Submitted by WILLIAM DE MEDEIROS SILVA null (wil_medeiros@hotmail.com) on 2016-04-25T23:25:09Z No. of bitstreams: 1 William de Medeiros Silva2.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-04-26T17:08:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_wm_me_ilha.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-26T17:08:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_wm_me_ilha.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Para aumentar a eficiência da seleção de indivíduos superiores, o uso de delineamentos experimentais e de métodos adequados de seleção são fundamentais. Este trabalho teve como objetivo verificar a influência de dois tamanhos de parcelas experimentais e comparar os ganhos obtidos com três índices de seleção e seleção direta e indireta aplicados aos valores genotípicos individuais em testes de progênies de E. camaldulensis, para os caracteres forma de fuste, DAP e altura total das árvores. O EXP 1 e EXP 2 foram implantados em delineamento de blocos casualizados, com 133 progênies e espaçamento de 3,0 m x 1,8 m. O EXP 1 foi composto por parcelas experimentais de 5 plantas e quatro repetições e no EXP 2 utilizou-se uma planta por parcela e 20 repetições. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidas utilizando o método REML/BLUP. Os indivíduos foram selecionados com base nos valores genéticos aditivos individuais, por meio de seleção direta e indireta dos caracteres e por meio dos índices de seleção da soma de postos, dos ganhos genéticos esperados e do somatório Z. O experimento com uma planta por parcela se mostrou mais eficiente na seleção, proporcionando ganhos superiores para caracteres de crescimento e similares para forma de fuste, sendo recomendado para testes de progênies do gênero Eucalyptus. O EXP 2 proporcionou maiores ganhos genéticos com a seleção devido à maior herdabilidade estimada. Os índices de seleção da soma de postos e do somatório Z foram os mais eficientes com ligeira superioridade do índice da soma de postos em função da maior facilidade da seleção. / In order to increase the efficiency of selection of superior individuals, the use of experimental design and appropriate selection methods are crucial. This study aimed to investigate the influence of two sizes of plots and compare the gains made with three levels of selection, direct and indirect selection applied to individual genotypic values in E. camaldulensis progeny tests for the variables stem shape, DAP and total height of the trees. The EXP 1 and EXP 2 were established in a randomized complete block design with 133 progenies and spacing of 3.0 m x 1.8 m. The EXP 1 consisted of plots of 5 plants and four replications, and EXP 2 used a plant per plot and 20 replications. Estimates of variance components and genetic parameters were obtained using the REML / BLUP method. Those individuals were selected based on individual genetic additive values, through direct and indirect selection of characters and through the selection indexes of rank, the expected genetic gains and the sum Z. The experiment with one plant per plot was more efficient in the selection, providing superior gains for growth traits and similar to stem shape, being the right one for Eucalyptus progeny tests. In EXP 2 larger genetic gains were obtained with selection due to higher estimated heritability. The selection index of the rank and the sum Z were the most effective with slight superiority index of rank, due to the greater ease of selection by this index.

Orientador: Bruno Ettore Pavan / Resumo: Para aumentar a eficiência da seleção de indivíduos superiores, o uso de delineamentos experimentais e de métodos adequados de seleção são fundamentais. Este trabalho teve como objetivo verificar a influência de dois tamanhos de parcelas experimentais e comparar os ganhos obtidos com três índices de seleção e seleção direta e indireta aplicados aos valores genotípicos individuais em testes de progênies de E. camaldulensis, para os caracteres forma de fuste, DAP e altura total das árvores. O EXP 1 e EXP 2 foram implantados em delineamento de blocos casualizados, com 133 progênies e espaçamento de 3,0 m x 1,8 m. O EXP 1 foi composto por parcelas experimentais de 5 plantas e quatro repetições e no EXP 2 utilizou-se uma planta por parcela e 20 repetições. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidas utilizando o método REML/BLUP. Os indivíduos foram selecionados com base nos valores genéticos aditivos individuais, por meio de seleção direta e indireta dos caracteres e por meio dos índices de seleção da soma de postos, dos ganhos genéticos esperados e do somatório Z. O experimento com uma planta por parcela se mostrou mais eficiente na seleção, proporcionando ganhos superiores para caracteres de crescimento e similares para forma de fuste, sendo recomendado para testes de progênies do gênero Eucalyptus. O EXP 2 proporcionou maiores ganhos genéticos com a seleção devido à maior herdabilidade estimada. Os índices de seleção da soma de postos e do ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In order to increase the efficiency of selection of superior individuals, the use of experimental design and appropriate selection methods are crucial. This study aimed to investigate the influence of two sizes of plots and compare the gains made with three levels of selection, direct and indirect selection applied to individual genotypic values in E. camaldulensis progeny tests for the variables stem shape, DAP and total height of the trees. The EXP 1 and EXP 2 were established in a randomized complete block design with 133 progenies and spacing of 3.0 m x 1.8 m. The EXP 1 consisted of plots of 5 plants and four replications, and EXP 2 used a plant per plot and 20 replications. Estimates of variance components and genetic parameters were obtained using the REML / BLUP method. Those individuals were selected based on individual genetic additive values, through direct and indirect selection of characters and through the selection indexes of rank, the expected genetic gains and the sum Z. The experiment with one plant per plot was more efficient in the selection, providing superior gains for growth traits and similar to stem shape, being the right one for Eucalyptus progeny tests. In EXP 2 larger genetic gains were obtained with selection due to higher estimated heritability. The selection index of the rank and the sum Z were the most effective with slight superiority index of rank, due to the greater ease of selection by this index. / Mestre

Orientador: Edson Seizo Mori / Banca: Edson Seizo Mori / Banca: Mauricio Dutra Zanotto / Banca: Léo Zimback / Resumo: O pinhão manso (Jatropha curcas L.) é uma espécie perene com grande potencial para produção de biodiesel, pois apresenta rápido crescimento é de fácil cultivo e com capacidade de adaptação às diversas condições edafoclimáticas. O presente trabalho tem como objetivo avaliar, por meio de teste de progênies, a variabilidade genética de progênies de pinhão manso para as características de crescimento: altura, diâmetro do colo e número de ramos. Foi implantado um teste de progênies na Fazenda São Manuel, localizada no município de São Manuel - SP, pertencente à Faculdade de Ciências Agronômicas, UNESP, Campus de Botucatu. O espaçamento utilizado foi de 4,0 x 2,5 m, em blocos casualizados. Foram analisadas altura, diâmetro da base e número de ramos das plantas de 28 progênies, procedentes principalmente da EPAMIG, e obtidas às estimativas de parâmetros genéticos. As médias de altura e diâmetro foram aos seis meses de 52,38 e 2,91, aos 12 meses 68,87 e 3,98, aos 18 meses 82,31 e 4,23 e aos 24 meses 108,78 e 5,04, respectivamente. Detectou-se diferença estatística pelo Teste F, em nível de 5% de probabilidade, indicando haver variabilidade entre as progênies. As estimativas dos coeficientes de variação genética individual (CVgi) e coeficiente de variação genética de progênies (CVgp) aos 24 meses foram de 26,7 e 13,4% para altura; 15,1 e 7,5% para diâmetro e 21,2 e 10,6% para número de ramos, respectivamente. As estimativas de herdabilidade média de progênies () aos 24 meses foi de 0,36 para altura; 0,35 e para diâmetro e 0,42 para número de ramos, respectivamente. Os resultados obtidos indicam que as progênies de pinhão manso apresentam variabilidade genética para os caracteres avaliados, mostrando potencial para serem utilizadas em programas de melhoramento genético / Abstract: The jatropha (Jatropha curcas L.) is a perennial species with a great potential for biodiesel production, as it offers rapid growth, moreover it is easy to be cultivated and it has a high capacity of adaptability to various soil and climatic conditions. The objective of this research is to evaluate, by progeny test, the genetic variability for the following characteristics of jatropha's progenies; growth, height diameter and number of branches. It has been implanted a progeny test, at São Manoel's farm, located in São Manoel - São Paulo, belonging to the Faculdade de Ciencias Agronomicas, UNESP, Botucatu. The experimental design was random blocs 4,0 x 2,5 m. The project analyzed height, diameter, number of branches of 28 progenies of plants, coming mainly from EPAMIG, and as a result the project obtained estimates of genetic parameters. The average height and diameter in the first six months were 52.38 and 2.91, at twelfth month were 68,87 and 3,98, at eighteenth month were 82,21 and 4,23 and at twenty-fourth month were 108,78 and 5,04. Statistical difference was detected by a F test at 5% level of probability, it indicates variability among the progenies. The coefficient estimates of individual genetic variation and genetic variation of progenies at twenty-fourth months were 26.7 and 13.4% for height, 15,1 and 7,5% for diameter 21.2 and 10.6% for number of branches, respectively. Estimates of heritability at twenty-fourth months were 0.36 for height, 0.35 for diameter and 0.42 for number of branches, respectively. The results obtained indicate that the progenies of jatropha present genetic variability for traits showing potential to be used in breedind programs / Mestre

Submitted by Alisson Mota (alisson.davidbeckam@gmail.com) on 2015-06-30T18:13:54Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Crystianne Bentes Barbosa Ferreira.pdf: 301180 bytes, checksum: a49848cd7e2915eeac3200451e77f4fc (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-01T15:26:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Crystianne Bentes Barbosa Ferreira.pdf: 301180 bytes, checksum: a49848cd7e2915eeac3200451e77f4fc (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-01T15:30:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Crystianne Bentes Barbosa Ferreira.pdf: 301180 bytes, checksum: a49848cd7e2915eeac3200451e77f4fc (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-01T15:30:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Crystianne Bentes Barbosa Ferreira.pdf: 301180 bytes, checksum: a49848cd7e2915eeac3200451e77f4fc (MD5) Previous issue date: 2009-04-30 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The palm (Elaeis guineensis Jacd) is a palm of great potential for sustainable agricultural development in the Amazon region, bringing social benefits, economic and environmental. The availability of varieties with high productivity and better adapted to the conditions of cultivation has a fundamental role in sustainable development of culture in this sense, one can resort to the use of biotechnology to increase the efficiency improvement programs. Microsatellite markers are tools preferred by breeders, because they are multi-allelic, has codominantes expression and show Mendelian inheritance, facilitating genetic analysis. Knowledge of the distribution of genetic variability within and between populations of palm, through the use of molecular markers, provide information for the implementation of plans for use and conservation of genetic resources of this species. From the results of that work can get grants for improving the palm at Embrapa Amazônia Ocidental, to provide the seed culture for the establishment of plantations with high productivity of oil. Samples were collected from 24 progenies of palm held at the Center for Experimental de palm the River Urubu (CERU) - Embrapa Amazônia Ocidental, and 22 progenies from self and two crosses between full siblings. There is low genetic variability in the progenies, with an average of five alleles per loci and total diversity (HT) equal to 0.0774. Of the four loci studied the site mEgCIR0254 had set in all the progenies and progenies LM11592, LM11547, LM11732, LM12366, LM13533, LM12826, LM11591 and PO393612, were fixed in all loci. These data were expected, they are progenies from self or full brother. The observed heterozygosities (Ho) the whole plant were lower than expected heterozygosity (He) in all loci, suggesting strong excess of homozygotes, indicating existence of a process endogamic. As the palm is allogamy plant and the progeny are genetically relatives, and autofecundadas, it is expected that the effects of inbreeding interfere directly in the indices of heterozygosity, contributing to the uniformity of the progenies. The AMOVA detected 62.99% of total variation among the progenies and 37.01% within progenies. Contrary to what has been observed in plants allogamy either in natural populations or collections of germplasm, where the greatest variability has been found within populations / provenances than between them, this paper notes that most of the variation was retained among the progeny, that is to be expected, because 91.67% of these are from self. / O dendê (Elaeis guineensis Jacd) é uma palmeira de grande potencial para o desenvolvimento agrícola sustentável da região Amazônica, trazendo benefícios sociais, econômicos e ambientais. A disponibilidade de variedades com alta produtividade e melhores adaptadas às condições de cultivo tem papel fundamental na sustentabilidade do desenvolvimento dessa cultura. Para este fim o conhecimento da distribuição da diversidade genética entre e dentro das progênies de dendezeiro, por meio do uso de marcadores moleculares microssatélites fornecerá informações para a implementação de planos de uso e conservação dos recursos genéticos dessa espécie . O objetivo desse trabalho foi estimar parâmetros de diversidade genéticos entre e dentro progênies de dendezeiro utilizadas na produção de sementes comerciais da Embrapa Amazônia Ocidental (Manaus-AM) . . Foram analisadas 24 progênies de dendezeiro que estão mantidas no Campo Experimental de Dendê do Rio Urubu (CERU) - Embrapa Amazônia Ocidental, sendo 22 progênies provenientes de autofecundação e duas de cruzamentos entre irmãos completos utilizando quatro loci SSR. Os dados obtidos foram analisados no Programa Genes e, através das análises verificou-se que existe baixa variabilidade genética nas progênies, com média de cinco alelos por loci e diversidade total (HT) igual a 0,0774. Dos quatro loci estudados o loco mEgCIR0254 apresentou fixado em todas as progênies e as progênies LM11592, LM11547, LM11732, LM12366, LM13533, LM12826, LM11591 e PO393612 apresentaram-se fixadas em todos os loci, devido principalmente serem progênies oriundas de autofecundação ou de irmão completos. As heterozigosidades observadas (Ho) no conjunto de plantas foram inferiores a heterozigosidade esperada (He) em todos os loci, sugerindo forte excesso de homozigotos, indicando existência de um processo endogâmico. Como o dendezeiro é planta alógama e as progênies serem geneticamente aparentadas, e ainda autofecundadas, é de se esperar que os efeitos da endogamia interfiram diretamente nos índices de heterozigose, contribuindo para a homogeneidade das progênies. A AMOVA detectou 62,99% do total da variação entre as progênies e 37,01% dentro das progênies. Ao contrário do que tem sido observado em plantas alógamas, seja em populações naturais ou coleções de germoplasmas, onde a maior variabilidade tem sido encontrada dentro das populações/procedências do que entre as mesmas, neste trabalho observa-se que a maior parte da variação ficou retida entre as progênies, isso é de se esperar, pois 91,67% destas são oriundas de autofecundação.

Submitted by Inês Marinho (bele_ballet@hotmail.com) on 2016-06-17T13:49:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-06-23T20:43:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-06-23T20:45:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-23T20:45:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) Previous issue date: 2014-03-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The guarana (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native species from the Amazon region rich in natural caffeine. Embrapa Western Amazon develops guarana breeding program based on clonal selection and recurrent selection to obtain cultivars and progenies with desirable agronomic characteristics. The use of molecular markers has been successfully applied in breeding programs to monitor genetic diversity and assist in marker-assisted selection. Thus, the present study aims to evaluate the genetic diversity of guarana improvement program, using TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) and the SRAP (Sequence-Related Amplification Polymorphism). The work was divided into two parts: the first to test the potential of TRAP and SRAP markers, using subsamples of 60 BAG (Active Germplasm Bank) and the second to analyze the genetic diversity six progenies of half brothers guarana. In the BAG a polymorphism observed percentage of 79% (TRAP) and 74.5% (SRAP). The Dice coefficient ranged from 0.64 to 0.87, forming four groups in the dendrogram, where one concentrated 82% of the studied material. In the progenies of half brothers, polymorphism percentage was 85% for the TRAP and 76% for SRAP. The genetic diversity of Nei (H) was 0.20 and the Shannon index (I) of 0.30. The AMOVA showed that the highest percentage of variation is within the progenies (54%). With these results, the TRAP and SRAP markers showed potential genetic diversity studies in guarana breeding program. / O guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma espécie nativa da região amazônica rica em cafeína natural. A Embrapa Amazônia Ocidental desenvolve programa de melhoramento de guaranazeiro baseado em seleção clonal e seleção recorrente para obtenção de cultivares e progênies com características agronômicas desejáveis. O uso de marcadores moleculares tem sido aplicado com sucesso em programas de melhoramento para monitorar a diversidade genética e auxiliar na seleção assistida por marcadores. Com isso, a presente pesquisa visa avaliar a diversidade genética do programa de melhoramento do guaranazeiro, usando TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) (Sequence - Related e o SRAP Amplification Polymorphism). O trabalho foi dividido em duas partes: a primeira para testar o potencial dos marcadores TRAP e SRAP, usando 60 subamostras do BAG (Banco Ativo do Germoplasma) e a segunda para análise da diversidade genética de seis progênies de meios-irmãos de guaranazeiro. No BAG observou-se um percentual de polimorfismo de 79% (TRAP) e 74,5% (SRAP). O coeficiente de Dice variou de 0,64 a 0,87, formando quatro grupos no dendrograma, onde um deles concentrou 82% do material estudado. Nas progênies de meios irmãos, o percentual de polimorfismo foi 85% para o TRAP e 76% para SRAP. A diversidade genética de Nei (H) foi de 0,20 e o índice de Shannon (I) de 0.30. A AMOVA mostrou que o maior percentual de variação se encontra dentro das progênies (54%). Com estes resultados, os marcadores TRAP e SRAP mostraram potencial em estudos de diversidade genética no programa de melhoramento de guaranazeiro.

A tendência atual, imposta pela competitividade do mercado, exige bovinos mais eficientes e adequados ao sistema de produção, visando atender a demanda pela qualidade de carne. Em função disso, o melhoramento genético vem sendo utilizado, de forma a incrementar a eficiência dos rebanhos, proporcionando assim, maior rentabilidade ao sistema. Assim, o presente estudo foi conduzido com o propósito de estudar a variabilidade da progênie de touros submetidos à avaliação genética, através da análise das Diferenças Esperadas na Progênie (DEP) dos filhos de 359 reprodutores. As DEP das progênies foram estimadas por procedimentos REML e as avaliações de touros por metodologias alternativas, foram realizadas com o auxílio do software SAS. Foram utilizados 45.014 dados de peso à desmama (PD), 45.014 de peso ao sobreano (PS) e 45.014 de ganho de peso da desmama ao sobreano (GP) de bovinos de corte da raça Nelore, criados em uma fazenda em região tropical do Brasil. As DEPs dos touros foram estimadas de acordo com três métodos: uso da média aritmética, média harmônica acrescida da média da característica estudada e média harmônica simples. Os resultados sugerem que o uso da média harmônica na estimação de DEPs com o objetivo de ajustar o valor genético aditivo de um touro para a dispersão dos valores genéticos de suas progênies não trouxe diferenças importantes em relação à estimativa pela média aritmética, na população estudada. No entanto, dadas as implicações e importância de novas metodologias, são necessários maiores estudos em busca de se encontrar uma metodologia que permita maior uniformidade das progênies de touros. / The strong competition in beef market imposed an actual trend of searching for quality in beef production systems, trying to attend the consumers\' demand. Due to the necessity of increasing productivity, animal breeding programs have been utilized to increase cattle efficiency, offering more profitability to the production system. The present study was carried out to contribute to knowledge about sires\' progeny variability, using Expected Progeny Difference (EPD) from calves of 359 sires. EPD\'s were estimated by REML procedures. The prediction od bull\'s EPD\'s were performed by software SAS, using 45,014 data of weaning weight (PD), 45,014 of post-weaning weight (PS) and 45,014 of weight gain post-weaning (GP) from Nellore beef cattle, raised in a tropical area of Brazil. Those data were analyzed according with three methods: application of arithmetic mean, harmonic mean of EPD added by trait mean and only harmonic mean. Results suggested that estimation of EPDs using harmonic mean on condition that adjust sire\'s additive genetic value to dispersion form its calves\' genetic values did not make difference to the prediction trough arithmetic mean in the population studied. Due to the implications and importance of alternative methods to adjust bull\'s EPDs to variability of progeny, further studies are necessary to search for better progeny\'s uniformity.

Os marcadores moleculares têm sido frequentemente utilizados em estudos sobre a diversidade e a estrutura genética populacional. A introdução dos marcadores moleculares revolucionou a genética de populações na década de 50, com a técnica de isoenzimas e recentemente tem conseguido enormes avanços com a aplicação de tecnologias baseadas em DNA. Os marcadores moleculares baseados em DNA permitiram uma ampla cobertura genômica e tornaram-se poderosas ferramentas para estudos de genética de populações. Marcadores codominantes têm sido muito utilizados na genética de populações por serem mais informativos que os marcadores dominantes. O objetivo principal deste trabalho foi utilizar marcadores dominantes com o intuito de contornar o problema da dominância. Para isso, foram utilizadas neste trabalho progênies para genotipagens com RAPD visando inferir o genótipo das plantas matrizes. Foi encontrando um valor de variação entre populações de plantas jovens, igual a ST f ˆ =0,328. E estimativa similar a esta, foi calculada com os dados de freqüências alélicas das plantas matrizes, obtendo-se um valor de ST F ˆ =0,318. O objetivo secundário deste trabalho foi gerar várias estimativas de parâmetros populacionais com a finalidade de comparar os diferentes tipos de marcadores moleculares. Foram comparadas as estimativas relacionadas ao sistema reprodutivo ( tˆ ), heterozigozidade esperada ( e H ˆ ) e observada ( o H ˆ ), estatísticas F de Wrigth, o parâmetro ST f ˆ e dendrogramas obtidos com os diferentes tipos de marcadores (SSR, RAPD e isoenzimas) em diversas abordagens. A taxa de cruzamento ( tˆ ) obtida com os diferentes tipos de marcadores foram congruentes, sendo que a menor foi encontrada com isoenzimas utilizando progênies ( m tˆ =0,835), e a maior obtida com marcadores SSR ( a tˆ =1,07) utilizando indivíduos adultos. Isto levou a concluir que a espécie é alógama ou com tendência para alogamia. Com relação à estrutura genética e o fluxo gênico as estimativas não foram inteiramente concordantes. A menor estimativa de divergência foi obtida com marcadores isoenzimáticos ( p q ˆ =0,154, Nm=1,370) e a maior com RAPD ( ST f ˆ =0,328, Nm=0,512). Porém é importante ressaltar, que estas estimativas não são diretamente comparáveis, pois são obtidas de maneiras diferentes e com dados de progênies ou adultos. Quanto à estruturação da variabilidade visualizada através de agrupamentos, observou-se que os dendrogramas apresentam um padrão concordante sendo que a maior sensibilidade (maior amplitude de distâncias) foi obtida com os dados de SSR. Além disso, foram feitas correlações entre as matrizes de distâncias genéticas e geográficas e entre as matrizes de distâncias genéticas (correlações entre os diferentes marcadores). Estas correlações foram altas indicando que todos os marcadores amostram bem o genoma. Este estudo permitiu comparar dados de duas gerações e uma metodologia diferente para análise de dados com marcadores dominantes, sem impor restrições nos modelos (f =1 ou f =0). Pôde-se concluir que houve congruência entre as estimativas dos parâmetros populacionais obtidas com os diferentes tipos de marcadores, embora tenha ocorrido algumas discrepâncias como foi o caso da estimativa de fluxo gênico com marcadores isoenzimáticos. Apesar de os marcadores possuírem diferentes naturezas todos foram igualmente informativos para este estudo populacional, inclusive os dominantes quando foram usados dados de duas gerações. / Molecular markers have frequently been used in studies on diversity and population genetic structure. The introduction of the these markers revolutionized the genetics of populations in the decade of 50 with the isoenzimes technique and recently enormous progresses have been achieved with the application of technologies based on DNA. Molecular markers based on DNA allowed a wide coverage of the genome and therefore became a powerful tool for these studies. Codominant markers, being more informative than the dominant ones are now being widely used. The main objective of this work was to use dominant (RAPD) markers overcomming the problem of dominance through progeny testing. Offspring were genotyped in order to infer the maternal genotype. Using the AMOVA procedure the variation value found among populations of seedlings was equal to ST f ˆ =0.328. The corresponding F statistic, based on allelic frequencies of seed parents, was ST F ˆ =0.318. The second objective of this work was to obtain different estimates of population parameters with the purpose of comparing the different types of molecular markers. In addition to Wright’s F statistics, estimates related to the reproductive system (tˆ ), expected ( e H ˆ ) and observed heterozigozities ( o H ˆ ) and dendrograms obtained with markers SSR, RAPD and isoenzimes were compared. The outcrossing rate ( tˆ ) obtained agreed reasonably well, and the smallest value was found with isozymes using progenies ( m tˆ =0.835), and the largest one, obtained with SSR markers ( a tˆ =1.07) using adult individuals. The results led to a conclusion that the species is allogamic or with tendency to allogamy. Estimates related with the genetic structure and gene flow, however, were not entirely congruent. The smallest divergence estimate was obtained with isozymes ( p q ˆ =0.154, Nm=1.370) and the largest one with RAPD ( ST f ˆ =0.328, Nm=0.512). It is important to point out, that these estimates are not directly comparable, due to the difference in the underlying model and the basic material used (progenies or adults). About the structuring of the variability visualized through groupings, dendrograms presented a congruent pattern and the largest sensibility (larger range of distances) was obtained with SSR data. In addition, correlations were calculated among the matrices of genetic and geographical distances and among the matrices of genetic distances obtained from the different markers. High correlations were verified among these matrices, indicating that all markers sampled well the genome under study. This study allowed to compare data of two generations and a different methodology for data analysis with dominant markers, without imposing restrictions on the model ( f =1 or f =0). It could be concluded that a reasonable consistency was verified among the population parameters obtained with different types of markers, although some discrepancies existed as in the case of estimates of gene flow with isozymes markers. In spite of their different origins, the markers used here were equally informative for this population study, including the dominant one, when data of two generations were used.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This study was conducted to investigate the effect of aflatoxins consumption (AFL), in broiler breeders of different strains. To evaluate reproductive and productive aspects of broiler breeders intoxicated with AFL were used 660 females and 60 males, distributed in a completely randomized design with factorial arrangement with three levels of AFL (0.0, 0.50 and 1.0 mg/kg diet) and two strains, Cobb 500® (LA) and Hybro PG® (LB), totalizing six treatments with five replicates pens of 22 females and 2 males each. The period of intoxication was from 24th to the 64th weeks of age, from 65th to the 70th weeks; all birds were fed a AFL free diet, with the objective of assessing the residual effects. To evaluate the progenies, three experiments were performed from 1 to 21 days. Each one used 600 day old males, from eggs produced by the breeders of the experiment above, at 32, 48 and 64 weeks of age. For each experiment, the same design used in the evaluation of breeders was used, in a total of six treatments with 10 replicates of 10 males each. The laying rate was depreciated by the addition of AFL in the diet. This negative effect was more pronounced when it was added 1mg of AFL/kg, indicating a dose-dependent effect. LB breeders had higher eggs production than LA. Breeders from LA, intoxicated with 0.5mg AFL/kg diet, showed a greater reduction in egg production than birds LB, intoxicated with the same level of AFL. The hatching was not influenced by the AFL in the breeders diets. LB breeders had a poorest fertility and hatching. The hatchability of eggs from breeders intoxicated with 1mg AFL/kg of diet was the lowest, caused by an increase in embryo mortality in the third week of incubation. Evaluating the interaction among AFL and strains, there was a negative effect on the fertility rate only in the LB, when 0.5 or 1.0mg AFL/kg were added to the diets. The progeny from breeders intoxicated with 1mg AFL/kg diet had the lowest body weight at birth and 21 days, in the three experiments. LA breeders produced the heaviest chicks at birth and at 21 days. Studying the interaction AFL and strain, it was observed that AFL intoxication in LB did not affect progeny s initial weight, but in LA, there was a decrease in day old chicks weight produced by intoxicated breeders. The studied levels of AFL influenced negatively the performance of breeders and their progeny. The two strains showed different responses in some of the parameters studied, when they were fed with diets containing AFL. / Este estudo foi conduzido para investigar o efeito do consumo de aflatoxinas (AFL) por matrizes de corte de diferentes linhagens. Para avaliar aspectos produtivos e reprodutivos de matrizes de corte intoxicadas com AFL, foram utilizadas 660 fêmeas e 60 machos, distribuídas em delineamento inteiramente casualizado em arranjo fatorial, com três níveis de AFL (0,0; 0,50 e 1,0 mg/kg de dieta) e duas linhagens, Cobb 500® (LA) e Hybro PG® (LB), totalizando seis tratamentos com cinco repetições de 22 fêmeas e 2 machos cada. O período de intoxicação foi da 24ª à 64ª semana de idade, da 65ª à 70ª semana, todas as aves receberam dietas isentas de AFL, com a finalidade de avaliar efeitos residuais. Para avaliar as progênies, foram realizadas três avaliações de 1 a 21 dias. Cada uma utilizou 600 pintos machos de um dia, provenientes de ovos produzidos por matrizes do experimento acima, na 32ª, 48ª e 64ª semanas de idade. Para cada avaliação, foi adotado o mesmo delineamento utilizado na avaliação das matrizes, totalizando seis tratamentos com 10 repetições de 10 machos cada. A taxa de postura foi depreciada pela adição de AFL na dieta. Esse efeito negativo foi mais acentuado quando foi adicionado 1mg de AFL/kg, indicando um efeito dose dependente. Aves LB apresentaram uma produção de ovos superior a da LA. Matrizes LA, intoxicadas com 0,5mg AFL/kg de dieta, apresentaram uma redução maior na produção de ovos que aves LB, intoxicadas com o mesmo nível de AFL. A eclosão não foi influenciada pelas AFL na dieta das matrizes. Aves da LB apresentaram pior fertilidade, reduzindo a taxa de eclosão da mesma. A eclodibilidade de ovos provenientes de aves intoxicadas com 1mg AFL/kg de dieta foi inferior às demais, devido a um aumento da mortalidade embrionária na terceira semana de incubação. Avaliando a interação entre AFL e linhagens sobre a taxa de fertilidade, verificou-se uma redução desta na LB, quando 0,5 ou 1,0mg AFL/kg foram adicionadas às dietas. A progênie de matrizes intoxicadas com 1mg AFL/kg de dieta apresentou um peso corporal inferior às demais, no primeiro e 21º dia, nas três avaliações realizadas. Matrizes da LA produziram pintos mais pesados ao nascer e aos 21 dias. Estudando a interação AFL e linhagens, observou-se que a intoxicação por AFL em matrizes da LB não afetou o peso inicial da progênie, porém, na LA, observou-se um decréscimo no peso de um dia de pintos produzidos por matrizes intoxicadas. Os níveis de AFL estudados prejudicaram o desempenho das matrizes e de suas progênies. As duas linhagens apresentaram respostas distintas em alguns dos parâmetros estudados, quando as mesmas foram submetidas à dietas contendo AFL.

<p> A quantitative study is made of the relative sensitivity of Phaseolus vulgaris var. Pinto to several different growth retardants, and to treatment of retarded plants with GA3. The growth of progeny from retarded plants is exam!ned and the cause of the transfer phenomenon is determined to be transfer of the growth retardants themselves to the progeny via the seeds, in some cases through to a third generation. </p> / Thesis / Master of Science (MSc)

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