Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Distribuicao espacial do percevejo do colmo.pdf: 2200998 bytes, checksum: 96ba2e406bd13f5eab8e639d97bddb15 (MD5) Previous issue date: 2012-11-09 / The injury imposed by Tibraca limbativentris Stål in plants of rice can negatively affect the production and reduce grain yield. Knowing the spatial arrangement of this species allows fast and accurate sampling and identifies focuses of infestation determining the ideal moment of decision-making for the control. The aim of this study was to investigate the spatial and probabilistic distribution of adults and nymphs of T. limbativentris in irrigated rice. Fifteen fields with plants of 50-80 days after emergency were sampled on approximately regular grids in 2008, 2010, and 2011. Poisson and Negative binomial distributions were tested and Pearson chi-squared test was used to determine a probability distribution with the best fit. Polynomial regressions of the number of individuals versus geographical coordinates were used to try detecting trends related with macroscale. Later, semivariograms were used to interpret the spatial dependence and distribution of insects. The semivariance of the samples obtained with nymphs showed patterns grouped in 13% of fields sampled. Similar pattern was also obtained by semivariograms of adults in 26% of fields sampled. However, there were no spatial dependence in the most of the sampled fields with adults (74%) and nymphs (87%). In conclusion, adults and nymphs of T. limbativentris are randomly distributed in irrigated rice fields, though rarely clustered pattern can occur. The probability distribution that best fits the data sampling is the Negative binomial. Adults and nymphs do not inhabit the same local in the rice field. Population levels above the value of economic damage may occur, but individuals are not present in about 2/3 of the units sampled. Polynomial regression models tested are not appropriate to fit the trends related to macro-scale in irrigated rice fields. / A injúria imposta por Tibraca limbativentris Stål às plantas de arroz pode inviabilizar a produção e reduzir o rendimento de grãos. Conhecer o arranjo espacial desta espécie permite que amostragens rápidas e precisas identifiquem focos de infestação e se determine o momento ideal de tomada de decisão para o controle. O objetivo desse trabalho foi verificar a distribuição espacial e probabilística de adultos e ninfas de T. limbativentris em arroz irrigado. Quinze campos com plantas de 50-80 dias de emergência foram amostrados em grades aproximadamente regulares durante as safras 2008, 2010 e 2011. A distribuição Poisson e Binomial negativa foram ajustadas e o teste de qui-quadrado de Pearson foi utilizado para verificar a distribuição probabilística de melhor ajuste. Regressões polinomiais do número de indivíduos em função das coordenadas geográficas foram utilizadas na tentativa de detectar tendências de macroescala. Posteriormente, semivariogramas foram utilizados para interpretar a dependência espacial e distribuição dos insetos. As semivariâncias obtidas das amostragens com ninfas indicaram padrão agregado em 13% dos campos amostrados. Padrão semelhante também foi obtido pelos semivariogramas de adultos em 26% dos campos amostrados. No entanto, houve ausência de dependência espacial na maior parte dos campos amostrados com adultos (74%) e ninfas (87%). Compreende-se então que adultos e ninfas de T. limbativentris se distribuem aleatoriamente pelos campos de arroz irrigado, embora, raramente, ocorram padrões agregados. A distribuição de probabilidade que melhor se ajusta aos dados de amostragem é a Binomial negativa. Os adultos e ninfas não ocupam os mesmos locais da lavoura. Níveis populacionais acima do valor de dano econômico podem ocorrer, mas os indivíduos não estão presentes em cerca de 2/3 das unidades amostradas. Os modelos de regressões polinomiais testados não são indicados para ajustar as tendências de macroescala em campos de arroz irrigado.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-11-08T10:14:33Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nara Cristina Teixeira - 2016.pdf: 2553556 bytes, checksum: 4d26487aa9084ba304be81c862eb3ec0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-11-08T10:14:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nara Cristina Teixeira - 2016.pdf: 2553556 bytes, checksum: 4d26487aa9084ba304be81c862eb3ec0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-08T10:14:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nara Cristina Teixeira - 2016.pdf: 2553556 bytes, checksum: 4d26487aa9084ba304be81c862eb3ec0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Considered the most destructive disease of rice (Oryza sativa), the blast caused by the fungus M. oryzae is of concern worldwide. Because the pathogen staying power in the soil and crop residues for long and indeterminate periods is essential monitoring before the pathogen's entry into new areas, due to the commitment of nearby plantations. The seeds are considered the main ways of spread of disease due to storage, transportation and introduction into harmless areas. The methodology currently recommended by the Ministry of Agriculture for fungi monitoring seed is the "Blotter test", however, the morphological characterization can often be uncertain due to the rapid growth of fungal invasion and the similarity between structures of some pathogens. Morphologically M. oryzae can be indistinguishable from some species, such as the causal agent of rice blast wheat and other grasses therefore the most adequate way for safe diagnosis is the molecular detection. In seeds percentage infestation is often low, which is nevertheless important because the seed of transmission capacity for the seedling, however small conidia concentrations may be insufficient for the molecular detection by techniques potentially used as PCR (Polymerase Chain Reaction). Technically a methodology for molecular amplification isothermal LAMP (Loop- Mediated Isothermal Amplification) simpler recently been developed, which allows to safely identify the target, due to the projection of specific primers based on exclusive regions of the genome of the organism. The technique has advantages as high sensitivity due to the recognition by the initiators of six regions of the target, in addition to specificity, speed and security in the diagnosis. It is important to consider the cost reduction compared with PCR, due to use of constant temperature and straightforward interpretation of results using turbidity generated in positive samples or color change if the addition of dyes, eliminating the use of devices, specialized professionals in handling high standard laboratories. The interpretation the results with the naked eye makes the seed control in environments such as laboratories, warehouses, cooperatives with minimal structure, reflecting positively on the proper targeting of lots, either for planting, consumption or disposal. Therefore, the aim of this study was to survey the main potentially destructive pathogenic fungi found in seeds, and develop a rapid detection kit by LAMP methodology for M. oryzae. / Considerada a doença mais destrutiva do arroz (Oryza sativa), a Brusone, causada pelo fungo Magnaporthe. oryzae é motivo de preocupação no mundo todo. Devido a capacidade de permanência do patógeno no solo e em restos culturais por longos e indeterminados períodos é essencial o monitoramento perante a entrada do patógeno em novas áreas, em razão do comprometimento dos próximos plantios. As sementes são consideradas as principais formas de disseminação da doença devido à capacidade de armazenamento, transporte e introdução em áreas indenes. A metodologia atualmente recomendada pelo Ministério da Agricultura para monitoramento de fungos em sementes é o “Blotter test”, entretanto, a caracterização morfológicapode muitas vezes ser incerta devido à invasão de fungos de crescimento rápido e a semelhança entre estruturas de alguns patógenos. Morfologicamente M. oryzae pode ser indistinguível de algumas espécies, como é o caso do agente causal da brusone de diversas gramíneas, portanto, a maneira mais adequada para diagnose segura é a detecção molecular. Em sementes, a porcentagem de infestação muitas vezes é baixa, o que não deixa de ser importante devido a capacidade de transmissibilidade da semente para a plântula, no entanto as pequenas concentrações de conídios podem ser insuficientes para a detecção molecular, por meio de técnicas potencialmente utilizadas como a PCR (Reação Polimerase em Cadeia). Tecnicamente mais simples, recentemente foi desenvolvida uma metodologia de amplificação molecular isotérmica LAMP (Loop-Mediated Isothermal Amplification), que permite identificar de forma segura o alvo, em decorrência da projeção de iniciadores específicos, baseados em regiões exclusivas do genoma do organismo. A técnica apresenta vantagens como, alta sensibilidade devido ao reconhecimento pelos iniciadores de seis regiões do alvo, além da especificidade, agilidade e segurança no diagnostico. È importante considerar a redução de custos em comparação com a PCR, devido ao uso de temperaturas constantes, e interpretação direta dos resultados por meio da turbidez gerada em amostras positivas, ou mudança de coloração no caso da adição de corantes, dispensando o uso de aparelhos, profissionais especializados e manuseio em laboratórios de alto padrão. A intepretação dos resultados a olhos nus facilita o controle de sementes em ambientes como laboratórios, armazéns, cooperativas com estrutura mínima, refletindo positivamente sobre o direcionamento adequado de lotes, seja para o plantio, consumo ou descarte. Portanto, o objetivo deste trabalho foi realizar o levantamento dos principais fungos patogênicos potencialmente destrutivos encontrados em sementes, e desenvolver um kit de detecção rápida por meio da metodologia LAMP para M. oryzae.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A cultura do arroz irrigado é a principal atividade agrícola de Roraima, onde se faz uso intensivo de fósforo e potássio, tanto em áreas com vários anos de cultivo, como em áreas de primeiro ano. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar a resposta do arroz irrigado a diferentes doses de fósforo e potássio sobre a produtividade de grãos, determinada pela colheita da área útil da parcela (3 x 2,5), em kg ha-1, altura de plantas em cm, medida em dez plantas ao acaso por parcela e componentes de produção. Os dados foram obtidos através da coleta de dez panículas por parcela na área útil, sendo a massa de mil grãos obtida da pesagem destes grãos em balança de precisão, e corrigida para 13%, número de grãos cheios, número de grãos estéreis e total de grãos por panícula, sendo feita sua contagem total e dividida pelo número de panículas, em áreas de primeiro ano e áreas intensamente adubadas. Utilizou-se o delineamento inteiramente ao acaso, no esquema de parcelas subdivididas, sendo feita análise de regressão através de superfície de resposta. / The cultivation of rice is the main agricultural activity of Roraima, which makes intensive use of phosphorus and potassium, so much in areas with several years of cultivation as in areas in the first year of agricultural activity. The aim of this study was to evaluate the response of irrigated rice to the application of different doses of phosphorus and potassium above the grains productivity, determined by the crop of the usuful area of the portion(3 x 2,5), em kg ha-1, height of plants in cm, measured in ten randomized plants for portion and production components.The Data were obtained by collecting ten panicles per plot in the useful area, being the thousand grain mass obtained from the weighing of grain in a precision scale and corrected to 13% number of filled grains, grain number and total number of sterile grains per panicle, and made his total score divided by the number of panicles, in areas of first year and heavily fertilized areas. It was used a completely randomized design in a split plot, being done through regression analysis of response surface.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O desenvolvimento de cultivares de arroz com tipos de grãos especiais, como as de grãos catetos, aromáticos, vermelhos, pretos, arbóreos e japônicos de boa qualidade e adaptados às condições de cultivo do Brasil, constitui-se em grande oportunidade com vistas a agregar valor a produção do arroz irrigado. No entanto, esses tipos de arrozes estão sendo cultivados em densidades baseadas em recomendação geral que nem sempre podem refletir o potencial genético do material, além do fator custo da semente. Neste contexto, objetivou-se no presente trabalho determinar as densidades de semeadura de genótipos de arroz com grãos especiais que apresentem boa adaptação às condições de cultivo irrigado em várzea de Roraima. Foram conduzidos dois experimentos oriundos do programa de melhoramento de arroz da Embrapa Roraima, designados como Ensaios de Valor de Cultivo e Uso (VCU), em área de várzea do Rio Branco, no município de Cantá, no período de novembro a março dos anos agrícolas de 2011/2012 e 2012/2013, em Gleissolo Háplico tb distrófico. O delineamento foi em blocos casualizados, no esquema fatorial 14x4, com quatro repetições. Os tratamentos foram compostos pela combinação de 12 genótipos de arroz com grãos especiais e duas cultivares comerciais de arroz de grãos comuns, com quatro densidades de semeadura de 50 sementes m-1 (60 kg ha-1); 100 sementes m-1 (120 kg ha-1); 150 sementes m-1 (180 kg ha-1), 200 sementes m-1 (240 kg ha-1). Foram avaliadas as características: floração média, altura média de plantas; acamamento de plantas; número de panículas por m2; número de grãos por panícula; comprimento da panícula, massa de 1000 grãos, número de grãos por panícula, produtividade de grãos em casca e o rendimento de grãos inteiros no beneficiamento. Os resultados mostram forte influência da densidade de semeadura sobre a maioria das características avaliadas, gerando redução na altura de planta, menor comprimento da panícula e menor número de grãos por panícula com o aumento da densidade de semeadura. Assim como, incrementos no número de panículas por m2 e na produtividade de grãos até, aproximadamente 150 sementes por metro para a maioria dos genótipos avaliados. Apenas a massa de 1000 grãos mostra-se pouco alterada com o aumento da densidade de semeadura. Os genótipos Jasmine (aromático) e RR 9903, (japônico) apresentam as maiores produtividades de grãos, na faixa de 7000 a 8000 kg ha-1 e são os mais promissores para uso em Roraima em condições de cultivo em várzea com irrigação. / The development of rice cultivars with special types of grains , such of catetos grains, aromatic, red , black , and arboreal japonica good quality and adapted to growing conditions in Brazil , constitutes a great opportunity with a view to add value the production of rice irrigation . However, these types of rice are being grown in densities based on general recommendation that may not always reflect the genetic potential of the material, in addition to the cost factor of the seed. In this context, the objective of this work was to determine the densities of seeding rice genotypes with special grains which show good adaptability to conditions in irrigated lowland of Roraima. Two experiments originated from the rice breeding program of Embrapa Roraima, designated as assays Value for Cultivation and Use (VCU) in the floodplains of the Rio Branco, in the municipality of Cantá were conducted in the period from November to March of the agricultural year the 2011/2012 and 2012/2013 in dystrophic Gleissolo Háplico tb . The delimitation was a randomized block, in design a factorial 14x4 with four replications. The treatments consisted of combinations of 12 rice genotypes with special grains and two cultivars of common rice grains with four sowing densities of 50 seeds m - 1 (60 kg ha - 1) ; 100 seeds m-1 (120 kg ha- 1); 150 seeds m-1 (180 kg ha -1), 200 seeds m-1 (240 kg ha- 1). The following characteristics were evaluated : average flowering , medium plant height ; bedding plants ; number of panicles by m2 ; number of grains by panicle ; panicle length , 1000 grain weight , number of grains by panicle , grain yield and yield of paddy rice after milling whole . The results show strong influence of planting density on most of the traits evaluated, generating a reduction in plant height , panicle length smaller and smaller number of grains per panicle with increasing seeding rate . As well as increases in the number of panicles by m2 and grain yield up to approximately 150 seeds per meter for most genotypes. Only the 1000 grain shows up slightly altered with increasing seeding rate. The Jasmine (aromatic) and RR 9903, (japonica) genotypes had the highest grain yields in the range 7000-8000 kg ha - 1 and are the most promising for use in Roraima in culture conditions in floodplain irrigation.

O arroz (Oryza sativa L.) está entre as culturas mais importantes do mundo, tanto em valores de produção quanto em contribuição para a alimentação humana. A mancha parda, causada pelo fungo Bipolaris oryzae, destaca-se entre as principais doenças que afetam o arroz por reduzir a produtividade das lavouras e a qualidade dos grãos colhidos, colocando em risco a segurança alimentar de mais da metade da população mundial. O biocontrole de doenças como a mancha parda apresenta-se como uma alternativa mais sustentável em comparação ao controle químico que, por sua vez, apresenta elevados custos financeiro e ambiental. Os objetivos desse trabalho foram isolar micro-organismos antagonistas de solo com potencial de utilização no biocontrole da mancha parda, elucidar alguns dos mecanismos de ação ocorrentes no antagonismo entre os micro-organismos isolados e B. oryzae, avaliar os efeitos dos filtrados de cultivos dos micro-organismos isolados sobre o desenvolvimento do fitopatógeno e avaliar a eficácia dos micro-organismos isolados no controle da mancha parda em folhas de arroz. Dois micro-organismos antagonistas foram selecionados pela capacidade de produzirem metabólitos que inibem o crescimento de outros micro-organismos. Os antagonistas foram identificados como Paecilomyces lilacinus e Bacillus amyloliquefaciens ou B. methylotrophicus (o fragmento sequenciado de gDNA apresentou nível idêntico de similaridade para ambas as espécies), micro-organismos já utilizados na formulação de produtos biológicos para o controle de doenças de plantas. Bacillus spp. e P. lilacinus inibiram o crescimento micelial de B. oryzae em 52,5% e 37,3%, respectivamente, em ensaio de pareamento de culturas. Ambos os micro-organismos isolados foram capazes de inibir, também, o crescimento de outros importantes fitopatógenos como Magnaporthe oryzae, Sclerotinia sclerotiorum e Phytophthora infestans. Além dos metabólitos dissolvidos no meio de cultivo, foi verificada a produção de compostos orgânicos voláteis (COVs) pelos antagonistas. Bacillus spp. e P. lilacinus produziram COVs que reduziram o crescimento de B. oryzae em 19,3% e 20,6% respectivamente. Os filtrados de cultivo de Bacillus spp. e P. lilacinus apresentaram efeito fungistático sobre o desenvolvimento de B. oryzae. O filtrado da bactéria inibiu o crecimento, a esporulação e a germinação daquele patógeno em 74,7%, 94,2% e 100% respectivamente. O filtrado do fungo, por sua vez, foi capaz apenas de reduzir o crecimento micelial do patógeno (39,4%). Os metabólitos produzidos por Bacillus spp. demonstraram ser foto e termoestáveis; enquanto que os produzidos por P. lilacinus perderam sua atividade inibitória na presença de luz ultravioleta de comprimento longo. O biocontrole da mancha parda foi avaliado em segmentos de folhas de arroz tratadas, separadamente, com suspensão de células e esporos de Bacillus spp. e P. lilacinus respectivamente, e em seguida inoculadas com esporos de B. oryzae. Não houve redução da incidência e da severidade da doença através do tratamento de segmentos de folhas de arroz com suspensões de células e esporos dos antagonistas. No presente estudo, os micro-organismos antagonistas isolados de solo foram capazes de inibir in vitro o crescimento de B. oryzae e outros 3 fitopatógenos; porém, nas condições experimentais avaliadas, não foram eficazes no controle in vivo da mancha parda. / Rice (Oryza sativa L.) is one of the most important crops in the world in terms of total production and contribution to human diet. Brown spot of rice, caused by the fungus Bipolaris oryzae, is among the diseases that most affect this crop, reducing both yield and grain quality, and threatening food security for millions of people across the world. Biological control is considered a more sustainable approach to control plant diseases since pesticides application presents higher economical and environmental costs. The objectives of this study were: isolating antagonistic microorganisms from soil which show potential for use in the biocontrol of brown spot; elucidating some of the antagonistic mechanisms of the interaction among the plant pathogen and the isolated microorganisms; assessing the effect of cell-free culture filtrates from the antagonists on the development of B. oryzae; and evaluating the efficacy of the antagonistic microorganisms on the biocontrol of brown spot in rice leaves. Two microorganisms were selected because of the production of metabolites wich showed inhibitory effects on other microorganisms. The selected antagonists were identified as Bacillus amyloliquefaciens or B. methylotrophicus (gDNA sequenced fragments presented high similarity to both species), and Paecilomyces lilacinus, which are already used as commercial biocontrol products. Bacillus spp. and P. lilacinus inhibited mycelial growth of B. oryzae in 52.5 and 37.3%, respectively, in dual plate assays. Both microorganisms also inhibited mycelial growth of other important plant pathogens such as Magnaporthe oryzae, Phytophthora infestans and Sclerotinia sclerotiorum. Besides the production of metabolites dissoveld in the culture medium, the antagonism among B. oryzae and the isolated microorganisms also involves volatile organic compounds (VOCs). Bacillus spp. and P. lilacinus produced VOCs which reduced mycelial growth of that pathogen in 19.3 and 20.6% respectively. The cell-free culture filtrate from both antagonists showed fungistatic effetcs on the development of B. oryzae. The filtrate obtained from Bacillus spp. inhibited mycelial growth (74.7%), spore formation (94.2%) and germination (100%) of the plant pathogen. On the other hand, the antagonistic fungus filtrate was only effective on the reduction of the mycelial growth of B. oryzae (39.4%). While the metabolites produced by Bacillus spp. remained stable after heat and light treatments, the ones produced by P. lilacinus lost their inhibitory activity under near-ultraviolet light exposure. Brown spot biocontrol was assessed in detached rice 5-cm leaf segments treated, simultaneously, with a spore suspension of B. oryzae and cell suspension of Bacillus spp. or spore suspension of P. lilacinus. No reduction in disease incidence and severity was observed in leaves treated with the antagonists in comparison to control (water). In the present study, the antagonistic microorganisms isolated from soil inhibited in vitro the mycelial growth of B. oryzae and other three plant pathogens; however, they were not able to control brown spot in rice leaves in the experimental conditions used.

A qualidade de sementes é fundamental para as decisões para a produção agrícola e as formas para determinar a qualidade de sementes requerem inúmeros estudos visando à semeadura. Adicionalmente é essencial que haja condições ideais de armazenamento até que as sementes sejam utilizadas estabelecidas em função da espécie e da temperatura e a umidade relativa do ar, e que são fundamentais para a manutenção do parâmetro fisiológico das sementes. Alguns pesquisadores têm afirmado que outros fatores podem contribuir significativamente para a deterioração das sementes durante o armazenamento, tal como o oxigênio. Dessa forma, nessa pesquisa foi avaliada a ação do oxigênio na deterioração das sementes de arroz durante o armazenamento. Num primeiro momento, a qualidade das sementes de arroz foi avaliada com a aplicação de técnicas multivariadas em contraste com a análise univariada, para classificar as sementes quanto ao parâmetro fisiológico. Em seguida, as sementes foram testadas quanto à qualidade ao serem submetidas ao aumento da pressão da atmosfera com o intuito de aumentar a interferência do oxigênio na qualidade das sementes. Complementarmente, foi avaliada a utilização de embalagem com aplicação de vácuo, para verificar a interferência na conservação dessas sementes. Há possibilidade de utilização da análise estatística multivariada para classificar as sementes de arroz quanto à qualidade. O oxigênio reduz a qualidade das sementes de arroz durante o armazenamento em condições em que há a redução da temperatura e da umidade relativa do ar. A embalagem com uso de vácuo é uma alternativa viável para reduzir a deterioração das sementes de arroz. / Seed quality is fundamental for decision for agricultural production. Ways to determine seed quality are targets of numerous studies to identify the quality of the lots for sowing. Once identified the quality of seeds, secured storage ideal conditions should be proceeded until the seeds are ready for use. Ideal conditions for seed storage are depending on the species, as temperature and air relative humidity, important for the maintenance of the physiological quality of seeds. Some researchers have raised the hypothesis that more factors can significantly contribute to the deterioration of seeds, such as oxygen. Through the chapters of this thesis sought to evaluate the oxygen action in the deterioration of rice seeds during storage. At first it evaluated the quality of the seeds with the use of multivariate techniques in contrast to the univariate analysis to classify seeds as the physiological. Then seeds were tested for quality being subjected to high-pressure atmosphere in order to enhance the effects of oxygen on the seed deterioration. Finally, an additional chapter discusses the use of application of vacuum packaging to verify the effect on conservation. It is concluded that the multivariate statistical analysis is a potential tool to classify rice seeds as quality. Oxygen reduces the quality of rice seeds during storage under conditions of lower temperature and relative humidity and vacuum packing is a good alternative to decrease seed deterioration.

Os efeitos negativos da ocorrência de baixas temperaturas sobre o arroz são de difícil controle e manejo, por ser um fator imprevisível. Embora não seja uma tarefa fácil, em diversas regiões do mundo, já foram desenvolvidas cultivares com adequada tolerância ao frio. O caminho para o desenvolvimento de cultivares deve envolver, a adoção de várias estratégias para tornar o processo de melhoramento desse caráter ágil e preciso. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética existente entre os acessos de arroz da subespécie Japonica do Banco de Germoplasma da ESALQ/USP e caracterizá-los a fim de identificar fontes de tolerância ao frio durante a fase reprodutiva. O trabalho foi conduzido em dois anos agrícolas sendo o primeiro experimento em 2013 e o segundo em 2014. No primeiro experimento, foi feita a identificação da diversidade genética por caracteres agromorfológicos e a avaliação do seu rendimento em condições de estresse por baixas temperaturas na fase reprodutiva. A divergência genética entre os acessos foi quantificada por meio de análises estatísticas multivariadas, sendo que foi utilizada a distância generalizada de Mahalanobis. O método de agrupamento utilizado foi o algoritmo de otimização de Tocher e foi feita análise de componentes principais para determinar as variáveis que mais contribuíram para a variabilidade dos acessos. No segundo experimento, os genótipos que apresentaram bom desempenho foram avaliados novamente a fim de identificar aqueles tolerantes ao frio na fase reprodutiva. Foi observada a presença de variabilidade genética para os caracteres avaliados. No primeiro experimento, os acessos japoneses apresentaram em média maior rendimento e massa de mil grãos e menor esterilidade quando comparados com as cultivares comerciais, indicando possível existência de fontes de tolerância ao frio na fase reprodutiva. Considerando simultaneamente as variáveis analisadas, de acordo com o algoritmo de otimização de Tocher, os acessos e cultivares foram reunidos em 37 grupos de similaridade. Os genótipos avaliados no segundo experimento apresentaram elevada esterilidade (próxima a 100%). No entanto, deve-se destacar que foram registradas temperaturas críticas baixas (inferiores a 15°C) ao longo de quase todo o ciclo, especialmente durante o período reprodutivo. / Being an unpredictable factor, the negative effects of occurrence of low temperatures on rice are difficult to control and managed. Although it is not an easy task, in various regions of the world, cultivars have been developed with adequate cold tolerance. The path to the development of cultivars should involve the adoption of various strategies to make the process of improvement of this character more agile and precise. The objective of this study was to evaluate the genetic diversity among rice accessions of Japonica subspecies of the Germplasm Bank of ESALQ / USP and characterize them morphological in order to identify sources of cold tolerance during the reproductive phase. The work was conducted in two years with the first trial in 2013 and the second in 2014. In the first trial, the identification of the genetic diversity of agronomic characters and the evaluation of its performance under stress conditions by low temperatures in the reproductive phase. The genetic divergence among accessions was quantified by means of multivariate statistical analysis, using the Mahalanobis distance. The clustering method used was Tocher optimization algorithm and it was also performed made principal component analysis to determine the variables that contributed the most to the variability of accessions. In the second trial, the genotypes that performed better were evaluated again in order to identify those that were cold tolerant in the reproductive phase. It was observed the presence of genetic variability for all the characters. In the first trial, the Japanese accessions showed on average higher yield and thousand grain weight, and also less sterility compared to commercial cultivars, which may indicate the existence of cold tolerance sources in the reproductive phase. Considering the variables analyzed, according to the Tocher optimization algorithm, accessions and cultivars were divided into 37 groups of similarity. The genotypes used in the second test showed high sterility (close to 100%). However, it should be noted that low critical temperatures were recorded (below 15 ° C) over almost the entire cycle, especially during the breeding season.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:36:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Cecilia_Reis.pdf: 514722 bytes, checksum: 082509cfd0d043efec68c43599a0918a (MD5) Previous issue date: 2008-03-24 / Soil chemical, physical and biological changes that occurr after soil flooding are very important for the irrigated rice crop, since they affect essential soil properties and nutrient availability. However, there is little information about the lowland soils in the State of Rio Grande do Sul, Brazil. The present study had as objective to evaluate the condition of 57 lowland soils regarding clay, organic matter and nitrogen content, ion exchange, acidity and phosphorus and sulphur availability, as well as to establish relationships among these soil attributes. Therefore, 57 samples of lowland soils were collected at a depth ranging from 0 to 20 cm (arable layer) in different locations, comprising the Santa Maria, Bagé, Hulha Negra, Jaguarão, Santa Vitória do Palmar, Camaquã, Uruguaiana, Barra do Quarai, Itaqui, São Borja, Eldorado do Sul, Rio Grande, São Lourenço do Sul and Pelotas Counties. Clay, total organic carbon and nitrogen, available phosphorus, potassium and sulphur, exchangeable calcium and magnesium, acidity, cation exchange ability and base saturation, were determined. In general, the studied lowland soils presented low organic matter, clay and nitrogen contents, a pH inferior to the recommended for the irrigated rice crop (5.5), low potential acidity, potassium levels bellow the limiting values, high calcium availability, magnesium, sulphur and phosphorus, besides the medium base saturation. Also, a high variability in the ion exchange ability and sulphur concentration available was found. The contents of total organic carbon, clay and nitrogen are highly correlated. The carbon content determined by elemental analysis and by the Walkley & Black method showed a high correlation. The relationships between the pH and the base saturation and between ion exchange ability and carbon content and clay are significant. Despite the low correlation between sulphur concentration available and organic carbon and clay contents, soils that show sulphur content below the critical level also possess low clay and organic carbon contents. / As transformações químicas, físicas e biológicas decorrentes do alagamento do solo são de grande importância para o arroz irrigado, visto que afetam os atributos do solo e a disponibilidade de nutrientes essenciais a essa cultura. No entanto, há carência de informações sobre os solos de várzea do Rio Grande do Sul. O presente estudo teve por objetivo avaliar a condição de 57 solos de várzea quanto ao teor de argila, matéria orgânica e nitrogênio, complexo de troca, acidez e disponibilidade de fósforo e enxofre, bem como estabelecer relações entre estes atributos do solo. Para isto, foram coletadas 57 amostras de solos de várzea, na profundidade de 0 a 20cm (camada arável) em diferentes localidades, abrangendo os municípios de Santa Maria, Bagé, Hulha Negra, Jaguarão, Santa Vitória do Palmar, Camaquã, Uruguaiana, Barra do Quaraí, Itaqui, São Borja, Eldorado do Sul, Rio Grande, São Lourenço do Sul e Pelotas, e determinados os teores de argila, carbono orgânico total, nitrogênio total, fósforo, potássio e enxofre disponíveis, cálcio e magnésio trocáveis, acidez, capacidade de troca de cátions e saturação por bases. Em geral, os solos de várzea estudados apresentaram baixos teores de matéria orgânica, argila e nitrogênio, pH inferior ao recomendado para o cultivo de arroz irrigado (5,5), baixa acidez potencial, teor de potássio abaixo do nível de suficiência, alta disponibilidade de cálcio, magnésio, enxofre e fósforo, além de média saturação por bases. Além disto, foi verificada grande variabilidade na capacidade de troca de cátions e na concentração de enxofre disponível nas amostras. Os parâmetros carbono orgânico total, argila e nitrogênio estiveram diretamente correlacionados e os métodos de determinação de carbono orgânico, análise elementar e Walkley & Black, apresentaram alta associação entre si. As relações entre o pH e a saturação por bases e entre a capacidade de troca de cátions e teores de carbono e argila são significativas. Apesar da baixa correlação entre a concentração de enxofre disponível e os teores de carbono orgânico e argila, os solos que apresentam teores de enxofre abaixo do nível crítico também possuem baixos teores de argila e de carbono orgânico. Palavras-chave: Oryza sativa L. Alagamento. Sulfato. Fertilidade.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_fabio_mielezrski.pdf: 269505 bytes, checksum: a46e1425b93c1d7d9886830f04ab1bec (MD5) Previous issue date: 2008-02-12 / The work had the objective of evaluating the behavior of populations of hybrid rice plants which were cultivated isolated, and the individual behavior and plants originated from seeds of high and low vigor of hybrid rice, inside of populations that were constituted of different combinations of seed line distributions. The experiment was conducted in the didactic experimental area of the agronomy school. It was used seeds of hybrid rice of the cultivar Avaxi, which belongs to the Ricetec®, including two types characterized as low and high vigor. Two studies were conducted. On the first, the effect of seed vigor on isolated plants, cultivated in hollows of 50 cm of depth, was evaluated. Two treatments were tested; plants originated from low and high vigor seeds, being each parcel composed by only one plant. On the second study, the evaluation was on the individual behavior of plants inside a population, as long as the entire population behavior established with different systems of distribution of plants originated from high and low vigor seeds, on the seed line. The experiment had 5 different combinations of seed line distribution of the plants originated from high and low vigor seeds, in seed lines of 4 meters of length. The plants were obtained by sowing each lot in distinct treys with soil as subtract, in a depth of 2,5cm with later transplant of the emerged plants to the field. It was concluded that plants of hybrid rice originated from seeds of high vigor shows better performance than the plants originated from low vigor seeds inside of a population. Increases at the ratio of plants originated from high vigor seeds, at the establishment of a population of hybrid rice plants, provide increases on the population yield and yield components. Hybrid rice populations established with high vigor seeds presents grain yield over 30%. Although presenting a superior performance, the plants originated from high vigor seeds don´t exert dominance effects on the plants originated from low vigor seeds. / O trabalho teve como objetivo avaliar o efeito do vigor de sementes sobre o comportamento de plantas de arroz híbrido cultivadas isoladamente e o comportamento individual e de populações de plantas de arroz híbrido originadas de sementes de alto e baixo vigor em comunidades constituídas de diferentes combinações de distribuição dessas plantas ao longo da linha de semeadura. Os experimentos foram realizados na Área Experimental e Didática do Departamento de Fitotecnia da Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel (FAEM/UFPel). Utilizou-se sementes de arroz do híbrido Avaxi da empresa RiceTec®, de dois lotes devidamente caracterizados como alto e baixo vigor. Realizaram-se dois trabalhos. No primeiro avaliou o efeito do vigor de sementes em plantas cultivadas isoladamente, em covas espaçadas de 50 cm.Testaram-se dois tratamentos; plantas originadas de sementes de alto e de baixo vigor, sendo cada parcela constituída por uma única planta. No segundo trabalho avaliou-se o comportamento individual de plantas dentro de comunidades, bem como o comportamento geral das comunidades estabelecidas com diferentes sistemas de distribuição de plantas originadas de sementes de alto e de baixo vigor, ao longo das linhas de semeadura. Foram realizadas cinco diferentes combinações de distribuição de plantas originadas de sementes de alto e baixo vigor, em linhas de 4 metros de comprimento. As plantas foram obtidas pela semeadura de cada lote em bandejas distintas com solo como substrato, a uma profundidade de 2,5 cm com posterior transplante para o campo. Conclui-se que plantas de arroz híbrido originadas de sementes de alto vigor apresentam desempenho superior em relação às originadas de sementes de baixo vigor dentro das comunidades. Aumentos na proporção de plantas originadas de sementes de alto vigor, no estabelecimento das comunidades de plantas de arroz híbrido, proporcionam acréscimos nos componentes do rendimento e na produtividade das comunidades. Comunidades de arroz híbrido estabelecidas com sementes de alto vigor apresentaram produtividade de grãos superiores a 30%. Embora apresentem um desempenho superior, as plantas originadas de sementes de alto vigor não exercem efeito de dominância sobre as plantas originadas de sementes de baixo vigor, dentro das comunidades.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Renata_Ahlert.pdf: 14058010 bytes, checksum: 2f8b5826a49cf784877ea9e91ec9e8e9 (MD5) Previous issue date: 2010-04-20 / Rice crop has great food and economic importance. Iron is an essential element for the development of crop and necessary for essential plants functions, such as photosynthesis, respiration and DNA synthesis. However, under irrigated cultivation conditions, the low redox potential leads to reduction of iron in the soil solution which is readily available and can become toxic to plants if absorbed in excess. In rice production areas of Rio Grande do Sul, the iron has caused problems toxicity and the use of tolerant cultivars becomes an important strategy to solve the problem being necessary the study of mechanisms that give this tolerance to plants application in breeding programs. Proteomics is an important tool, which through combination of techniques such as two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry allows the analysis of proteins complex involved in response to adverse environmental conditions. The objective of this study was to analyze and identify proteins with differential expression in roots of rice cultivars exposed to iron stress, to identify mechanisms involved in stress tolerance. It was used two rice cultivars, Epagri 107 and BR-IRGA 410, tolerant and sensitive to the iron toxicity, respectively, which were subjected to treatment with 7mM FeSO4EDTA. Through two-dimensional electrophoresis, it was identified 284 spots with differential expression between combinations of treatment (between cultivars and plants treated and control). Of this total, 93 proteins were identified by mass spectrometry. The identified proteins were involved in carbohydrate metabolism, signal transduction, related to plant defense, transcription factors, transposons, nucleic acids, redox reactions, among other functions. Many of the proteins have no known function. The glutathione Stransferase protein and GATA type transcription factor that have direct relation to iron metabolism were differentially expressed in the tolerant cultivar when submitted to stress. Its association with the tolerance mechanism requires, however, be confirmed. / O arroz é uma cultura que possui grande importância alimentar e econômica. O ferro é um elemento essencial para o desenvolvimento da cultura e necessário para funções essenciais da planta, como fotossíntese, respiração e síntese de DNA. Porém, em condições de cultivo irrigado, o baixo potencial redox do meio leva a redução do ferro presente na solução do solo o qual torna-se prontamente disponível, podendo se tornar tóxico à planta quando absorvido em excesso. Em áreas de cultivo de arroz do Rio Grande do Sul, o ferro tem causado problemas de toxidez e o uso de cultivares tolerantes torna-se uma importante estratégia para solucionar o problema, sendo necessário o estudo dos mecanismos que conferem essa tolerância às plantas para aplicação em programas de melhoramento. A proteômica é uma importante ferramenta, que através da combinação de técnicas como a eletroforese em gel bidimensional e espectrometria de massa permite a análise do complexo de proteínas envolvido nas respostas às condições ambientais adversas. Assim, o objetivo desse trabalho foi analisar e identificar proteínas com expressão diferencial em raízes de cultivares de arroz quando submetidas ao estresse por ferro, para identificar mecanismos envolvidos na tolerância a esse estresse. Foram utilizadas duas cultivares de arroz, Epagri 107 e BR-IRGA 410, tolerante e sensível à toxidez por ferro, respectivamente, que foram submetidas ao tratamento com FeSO4EDTA 7mM. Através de eletroforese em gel bidimensional, foram identificados 284 spots com diferença de expressão entre as combinações de tratamentos (entre cultivares e plantas tratadas e controle). Desse total, 93 proteínas foram identificadas por espectrometria de massa. As proteínas identificadas estão envolvidas no metabolismo de carboidratos, transdução de sinais, relacionadas à defesa da plantas, a fatores de transcrição, transposons, ácidos nucléicos, reações redox, entre outras funções. Grande parte das proteínas não possui função conhecida. A proteína glutationa S-transferase e o fator de transcrição tipo GATA que possuem relação direta com o metabolismo do ferro, foram diferencialmente expressos na cultivar tolerante quando submetida ao estresse. Sua associação com o mecanismo de tolerância necessita, no entanto ser confirmada.