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Sinal filogenético e conservação filogenética de nicho : integrando métodos aos conceitos ecológicos

Debastiani, Vanderlei Julio January 2016 (has links)
Compreender os fatores que afetam a distribuição das espécies tem sido um dos principais objetivos dos ecólogos. Atualmente, sabe-se que os processos ecológicos e evolutivos moldam a dinâmica de especiação e extinção de espécies, e determinam a distribuição e abundância das mesmas. Ao longo dos últimos anos, tem havido um aumento no número de estudos que utilizam informação filogenética para explicar as dinâmicas populacionais e as distribuições de espécies, e que buscam identificar os mecanismos responsáveis pela montagem das comunidades. Interações das espécies, sejam elas intraespecífica, interespecífica ou com o ambiente, ocorrem baseadas nas diferenças e semelhanças fenotípicas. Essas variações fenotípicas tem origem na evolução das espécies, e com isso espera-se que as espécies proximamente relacionadas tendam a ser ecologicamente mais semelhantes entre si do que as espécies distantemente relacionadas. Esta concepção tem dado origem a um conceito importante, com implicações para estudos tanto ecológicos quanto evolutivos: o conceito de conservação filogenética de nicho, isto é, quando as espécies relacionadas mantêm seus nichos ancestrais ao longo do tempo evolutivo. Esse padrão tem importância para diversas áreas de ecologia, permitindo a ligação das espécies aos processos ecológicos e auxiliando na maior compreensão da ecologia evolutiva das diferentes linhagens. Devido à sua importância, é fundamental o desenvolvimento de métodos estatísticos adequados para quantificar esses padrões e inferir os processos que o subjazem. Atualmente, os métodos utilizados para inferir conservação filogenética de nicho são, em sua maioria, incompatíveis com determinados conceitos ecológicos e não abrangem todos os tipos de dados e esse fato explica uma visão incompleta dos processos presentes nas comunidades e conflitante com o objetivo de muitos estudos ecológicos e conservacionistas que buscam vincular as espécies aos processos ecológicos e evolutivos. Desta forma, o principal objetivo desta tese é propor novos métodos para quantificar o sinal filogenético que integrem diferentes aspectos do conceito de nicho ecológico. Apresentamos aqui os novos métodos em detalhes e avaliamos suas propriedades estatísticas (erro tipo I e poder estatístico) por meio de dados simulados. No capítulo 1, nós propomos um método para medir sinal filogenético utilizando o teste de Mantel, incorporando modelos evolutivos para testar hipóteses específicas da evolução dos atributos. No capítulo 2, descrevemos um conjunto de funções e um novo pacote estatístico para explorar os padrões filogenéticos no nível de metacomunidade. Este pacote permite explorar a distribuição de linhagens filogenéticas através de gradientes ecológicos, a análise de sinal filogenético no nível da metacomunidade e explorar a associação entre clados e gradientes ecológicos. No capítulo 3, investigamos a relação entre sinal filogenético dos atributos com os padrões de coocorrência das espécies nos níveis da comunidade. Esta abordagem permite testar se espécies filogeneticamente relacionadas que coocorrem expressam as suas dimensões de nicho com maior semelhança do que seria esperado por modelos neutros de evolução. Por fim, testamos as propriedades estatísticas destes métodos em relação dois modelos nulos, que incorporam diferentes aspectos da estrutura da comunidade e evolução dos atributos das espécies. Os três capítulos representam diferentes trabalhos que se interconectam no sentido de elucidar o conceito de sinal filogenético e conservação filogenética de nicho. / Understanding the factors that can affect species distributions has been a main goal of ecologists. Currently, it is known that evolutionary and ecological processes shape the speciation dynamics, species extinction and determine the distribution and abundance of species. Over the last years, there has been an increase in the number of studies using phylogenetic information to explain the dynamics of population, species distribution and identifying the mechanisms of community assembly. Species interactions – intraspecific, interspecific or with the environment – occur based on their phenotypic differences and similarities. As phenotypic variation has a basis in evolutionary history, it is expected that closely related species tend to be more ecologically similar to each other than distantly related ones. This notion has given rise to an important concept, with implications for both evolutionary and ecological studies: the concept of phylogenetic niche conservatism, that is, when related species maintain their ancestral niches over evolutionary time. This pattern is important for several areas of ecology, and allows to link species to ecological processes and to understand the evolutionary ecology of different lineages. Despite its importance, it is crucial the development of appropriate statistical method to measure this pattern and to infer the processes behind it. The methods currently available to infer phylogenetic niche conservatism are sometimes incompatible with some ecological concepts and do not cover all kind of data, this fact leads to an incomplete view of the process acting in the currents communities and conflict with the goal of many ecological and conservation studies that need to link species to ecological and evolutionary processes. The main goal of this dissertation is to propose novel methods to measure phylogenetic signal incorporating different aspects of ecological niche. We introduce novel methods in detail and evaluate its statistical properties (type I error and statistical power) by means of simulated data with known structure. In chapter 1 we propose a method to measure phylogenetic signal using the Mantel test, incorporating evolutionary model to test specific hypothesis of trait evolution. In chapter 2, we describe a set of function and a new statistical package for exploring the phylogenetic patterns at the metacommunity level. This package allows the exploration of distribution of phylogenetic lineages across ecological gradients, the analysis of phylogenetic signal at metacommunity level and to explore the association between clades and ecological gradients. In the chapter 3, we access the relationship between phylogenetic signal in traits and species co-occurrence patterns in the community levels. This approach allows one to test whether phylogenetic close related species cooccurring in metacommunities express their niche dimensions more similarly than would be expected by neutral expectation. We tested the statistical properties of these methods in relation to two null models, which incorporate these different aspects of the community structure and evolution of species traits. The three chapters represent different works that are interconnected in order to elucidate the concept of phylogenetic signal and phylogenetic niche conservatism.
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Cetáceos na costa sudeste do Brasil: ocorrência, distribuição e inferência de nicho / Cetaceans along the Southeastern Brazilian coast: occurrence, distribution and niche inference

Figueiredo, Giovanna Correa e 10 March 2017 (has links)
Para se compreender o papel ecológico dos cetáceos são necessários maiores conhecimentos sobre suas ocorrências e distribuições. A distribuição potencial das espécies pode ser determinada a partir das áreas geográficas de ocorrência dos seus nichos. Estes podem ser definidos com o uso de variáveis ambientais, o que se demonstra uma vantagem por serem estáticas e não serem dinamicamente afetadas pelas atividades biológicas. O presente estudo tem como objetivo determinar a ocorrência e distribuição dos cetáceos ao largo da costa sudeste do Brasil com base em dados de avistagens, bem como delimitar os nichos fundamentais e a sobreposição das áreas de distribuição potencial das espécies avaliadas. Os dados de avistagem foram obtidos por meio de cruzeiros oceanográficos realizados entre 2012 e 2015. Os modelos ecológicos de nicho foram elaborados com o uso das variáveis ambientais disponibilizadas pelo MARSPEC e com o uso do software NicheA. Foram avistadas doze espécies com a realização dos cruzeiros, sendo as seis mais frequentes utilizadas para a determinação das áreas de distribuição potencial. Apesar de apresentarem diferenças quanto às preferências ambientais, a maioria das espécies de cetáceos amostrada apresentou sobreposição parcial de nicho e da área de distribuição potencial. / It is deemed important to understand cetacean occurrence and distribution to comprehend their ecological roles. The geographical occurrence of species\' niche can be used to evaluate their potential distribution. The niche can be defined using environmental variables. Those variables are considered static and are not affected by biological activities. The present study goal is to access the occurrence and distribution of cetaceans along the southeastern Brazilian coast, as well as to define the fundamental niche of the species and the overlap between their potential distribution areas. Sighting data were obtained through oceanographic surveys conducted between 2012 and 2015. The environmental variables available on MARSPEC and the software NicheA were used for the ecological niche modeling. A total of twelve cetacean species were identified during the cruises. The potential distribution areas of the six commonest species were defined. Even though the species presented different environmental preferences, most of them had partial overlap between niches and potential distribution areas.
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Filogeografia a partir de DNA de cloroplasto da orquídea neotropical Epidendrum orchidiflorum (Orchidaceae: Laeliinae) no Brasil / Phylogeography from chloroplast DNA of the Neotropical orchid Epidendrum orchidiflorum (Orchidaceae: Laellinae) in Brazil

Robles Pachon, Adriana Marcela 13 October 2016 (has links)
A filogeografia é o campo de estudo que pode revelar a história evolutiva das espécies, sua diversidade e a estrutura genética atual das populações. Neste estudo, foi avaliada a diversidade genética de 13 populações de Epidendrum orchidiflorum (Orchidaceae) utilizando uma abordagem filogeográfica, na tentativa de reconstruir a história evolutiva desta espécie ao longo da Chapada Diamantina e suas serras próximas, do litoral de Bahia e litoral do Rio de Janeiro.Foram usados como marcadores moleculares regiões de DNA de cloroplasto - cpDNA, as quais por serem de herança materna, natureza não recombinante e se encontrarem abundantemente nas plantas, são ideais para este tipo de estudos. Com os dados obtidos do seqüenciamento de duas regiões de cpDNA (rps16-trnK e rpl32-trnL), foram calculados os índices de diversidade para as 13 localidades amostradas, sendo que o número total de haplótipos foi 12. A diversidade haplotípica (Hd) variou de 0 para a população do Litoral da Bahia, Restinga (RE) a 0,889 para a população de Seabra (SE), próxima da Chapada Diamantina. O haplótipo mais freqüente foi o H2 apresentando-se em nove populações. A população RE só apresentou um haplótipo (H2), enquanto que a população de maior diversidade (SE) apresentou seis haplótipos. Além disso, em três populações (SE, Morro do Chapéu e Arraial do Cabo) foram encontrados haplótipos únicos. A análise de variância molecular (AMOVA) indicou que a diferenciação genética encontrada entre populações (FST = 47,5%) é elevada, mostrando que existem diferenças entre populações para esta espécie. No entanto, a proporção de variabilidade de haplótipos encontrados dentro das populações (52,5%, P<0,001) foi maior do que entre as populações.As análises geradas para diferentes agrupamentos testados nas AMOVAS e no programa Migrate-n, sugerem que o melhor modelo que explicaria a conectividade entre as populações seria o modelo de uma grande população panmítica que reúne as populações das serras (JA, PD, RU, MC, CD, SA, LE, CF, MU, PI e SE) com migração para as populações do litoral da Bahia (RE) e a população do Rio de Janeiro (AC). Estas análises são suportadas pelas análises geradas da Modelagem de Nicho Ecológico (EEM), indicando que as populações próximas a Chapada Diamantina se encontram conectadas desde a interglaciação e a última glaciação, porém a população do Rio de Janeiro foi separada durante a ultima glaciação, permanecendo isolada, divergindo ao longo do tempo devido à deriva genética e à mutação. / Phylogeography is the field of study that may reveal the evolutionary history of the species, their diversity and the current genetic structure of populations. In this study, we evaluated the genetic diversity of 13 populations of Epidendrum orchidiflorum (Orchidaceae ) using a phylogeographic approach in an attempt to reconstruct the evolutionary history of this species along the Chapada Diamantina and its nearby sierras, the Bahia coastline and the Rio de Janeiro coastline. We used as molecular markers chloroplast DNA regions - cpDNA, which are maternally inherited, non-recombinant and found abundantly in plants, and for these reasons are ideal for this type of studies. With the data obtained from the sequencing of two regions of cpDNA(rps16-trnK and rpl32-trnL), the diversity index for the 13 sampled locations were calculated, and the total number of haplotypes was 12.The haplotype diversity (Hd) ranged from 0.0 for the Coastal population of Bahia, Restinga (RE) to 0.889 for the population of Seabra (SE), near the Chapada Diamantina. The most common haplotype was the H2 found in nine populations. The RE population showed only one haplotype (H2), while the population of greater diversity (SE) showed six haplotypes. Moreover, in three populations (SE, Morro do Chapéu and Arraial do Cabo) unique haplotypes were found. The analysis of molecular variance (AMOVA) showed that the genetic difference found between populations (FST = 47.5%) is high, showing that there are differences between populations for this species. However, the proportion of haplotypes variability found within populations (52.5%, P <0.001) was higher than among populations. The analyses generated for different groups tested in AMOVAS and in the Migrate-n program suggest that the best model to explain the connectivity between populations would be the model of a large panmitic population that brings together the populations of the Sierras (JA, PD, RU, MC, CD, SA, LE, CF, MU, PI and SE) with migration towards the populations of the coast of Bahia (RE) and the population of Rio de Janeiro (AC). These analyses are supported by the analyses generated by the Ecological Niche Modeling (EEM), indicating that the populations near the Chapada Diamantina are connected since the interglacial and the last glaciation, but the population of Rio de Janeiro was separated during the last glaciation, remaining isolated and diverged over time due to genetic drift and mutations.
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Recursos alimentares e local de forrageio de três espécies de Helicops wagler, 1830 (Serpentes: Dipsadidae) na Amazônia Oriental, Brasil / Food resources and foraging place of three species of Helicops wagler 1830 (Serpentes: Dipsadidae) in Eastern Amazonia, Brazil

TEIXEIRA, Cássia de Carvalho January 2012 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-02-18T21:40:41Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_RecursosAlimentaresLocal.pdf: 787135 bytes, checksum: 0596792fdc536afe0541ed8394175217 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-02-21T15:01:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_RecursosAlimentaresLocal.pdf: 787135 bytes, checksum: 0596792fdc536afe0541ed8394175217 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-02-21T15:01:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_RecursosAlimentaresLocal.pdf: 787135 bytes, checksum: 0596792fdc536afe0541ed8394175217 (MD5) Previous issue date: 2012 / Espécies filogeneticamente aparentadas, que coexistem no ambiente com semelhanças na utilização dos recursos, são potencialmente competidoras. Assim, espera-se que apresentem diferenciação em algum dos principais eixos do nicho ecológico. Helicops angulatus, H. hagmanni e H. polylepis são cobras d’água abundantes no estado do Pará, Amazônia Oriental, e podem ser sintópicas, o que sugere que estas espécies apresentem alguma variação na dieta ou no local de forrageio. Esse estudo teve o objetivo de verificar variações na composição da dieta, a amplitude e sobreposição de nicho trófico, bem como variações no local de forrageio, baseadas em características ecomorfológicas dos peixes consumidos por três espécies de cobras d’água na Amazônia Oriental, Pará. Verificamos que a dieta das três espécies de Helicops é semelhante, contudo, as proporções em que os itens são consumidos diferem. Helicops angulatus é a espécie mais generalista e H. hagmanni a mais especialista, e a sobreposição alimentar entre as três espécies foi intermediária. De acordo com os dados ecomorfológicos dos peixes consumidos por H. angulatus, H. hagmanni e H. polylepis pôde-se concluir que estas espécies forrageiam os mesmos ambientes em meio aquático, principalmente microhábitats de águas lênticas nos estratos médio e superior da coluna d’água. A coexistência dessas espécies pode estar sendo favorecida pela abundância dos recursos consumidos. / Close related species that coexist in the same environment with similarities in the use of resources are potentially competitors. Therefore, it is expected that they present differentiation in some of the main axes of their ecological niche. Helicops angulatus, H. hagmanni and H. polylepis are abundant species found in the state of Pará, Eastern Amazonia, and they are sintopic sometimes, what suggests that these species present some variation in their diet or in the foraging place. This work aimed to verify variations in the composition of the diet, the width and overlap of food niche, as well as variations in the foraging place, based on ecomorphological characteristics of the consumed fishes of three species of the genus Helicops in the Eastern Amazonia, Pará state. We verified that the three species of snake possess similar diet composition, however, the proportions in that the items are consumed differ between them. Helicops angulatus is the most generalist species and H. hagmanni the most specialist. The food niche overlap between the three species was intermediate. In agreement with ecomorphological data of the fishes consumed by H. angulatus, H. hagmanni and H. polylepis, it can be concluded that these species forage in the same place, that would be the medium and superior strata of the water column, especially in the lentic waters of the margins. The coexistence of those species can be favored by the abundance of the consumed resources.
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Distribuição potencial e atual do tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla) e indicação de áreas prioritárias para sua conservação / Potential and current distribution of giant anteater (Myrmecophaga tridactyla) and identification of priority areas for its conservation

Roberto, Vinicius Alberici 11 December 2017 (has links)
O tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla) se distribui amplamente ao longo da região Neotropical, porém é provável que esteja extinto da maior parte de sua extensão original, notadamente na América Central e nos limites austrais de sua distribuição. O táxon está ameaçado de extinção globalmente (IUCN) e também em âmbito nacional. Embora historicamente a espécie ocorra em todos os biomas brasileiros, hoje é considerada extinta nos Pampas, quase extinta na Mata Atlântica, sendo que na Caatinga sua presença necessita de confirmação e no Cerrado suas populações vem sofrendo drásticas reduções. Atualmente não há estudos de revisão da distribuição da espécie nos biomas brasileiros, tão pouco foi avaliado se as áreas mais adequadas à espécie estão sendo protegidas e o conhecimento existente é insuficiente para adotar estratégias de conservação adequadas. Dessa maneira, o presente estudo teve como principal objetivo modelar a distribuição potencial e atual do tamanduá-bandeira no Brasil e nos biomas brasileiros, a fim de identificar quais variáveis preditoras melhor explicam a ocorrência da espécie em diferentes escalas. Além disso, a partir dos modelos de distribuição atual, os biomas foram avaliados quanto à adequabilidade ambiental (i.e. probabilidade de presença) e foram realizadas uma análise de lacunas e a identificação de áreas prioritárias para a conservação. A distribuição potencial do tamanduá-bandeira foi melhor explicada em escala continental, por variáveis bioclimáticas (sazonalidade de temperatura e precipitação) e topográficas (altitude), enquanto que a distribuição atual foi bem explicada nas duas escalas, por variáveis de uso e cobertura da terra (porcentagens de cobertura arbórea, de silvicultura e de cana-de-açúcar). O Cerrado foi o bioma de maior adequabilidade ambiental à espécie, seguido da Amazônia, Pantanal, Mata Atlântica e Caatinga, sendo que não foram obtidos registros recentes para os Pampas. Menos de 10% da distribuição atual do tamanduá-bandeira no Cerrado e Pantanal encontra-se protegida por Unidades de Conservação, existindo uma lacuna parcial de conservação. Áreas prioritárias para a espécie incluem um corredor central no Cerrado, grande parte do Pantanal e áreas de transição (ecótonos) com outros biomas. Os resultados obtidos neste estudo permitiram preencher lacunas de conhecimento acerca da distribuição do tamanduá-bandeira, bem como dar suporte para o planejamento de sua conservação. / The giant anteater (Myrmecophaga tridactyla) is widely distributed throughout the Neotropical region, but is probably extinct from most of its range, notably in Central America and the southern limits of its distribution. The species is listed as Vulnerable on the IUCN and national Red Lists. Although historically present in all Brazilian biomes, there are no studies reviewing its distribution, nor has it been evaluated if the Brazilian federal conservation units are protecting the areas most suitable to the species. Thus, the aim of this study was to model the potential and current distribution of the giant anteater in Brazil and Brazilian biomes, to identify which predictor variables best explain the occurrence of the species at different scales. Current distribution models were used to evaluate the biomes environmental suitability (i.e. probability of presence) and a gap analyses were performed. Also, priority areas for conservation were identified. The potential distribution of the anteater was better explained on a continental scale by bioclimatic (seasonality of temperature and precipitation) and topographic (altitude) variables, while the current distribution was well predicted in both scales, by land cover variables (percentages of tree cover, silviculture, and sugarcane). The Cerrado was the biome of greater environmental suitability to the species, followed by the Amazon, the Pantanal, the Atlantic Forest and the Caatinga. No recent records were obtained for the Pampas. Conservation units protect less than 10% of the current distribution of the giant anteater in the Cerrado and Pantanal. Priority areas for the species include a central corridor in the Cerrado, much of the Pantanal and ecotones. The results obtained in this study helped to fill knowledge gaps on the distribution of the giant anteater in Brazil, supporting actions for its conservation.
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Influência da salinidade na distribuição e dieta da ictiofauna em um estuário hipersalino

Sales, Natalice dos Santos 24 February 2015 (has links)
Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2016-02-29T13:53:28Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) PDF - Natalice dos Santos Sales.pdf: 3971336 bytes, checksum: 5c5a0633dc255180a572d2b151d73426 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2016-06-13T20:31:10Z (GMT) No. of bitstreams: 2 PDF - Natalice dos Santos Sales.pdf: 3971336 bytes, checksum: 5c5a0633dc255180a572d2b151d73426 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-13T20:31:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 PDF - Natalice dos Santos Sales.pdf: 3971336 bytes, checksum: 5c5a0633dc255180a572d2b151d73426 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Hypersaline estuarine systems the fish species move between areas of greater supply of resources and according to salinity gradient, because the physiological tolerance is a common adaptation to many species of estuarine fish. Moreover, those species can display other behavioral adaptations, such as food flexibility. Thus, this study analized structure and composition of the ichthyofauna in accordance with the salinity gradients as well as ecology and trophic organization. Samples were collected in rainy and dry season, from January to Decembre 2012, in 12 points distributed into three areas defined according to the salinity gradient (Inferior, Intermediate and Upper). The fishes were captured using a beach seine. The low rainfall, high evaporation rate and the small input of freshwater in Tubarão River estuary favored a salinity between 30 and 45. The structure and composition of ichthyofauna showed spatial and temporal differences between the Tubarão River estuary areas, with salinity and substrate influencing the distribution of species. Atherinella brasiliensis, Lile piquitinga, Eucinostomus argenteus, Ulaema lefroyi, Lutjanus analis and Sphoeroides greeleyi are the most abundant distributed in all the estuarine areas. Among the 104 species caught at the estuary of Tubarão River, 18 were selected according to their abundance, for analysis of trophic ecology. However, only the spacial variation showed significant changes in fish diet. In general, the diet of the species was based mainly on Macroalgae, Polychaeta, Decapoda, Mollusca and Zooplankton. Among these items the representatives of Zooplankton are the main prey in the diet of small juveniles. Because of this preference for certain food items species were grouped into six different trophic guilds: Zooplanktivore, Omnivore, Herbivore-Macroalgae, Zoobenthivore- Hyperbenthos, Zoobenthivore-Epifauna and Zoobenthivore-Infauna. The largest overlap values occured in the Upper zone, due to a higher salinity restricting the establishment of various prey. The results presented in this study showed the direct relationship of the structure and composition of ichthyofauna and the trophic ecology with habitat heterogeneity and the variation in salinity. Thus, the data obtained in the study allows our understanding of the dynamics of community structure that hypersaline system and favors the development of approaches to conservation and sustainable use of biological diversity. / Nos sistemas estuarinos hipersalinos as espécies de peixes se movimentam entre os locais de maior oferta de recursos e entre os diferentes gradientes de salinidade, de acordo com a tolerância fisiológica que é uma adaptação comum para espécies de peixes estuarinos. Além disso, estas espécies podem exibir outras adaptações comportamentais, como a flexibilidade alimentar. Assim, o estudo analisou a estrutura e composição da ictiofauna de acordo com o gradiente de salinidade, bem como a ecologia e a organização trófica. As amostragens foram realizadas durante a chuva e a seca de 2012 em 12 pontos distribuídos em três zonas definidas de acordo com o gradiente de salinidade (Inferior, Intermediária e Superior). Os peixes foram capturados com a utilização de uma rede beach seine através de arrasto de praia. O baixo índice pluviométrico, a elevada taxa de evaporação e a pequena entrada de água doce presentes no estuário do Rio Tubarão favoreceram uma salinidade entre 30 e 45. A estrutura e composição da ictiofauna apresentaram diferenças espacial e temporal entre as zonas do estuário do rio Tubarão, com a salinidade e o substrato influenciando na distribuição das espécies Atherinella brasiliensis, Lile piquitinga, Eucinostomus argenteus, Ulaema lefroyi, Lutjanus analis and Sphoeroides greeleyi Dentre as 104 espécies capturadas no estuário do Rio Tubarão 18 foram selecionadas, de acordo com sua abundância, para análise da ecologia trófica. No geral a dieta das espécies foi baseada, principalmente, em Macroalgas, Polychaeta, Decapoda, Mollusca e Zooplâncton. Dentre esses itens os representantes do Zooplâncton são as presas principais na dieta dos pequenos juvenis. Devido a essa preferência por determinados itens alimentares as espécies foram agrupadas em seis guildas tróficas, distintas: Zooplanctívoro, Onívoro. HerbívoroMacroalga, Zoobentívoro-Hiperbentos, Zoobentívoro-Epifauna e Zoobentívoro-Infauna. Os maiores valores de sobreposição foram registrados na zona Superior, possivelmente pela elevada salinidade que restringe o estabelecimento de diversas presas. Em geral os resultados apresentados nesse estudo mostram a relação direta da estrutura e composição da ictiofauna e a ecologia trófica das espécies com a heterogeneidade do habitat e a variação de salinidade que possibilita proteção aos peixes juvenis e maior abundância de recursos tróficos. Assim, os dados obtidos no estudo possibilita a compreensão da dinâmica da estrutura da comunidade desse sistema hipersalino, bem como favorece o desenvolvimento de abordagens para a conservação e uso sustentável da diversidade biológica.
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Cetáceos na costa sudeste do Brasil: ocorrência, distribuição e inferência de nicho / Cetaceans along the Southeastern Brazilian coast: occurrence, distribution and niche inference

Giovanna Correa e Figueiredo 10 March 2017 (has links)
Para se compreender o papel ecológico dos cetáceos são necessários maiores conhecimentos sobre suas ocorrências e distribuições. A distribuição potencial das espécies pode ser determinada a partir das áreas geográficas de ocorrência dos seus nichos. Estes podem ser definidos com o uso de variáveis ambientais, o que se demonstra uma vantagem por serem estáticas e não serem dinamicamente afetadas pelas atividades biológicas. O presente estudo tem como objetivo determinar a ocorrência e distribuição dos cetáceos ao largo da costa sudeste do Brasil com base em dados de avistagens, bem como delimitar os nichos fundamentais e a sobreposição das áreas de distribuição potencial das espécies avaliadas. Os dados de avistagem foram obtidos por meio de cruzeiros oceanográficos realizados entre 2012 e 2015. Os modelos ecológicos de nicho foram elaborados com o uso das variáveis ambientais disponibilizadas pelo MARSPEC e com o uso do software NicheA. Foram avistadas doze espécies com a realização dos cruzeiros, sendo as seis mais frequentes utilizadas para a determinação das áreas de distribuição potencial. Apesar de apresentarem diferenças quanto às preferências ambientais, a maioria das espécies de cetáceos amostrada apresentou sobreposição parcial de nicho e da área de distribuição potencial. / It is deemed important to understand cetacean occurrence and distribution to comprehend their ecological roles. The geographical occurrence of species\' niche can be used to evaluate their potential distribution. The niche can be defined using environmental variables. Those variables are considered static and are not affected by biological activities. The present study goal is to access the occurrence and distribution of cetaceans along the southeastern Brazilian coast, as well as to define the fundamental niche of the species and the overlap between their potential distribution areas. Sighting data were obtained through oceanographic surveys conducted between 2012 and 2015. The environmental variables available on MARSPEC and the software NicheA were used for the ecological niche modeling. A total of twelve cetacean species were identified during the cruises. The potential distribution areas of the six commonest species were defined. Even though the species presented different environmental preferences, most of them had partial overlap between niches and potential distribution areas.
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Conservação de mamíferos no cerrado e em Goiás / Conservation biogeography of bats in the Brasilia cerrado

Barreto, Bruno de Souza 19 December 2012 (has links)
Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2014-10-10T21:20:05Z No. of bitstreams: 2 Tese - Bruno de souza Barreto - 2012.pdf: 2817636 bytes, checksum: 84c30327e24d85125e1faf1207b4bb14 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-10-13T20:46:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Bruno de souza Barreto - 2012.pdf: 2817636 bytes, checksum: 84c30327e24d85125e1faf1207b4bb14 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-13T20:46:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Bruno de souza Barreto - 2012.pdf: 2817636 bytes, checksum: 84c30327e24d85125e1faf1207b4bb14 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-12-19 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Increasingly biodiversity has lost diversity around the globe because of the way the human population have used natural resources. To reduce the impacts caused by human activity, conservation units (CU) have been created to ensure the maintenance of biodiversity. However, many conservation units were not established following scientific criteria and its efficiency can therefore be questioned. In this study we tried to evaluate the efficiency of conservation of the Cerrado based on species richness and beta diversity of mammals currently and in accord to climate change expected for 2080. We show through gap analyzes that species are represented in the current system both in the current climate and in the future. However, they have become rarer within CUs with climate change. We show that CUs do not capture a greater diversity than expected by chance. It is expected a larger number of species within the CUs in 2080, however, the number of species outside them will also be greater. As for beta diversity, there will be a reduction of the index in 2080 and both outside and within the UCs expected on average the same value. Climate change became UC’s Cerrado more inefficient, there will be an increase in the number of threatened species because of climate change interfering in the spatial arrangement of species on the Cerrado. This draws attention to the evaluation of systems of protected areas consider the spatial-temporal dynamics of the species. / Cada vez mais a biodiversidade tem perdido diversidade ao redor do planeta em razão do modo como a população humana têm utilizado os recursos naturais. Para reduzir os impactos causados pela atividade humana, unidades de conservação (UC) têm sido criadas para garantir a manutenção da biodiversidade. Contudo, muitas unidades de conservação criadas não seguem critérios científicos e sua eficiência pode ser, portanto, questionada. No presente trabalho buscou-se avaliar a eficiência das unidades de conservação do Cerrado com base na riqueza de espécies e a diversidade beta dos mamíferos atualmente e em consonância com as mudanças climáticas esperadas para 2080. Nós mostramos por meio de análises de lacunas, as espécies estão representadas no atual sistema tanto no clima atual quanto no futuro. Contudo, elas tornaram-se mais raras dentro das UC’s com as mudanças climáticas. Mostramos que as UC’s não capturam uma diversidade maior que o esperado ao acaso. Espera-se um número maior de espécies dentro das UC’s em 2080, contudo, o número de espécies fora delas será também maior. Quanto a diversidade beta, haverá uma redução do índice em 2080 e tanto fora das UC’s quanto dentro espera-se, em média o mesmo valor. As mudanças climáticas tornaram as UC’s do Cerrado mais ineficientes, haverá um aumento do número de espécies ameaçadas em razão das mudanças climáticas interferirem no arranjo espacial das espécies sobre o Cerrado. Isto chama a atenção para a avaliação de sistemas de unidades de conservação considerem a dinâmica espaço-temporal das espécies.
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Células-tronco mesenquimais: isolamento e caracterização de populações derivadas de alvéolo dental humano e identificação e caracterização de populações de polpas dentais de camundongos / Mesenchymal stem cells: Isolation and characterization of populations derived from human dental alveolus and identification and characterization of populations from mouse dental pulp

Lucyene Miguita Luiz 29 November 2013 (has links)
Há um grande interesse no estudo de células-tronco em função de sua capacidade de auto-renovação e plasticidade. Estas características capacitam as células-tronco a produzirem células de diferentes linhagens que participam ativamente do processo de homeostase, da resposta à injúria e da regeneração e reparação tecidual. A polpa dental é o tecido mais estudado na Odontologia em relação a células-tronco, mas diversos estudos já mostraram a presença dessas células também na região periodontal. É importante salientar, que dependendo de sua origem, as células-tronco apresentam comportamentos diversos, especialmente no que tange ao transplante in vivo. Além disso, os microambientes onde as células-tronco residem (nichos), têm um papel fundamental no comportamento das mesmas, pois controlam aspectos essenciais como o estado de indiferenciação e a auto-renovação. Esse projeto de pesquisa teve como objetivos duas análises distintas. Na primeira, verificar se existem células-tronco mesenquimais derivadas da curetagem do alvéolo dental humano após extrações dentais. Na segunda, analisar o nicho de células-tronco nas polpas dentais de camundongos. Em comum, as duas análises se basearam no uso de marcadores previamente utilizados na literatura para o estudo de células-tronco. Como não existem marcadores únicos e específicos para a identificação dessas células, diferentes combinações desses marcadores entre si e de técnicas laboratoriais foram empregadas. No primeiro estudo, após o isolamento das células, deu-se especial atenção à sua caracterização, que foi realizada através de ensaios que avaliaram propriedades e comportamentos que sabidamente ocorrem em células-tronco. Já na segunda parte desse estudo, utilizamos a polpa dental de camundongos para a análise in vivo de nichos. Em camundongos, a localização do nicho responsável pelo crescimento continuo dos incisivos é conhecida. De uma maneira geral, nossos resultados demonstram que: 1) É possível isolar células-tronco/progenitoras a partir de tecidos curetados de alvéolo dental após extrações dentárias. Esse fato é inédito e abre novas perspectivas em termos de oportunidade de coleta e futura aplicação clínica. 2) É possível observar a diversidade populacional nas células que formam o nicho de células-tronco em polpa dental de camundongos, e através de uma organização hierárquica, propusemos um modelo para este nicho. Esse modelo servirá de base para estudos subsequentes que visem avaliar o comportamento das células que formam o nicho, quando isoladas das demais, e abrirá possibilidade para análises em outros tecidos dentais e não dentais. / There is great interest in the study of stem cells due to their ability to produce mature cells of different lineages that participate actively in the process of homeostasis, injury response, regeneration and tissue repair. The dental pulp is the most studied tissue in dentistry, but several studies have shown the presence of these cells in the periodontal tissue region. It is important to note that depending on their origin, these cells exhibit different behaviours, especially in regard to in vivo transplantation. Furthermore, the microenvironment in which these cells are found (niches) have an essential role in their behaviour as they control important aspects such as differentiation and self-renewal. This research project aimed for two distinct analyses. The first was to verify if there are mesenchymal stem cells derived from human dental socket curettage after dental extractions. The second, to analyse the stem cell niche in mouse dental pulp. In common, the two analyses were based on the use of markers previously used in the literature for the study of stem cells. As there are no specific and unique markers to identify these cells, an extensive combination of these markers among themselves, and laboratory techniques were performed. In the first study, after the isolation of the cells, special attention was given to their characterization by combining assays to evaluate stem cells properties and behaviours. In the second part of this study, we used the mouse dental pulp model for in vivo analysis of stem cell niches. In mice, the location of the niche responsible for the incisors continuous growth is known. In general our results showed that: 1) It is possible to isolate progenitor/stem cells from tissue curettage of the alveolus after tooth extractions. This fact is unprecedented and opens new perspectives for the obtention of stem cells for future clinical applications. 2) It is possible to observe the cells population diversity of the mouse dental pulp niche and through a hierarchical organization, we proposed a model for this niche. This model will provide basis for further studies aimed at evaluating the behavior of cells that form the niche, when isolated from the others, and opens the possibility for the analysis of the niche structure in other dental and non-dental tissues.
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Relações interpessoais na interação midiática: recursos de envolvimento na constituição de práticas discursivas de conselho em revistas de nicho / Interpersonal relations in the mediatic interaction: resources of involvement in the constitution of discursive practice of counselling in niche magazines

Rafaela Baracat Ribeiro Rodrigues 03 November 2016 (has links)
Nesta pesquisa, temos por objeto de estudo o envolvimento interpessoal. Buscamos descrever um conjunto de opções linguísticas que constitui uma atividade interativa e que tenham por finalidade gerenciar o contato com o leitor. Nosso objetivo é analisar o papel do envolvimento e delinear sua rede de recursos na construção das relações interpessoais. Para tanto, investigamos textos produzidos no âmbito da interação midiática, em particular em revistas de nicho, uma vez que favorecem a particularidade da relação com o público alvo, empregando em suas publicações estratégias para criar afinidade e identificação com o mercado consumidor, além de investir na atratividade dos textos. Selecionamos como corpus um espaço interativo composto por cartas de leitores e respostas das revistas às perguntas enviadas no caso, por homens adultos, mulheres adultas e mulheres adolescentes , que constituem os textos das seções Pergunte à Vizinha e Pergunte ao Beto, o Barman (revista Mens Health), Pergunte ao Amigo Gay e Pergunte ao Vizinho (revista Womens Health) e Arrasa! Ficadas e rolos (revista Atrevida). Por oferecer soluções sucintas para situaçõesproblema do cotidiano, tais seções caracterizam-se como prática discursiva de aconselhamento, e, para analisá-las, respaldamo-nos na abordagem sistêmico-funcional, com foco na metafunção interpessoal, a fim de depreender os recursos responsáveis pela construção do envolvimento, complementando com estudos a respeito do que ocorre na dinâmica da interação, para verificar de que maneira são efetivados a solidariedade e o estreitamento dos vínculos entre revista de nicho e leitor. Particularmente, fundamentamo-nos na concepção e nas categorias propostas por Gonçalves Segundo (2011), e, em diálogo com essa perspectiva, a partir da análise do corpus, pudemos ampliar a rede de opções linguísticas que constroem vínculos e buscam atrair a atenção dos leitores. Os resultados da investigação apontam variadas opções paradigmáticas que desempenham a função de tracionar e atrair o leitor e que formam a rede de envolvimento, bem como revelam o papel de relevância dos recursos dessa rede na prática de conselhos em revistas de nicho, por possibilitar que efeitos de empatia sejam neles insculpidos, sinalizando padrões interpessoais que enfatizam o gerenciamento interativo. / This research aims to study the interpersonal involvement. We seek to describe a set of linguistic options that constitutes an interactive activity and whose purpose is to manage the contact with the reader. Our objective is analyzing the role of involvement and delineating its network resources in the construction of interpersonal relations. To this end, we investigate texts produced within a mediatic interaction approach, specifically in Brazilian niche magazines, in view of the fact that they foster the relation with the targeted public, embracing in their publications strategies to promote bonding and identification with the consumer market, besides investing in attractiveness of the texts. We have selected as corpus an interactive space formed by letters from readers and replies from the magazines to the questions sent by adult men and women, and teenage girls, which compound the texts of the sections Pergunte à Vizinha and Pergunte ao Beto, o Barman (Mens Health), Pergunte ao Amigo Gay and Pergunte ao Vizinho (Womens Health) and Arrasa! Ficadas e rolos (Atrevida). Since they offer simple solutions for daily-basis problems, those sections are characterized as discursive practice of counselling, and, in order to analyze them we employed the systemic functional approach, focusing on interpersonal metafunction, so as to understand the responsible resources in the construction of involvement, adding studies regarding the dynamics of interaction in order that it is possible to verify solidarity and interpersonal bonds between niche magazine and the reader. Particularly, we are based on the conception and categories proposed by Gonçalves Segundo (2011), and, in dialogue with this perspective, from the analysis of the corpus, it was possible to extend the network linguistic options that build bonds and seek to attract the attention of readers. The results of the investigation suggest a varied number of paradigmatic options which perform the function of traction and attract the reader, build an involvement network, as well as reveal the role of relevance of these network resources in the practice of counselling in niche magazines due to the allowance-insertion of empathy effects, signaling to interpersonal patterns which emphasize the interaction management.

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