Made available in DSpace on 2016-01-13T13:28:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-05-11. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-13T13:33:36Z : No. of bitstreams: 1 000856242.pdf: 1246530 bytes, checksum: a1d6b60bc6042d7e202e7f8317d9b52e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Diante da perda de habitats, a recuperação e restauração de áreas e processos ecológicos tem destaque na conservação da biodiversidade. Desta forma, é muito importante avaliar se as áreas recuperadas e restauradas estão assumindo gradualmente atributos biológicos semelhantes aos de ambientes naturais. Nesses atributos estão o retorno das espécies e seus mutualismos e a reprodução das espécies presentes nessas áreas. Nessa avaliação os morcegos constituem um grupo zoológico fávorável, pois são diversos, abundantes, possuem grande diversidade de uso de recursos alimentares e de habitats, além de importantes funções ecológicas. Os objetivos gerais desse estudo foram: conhecer a assembleia de morcegos (capítulo 1), a dieta das espécies frugívoras (capítulo 2) e a biologia reprodutiva das espécies (capítulo 3) em cinco áreas no Estado de São Paulo, três delas restauradas com diferentes idades (áreas 1, 2 e 3), uma nativa (4) e outra periurbana (5). Os morcegos foram capturados mensalmente com redes de neblina em cada uma das áreas durante um ano. Após a captura, os animais foram mantidos em sacos de algodão até serem triados. Fezes oriundas do período em que estiveram presos nas redes foram coletadas de plásticos dispostos sob as redes, bem como dos sacos de algodão. Nas triagens os morcegos foram identificados, sexados e tiveram sua faixa etária e estado reprodutivo anotados. As sementes das fezes foram identificadas usando-se comparações com coleções de referência, consultas a especialistas e dados morfométricos. Com um esforço mensal de 16200 h.m² por área, entre abril de 2012 e março de 2013 foram 647 capturas (50 recapturas) de 18 espécies pertencentes a três famílias. Na área 1 foram 46 capturas (duas recapturas) de cinco espécies (estimativa de riqueza Jackknife 2, J2 = 8,5 espécies; Chao 1, C1 = 5 espécies e índice de Shannon H' = 1,56); na 2 foram 173 (26) de 12 (20,75; 15,33 e... / Faced the loss of habitats, recovery and restoration areas and ecological processes has featured in biodiversity conservation. Thus, it is very important to assess whether the recovered and restored areas are gradually assuming biological properties similar to those of natural environments. These attributes are the return of the species and their mutualism and the reproduction of the species in those areas. In this evaluation bats are a good model, as they are diverse, abundant, have great diversity of use of food resources and habitats, and important ecological function. The general objectives of this thesis were to examine the structure of bat communities (Chapter 1), the diet of frugivorous species (Chapter 2) and the reproductive biology of the species (Chapter 3) in five areas in the state of São Paulo, three of them restored at different ages (areas 1, 2 and 3), a native (4) and a periurban (5). The bats were captured with mist-nets in each area for one year. After captured they were kept in cotton bags to be screened. Feces were collected them coming on plastic under the mist-nets and cotton bags. In trials they were identified, sexed and had their age and reproductive status noted. The seeds of feces were identified using comparisons with reference collections, consultations with specialists and morphometric data. With a monthly effort to 16200 h.m² by area, between April 2012 and March 2013 were 646 catches (50 recaptures) of 18 species belonging to three families. In area 1 were 46 catches (two recaptures) of five species (estimated wealth of Jackknife 2, J2 = 8.5 species and Shannon index H '= 1.56); in area 2 were 173 (26) of 12 species (20.75 and 2.4); in area 3 were 264 (17) of 12 species (19.99 and 2.39); in area 4 were 49 in (two) five (6.75 and 1.27); and in area 5 were 144 catches (five) of tem species (17.99 and 2.23). In 291 feces samples from ten species of bats were found 28,256 seeds of 32 species of plants. Two ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-02-20Bitstream added on 2014-06-13T20:14:34Z : No. of bitstreams: 1 moreira_prl_me_sjrp.pdf: 475365 bytes, checksum: 7053d5f3ee8ab1aee3f60d4fc5958a52 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Foi utilizada a técnica de RAPD para estudo da variabilidade genética e identificação de marcadores moleculares, em sete espécies de morcegos pertencentes a cinco gêneros e três famílias: E. glaucinus, E. perotis, M. molossus, M. rufus (Molossidae), E. furinalis, M. nigricans (Vespertilionidae) e A. planirostris (Phyllostomidae). Para amplificação do DNA genômico foram utilizados 20 primers decaméricos que juntos produziram 741 bandas, identificadas pelos tamanhos dos fragmentos em pares de bases (pb). As bandas foram registradas quanto a presença e ausência em cada indivíduo e os dados usados na construção de uma matriz binária e analisados estatísticamente e filogeneticamente com auxílio do programa Popgene 1.31 e PAUP 4.0b/0. O número total de bandas produzidas variou em cada espécie, sendo M. molossus a espécie que apresentou o maior número de bandas (369), e E. glaucinus o menor número (239). O número de bandas polimórficas e as freqüências relativas e médias em cada espécie também variaram. As maiores freqüências médias de bandas polimórficas foram apresentadas pelos primers 1, 2, 3, 7, 8, 18 e 19. Entre as espécies, M. molossus foi a mais polimórfica (43%), seguida de M. nigricans (40,1%), A. planirostris (32,9%), E. furinalis (31,4%), E. glaucinus (29,4%), M. rufus (28,5%) e E. perotis (23,1%). Outras bandas foram reconhecidas como monomórficas para uma espécie, sendo quatro para M. nigracans, duas para M. molossus, uma para E. glaucinus e uma para E. furinalis. Apesar de monomórficas para a espécies, quando os fragmentos foram utilizados como sondas em procedimentos de hibridação in situ cromossômicos e nuclear eles hibridaram com diferentes espécies, não confirmando a especificidade da banda. A diversidade gênica calculada segundo Nei (1973), foi analisada para a população, representada pelas sete espécies...

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-12-14Bitstream added on 2015-04-09T12:48:05Z : No. of bitstreams: 1 000814242.pdf: 292290 bytes, checksum: 7f608cbeff5c861ea06e130020ce4d2a (MD5) / The control of the Desmodus rotundus bats populations is one of the measures included in the National Program of Herbivores Rabies Control of the Agriculture Ministry, which also includes vaccination of animals, epidemiological surveillance and health education. The methodology used for this control mainly includes the elimination of individuals or colonies of D. rotundus by the use of anticoagulant substances applied directly to sores produced by these animals in herbivores, or on the back of bats captured in shelters or in nets placed around the corrals. Besides this direct measure, the control of these bats populations also involves the registration and monitoring of shelters, the bites rate control in cattle and other herbivores in the properties and the send of specimens to the laboratory for the search of rabies virus. The aim of this study was to characterize the shelters and quantify the population of D. rotundus, in the region Andradina, São Paulo State, in the period from 2010 to 2012, in order to evaluate the effects of the actions adopted for control of bats, with the developing a critique of the method and propose actions to be forwarded to the National Program for Control of Herbivores Rabies of the Agriculture Ministry, hoping to improve knowledge of environmental impacts caused by the control, the impacts of the removal of bats for animal communities, and the transmission of rabies. Fifty shelters for bats registered by CDA and distributed in 12 municipalities were visited during the period from April to June 2010 and bats captured were treated with paste-based Warfarine. Thirty-one of them were re-inspected in September 2012. Most of the shelters, registered in the region, are artificial, corresponding to 92% and 97% of the total found in 2010 and 2012, respectively. Regarding the type of shelters, empty houses, sewers or tunnels under highways, tree holes, abandoned wells, bridges...

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:25:27Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:48:48Z : No. of bitstreams: 1 000844062_20160502.pdf: 428516 bytes, checksum: c56c96a72c53f314e53b0c24c154c60f (MD5) Bitstreams deleted on 2016-05-04T13:08:29Z: 000844062_20160502.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-05-04T13:09:32Z : No. of bitstreams: 1 000844062.pdf: 4509391 bytes, checksum: f6babbe2a0a697cce4856b138d318181 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Chiroptera é a segunda maior ordem de mamíferos. Esta apresenta diferentes estratégias e características reprodutivas únicas. Entretanto, são raros os relatos relacionados com as glândulas reprodutivas acessórias (GRAs) masculinas de morcegos brasileiros. Artibeus planirostris (Phyllostomidae: Chiroptera) apresenta um complexo prostático compacto composto por duas regiões (ventral e dorsal) e um par de glândulas bulbouretrais. O complexo prostático desta espécie apresenta variações durante o ano: no peso, na altura de epitélio, na porcentagem dos componentes glamdulares (lúmen, epitélio e estroma), na quantidade de células receptor de andrógeno positiva e células em processo de proliferação e morte, bem como variações hormonais. Indicando assim que o nível de testosterona influencia nessas variações. A castração (supressão de testosterona) e a subsequente suplementação deste hormônio podem elucidar a relação das GRAs com a testosterona. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da castração e suplementação de testosterona nas GRAs de A. planirostris. Os animais foram coletados na cidade de São José do Rio Preto, no noroeste do Estado de São Paulo, Brasil. As capturas foram realizadas no verão (21 de dezembro - 21 de março), a fim de minimizar as variações decorrentes da sazonalidade. Foram utilizados apenas machos adultos, com a determinação da idade dos animais baseada no peso corporal, ossificação completa das epífises metacarpo-falange, desgaste dos dentes, o posicionamento dos testículos e na presença de espermatozoides no testículo, cauda do epidídimo e/ou na uretra. Neste trabalho foram analisados quarenta e seis espécimes machos sexualmente maduros, os quais foram divididos em oito grupos: I) 3 dias castrado (CA3d, n = 7); II) controle três dias (CO3d, n = 4); III) 15 dias castrado (CA15d, n = 7); IV) 15 dias controle (CO15d, n = 5)... / Chiroptera is the second largest order of mammals. This presents different reproductive strategies with some unique characteristics. However, there are very few reports related to the accessory reproductive glands (GRAs) of Brazilian bats. Artibeus planirostris (Phyllostomidae: Chiroptera) has a prostatic complex comprised of two regions (ventral and dorsal) and a pair of bulbourethral glands. The prostatic complex of this species shows variations during the year in: weight, epithelial height, percentage of components glands (lumen, epithelium and stroma), the amount of cells: positive androgen receptor and proliferation and death, as well as variations hormonal. Indicating that testosterone levels influence these variations. Castration (testosterone suppression) and subsequent supplementation of this hormone may elucidate the relationship of the GRAs with testosterone. Thus, the aim of this study was to evaluate the effect of castration and testosterone supplementation in GRA of A. planirostris. The animals were collected in the city of São José do Rio Preto, in the northwest of São Paulo State, Brazil. The captures were concentrated in the summer (21 st December to 21st March) in order to minimize variations arising from seasonality. The bats were aged as adults based on body weight, complete ossification of the metacarpalphalangeal epiphyses, wear of the teeth, positioning of the testes and the presence of sperm inside the testes, cauda epididymis and/or urethra. Thus, forty-six sexually male mature specimens were analyzed. Eight groups were formed: I) 3 days castrated (CA3d, n=7); II) 3 days control (CO3d, n=4); III) 15 days castrated (CA15d, n=7); IV) 15 days control (CO15d, n=5); V) 15 days castrated with testosterone cypionate (1µg/Kg/day) repositioned for 3 days (T3d, n=7); VI) 15 days castrated with testosterone cypionate (1µg/Kg/day) repositioned for 7 days (T7d, n=7); VII) Control of...

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-12-12Bitstream added on 2014-08-13T18:00:06Z : No. of bitstreams: 1 000766910.pdf: 1743638 bytes, checksum: 2982d47b717cb578b36c15eb29139681 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A fragmentação e perda de hábitat levam à diminuição da quantidade ou variedade de alimentos e área de vida, deixando populações mais vulneráveis a efeitos ambientais. Chiroptera é uma das ordens de maior sucesso dentre os mamíferos e participa ativamente de processos ecológicos. Todavia podem responder de forma negativa à fragmentação, e este efeito pode variar interespecificamente. Assim, determinar a magnitude dos impactos da fragmentação nas populações de morcegos pode ser útil no sentido de detectar a sensibilidade de espécies a esse distúrbio, facilitando propostas de medidas preventivas e de manejo. Dentre as várias ferramentas que podem ser utilizadas para determinar os mecanismos subjacentes aos efeitos diferenciais de distúrbios antrópicos, aquelas que fazem uso de métodos e conceitos da Fisiologia são consideradas como altamente promissoras, sendo que qualquer parâmetro fisiológico que indexe o estado de saúde de um organismo e que possa ser medido em diversas condições tem o potencial de ser utilizado para determinar se o animal está experimentando uma situação de estresse. Um dos principais protocolos para determinar a resposta ao estresse em vertebrados é a comparação da concentração dos níveis de base de hormônios glucocorticóides e a resposta hormonal a um estímulo indutor de estresse. Complementarmente, a determinação de índices de condição corpórea pode auxiliar na detecção de efeitos de impactos ambientais por indicarem o status fisiológico dos indivíduos relacionado à nutrição, acúmulo de gordura, massa muscular e estrutura esquelética, além de estarem potencialmente relacionados com fitness evolutivo. O principal objetivo desta pesquisa foi analisar as respostas das espécies Artibeus lituratus, Carollia perspicillata e Sturnura lillium aos efeitos da fragmentação da Mata Atlântica através da quantificação e comparação do perfil de hormônios glucocorticóides.. / The fragmentation and habitat loss led to a decrease in quantity or variety of food and living area, leaving populations morev ulnerable to environmental effects. Chiroptera is one of the most successful order among mammals and actively participates in ecological processes. However may respond negatively to fragmentation, and this effect can vary interspecific. Thus, assess the magnitude of the impacts of fragmentation on bat populations can be useful in order to detect the sensitivity of species to this disorder, making proposals for preventive measures and management. Among the various tools that can be used to determine the mechanisms underlying the differential effects of human disturbance, those who make use of methods and concepts of physiology are considered as highly promising, and any physiological parameter that indexes the state of health of an organism and which can be measured under various conditions has the potential to be used to determine whether the animal is experiencing stress situation. One of the main protocols to determine the stress response in vertebrates is to compare the concentration of baseline levels of glucocorticoid hormones and hormonal response to a stimulus inducing stress. In addition, the determination of indexes of body condition can help detect effects of environmental impacts because they indicate the physiological status of individuals related to nutrition, fat accumulation, muscle and skeletal structure, and are potentially related to evolutionary fitness. The main objective of this project was to analyze the responses of species Artibeus lituratus, Carollia perspicillata and Sturnira lillium to the effects of fragmentation of the Mata Atlântica through the quantification and comparison of the profile of glucocorticoid hormones and body condition. Besides differences in body size, these species differ in the use of the landscape, which may reflect a differential sensitivity to the effects of... / FAPESP: 10/13014-1 / FAPESP: 08/57687-0

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-11-08T16:38:57Z No. of bitstreams: 1 2016_AnaCarolinaMoreiraMartins.pdf: 67463150 bytes, checksum: 40180dbaa9ff2ff477550e027b371a44 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-01-05T16:03:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_AnaCarolinaMoreiraMartins.pdf: 67463150 bytes, checksum: 40180dbaa9ff2ff477550e027b371a44 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-05T16:03:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_AnaCarolinaMoreiraMartins.pdf: 67463150 bytes, checksum: 40180dbaa9ff2ff477550e027b371a44 (MD5) / A degradação de florestas tropicais tem reduzido o percentual de habitat de qualidade, criando paisagens fragmentadas e desmatadas. Estas alterações na paisagem causam muitos ajustes na distribuição, abundância e capacidade de cada espécie de persistir em uma determinada área. Devido aos vários serviços ecossistêmicos desempenhados pelos morcegos como dispersores de sementes, polinizadores e predadores, estes animais contribuem para o funcionamento dos ecossistemas florestais. Neste contexto, é importante entender como estes prestadores de serviços ecossistêmicos reagem às alterações antrópicas, em diversas escalas de análise, sejam elas espaciais (variáveis locais como estrutura da vegetação ou de paisagem), temporais (efeito da sazonalidade) ou em níveis ecológicos (populações, métricas de comunidade, diversidades filogenética e taxonômica). Para isso, morcegos foram coletados em 24 sítios florestados de 2013 a 2014 (amostragens de 6 horas/noite, 12 redes de neblina [12 x 2,6 m], 4 noites/sítio [durante estações seca e chuvosa], esforço amostral de 8640 m2.h/sitio). A área de estudo consiste de uma paisagem fragmentada de 100 km2 no município de Alta Floresta, norte do estado do Mato Grosso, Brasil. A paisagem compreende quatro classes de uso do solo: floresta (habitat), matriz (tipicamente pastagem), vegetação arbustiva e vegetação secundária. A estrutura da paisagem foi quantificada (tamanho do fragmento; quantidade de floresta; características do habitat, da matriz, ou de toda a paisagem), assim como a estrutura da vegetação (densidade, altura e área basal das árvores, densidade de sub-bosque e abertura de dossel). No capítulo 1, o objetivo foi compreender como a diversidade e as populações de morcegos (14 espécies mais abundantes) são afetadas por variações na estrutura da vegetação em florestas fragmentadas. O modelo para abundância total, diversidade taxonômica (diversidade de espécies e dominância) e diversidade filogenética foram significativos, apresentando relação positiva com a altura e área basal das árvores, e relação negativa com a abertura de dossel. Em nível populacional, a abundância dos frugívoros (Carollia perspicillata, Rhinophylla pumilio, Artibeus planirostris, A. obscurus, A. lituratus, Uroderma bilobatum) e nectarivoros (Lonchopylla thomasi, Glossophaga soricina) foi relacionada à estrutura da vegetação. Alguns frugívoros de sub-bosque exibiram relações negativas com altura das árvores, optando por florestas mais jovens, enquanto alguns frugívoros de dossel preferiram florestas com dossel fechado. Dos nectarívoros, L. thomasi foi mais abundante em florestas mais maduras (relação negativa com densidade de árvores), enquanto G. soricina foi mais abundante em áreas com dossel mais aberto e reduzidas áreas basais (i.e., florestas em estágio sucessional inicial). Consequentemente, órgãos governamentais deveriam continuar a priorizar a conectividade florestal e tamanhos de fragmentos, mas também deveriam considerar idade e estrutura das florestas locais. Em geral, áreas protegidas com grandes árvores e dosséis fechados aumentam a persistência de polinizadores e dispersores de semente. No capítulo 2, aumentamos a escala de análise espacial, procurando entender como as populações dos morcegos são afetadas pela fragmentação da paisagem. As respostas às características da paisagem foram detectadas para as populações das 14 espécies mais abundantes e representativas em um gradiente ambiental de perda florestal. Usamos uma abordagem de múltiplas hipóteses concorrentes em uma seleção de modelos por AIC, com o objetivo de descobrir quais características da paisagem importam para estas populações de morcegos. Este processo foi reproduzido para 5 escalas de análise com raio de 1, 2, 3, 4 e 5 km, porque as espécies de morcegos têm diferentes estratégias de forrageio. Os morcegos exibiram diferentes respostas a essa paisagem fragmentada: 1) O maior frugívoro de dossel, Artibeus lituratus, respondeu à paisagem desde a menor escala local até a maior, mas não se mostrou dependente de grandes áreas florestadas em algumas escalas (2, 3 e 4 km). Entretanto, tem relações positivas com a diversidade da paisagem; 2) Artibeus obscurus apresentou abundância associada a cobertura florestal em escala local; 3) Glossophaga soricina, um nectarívoro que realiza um serviço ecossistêmico-chave, esteve associado à paisagens mais heterogêneas em escala local, exibindo relações negativas com a quantidade de matriz (2 km) e isolamento das manchas de floresta (3 km); 4) Lophostoma silvicola, que auxilia no controle de populações de artrópodes, apresentou respostas somente em uma escala de 5 km, com maior abundância relacionada à matriz e vegetação arbustiva. Concluindo, alguns morcegos são sensíveis ao desmatamento e outros não, e suas repostas à alteração do habitat variam entre as espécies e com a escala espacial. No capítulo 3, na mesma escala espacial, avaliamos como a diversidade dos morcegos é afetada por variações em uma paisagem fragmentada. As respostas às características da paisagem foram testadas para riqueza, abundância total, equitabilidade, dominância, raridade, diversidade taxonômica, e diversidade filogenética de morcegos filostomideos. Aqui, foi usada a mesma metodologia estatística e as mesmas variáveis do capítulo 2. As dimensões de diversidade e abundância apresentaram relações variadas com as métricas da paisagem e dependente de escalas, as demais métricas não apresentaram um padrão. Diversidade taxonômica e filogenética respondem positivamente à área de floresta em escala local. A abundância apresentou respostas em todas as escalas e muito diferenciadas, o que demonstra as formas complexas em que perturbação antrópica pode afetar cada espécie de morcego. O estudo reforça a ideia da relação espécie-área, já que a quantidade de habitat é um determinante da diversidade taxonômica e filogenética de morcegos em áreas fragmentadas da Amazônia. No capítulo 4, apresentamos o uso de uma nova e eficiente abordagem para entender quais são os fatores estruturadores de comunidades (Análise de Elementos de Metacomunidade (AEM) associada à partição de variância) que permite descobrir um gradiente ambiental latente que afeta em particular a estrutura de uma metacomunidade e a variação na composição de espécies entre os sítios. Assim, na AEM, foram avaliadas coerência, troca de espécies, e coincidência de limites de distribuição, para identificar a estrutura emergente de metacomunidades. Também foi estimada a importância relativa das características da paisagem na composição de espécies de morcegos usando a partição de variância, apenas na escala de 1 km. Análises foram conduzidas para todos os morcegos e para duas grandes guildas (herbívoros e carnívoros), nas duas estações (seca e chuvosa). Foi avaliado se a estrutura da metacomunidade era consistente com um gradiente de paisagem via Correlação de Spearman. Através da Partição de Variância, baseada em quatro partições (Composição e Configuração do Habitat e das Classes de Matriz), exploramos como a composição de morcegos (identidade das espécies e abundâncias) respondem à variação na paisagem. As metacomunidades baseadas em todos os morcegos e somente animalívoros evidenciaram uma estrutura aleatória. Em contraste, a distribuição de herbívoros (nectarívoros e frugívoros) indicou uma estrutura Quasi- Clemensiana, sugerindo que a maioria das espécies está respondendo ao mesmo gradiente ambiental latente. Esta organização ocorre porque espécies que formam agrupamentos utilizam recursos semelhantes. A metacomunidade não foi associada a nenhum gradiente ambiental latente. Entretanto, a metacomunidade de herbívoros foi associada com a latitude (Correlação de Spearman = 0,4; p = 0,051), um substituto para distância das populações-fonte ao norte da área de estudo (grande maciço de florestas não perturbadas). A variação na composição de espécies de herbívoros (ponderada pela abundância) foi associada com a variação das características da paisagem (Modelo Global= p = 0,092; R2aj = 0,46), principalmente devido a Composição do Habitat (p= 0,036; R2aj = 0,51). A metacomunidade de herbívoros mostrou resposta significativa à composição de habitat (quantidade e densidade de fragmentos florestais), quando a presença foi ponderada pela abundância. Esses resultados indicam que comunidades em uma paisagem fragmentada próxima a uma extensa área de floresta preservada não sofrem extinções locais, mas a abundância das espécies se altera em resposta à fragmentação e perda de habitat. __________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The degradation of tropical forests has reduced the amount of high-quality habitat, creating deforested and fragmented landscapes. These changes in landscape cause many shifts in distribution, abundance, and ability of each species to persist in an area. Because seed dispersers, pollinators, or top predators, such as bats, contribute to the structure and function of forests, it is important to understand how these ecosystem services respond to anthropogenic changes at several scales of analysis, whether spatial (local variables such as vegetation structure or landscape metrics), temporal (seasonal effects), or ecological levels (populations, community metrics, phylogenetic and taxonomic diversity). We collected bats from 24 forested sites in 2013 and 2014 (sampling six hours per night, with 12 mist nets [12 x 2.6 m], 4 nights/site (during dry and wet seasons), with a total effort of 8640 m2.h/site). The study area was a 100 km2-fragmented landscape in southern Amazonia, northern Mato Grosso State, Brazil. This landscape comprises four land use classes: forest, matrix (typically pasture), shrubby vegetation, and disturbed areas. Landscape attributes were determined (patch size; forest amount; habitat, matrix or landscape characteristics), and we quantified vegetation structure (density, height and basal area of trees, density of understory and canopy openness). In chapter 1, the aim was to understand how the population (14 more abundant species) and biodiversity of bats were affected by variation in vegetation structure in fragmented forests. The models for total abundance, taxonomic diversity (species diversity and dominance), and phylogenetic diversity were significant, positively associated with tree height and basal area, and negatively associated with canopy openness. At the population level, frugivores (Carollia perspicillata, Rhinophylla pumilio, Artibeus planirostris, A. obscurus, A. lituratus, Uroderma bilobatum) and nectarivores (Lonchopylla thomasi, Glossophaga soricina) abundances were significantly related to vegetation structure. Abundances of some understory frugivores exhibited negative relationships with tree height (and consequently forest age), whereas abundances of canopy frugivores were highest in closed-canopy forests. Among the nectarivores, L. thomasi was more abundant in older forests (negative relationship with density of trees), whereas G. soricina was more abundant in areas with low canopies and low basal area (i.e., earlier successional forest). Consequently, government agencies should prioritize local forest age and structure, in addition to forest connectivity and patch size. In general, protecting areas with large trees and closed canopies enhances the persistence of pollinators and seed dispersers. In chapter 2, we increased the spatial scale of analysis, trying to understand how bat abundance is affected by landscape fragmentation. The responses to landscape features were detected for fourteen populations of phyllostomid bats along an environmental gradient of forest loss. We have used a multiple hypothesis approach using model selection by AIC, with the aim of assessing which landscape attributes matter most to bat populations. This procedure was conducted at five scales with radii of 1, 2, 3, 4 and 5 km, because bat species have different foraging strategies. Bats showed different responses to landscape fragmentation: the greater canopy frugivore Artibeus lituratus did not require huge amounts of forest, but had positive associations with landscape diversity (2, 3 and 4 km); Artibeus obscurus was more abundant in highly forested sites, but at the 2-km scale this species chose a less forested landscape; Glossophaga soricina, a nectarivore that plays a key ecosystem role, preferred a more heterogeneous landscape at local scales, presenting a negative relationship with matrix amount (2 km) and forest isolation (3 km); and Lophostoma silvicola, that seems to control arthropod populations, showed landscape associations only at the 5-km scale, with greater abundances related to matrix and shrub vegetation amount. In conclusion, some of these bats were sensitive to deforestation and other not, their response to habitat modification varying among species and with spatial scale. In chapter 3, at the same spatial scale, and increasing the taxonomic scale, we evaluated how bat diversity is affected by variations in a fragmented landscape. Responses to landscape features were tested for richness, total abundance, evenness, dominance, rarity, taxonomic diversity, and phylogenetic diversity of phyllostomid bats. Here we used the same statistical analyses and the same variables as in Chapter 2. Bat diversity and abundance presented different relationships with the landscape metrics, and are scale dependent, while the other community metrics were unassociated with landscape attributes. Taxonomic and phylogenetic diversity were positively associated with forest area at local scales. Total abundance presented different responses at all spatial scales, which shows the complex ways in which human disturbance can affect each bat species. The study reinforces the classical idea of the species-area relationship, since the amount of habitat is a determinant of the taxonomic and phylogenetic diversity of bats in fragmented areas of the Amazon. In chapter 4, we presented the use of a new and effective approach to understand which factors are structuring the communities, elements of metacommunity structure (EMS) associated with Variance Partitioning. This approach allows the uncovering of a latent environmental gradient that particularly affect metacommunity structure and the variation of species composition among sites. Thus, using the EMS, based on presence–absence data, were evaluated coherence, species turnover, and range boundary clumping to identify the emergent bat metacommunity structure. Moreover, we assessed the relative importance of landscape characteristics on bat species composition using variance partitioning, at the scale of 1 km only. Analyses were conducted for all bats and for two broad feeding guilds (herbivores and animalivores). Using landscape metrics (number of patches, total area, edge density, mean patch size, shape index, proximity index, mean nearest neighbor) we evaluated whether the metacommunity structure was consistent with a local landscape gradient using Spearman correlations. By means of a Variance Partitioning Analysis, based on four partitions (i.e. Composition and Configuration for Habitat/Forest and Matrix Classes), we explored how bat composition (identity of species and their abundance) responded to variation in the landscape structure. The metacommunities based on all bats and only animalivores evinced a random structure at the local scale. In contrast, herbivores (nectarivores and frugivores) evinced a Quasi-Clementsian structure, suggesting that most species are responding to the same environmental gradient. This pattern arises because species that form clusters have similar resource requirements. Metacommunities’ scores were not associated with any latent environmental gradient. However, the herbivorous metacommunity was associated with latitude (Spearman Correlation = 0.4; p = 0.051), a surrogate for distance from source populations in the North of the study area (massive block of undisturbed forest). Variation in herbivorous species composition (weighted by abundance) was associated with variation in Landscape characteristics (Global Model p = 0.092, R2adj = 0.46), mostly due to Habitat Composition (p = 0.036, R2adj = 0.51). However, the herbivores metacommunity showed a significant response to habitat composition (amount and density of forest areas), when presence was weighted by abundance. These outcomes indicate that communities in fragmented landscapes in close proximity to extensive undisturbed forests do not present local extinctions, but species abundances do change in response to fragmentation and habitat loss in the landscape.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-22Bitstream added on 2014-06-13T18:31:11Z : No. of bitstreams: 1 allendorf_sd_me_botfmvz.pdf: 391470 bytes, checksum: 4de5cbdaf392b6546f0a5a82ea035e2b (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Morcegos vêm recebendo crescente importância em Saúde Pública, pois são os principais reservatórios para a raiva em diversas partes do mundo. Pouco se conhece a respeito da distribuição do vírus rábico em tecidos e órgãos não nervosos. O objetivo deste estudo foi avaliar a distribuição do vírus rábico em órgãos e tecidos de quirópteros naturalmente infectados de diferentes hábitos alimentares, e avaliar a existência de alguma possível correlação com a filogenia das amostras. Foram utilizados 26 morcegos previamente diagnosticados positivos para raiva pelos métodos padrão, sendo coletado cérebro, glândulas salivares, pulmão, coração, fígado, baço, estômago, intestinos, rins, bexiga, gordura interescapular e fezes. As amostras foram submetidas à extração do material genético e submetidas à reação de RT-PCR com iniciadores específicos para o gene N. As amostras que resultaram negativas na primeira reação foram submetidas a uma segunda amplificação (hemi-nested PCR). Os produtos amplificados foram submetidos ao sequenciamento genético e as sequências alinhadas com sequências homólogas obtidas do GenBank para construção da árvore filogenética. Os resultados demonstraram uma ampla distribuição do vírus em órgãos e tecidos dos morcegos, não sendo possível correlacionar com a espécie e tão pouco com a linhagem viral encontrada. O maior percentual de positividade foi encontrado em cérebro e glândula salivar e a técnica de heminested PCR demonstrou ter maior sensibilidade na detecção do vírus rábico nas amostras estudadas. Na análise filogenética observou-se o agrupamento das amostras de acordo com as espécies, confirmando a existência de linhagens gênero específicas / Bats have been assigned an increasing importance in Public Health as these are the main rabies reservoirs in many parts of the world. Little is known about the distribution of rabies virus in non-nervous tissues and organs. The aim of this study was to evaluate the distribution of rabies virus in organs and tissues of naturally infected bats with different feeding habits, and evaluate the existence of any possible correlation with the phylogeny of the samples. 26 bats previously diagnosed as positive for rabies by standard methods were used; the brain, salivary glands, lung, heart, liver, spleen, stomach, intestine, kidneys, urinary bladder, interscapular fat and feces were collected. The genetic material were extracted and submited to RT-PCR reaction with specific primers for the N gene. The samples that were negative in the first reaction underwent a second amplification (hemi-nested PCR). The amplified products were subjected to genetic sequencing and the sequences aligned with homologous sequences obtained from GenBank for phylogenetic tree construction. The results showed a wide distribution of virus in organs and tissues of bats, it was not possible to correlate the viral distribuition with the species nor with the viral strain found. The highest percentage of positivity was found in brain and salivary glands and the technique of heminested PCR demonstrated to have a greater sensitivity for detection of rabies virus in the studied samples. The phylogenetic analysis showed the clustering of samples according to the species, confirming the existence of genus specific lineages

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-08-20Bitstream added on 2014-06-13T19:14:35Z : No. of bitstreams: 1 carvalho_c_me_araca.pdf: 284989 bytes, checksum: 926c8c7db1bce860bcc7f1964a72b6fc (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A riqueza de espécies da fauna de morcegos e a ocorrência de vírus rábico foram avaliadas em área urbana (municípios da região de Araçatuba) e florestal (fragmento localizado no município de Valparaíso-SP), ambos localizados na região noroeste do Estado de São Paulo. Os morcegos da área urbana foram recebidos diretamente no laboratório de diagnóstico de raiva da UNESP - Campus de Araçatuba no período de 2006 a 2007. Morcegos da área florestal foram capturados mensalmente, no período de um ano de coletas em 2007, resultando em uma baixa diversidade de espécies. As amostras das duas áreas foram submetidas ao exame de diagnóstico de raiva, por meio das técnicas de imunofluorescência direta (IDF) e inoculação intracerebral em camundongos. Foram analisados 968 morcegos pertencentes a quatro famílias, Phyllostomidae, Noctilionidae, Molossidae e Vespertilionidae. Os morcegos observados em ambas as áreas no período de 2007 resultaram em uma similaridade na composição das espécies representada pela família Phyllostomidae. Morcegos da família Molossidae foram registrados na sua maioria em áreas urbanas, observando-se somente uma espécie no fragmento Florestal. A taxa de positividade na área urbana no período de 2006 a 2007 foi de 0,72%, inferior à média registrada em estudos anteriores, sendo os casos positivos em morcegos de hábito alimentar frugívoro e insetívoro. Todos os morcegos da área florestal foram negativos para o diagnóstico da raiva. O estudo pode contribuir para o conhecimento da diversidade de morcegos e a epidemiologia da raiva na região. / The species richness of bat fauna and the ocurrence of rabies virus were studied in urban (municipal districts from Araçatuba region) and natural (forest fragment in Valparaiso town) environments, both located in the Northwestern Sao Paulo State. Bats from the natural forest were collected with mist nets in four different areas: forest, boarding areas, natural clearings in the woods and areas close to water and food sources. Urban samples were composed by bats, sent to UNESP Rabies Laboratory, for rabies virus research by fluorescent antibody test (FAT) and mouse inoculation test (MIT). A total of 968 bats belonging to four families, Phyllostomidae, Noctilionidae, Molossidae e Vespertilionidae, were analyzed. The results obtained from both areas showed a closed similarity in the composition of species and some particularities in the distribution of species according to trophic guilds in bats from Phyllostomidae family. Most of bats from the Molossidade family were recorded in urban areas, with only one species in the forest fragment. Considering all samples, 0,72% was rabies positive, a lower index compared to the mean index registered in the last years. All the positive cases occurred in frugivorous and insectivorous bats. This study was important to improve the knowlegment of bat diversity and rabies epidemiology in this specific region.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-04-12Bitstream added on 2014-06-13T19:28:27Z : No. of bitstreams: 1 scatena_mp_me_sjrp.pdf: 361046 bytes, checksum: 070147acd31974b26757d6f198b0f1d5 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho analisou a viabilidade da extração de DNA de tecidos fixados em formalina e sua aplicabilidade em experimentos de PCR e sequenciamento. Um total de 123 amostras de tecidos de 54 espécimes depositados em coleção científica (DZBSJRP) foram utilizados para a extração de DNA. Os tecidos passaram por pré-tratamentos antes da extração de DNA em diferentes temperaturas e pHs, na tentativa de minimizar os efeitos da fixação sobre os ácidos nucléicos. Os resultados demonstraram que o tratamento em soluções neutras à 37oC, por no mínimo quatro dias melhora a qualidade do DNA extraído e seu desempenho nas reações de amplificação e de sequenciamento. As seqüências geradas foram utilizadas em uma análise filogenética de parcimônia das espécies brasileiras de grandes Artibeus. Os alinhamentos das seqüências e as árvores produzidas apresentaram altos valores de bootstrap para a maioria dos clados, evidenciando que as seqüências obtidas de tecidos fixados também podem gerar dados confiáveis e que podem contribuir para o esclarecimento de aspectos evolutivos de muitos grupos animais que encontram-se bem representados em coleções científicas. / The present work analyzed the viability of the extraction of DNA of formalin fixed tissues and the applicability in PCR and sequencing experiments. A totality of 123 samples of tissues representing 54 specimens deposited in scientific collection (DZBSJRP) were used for the extraction of DNA. The tissues were exposed to different treatments before extraction of DNA involving different temperatures and pHs, in the attempt of minimizing the effects of the fixation on the nucleic acids. The results demonstrated that the treatment in neutral solutions at 37oC during at least four days improve the quality of extracted DNA and the conditions of amplification reactions and sequencing. The sequences obtained after amplifications were used in a phylogenetic analysis of parsimony involving Brazilian species of great Artibeus. The alignments of the sequences and the trees produced evidenced that the sequences of amplified of formalin-fixed tissue can also generate reliable data and than contribute to the explanation of evolutionary aspects of many animal groups that are archived in scientific collections.

Orientador: Eliana Morielle Versute / Banca: Marlene Kiyoni Hosaki Kobayashi / Banca: Wagner André Pedro / Resumo: Foram analisados citogenéticamente seis espécies de Vespertilionidae dos gêneros Myotis, Lasiurus, Histiotus e Eptesicus. As metáfases obtidas de culturas de fibroblastos foram analisadas em coloração convencional, Ag-NOR, bandamento C e G e hibridização in situ fluorescente com sonda de seqüências teloméricas (TTAGGG)n humana. As espécies Myotis nigricans, Myotis riparius (2n=44; NF=50), Eptesicus brasiliensis (2n=50; NF=48) e Histiotus velatus (2n=50; NF=48) foram as que apresentaram o maior número de cromossomos; Lasiurus ega (2n=28; NF=48) e Lasiurus cinereus (2n=28; NF=48) apresentaram o menor número de cromossomos, o que evidencia variabilidade cariotípica ao nível morfológico. A coloração Ag-NOR evidenciou variação no número de nucléolos interfásicos e nos cromossomos com RONs. Em M. nigricans e M. riparius as marcações nos cromossomos portadores de RONs variaram em distribuição, número e tamanho. Em M. nigricans o número de cromossomos marcados variou de 7 a 9 e em M. riparius de 6 a 10. Nas duas espécies, as RONs foram observadas nas extremidades dos braços curtos e longos de cromossomos acrocêntricos. A variação no número deve estar refletindo a ativação diferencial de RONs, o que resulta uma variação no número e no tamanho dos nucléolos. Em M. nigricans o número de nucléolos observados variou de 01 a 09 e em M. riparius de 01 a 10. Além da ativação diferencial, a fusão nucleolar resultante do movimento, crescimento e aproximação dos nucléolos podem ser responsáveis pela variação observada. Em L. cinereus e H. velatus as RONs foram coincidentes com as constrições secundárias dos pares heteromórficos 11 e 13 em L. cinereus, e 15 em H. velatus. O padrão de bandas G obtidos para as espécies M. nigricans e M. riparius evidenciou a ocorrência de homologias cromossômicas entre elas. / Abstract: Six species of four vespertilionid genera (Myotis, Lasiurus, Histiotus and Eptesicus) were cytogenetically analyzed. The metaphases obtained from fibroblast cultures were analyzed in conventional staining, Ag-NOR, C and G banding and fluorescent in situ hybridization with probe of human telomeric sequence (TTAGGG)n. The species Myotis nigricans (2n=44, NF=48), Myotis riparius (2n=44; NF=50), Eptesicus brasiliensis (2n=50; NF=48) and Histiotus velatus (2n=50; NF=48) showed the highest number of chromosomes; Lasiurus ega (2n=28; NF=48) and Lasiurus cinereus (2n=28; NF=48) showed the lowest number, indicating karyotypic variability on the morphologic level. Ag-NOR staining evinced variation in the number of interphasic nucleoli and in chromosomes with NORs. In M. nigricans and M. riparius, the chromosomal Ag-stained regions varied in distribution, number and size. In M. nigricans, the number of marked chromosomes varied between 7 and 9, and in M. riparius, the number varied between 6 and 10. In both species, the NORs were observed on the extremities of the short and long arms of acrocentric chromosomes. The variation in number might be reflecting of NORs differential activation, resulting in variation in the number and size of nucleoli. In M. nigricans, the number of observed nucleoli has varied between 01 and 09, and in M. riparius, between 01 and 10. Besides differential activation, the nucleolar fusion resulting from the movement, growth and approximation of nucleoli might be responsible for the observed variation. In L. cinereus and H. velatus, the NORs were coincident with the secondary constrictions of heteromorphic pairs 11 and 13 in L. cinereus, and pair 15 in H. velatus. The pattern for G banding obtained for the species M. nigricans and M. riparius evinced the occurrence of chromosomal homologies between them. / Mestre