O crescimento anual no número de procedimentos realizados em Medicina Nuclear se deve em primeiro lugar à vantagem de não serem invasivos. Cerca de 80% dos diagnósticos realizados em Medicina Nuclear utilizam radiofármacos preparados com tecnécio-99m devido a suas características físicas ideais, disponibilidade e baixo custo. Dentre os radiofármacos utilizados para identificar processos de infecção e inflamação estão os leucócitos marcados com tecnécio-99m, considerado o padrão ouro e o citrato de gálio (67 Ga), atualmente comercializado no Brasi. Os leucócitos marcados possuem a desvantagem da técnica laboriosa de marcação nem sempre disponível nos centros de Medicina Nuclear, enquanto o citrato de gálio (67 Ga) não é específico e possui energias desfavoráveis para a dosimetria do paciente e para a aquisição de imagens. Neste cenário, novas moléculas para diagnóstico de focos de infecção têm sido pesquisadas, particularmente envolvendo biomoléculas, como os peptídeos antimicrobianos. Nesta categoria, a Ubiquicidina na forma de um fragmento sintético (UBI 29-41) despertou o interesse de pesquisadores que estudaram a marcação com tecnécio-99m utilizando métodos direto e indireto. Um reagente liofilizado de UBI 29-41descrito na literatura demonstrou eficácia no diagnóstico de focos de infecção utilizando-se imagens cintilográficas, porém o produto não está disponível no Brasil. O objetivo deste trabalho foi estudar a marcação do fragmento de UBI 29-41 com tecnécio-99m por método direto e avaliar a utilização de soluções tampão no procedimento de marcação, de modo a flexibilizar o volume da solução de pertecnetato de sódio a ser utilizado, o que constitui aspecto de ineditismo deste trabalho. O fragmento foi radiomarcado com diferentes volumes de soluções tampão alcalinas (carbonato e fosfato) e a utilização dos tampões em substituição à solução de hidróxido de sódio possibilitou realizar a marcação com diferentes volumes da solução de pertecnetato de sódio, sem comprometimento do rendimento de marcação. Uma formulação liofilizada foi avaliada, demonstrando estabilidade por período de 12 meses, viabilizando a produção rotineira do agente de marcação. Os estudos de biodistribuição das preparações efetuadas com os diferentes tampões demonstraram que os complexos formados apresentam características gerais de biodistribuição semelhantes ao composto padrão descrito na literatura, incluindo rápido clareamento sanguíneo e alta captação renal, condizente com a eliminação do produto por esta via. Entretanto, as preparações estudadas apresentaram captação hepática maior e captação renal menor que o composto padrão. As preparações estudadas captaram no foco de infecção provocado por S.aureus e demonstraram potencial para aplicação clínica no diagnóstico em Medicina Nuclear. Como pré-requisito para a realização de estudos clínicos de um novo composto foi realizado estudo de cito e genotoxicidade, cujos resultados demonstraram a segurança das preparações estudadas. / The annual growth in the number of Nuclear Medicine procedures is directly related to the fact that they are non invasive techniques. About 80% of diagnostic procedures in Nuclear Medicine use technetium-labelled radiopharmaceuticals, because of ideal physics characteristics of this radionuclide, disponibility and low cost. Some radiopharmaceuticas employed in the diagnostic of infection and inflammation is technetium labeled leukocytes, considered the gold standard, and gallium citrate (67 Ga) that are commercialized in Brazil. The procedures for labeling leukocytes are laborious and not always aviable in the Nuclear Medicine Centers, that constitutes a disadvantage of this radiopharmaceutical. On the other hand, galium citrate (67 Ga) is not specific and its energies are not favourable for patient dosimetry and image. In this context, new molecules for diagnostic of infection have been studied, particularly biomolecules, as the antimicrobians peptides. In this category, the Ubiquicidine, as a synthetic fragment (UBI 29-41), was particularly investigated by many researchers for labeling with technetium-99m by direct and indirect methods. A liophylized kit described in the literature showed good results in the diagnostic of infection focous by scintilographic images, but this product is not aviable in Brazil. The objective of this work was to study the labeling of the UBI 29-41 fragment with technetium-99m by direct method using buffer solutions on labeling procedure, that results in a less restrictive labeling technique concerning the volume of sodium pertechnetate solution employed, that constitutes in the originality of this work. UBI fragment was labeled with different volumes of alkaline buffers (carbonate and phosphate) and the use of buffers instead sodium hydroxide solution resulted in labeling procedures that employed different volumes of sodium pertechnetate solution without loss in the labeling yield. A liophylized kit was prepared, showing stability for 12 months, that supports a rotine production of this labeling agent. The biodistribution studies using the radiopharmaceutical prepared with different buffers showed that the resulted complexes presented biodistribution characteristics similar to the standard preparation described in the literature, including fast blood clearance and renal excretion. However, the studied preparations showed higher liver uptake and lower renal uptake when compared to the standard preparation. The studied preparations presented good uptake on infection focus produced by inoculation of S.aureus and showed potential for application in clinical procedures in Nuclear Medicine. Citotoxicity and genotoxicity studies were conducted with the peptide fragment as prerequisit for future clinical studies and the results showed the security of the compound for clinical application.

Nos últimos anos, um grande esforço tem sido despendido no estudo de formas de representar documentos textuais, chamados semi-estruturados, objetivando extrair informações destes documentos com a mesma eficiência com que essas são extraídas de bancos de dados relacionais e orientados a objetos. A pesquisa, em dados semi-estruturados, tornou-se fundamental com o crescimento da Web como fonte e repositório de dados, uma vez que os métodos de pesquisa existentes, baseados em navegação e busca por palavra-chave, mostraram-se insuficientes para satisfazer as necessidades de consulta em escala cada vez maior. Com o surgimento da XML, e a tendência de se tornar a linguagem padrão na Web, fez com que a representação de informações fosse dirigida para este novo padrão, porque disponibiliza um bom intercâmbio de informações e a produção de documentos eletrônicos. Existe a necessidade de se disponibilizar os documentos e as informações na rede em formato Web, HTML ou XML. Sendo assim, consultar documentos XML representa um desafio para a comunidade de pesquisa em banco de dados, pois implica em disponibilizar os grandes volumes de dados já existentes em formato XML, surgindo a necessidade de ferramentas de consulta que sejam ao mesmo tempo, flexíveis o suficiente para compreender a heterogeneidade dos documentos e, poderosas ao ponto de extraírem informações com rapidez e correção. Este trabalho apresenta uma abordagem sobre a linguagem XML, sua importância, vantagens, principais aplicações e as linguagens de consulta para dados XML. Após, é detalhada uma aplicação para Web utilizando a tecnologia XML, baseado em Ontologias, e a sua disponibilização na Web. A aplicação desenvolvida utilizou XML e linguagens de consulta para XML e com suporte a XML, baseando-se em Ontologias, com o objetivo de permitir consultas e o armazenamento de informações referentes aos alunos concluintes de determinados cursos da Universidade da Região da Campanha - Urcamp/Bagé, colocando à disposição da Universidade uma nova ferramenta, que disponibiliza informações referentes aos cursos em questão, utilizando uma nova tecnologia, que tende a tornar-se padrão na Web.

O surgimento de diferentes dispositivos computacionais fez crescer a demanda pela possibilidade de utilização de um aplicativo em múltiplas plataformas, exigindo o desenvolvimento de novas técnicas que possibilitem o atendimento desse requisito de forma mais simples. Uma das abordagens propostas para solucionar esse problema é caracterizada pelo uso de interfaces plásticas, que se adaptam ao contexto de uso, e permitem a utilização de uma mesma descrição de interface para diferentes contextos. A adoção de técnicas de desenvolvimento baseado em modelos e de linguagens de descrição de interfaces (como a UsiXML, USer Interface eXtensible Markup Language) permitem a descrição de interfaces de usuário em diferentes níveis de abstração, mas para o desenvolvimento de interfaces plásticas multiplataforma utilizando UsiXML, são necessárias ferramentas que permitam o mapeamento entre cada um desses níveis. Nesse trabalho é apresentado o RenderXML, um renderizador de interfaces de usuário que atua no último nível de abstração da linguagem UsiXML, mapeando descrições de interfaces concretas para interfaces de usuário finais sendo executadas em um dispositivo específico. Além disso, o RenderXML fornece um segundo grau de liberdade ao desenvolvedor, permitindo a conexão da interface de usuário renderizada com lógicas de aplicação desenvolvidas em múltiplas linguagens de programação. Para ilustrar sua aplicação, RenderXML foi usado e testado no desenvolvimento de software multiplataforma, em particular para a criação de livros eletrônicos falados, tema do projeto LIFAPOR, no qual este trabalho está inserido. / The existent of different computing devices has created the necessity of software development for multiple platforms, requiring new techniques that permit the fulfillment of this requirement in a simple way. One of the proposed approaches to solve this problem is characterized by the use of plastic user interfaces, which adapt themselves to an use context, and allow the utilization of the same user interface description in multiple contexts. The adoption of model-based development techniques and user interface description languages (as UsiXML, USer Interface eXtensible Markup Language) enables the specification of user interfaces at different levels of abstraction, but requires tools which perform the mapping between each one of these levels. This work presents RenderXML, a user interface rendering application which acts on the last abstraction level of UsiXML, mapping concrete user interfaces descriptions to final user interfaces running on a specific device. Moreover, RenderXML provides a second degree of freedom to the developer, allowing the connection of the rendered user interface to functional cores developed in multiple programming languages. To illustrate its application, RenderXML was used and tested in the development of multiplatform software, in particular in the creation of digital talking books, theme of the LIFAPOR project, in which this work is inserted.

Tese de mestrado integrado. Engenharia Electrotécnica e de Computadores. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2010

O surgimento de diferentes dispositivos computacionais fez crescer a demanda pela possibilidade de utilização de um aplicativo em múltiplas plataformas, exigindo o desenvolvimento de novas técnicas que possibilitem o atendimento desse requisito de forma mais simples. Uma das abordagens propostas para solucionar esse problema é caracterizada pelo uso de interfaces plásticas, que se adaptam ao contexto de uso, e permitem a utilização de uma mesma descrição de interface para diferentes contextos. A adoção de técnicas de desenvolvimento baseado em modelos e de linguagens de descrição de interfaces (como a UsiXML, USer Interface eXtensible Markup Language) permitem a descrição de interfaces de usuário em diferentes níveis de abstração, mas para o desenvolvimento de interfaces plásticas multiplataforma utilizando UsiXML, são necessárias ferramentas que permitam o mapeamento entre cada um desses níveis. Nesse trabalho é apresentado o RenderXML, um renderizador de interfaces de usuário que atua no último nível de abstração da linguagem UsiXML, mapeando descrições de interfaces concretas para interfaces de usuário finais sendo executadas em um dispositivo específico. Além disso, o RenderXML fornece um segundo grau de liberdade ao desenvolvedor, permitindo a conexão da interface de usuário renderizada com lógicas de aplicação desenvolvidas em múltiplas linguagens de programação. Para ilustrar sua aplicação, RenderXML foi usado e testado no desenvolvimento de software multiplataforma, em particular para a criação de livros eletrônicos falados, tema do projeto LIFAPOR, no qual este trabalho está inserido. / The existent of different computing devices has created the necessity of software development for multiple platforms, requiring new techniques that permit the fulfillment of this requirement in a simple way. One of the proposed approaches to solve this problem is characterized by the use of plastic user interfaces, which adapt themselves to an use context, and allow the utilization of the same user interface description in multiple contexts. The adoption of model-based development techniques and user interface description languages (as UsiXML, USer Interface eXtensible Markup Language) enables the specification of user interfaces at different levels of abstraction, but requires tools which perform the mapping between each one of these levels. This work presents RenderXML, a user interface rendering application which acts on the last abstraction level of UsiXML, mapping concrete user interfaces descriptions to final user interfaces running on a specific device. Moreover, RenderXML provides a second degree of freedom to the developer, allowing the connection of the rendered user interface to functional cores developed in multiple programming languages. To illustrate its application, RenderXML was used and tested in the development of multiplatform software, in particular in the creation of digital talking books, theme of the LIFAPOR project, in which this work is inserted.

O uso da Internet como ferramenta de ensino tem se tornado cada vez mais freqüente. A recente popularização da Internet vem permitindo o desenvolvimento de ambientes de ensino-aprendizagem baseados na Web. Os principais recursos explorados para fins educacionais são hipertexto e hipermídia, que proporcionam uma grande gama de elementos para o instrutor que pretende utilizar a WWW. Este trabalho está inserido no desenvolvimento do ambiente AdaptWeb (Ambiente de Ensino e Aprendizagem Adaptativo para a Web), que visa o desenvolvimento de um ambiente de educação a distância. A arquitetura do ambiente é composta por quatro módulos entre eles o módulo de Armazenamento de dados que armazena todos os dados provenientes da fase de Autoria utilizando XML (Extensible Markup Language). Na etapa de Autoria é feita a inserção de todos os dados relativos a disciplina que deseja disponibilizar, estes dados serão armazenados temporariamente em uma representação matricial em memória. A entrada de dados do módulo de Armazenamento de Dados é esta representação matricial que serve então como base para a geração dos arquivos XML, que são utilizados nas demais etapas do ambiente. Para a validação dos arquivos XML foram desenvolvidas DTD (Document Type Definition) e também foi implementado um analisador de documentos XML, utilizando a API (Application Programming Interface) DOM (Document Object Model), para efetuar a validação sintática destes documentos. Para conversão da representação matricial em memória foi especificado e implementado um algoritmo que funciona em conformidade com as DTD especificadas e com a sintaxe da linguagem XML.

Existem vários trabalhos na área de extração de dados semi-estruturados, usando diferentes técnicas. As soluções de extração disponibilizadas pelos trabalhos existentes são direcionadas para atenderem a dados de certos domínios, considerando-se domínio o conjunto de elementos pertencentes à mesma área de interesse. Dada a complexidade e a grande quantidade dos dados semi-estruturados, principalmente dos disponíveis na World Wide Web (WWW), é que existem ainda muitos domínios a serem explorados. A maior parte das informações disponíveis em sites da Web está em páginas HTML. Muitas dessas páginas contêm dados de certos domínios (por exemplo, remédios). Em alguns casos, sites de organizações diferentes apresentam dados referentes a um mesmo domínio (por exemplo, farmácias diferentes oferecem remédios). O conhecimento de um determinado domínio, expresso em um modelo conceitual, serve para definir a estrutura de um documento. Nesta pesquisa, são consideradas exclusivamente tabelas de páginas HTML. A razão de se trabalhar somente com tabelas está baseada no fato de que parte dos dados de páginas HTML encontra-se nelas, e, como conseqüência, elimina-se o processamento dos outros dados, concentrando-se os esforços para que sejam processadas automaticamente. A pesquisa aborda o tratamento exclusivo de tabelas de páginas HTML na geração das regras de extração, na utilização das regras e do modelo conceitual para o reconhecimento de dados em páginas semelhantes. Para essa técnica, foi implementado o protótipo de uma ferramenta visual denominado Gerador de Regras de Extração e Modelo Conceitual (GREMO). GREMO foi desenvolvido em linguagem de programação visual Delphi 6.0. O processo de extração ocorre em quatro etapas: identificação e análise das tabelas de informações úteis em páginas HTML; identificação de conceitos para os elementos dos modelos conceituais; geração dos modelos conceituais correspondentes à página, ou utilização de modelo conceitual existente no repositório que satisfaça a página em questão; construção das regras de extração, extração dos dados da página, geração de arquivo XML correspondente aos dados extraídos e, finalmente, realimentação do repositório. A pesquisa apresenta as técnicas para geração e extração de dados semi-estruturados, as representações de domínio exclusivo de tabelas de páginas HTML por meio de modelo conceitual, as formas de geração e uso das regras de extração e de modelo conceitual.

O problema da integração de dados (fragmentação de dados, decomposição de consultas) tem sido largamente estudado na literatura, mas a estrutura hierárquica inerente do modelo XML apresenta problemas que são específicos deste modelo de dados. Cada relacionamento conceitual muitos-para-muitos deve ser mapeado para uma estrutura hierárquica específica em XML. Diferentes fontes XML podem implementar o mesmo relacionamento conceitual muitos-para-muitos de diferentes maneiras. Na abordagem proposta neste trabalho, o problema de integra»c~ao de fontes de dados XML é dividido em dois problemas: (1) naquele da fragmentação de um modelo global do tipo grafo (ex., um modelo ER) em diversos modelos locais do tipo grafo representando conceitualmente fontes de dados e (2) naquele do ma- peamento de um modelo local do tipo grafo em um esquema hierárquico XML. Este trabalho apresenta um conjunto de operadores especificamente projetados para esta abordagem, assim como um mecanismo de decomposi»c~ao que permite que uma con- sulta especificada em um nível conceitual seja decomposta em uma consulta XQuery especificada no nível XML. Como linguagem de consulta para o nível conceitual, é adotado o CXPath (Conceptual XPath), uma linguagem de consulta proposta em um trabalho anterior. / The problem of data integration (query decomposition, data fragmentation) has been widely studied in literature, but the inherent hierarchical nature of XML data presents problems that are specific to this data model. Each many-to-many con- ceptual relationship must be mapped to a specific hierarchical structure in XML. Di®erent XML sources may implement the same many-to-many conceptual rela- tionship in di®erent ways. In our approach the problem of integration of XML data sources is decomposed in two problems: (1) that of fragmentation of a global graph-like model (e.g., an ER model) into several local graph-like models conceptu- ally representing data sources and (2) that of mapping the local graph-like model into an XML tree-like schema. This work presents a set of fragmentation operators specifically designed for our approach, as well as a query decomposition mechanism that allows a query stated at the conceptual level to be decomposed into an XQuery statement at the XML level. As the query language at the conceptual level, we adopt CXPath (conceptual XPath) a query language we have defined in previous work.

Algoritmos de similaridade que comparam dados expressos em XML são importantes em diversas aplicações que manipulam informações armazenadas nesse padrão. Sistemas de integração de dados XML e de consulta a instâncias XML são exemplos dessas aplicações. A utilização de funções de similaridade para efetuar as comparações nessas aplicações melhora seus resultados finais. A melhora ocorre porque as funções de similaridade possibilitam encontrar estruturas não idênticas às apresentadas nos parâmetros das consultas mas que armazenam informações relevantes. Uma característica importante que pode ser utilizada para definir se dois elementos XML representam o mesmo objeto real é os caminhos que chegam a estes elementos nas suas respectivas árvores. No entanto, os nodos que representam um determinado objeto real em duas instâncias XML diferentes podem se acessados por caminhos distintos, devido a opções de modelagem dos documentos. Portanto um algoritmo para calcular a similaridade entre caminhos XML é importante para as aplicações descritas acima. Neste contexto, esta dissertação objetiva desenvolver um algoritmo de similaridade entre caminhos XML. O resultado principal do trabalho é um algoritmo de similaridade entre caminhos XML, nomeado PathSim, que efetua o cálculo de similaridade entre dois caminhos baseado no número mínimo de operações de edição (inserção, remoção e substituição de nomes de elementos) necessárias para transformar um caminho no outro. Além deste algoritmo, foram desenvolvidas três funções de pré-processamento para simplificar os caminhos XML e melhoram os resultados do algoritmo. Adicionalmente, duas variações do algoritmo PathSim são apresentadas, uma incrementada com comparações entre combinações de nomes de elementos, nomeada PathSimC, e a outra auxiliada por técnicas de alinhamento, nomeada PathSimA. Experimentos utilizando documentos XML criados por terceiros, validam empiricamente os algoritmos PathSim e PathSimC.Nos experimentos, os algoritmos foram comparados a uma abordagem para mensurar a similaridade entre caminhos encontrada na literatura. Os algoritmos apresentam melhores resultados que o baseline. Os ganhos variam de acordo com o ambiente onde os caminhos foram extraídos e com as funções de pré-processamento que foram aplicadas aos caminhos. / Similarity algorithms for comparing XML data are important in various applications that manipulate information stored according to this standard. XML data integration systems and XML instance querying systems are examples of such applications. The use of similarity functions to evaluate comparisons in these applications improves their final results. The improvement occurs because similarity functions allow finding structures that are not identical to the query parameter but store relevant information. One important feature that may be used to define if two XML elements represent the same real world object is the paths that lead to those objects in their corresponding trees. However, the nodes that represent a specific real world object in two different XML instances may be accessed by distinct paths, due to XML design decisions. Thus a method for assessing the similarity of XML paths is important in the applications described above. In this context, the goal of this dissertation is to develop a XML path similarity algorithm. The main contribution of this work is a XML path similarity algorithm, named Path- Sim, that calculates the similarity between two paths by computing the minimum number of edit operations (element name insertions, deletions and substitutions) required to transform one path into another. Besides the algorithm, three preprocessing functions were developed to simplify XML paths and improve the results of the algorithm. Additionally, two variations of PathSim algorithm are presented, one enhanced with comparisons among combinations of element names, named PathSimC, and the other one assisted by alignment techniques, named PathSimA. Experiments using XML documents created by third parties validate the algorithms PathSim and PathSimC empirically. On the experiments, the algorithms are compared to a path similarity algorithm found in the literature. The proposed algorithms presents better results than the baseline. The gains vary according to the environment from which the paths were extracted and to the preprocessing functions applied.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Comunicação e Expressão. Programa de Pós-Graduação em Letras/Inglês e Literatura Correspondente / Made available in DSpace on 2012-10-23T10:39:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 249271.pdf: 3171345 bytes, checksum: 00f207cece278de30d1f5b7fd246c496 (MD5) / Pesquisas recentes sobre comunicação científica têm revelado que desde o final dos anos de 1990 o uso de periódicos acadêmicos passou da mídia impressa para o mídia eletrônica (Tenopir, 2002, 2003; Tenopir & King, 2001, 2002) e, conseqüentemente, há previsões de que por volta de 2010 cerca de 80% dos periódicos terão apenas versões online (Harnad, 1998). Todavia, essas pesquisas mostram também que nem todas as disciplinas estão migrando para a Internet com a mesma velocidade. Enquanto que áreas como as Ciências da Informação, Arquivologia, Web design e Medicina têm mostrado interesse e preocupação em entnder e explicar esse fenômeno, em Lingüística Aplicada, particularmente em Análise de Gênero, os estudos ainda são escassos. Neste trabalho, portanto, procuro investigar em que medida o meio eletrônico (Internet) afeta o gênero artigo acadêmico no seu processo de mudança da mídia impressa para a mídia eletrônica. Mais especificamente, examino artigos acadêmicos em HTML nas áreas de Lingüística e Medicina com vistas a verificar se esse hypertexto é um gênero novo ou não. A abordagem metodológica adotada nesta pesquisa deriva da proposta de Askehave e Swales (2001) e de Swales (2004), na qual o critéro predominante para a classificação de um gênero é o propósito comunicativo, o qual só pode ser definido com base em uma análise textual tanto quanto em uma análise contextual. Dessa forma, neste estudo foram coletados e analisados dados textuais e contextuais e os resultados de ambas análises revelam que o artigo acadêmico em HTML é um gênero novo, cujo propósito comunicativo é realizado por hiperlinks e portanto, esse gênero é profundamente dependente da mídia eletrônica.