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Filogenia molecular de Brucepattersonius (Sigmodontinae : Akodontini) com uma análise morfométrica craniana do gêneroVilela, Júlio Fernando 29 March 2005 (has links)
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Previous issue date: 2005-03-29 / CAPES / Para identificar unidades evolutivas no gênero Brucepattersonius e propor uma hipótese filogenética, foram realizadas análises morfológicas e moleculares para amostras representando uma ampla área da distribuição do gênero. Ambas análises revelaram a presença de cinco linhagens evolutivas independentes entre as amostras disponíveis: A linhagem "A", do Maciço do Caparaó, Minas Gerais, revelou-se composta apenas por uma espécie, B. griserufescens, uma vez que o holótipo de B. albinasus, descrita para a mesma localidade, não se distinguiu dela em termos moleculares (Citocromo b). A linhagem "B", das Serras dos Órgãos e da Mantiqueira (Rio de Janeiro e Minas Gerais), não pôde ser associada a qualquer das fom1as nominais disponíveis. A linhagem "C", reuniu amostras de São Paulo a um haplótipo que ocorreu em simpatria com espécimes da linhagem "B" da Serra da Mantiqueira. A linhagem "D", composta por indivíduos de Aratiba, Rio Grande do Sul, foi associada em termos morfométricos a uma das três espécies descritas para a província de Misiones, Argentina. A linhagem "E", composta por um indivíduo de Urubici, Santa Catarina, revelou-se uma espécie divergente ainda não descrita. Estas cinco unidades, restritas ao domínio morfoclimático da Floresta Atlântica, apresentaram uma forte estruturação geográfica: um grupo mais basal, com distribuição predominantemente ao sul, sendo o haplótipo diferente da Serra da Mantiqueira uma provável extensão dele; uma forma isolada na Serra Geral em Santa Catarina; e um grupo mais derivado, com duas espécies, uma do Maciço do Caparaó, e outra das serras dos Órgãos e da Mantiqueira. / In the attempt to identify evolutionary units in the genus Brucepattersonius and to propose a phylogeneti hypothesis for them, morphometric and molecular analyses were carried out on samples enpompassing a wide are a ofthe distribution ofthe genus. Both analyses sorted the available samples into tive independent units: Lineage “A”, from the Caparaó massif, state of Minas Gerais, was shown to belong to only one species, namely B. griserufescens, in as much as the holotype of B. a/binasus, described for the same locality, was not distinct from it in molecular terms (cyt. b sequence). Lineage “B”, from Órgãos and Mantiqueira mountains (Rio de Janeiro and Minas Gerais), could not be assigned to any ofthe available nominal fom1s in the genus. Lineage “C”, clustered samples from São Paulo states to an haplotype that occurred in simpatry with specimens of Lineage “B” from Mantiqueira mountains. Lineage “D”, composed by specimens from Aratiba, state of Rio Grande do Sul, was shown to be morphometrically related to one of the three species described from the province of Misiones, Argentina. Lineage “E”, represented by a sole specimen from Urubici, state of Santa Catarina, is a divergent undescribed formo These tive units, restricted to the Atlantic Forest morphoclimatic domain, have shown a strong geographic structure: a basal group, predominantly meridional in distribution, with an offshot dispersed into the Mantiqueira montains; an isolated form in the Serra Geral of Santa Catarina; and a more derived group, with two species, one from the Caparaó massif, and the another from Órgãos and Mantiqueira mountains.
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Variação craniana, bacular e citogenética em três populações de Thrichomys apereoides (Lund, 1839) (Rodentia: Echimyidae) do nordeste, centro e sudeste do BrasilSilva, André Luiz Guedes da 06 1900 (has links)
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Previous issue date: 2005-06 / No gênero Thrichomys cinco descrições de espécies são reconhecidas, sendo que geralmente este gênero é considerado monotípico. Thrichomys apereoides (Lund, 1839) descrito de Lagoa Santa em Minas Gerais é um roedor echimídeo que difere da maioria dos roedores desta família por apresentar pelagem macia e cauda densamente pilosa. Em estudos recentes que enfocam a espécie, os resultados das análises já realizadas (morfométricas, citogenéticas e moleculares) sugerem que Thrichomys seja politípico. O objetivo deste estudo foi realizar análises morfológicas (crânio e báculo) e análise citogenética em três amostras populacionais de Thrichomys apereoides em Minas Gerais (Lagoa Santa, Matozinhos e Santana do Riacho) incluindo os espécimes coletados por Lund (1839), na Bahia (Morro do Chapéu, Mucugê, Palmeiras e Rio de Contas) e em Mato Grosso (Barão de Melgaço), visando compreender os limites morfológicos de possíveis unidades evolutivas independentes dentro do gênero Thrichomys. As análises qualitativa e quantitativa do crânio foram úteis na diferenciação das amostras. Estados de caracteres cranianos, Análise das Funções Discriminantes e Análise dos Componentes Principais discriminaram as amostras. A amostra da Bahia foi totalmente discriminada no eixo canônico principal 1 e parcialmente discriminada das demais amostras no componente principal 1. A análise bacular não discriminou as amostras. A análise citogenética apresentou cariótipos diferenciados: Minas Gerais com 2n = 28 e NF = 50; Bahia com 2n = 26 e NF = 48; Mato Grosso com 2n = 34 e NF = 64. A amostra de Minas Gerais é alocada a Thrichomys aperoides. A amostra da Bahia é alocada a Thrichomys inermis. A amostra de Mato Grosso é alocada a Thrichomys pachyurus. / Five nominal forms in Thrichomys has described, but this genera is currently regarded as monotypic. Thrichomys apereoides (Lund, 1839) described from Lagoa Santa (Minas Gerais) can be distinguished from other genera within the Echimyidae by its soft fur and densely-haired tail. Morphometric, karyological and molecular analysis in Thrichomys suggested that genera is politypic. The present study realized morphological (cranial and bacular) and Karyological analysis in three Thrichomys apereoides samples from Minas Gerais (Lagoa Santa, Matozinhos and Santana do Riacho) within specimens Lund ( 1839) collected, Bahia (Morro do Chapéu, Mucugê Palmeiras and Rio de Contas) and Mato Grosso (Barão de Melgaço) attempt to found independent evolutionary units. Qualitative and quantitative cranial analysis shows differences among the samples studied. Cranial traits conditions, Discriminant Functions Analysis and Principal Component Analysis discriminated the samples. The sample from Bahia has fully discriminated a1ong an axis CV 1 and parti11y discriminated along axis CP 1 . Bacular analysis not discriminated the samples. Karyological analysis discriminated the samples: 2n = 28 and FN = 50 from Minas Gerais; 2n = 26 and FN = 48 from Bahia; 2n = 34 and NF = 64 from Mato Grosso. Thrichomys apereoides is the oldest name the sample from Minas Gerais. Thrichomys inermis is the oldest name the sample from Bahia. Thrichomys pachyurus is the oldest name the sample from Mato Grosso.
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Comparação interpopulacional de caracteres morfológicos e reprodutivos do ouriço-do-mar Arbacia lixula (Linnaeus, 1758) (Echinodermata: Echinoidea) em duas localidades do litoral do estado do Rio de JaneiroZama, Paula Caetano 07 1900 (has links)
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Previous issue date: 2005-07 / Arbacia lixula (Linnaeus, 1758) é um equinóide comum no litoral brasileiro e, apesar disso, é pouco estudado no Atlântico Sul. Os objetivos deste trabalho foram comparar as variações morfológicas e reprodutivas dentro e entre duas populações e analisar o ciclo reprodutivo de Arbacia lixula através do índice gonadal, do índice de maturidade e da análise histológica das gônadas. Mensalmente, 15 a 20 indivíduos foram coletados por mergulho em apneia na Prainha, Arraial do Cabo e na Ponta de Itaipu, Niterói. Os indivíduos coletados foram pesados e medidos antes da dissecação. O índice dos órgãos foi calculado. Uma gônada de cada indivíduo foi analisada histologicamente para determinação dos estágios gametogênicos. O ciclo reprodutivo foi rápido e contínuo, com produção e liberação de gametas durante todos os meses do estudo. Diferenças morfológicas interpopulacionais foram encontradas entre o diâmetro, a altura, e o peso da carapaça e o comprimento da demi-pirâmide. Os resultados deste estudo sugerem a ocorrência de plasticidade fenotípica e fluxo gênico entre as duas populações de Arbacia lixula. Estudos de manipulação e genética de populações devem anteceder qualquer atividade de manejo e exploração dessa espécie. / Arbacia lixula (Linnaeus, 1758) is a common echinoid on the Brazilian coast, although there are few studies about this species in the South Atlantic Ocean. This work aims to compare morphological and reproductive traits in two sea urchin populations and verify the reproductive cycle of Arbacia lixula using gonadal index, maturity index and histological analysis of the gonads. Monthly 15 to 20 specimens were collected by free diving in Prainha, Arraial do Cabo and in Ponta de Itaipu, Niterói. The specimens captured were weighed and had the test diameter and height measured before dissection. The body components indexes were calculated. Each specimen had one gonad analyzed histologically to verify gametogenic stages. The reproductive cycle was fast and continuous showing production and spawning of gametes all the period. Morphological differences were found among diameter, height, and weight of the tests and length of Aristotle's lantern. The results of this study suggest that phenotypic plasticity and gene flow between these two populations of Arbacia lixula should be occurring. Studies on population genetics and ecology should be done before any commercial explotation of this species.
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Distribuição espaço-temporal de Scolelepsis cf. squamata (Muller, 1808) (Polychaeta: Spionidae) como ferramenta para estudos da dinâmica sedimentar costeiraSouza, Gabriela Neves de 08 1900 (has links)
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Previous issue date: 2003-08 / A população de Scolelepsis cf. squamata da praia de Dois Rios, Ilha Grande, litoral sul do Estado do Rio de Janeiro, foi analisada durante as marés baixas de maio/2001, julho/01, novembro/01 e janeiro/02. A relação entre a distribuição espaço-temporal de S. squamata e a morfodinâmica da praia de Dois Rios foi examinada em escalas longitudinal e transversal, utilizando como variáveis a densidade e o tamanho da espécie. Foram traçados oito transectos que estiveram submetidos a diferentes influências hidrodinâmicas ao longo da praia. A face da praia foi dividida em três regiões transversais, de onde foram tomadas três réplicas aleatórias em cada um dos pontos ao longo da praia. As diferenças observadas na distribuição longitudinal foram explicadas pela morfodinâmica da praia, onde a densidade aumentou do estado de erosão (terraço de baixa mar) para o de deposição (refletivo) e o tamanho aumentou do estado de deposição para o de erosão. As exceções observadas, neste padrão foram explicadas pelo regime hidrodinâmico local. A relação observada entre tamanhos intermediários para grandes de S. squamata e a assimetria negativa do sedimento, mostram a importância do transporte passivo na distribuição da espécie. Não foi encontrada uma correlação entre a distribuição de S. squamata e o tamanho do grão, porém, foi encontrada uma evidente relação entre a distribuição da espécie e o transporte de sedimento marinho. Baixas densidades de S. squamata foram observadas durante períodos de alta hidrodinâmica, devido a sua baixa resistência ao transporte pela ação de ondas. Mesmo sob influência de alta hidrodinâmica, pequenos tamanhos de S. squamata foram encontrados durante este período, que coincidiu com o período de recrutamento da espécie. A associação observada entre a distribuição espaço-temporal de S. squamata, o estado morfodinâmico da praia e o transporte de sedimento em praias arenosas oceânicas. / A population of the spionid polychaete Scolelepis cf. squamata was studied on Dois Rios beach, an embayed oceanic beach located at Ilha Grande (a coastal island), at the southeastern Brazilian coast. The relationship between beach morphodynamics and the spatial-temporal distribution of this species along and across the beach was evaluated in relation to density and body size variables. Sampling was carried out during spring low tides of May/2001, July/2001, November/2001 and January/2002. Eight transects with different hydrodynamical influences were chosen along the entire beach. The intertidal beach was divided into three across-shore zones, where three replicate samples were randomly collected from each zone at each transect. Differences in S. squamata longshore distribution occurred mainly due to beach morphodynamics, where species densities increased from erosional (low tide terrace) to depositional (reflective) beach states and species body size increased from depositional to erosional ones. However, exceptions that could not be explained by the morphodynamic state per se, seems to be related to hydrodynamic patterns. The association between intermediate to large S. squamata body sizes and coarser skewed sands, shows the great importance of passive transport of individuals in determining species distribution. A correlation between sediment size and S. squamata distribution were not found, although a clear relationship between species distribution and marine sediment transport were found. S. squamata densities were lower during high hydrodynamic periods due to their weaker resistance to transport by wave action. In spite of the high hydrodynamics, smallest S. squamata body sizes were found in this period, that coincided with a species recruitment. The close association observed among S. squamata spatialtemporal distribution, morphodynamic beach state and sediment transport, supports the hypothesis that this species density and body size distribution might be used as a tool for correlating beach morphodynamics, hydrodynamics and sediment transport in oceanic sandy beaches.
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Heterogeneidade morfológica escapular e umeral em micromamíferos terrestres (Rodentia: Sigmodontinae): relações com as estratégias de uso dos habitatsNeves, Raquel Matilde Barbosa 28 February 2003 (has links)
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Previous issue date: 2003-02-28 / Baseada na premissa de que o esqueleto desempenha um papel funcional fundamental e apresenta suficiente plasticidade para responder às diferentes demandas dos habitats disponíveis e ocupados, foram realizadas análises visando avaliar as possíveis relações entre a morfologia da escápula e do úmero de 7 gêneros de sigmodontíneos (Bolomys, Calomys, Nectomys, Oecomys, Olígoryzomys, Oryzomys e Rhipidomys) da família Muridae e as estratégias de uso dos habitats. Um total de vinte e oito dimensões da escápula e sete dimensões do úmero foi analisado. A avaliação do significado dos caracteres utilizados no reconhecimento dos grupos de hábitos locomotores foi feita através da Análise da Função Discriminante. As percentagens de acertos dos grupos atribuídos evidenciaram que as formas de uso dos habitats podem ser identificadas com relativa segurança e que seu design pode ser considerado como envolvido na mecânica da locomoção e utilização dos habitats. A disposição dos diferentes grupos no espaço morfológico evidenciou três extremos de variação para a escápula: formas arborícolas, escansoriais e semiaquáticas. As formas arborícolas são caracterizadas por escápulas amplas e com área de articulação com o úmero robusta. A espinha da escápula é relativamente alta e o acrômio largo. As formas escansoriais são caracterizadas por escápulas estreitas, processo coracóide robusto e espinha escapular relativamente baixa. As formas semi-aquáticas são caracterizadas por grandes dimensões para a escápula o que possivelmente reflete a importância dessa para organismos aquáticos quando comparados aos seus correspondentes terrestres. A disposição dos diferentes grupos no espaço morfológico evidenciou dois extremos de variação para o úmero, representados pelas formas arborícolas e escansoriais. As formas arborícolas são caracterizadas por um úmero longo, com as áreas de articulação robustas. As formas escansoriais apresentam um úmero delicado que reflete suas pequenas dimensões. Sugere-se que essas representem um elemento facilitador da utilização de diversos estratos da vegetação com uma mecânica similar à utilizada no solo. / The skeleton plays a fundamental functional role in the survival of the species and presents plasticity to solve different demands of the habitat availability. Analyses were developed to evaluate the possible relationships among the scapular morphology and of the humerus in 7 genus of Sigmodontinae (Bolomys, Calomys, Nectomys, Oecomys, Oligoryzomys, Oryzomys and Rhipidomys), family Muridae, and the strategies of use of the habitats. Each genus were allocated in modal categories of habitat use form. Twenty-eight scapular dimensions and seven humeral dimensions were taken. The analysis of the correct allocation of the habitat use categories were evaluated by Discriminant Function analysis. The design of the same structures is involved in the mechanics of the locomotion and use of the habitats. The disposition of groups in the morphologic space evidenced three main class of variation: arboreal, scansorial and semiaquatic. The arboreal shows wide scapulas and articulation area with a robust humerus. The scapular spine is relatively high and the acromion is wide. A narrow scapula as well as a robust coracoid process and a relatively low scapular spine characterize the scansorial forms. The contrast between arboreal and scansorial forms suggests plasticity in the use of the structural resources of the environment, especially for the scansorial forms. The semi-aquatic forms are characterized by large scapulas that are related to body size that reflects its importance for aquatic small mammals when compared to terrestrial forms. The morphologic space evidenced two main variation for the humerus regarding scansorial and arboreal forms. The arboreal forms are characterized by long humerus, robust articulation areas, prominent head of the humerus and epicondylus, and large deltoid tuberosity. The scansorial forms present delicate humerus which reflects their small dimensions. This may facilitates the use of vegetation strata in a similar way as shown by terrestrial forms.
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Análise morfométrica do sistema auditivo periférico da preguiça (Bradypus variegatus)SOUSA, Pêssi Socorro Lima de 27 August 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A superordem Xenarthra é composta de 31 espécies viventes de tatus, tamanduás e preguiças. As arborícolas preguiças pertencem a dois gêneros, Choloepus e Bradypus, cuja divergência se deu a aproximadamente 40 milhões de anos atrás. As similaridades entre os dois taxa, tais como a presença de algas verdes nos pêlos e habilidade locomotora suspensória, são notáveis exemplos de evolução convergente. A exata posição da linhagem Xenarthra entre os mamíferos na árvore filogenética ainda não é completamente compreendida, com alguns rearranjos na árvore da família dos mamíferos placentários, considerando os Xenarthras mais relacionados entre Afrotheria (que inclui musaranhos, porcos-da-terra, peixes-boi e elefantes) ou a Boreoeutheria (que inclui primatas, roedores, carnívoros e ungulados). O objetivo deste trabalho é descrever pela primeira vez características morfológicas dos ouvidos médio e interno de Bradypus variegatus e compará-las a outros mamíferos placentários que possuam dados publicados na literatura. Nós usamos 13 espécimes adultas post-mortem (machos e fêmeas) e 15 crânios da coleção do Museu Paraense Emílio Goeldi. Além das medições, foram usadas técnicas de microscopia óptica, microscopia eletrônica de varredura e tomografia computadorizada. Através da árvore filogenética das preguiças, o gênero Bradypus é posicionado como táxon-irmão de todas as outras preguiças. Nossos resultados mostram que a morfologia do ouvido médio e interno de Bradypus variegatus é similar a de outros mamíferos com dados publicados na literatura e que apresentam escalonamento alométrico. / The mammalian super order Xenarthra is composed of about 31 extant species of armadillos, anteaters and sloths. The tree sloths belong to two genera, Choloepus and Bradypus, which diverged close to 40 million years ago. The similarities between the two taxa, such as the presence of green algae in the fur and the suspensory locomotor ability, are remarkable examples of convergent evolution. The exact location of the xenarthran lineage within the mammalian phylogenetic tree isn’t completely understood yet, with some recent rearrangements of the placental mammal family tree considering xenarthrans to be either most closely related to Afrotheria (that includes shrews, aardvarks, seacows and elephants), or Boreoeutheria (that includes primates, rodents, carnivorans and ungulates). The aim of present work is to describe for the first time the morphological features of both the middle and the inner ear of Bradypus variegatus and compare them to other placental mammals whose data is available in the literature. We used 13 mature postmortem specimens (males and females) and 15 skulls from the collection of the Museu Paraense Emílio Goeldi. Than measurements, techniques were used optical microscopy, scanning electron microscopy and computed tomography. Within the sloths’ phylogenetic tree, the genus Bradypus is positioned as the sister-taxon to all other sloths. Our results show that the morphology of the middle and inner ears of Bradypus variegatus are similar to other mammals with data published in the literature and they present allometric scalation.
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Morfologia hemipeniana de 11 espécies do gênero Micrurus Wagler, 1824 na Amazônia Brasileira, com redescrição de Micrurus filiformis (Günther, 1859) e Micrurus paraensis Cunha & Nascimento, 1973 (Serpentes, Elapidae)FEITOSA, Darlan Tavares January 2006 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-11T17:11:54Z
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Previous issue date: 2006 / O gênero Micrurus reúne serpentes de hábitos semi-fossoriais, terrestres e semiaquáticos, distribuídas desde o Sul dos Estados Unidos até o Sul da Argentina. Entre as cerca de 66 espécies atualmente válidas, 25 são registradas para a Amazônia brasileira. Com o objetivo de ampliar o conhecimento das serpentes do gênero Micrurus na Amazônia brasileira, foram levantados neste trabalho dados de lepidose, hemipênis e distribuição geográfica de 544 exemplares de 11 espécies. O presente trabalho compreende dois capítulos. O primeiro capítulo apresenta uma descrição comparativa dos hemipênis de 11 espécies de Micrurus. Baseado nos resultados obtidos nas análises dos exemplares foi elaborada diagnose, padrão de desenho e coloração, descrição e representação do hemipênis e mapa de distribuição geográfica para cada táxon. Neste capítulo são apresentadas descrições inéditas dos hemipênis de M. hemprichii ortoni e M. paraensis além de variações morfológicas até então não descritas da morfologia hemipeniana das espécies. O segundo capítulo apresenta uma descrição mais detalhada de duas espécies, M. filiformis e M. paraensis, com base na morfologia externa e do hemipênis. / Micrurus includes snakes of semi-fossorial, terrestrial and semi-aquatic habits, distributed from the southern United States to southern Argentina. From the 66 currently valid species, 25 are registered on the Brazilian Amazonia. In order to improve the knowledge on this group Brazilian Amazonia Micrurus, data about pholidosis, hemipenis and geographic distribution of 542 individuals of 11 species were collected. The present work contains two chapters. The first one is a comparative description of hemipenis from 11 Micrurus species. Diagnosis, coloration pattern, hemipenis description, geographic distribution are presented for each taxon. The hemipenis of M. hemprichii ortonii and M. paraensis are described for the first times. The second chapter presents more thorough a description of two species, M. filiformis and M. paraensis, based on the external hemipênis.
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Diversidade morfológica e molecular do gênero Oecomys thomas, 1906 (Rodentia: Cricetidae) na Amazônia oriental brasileiraFLORES, Tamara Almeida January 2010 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-10-24T22:26:26Z
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Previous issue date: 2010 / Os roedores arborícolas do gênero Oecomys possuem distribuição reconhecida para áreas de floresta tropical e subtropical da América Central e do Sul, e compreendem 17 espécies atualmente reconhecidas, além de duas descritas, mas não nomeadas, reconhecidas em estudos prévios. Destas, apenas seis têm ocorrência esperada para a Amazônia oriental brasileira. A delimitação das espécies com base apenas em caracteres morfológicos é complicada, de forma que diversos táxons nominais já foram associados ao gênero e diversos arranjos taxonômicos foram propostos. Na única revisão taxonômica para o gênero, realizada há 50 anos, foram reconhecidas apenas duas espécies politípicas. Desde então, vários trabalhos envolvendo análises morfológicas, moleculares e cariotípicas têm demonstrado que
há uma maior diversidade de espécies em Oecomys, resultando em descrições de espécies novas e revalidações de espécies anteriormente sinonimizadas. Este trabalho buscou caracterizar a variação morfológica e a diversidade molecular das espécies com ocorrência na Amazônia oriental brasileira. Para isto, empregamos análises filogenéticas com base no gene mitocondrial citocromo-b a fim de definir clados que representassem espécies, para as quais
descrevemos a morfologia externa e craniana. Como resultado, reconhecemos 11 espécies com ocorrência para o leste da Amazônia brasileira, das quais cinco são esperadas para a região (Oecomys auyantepui, O. bicolor, O. paricola, O. rex e O. rutilus), duas são registradas pela primeira vez para o bioma Amazônia (Oecomys catherinae e O. cleberi) e quatro espécies são novas ou não reconhecidas como válidas atualmente, aqui denominadas Oecomys
sp. A, Oecomys sp. B, Oecomys sp. C e Oecomys sp. D. Além disso, corroboramos estudos moleculares prévios em que Oecomys bicolor é um complexo de espécies, com base na alta taxa de divergência nucleotídica apresentada (7,5 %). Observamos dimorfismo sexual e
variação ontogenética na morfometria craniana da espécie Oecomys paricola, e para efeito de comparação extrapolamos estas variações para as demais espécies tratadas aqui. Sugerimos também uma hipótese filogenética entre as espécies do gênero a partir de 653 pb do gene citocromo-b, sendo esta a filogenia mais abrangente para Oecomys publicada até o momento, devido ao elevado número de espécies incluídas (11 das 16 espécies atualmente reconhecidas
e sete prováveis novas espécies) e a amplitude geográfica das amostras aqui utilizadas. / The arboreal rice rats, genus Oecomys, are distributed in tropical and subtropical areas from Central and South America, with 17 currently recognized species and another two species
already described in earlier studies but still unnamed. Six of these species are expected to occur in eastern Brazilian Amazon. Because defining the species limits inside Oecomys based only on morphological characters is a complicated task, many nominal taxa have already been associated to the genus, and different taxonomic arrangements have been proposed by specialists. Despite of this taxonomic instability, there is only one taxonomic review for the
genus carried out 50 years ago, in which only two polytypical species were recognized. However, several recent studies based on morphological, molecular and karyotypical data have been showing that the species diversity inside Oecomys is largely underestimated,
resulting in recent descriptions of new taxa or revalidation of previously synonymized species. This work aimed to assess the species diversity inside this genus in the eastern Brazilian Amazon by investigating the molecular and morphological variation in regional specimens. We employed phylogenetic analysis based on cytochrome-b in order to define clades that may represent species, and described the external and cranial morphology of these
recognized species. As a result, we recognized 11 species in the eastern Amazonian forest in Brazil, of which five are already expected to occur in this area (Oecomys auyantepui, O. bicolor, O. paricola, O. rex, and O. rutilus), two are recorded for the first time in the biome Amazonia (Oecomys catherinae and O. cleberi), and the four are either new or not currently recognized species (i.e. synonyms), herein referred as Oecomys sp. A, Oecomys sp. B,
Oecomys sp. C, and Oecomys sp. D. Moreover, we suggest that Oecomys bicolor is a species complex, based in the high nucleotide divergence we found (7.5 %), corroborating previous molecular studies. We observed sexual dimorphism and ontogenetic variation on cranial morphometry in the species Oecomys paricola, and for comparison purposes we treated all other species herein studied as exhibiting this kind of dimorphism. We also suggest a phylogenetic hypothesis among the species of this genus based on 653 bp of cytochrome-b. This is the most comprehensive phylogeny for Oecomys published to date, due to the great number of species included in the analysis (11 of the 16 currently recognized species plus seven probably new species), and the wide-ranging geographic area included in our sample.
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Ecomorfologia de três espécies de Dipsas Laurenti, 1768 e Sibynomorphus Fitzinger, 1843 (Dipsadidae: Dipsadinae)SANTOS, Marina Meireles dos January 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013 / Fatores ecológicos como a utilização do ambiente e a alimentação, podem influenciar na morfologia corporal e cefálica de um organismo, porém, esta também pode ser o reflexo da linhagem filogenética a que ele pertence. A subfamília Dipsadinae inclui serpentes sul-americanas formadas por dois clados, um incluindo Geophis e Atractus e outro incluindo Dipsas, Ninia, Sibon e Sibynomorphus, que formam a tribo Dipsadini. As serpentes desta tribo apresentam um alto grau de modificações na morfologia corporal e cefálica relacionadas ao ambiente e a alimentação malacófaga. As espécies de Dipsas e Sibon possuem especializações relacionadas à utilização do ambiente arborícola, conferindo um melhor desempenho na locomoção pela vegetação, enquanto que as espécies de Sibynomorphus, em sua grande maioria, são adaptadas ao ambiente terrestre. Quanto à alimentação todas elas apresentam, em diferentes graus, uma série de modificações cranianas relacionadas à manipulação e ingestão de gastrópodes, lesmas e caramujos. Considerando que existe uma relação direta entre a forma da cabeça e a dieta, este trabalho tem como objetivo analisar as divergências da morfologia cefálica relacionadas à dieta entre espécies de Dipsas e Sibynomorphus, assim como analisar possíveis convergências entre espécies destes gêneros e Tomodon dorsatus, espécie da tribo Tachymenini, reconhecidamente especialista em lesmas. Para isto este trabalho está estruturado em duas partes: a primeira refere-se à Introdução geral, onde é apresentada uma ampla abordagem sobre as adaptações morfológicas relacionadas à alimentação dos Dipsadini, assim como as vantagens da utilização da técnica de morfometria geométrica em estudos morfológicos; e a segunda parte refere-se ao trabalho propriamente dito, intitulado “Ecomorfologia de três espécies de Dipsas Laurenti, 1768 e Sibynomorphus Fitzinger, 1843 (Dipsadidae: Dipsadinae)”. / Ecological factors such as the use of the environment and feeding habits may influence the body and cephalic morphology of an organism, however, this can also reflect the phylogenetic lineage. The subfamily Dipsadinae includes South American snakes formed by two clades, one including Geophis and Atractus and another including Dipsas, Ninia, Sibon and Sibynomorphus, which are the tribe Dipsadini. The snakes of this tribe show a high degree of modification in their body and cephalic morphology wich is related to the environment and malacophagous feeding habits. The species of Dipsas and Sibon have specializations related to the use of arboreal environment, offering a better performance in locomotion in the vegetation, while the Sibynomorphus species are mostly adapted to terrestrial environment. Regarding their feeding habits they posses, in varying degrees, a number of changes related to cranial modification and to manipulation and ingestion of gastropods such as slugs and snails. Whereas there is a direct relationship between the shape of the head and the diet, this study aims to analyze the divergences of cephalic morphology between species of diet related to Dipsas and Sibynomorphus, as well as analyze possible convergences between species of these genera and Tomodon dorsatus, species of the tribe Tachymenini, recognized as specialized in slugs. This study is structured in two parts: the first refers to the general introduction, where a broad approach on the morphological adaptations related to feeding habits of Dipsadini, as well as the advantages of the use of geometric morphometry technique in morphological studies; and the second part refers to the work itself, titled "Ecomorphology of three species of Dipsas Laurenti, 1768 and Sibynomorphus Fitzinger, 1843 (Dipsadidae: Dipsadinae)".
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Estruturação morfológica e gênica das populações de Corallus hortulanus (Linnaeus, 1758) (Serpentes, Boidae) ao sul da bacia Amazônica, BrasilDUARTE, Mel de Oliveira January 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014 / Corallus hortulanus é uma espécie conhecida por apresentar grande variação no padrão de coloração e desenho, além de apresentar a maior distribuição geográfica e ecológica dentre as serpentes Neotropicais. O objetivo deste trabalho foi determinar a variação morfológica nos padrões de cor e desenho, verificar se estes padrões estão relacionados à presença dos rios amazônicos, verificar o grau de estruturação genética entre as populações de C. hortulanus ao longo de sua distribuição e verificar se os principais interflúvios ao sul da bacia amazônica representam populações geneticamente estruturadas. Foram analisados as cores e desenhos de 125 espécimes e geradas 103 sequências de Citb e 38 de COI. Um total de seis morfotipos foram descritos para as populações ao sul do Rio Amazonas. Verificou-se que os rios ao sul do Rio Amazonas apresentaram um padrão misto, onde Tocantins, Xingu e Madeira não influenciaram na estruturação genética, enquanto que os rios Purus e Tapajós se apresentaram como barreira geográfica para as populações de C. hortulanus, sendo que apenas em um caso a estruturação é encontrada em todas as análises (Purus). / Corallus hortulanus is a species known to exhibit great variation in color pattern, as well as presenting the greatest geographical and ecological distribution among Neotropical snakes. The aim of this study was to determine the patterns of morphological variation in color and design, verify that these patterns are related to the presence of Amazonian rivers, verify the degree of genetic structure among populations of C. hortulanus throughout its distribution and verify that the major south interfluves of the Amazon basin represent genetically structured populations. For morphologic data were analyzed the color pattern of 125 specimens and for molecular data were generated 103 sequences of COI and 38 of CITB. Six morphotypes were described for populations from south of the Amazon River. It was observed that the rivers of south of the Amazon River showed a mixed pattern, which Tocantins, Xingu and Madeira rivers did not influence the genetic structure, while Purus and Tapajós rivers acted as a geographical barrier for populations of C. hortulanus, and only in one case the genetic structure was found in all analyzes (Purus).
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