Le but de cette étude était de développer et caractériser de nouveaux films antimicrobiens à base de chitosane et de divergicine M35 et d'évaluer leur potentiel pour le biopréservation des produits marins prêts à consommer (PMP AC). Dans un premier temps, nous avons démontré dans cette étude que le chitosane, dépendamment de son poids moléc~laire, peut exercer une activité antimicrobienne importante contre L. monocytogenes. Trois types de chitosane ayant des poids moléculaires de 2, 20 et 100KDa ont été choisis pour leur activité antibactérienne importante. Nous avons aussi démontré que le mécanisme d' action du chitosane dépendait de son poids moléculaire. La détermination des concentrations minimales inhibitrices du chitosane et de la divergicine contre L. monocytogenes a permis de mettre en évidence un effet additif de ces deux composés contre L. monocytogenes. Finalement, des films bioactifs à base de chitosane à 100 KDa et de di vergicine ont été développés et caractérisés. Ces films ont montré des propriétés mécaniques, physiques et biologiques intéressantes. L'étude de la libération de la divergicine a montré que cette dernière se libérait graduellement des films de chitosane et que l'incorporation de la divergicine dans les films de chitosane augmentait l'activité antimicrobienne de ce dernier. Les résultats par spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier démontrent que l'incorporation de la divergicine n'a pas affecté la structure des films et que les spectres de la divergicine libérée obtenus ne différent du spectre de la bactériocine pure que par l'intensité des pics. Nous avons par la suite validé nos résultats sur du saumon fumé à froid (SFF) entreposé à 4°C et 8°C pendant 21 jours'. Nous avons pu démontrer que le film à base de chitosane et de divergicine présente une meilleure activité contre L. monocytogenes comparativement à l'application de la solution filmogène et que l'application du film résulte en une inhibition de L. monocytogenes durant toute la période de l'entreposage. L'utilisation du film a aussi permis d'obtenir une meilleure qualité microbiologique et de meilleures caractéristiques organoleptiques du SFF, de maintenir la concentration des bases azotées volatiles totales à un niveau inférieur à celui du SSF non traité et d'augmenter la fermeté des filets.

L'objectif de cette thèse a été de déterminer la pertinence des lâchers comme mode de gestion des pêcheries récréatives de brochet (Esox lucius). Une synthèse bibliographique a d'abord permis d'identifier les potentialités et les risques liés aux lâchers de brochets. La construction d'une vaste base de données sur les lâchers et sa mise en relation avec des données de pêche électrique a permis de démontrer que les lâchers ont un effet positive sur l'occurrence du brochet mais pas d'effet sur son abondance malgré que l'efficacité des lâchers augmente avec la taille des poissons lâchés. Deux études génétiques ont permis de mettre en évidence un fort taux d'hybrides permis les juvéniles et un taux relativement modéré parmi les adultes. D'une manière générale, les lâchers un bon potentiel d'amélioration des pêcheries mais présentent des risques pour la conservation de l'espèce. Ce travail se termine par des recommandations sur l'usage des lâchers et une réflexion sur les stratégies alternatives de gestion. / The objective of this PhD was to determine the relevance of stocking for pike (Esox lucius) recreational fisheries management. First, we identified benefits (for recreation) and risks (for conservation) of stocking of pike through a bibliographic review. Second, we used a large dataset (96 sites, 6 years) to evaluate the actual and potential effects of stocking on pike populations. We found that pike stocking programs actually positively affect pike occurrences but not pike abundance despite we found that the effect of stocking on pike abundance increases with the size of the stocked pike. Third, we measured the genetic impact of stocking. We found a high rate of hybridization among juveniles but a moderate rate of hybridization among adult pike. Overall, stocking has good potential to enhance fisheries yet it carries conservation risks. We conclude with recommendations for the use of stocking and discussion about alternative management strategies.

Le Sénégal est actuellement confronté à une forte socialisation du littoral liée, entre autres, au dynamisme de la pêche piroguière qui a évolué, en moins d'une cinquantaine d'années, d'une activité traditionnelle à une pêche artisanale. L'approche territoriale, appliquée à trois niveaux d'échelles spatiales (les territoires de pêche, les pôles halieutiques et les territoires littoraux) apporte de nouveaux éléments informatifs sur la gestion durable des ressources, la nature et les dynamiques des territoires et sociétés halieutiques ainsi que sur le rôle de la pêche artisanale dans la structuration des territoires littoraux. Étant donné les écueils que comporte une démarche scientifique en terre africaine, la méthodologie s'appuie sur une approche participative du terrain. L'analyse de trois sites-témoins démontre que la pêche artisanale constitue une menace pour la pérennité des ressources du fait d'une extraversion croissante de la filière de commercialisation. Elle révèle que la politique nationale en matière de pêche, fortement influencée par la politique et la coopération internationales, contribue à cette extraversion. Néanmoins, les sociétés halieutiques se distinguent par une plus grande résistance à l'occidentalisation des mœurs et coutumes qui, en d'autres lieux du littoral, est à l'origine de profondes recompositions territoriales. Les territoires littoraux, en plus d'être soumis à des dégradations environnementales et des concurrences territoriales, sont en effet le théâtre d'une dualité entre les dynamiques endogènes et des facteurs exogènes que les politiques de gestion doivent pleinement intégrer. Cette réflexion soulève le problème des relations Nord/Sud puisque la globalisation libérale apparaît comme une continuité de l'exploitation coloniale et prouve la nécessité de renouveler les approches scientifiques et politiques en matière de développement.

Vers la fin des années 1980, les gardes-chasse de l'Île Manitoulin ont organisé et effectué une infiltration technique pour faire cesser une pratique de braconnage et de vente de gibier par des personnes de l'île à des acheteurs de l'extérieur. Cette opération a impliqué 60 gardes-chasse et a abouti à la mise en accusation de 21 membres des Premières Nations. Dans le rocès qui suivit, tous les «Blancs» furent condamnés à des amendes après avoir déposé un plaidoyer de culpabilité tandis que les Amérindiens subirent un long procès de sept ans qui s'est terminé par une décision sans sentence. Ce procès a vu plusieurs rebondissements. Les avocats de la défense ont fait appel à tous les arguments ossibles en se référant au droit constitutionnel. L'argument final fut que les membres des Premières Nations ont des droits ancestraux et des droits reconnus par les traités, des droits de chasse et de pêche sur toute la surface de l'île et des terres nvironnantes. Selon ces traités, ils possèdent parallèlement un droit d'échange de archandise. La question fondamentale est donc de savoir si les droits ancestraux et les traités sont encore compatibles avec l'utilisation de moyens modernes de récolte. Peut-il y avoir pluralisme juridique anachronique? Les politiques modernes sont-elles compatibles avec les coutumes ancestrales?

L'identité maritime des ports basques a été forgée par la notoriété des pêches lointaines développées dans l'Atlantique Nord entre XVIe et XVIIIe siècle et par celle des pêches artisanales pratiquées dans le golfe de Gascogne. De part et d'autre de la frontière franco-espagnole, les marins des ports basques ont longtemps utilisé des engins de pêche et des techniques semblables. L'essor de ces flottilles a suscité et approvisionné une activité de transformation du poisson. Ces pêches se sont différenciées au XXe siècle mais seul le Pays basque d'Espagne a développé une flotte industrielle.<br />La géographie culturelle issue de l'activité halieutique a été malmenée par le déclin de la ressource et des flottilles. Les changements réglementaires, juridiques et commerciaux intervenus au cours des trois dernières décennies du XXe siècle ont bouleversé l'organisation, la pratique de la pêche et ont engendré des conflits de métiers, en mer comme à terre. Dans le contexte de l'Union Européenne, les différentes fonctions de la frontière ont évolué pour aboutir à une véritable recomposition des flottilles basques qui ont renouvelé les méthodes et les lieux de commercialisation des produits de la pêche.

Une ZEE de près de 230000 km², avec un plateau continental d'environ 39000 km², balayée par l'intense upwelling présent pratiquement toute l'année dans cette zone de l'Atlantique centre est, expliquent la richesse biologique des eaux mauritaniennes et leur potentiel élevé en ressources halieutiques, avec des espèces diversifiées et de valeur marchande élevée.Plusieurs décennies d'efforts s'appuyant sur des politiques centrées sur la conservation des ressources halieutiques et l'intégration de la pêche à l'économie nationale, ont permis au pays d'impulser le développement d'un secteur national dynamique de pêche.Le développement des institutions nationales et de la réglementation a permis d'asseoir la souveraineté de l'Etat sur la ZEE, de codifier le droit régalien de l'Etat sur les ressources halieutiques, de déterminer les mécanismes d'allocation des droits de pêche et leurs supports physiques, et d'organiser les structures chargées de la mise en œuvre des ces institutions. Avec une contribution moyenne au cours des dernières décennies, de 4-10% du PIB, de 20-30% des recettes budgétaires, les recettes en devises générées par l'exportation des produits et les redevances de pêche versées par les armements étrangers, qui constituent un soutien important au budget national, la pêche mauritanienne joue, depuis quelques décennies, un rôle clef dans la réalisation des objectifs des politiques économiques du pays.La Mauritanie a toujours été un pays habité en majorité par des nomades qui ne connaissaient pas la mer auparavant, à l'exception de la tribu Imraguen qui pratiquait la pêche traditionnelle depuis des générations. Il est aujourd'hui tourné vers la mer par nécessité et commence à se rendre compte de ses ressources aussi bien bénéfiques pour sa population que pour son développement économique. Cependant, l'avenir du secteur de la pêche sera surtout dessiné avec la mise en place des plans d'aménagement efficaces, qui vont constituer le cadre de gestion du secteur de la pêche pour les prochaines années.

Située au coeur du golfe de Gascogne, La Rochelle fut dès sa naissance au début du XIIe siècle une communauté de pêcheurs. La ville s’affirme comme une cité marchande, devenant l’une des plus dynamiques de l’Ouest français. Son port de commerce se déplace sur un nouveau site en 1890, libérant le vieux port au centre-ville pour la pêche. De nombreux voiliers viennent déjà y vendre leur pêche sur un marché aux poissons attractif, que le chemin de fer relie à l’intérieur du pays en 1857. Une nouvelle page s’ouvre, celle du chalutage industriel qui fait une percée majeure en Grande-Bretagne. A La Rochelle, après l’échec d’une tentative de l’anglais Craggs d’y implanter le chalutage à vapeur en 1871, de grands armements à la pêche industrielle sont fondés de 1904 à 1920. Une première période d’essor de ces armements fait de la cité le deuxième port de pêche de France, le premier de l’Atlantique. Après le marasme des pêches françaises et la crise de la flottille de chalutiers à vapeur rochelais, un nouvel essor du port s’affirme après la Seconde guerre mondiale. La Rochelle redevient le quatrième port de pêche de France dans les années 1960. Mais l’année 1965 marque une rupture de la pêche industrielle rochelaise et un déclin s’ensuit qui conduit à la disparition des derniers grands chalutiers en 1994. De nombreux travaux menés jusqu’ici ont porté sur d’autres ports de pêche de France. Cette étude a l’ambition de contribuer à la connaissance de plus d’un siècle d’histoire de pêche industrielle du port de La Rochelle, de ses dimensions économiques, sociologiques, politiques et écologiques, dans le cadre d’une étude comparative, en analysant les caractéristiques et les raisons de cet essor et celles d’un déclin précoce et rapide. / Situated in the heart of the bay of Biscay, La Rochelle, right from its foundation, at the beginning of the XIIth century, was a community of fishermen. It then became one of the most dynamic cities in western France. In 1890 the commercial port moved to a new site, liberating the old port in the city centre for fishing activities. Many sailing ships came to sell their fish on an attractive fish market boosted by the railway connection to the inland part of the country in 1857. A new era started with industrial trawling, a major innovation in Great Britain. In 1871, the English shipowner Craggs tried to introduce steam-powered trawling but suffered a setback . However from 1904 to 1920 important armaments in industrial trawling were created, making La Rochelle, in this early period of expansion, the second fishing port in France and the first one on the Atlantic coast. After the stagnation of French fisheries and a crisis of Rochelais steam-powered trawlers, a new expansion of the port occured after WWII. In the sixties, La Rochelle became the 4th fishing port in France, until in 1965 a break in industrial fishing activities resulted in the loss of the last big trawlers in 1994. There have been numerous documents about other fishing ports in France. This study aims to concentrate on the history of industrial fishing in the port of La Rochelle over a century, highlighting its economic, sociological, political and ecological dimensions. For this purpose a comparative study has been made, analysing the characteristics and the reasons of this expansion as well as the ones of a rapid and premature decline.

L'éveil de la société internationale aux problèmes environnementaux, en particulier ceux touchant les océans et les zones côtières, a permis de développer des principes et notions nécessaires à la protection du milieu marin et de ses ressources. Le concept de pêche responsable vise à atteindre une gestion durable des pêches. Il nécessite la mise en place de mesures de plus en plus contraignantes pour l'activité de pêche afin de limiter son impact sur les ressources biologiques marines et les écosystèmes marins. Dans un contexte global de raréfaction des ressources, la difficulté à trouver un consensus mondial autour des questions les plus urgentes suscite le doute quant à la capacité des organismes internationaux à mettre en place des mesures contraignantes et effectives dans les zones au-delà des juridictions nationales. Il convient donc de s'interroger sur la place que tiennent les acteurs publics dans la gestion durable des ressources halieutiques. L'objet de cette thèse est de vérifier dans quelle mesure les compétences conférées à l'Union européenne en matière de gestion des pêches lui permettent de contribuer à l'application du concept de pêche responsable pour une gestion durable des pêcheries mondiales.

Le suivi, le contrôle et la surveillance (MCS) des pêches marines sont des problèmes essentiels pour la gestion durable des ressources halieutiques. Dans cette thèse, nous étudions le suivi spatial des activités des navires de pêche en utilisant les données de trajectoire du système de surveillance des navires (VMS) dans le cadre du projet INDESO (2013-2017). Notre objectif général est de développer une chaîne de traitement des données VMS afin de: i) effectuer un suivi de l'effort de pêche des flottilles de palangriers indonésiens, ii) détecter les activités de pêche illégales et évaluer leur importance. L'approche proposée repose sur des modèles de mélange gaussien (GMM) et les modèles de Markov cachés (HMM), en vue d'identifier les comportements élémentaires des navires de pêche, tels que les voyages, la recherche et les activités de pêche, dans un cadre non supervisé. Nous considérons différentes paramétrisations de ces modèles avec une étude particulière des palangriers indonésiens, pour lesquels nous pouvons bénéficier de données d'observateurs embarqués afin de procéder à une évaluation quantitative des modèles proposés et testés.Nous exploitons ensuite ces modèles statistiques pour deux objectifs différents: a) la discrimination des différents flottilles de pêche à partir des trajectoires des navires de pêche et l'application à la détection et à l'évaluation des activités de pêche illégale, b) l'évaluation d'un effort de pêche spatialisé à partir des données VMS. Nous obtenons de très bons taux de reconnaissance (environ 97%) pour la première tâche et nos expériences soutiennent le potentiel d'une exploration opérationnelle de l'approche proposée. En raison du nombre limité de données d'observateurs embarqués, seules des analyses préliminaires on pu être effectuées pour l'estimation de l'effort de pêche à partir des données VMS. Au-delà des développements méthodologiques potentiels, cette thèse met l'accent sur l'importance de la qualité de données d'observation en mer représentatives pour développer davantage l'exploitation des données VMS tant pour la recherche que pour les questions opérationnelles. / Monitoring, control and surveillance (MCS) of marine fisheries are critical issues for the sustainable management of marine fisheries. In this thesis we investigate the space-based monitoring of fishing vessel activities using Vessel Monitoring System (VMS) trajectory data in the context of INDESO project (2013-2017). Our general objective is to develop a processing chain of VMS data in order to: i) perform a follow-up of the fishing effort of the Indonesian longline fleets, ii) detect illegal fishing activities and assess their importance. The proposed approach relies on classical latent class models, namely Gaussian Mixture Models (GMM) and Hidden Markov Models (HMM), with a view to identifying elementary fishing vessel behaviors, such as travelling, searching and fishing activities, in a unsupervised framework. Following state-of-the-art approaches, we consider different parameterizations of these models with a specific focus on Indonesian longliners, for which we can benefit from at-sea observers¿ data to proceed to a quantitative evaluation. We then exploit these statistical models for two different objectives: a) the discrimination of different fishing fleets from fishing vessel trajectories and the application to the detection and assessment of illegal fishing activities, b) the assessment of a spatialized fishing effort from VMS data. We report good recognition rate (about 97%) for the former task and our experiments support the potential for an operational exploration of the proposed approach. Due to limited at-sea observers¿ data, only preliminary analyses could be carried out for the proposed VMS-derived fishing effort. Beyond potential methodological developments, this thesis emphasizes the importance of high-quality and representative at-sea observer data for further developing the exploitation of VMS data both for research and operational issues.

La présente recherche souligne l'importance de la pêche chez les chasseurs cueilleurs marins de la région centrale du détroit de Magellan et des mers adjacentes. L'approche méthodologique prend en compte l'analyse ichthyoarchéologique de 13 sites archéologiques couvrant une chronologie de 6000 à 1000 ans BP. La méthode de la sclérochronologie est appliquée aux vertèbres de l'espèce la plus importante (Salilota aust alis) afin d'évaluer la saisonnalité des activités de pêche. Les techniques de pêche sont abordées à partir des éléments de technologie découverts dans les gisements étudiés (poids lithiques, pointes en os, murets de pêcherie) et de l'information ethnographique. Les résultats permettent de discuter et de réévaluer le rôle de la pêche par rapport à la chasse aux mammifères marins, généralement estimée (avec les mollusques) comme l'axe principal de subsistance de ces sociétés nomades. Des changements radicaux sont observés dans le modèle d'exploitation des poissons à travers le temps. On observe à l'époque ancienne et moyenne (de 6000 à 2000 ans BP) une grande spécialisation dans des espèces démersales exploitées à différents moments de l'année, et l'emploi de technologies spécialisées standardisées. Au cours des derniers 2000 ans et jusqu'à la période ethnographique, la pêche est concentrée sur les bords de côte ; son rôle dans la subsistance est variable et on observe des stratégies opportunistes permises par l'usage de techniques de pêche variées. Le modèle d'exploitation observé tout au long de la séquence chronologique est différent de celui qui avait été suggéré par D. Zangrando pour les nomades marins du canal Beagle, où est observée une intensification progressive de la pêche à travers le temps. Finalement on remarque le haut niveau de spécialisation de la pêche chez les premiers indiens canoeros qui ont peuplé la région de Magellan, il y a 6000 ans, ce qui permet de discuter du degré d'adaptation de ces populations aux milieux marins. Cette observation renforce l'hypothèse, de plus en plus documentée, d'un peuplement maritime venu du nord, le long de la côte pacifique. / This research highlights the importance of fishing in marine hunter-gatherers of the central region of the Magellan Strait and adjacent seas. The methodological approach takes into account the ichthyoarchaeological analysis of 13 archaeological sites covering a chronology from 6000 to 1000 years BP. The Sclerochronology method is applied to the vertebrae of the most important species (Salilota australis) to estimate the seasonality of fishing activities. Fishing techniques are discussed from technology elements discovered in the studied deposits (weight lithic, bone points, fishing weirs) and ethnographic information. The results allow to discuss and reassess the role of fisheries in respect to the hunting of marine mammals, generally estimated to be (along with shellfish) the main source of subsistence nomadic societies. Radical changes are observed on fishing strategies over time. We observe in the Early and Middle Periods (6000 to 2000 years BP) a specialization in demersals species exploited at different moments of the year, and the use of standardized and specialized technologies. ln the last 2000 years until the ethnographic period, fishing is concentrated on the seashore; the role in subsistence is variable and opportunistic strategies enabled by the use of various fishing technics can be observed. The fishing strategies observed throughout the chronological sequence is different from the one suggested by F. Zangrando for the marine nomads of the Beagle Channel, where a progressive intensification of fishing through time is detected. Finally this research emphasizes the high level of the fishing specialization of the first canoeros Indians who populated the region of Magallanes, 6000 years ago, which allows us to discuss the degree of adaptation of these populations to marine environments. This observation strengthens the hypothesis, increasingly documented, of the existence of a maritime population from the Northern regions, along the Pacific Coast.