Introduction Pneumocystis jirovecii is the cause of a serious opportunistic infection in immunocompromised patients. As a specifically human microorganism, its reservoir is made up of individuals that have pneumonia or are colonized. Colonization has been studied only in specific groups, such as patients with HIV infection or chronic pulmonary diseases and children with primary infection by this microorganism. Colonization in healthy adults in the general population has not been confirmed. The distribution of the P. jirovecii reservoir in the community is, therefore, unknown. Objectives To study colonization by P. jirovecii in the community of the geographic area of the Primary Health Care Unit of Hospital de Clínicas de Porto Alegre (UBS/HCPA); to determine the prevalence of colonization; to evaluate the association between clinical or demographic data and colonization; to investigate whether healthy adults are colonized by P. jirovecii. Material and methods This study randomly enrolled 405 individuals that lived in the geographic area of UBS/HCPA. Oropharyngeal wash specimens and clinical and demographic data were collected along 2010. The presence of P. jirovecii in oropharyngeal wash specimens was investigated using nested PCR, which amplifies the mitochondrial large subunit ribosomal RNA (mtLSUrRNA). Tests were conducted in the Experimental Research Center of HCPA. Univariate and multivariate statistical analyses were used to evaluate the data collected. Results Colonization by P. jirovecii was found in 7.7% (31/405) of the individuals. Univariate statistical analysis revealed that the presence of the fungus was associated with smoking, chronic respiratory diseases and age; children and older adults were more often colonized than adults and adolescents. In multivariate analysis, only smoking and age were independently associated with colonization. Of the individuals with colonization, three were healthy adults. Conclusions The prevalence of colonization among individuals in the population was 7.7% (31/405). Smoking and age (children and older adults) were associated with colonization in multivariate analysis, which confirms previous findings. About 10% (3/31) of all colonized individuals were healthy adults, a group that seems to be part of the reservoir of the fungus. In this study, colonization was distributed among different individuals in the population, which suggests that a large and dynamic reservoir of P. jirovecii is kept by fungus transmission between inhabitants of the region.

Introdução O Pneumocystis jirovecii causa uma grave infecção oportunista nos pacientes imunossuprimidos. Como o P. jirovecii é específico do ser humano, o reservatório deve ser constituído pelos indivíduos que apresentam a pneumonia ou a colonização pelo fungo. A colonização foi estudada somente em grupos específicos (pacientes infectados pelo vírus HIV, pacientes com doenças pulmonares crônicas, crianças com a primoinfecção pelo microorganismo, entre outros) e não foi ainda comprovada a colonização de indivíduos adultos saudáveis na população em geral. A distribuição do reservatório do P. jirovecii na comunidade, portanto, não é conhecida. Objetivos Estudar a colonização pelo P. jirovecii na comunidade da região geográfica de abrangência da Unidade Básica de Saúde (UBS) do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA). Determinar a prevalência da colonização; investigar a associação entre dados clínicos ou demográficos e colonização; verificar se adultos saudáveis são colonizados pelo P. jirovecii. Material e métodos Foram selecionados aleatoriamente 405 indivíduos que residem na área atendida pela UBS/HCPA. O lavado de orofaringe e os dados clínicos e demográficos foram coletados no decorrer do ano de 2010. A presença do P. jirovecii no lavado de orofaringe foi investigada através de uma nested-PCR que amplifica a grande subunidade do RNA ribossômico mitocondrial (mtLSUrRNA), a qual foi realizada no Centro de Pesquisa Experimental do HCPA. Os dados obtidos foram submetidos às análises estatísticas univariada e multivariada. Resultados A colonização pelo P. jirovecii foi observada em 7,7% (31/405) dos indivíduos. A análise estatística univariada demonstrou que a presença do fungo está associada ao tabagismo, à doença respiratória crônica e à idade (as crianças e os idosos apresentam-se mais colonizados que os adultos e adolescentes). Na análise multivariada, o tabagismo e a idade foram variáveis cuja associação com a colonização foi independente. Dentre os indivíduos colonizados, três eram adultos saudáveis. Conclusões Uma prevalência de 7,7% (31/405) de colonização entre os indivíduos da população foi identificada. O tabagismo e a idade (crianças e idosos) estão associados à colonização na análise multivariada, o que confirma evidências prévias. Entre os indivíduos colonizados, cerca de 10% (3/31) são pessoas adultas e saudáveis, um grupo que este estudo revela como parte do reservatório do fungo. A prevalência de colonização identificada no estudo, distribuída em diferentes indivíduos da população, sugere que um grande reservatório do P. jirovecii é dinâmico e é mantido através da transmissão do fungo entre os habitantes da região. / Introduction Pneumocystis jirovecii is the cause of a serious opportunistic infection in immunocompromised patients. As a specifically human microorganism, its reservoir is made up of individuals that have pneumonia or are colonized. Colonization has been studied only in specific groups, such as patients with HIV infection or chronic pulmonary diseases and children with primary infection by this microorganism. Colonization in healthy adults in the general population has not been confirmed. The distribution of the P. jirovecii reservoir in the community is, therefore, unknown. Objectives To study colonization by P. jirovecii in the community of the geographic area of the Primary Health Care Unit of Hospital de Clínicas de Porto Alegre (UBS/HCPA); to determine the prevalence of colonization; to evaluate the association between clinical or demographic data and colonization; to investigate whether healthy adults are colonized by P. jirovecii. Material and methods This study randomly enrolled 405 individuals that lived in the geographic area of UBS/HCPA. Oropharyngeal wash specimens and clinical and demographic data were collected along 2010. The presence of P. jirovecii in oropharyngeal wash specimens was investigated using nested PCR, which amplifies the mitochondrial large subunit ribosomal RNA (mtLSUrRNA). Tests were conducted in the Experimental Research Center of HCPA. Univariate and multivariate statistical analyses were used to evaluate the data collected. Results Colonization by P. jirovecii was found in 7.7% (31/405) of the individuals. Univariate statistical analysis revealed that the presence of the fungus was associated with smoking, chronic respiratory diseases and age; children and older adults were more often colonized than adults and adolescents. In multivariate analysis, only smoking and age were independently associated with colonization. Of the individuals with colonization, three were healthy adults. Conclusions The prevalence of colonization among individuals in the population was 7.7% (31/405). Smoking and age (children and older adults) were associated with colonization in multivariate analysis, which confirms previous findings. About 10% (3/31) of all colonized individuals were healthy adults, a group that seems to be part of the reservoir of the fungus. In this study, colonization was distributed among different individuals in the population, which suggests that a large and dynamic reservoir of P. jirovecii is kept by fungus transmission between inhabitants of the region.

Introdução O Pneumocystis jirovecii causa uma grave infecção oportunista nos pacientes imunossuprimidos. Como o P. jirovecii é específico do ser humano, o reservatório deve ser constituído pelos indivíduos que apresentam a pneumonia ou a colonização pelo fungo. A colonização foi estudada somente em grupos específicos (pacientes infectados pelo vírus HIV, pacientes com doenças pulmonares crônicas, crianças com a primoinfecção pelo microorganismo, entre outros) e não foi ainda comprovada a colonização de indivíduos adultos saudáveis na população em geral. A distribuição do reservatório do P. jirovecii na comunidade, portanto, não é conhecida. Objetivos Estudar a colonização pelo P. jirovecii na comunidade da região geográfica de abrangência da Unidade Básica de Saúde (UBS) do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA). Determinar a prevalência da colonização; investigar a associação entre dados clínicos ou demográficos e colonização; verificar se adultos saudáveis são colonizados pelo P. jirovecii. Material e métodos Foram selecionados aleatoriamente 405 indivíduos que residem na área atendida pela UBS/HCPA. O lavado de orofaringe e os dados clínicos e demográficos foram coletados no decorrer do ano de 2010. A presença do P. jirovecii no lavado de orofaringe foi investigada através de uma nested-PCR que amplifica a grande subunidade do RNA ribossômico mitocondrial (mtLSUrRNA), a qual foi realizada no Centro de Pesquisa Experimental do HCPA. Os dados obtidos foram submetidos às análises estatísticas univariada e multivariada. Resultados A colonização pelo P. jirovecii foi observada em 7,7% (31/405) dos indivíduos. A análise estatística univariada demonstrou que a presença do fungo está associada ao tabagismo, à doença respiratória crônica e à idade (as crianças e os idosos apresentam-se mais colonizados que os adultos e adolescentes). Na análise multivariada, o tabagismo e a idade foram variáveis cuja associação com a colonização foi independente. Dentre os indivíduos colonizados, três eram adultos saudáveis. Conclusões Uma prevalência de 7,7% (31/405) de colonização entre os indivíduos da população foi identificada. O tabagismo e a idade (crianças e idosos) estão associados à colonização na análise multivariada, o que confirma evidências prévias. Entre os indivíduos colonizados, cerca de 10% (3/31) são pessoas adultas e saudáveis, um grupo que este estudo revela como parte do reservatório do fungo. A prevalência de colonização identificada no estudo, distribuída em diferentes indivíduos da população, sugere que um grande reservatório do P. jirovecii é dinâmico e é mantido através da transmissão do fungo entre os habitantes da região. / Introduction Pneumocystis jirovecii is the cause of a serious opportunistic infection in immunocompromised patients. As a specifically human microorganism, its reservoir is made up of individuals that have pneumonia or are colonized. Colonization has been studied only in specific groups, such as patients with HIV infection or chronic pulmonary diseases and children with primary infection by this microorganism. Colonization in healthy adults in the general population has not been confirmed. The distribution of the P. jirovecii reservoir in the community is, therefore, unknown. Objectives To study colonization by P. jirovecii in the community of the geographic area of the Primary Health Care Unit of Hospital de Clínicas de Porto Alegre (UBS/HCPA); to determine the prevalence of colonization; to evaluate the association between clinical or demographic data and colonization; to investigate whether healthy adults are colonized by P. jirovecii. Material and methods This study randomly enrolled 405 individuals that lived in the geographic area of UBS/HCPA. Oropharyngeal wash specimens and clinical and demographic data were collected along 2010. The presence of P. jirovecii in oropharyngeal wash specimens was investigated using nested PCR, which amplifies the mitochondrial large subunit ribosomal RNA (mtLSUrRNA). Tests were conducted in the Experimental Research Center of HCPA. Univariate and multivariate statistical analyses were used to evaluate the data collected. Results Colonization by P. jirovecii was found in 7.7% (31/405) of the individuals. Univariate statistical analysis revealed that the presence of the fungus was associated with smoking, chronic respiratory diseases and age; children and older adults were more often colonized than adults and adolescents. In multivariate analysis, only smoking and age were independently associated with colonization. Of the individuals with colonization, three were healthy adults. Conclusions The prevalence of colonization among individuals in the population was 7.7% (31/405). Smoking and age (children and older adults) were associated with colonization in multivariate analysis, which confirms previous findings. About 10% (3/31) of all colonized individuals were healthy adults, a group that seems to be part of the reservoir of the fungus. In this study, colonization was distributed among different individuals in the population, which suggests that a large and dynamic reservoir of P. jirovecii is kept by fungus transmission between inhabitants of the region.

Depuis la disponibilité des combinaisons antirétrovirales (cART) en 1996, l’incidence des infections opportunistes classantes SIDA (IO), dont la pneumocystose (PCP) a très fortement diminué. Malgré tout, chez les patients infectés par le VIH, la PCP était la 2ème IO la + fréquente en France en 2001-2003 et les infections fongiques, avec 1 million de nouveaux cas/an de cryptococcose, restent un problème de santé publique majeur au niveau mondial. Cependant, depuis l’ère des cART, très peu de recherches épidémiologiques sur les infections fongiques dans les pays industrialisés ont été entreprises. C’est dans ce contexte que nous avons mené une étude épidémiologique de 2 infections fongiques chez les patients infectés par le VIH en France sur la French Hospital Database on HIV ANRS CO4 (FHDH) : la pneumocystose et l’aspergillose invasive. Concernant la pneumocystose, sur la période 2004-2011, dans la base FHDH, la moitié des 1259 cas de PCP étaient survenus chez des patients qui avaient interrompus leur suivi, et, pour ceux qui avaient déjà eu une IO avant la PCP, leur mortalité était de 25% à 3 ans. Pour l’aspergillose invasive (AI), après un retour national aux dossiers des cas déclarés sur 20 ans sur la base FHDH, un comité d’experts a validé 242 cas d’AI. Les données montrent que, chez les patients infectés par le VIH, seulement la moitié des AI validées répondaient aux critères EORTC. La mortalité à 3 mois après une AI s’est améliorée après l’ère des cART et un rôle protecteur du voriconazole sur la survie à 3 mois a également été démontré pour la 1ère fois chez les patients infectés par le VIH. / The advent of combined antiretroviral therapy (cART) in 1996 resulted in a dramatic fall in the incidence of AIDS-defining illness (ADI), including Pneumocystis jirovecii pneumonia (PCP). Nevertheless, PCP was the second most frequent ADI in France in 2001-2003 and fungal infections remain a major threat for HIV-infected individuals worldwide. Epidemiological data on fungal infections in the late cART period in resource-rich settings are scarce. The purpose of our work was to study changes in the epidemiology of fungal infections among HIV-infected individuals in France in the late cART period, focusing on PCP and invasive aspergillosis (IA) in the French Hospital Database on HIV ANRS CO4 (FHDH). In the FHDH, during the 2004-2011 period, half of the 1259 PCP cases occurred among HIV-infected individuals who had waning adherence to care, and for those who had a prior ADI before PCP the 3-year mortality rate was 25%. For the second study on IA, a review committee validated IA cases among all the cases that included a diagnostic code for aspergillosis (ICD-9 or ICD-10) in the FHDH over a 20-year period. Our study demonstrated that only half of validated IA cases among HIV-infected individuals met EORTC criteria. The 3-months survival rate after IA diagnosis improved after the advent of cART and a protective role of voriconazole was observed in the period after 2001.

The overall aim of this thesis is to improve knowledge about the prevention of infectious and bleeding complications in patients with hematological malignancies, primarily in those with chronic lymphocytic leukemia (CLL) and myelodysplatic syndrome (MDS). Hypogammaglobulinemia, impaired production of immunoglobulins (Ig), is an established risk factor for infection, but the impact of IgG pure subclass deficiency (IgG subclass deficiency with adequate production of IgG, IgA, and IgM) has been debated. In a retrospective single institution study, we concluded that pure IgG subclass deficiency in CLL patients is rare and is not associated with an increased risk of infection. Hence, routine analysis of IgG subclasses in patients with CLL is not warranted. There is no consensus on recommending vaccination against Streptococcus pneumoniae to CLL patients mainly because comparative studies are lacking. In our randomized trial, the efficacy of a conjugated pneumococcal vaccine on immune response was superior or equal to a polysaccharide vaccine for all pneumococcal serotypes common for the two vaccines. A conjugate pneumococcal vaccine should therefore be included in vaccination programs for patients with CLL. Bronchoalveolar lavage (BAL) is a well-established invasive method to identify the cause of pulmonary infiltrates in immunocompromised patients. In a retrospective trial, we have studied the diagnostic yield of BAL in patients with hematological malignancies. We concluded that BAL is highly useful in either verifying or excluding some of the important respiratory tract infections affecting these patients, particularly invasive pulmonary aspergillosis (IPA) and Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP). However, standardized procedures for BAL sampling should be continually revised to avoid unnecessary microbiological tests. Thrombocytopenia, an adverse prognostic factor in patients with MDS, can be aggravated by azacitidine, first-line treatment for high-risk MDS. Eltrombopag, a thrombopoietin-receptor agonist (TPO-R), alleviates thrombocytopenia in patients with immune thrombocytopenic purpura (ITP). In a phase I clinical trial, we concluded that the combination of eltrombopag and azacitidine in high-risk MDS patients with thrombocytopenia is feasible and well tolerated in doses up to 200 mg eltrombopag daily.