This study examines prevalence of antibiotic resistant bacteria in Amazon parrots in three different groups, one wild and two captive. Commensal bacteria were isolated from 24 parrots and screened for antibiotic resistance. Culture-based and molecular methods were used and a total of 546 isolates from the genus Staphylococcus and Rothia were obtained. Antibiotic resistance was found in all parrot groups in 161 isolates with 48 having multi-drug resistance. The highest frequency of resistance was found to Enrofloxacin and Amoxicillin/Clavulnate though all antibiotics tested were resisted by some bacterial isolates. Both captive groups exhibited more resistant individuals than the wild. This study concluded that antibiotic resistant commensal bacteria in Amazons are common; however, patterns found cannot be explained by antibiotic use. A high rate of multi-drug resistance was detected in more common mannitol non-fermenting Staphylococcus spp., and drug resistant detected in Rothia spp. may indicate a future role in disease. / by Caroline Ann Efstathion. / Thesis (M.S.)--Florida Atlantic University, 2011. / Includes bibliography. / Electronic reproduction. Boca Raton, Fla., 2011. Mode of access: World Wide Web.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-11-11Bitstream added on 2014-06-13T19:55:56Z : No. of bitstreams: 1 pupin_b_me_jabo.pdf: 580848 bytes, checksum: d8086b4efc4bd654f31341b062e4af6c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A cultura da cana-de-açúcar tem sido conduzida por cortes sucessivos e para isso é intensamente adubada e mecanizada. A influência sobre as bactérias totais, nitrificantes e desnitrificantes, os fungos, a biomassa microbiana-C, as atividades, respiratória, amonificante, nitrificante e solubilizadora e das enzimas desidrogenase, urease e fosfatase foram estudada em um solo após seis cortes da cultura de cana-de-açúcar. As amostras de solo foram coletadas na linha e entrelinha na profundidade do solo de 0-20 cm. Para a colheita, a palha da cana do 2º e 3º cortes foi queimada. As demais não foram queimadas. Reduções sucessivas foram encontradas nas contagens e atividades microbianas do solo após os sucessivos cortes. A não queima da palha no 4º corte acarretou aumento nas contagens dos fungos e das atividades amonificante, nitrificante, solubilizadora e das enzimas urease e fosfatase, que em seguida diminuíram. As contagens das bactérias totais, nitrificantes e desnitrificantes e dos fungos diminuíram de 55%, 22%, 17% e 77%, respectivamente, do primeiro corte ao sexto corte. Foram também observadas as seguintes reduções: biomassa microbiana-C 43%, atividades respiratória 39%, amonificante 35%, nitrificante 40% e solubilizadora 35%. A atividade das enzimas desidrogenase (58%) e urease (36%), mas não a da fosfatase. Redução significativa foi observada no conteúdo de umidade do solo (33%). Cortes sucessivos da cana-de-açúcar têm importante impacto nas populações e atividades microbianas, acarretando conseqüências negativas nos ciclos do C, N e P e diminuição da produtividade da cultura. Tendo em vista que a compactação é um dos fatores mais agravantes para a qualidade do solo, objetivou-se avaliar o efeito da compactação a comunidade e atividade enzimática microbiana de um solo sob cultura de milho. Seis níveis de compactação foram obtidos pela passagem... / Sugarcane culture has been cultivated by successive cuts and for that it is fertilized intensely and mechanized. The influence on the total bacteria, nitrifying and denitrifying, the fungi, the C of the biomass microbial, the activities, respiratory, amonifying, nitrifying and phosphates solubilizers and of enzymes dehydrogenase, urease and phosphatase it was studied in a soil after six cuts of the sugarcane culture. The soil samples were collected in the line and space between lines in the depth of the soil of 0-20 cm. For de harvest, the straw of the sugarcane of the 2º and 3º cuts it was burned. The others were not burned. Successive reductions were found in the counts and microbial activities of the soil after the successive cuts. It doesn't burn of the straw in the 4º cut caused increase in the counting of fungi and of the activities amonifying, nitrifying, solubilizers and of the enzymes urease and phosphatase that soon after decreased. The counting of the total bacteria, nitrifying and denitrifying and of the fungi they decreased of (55%), (22%), (17%) and (77%), respectively, of the first cut to the sixth cut. They were also observed the following reductions: C of the biomass microbial (43%), activities respiratory (39%), amonifying (35%), nitrifying (40%) and solubilizers (35%). The activity of enzymes dehydrogenase (58%) and urease (36%), but not it of phosphatase. Significant reduction was presented in the content of humidity of the soil (33%). Successive cuts of the sugarcane have important impact in the populations and microbial activities, causing negative consequences in the cycles of C, N and P and decrease of the productivity of the culture. Tends in view that the compaction is one of the most agravating factors for the soil quality, however the effect in the community and microbial enzymatic activity has not been studied sufficiently. Six compaction levels were... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Brenda Paula Figueiredo de Almeida Gomes / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-12T19:24:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sena_NeyllaTeixeira_D.pdf: 3038730 bytes, checksum: 1cacde1c32eceda5813f7908699bd2f9 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Este estudo investigou: a) a atividade antimicrobiana de cimentos endodônticos (AH Plus e Epiphany) frente a microrganismos encontrados na microbiota intracanal (Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus, Actinomyces naeslundii e Candida albicans); b) a microinfiltração coronária de dentes obturados com AH Plus/ guta-percha e Epiphany/ Resilon; c) os possíveis efeitos antimicrobianos residuais destas substâncias nos cones quando em contato com E. faecalis e Porphyromonas gingivalis, d) as alterações na superfície dos cones de guta-percha e Resilon expostos à desinfecção com clorexidina gel 2% e hipoclorito de sódio 5,25%. A ação antimicrobiana dos cimentos foi testada através de dois métodos: o de contato direto nos tempos: imediato, 24 h, 48 h, 7 e 14 dias após a espatulação, e através do teste de difusão em Agar. A avaliação da microinfiltração coronária de dentes obturados endodonticamente foi acompanhada diariamente por 90 dias após a contaminação. A ação residual dos agentes desinfetantes sobre a superfície dos cones foi observada através do método de difusão em Agar (nos períodos de 1, 5, 10, 20 e 30 min), e as alterações estruturais na superfície dos cones foram testadas através de análise em Microscópio Eletrônico de Varredura (MEV). Quanto ao método de contato direto os resultados foram: O cimento AH Plus teve maior atividade antimicrobiana que o Epiphany, o Epiphany apresentou grande dissolução em todos os tempos testados (p<0.05), A. naeslundii foi o microrganismo mais suscetível e E. faecalis o mais resistente a todos os cimentos testados. Quanto ao método de difusão em Agar a maior atividade antimicrobiana foi a do Primer, seguida do AH Plus e do Epiphany. C. albicans foi o microrganismo mais suscetível e o S. aureus o mais resistente. Quanto à prevenção da microinfiltração coronária, AH Plus/guta-percha foi superior ao sistema Epiphany (p<0.05). Os dentes obturados com o sistema Epiphany apresentaram clinicamente alterações de cor em suas raízes. Quanto à atividade antimicrobiana das substâncias químicas auxiliares sobre os cones, estas foram incapazes de se unirem aos componentes dos cones de guta-percha e de apresentarem efeito residual. Entretanto o cone de Resilon apresentou ação antibacteriana residual quando exposto a clorexidina gel. Quanto às alterações estruturais dos cones em MEV, não foi encontrada modificação nas características superficiais dos cones e nem presença de cristais de cloreto. Em conclusão, os resultados sugerem que o sistema Epiphany não demonstrou ser superior ao AH Plus quanto à ação antimicrobiana e à prevenção da microinfiltração coronária, e que as substâncias químicas auxiliares usadas na desinfecção dos cones de guta-percha e de Resilon não apresentaram ação residual nos cones de guta-percha e nem alteraram a superfície dos dois tipos de cones testados. Entretanto o cone de Resilon apresentou ação antibacteriana residual quando exposto à clorexidina gel. / Abstract: The aims of the present study were to investigate: a) the antimicrobial property of endodontic sealers (AH Plus and Epiphany) against the following microorganisms: Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus, Actinomyces naeslundii and Candida albicans; b) the coronal microleakage of teeth obturated with AH Plus/ gutta-percha and Epiphany/ Resilon; c) to evaluate the alterations on the surface of the gutta-percha and Resilon cones disinfected with 2% CHX-gel and 5.25% NaOCl; d) the possible residual antimicrobial properties of these substances on the cones when in contact with E. faecalis and Porphyromonas gingivalis. The antimicrobial properties of endodontic sealers were tested by two methods: the direct contact at different times (immediately, 24/ 48 hours and after 7/14 days) and the Agar diffusion method. The coronal microleakage was followed daily during 90 days after contamination. The residual property of the disinfectant agents on the cones was tested by the Agar diffusion method (at 1, 5, 10, 20 and 30 min) and the alterations on the surface structure of the cones were observed by the Scanning Electron Microscopy (SEM) analysis. Regarding the direct contact method, the results are: the AH Plus sealer showed greater antimicrobial than the Epiphany; Epiphany presented greater dissolution during all tested times (p< 0.05). A. naeslundii was the most susceptible microorganism and S. aureus the most resistant against all tested sealers. Regarding the Agar diffusion method, the greatest antimicrobial activity was achieved by the primer, followed by AH Plus and Epiphany. C. albicans was the most susceptible microorganism, while S. aureus was the most resistant. Regarding the prevention of the coronal microleakage, AH Plus/ gutta-percha presented better results than the Epiphany system (p<0.05). All teeth filled with Epiphany system presented color alteration on the root surface. Regarding the antimicrobial property of the auxiliary chemical substances on the cones, both chemical agents were unable to bind to the gutta-percha cone components and to release themselves into the Agar medium during all the periods of time tested. Nevertheless, when disinfected with 2% CHX gel, the Resilon cone demonstrated a residual action. Regarding the residual property of the disinfectants on the surface of the cones, SEM analysis showed no alteration on their superficial features. In conclusion, the results suggest that the Epiphany system was not superior to the AH Plus regarding the antimicrobial action and the prevention of the coronal microleakage, and the auxiliary chemical substances used in the disinfection of gutta-percha and Resilon cones did not show any residual action on the gutta-percha cones and did not cause any damage on the surface of both types of cones. However, the Resilon cones showed a residual antibacterial action when exposed to the chlorhexidine gel. / Doutorado / Endodontia / Doutor em Clínica Odontológica

Turnera subulata L. is a plant belonging to the Turneraceae family and is popularly known in Brazil as chanana. The genus Turnera has about 120 species distributed in the Americas and Africa, being the most representative of the family Turneraceae. Some species of Turnera are highly used in popular medicine for different types of inflammatory diseases. The association between living beings is a vital condition for species unable to achieve alone, as a means of survival for obtaining nutrients and defenses against predatory species. Among the microorganisms, the fungi are those who are most often associated with plants. Endophytic are microorganisms that inhabit the bodies of plants that, at some period of their life cycle, colonize internal tissues of the plant, without causing any apparent damage to its host. From the fragments of leaves from Turnera subulata L. could be isolated a filamentous fungus that was identified as the fungus Phomopsis sp. through traditional microscopy and molecular techniques. In a statistical evaluation it was noted that the endophytic Phomopsis sp. presents a higher growth in BDA and BSA media, as well as in the presence of light. The steroid ergosterol could be isolated from the hexane extract of this fungus and identified by the NMR techniques. In tests of antagonism of the endophytic Phomopsis sp. against phytopathogens, it was observed halum of inhibition against Rhizoctonia sp., Colletotrichum sp. and Pestalotiopsis sp. Concerning the antioxidant activity it was observed that the chloroform extract was more effective than the hexane one. On the other hand all the extracts from the mycelium of Phomopsis sp. and its ethylacetate extract from the cultured filtrate showed no antimicrobial activity against strains of Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Candida albicans, Candida tropicalis and Candida glabrata. Therefore it was concluded that Phomopsis sp. may act as endophytic of T. subulata. it has shown to grow best in BDA and BSA medium, as well as under continuous lightining. It produces and accumulates ergosterol in his micelium. It promotes inhibition zone of growth when tested against phytopathogens. His hexanic and chloroform extrat has shown very litte antioxidant activity / Turnera subulata L. é uma planta pertencente à família Turneraceae e popularmente conhecida no Brasil como chanana. O gênero Turnera apresenta cerca de 120 espécies espalhadas nas Américas e África, sendo o mais representativo da família Turneraceae. Algumas espécies de Turnera são altamente utilizadas na medicina popular para diferentes tipos de doenças inflamatórias. A associação entre os seres vivos é uma condição vital para espécies incapazes de conseguirem, sozinhas, meios de sobrevivência como obtenção de nutrientes e defesas contra espécies predadoras. Entre os microrganismos, os fungos são os que se encontram mais frequentemente associados às plantas. Microrganismos endofíticos são os organismos que habitam órgãos de plantas sem causar dano aparente a seu hospedeiro. A partir dos fragmentos de folhas de Turnera subulata L. isolou-se um fungo filamentoso que foi identificado através de características morfológicas (morfoculturais) e moleculares como sendo Phomopsis sp. O isolado obtido apresentou um crescimento superior nos meios BDA (Batata-Dextrose-Ágar) e BSA (Batata-Sacarose-Ágar), com relações à cinco meios testados, sendo a presença de luz constante um fator de estímulo. Foi identificada por RMN a presença de ergosterol no extrato hexânico das céluas do Phomopsis sp. cultivado em meio líquido BD (Batata-dextrose). Em testes de antagonismo do endofítico Phomopsis sp. contra patógenos de plantas, observou-se halo de inibição deste frente a Rhizoctonia sp., Colletotrichum sp. e Pestalotiopsis sp. Nos resultados da avaliação do percentual de atividade antioxidante dos extratos do micélio em hexano e clorofórmio pôde-se observar que extrato em hexano teve menor atividade que o extrato em clorofórmio. Os extratos hexânico, clorofórmico, acetato etílico e metanólico do micélio de Phomopsis sp. e o extrato acetato etílico do filtrado de cultura desse fungo isento de células não apresentaram atividade antimicrobiana contra as cepas de Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Candida albicans, Candida tropicalis e Candida glabrata. Com este trabalho, portanto, podemos concluir que o Phomopsis sp. pode atuar como endófito de T. subulata, apresenta um melhor crescimento em meios BDA e BSA, bem como em presença de iluminação contínua, apresenta ergosterol em sua composição, é capaz de promover halo de inibição frente à alguns patógenos de plantas e que seus extratos celulares hexânico e clorofórmico apresentam uma pequena atividade antioxidante

Orientador: Ely Nahas / Banca: José Frederico Centurion / Banca: Marisa de Cássia Piccolo / Resumo: A cultura da cana-de-açúcar tem sido conduzida por cortes sucessivos e para isso é intensamente adubada e mecanizada. A influência sobre as bactérias totais, nitrificantes e desnitrificantes, os fungos, a biomassa microbiana-C, as atividades, respiratória, amonificante, nitrificante e solubilizadora e das enzimas desidrogenase, urease e fosfatase foram estudada em um solo após seis cortes da cultura de cana-de-açúcar. As amostras de solo foram coletadas na linha e entrelinha na profundidade do solo de 0-20 cm. Para a colheita, a palha da cana do 2º e 3º cortes foi queimada. As demais não foram queimadas. Reduções sucessivas foram encontradas nas contagens e atividades microbianas do solo após os sucessivos cortes. A não queima da palha no 4º corte acarretou aumento nas contagens dos fungos e das atividades amonificante, nitrificante, solubilizadora e das enzimas urease e fosfatase, que em seguida diminuíram. As contagens das bactérias totais, nitrificantes e desnitrificantes e dos fungos diminuíram de 55%, 22%, 17% e 77%, respectivamente, do primeiro corte ao sexto corte. Foram também observadas as seguintes reduções: biomassa microbiana-C 43%, atividades respiratória 39%, amonificante 35%, nitrificante 40% e solubilizadora 35%. A atividade das enzimas desidrogenase (58%) e urease (36%), mas não a da fosfatase. Redução significativa foi observada no conteúdo de umidade do solo (33%). Cortes sucessivos da cana-de-açúcar têm importante impacto nas populações e atividades microbianas, acarretando conseqüências negativas nos ciclos do C, N e P e diminuição da produtividade da cultura. Tendo em vista que a compactação é um dos fatores mais agravantes para a qualidade do solo, objetivou-se avaliar o efeito da compactação a comunidade e atividade enzimática microbiana de um solo sob cultura de milho. Seis níveis de compactação foram obtidos pela passagem... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sugarcane culture has been cultivated by successive cuts and for that it is fertilized intensely and mechanized. The influence on the total bacteria, nitrifying and denitrifying, the fungi, the C of the biomass microbial, the activities, respiratory, amonifying, nitrifying and phosphates solubilizers and of enzymes dehydrogenase, urease and phosphatase it was studied in a soil after six cuts of the sugarcane culture. The soil samples were collected in the line and space between lines in the depth of the soil of 0-20 cm. For de harvest, the straw of the sugarcane of the 2º and 3º cuts it was burned. The others were not burned. Successive reductions were found in the counts and microbial activities of the soil after the successive cuts. It doesn't burn of the straw in the 4º cut caused increase in the counting of fungi and of the activities amonifying, nitrifying, solubilizers and of the enzymes urease and phosphatase that soon after decreased. The counting of the total bacteria, nitrifying and denitrifying and of the fungi they decreased of (55%), (22%), (17%) and (77%), respectively, of the first cut to the sixth cut. They were also observed the following reductions: C of the biomass microbial (43%), activities respiratory (39%), amonifying (35%), nitrifying (40%) and solubilizers (35%). The activity of enzymes dehydrogenase (58%) and urease (36%), but not it of phosphatase. Significant reduction was presented in the content of humidity of the soil (33%). Successive cuts of the sugarcane have important impact in the populations and microbial activities, causing negative consequences in the cycles of C, N and P and decrease of the productivity of the culture. Tends in view that the compaction is one of the most agravating factors for the soil quality, however the effect in the community and microbial enzymatic activity has not been studied sufficiently. Six compaction levels were... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientadores: Bruno Coraucci Filho, Roberto Feijo de Figueiredo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Civil, Arquitetura e Urbanismo / Made available in DSpace on 2018-08-11T17:07:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 SousaJunior_OderLuizde_M.pdf: 3018467 bytes, checksum: f62050928dc0c085881f96c0708b1328 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: O objetivo deste projeto foi estudar as valas de filtração como um método de baixo custo aplicável a residências isoladas e pequenas ou médias comunidades brasileira, analisar as valas de filtração como unidades de pós-tratamento de efluente anaeróbio de um sistema fossa filtro, na remoção natural de nutrientes e microrganismos patogênicos. No presente estudo foram estudadas três valas de filtração em escala piloto com 1 m de comprimento e 0,50 m de largura, com altura da camada de areia igual a 0,25, 0,50, e 0,75 m, foi utilizado tubo de drenagem em PEAD - polietileno de alta densidade ¿ com 0,10 m de diâmetro, as valas de filtração foram alimentadas por efluente de um sistema fossa filtro, foram empregadas 4 taxas hidráulicas (40, 60, 80, e 100 L/m2.dia) cada taxa foi aplicada na freqüência de 6, 12, 18, e 24 hora/dia. O esgoto bruto, afluente, e efluente das valas de filtração, foram analisados semanalmente permitindo constatar que os resultados obtidos no estudo das valas de filtração no emprego de altas taxas hidráulicas proporcionavam uma remoção superior a 82,5% DBO e adequação de coliformes e a ausência de microrganismo patogênico. Quanto aos compostos nitrogenados, ocorreu uma grande nitrificação. A concentração de fósforo também foi muito reduzida, adequando o efluente das valas de filtração a legislação brasileira, em todas as taxas empregadas / Abstract: The aim of this work was to study filtration ditches as a method of low cost applicable the isolated homes and the small Brazilian municipalities for the posttreatment of anaerobic effluent from a system septic tank with anaerobic unit in the removal of natural nutrients and pathogenic microorganisms. For the research were analyzed three filtration ditches on pilot-scale with 1 m length and 0,5 m width, with height of the layer of sand equal 0,25, 0,50, and 0,75 m was used a drainage pipe in HDPE - High Density Polyethylene - with 0,10 m in diameter. The of filtration ditches were fed by effluent from a system septic tank with anaerobic unit were used four high hydraulic rates (40, 60, 80, and 100 L/m2.day) each rate was applied in the frequency of 6, 12, 18, and 24 hours/day. The municipal wastewater, affluent and the effluent of the filtration ditches were weekly analyzed allowing that the results obtained in the study removal of organic matter exceeded 82,5% BOD and adequacy of coliform, absence of pathogenic microorganisms. In terms of nitrogen compounds, a high nitrification occurred. The phosphorus concentration also was very reduced, the effluent of the three filtration ditches being in compliance with Brazilian laws at all the rates used. / Mestrado / Saneamento e Ambiente / Mestre em Engenharia Civil