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Ferramentas de seleção para uniformidade de produção em bovinos da raça Nelore / Selection tools for uniformity of production in Nellore cattleIung, Laiza Helena de Souza 20 July 2018 (has links)
Submitted by Laiza Helena de Souza Iung (laizinha21@hotmail.com) on 2018-08-07T12:43:48Z
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Agradecemos a compreensão. on 2018-08-07T12:58:57Z (GMT) / Submitted by Laiza Helena de Souza Iung (laizinha21@hotmail.com) on 2018-08-07T16:56:16Z
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Previous issue date: 2018-07-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A existência de um controle genético sobre a variância residual torna possível a seleção para uniformidade de produção. Desta forma, os objetivos do presente estudo foram: i) investigar a presença deste componente genético na variância residual do peso ao sobreano (PS) em bovinos da raça Nelore (N = 194.628, touros = 625), usando duas abordagens: dois passos (two-step) e modelo linear generalizado hierárquico duplo (double hierarchical generalized linear model, DHGLM); e ii) identificar, através de estudo de associação genômica ampla (genome-wide association study, GWAS), regiões genômicas associadas com uniformidade do PS usando differentes variáveis respostas: EBV desregredido (dEBVv) obtido a partir de soluções de um DHGLM assumindo correlação genética não-nula entre média e variância residual (rmv ≠ 0); e dEBVv_r0 e variância dos resíduos log-transformada (ln_σ2ê) obtidos a partir de soluções de um DHGLM assumindo rmv = 0. Os resultados confirmam a presença de heterogeneidade genética de variância residual bem como oportunidade de seleção (coeficiente de variação genética da variância residual (GCVE) variando de 0,10 a 0,17). Porém, a seleção pode ser limitada devido à magnitude da variância genética da variância residual e à forte e positiva correlação genética entre a média e a variância (0,20 e 0,76 para a abordagem em dois passos e DHGLM, respectivamente). Além disso, foi possível observar que um grande número de progênies por touro é necessário para obter EBV com maiores acurácias (herdabilidade da variância residual, h2v < 0,007). A relação média-variância foi reduzida com a utilização da transformação Box-Cox, o que provocou uma redução nas estimativas dos parâmetros genéticos (h2v, GCVE) e mudou o sinal e a magnitude das correlações genéticas entre média e variância residual. DHGLM foi superior à abordagem em dois passos de acordo com as comparações realizadas, incluindo um delineamento de validação-cruzada. Em relação aos resultados do GWAS, dEBV da média (dEBVm) foi altamente correlacionado com dEBVv (0,90), resultando em regiões associadas simultaneamente com a média e variância residual do PS, no qual demonstraram estar além dos efeitos de escala. Resultados mais independentes entre média e variância residual foram obtidos quando rmv = 0 foi assumida. No total, 13 e 4 polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) mostraram uma forte associação (Bayes Factor > 20) com dEBVv e ln_σ2ê , respectivamente, apenas sugestivos sinais (Bayes Factor > 3) foram encontrados para dEBVv_r0. Todas as janelas de 1-Mb compartilhadas entre as top 20 entre dEBVm e dEBVv foram previamente associadas com características de crescimento. Potenciais genes candidatos do ponto de vista biológico para uniformidade estão envolvidos em metabolismo (principalmente energético e lipídico), resposta ao estresse, resposta inflamatória e imune, mineralização, atividade neuronal e formação óssea. É necessário usar uma estratégia como assumir rmv = 0 a fim de obter resultados relacionados à uniformidade e não a média. Nenhuma evidência clara em favor da utilização de uma variável resposta específica foi observada, por isso recomenda-se a utilização de diferentes variáveis para estudar uniformidade a fim de aumentar as evidências sobre regiões candidatas e os mecanismos biológicos que influenciam este tipo de resposta. / The existence of genetic control on residual variance makes possible the selection for uniformity. Thus, the objectives of the present study were: i) to investigate the presence of this genetic component on the residual variance of yearling weight (YW) in Nellore cattle (N = 194,628, sires = 625) using two approaches: two step approach and double hierarchical generalized linear model (DHGLM); and ii) to identify, through a genome-wide association study (GWAS), genomic regions associated with uniformity of YW using different response variables: deregressed EBV (dEBVv) obtained from solutions of a DHGLM assuming non-null genetic correlation between mean and residual variance (rmv ≠ 0); and dEBVv_r0 and log-transformed variance of estimated residuals (ln_σê 2) obtained from solutions of a DHGLM assuming rmv = 0. The results confirm the presence of genetic heterogeneity of residual variance as well as opportunity of selection (coefficient of genetic variance of residual variance (GCVE) ranging from 0.10 to 0.17). However, selection may be limited by the magnitude of the genetic variance of the residual variance and the strong and positive genetic correlation between mean and variance (0.20 and 0.76 for two-step approach and DHGLM, respectively). In addition, it was observed that large sire families are required to obtain higher EBVv accuracies (heritability of residual variance, hv 2 < 0.007). The mean-variance relationship was reduced by using Box-Cox transformation, which reduced the genetic parameter estimates (hv 2 , GCVE) and changed the signal and magnitude of the genetic correlation between mean and residual variance. The DHGLM was superior to the two-step approach according to the comparisons, including a cross-validation design. Regarding the GWAS results, dEBV of the mean (dEBVm) were highly correlated with dEBVv (0.90), resulting in regions associated simultaneously with mean and residual variance of YW, in which they proved to be beyond scale effects. More independent results between mean and residual variance were obtained when rmv = 0 was assumed. In total, 13 and 4 single nucleotide polymorphisms (SNPs) showed a strong association (Bayes Factor > 20) with dEBVv and ln_σê 2, respectively, only suggestive signals (Bayes Factor > 3) were found for dEBVv_r0. All 1-Mb windows shared among top 20 between dEBVm and dEBVv were previously associated with growth traits. Potential candidate genes from the biological point of view for uniformity are involved in metabolism (mainly energetic and lipid), stress, inflammatory and immune responses, mineralization, neuronal activity, and bone formation. It is necessary to use a strategy like assuming rmv = 0 in order to obtain results related only with uniformity. No clear evidence in favor of using a specific response variable was observed, we recommend using different variables to study uniformity to increase evidence on candidate regions and biological mechanisms behind it. / CAPES: 88881.131673/2016-01
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Análise de sobrevivência: uma visão de risco comportamental na utilização de cartão de créditoFERREIRA, Joanne Medeiros 30 March 2007 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-06T18:43:41Z
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Previous issue date: 2007-03-30 / Through the use of statistical techniques, this paper aims to present the behavior of credit card consumers, as well as to add value to the process of strategical marketing in a financial institution. For doing so, we present methodologies based on the techniques of logistical regression and survival analysis. Such tools are capable of foreseeing the behavior of customers, and thus focus on certain strategies in order to place resources that may hinder their migration to other financial institutions. The use of survival analysis methods makes it possible to analyze which variant presents evidence of customer migration; the logistical regression technique will be used in order to compare and validate the models hereby proposed, besides showing whether there are other variants that also demonstrate the closing of credit card accounts by the customers. / Este trabalho visa, através de técnicas estatísticas, apresentar metodologicamente o comportamento dos consumidores do produto cartão de crédito e agregar valor ao processo de marketing estratégico de uma instituição financeira. Apresentam-se metodologias, baseadas em técnicas como analise de sobrevivência e regressão logísticas. Estas ferramentas são capazes de prever o comportamento de clientes e assim focar estratégias de modo a alocar recursos para impedir a migração dos mesmos para instituições concorrentes. Com a técnica de Analise de Sobrevivência clássica será possível analisar o tempo de vida da conta cartão e as variáveis que apresentam indícios de migração para concorrência e com a técnica de regressão logística será feita uma comparação afim de validação do modelo, além de mostrar se existem outras variáveis que também demonstram o encerramento do produto cartão por parte do cliente.
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Flexible models for hierarchical and overdispersed data in agriculture / Modelos flexíveis para dados hierárquicos e superdispersos na agriculturaSercundes, Ricardo Klein 29 March 2018 (has links)
In this work we explored and proposed flexible models to analyze hierarchical and overdispersed data in agriculture. A semi-parametric generalized linear mixed model was applied and compared with the main standard models to assess count data and, a combined model that take into account overdispersion and clustering through two separate sets of random effects was proposed to model nominal outcomes. For all models, the computational codes were implemented using the SAS software and are available in the appendix. / Nesse trabalho, exploramos e propusemos modelos flexíveis para a análise de dados hierárquicos e superdispersos na agricultura. Um modelo linear generalizado semi- paramétrico misto foi aplicado e comparado com os principais modelos para a análise de dados de contagem e, um modelo combinado que leva em consideração a superdispersão e a hierarquia dos dados por meio de dois efeitos aleatórios distintos foi proposto para a análise de dados nominais. Todos os códigos computacionais foram implementados no software SAS sendo disponibilizados no apêndice.
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Análise da incidência dos linfomas no município de São Paulo, 1997 a 2012 / Analysis of the incidence of lymphomas in the city of São PauloIshibashi, Raphael Akira Siqueira 25 October 2018 (has links)
Introdução: Os linfomas abrangem um grupo heterogêneo de neoplasias originadas no sistema linfático, diferentes quanto à sua histologia, prognóstico e epidemiologia, embora possa haver grande número de aspectos clínicos comuns. De acordo com sua morfologia, dividem-se dois grupos: os linfomas Hodgkin (LH) e os linfomas não-Hodgkin (LNH). Objetivo: Avaliar a tendência temporal da incidência de linfomas no período de 1997 a 2012, identificando a influência de fatores como o sexo, a idade, o período e a coorte e nascimento. Metodologia: Trata-se de um estudo ecológico. Foram obtidas, do Registro de Câncer de Base Populacional de São Paulo (RCBP-SP), informações sobre todos os casos novos de linfomas no Município de São Paulo, diagnosticados no período de 1997 a 2012. Informações sobre o número de habitantes do Município foram obtidas online através do site do Departamento de Informática do SUS. Para avaliar a tendência da incidência de linfomas no decorrer do período, segundo sexo e faixa etária, foram ajustados modelos lineares generalizados (MLG). Para avaliar a influência da idade, do período de diagnóstico e das coortes de nascimento na tendência da incidência dos linfomas, foi utilizado o modelo idade-período-coorte (IPC). Resultados e conclusões: Dos 18.037 casos analisados, 20,5% eram do tipo LH e 79,5% do tipo LNH. Entre os casos de LH, 52,6% eram homens e 70,0% tinham entre 20 e 39 anos. A taxa de incidência de LH padronizada por idade, por 100 mil habitantes, variou de 5,0 em 1997 para 4,0 em 2012, entretanto, não foi detectada nenhuma tendência significativa na incidência ao longo do tempo (p>0,05). O risco de desenvolver LH foi maior no sexo masculino do que no feminino apenas na faixa etária de 0 a 14 anos (p<0,001), nas demais, o risco foi semelhante para ambos os sexos (p>0,05). O risco de desenvolver LH segundo a faixa etária apresentou um padrão etário bimodal. No sexo feminino, os maiores riscos ocorreram nas faixas de 20 a 39 e de 65 anos e mais e, no masculino, nas faixas de 15 a 19 e de 65 anos e mais. O modelo IPC apontou uma influência da coorte de nascimento na incidência de LH em mulheres: para aquelas nascidas antes de 1960, quanto mais antiga a coorte, maior o risco de LH; para as nascidas após 1960, o risco relativo permaneceu estável. Entre os casos de LNH, 51,6% eram homens e 77,4% tinham mais de 40 anos. A taxa de incidência de LNH padronizada por idade, por 100 mil habitantes, passou de 22,6 em 1997 para 17,0 em 2012. Foi detectada uma tendência de decréscimo na incidência de LNH de 1,7% ao ano em todas as faixas etárias, em ambos os sexos (p<0,001). O risco de desenvolver LNH aumentou continuamente com o avançar da idade, em ambos os sexos. O modelo IPC não detectou efeitos de período. Para os homens, as coortes mais velhas apresentam maior risco e, as mais jovens, menor risco. Para as mulheres nascidas antes de 1960 o comportamento foi semelhante ao dos homens, para as nascidas após 1960, o risco relativo permaneceu estável. / Introduction: Lymphomas comprise a heterogeneous group of neoplasias originating in the lymphatic system, different in their histology, prognosis and epidemiology, although there may be a large number of common clinical aspects. According to their morphology, two groups are divided: Hodgkin\'s lymphomas (HL) and non-Hodgkin\'s lymphomas (NHL). Objective: To evaluate the temporal trend of the incidence of lymphomas in the period from 1997 to 2012, identifying the influence of factors such as sex, age, period and cohort and birth. Methodology: This is an ecological study. Information about all new cases of lymphomas in the city of São Paulo, diagnosed in the period from 1997 to 2012, were obtained from the São Paulo Population Based Cancer Registry. Information on the number of inhabitants of the Municipality were obtained online through the website of the SUS Department of Informatics. To evaluate the trend of lymphoma incidence during the period, according to sex and age group, generalized linear models (GLM) were adjusted. The age-period-cohort (APC) model was used to evaluate the influence of age, diagnosis period and birth cohorts on the trend of lymphoma incidence. Results and conclusions: Of the 18,037 cases analyzed, 20.5% were HL type and 79.5% NHL type. Among the cases of HL, 52.6% were men and 70.0% were between 20 and 39 years old. The age-standardized incidence rate of HL per 100,000 population ranged from 5.0 in 1997 to 4.0 in 2012, however, no significant trend in incidence over time was detected (p> 0.05). The risk of developing HL was greater in males than in females only in the age group 0 to 14 years (p <0.001), in the others, the risk was similar for both sexes (p> 0.05). The risk of developing HL according to the age group presented a bimodal age pattern. In females, the highest risks occurred in the 20-39 and 65-year-olds, and in the male, in the 15-19 and 65 years and older ranges. The APC model pointed to an influence of the birth cohort on the incidence of HL in women: for those born before 1960, the older the cohort, the higher the risk of HL; for those born after 1960, the relative risk remained stable. Among the cases of NHL, 51.6% were men and 77.4% were over 40 years old. The age-standardized incidence rate of NHL per 100,000 population increased from 22.6 in 1997 to 17.0 in 2012. A trend of a decrease in the incidence of NHL of 1.7% per year was observed in all ranges in both sexes (p <0.001). The risk of developing NHL increased steadily with advancing age in both sexes. The APC model did not detect period effects. For men, older cohorts are at higher risk, and younger cohorts are at lower risk. For women born before 1960 the behavior was similar to that of men, for those born after 1960, the relative risk remained stable.
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Análise da incidência dos linfomas no município de São Paulo, 1997 a 2012 / Analysis of the incidence of lymphomas in the city of São PauloRaphael Akira Siqueira Ishibashi 25 October 2018 (has links)
Introdução: Os linfomas abrangem um grupo heterogêneo de neoplasias originadas no sistema linfático, diferentes quanto à sua histologia, prognóstico e epidemiologia, embora possa haver grande número de aspectos clínicos comuns. De acordo com sua morfologia, dividem-se dois grupos: os linfomas Hodgkin (LH) e os linfomas não-Hodgkin (LNH). Objetivo: Avaliar a tendência temporal da incidência de linfomas no período de 1997 a 2012, identificando a influência de fatores como o sexo, a idade, o período e a coorte e nascimento. Metodologia: Trata-se de um estudo ecológico. Foram obtidas, do Registro de Câncer de Base Populacional de São Paulo (RCBP-SP), informações sobre todos os casos novos de linfomas no Município de São Paulo, diagnosticados no período de 1997 a 2012. Informações sobre o número de habitantes do Município foram obtidas online através do site do Departamento de Informática do SUS. Para avaliar a tendência da incidência de linfomas no decorrer do período, segundo sexo e faixa etária, foram ajustados modelos lineares generalizados (MLG). Para avaliar a influência da idade, do período de diagnóstico e das coortes de nascimento na tendência da incidência dos linfomas, foi utilizado o modelo idade-período-coorte (IPC). Resultados e conclusões: Dos 18.037 casos analisados, 20,5% eram do tipo LH e 79,5% do tipo LNH. Entre os casos de LH, 52,6% eram homens e 70,0% tinham entre 20 e 39 anos. A taxa de incidência de LH padronizada por idade, por 100 mil habitantes, variou de 5,0 em 1997 para 4,0 em 2012, entretanto, não foi detectada nenhuma tendência significativa na incidência ao longo do tempo (p>0,05). O risco de desenvolver LH foi maior no sexo masculino do que no feminino apenas na faixa etária de 0 a 14 anos (p<0,001), nas demais, o risco foi semelhante para ambos os sexos (p>0,05). O risco de desenvolver LH segundo a faixa etária apresentou um padrão etário bimodal. No sexo feminino, os maiores riscos ocorreram nas faixas de 20 a 39 e de 65 anos e mais e, no masculino, nas faixas de 15 a 19 e de 65 anos e mais. O modelo IPC apontou uma influência da coorte de nascimento na incidência de LH em mulheres: para aquelas nascidas antes de 1960, quanto mais antiga a coorte, maior o risco de LH; para as nascidas após 1960, o risco relativo permaneceu estável. Entre os casos de LNH, 51,6% eram homens e 77,4% tinham mais de 40 anos. A taxa de incidência de LNH padronizada por idade, por 100 mil habitantes, passou de 22,6 em 1997 para 17,0 em 2012. Foi detectada uma tendência de decréscimo na incidência de LNH de 1,7% ao ano em todas as faixas etárias, em ambos os sexos (p<0,001). O risco de desenvolver LNH aumentou continuamente com o avançar da idade, em ambos os sexos. O modelo IPC não detectou efeitos de período. Para os homens, as coortes mais velhas apresentam maior risco e, as mais jovens, menor risco. Para as mulheres nascidas antes de 1960 o comportamento foi semelhante ao dos homens, para as nascidas após 1960, o risco relativo permaneceu estável. / Introduction: Lymphomas comprise a heterogeneous group of neoplasias originating in the lymphatic system, different in their histology, prognosis and epidemiology, although there may be a large number of common clinical aspects. According to their morphology, two groups are divided: Hodgkin\'s lymphomas (HL) and non-Hodgkin\'s lymphomas (NHL). Objective: To evaluate the temporal trend of the incidence of lymphomas in the period from 1997 to 2012, identifying the influence of factors such as sex, age, period and cohort and birth. Methodology: This is an ecological study. Information about all new cases of lymphomas in the city of São Paulo, diagnosed in the period from 1997 to 2012, were obtained from the São Paulo Population Based Cancer Registry. Information on the number of inhabitants of the Municipality were obtained online through the website of the SUS Department of Informatics. To evaluate the trend of lymphoma incidence during the period, according to sex and age group, generalized linear models (GLM) were adjusted. The age-period-cohort (APC) model was used to evaluate the influence of age, diagnosis period and birth cohorts on the trend of lymphoma incidence. Results and conclusions: Of the 18,037 cases analyzed, 20.5% were HL type and 79.5% NHL type. Among the cases of HL, 52.6% were men and 70.0% were between 20 and 39 years old. The age-standardized incidence rate of HL per 100,000 population ranged from 5.0 in 1997 to 4.0 in 2012, however, no significant trend in incidence over time was detected (p> 0.05). The risk of developing HL was greater in males than in females only in the age group 0 to 14 years (p <0.001), in the others, the risk was similar for both sexes (p> 0.05). The risk of developing HL according to the age group presented a bimodal age pattern. In females, the highest risks occurred in the 20-39 and 65-year-olds, and in the male, in the 15-19 and 65 years and older ranges. The APC model pointed to an influence of the birth cohort on the incidence of HL in women: for those born before 1960, the older the cohort, the higher the risk of HL; for those born after 1960, the relative risk remained stable. Among the cases of NHL, 51.6% were men and 77.4% were over 40 years old. The age-standardized incidence rate of NHL per 100,000 population increased from 22.6 in 1997 to 17.0 in 2012. A trend of a decrease in the incidence of NHL of 1.7% per year was observed in all ranges in both sexes (p <0.001). The risk of developing NHL increased steadily with advancing age in both sexes. The APC model did not detect period effects. For men, older cohorts are at higher risk, and younger cohorts are at lower risk. For women born before 1960 the behavior was similar to that of men, for those born after 1960, the relative risk remained stable.
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Relação entre poluição do ar e internações de adultos por doenças cardiovasculares totais em São Paulo entre 2000 e 2013Bezerra, Yuri Charllub Pereira 30 January 2017 (has links)
Submitted by Rosina Valeria Lanzellotti Mattiussi Teixeira (rosina.teixeira@unisantos.br) on 2017-04-10T12:24:50Z
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Yuri C. Pereira Bezerra.pdf: 1511197 bytes, checksum: 07b7896685114a1850da4781cd9b97e8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-10T12:24:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Yuri C. Pereira Bezerra.pdf: 1511197 bytes, checksum: 07b7896685114a1850da4781cd9b97e8 (MD5)
Previous issue date: 2017-01-30 / This observational, ecological time series study aims to verify the relationship between adult hospitalizations for total cardiovascular diseases (CVDD) and air pollution stratified by sex in residents of the city of São Paulo from 2000 to 2013, observing their Structure of lag. Analyzes were stratified by age group and sex and included hospitalizations for Total Cardiovascular Diseases (ICD10: Chapter IX - I00-I99). The pollutant and meteorological data were provided by the Environmental Sanitation Technology Company of the State of São Paulo. The relationship between air pollutants and climatic factors in hospitalizations for Total Cardiovascular Diseases was analyzed by means of a polynomial distribution lag model for both temperature and air pollutants with a lag structure of up to 6 days after exhibition. Generalized linear models of Poisson regression were used, controlling for long-term seasonality, days of the week, and holidays. The following was calculated the increase in the number of hospitalizations for the interquartile difference of the pollutants significant in the regression model, as well as for the meteorological factors. For all hospital admissions for Total Cardiovascular Diseases, acute short-term effects were observed. The O3 was the only pollutant that did not have any relation to any of the analyzed results and NO2 had the greater effect, for an increase of interquartile 50.22 ¿g / m 3 of NO2, an increase of 13.09% (IC95 %: 4.74% - 21.45%), among the total admissions from 30 to 44 years. Stratifying the analysis by age group, a greater effect was found for hospitalizations from 45 to 60 years. Regarding gender, between the age group 30 and 44, the men stood out, and for the 45-60 age group, the women were more affected than the men. / Este estudo observacional, ecológico de series temporais tem por objetivo de verificar a relação entre internações de adultos por doenças cardiovasculares totais (DCVT) e poluição do ar estratificado por sexo, em residentes do município de São Paulo no período de 2000 a 2013, observando sua estrutura de defasagem. As analises foram estratificadas por faixa etária e sexo e incluíram internações por Doenças Cardiovasculares Totais (CID10: capítulo IX - I00-I99). Os dados de poluentes e meteorológicos foram fornecidos pela Companhia de Tecnologia de Saneamento Ambiental do Estado de São Paulo. A relação entre poluentes do ar e fatores climáticos nas internações por Doenças Cardiovasculares Totais, foram analisadas por meio de um modelo de defasagem de distribuição polinomial tanto para a temperatura como para os poluentes do ar, com uma estrutura de defasagem de até 6 dias após a exposição. Foram utilizados modelos lineares generalizados de regressão de Poisson, controlando-se para sazonalidade de longa duração, dias da semana e feriados. A seguir foi calculado o aumento no número de internações para a diferença interquartil dos poluentes significativos no modelo de regressão, bem como para os fatores meteorológicos. Para todas as admissões hospitalares por Doenças Cardiovasculares Totais, foram observados efeitos agudos de curta duração. O O3 foi o único poluente que não teve relação a nenhum dos desfechos analisados e o NO2 foi o que teve o efeito maior, para um aumento de interquartil 50,22 µg/m³ de NO2, revelou um aumento de 13,09% (IC95%: 4,74% - 21,45%), entre as internações totais de 30 a 44 anos. Estratificando a análise por faixa etária, encontrou-se um maior efeito para as internações de 45 a 60 anos. No que diz respeito ao sexo, entre a faixa etária 30 a 44, sobressaíram os homens, e para a faixa etária de 45 a 60 anos, as mulheres foram mais afetadas que os homens.
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Crescimento de espécies florestais madeiráveis como subsídio para o manejo florestal na Amazônia ocidental / Growth of forest timber species as improvements to the forest management in western AmazonCunha, Thiago Augusto da 25 February 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Reliable growth data from trees are very important in the context of forest
management. Tree-characteristics such as architecture and competition are
associated with diameter growth. Previous studies analyzing tree growth changes
have indicated that these variables can describe these effects more effectively.
However, the precise role of these effects in the growth modeling of tropical trees
needs to be studied further to discuss more effectively the actual forest management
practices. Here, we reconstructed the periodic annual basal area increment (IPAg) of
four long-lived timber species from the Amazon forest: Cedro (Cedrela odorata);
Cerejeira (Amburana cearensis); Copaíba (Copaifera paupera) e Mogno (Swietenia
macrophylla) aiming to explain the IPAg variation by developing a individua-tree
growth model using the following potential predictors: tree size, morphometric data,
competition; crown position and liana load. The model was fitted using a Gamma
distribution in the context of Generalized Linear Models. The statistics criteria and
residual distributions showed that growth model was adequate to adjust the observed
IPAg data and revealed some dendrometric variables that were involved into the
effects that lead the observed variation in IPAg, presenting a broad range of the
observed data in situations were growth is complex and variable between species.
Trees sampled in good site conditions - expressed as a good crown exposure to light,
and therefore low competition - presented higher growth rates than trees sampled
under high competition from neighboring trees. Besides, the variables Liana load, for
Cedrela, the crown diameter and the Hegyi competition index was demonstrated to
be highly influential predictive variable. Also, trees sampled in densities greater than
25 m2.ha-1 had their IPAg% significantly reduced. In the context of basal area
increment yield by the space occupied in the forest (crown efficiency) the species
presented mostly efficiency when growth in dominant position with thin and long
crown (crown formal). Among the species, Cedrela odorata was the most efficient in
growth. This behavior reinforces the importance of release trees to obtain better
crown exposure. / Dados confiáveis de crescimento de árvores são muito importantes no contexto do
manejo florestal. Características próprias da árvore como a arquitetura e a
competição estão associadas diretamente com o crescimento em diâmetro e altura.
Estudos anteriores indicaram que essas variáveis podem descrever a variação do
incremento. No entanto, o efeito dessas variáveis na modelagem do crescimento de
árvores tropicais precisa ser mais bem estudado, para discutir efetivamente as
praticas de manejo florestal atuais. Portanto, nessa pesquisa reconstruiu-se o
incremento periódico anual em área basal (IPAg) de quatro espécies de árvores
madeiráveis de vida longa da Amazônia: Cedro (Cedrela odorata); Cerejeira
(Amburana cearensis); Copaíba (Copaifera paupera) e Mogno (Swietenia
macrophylla) com o objetivo de explicar a variação de IPAg, propondo um modelo de
crescimento tipo de árvore individual utilizando os seguintes preditores potenciais:
tamanho e morfometria da árvore; o status competitivo; a posição social e a carga de
lianas na copa. O modelo foi ajustado considerando a distribuição de probabilidade
Gama no contexto de Modelo Linear Generalizado. Em base a critérios estatísticos e
avaliação residual, o modelo de crescimento demonstrou ser adequado para explicar
a variação de IPAg e revelou variáveis dendrométricas que englobam grande parte
dos efeitos que moldaram a variação observada do IPAg, apresentando boa
abrangência dos dados observados em situações onde o crescimento é complexo e
variado entre as espécies. As árvores quando amostradas em boas condições de
sítio, expressado por boa exposição da copa à luz solar e, portanto, pouca
competição, apresentaram as maiores taxas de IPAg, no período avaliado, do que
aquelas encontradas sob forte competição por árvores vizinhas. Além disso, as
variáveis carga de lianas na copa, para Cedrela, o diâmetro de copa e o status
competitivo de Hegyi influenciaram de forma significativa o IPAg. Árvores
amostradas em densidade maior do que 25 m2.ha-1 mostraram queda significativa do
IPAg%. No contexto de incremento em área basal por área ocupada na floresta
(eficiência da copa), todas as quatro espécies mostraram-se mais eficientes quando
em melhor posição social e quando com copas estreitas e longas (formal de copa
pequeno). Entre as espécies a Cedrela odorata foi a mais eficiente no crescimento,
comportamento que reforça a importância da liberação das árvores o que
proporcionaria melhor exposição da copa à luz solar.
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Ferramentas de seleção para uniformidade de produção em tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) / Selection tools for uniformity of production in Nile tilapia (Oreochromis niloticus) / Herramientas de selección para uniformidad de producción en tilápias del Nilo (Oreochromis niloticus)Lázaro Velasco, Ángel de Jesús [UNESP] 26 September 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-09-26 / Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT) / Há evidências na literatura que a uniformidade das características fenotípicas dos peixes, entre outros animais, pode ser afetada por componentes genéticos, além de fatores ambientais. Maior uniformidade na despesca é desejada, a fim de reduzir a competição entre os animais e, assim, ter uma produção mais homogênea, visando maior retorno financeiro da atividade. O objetivo deste estudo foi estimar se as variâncias residuais do peso e comprimento à despesca de tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) são afetadas por componentes genéticos, para avaliar a possibilidade de seleção para uniformidade de produção. Empregou-se o modelo hierárquico linear generalizado duplo (DHGLM) para calcular os componentes de variância, os parâmetros de herdabilidade, coeficientes de variação e correlações genéticas para peso (não transformado e com transformação Box-Cox) e comprimento à despesca. Foi utilizado um total de 8.725 informações fenotípicas de tilápias provenientes de 271 famílias da linhagem GIFT (Malásia), criados na estação experimental de piscicultura da Universidade Estadual de Maringá. Os resultados apoiaram a hipótese de heterogeneidade genética da variância residual para peso e comprimento à despesca, e a oportunidade de seleção medida através do coeficiente genético de variação da variância residual. Além disso, observou-se a necessidade de um grande número de filhos para a obtenção de estimativas precisas do mérito genético para variação residual, conforme indicado pelas estimativas de baixa herdabilidade. A transformação de Box-Cox foi capaz de diminuir a dependência entre a variância e a média do peso à despesca. A transformação reduziu, mas não eliminou toda a heterogeneidade genética da variância residual, destacando sua presença além do efeito da escala. / There is evidence in the literature that the uniformity of phenotypic traits of fish, among other animals, can be affected by genetic components, as well as environmental factors. Greater uniformity is desired in order to reduce competition among animals and thus have a more uniform production, aiming a greater financial return of the activity. The objective of this study was to assess if the residual variance of the weight and harvest length of the Nile tilapia (Oreochromis niloticus) is affected by a genetic component, to evaluate the possibility of selection for uniformity of production. The double hierarchical generalized linear model was used to estimate the components of variance, heritability, coefficients of variation and genetic correlation for weight (untransformed and with Box-Cox transformation) and harvest length. Phenotypic records of 8,725 individuals from 271 families were analyzed. The results supported the existence of genetic heterogeneity of residual variance on harvest weight and length, and the opportunity to select for increasing uniformity. Moreover, the low heritability estimates showed the necessity of high number of progeny for an accurate estimate of the genetic merit for the residual variance. The Box-Cox transformation of harvest weight reduced the dependency among its mean and variance. The transformation reduced but did not eliminate the genetic heterogeneity of residual variance, highlighting its presence beyond the scale effect. / CONACYT: 579742/410471
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Um modelo dinâmico para séries temporais contínuas com massa em zeroPereira, Jhonata da Silva, 92-99124-1515 22 March 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-03-22 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / We present in this dissertation a model for continuous time series in which the
observed values are nonnegative but have a proportion of zeros (mass in zero). The
model is based on the theory of Dynamic Linear Model (DLM) and Dynamic Generalized
Linear Model (DGLM) Which allows us to make inferences of the parameters
in a recursive way through the Kalman filter. To evaluate the proposed model
was developed a simulation study and applications in time series of pluviometric
precipitation. / Apresentamos nesta dissertação um modelo para séries temporais contínuas em
que os valores observados são não negativos, mas tem uma proporção de zeros (massa
em zero). O modelo é baseado na teoria do Modelo Linear Dinâmico (MLD) e
Modelo Linear Generalizado Dinâmico (MLGD) que nos permite fazer inferências
dos parâmetros de forma recursiva através do filtro de Kalman. Para avaliar o
modelo proposto foi desenvolvido um estudo de simulação e aplicações em séries
temporais de precipitação pluviométrica.
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Modelo linear beta Weibull generalizado: propriedades, estimação, diagnóstico e aplicações / Generalized beta Weibull linear model: properties, estimation, diagnostics and aplicationsSantana, Tiago Viana Flor de 05 October 2016 (has links)
Neste trabalho dois novos modelos estatísticos de regressão são propostos, com estrutura muito semelhante aos Modelos Lineares Generalizados (MLG) porém, admitindo as distribuições Weibull exponenciada (WE) e beta Weibull (BW) para o componente aleatório as quais não pertencem a família exponencial como é requerido em MLG. Os novos modelos trazem uma nova abordagem para as distribuições admitidas em modelos de regressão e estende o MLG para além da família exponencial. Os modelos, nomeados por Modelo Linear Weibull Exponeciada Generalizado (MLWEG) e Modelo Linear Beta Weibull Generalizado (MLBWG), possuem como caso particular o modelo Exponencial, pertencente a família de MLG, além de outros modelos que os MLGs não contemplam como, por exemplo: Weibull, WE, Exponencial Exponenciado (EE) entre outros. Além da função taxa de falha (ftf) constante da distribuição Exponencial, os novos modelos ajustam também formas monótonas e não monótonas da ftf. Quando se admite função de ligação logarítmica obtém-se o mesmo modelo de locação e escala, muito utilizado em análise de sobrevivência, sem a necessidade de transformação da variável resposta simplificando a modelagem e permitindo maior compreensão da influência das covariáveis na resposta. Método de estudo de observações influentes foi construído baseado na metodologia de influência local sobre três esquemas de perturbações: perturbação da verossimilhança, da variável resposta e das covariáveis e a análise de resíduo foi proposta a partir da função quantílica. Por fim, dois conjuntos de dados reais foram utilizados para ilustrar a aplicabilidade dos modelos propostos e seus resultados discutidos. / In this work two new statistical regression models are proposed, with very similar structure to Generalized Linear Models (GLM) but, assuming the exponentiated Weibull (EW) and beta Weibull (BW) distributions for the random component which do not belong to the exponential family as required in GLM. The new models bring a new approach to the distribution accepted in regression models and extend the GLM beyond of the exponential family. The models, named by Generalized Exponentiated Weibull Linear Model (GEWLM) and Generalized Beta Weibull Linear Model (GBWLM) have as a particular case the Exponential model, belonging to the family of GLM, and other models that GLMs do not include, for example : Weibull, EW, Exponentiated Exponential (EE) among others. Besides the failure rate function (frf) constant of Exponential distribution, the new models also model monotonous and not monotonous forms of frf. When it accepts logarithmic link function obtains the same location and scale model, widely used in the analysis of survival without the need to transform the response variable simplifying the modeling and allowing greater understanding of the inuence of covariates on the response. Study of inuential observations method was built based on the methodology of the local inuence on three perturbations schemes: perturbation of the likelihood of the response variable and the covariates and residual analysis was proposed from the quantile function. Finally, two sets of real data are used to illustrate the applicability of the models proposed and results discussed.
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