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Identificação de marcadores e caracterização de mecanismos moleculares associados à resistência à ferrugem da folha em trigo / Molecular markers and mechanisms associated to the leaf rust resistance in wheat

Silva, Paulo Roberto da January 2006 (has links)
A ferrugem da folha é a doença que causa maiores prejuízos à triticultura. A resistência genética é comprovadamente o método mais eficiente e econômico de controle. Em trigo, a resistência à ferrugem da folha pode ser específica à raça e não específica à raça. Atualmente a melhor estratégia para manter uma proteção efetiva contra a ferrugem da folha consiste em empregar combinações de genes, independente do tipo de resistência que conferem. A piramidização de genes é facilitada com o uso de marcadores moleculares. Os mecanismos moleculares de resistência dos genes que conferem resistência específica à raça têm sido amplamente estudados, no entanto da resistência não específica à raça pouco se sabe. Assim, este projeto teve como objetivos: I) validar marcadores moleculares para seleção assistida para a resistência à ferrugem da folha em genótipos brasileiros de trigo; II) identificar marcadores moleculares potencialmente associados a genes de resistência não específica à raça à ferrugem da folha; III) identificar e caracterizar análogos a genes de resistência em trigo;IV) caracterizar mecanismos moleculares da resistência não específica à raça a ferrugem da folha em trigo. Para a validação foram avaliados cinco marcadores PCR-específcos associados aos genes Lr1, Lr9, Lr10 e Lr24. Os marcadores associados aos genes Lr9, Lr10 e Lr24 apresentaram potencial para uso na seleção assistida, pois foram específicos para plantas contendo estes genes. Para a identificação de RGAs foram utilizadas três combinações de primers degenerados. A maioria das seqüências apresentou os motivos comuns a genes de resistência. Uma seqüência apresentou alta homologia com genes de resistência previamente identificados. Os primers derivados das seqüências identificadas apresentaram alto polimorfismo, sendo que um destes mostrou-se associado ao gene Lr26 e a resistência de planta adulta à ferrugem da folha. A combinação da técnica de AFLP com linhagens diferenciais contrastantes para os genes Lr13 e Lr34 permitiu identificar duas seqüências potencialmente associadas ao gene Lr34. O uso da SSH permitiu identificar genes diferencialmente expressos na resistência não específica à raça à ferrugem da folha no cultivar Toropi. Dentre as seqüências identificadas estão genes codificadores de proteínas de membranas potencialmente associados à percepção do patógeno e genes com domínios característicos de sinalizadores secundários para a resistência como NPR1, Rar1, Sgt1 e calmodulina. Além destas, foram identificados também seqüências com homologia a genes codificadores de enzimas chaves no controle de rotas de síntese de substâncias relacionadas à defesa e envolvidas no metabolismo primário, principalmente produção de energia. Os marcadores e seqüências obtidas e mecanismos elucidados neste trabalho representam ferramentas valiosas para a obtenção de cultivares de trigo com resistência ampla e durável à ferrugem da folha. / Leaf rust is one of the most important wheat diseases worldwide. The genetic resistance is the most efficient and economical method to leaf rust control. Host resistance to leaf rust can either be race-specific or no race-specific. The best strategy to maintain an effective protection against leaf rust consists in resistance gene combinations, independent of the resistance type. Marker-assisted selection greatly facilitates gene pyramidization. The molecular mechanisms of race-specific resistance genes have been well studied, however there is little known about the no race-specific resistance gene mechanisms. The objectives of this project were: I) to validate molecular markers for marker-assisted selection to leaf rust resistance genes in Brazilian wheat cultivars; II) to isolate and characterize resistance gene analogues (RGAs) in wheat; III) to identify molecular markers potentially associated to leaf rust no race-specific resistance genes; IV) to characterize molecular mechanisms from no race-specific resistance genes to leaf rust in wheat. Five PCR-specific markers previously identified as associated to the Lr1, Lr9, Lr10 and Lr24 genes were evaluated. The markers associated to the Lr9, Lr10 and Lr24 genes were specific to the cultivars carrying them in the Brazilian wheat cultivars, demonstrating potential for marker-assisted selection. Three degenerate primer combinations were used for the RGAs identification and most of the identified sequences showed the conserved motifs from resistance genes. One sequence showed high homology with previous identified plant resistance genes. The primers from identified sequences showed high polimorphism, and one of these is associated to the Lr26 leaf rust resistance gene and to the adult plant resistance present in cultivar BR35(?). The use of AFLP (amplified fragment length polymorphism) technique with near-isogenic lines carrying Lr13 and Lr34 genes from wheat cv. Thatcher allowed to identify two sequences potentially associated to the Lr34 gene. SSH were used to identify leaf rust induced genes from no race-specific resistance wheat cultivar Toropi. Among the identified sequences there are proteins of membranes for genes potentially associated to the pathogen perception and genes with secondary signals resistance domains as NPR1, Rar1, Sgt1 and calmodulin binding protein. Besides these, we identified sequences with homology to genes for key enzymes in the control of the related defense substances synthesis and involved in the primary metabolisms, mainly energy production. The markers and sequences obtained and the mechanisms elucidated in this work represent a valuable tool for the development of wheat cultivars with more reliable resistance to leaf rust.
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A metodologia de análise de dados espaciais aplicada a plantas forrageiras / A Methodology of spatial data analysis applied on forage plant

Cadenazzi Pascual, Monica Graciela January 2000 (has links)
Dois experimentos e um levantamento por amostragem foram analisados no contexto de dados espaciais. Os experimentos foram delineados em blocos completos casualizados sendo que no experimento um (EXP 1) foram avaliados oito cultivares de trevo branco, sendo estudadas as variáveis Matéria Seca Total (MST) e Matéria Seca de Gramíneas (MSGRAM) e no experimento dois (EXP 2) 20 cultivares de espécies forrageiras, onde foi estudada a variável Percentagem de Implantação (%IMPL). As variáveis foram analisadas no contexto de modelos mistos, sendo modelada a variabilidade espacial através de semivariogramas exponencias, esféricos e gaussianos. Verificou-se uma diminuição em média de 19% e 14% do Coeficiente de Variação (CV) das medias dos cultivares, e uma diminuição em média de 24,6% e 33,3% nos erros padrões dos contrastes ortogonais propostos em MST e MSGRAM. No levantamento por amostragem, estudou-se a associação espacial em Aristida laevis (Nees) Kunth , Paspalum notatum Fl e Demodium incanum DC, amostrados em uma transecção fixa de quadros contiguos, a quatro tamanhos de unidades amostrais (0,1x0,1m; 0,1x0,3m; 0,1x0,5m; e 0,1x1,0m). Nas espécies Aristida laevis (Nees) Kunth e Paspalum notatum Fl, existiu um bom ajuste dos semivariogramas a tamanhos menores das unidades amostrais, diminuíndo quando a unidade amostral foi maior. Desmodium incanum DC apresentou comportamento contrario, ajustando melhor os semivariogramas a tamanhos maiores das unidades amostrais. / Two experiments and one sample survey were analysed used methods for spatial statistical analysis. The experiments were in randomized blocks; in the first (EXP 1), measurement of total dry matter (MST) and dry weight of seeds (MSGRAM) were recorded for nine cultivars of white clover. In the second experiment (EXP 2), percentage of take (%IMPL) was recorded for 20 cultivars of forage plant species. Variables were analysed in the context of mixed models, with spatial variability modeled in terms of exponential, spherical and Gaussian semivariograms. A mean reduction of 19% an 13.7% was found for the Coefficient of Variation (CV) for the cultivar means, and a mean reduction of 24.6% and 33.3% was found for the standard errors of orthogonal contrast for MST and MSGRAM. In the sample survey, the spatial association was studied for Aristida laevis, Paspalum notatum and Desmodium incanum, sampled on a fixed transect for adjacent plots, for four sizes of sampling units (0.1 x 0.1m; 0.1 x 0.3 m; 0.1 x 0.5 m and 0.1 x 1 m). For the species Aristida laevis and Paspalum notatum, semivariograms fitted well for the smaller sampling units, but goodness of fit declined with increasing size of sampling unit. The opposite was found for Desmodium incanum, were semivariogram fit was better for larger sampling units.
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Mapeamento de locos de características quantitativas associados a desempenho e carcaça nos cromossomos 11 e 13 de Gallus gallus

Boschiero, Clarissa [UNESP] 22 February 2006 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:19Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-02-22Bitstream added on 2014-06-13T19:35:15Z : No. of bitstreams: 1 boschiero_c_me_botfmvz.pdf: 659097 bytes, checksum: 7983c4a2922fd57ea2f00e34dedf4a2e (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O objetivo deste trabalho foi identificar locos controladores de características quantitativas (QTLs) nos cromossomos 11 e 13 de galinhas (Gallus gallus) para características de desempenho e carcaça. A partir do cruzamento entre uma linhagem de corte e uma de postura, foi gerada a população experimental F2 na Embrapa Suínos e Aves. Foram avaliadas as seguintes informações fenotípicas: peso ao nascer, peso aos 35, 41 e 42 dias, ganho de peso, consumo de ração, eficiência e conversão alimentar dos 35 aos 41 dias e valores de hematócrito. As carcaças foram evisceradas e avaliados: o comprimento do intestino, peso dos pulmões, do fígado, do coração e da moela. Foram obtidos após quatro horas de resfriamento: peso da carcaça, gordura abdominal, peso de partes: peito, coxas, dorso, asas, cabeça e pés. Quatro e cinco marcadores microssatélites dos cromossomos 11 e 13, respectivamente, foram genotipados num total aproximado de 330 animais F2 em quatro famílias de irmãos-completos. Os mapas de ligação para ambos os cromossomos foram construídos e a análise de mapeamento de QTLs baseada no modelo genético de F2 foi realizada. No cromossomo 11 foram mapeados dois QTLs sugestivos: para peso de pés e de moela, ambos posicionados no intervalo entre ADL0123 e ADL0210. No cromossomo 13 foi mapeado um QTL sugestivo para peso de coração posicionado no intervalo entre MCW0110 e MCW0104. / The objective of this study was to identify quantitative trait loci (QTLs) for performance and carcass traits in chicken (Gallus gallus) chromosomes 11 and 13. From the crossbreeding of a broiler and a layer line, an F2 experimental population was generated at the Embrapa Suínos e Aves. The following phenotypic data were recorded: body weights at birth, 35, 41 and 42 d; weight gain, feed consumption and feed conversion from 35 to 41 d; weights of carcass, carcass parts, organs and abdominal fat, hematocrit and length of intestine. Four and five microsatellite markers from chromosomes 11 and 13, respectively, were genotyped in approximately 330 F2 chickens from four full-sib families. The linkage maps for both chromosomes were constructed and the QTL mapping analyses were carried out based on an F2 genetic model. Two suggestive QTLs were mapped to chromosome 11: for feet and gizzard weights, both located in the interval between ADL0123 and ADL0210. On chromosome 13 one suggestive QTL for heart weight was detected in the interval between MCW0110 and MCW0104.
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Possíveis associações entre marcadores genético-bioquímicos e sensibilidade a mastite em vacas da raça holandês, pura por cruzamento, variedade malhada de preto, em ambiente tropical

Repetti, Leandro [UNESP] January 2003 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003Bitstream added on 2014-06-13T19:35:49Z : No. of bitstreams: 1 repetti_l_me_botfmvz.pdf: 176079 bytes, checksum: be20a2b4bea8e875acd51fdecc8bce0e (MD5) / A mastite é um processo inflamatório da glândula mamária, aguda ou crônica, freqüente em ruminantes, sendo consideráveis as perdas econômicas por tal patologia, por desencadear inúmeros problemas sanitários para a pecuária leiteira. Portanto, a análise do polimorfismo dessas proteínas constitui-se numa importante ferramenta para o melhoramento genético do rebanho leiteiro. Neste trabalho, foram analisadas possíveis associações entre o polimorfismo bioquímico das hemoglobinas, transferrinas, albuminas séricas e beta lactoglobulinas e freqüência de mastite em vacas da raça Holandês, num rebanho controlado, mantidas em ambiente tropical. Embora não tenha sido constatada diferença significativa entre as freqüências de polimorfismo bioquímico das proteínas entre as duas populações estudadas, propõe-se a realização de novos estudos na área de biologia genética para que os dados que forem obtidos poderão ser empregados na orientação de programas de manejo e de melhoramento com vistas à resistência a mastite. / Mastitis is an inflammatory process of the mammary gland, sharp or chronic; frequent in ruminant, being considerable the economical losses for such pathology, for unchaining countless sanitary problems for the livestock milk pan. Therefore, the analysis of polymorphism of those proteins is constituted of an important tool for the flock milkman's genetic improvement. In this work, possible associations were analyzed among the biochemical polymorphism of the hemoglobins, transferrins, serum albumins and beta lactoglobulins and mastitis frequency in cows of the Dutch race, in a controlled flock, maintained in tropical atmosphere. Although it has not been verified significant differences among the frequencies of biochemical polymorphism of the proteins among the two studied populations, intends the accomplishment of new studies in the area of genetic biology so that the data that be obtained can be used in the orientation of handling programs and of improvement with views to the resistance the mastitis.
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Concentrados de alta fibra em dietas para a terminação de novilhas Nelore

Oliveira, Priscila Silva Neubern de [UNESP] 02 July 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-02Bitstream added on 2014-06-13T19:16:12Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_psn_me_jabo.pdf: 143666 bytes, checksum: 8917daa47b0787a19d0ef98f6d336e3a (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O estudo foi conduzido para avaliar o efeito de duas proporções de concentrado, 70 e 80%, com duas fontes energéticas, milho e farelo de gérmen de milho, e volumoso à base de silagem de milho, sob o consumo de nutrientes, desempenho, características de carcaça, não componentes de carcaça e qualidade da carne de 28 novilhas Nelore confinadas, com aproximadamente 14 meses de idade e peso corporal médio de 200 kg, objetivando o abate. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado segundo esquema fatorial 2 x 2 ( 2 proporções de concentrado x 2 fontes energéticas) totalizando 4 tratamentos e 7 repetições, sendo as médias comparadas pelo teste de Tukey a 5%. Não houve interação da proporção de concentrado x fonte energética da dieta sobre o consumo de MS. Houve efeito significativo da interação proporção de concentrado x fonte energética da dieta para os consumos de proteína bruta (PB) e fibra em detergente neutro (FDN), sendo que a maior proporção de concentrado, associada ao milho, possibilitou maior consumo diário de PB (1,17 kg/dia) e FDN (4,05 kg/dia). Observou-se valor médio de consumo de fibra em detergente ácido superior para as dietas com 80% de concentrado, tanto para a dieta com milho quanto com farelo de gérmen de milho. Houve efeito significativo da fonte energética da dieta sobre o peso final dos animais, sendo que os animais alimentados com as dietas contendo milho apresentaram valor médio de peso final (326,14 kg) superior aos alimentados com as dietas contendo farelo de gérmen de milho (292,07 kg). A associação de altas proporções de concentrado, com milho como fonte energética, proporciona resultados satisfatórios de ganho em peso e desempenho de novilhas Nelore, já a substituição total do milho pelo farelo de gérmen de milho, associado à altas proporções de concentrado ricos em fibra... / The objective of this study was to evaluate the effect of two proportions of concentrate, 70 and 80%, with two energy sources, corn and corn germ meal, and roughage basis of corn silage on the intake of nutrients, performance, characteristics of a carcass, non components of carcass and meat quality of confined 28 Nellore heifers. The experimental design was a completely randomized design in factorial scheme 2 x 2 (2 proportions of concentrate x 2 energy sources) 4 replications and 7 treatments, and the averages has been compared by Tukey 5% test.. There was no interaction proportion of concentrate x energy source on the intake of dry matter. There was a significant effect of interaction proportion of concentrate x energy source intake for crude protein (CP) and neutral detergent fiber (NDF), suggesting that a higher proportion of concentrate, with the corn, allowed greater intake of CP (1.17 kg / day) and NDF (4,05 kg / day). It was observed average intake of acid detergent fiber than for diets with 80% concentrate, with both the diet with corn as the corn germ meal. There was a significant effect of dietary energy source on the final weight of animals, and the animals fed the diets with corn had average final weight (326.14 kg), above the fed with diets with corn germ meal (292.07 kg). The association of high proportions of concentrate with corn as an energy source, provided satisfactory results in performance of Nellore heifers, since the replacement of the corn germ meal, associated with high proportions of concentrate rich in fiber, not was recommended for young Nellore heifers. There was a significant effect the energy source of the diet on the weight of empty body, and the animals that received the diets with corn showed the average value of empty body weight (309.44 kg) than the diets of with corn germ meal (276.42 kg). The carcass yield, the thickness... (Complete abstract click electronic access below)
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Seleção de progênies de cruzamentos entre Saccharum spontaneum e cana-de-açúcar para produção de bioenergia

Alvim, Karen Rodrigues de Toledo [UNESP] 27 February 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:50:56Z : No. of bitstreams: 1 000867500.pdf: 2019573 bytes, checksum: 40f7858028aeee27f3505baf4ff535b9 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Há alguns anos se tem falado e mostrado a necessidade de geração de energia através de fontes renováveis, pouco poluentes e que possam ajudar a atender a alta demanda de combustíveis que vem sendo gerada de forma cada vez mais acelerada. Com o intuito de auxiliar nessa questão, procurou-se identificar genótipos superiores em produção de biomassa para produção de bionergia, oriundos de três cruzamentos entre cultivares comerciais de cana-de-açúcar e genótipos de Saccharum spontaneum. Foram utilizados três cruzamentos, sendo um biparental denominado de Família 5002 (RB855465 x GLAGAH) e dois policruzamentos denominados de Família 5006 (NG26011 x ?) e Família 5008 (SE5069 x ?). Os seedlins cedidos ao IAC (Instituto Agronômico de Campinas) foram transplantados no dia 05 de abril de 2011 no Centro de Cana em Ribeirão Preto/SP. O delineamento utilizado foi o de blocos aumentados, com 9 blocos de 3 parcelas, cada parcela com 5 linhas de 10 plantas cada, totalizando 1.350 plantas. O espaçamento utilizado foi de 1,5 x 1,5 m (entre plantas e entre linhas). Como cultivares padrão, foram utilizadas 5 cultivares comerciais (IACSP95-5000, IACSP95-5094, IAC91-1099, IACSP93-3046 e IACSP94-2101). A colheita de cana planta foi realizada aos 10 meses após o plantio e a de cana soca 7 meses após o primeiro corte. Foram avaliadas características biométricas, de produção e análises tecnológicas, além da seleção fenotípica massal dos indivíduos com melhor perfil bioenergético e correlação entre os atributos. Na comparação entre as médias das famílias e dos cruzamentos padrão, houve diferença significativa, com exceção da Família 5008 que não diferiu das cultivares. Das 326 progênies selecionadas durante a seleção massal, 245 foram da Família 5002, 19 foram da Família 5008 e 62 foram da Família 5006. Na seleção pela análise estatística, via modelos mistos, a produtividade genotípica predita das... / For a few years now, it has been discussed and exposed the need of energy generation through renewable, low-polluting sources that might be able to attend to the high demand for fuel, which is constantly growing. With the purpose of aiding in this matter, it was intended to identify genotypes with superior biomass production for energy production, descending from three crossbreeds between sugarcane commercial cultivars and genotypes from Saccharum spontaneum. Three crossbreeds were used, being one biparental crossbreed named Family 5002 (RB855465 x GLAGAH) and two polycrosses named Family 5006 (NG26011 x ?) and Family 5008 (SE5069 x ?). The seedlings provided to the IAC (Instituto Agronômico de Campinas - Agronomic Institute of Campinas) were transplanted in April 5th 2011 from the Sugar Cane Center in Ribeirao Preto/SP. It was used the augmented block design, with 9 blocks of 3 portions each, each portion having 5 lines of 10 plants each, totalizing 1350 plants. The spacing used was 1.5 x 1.5 m (between plants and lines). As standard cultivars, were used 5 commercial cultivars (IACSP95-5000, IACSP95-5094, IAC91-1099, IACSP93-3046 and IACSP94-2101). The harvest of each plant was performed 10 months after plantation and the ratoon cane 7 months after the first cut. Were evaluated characteristics regarding biometry, production and technological analyzes, and also mass phenotypic selection of subjects with better bioenergetics profile and correlation between the attributes. In the comparison between the medium of families and standard crossbreeds, a significant difference was noted, except the Family 5008 which wasn't different from the cultivars. From the 326 progenies chosen during the mass selection, 245 were from Family 5002, 19 from Family 5008 and 62 from the Family 5006. The selection by statistic analysis, via mixed models, the predicted genotypic productivity of the 30 superior progenies varied from 176.70 to 221.31 ...
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Caracterização de uma região relacionada à característica Lignotúber em eucalipto /

Bortoloto, Tânia Mara. January 2011 (has links)
Orientador: Celso Luís Marino / Banca: Douglas da Silva Domingues / Banca: Esteban Roberto González / Banca: Ivan de Godoy Maia / Banca: Edson Luiz Furtado / Resumo: O grupo CAGEN em parceria com a empresa Suzano de Papel e Celulose vem desenvolvendo projetos de identificação de características relacionadas ao estresse abiótico em eucalipto. A presença de lignotuber é uma característica que confere a essas espécies maior tolerância a níveis de estresse. Em 2006 foi realizado um experimento que demonstrou uma correlação entre o aumento dos níveis de estresse e o aumento da formação de lignotuber em eucalipto, até atingir a proporção de 3:1, indicando a ação de um gene com efeito principal na formação do lignotuber. Através da técnica de BSA (Bulked Segregant Analyses) em conjunto com marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) foi possível detectar um marcador molecular que permitiu a identificação de indivíduos não portadores do lignotuber em eucalipto. Esse marcador foi convertido em SCAR e passou a ser chamado de ELig (Eucalyptus - Lignotuber). Diante do exposto, esse trabalho teve como objetivo a caracterização dessa região genômica relacionada à presença de lignotuber em eucalipto. O marcador ELig foi eficiente em identificar indivíduos de espécies de eucalipto sem lignotuber, podendo ser incorporado a programas de seleção assistida por marcadores moleculares. As espécies Eucalyptus grandis e E. urophylla apresentaram uma única cópia da sequência ELig em seus genomas. Essa sequência mostrou identidade a um contig de EST de eucalipto de 1918 nucleotídeos do banco de dados FORESTs-FAPESP, que apresenta o domínio de proteínas DnaJ, uma grande família de proteínas com membros relacionados à resposta da planta contra estresse abiótico, incluindo proteínas heat shock e chaperonas. A identidade do ELig ao contig restringe-se... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: CAGEN group in association with Suzano Pulp and Paper has developed projects to identify characteristics related to abiotic stress in Eucalyptus. Lignotuber presence is a resource which gives to these species higher levels of stress tolerance. An experiment was performed in 2006 which showed a correlation between increased stress levels and the increment of lignotuber formation, until 3:1 proportion, indicating the gene action with major effect on the lignotuber formation. Using BSA (Bulked Segregant Analyses) technique with RAPD markers (Random Amplified Polymorphic DNA) was detected a molecular marker that allowed the identification of individuals without lignotuber in Eucalyptus. This marker was converted into a SCAR (Sequenced Characterized Amplified Region) marker and was named Elig (Eucalyptus - Lignotuber). The purpose of this study is characterize this genomic region related to the lignotuber presence in Eucalyptus. The Elig marker was effective in identifying Eucalyptus without lignotuber, and it can be incorporated into marker-assisted selection programs. Eucalyptus grandis and E. urophylla presented a single copy sequence ELig in their genomes. This sequence showed identity with a eucalypt EST contig with1918 nucleotides on the FORESTs-FAPESP database, the contig displays the protein domain DnaJ, a large proteins family with members related to plant response against abiotic stress, this domain includes heat shock proteins and chaperones. The ELig identity with the contig was restricted in the 5 'ELig region, in which was not possible to identify the polymorphism in the primers pairing site, indicating that this polymorphism is found in the 3' ELig region sequence. Through the RACE 3' (Rapid Amplification of cDNA Ends)... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Identificação de raças de Bremia lactucae no Estado de São Paulo e desenvolvimento de linhagens de alface-crespa resistentes /

Souza, Jean de Oliveira. January 2009 (has links)
Orientador: Leila Trevizan Braz / Coorientador: Tagli Dalpian / Coorientador: Margarete Camargo / Banca: Arlete Marchi Tavares de Melo / Banca: Antonio Ismael Inácio Cardoso / Banca: Modesto Barreto / Banca: Érika Auxiliadora Giacheto Scaloppi / Resumo: Os objetivos do trabalho foram identificar raças de Bremia lactucae agente causal do míldio no período de 2006 a 2007, na região produtora de alface do Estado de São Paulo; obter linhagens de alface-crespa resistentes. Os experimentos de campo foram realizados no Setor de Olericultura e Plantas Aromático-Medicinais e no Laboratório de Melhoramento Genético de Hortaliças, do Departamento de Produção Vegetal da UNESP-FCAV, Câmpus de Jaboticabal-SP. Foram coletados 36 isolados de B. lactucae em regiões produtoras do Estado de São Paulo, que permitiram identificar três novos comportamentos do fungo, dando origem a três novas raças: SPBl:02 (63/31/19/00), SPBl:03 (63/63/19/00) e SPBl:04 (63/63/03/00). Os genes Dm-14, Dm- 17, Dm-18, Dm-36, Dm-37 e Dm-38 conferem resistência a essas novas raças identificadas. As linhagens JAB 4-2-4, JAB 4-13-7 e JAB 4-13-9 apresentaram os melhores resultados de padrão de plantas e com resistência a B. lactucae. Os genótipos 'Amanda', 'Solaris', 'Vanda', 'Vera', JAB 4-13-7 e 'Malice' apresentaram melhores desempenhos das características agronômicas no inverno. Para as condições de verão, JAB 4-13-7 e 'Solaris' apresentaram melhores desempenhos das características agronômicas. JAB 4-13-7 é o mais indicado para o cultivo de inverno pelo bom desempenho e resistência às raças de B. lactucae. 'Malice' apresentou o pior comportamento produtivo, apesar da resistência às quatro raças de B. lactucae avaliadas / Abstract: The aims of the study were to verify the emergence of races of B. lactucae casual agent of downy mildew in the period from 2006 to 2007 in lettuce-producing region in the State of São Paulo; to obtain lines lettuce with resistance to race SPBI:01; the performance of JAB 4-13-7 before the commercials cultivars as an option to allow for the cultivation of this genotype for both evaluation periods, in the conditions of Jaboticabal and check the resistance of lettuce genotypes to four races of Bremia lactucae. The field experiments were accomplished at the Section of Vegetables Crops and Aromatic-Medicinal Plants and in the Laboratory of Vegetable Breeding of the Department of Vegetable Production from the São Paulo State University at Jaboticabal (UNESP). The monitoring of B. lactucae allowed to identify three new behaviors of the fungus, resulting in three new races SPBI:02 (63/31/19/00), SPBI:03 (63/63/19/00) SPBI:04 (63/63/03/00). The genes Dm-14, Dm-17, Dm-18, Dm-36, Dm-37 and Dm-38, confer resistance to these new identified races. The lines JAB 4-2-4, JAB 4-13-7 and JAB 4-13-9 achieved the best results of standart plants with resistance to B. lactucae. The genotypes 'Amanda', 'Solaris', 'Vanda', 'Vera', JAB 4-13-7 and 'Malice' showed the best performances of agronomic traits in winter. For summer conditions, JAB 4-13-7 and 'Solaris' presented better performances of agronomic traits. The JAB 4-13-7 is the most suitable for the winter cultivation by good performance and resistance for the races of B. lactucae. 'Malice' had the worst productive performance, despite the resistance to the four races of B. lactucae evaluated / Doutor
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Estudo genético de critérios de seleção ligados à eficiência reprodutiva e ao crescimento de machos e fêmeas da raça Canchim /

Pereira, Viviane Martha de Castro. January 2003 (has links)
Orientador: Maurício Mello de Alencar / Banca: Alexander George Razook / Banca: Pedro Franklin Barbosa / Resumo: Estimaram-se, pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivadas, parâmetros genéticos dos pesos ao nascimento (PN), à desmama (P240), ao ano (P365) e ao sobreano (P550), dos ganhos em peso do nascimento à desmama (GND) e do nascimento ao sobreano (GN18), do número de dias para ganhar 175 kg do nascimento à desmama (D175) e 450 kg do nascimento ao abate (D450) de machos e fêmeas, do perímetro escrotal (PE12) de machos aos 12 meses de idade e da idade (IPP) e peso (PPP) ao primeiro parto e peso adulto (PAD) de fêmeas, em um rebanho Canchim. As herdabilidades foram: 0,41 (PN e PE12); 0,28 (P240 e P550); 0,38 (P365); 0,26 (GND); 0,30 (GN18); 0,23 (D175 e D450); 0,09 (IPP); 0,42 (PPP) e 0,48 (PAD). As correlações genéticas entre as características de crescimento (-0,98 a 0,97) e das características de crescimento com PE12 (-0,39 a 0,46) e com IPP (-0,38 a 0,44) foram favoráveis, com exceção de PN com IPP (0,49). Com PPP (-0,47 a 0,88) e PAD (-0,42 a 0,78), as correlações genéticas das características de crescimento foram desfavoráveis e as de PE12 com IPP, PPP e PAD foram -0,37; 0,04 e -0,09, respectivamente. Os resultados sugerem que a seleção para melhorar as características de crescimento após o nascimento deve reduzir IPP, mas resultar em fêmeas com maior PAD, enquanto que a seleção para maior PE12 deve reduzir IPP sem modificar PAD. / Abstract: Genetic parameters for body weights at birth (PN), weaning (P240), twelve (P365) and eighteen (P550) months of age, body weight gains from birth to weaning (GND) and from birth to eighteen (GN18) months of age, and days to gain 175 kg from birth to weaning (D175 = 175/GND) and 450 kg (D450 = 450/GN18) from birth to slaughter of males and females, male scrotal circumference at 12 months of age (PE12), and female age (IPP) and weight (PPP) at first calving, and adult body weight (PAD), were obtained by the derivative free restricted maximum likelihood method, in a Canchim (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) beef cattle herd. The heritabilities were: 0.41 (PN and PE12), 0.28 (P240 and P550), 0.38 (P365), 0.26 (GND), 0.30 (GN18), 0.23 (D175 and D450), 0.09 (IPP), 0.42 (PPP) and 0.48 (PAD). The genetic correlations among the growth traits (-0.98 to 0.97), and between the growth traits and PE12 (-0.39 to 0.46) and IPP (-0.38 to 0.44) were favorable, with the exception of that for PN and IPP (0.49). For PPP (-0.47 to 0.88) and PAD (-0.42 to 0.78) with the growth traits, the correlations were unfavorable, while for PE12 with IPP, PPP and PAD they were -0.37, 0.04 and -0.09, respectively. The results suggest that selection to enhance growth traits after birth should reduce IPP, but increase PAD, while selection to increase PE12 should reduce IPP without changes in PAD. / Mestre
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Variabilidade genética em progênies de polinização aberta de Eucalyptus urophylla /

Moraes, Cristiano Bueno de, 1973. January 2013 (has links)
Orientador: Edson Seizo Mori / Coorientador: Rinaldo César de Paula / Banca: Léo Zimback / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Banca: Edwing Camacho Palomino / Banca: Mauricio Dutra Zanotto / Resumo: Os danos provocados pelas geadas severas em plantios de reflorestamentos de eucaliptos trazem prejuízos consideráveis para o setor florestal e agronegócio brasileiro. Essas perdas podem variar dependendo da intensidade da geada e da tolerância da espécie ao fenômeno. Na região sul do Brasil, à ocorrência de geadas é o principal fator que limita a produção de madeira do gênero eucaliptos, devido à inibição ou alterações de vários processos importantes no crescimento e desenvolvimento das plantas no período de inverno. Desta maneira, o objetivo da pesquisa foi estudar a variabilidade genética em progênies de polinização aberta de Eucalyptus urophylla para tolerância à geada em diferentes ambientes. Foram instalados três testes de progênies com material genético de Eucalyptus urophylla, todos em delineamento em blocos casualizados. Os testes foram implantados em áreas com histórico de observação de ocorrência de geada pertencentes às empresas Eucatex no município de Itatinga/SP e na Palmasola no município de Palma Sola/SC. O teste testemunha foi instalado na Estação Experimental de Anhembi/SP onde as geadas são raras. Os testes de progênies foram avaliados com: 150 progênies, quatro repetições, seis plantas por parcela, totalizando 3.600 plantas para cada um dos três experimentos. Foram realizadas as seguintes avaliações: a) medições de altura de plantas; b) diâmetro à altura do peito das plantas; c) volume de madeira; d) percentagem de bifurcação; e) sobrevivência de plantas e f) danos por geada. Os parâmetros genéticos foram estimados com base no procedimento REML/BLUP. Os resultados apontaram que à ocorrência de geada na região de Palma Sola/SC promoveram 36% de plantas bifurcadas e 22% de mortalidade, diferentemente das regiões de Itatinga/SP e Anhembi/SP. Foi verificada interação genótipos x ambientes para as progênies nas três regiões ... / Abstract: The damages caused by severe frosts on eucalypt plantings bring outstanding losses for Brazilian forest sector and agribusiness. Such losses may vary according to the frost intensity and the species tolerance. In the Southern Brazil, the occurrence of frosts is one of the main factor limiting the eucalypts wood production, due to inhibition or changes in several important processes to the plants growth and its development during the winter. Therefore, the objective of this research was to study the genetic variability of open-pollinated progenies of Eucalyptus urophylla for frost tolerance in different environments. We set up three progenies trials of Eucalyptus urophylla using the statistical design of randomized blocks. The trials were set up on areas with historic of frost occurrence belonging to Eucatex company in Itatinga municipality/SP and in Palmasola company in Palma Sola municipality/SC, both in Brazil. The control trial was set up in Anhembi Experimental Station in Anhembi/SP-Brazil with rare occurrence of frosts. The progenies trials were with 150 progenies, four replications, six plants per plot, totalizing 3.600 plants per trial. The following evaluations were performed with measurements of: a) plants height; b) diameter of breast height; c) wood volume; d) percentage of bifurcation, e) plants survival, and f) frost damage. The quantitative genetic parameters were estimated by REML/BLUP. The results showed that the occurrence of frosts in Palma Sola/SC promoted 36% of forked plants and 22% of mortality, different from Itatinga/SP and Anhembi/SP. There were genotype x environment interactions for progenies in those three climate regions. The methodology of MHVG (stability), PRVG (adaptability), and MHPRVG (productivity, stability and adaptability) was efficient for selection of productivity and frost-tolerant genotypes for Itatinga/SP and Palma Sola/SC regions, Brazil ... / Doutor

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