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Identifizierung und funktionelle Charakterisierung mitochondrialer Proteinkinasen und-phosphatasen in Saccharomyces cerevisiae

Gey, Uta 19 December 2012 (has links) (PDF)
Über die Proteinphosphorylierung in den Mitochondrien der Hefe Saccharomyces cerevisiae ist im Gegensatz zu anderen Kompartimenten nur wenig bekannt. Insbesondere hinsichtlich der physiologischen Bedeutung sowie den an der Modifikation beteiligten Enzymen sind kaum Daten verfügbar. Vor diesem Hintergrund stand die Identifizierung und molekularbiologische Charakterisierung mitochondrialer Proteinkinasen (PKasen) und Proteinphosphatasen (PPasen) im Fokus dieser Arbeit. Unter Verwendung komparativer 2D DIGE-Analysen konnten zwei Strategien erfolgreich verfolgt werden: Zum einen wurde die Konsequenz einer Gendeletion von ausgewählten PKasen bzw. PPasen mit putativer mitochondrialer Lokalisation untersucht. Dabei gelang es, die an der in vivo Regulation des Pyruvatdehydrogenase(PDH)-Komplexes beteiligten Enzyme erstmalig zu identifizieren und im Folgenden deren regulatorisches Zusammenspiel umfassend zu analysieren. Zum anderen wurde in einem inversen Ansatz beispielhaft für die PKase Sat4p untersucht, welche Auswirkungen eine Überexpression dieser Kinase auf das mt Proteom hat. Erste Hinweise, welche zur Identifizierung der PDH-Kinasen (Pkp1p und Pkp2p) bzw. PDH Phosphatasen (Ppp1p und Ppp2p) führten, lieferten die signifikanten Spotänderungen von Pda1p (E1α-Untereinheit des PDH-Komplexes) in den 2D-DIGE-Analysen. Im Folgenden wurde die mitochondriale Lokalisation der vier regulatorischen Enzyme unter Verwendung Epitop-getaggter Varianten nachgewiesen sowie Pda1p in unabhängigen phosphospezifischen Analysen als Target der Phosphorylierung verifiziert. Die Phosphorylierungsstelle von Pda1p konnte massenspektrometrisch dem Serin313 zugeordnet werden. PDH-Aktivitätsmessungen zeigten, dass die Phosphorylierung von Pda1p den PDH Komplex inaktiviert, während eine Dephosphorylierung zur Aktivierung führt. Dabei war der Einfluss der Deletion der PDH Kinasen bzw. der PDH-Phosphatasen unterschiedlich stark ausgeprägt. Während Ppp1p und Ppp2p partiell redundante Funktionen besitzen, lassen die Analysen komplementäre Aktivitäten von Pkp1p und Pkp2p vermuten. Eine physikalische Interaktion der beiden Kinasen wurde in vivo nachgewiesen und deutet auf die Bildung funktioneller Heteromere hin. Durch Analysen in der 2D-BN/SDS-PAGE konnte eine Assoziation der PDH-Kinasen sowie PDH-Phosphatasen mit dem hochmolekularen, etwa 8 MDa großen PDH-Komplex sowie mit PDH-Subkomplexen geringeren Molekulargewichts gezeigt werden. Die Erkenntnisse dieser Arbeit ermöglichten in Verbindung mit denen eigener Vorarbeiten die Erstellung eines Modells zur PDH-Regulation in Saccharomyces cerevisiae. Neben der Aktivitätsregulation durch die von Pkp1p/Pkp2p bzw. Ppp1p/Ppp2p katalysierte Phosphorylierung wird eine Funktion der regulatorischen Enzyme – insbesondere der PDH-Kinasen – an der Assemblierung bzw. Stabilisierung des PDH-Komplexes postuliert. Es konnte somit gezeigt werden, dass in der Hefe ein ähnlicher, aber nicht identischer Regulationsmechanismus vorliegt wie in höheren Eukaryoten. Die zweite Strategie, welche in dieser Arbeit exemplarisch für eine PKase verfolgt wurde, führte zur Identifikation einer bislang unbekannten Funktion der Kinase Sat4p in den Mitochondrien. Es konnte gezeigt werden, dass Sat4p dual lokalisiert in der cytoplasmatischen sowie mitochondrialen Fraktion vorliegt und selbst Target der Phosphorylierung ist. Die Überexpression von Sat4p führte nicht nur zu einem verminderten Wachstum auf nicht fermentierbaren Medien, sondern auch zur Beeinflussung spezifischer mitochondrialer Proteingruppen. Während die Spots der Proteine Pil1p und Lsp1p eine höhere Intensität zeigten, wiesen die Fe/S-Proteine Aco1p und Lys4p eine verminderte „steady-state“-Konzentration auf. Darüber hinaus lagen die Proteine, welche Liponsäure als prosthetische Gruppe tragen (Lat1p, Kgd2p und Gcv3p), im Tet-Sat4-Stamm vorwiegend in ihrer nicht-lipoylierten Form vor. Die Lipoylierungsstellen aller drei Proteine konnten im Wildtyp unter Nutzung von nanoLC-MS/MS erstmals experimentell bestimmt und Lys75 (Lat1p), Lys114 (Kgd2p) bzw. Lys102 (Gcv3p) zugeordnet werden. Die fehlende Lipoylierung der Proteine bzw. die verminderte Proteinkonzentration der Aconitase führte zu einer stark verminderten Aktivität der betroffenen Enzymkomplexe. Neben den in der Literatur beschriebenen putativen Funktionen von Sat4p bei der Regulation cytoplasmatischer Proteine wurde basierend auf den Erkenntnissen der Analysen eine spezifische Funktion der Kinase in den Mitochondrien postuliert. Das Modell schlägt eine Rolle von Sat4p in den späten Schritten der Maturation einer spezifischen Gruppe von mitochondrialer Fe/S-Proteinen vor. Die Beeinträchtigung der Lipoatsynthase Lip5p, welche neben Aco1p und Lys4p ebenfalls zu dieser Gruppe gehört, führt vermutlich sekundär zum beobachteten Verlust der Lipoylierung von Lat1p, Kgd2p und Gcv3p.
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Visualizing Interacting Biomolecules In Situ

Weibrecht, Irene January 2011 (has links)
Intra- and intercellular information is communicated by posttranslational modifications (PTMs) and protein-protein interactions, transducing information over cell membranes and to the nucleus. A cells capability to respond to stimuli by several highly complex and dynamic signaling networks provides the basis for rapid responses and is fundamental for the cellular collaborations required in a multicellular organism. Having received diverse stimuli, being positioned at various stages of the cell cycle or, for the case of cancer, containing altered genetic background, each cell in a population is slightly different from its neighbor. However, bulk analyses of interactions will only reveal an average, but not the true variation within a population. Thus studies of interacting endogenous biomolecules in situ are essential to acquire a comprehensive view of cellular functions and communication. In situ proximity ligation assay (in situ PLA) was developed to investigate individual endogenous protein-protein interactions in fixed cells and tissues and was later applied for detection for PTMs. Progression of signals in a pathway can branch out in different directions and induce expression of different target genes. Hence simultaneous measurement of protein activity and gene expression provides a tool to determine the balance and progression of these signaling events. To obtain this in situ PLA was combined with padlock probes, providing an assay that can interrogate both PTMs and mRNA expression at a single cell level. Thereby different nodes of the signaling pathway as well as drug effects on different types of molecules could be investigated simultaneously. In addition to regulation of gene expression, protein-DNA interactions present a mechanism to manage accessibility of the genomic DNA in an inheritable manner, providing the basis for lineage commitment, via e.g. histone PTMs. To enable analyses of protein-DNA interactions in situ we developed a method that utilizes the proximity dependence of PLA and the sequence selectivity of padlock probes. This thesis presents new methods providing researchers with a set of tools to address cellular functions and communication in complex microenvironments, to improve disease diagnostics and to contribute to hopefully finding cures.
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Functional analysis of Drosophila melanogaster linker histone dH1

Vujatovic, Olivera, 1981- 27 July 2012 (has links)
We did functional characterisation of Drosophila melanogaster linker histone, dH1. In the mutant state for this protein, we observed structural changes in polytene chromosomes chromocenter and nucleoli of mutant larvae. In addition, we performed a microarray analysis in H1 mutant background in order to determine contribution of dH1 to gene expression regulation. We determined effects of dH1 loss in different types of chromatin and we identified groups of differentially expressed (DE) genes, groups in sense of physical clusters of genes and genomic elements rather than groups of functionally related genes. We found that dH1 affects in greater extent expression of heterochromatin genes compared to its effect on euchromatin genes; that dH1 regulates transcription in a regional manner, since the genes physically nearest to the most DE genes tend to be upregulated as well; and that dH1 is negatively regulating expression of transposable elements and members of certain gene families. In addition, we found that dH1 is necessary for preserving genome stability. Among DE transposable elements we detected R1 and R2 retrotransposons, elements that are integrating specifically in rRNA locus. We showed that activation of their transcription is also upregulating expression of aberrant, transposon-inserted, rDNA units of the locus. In this regard we observed an accumulation of extra-chromosomal rDNA circles, increased γ-H2Av content, stop in cell proliferation and activation of apoptosis. Altogether, these results are revealing so far unknown role of histone H1 in preserving genome stability and its effects on cell proliferation.
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Mécanismes moléculaires impliqués dans la régulation post-traductionnelle du système de sécrétion du type VI chez Pseudomonas aeruginosa / Molecular mechanisms involved in the post-translational regulation of type VI secretion system in Pseudomonas aeruginosa

Casabona, Maria Guillermina 13 May 2013 (has links)
La bactérie à Gram-négatif Pseudomonas aeruginosa est un pathogène humain opportuniste qui peut causer des infections chroniques pouvant conduire à la mort des patients, et plus particulièrement ceux atteints de la mucoviscidose. Il a été montré qu‘un de ses trois systèmes de sécrétion de type VI (SST6) est actif durant les infections chroniques, le SST6-H1. P. aeruginosa est capable d'injecter des toxines de type bactériolytique directement dans le périplasme des autres bactéries à Gram-négatif grâce au SST6-H1, ce qui laisse penser que cette nanomachine pourrait être capitale dans la compétitivité de P. aeruginosa dans les niches polymicrobiennes, comme par exemple un poumon infecté. Cette nanomachine insérée dans l'enveloppe bactérienne est régulée au niveau post-traductionnel par une voie de phosphorylation ressemblant à celles des eucaryotes. Cette voie est constituée par une kinase, PpkA, et une phosphatase, PppA, qui modulent ensemble le niveau de phosphorylation de la protéine Fha1. Nous avons démontré que quatre protéines spécifiques de Pseudomonas appelées TagT, TagS, TagR et TagQ, agissent en amont du couple PpkA/PppA, et sont indispensables pour l'activation du SST6-H1. De plus, elles sont aussi nécessaires lors de compétitions entre P. aeruginosa et d'autres bactéries. Nous avons montré que TagR, connue comme étant une protéine périplasmique, est en fait associée à la membrane externe et cette localisation dépend de TagQ, une lipoprotéine ancrée dans le feuillet interne de la membrane externe. TagT et TagS forment un transporteur de type ABC qui a une activité d'ATPase. L'association de TagR à la membrane externe a été mise en évidence par des études de protéomique à haut débit qui avaient pour but la caractérisation des membranes externe et interne de P. aeruginosa. Grâce à l'analyse des résultats, unmodèle de l'assemblage du SST6-H1 au sein de l'enveloppe a pu être proposé. Ce travail a permis l'identification de plus de 1700 protéines, parmi elles un complexe multi-protéique incluant MagD, une protéine homologue à la macroglobuline humaine. Les résultats obtenus lors de la caractérisation de ce complexe sont aussi présentés dans ce manuscrit. / Pseudomonas aeruginosa is a human opportunistic pathogen that can cause severe infections and death in chronically infected cystic fibrosis (CF) patients. It has been shown that one of its three Type VI Secretion Systems (T6SS), the H1-T6SS, is active during chronic infections in CF patients. P. aeruginosa injects bacteriolytic toxins directly into other Gram-negative bacteria by means of its H1-T6SS, which could be of high importance in its outcome in complex niches such as an infected lung. This trans-envelope nanomachine is posttranslationally regulated by a eukaryotic-like phosphorylation pathway, which includes a kinase-phosphatase pair, PpkA and PppA, respectively. In this work, TagT, TagS, TagR and TagQ, Pseudomonas specific T6SS proteins that are encoded in the same operon as Ppka, PppA and Fha1, were analysed functionally and biochemically. We found that these four proteins are indispensable for the activation of H1-T6SS, by acting upstream of the phosphorylation checkpoint. Moreover, they were also needed for intra- and inter-species fitness mediated by H1-T6SS. We discovered that TagR, a periplasmic protein, associates with the outer membrane (OM) of P. aeruginosa in a TagQ-dependent manner. TagQ is an OM lipoprotein that faces the periplasm. TagT and TagS form a membrane-bound complex, an ABC transporter, with ATPase activity. TagR association with the OM was discovered by shotgun mass spectrometry analyses of the OM and the inner membrane (IM) of P. aeruginosa. In this work, the IM and OM sub-proteomes of P. aeruginosa are also presented, with highlights on T6SS global assembly. Moreover, these two sub-proteomes allowed the identification of a novel envelope-associated complex with macroglobulin-like protein, MagD. The studies concerning this protein and its partners in P. aeruginosa are also presented in this manuscript.
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Vliv posttranslačních modifikací minoritních proteinů a acetylace mikrotubulů na průběh infekce myším polyomavirem / The role of posttranslational modifications of minor proteins and acetylation of microtubules in mouse polyomavirus infection

Mariničová, Zuzana January 2017 (has links)
Mouse polyomavirus (MPyV) capsid is composed of the main capsid protein VP1 and minor capsid proteins VP2 and VP3. Minor proteins are not essential capsid assembly, but they are key for efficient viral infection. The first part of this thesis studies the modifications of VP2 and VP3, the deamidation of Asn at 253 of VP2 (137 of VP3) and N-terminal acetylation of Ala of VP3, which could be the cause of double bands for VP2 and VP3 on SDS-PAGE. Mutated genomes of MPyV N253D (Asn to Asp) and N253E (Asn to Glu) simulating deamidation and A117V (Ala to Val) with reduced acetylation were prepared previously. We prepared three isolations of the mutant viruses and we confirmed that the deamidation is the cause of the double bands. Mutant viruses were compared to the wild type in terms of efficiency of infection, but the role of deamidation could not be proven. Virus A117V is noninfectious either due to lowered acetylation or the substitution of amino acid at this position. This thesis also studies the role of -tubulin acetylation in the infection of MPyV. The role of -tubulin acetylation in viral infection is being investigated to find new antiviral strategies. Acetylation rises after MPyV infection, but this is not due to a change in mRNA expression of tubulin acetylating (TAT1) or deacetylating enzyme...
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Function and targets of the Urm1/Uba4 conjugation machinery in Drosophila melanogaster

Khoshnood, Behzad January 2017 (has links)
Posttranslational modification (PTM) of proteins is essential to maintain homeostasis and viability in all eukaryotic cells. Hence, besides the sequence and 3D folding of a polypeptide, modification by multiple types of PTMs, ranging from small molecular groups to entire protein modules, adds another layer of complexity to protein function and regulation. The ubiquitin-like modifiers (UBLs) are such a group of evolutionary conserved protein modifiers, which by covalently conjugating to target proteins can modulate the subcellular localization and activity of their targets. One example of such a UBL, is the Ubiquitin related modifier 1 (Urm1). Since its discovery in 2000, Urm1 has been depicted as a dual function protein, which besides acting as a PTM, in addition functions as a sulfur carrier during the thio-modification of a specific group of tRNAs. Due to this dual capacity, Urm1 is considered as the evolutionary ancestor of the entire UBL family. At present, it is well established that Urm1, with help of its dedicated E1 enzyme Uba4/MOCS3, conjugates to multiple target proteins (urmylation) and that Urm1 thus plays important roles in viability and the response against oxidative stress. The aim of this thesis has been to, for the first time, investigate the role of Urm1 and Uba4 in a multicellular organism, utilising a multidisciplinary approach that integrates Drosophila genetics with classical biochemical assays and proteomics. In Paper I, we first characterized the Drosophila orthologues of Urm1 (CG33276) and Uba4 (CG13090), verified that they interact physically as well as genetically, and that they together can induce urmylation in the fly. By subsequently generating an Urm1 null Drosophila mutant (Urm1n123), we established that Urm1 is essential for viability and that flies lacking Urm1 are resistant to oxidative stress. Providing a molecular explanation for this phenotype, we demonstrated an involvement of Urm1 in the regulation of JNK signaling, including the transcription of the cytoprotective genes Jafrac1 and gstD1. Besides the resistance to oxidative stress, we have moreover (Manuscript IV) made an in-depth investigation of another phenotype displayed by Urm1n123 mutants, an overgrowth of third instar larval neuromuscular junctions (NMJs), a phenotype which is shared also with mutants lacking Uba4 (Uba4n29). To increase the understanding of Urm1 in the fly, we next employed a proteomics-based approach to identify candidate Urm1 target proteins (Paper II). Using this strategy, we identified 79 Urm1-interacting proteins during three different stages of fly development. Of these, six was biochemically confirmed to interact covalently with Urm1, whereas one was found to be associated with Urm1 by non-covalent means. In Manuscript III, we additionally identified the virally encoded oncogene Tax as a target of Urm1, both in Drosophila tissues and mammalian cell lines. In this study, we established a strong correlation between Tax urmylation and subcellular localization, and that Urm1 promoted a cytoplasmic accumulation and enhanced signalling activity of Tax, with implications for a potential role of Urm1 in Tax-induced oncogenesis. Taken together, this thesis provides a basic understanding of the potential roles and targets of Urm1 in a multicellular organism. The four studies included cover different aspects of Urm1 function and clearly points towards a highly dynamic role of protein urmylation in fly development, as well as in adult life.
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Tau protein, biomarker Alzheimerovy choroby: in vitro fosforylace a charakterizace tau reaktivních protilátek / Tau protein, a biomarker of Alzheimer's disease: in vitro phosphorylation and tau-reactive antibodies characterization

Hromádková, Lenka January 2018 (has links)
Tau protein, a microtubule-associated protein localized in axonal projections of neurons, is a key molecule in the pathology of Alzheimer's disease (AD), the most common cause of dementia in the elderly population. Tau belongs to the group of natively unfolded proteins without globular structure and is prone to numerous posttranslational modifications (PTMs). Under pathological conditions, abnormal PTMs and misfolding of tau protein occurs and leads to oligomerization and aggregation into paired helical filaments forming neurofibrillary tangles, the histopathological hallmark of AD. Currently available drugs applied in AD treatment can only slow the disease progression and those, which halt the AD-specific neurodegenerative processes, are still missing. Very promising and evolving therapeutic approach is immunotherapy, and even immunomodulation by administration of intravenous immunoglobulin (IVIG) products, a reservoir of natural antibodies from the plasma of healthy donors, has been already tested. The discovery of naturally occurring antibodies directed to tau (nTau-Abs) in body fluids of both AD and healthy subjects and their presence in IVIG begin the investigation of their therapeutic potential. Considering a wide range of possible modifications of tau and of various tau species (oligomers,...
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Identifizierung und funktionelle Charakterisierung mitochondrialer Proteinkinasen und-phosphatasen in Saccharomyces cerevisiae

Gey, Uta 16 November 2012 (has links)
Über die Proteinphosphorylierung in den Mitochondrien der Hefe Saccharomyces cerevisiae ist im Gegensatz zu anderen Kompartimenten nur wenig bekannt. Insbesondere hinsichtlich der physiologischen Bedeutung sowie den an der Modifikation beteiligten Enzymen sind kaum Daten verfügbar. Vor diesem Hintergrund stand die Identifizierung und molekularbiologische Charakterisierung mitochondrialer Proteinkinasen (PKasen) und Proteinphosphatasen (PPasen) im Fokus dieser Arbeit. Unter Verwendung komparativer 2D DIGE-Analysen konnten zwei Strategien erfolgreich verfolgt werden: Zum einen wurde die Konsequenz einer Gendeletion von ausgewählten PKasen bzw. PPasen mit putativer mitochondrialer Lokalisation untersucht. Dabei gelang es, die an der in vivo Regulation des Pyruvatdehydrogenase(PDH)-Komplexes beteiligten Enzyme erstmalig zu identifizieren und im Folgenden deren regulatorisches Zusammenspiel umfassend zu analysieren. Zum anderen wurde in einem inversen Ansatz beispielhaft für die PKase Sat4p untersucht, welche Auswirkungen eine Überexpression dieser Kinase auf das mt Proteom hat. Erste Hinweise, welche zur Identifizierung der PDH-Kinasen (Pkp1p und Pkp2p) bzw. PDH Phosphatasen (Ppp1p und Ppp2p) führten, lieferten die signifikanten Spotänderungen von Pda1p (E1α-Untereinheit des PDH-Komplexes) in den 2D-DIGE-Analysen. Im Folgenden wurde die mitochondriale Lokalisation der vier regulatorischen Enzyme unter Verwendung Epitop-getaggter Varianten nachgewiesen sowie Pda1p in unabhängigen phosphospezifischen Analysen als Target der Phosphorylierung verifiziert. Die Phosphorylierungsstelle von Pda1p konnte massenspektrometrisch dem Serin313 zugeordnet werden. PDH-Aktivitätsmessungen zeigten, dass die Phosphorylierung von Pda1p den PDH Komplex inaktiviert, während eine Dephosphorylierung zur Aktivierung führt. Dabei war der Einfluss der Deletion der PDH Kinasen bzw. der PDH-Phosphatasen unterschiedlich stark ausgeprägt. Während Ppp1p und Ppp2p partiell redundante Funktionen besitzen, lassen die Analysen komplementäre Aktivitäten von Pkp1p und Pkp2p vermuten. Eine physikalische Interaktion der beiden Kinasen wurde in vivo nachgewiesen und deutet auf die Bildung funktioneller Heteromere hin. Durch Analysen in der 2D-BN/SDS-PAGE konnte eine Assoziation der PDH-Kinasen sowie PDH-Phosphatasen mit dem hochmolekularen, etwa 8 MDa großen PDH-Komplex sowie mit PDH-Subkomplexen geringeren Molekulargewichts gezeigt werden. Die Erkenntnisse dieser Arbeit ermöglichten in Verbindung mit denen eigener Vorarbeiten die Erstellung eines Modells zur PDH-Regulation in Saccharomyces cerevisiae. Neben der Aktivitätsregulation durch die von Pkp1p/Pkp2p bzw. Ppp1p/Ppp2p katalysierte Phosphorylierung wird eine Funktion der regulatorischen Enzyme – insbesondere der PDH-Kinasen – an der Assemblierung bzw. Stabilisierung des PDH-Komplexes postuliert. Es konnte somit gezeigt werden, dass in der Hefe ein ähnlicher, aber nicht identischer Regulationsmechanismus vorliegt wie in höheren Eukaryoten. Die zweite Strategie, welche in dieser Arbeit exemplarisch für eine PKase verfolgt wurde, führte zur Identifikation einer bislang unbekannten Funktion der Kinase Sat4p in den Mitochondrien. Es konnte gezeigt werden, dass Sat4p dual lokalisiert in der cytoplasmatischen sowie mitochondrialen Fraktion vorliegt und selbst Target der Phosphorylierung ist. Die Überexpression von Sat4p führte nicht nur zu einem verminderten Wachstum auf nicht fermentierbaren Medien, sondern auch zur Beeinflussung spezifischer mitochondrialer Proteingruppen. Während die Spots der Proteine Pil1p und Lsp1p eine höhere Intensität zeigten, wiesen die Fe/S-Proteine Aco1p und Lys4p eine verminderte „steady-state“-Konzentration auf. Darüber hinaus lagen die Proteine, welche Liponsäure als prosthetische Gruppe tragen (Lat1p, Kgd2p und Gcv3p), im Tet-Sat4-Stamm vorwiegend in ihrer nicht-lipoylierten Form vor. Die Lipoylierungsstellen aller drei Proteine konnten im Wildtyp unter Nutzung von nanoLC-MS/MS erstmals experimentell bestimmt und Lys75 (Lat1p), Lys114 (Kgd2p) bzw. Lys102 (Gcv3p) zugeordnet werden. Die fehlende Lipoylierung der Proteine bzw. die verminderte Proteinkonzentration der Aconitase führte zu einer stark verminderten Aktivität der betroffenen Enzymkomplexe. Neben den in der Literatur beschriebenen putativen Funktionen von Sat4p bei der Regulation cytoplasmatischer Proteine wurde basierend auf den Erkenntnissen der Analysen eine spezifische Funktion der Kinase in den Mitochondrien postuliert. Das Modell schlägt eine Rolle von Sat4p in den späten Schritten der Maturation einer spezifischen Gruppe von mitochondrialer Fe/S-Proteinen vor. Die Beeinträchtigung der Lipoatsynthase Lip5p, welche neben Aco1p und Lys4p ebenfalls zu dieser Gruppe gehört, führt vermutlich sekundär zum beobachteten Verlust der Lipoylierung von Lat1p, Kgd2p und Gcv3p.
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Characterization of posttranslational modification of 19 kDa protein expressed by Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis

Spinelli, Natalia 01 January 2008 (has links)
Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) is the causative agent of Johne's disease, a chronic enteritis in ruminants, and has recently been linked to Crohn's disease in humans. To generate an effective vaccine against MAP, it is necessary to identify MAP antigens that trigger protective immunity. Unfortunately, not much is known about MAP proteins despite decades of research. We have previously shown that a 4.8 kb insert from MAP will produce a 16 kDa recombinant protein when expressed in Escherichia coli and 19 kDa recombinant protein when expressed in M smegmatis ( smeg 19K). The difference of 3 kDa in size of these expressed proteins may be related to posttranslational modificatjons that occur in Mycobacterium species. We hypothesized that smeg19K is a lipoglycoprotein since blast analysis revealed approximately 76 % amino acid identity between the MAP 19 kDa protein and a known lipoglycoprotein, the 19 kDa protein of M tuberculosis. This prediction was confirmed following positive staining of smeg19K with Sudan Black 4B, a postelectrophoresis dye used to stain for lipids. Smeg 19K has also stained positively for glycosylation with the lectin concavalin A, a highly specific stain for mannose residues. As expected, treatment with tunicamycin (an antibiotic known to inhibit N-glycosylation) and treatment with deglycosylation assay (non-specific for mannose ), showed no reduction in size of 19 kDa glycolipoproteins. Since covalent modification of proteins with acyl or glycosyl moieties alter immunogenicity and/or pathogenicity, the study here provides foundation for future experiments regarding the antigenicity of MAP 19 kDa lipoglycoprotein and its role in disease pathogenicity.
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Insulin-Like Growth Factor Binding Protein-6: Posttranslational modifications and sorting in polarized MDCK cells / Insulin-ähnlicher Wachstumsfaktor Bindungsprotein 6: Posttranslationale Modifikationen und Sortierung in polarisierten MDCK Zellen

Shalamanova-Malinowski, Liliana Dimitrova 30 October 2001 (has links)
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