As novas biotecnologias em reprodução, como a transferência de embriões e a fecundação in vitro, de certo modo, despertaram nos produtores e pesquisadores da área de melhoramento animal o interesse na seleção de fêmeas, antes pouco explorada dada a grande ênfase empregada na seleção e avaliação de reprodutores machos. A cada ano é percebido que a pecuária de corte funciona como uma empresa e, como tal, deve-se preocupar com todos os detalhes e não enfocando apenas um, como o mais importante, e é com isso que o Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-USP) estuda cada vez mais um número maior de características como, stayability e suas possíveis aplicações à seleção das vacas Nelore, pois tem grande importância econômica. Com o objetivo de analisar a característica stayability sob enfoque Bayesiano, em registros de produção de vacas da raça Nelore, inicialmente foram implementados dois tamanhos de cadeia de Gibbs (225 ou 550 mil), dois períodos de descarte amostral (25 ou 50 mil) e duas formas de tomadas de amostra (a cada 1000 ou 250 rodadas). Os registros foram codificados como 0 (fracasso, ou menos de três partos até os 6 anos de idade) ou 1 (sucesso, ou pelo menos três partos até os 6 anos de idade) e os arquivos sofreram restrição ou não para NEP (Número Efetivo de Progênie), para número de touros dentro do grupo de contemporâneos (GC) e exclusão de grupos inteiros com média para a característica igual a 0 ou 1 (ou seja, sem variabilidade dentro do GC). Testaram-se três definições para GC. Utilizou-se o software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models), sob modelo unicaráter de touro-avô materno, para obtenção de componentes de (co)variância, estimativas de herdabilidade e soluções para cada touro (que originam as Diferenças Esperadas na Progênie - DEPs). As análises resultaram em amostras com baixa correlação serial, mostraram pequenas diferenças entre as estimativas pontuais de herdabilidade e alta correlação de rank para as DEPs dos 4180 touros avaliados. Adotou-se a implementação tamanho da cadeia/descarte amostral/amostragem como 225mil/25mil/1000 para as análises subseqüentes. A comparação entre estimativas de herdabilidade obtidas sob modelo de limiar e sob modelo linear não mostrou vantagens do primeiro, sendo que análises sob modelo linear, que têm reduzido tempo de processamento, poderiam ser preferidas quando houver muitos registros de produção, bastando transformar as estimativas de herdabilidade para escala subjacente. As comparações, sob modelo linear ajustadas para escala subjacente, entre a stayability padrão (0 ou 1) e a alternativa (considerando o número de partos até os seis anos de idade para aquelas vacas antes codificadas com valor 1), mostraram que podem ocorrer alterações na classificação de um número significativo de touros avaliados, mesmo sendo nas posições intermediárias do rank, talvez pela ligeira capacidade da característica alternativa em detectar variabilidade entre touros. Classificaram-se os 4180 touros em ordem decrescente e foram estudadas as genealogias dos 42 melhores (também chamados de TOP 1% ou aqueles que apresentam DEP para stayability superior a 57,6%) para identificar famílias importantes e avaliar a variabilidade genética da stayability. Além do touro Karvadi Imp. (essencialmente presente como avô, bisavô ou tataravô das mães dos touros TOP1%), outros genearcas com grande representatividade entre os TOP1% foram os touros Godhavari Imp. (via Kurupathy e Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã e Falo da BV (estes últimos pela via materna). / The new reproduction technologies like embryo transfer and in vitro fertilization brought to animal breeding researchers, and producers, a growing interest in the selection of females, which was a subject not well explored before, when the focus used to be only on evaluation and selection of males. The beef cattle industry is becoming more competitive each year, and the producers must think about all the aspects and details that can affect the production process. The PMGRN-USP (Nelore Breeding Program of the São Paulo University) studies a large number of traits to be used as selection criteria. Among these traits, there is stayability, which has a great economic importance. The aim of this project was to analyze the trait stayability, with a Bayesian approach, in a Nelore cattle population. Firstly, the implementation used two lengths of Gibbs chain (225 or 550 thousand), two periods of burn-in (25 or 50 thousand) and two thinning intervals (at each 1000 or 250 rounds). The cows were classified as 0 (failure, or less than three calves until six years of age), or 1 (success, or at least 3 calves until six years of age). The data were, or were not, restricted for NEP (Effective Number of Progeny), for number of sires in the contemporary group (GC), and for lack of variability in the contemporary group. Three different definitions of GC were tested. The software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models) was used, under an univariate sire-maternal grandsire model to get the (co)variance components, the heritability estimate and the solutions to each sire (that are used to get the Expected Progeny Differences - EPD). The results showed a low serial correlation in the samples, small differences among heritability estimates and a high rank correlation among the EPD estimates of the 4180 sires evaluated. The implementation 225000/25000/1000 was adopted to the subsequent analysis. The comparison between the heritability estimates obtained under the threshold model and the linear model didn’t show any advantage to the first. The analysis under linear models could be preferred because of its reduced processing time in large data sets, needing only a transformation of the heritability estimates to the underlying scale. The comparisons, under linear model adjusted to the underlying scale, between the standard stayalility (0 or 1) and the alternative (obtained from the perception of the fertility differences among the cows classified as 1) showed a variation in the position of a considerable number of sires in the rank, maybe because the alternative trait gets some additional variation among sires. 4180 sires were classified in a rank and the genealogies of the 42 best sires (or TOP 1%, or the ones with stayability EPD greater than 57,6%) were studied to identify major families and evaluate the genetic variation of stayability. Besides of Karvardi Imp (a bull very present as an ascendant (2, 3 or 4 generations) of the dams of the TOP1% sires), another founder sires with influence among the TOP1% were Godhavari Imp (via Kurupathy and Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã, and Falo da BV (the last two via maternal).

As novas biotecnologias em reprodução, como a transferência de embriões e a fecundação in vitro, de certo modo, despertaram nos produtores e pesquisadores da área de melhoramento animal o interesse na seleção de fêmeas, antes pouco explorada dada a grande ênfase empregada na seleção e avaliação de reprodutores machos. A cada ano é percebido que a pecuária de corte funciona como uma empresa e, como tal, deve-se preocupar com todos os detalhes e não enfocando apenas um, como o mais importante, e é com isso que o Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-USP) estuda cada vez mais um número maior de características como, stayability e suas possíveis aplicações à seleção das vacas Nelore, pois tem grande importância econômica. Com o objetivo de analisar a característica stayability sob enfoque Bayesiano, em registros de produção de vacas da raça Nelore, inicialmente foram implementados dois tamanhos de cadeia de Gibbs (225 ou 550 mil), dois períodos de descarte amostral (25 ou 50 mil) e duas formas de tomadas de amostra (a cada 1000 ou 250 rodadas). Os registros foram codificados como 0 (fracasso, ou menos de três partos até os 6 anos de idade) ou 1 (sucesso, ou pelo menos três partos até os 6 anos de idade) e os arquivos sofreram restrição ou não para NEP (Número Efetivo de Progênie), para número de touros dentro do grupo de contemporâneos (GC) e exclusão de grupos inteiros com média para a característica igual a 0 ou 1 (ou seja, sem variabilidade dentro do GC). Testaram-se três definições para GC. Utilizou-se o software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models), sob modelo unicaráter de touro-avô materno, para obtenção de componentes de (co)variância, estimativas de herdabilidade e soluções para cada touro (que originam as Diferenças Esperadas na Progênie - DEPs). As análises resultaram em amostras com baixa correlação serial, mostraram pequenas diferenças entre as estimativas pontuais de herdabilidade e alta correlação de rank para as DEPs dos 4180 touros avaliados. Adotou-se a implementação tamanho da cadeia/descarte amostral/amostragem como 225mil/25mil/1000 para as análises subseqüentes. A comparação entre estimativas de herdabilidade obtidas sob modelo de limiar e sob modelo linear não mostrou vantagens do primeiro, sendo que análises sob modelo linear, que têm reduzido tempo de processamento, poderiam ser preferidas quando houver muitos registros de produção, bastando transformar as estimativas de herdabilidade para escala subjacente. As comparações, sob modelo linear ajustadas para escala subjacente, entre a stayability padrão (0 ou 1) e a alternativa (considerando o número de partos até os seis anos de idade para aquelas vacas antes codificadas com valor 1), mostraram que podem ocorrer alterações na classificação de um número significativo de touros avaliados, mesmo sendo nas posições intermediárias do rank, talvez pela ligeira capacidade da característica alternativa em detectar variabilidade entre touros. Classificaram-se os 4180 touros em ordem decrescente e foram estudadas as genealogias dos 42 melhores (também chamados de TOP 1% ou aqueles que apresentam DEP para stayability superior a 57,6%) para identificar famílias importantes e avaliar a variabilidade genética da stayability. Além do touro Karvadi Imp. (essencialmente presente como avô, bisavô ou tataravô das mães dos touros TOP1%), outros genearcas com grande representatividade entre os TOP1% foram os touros Godhavari Imp. (via Kurupathy e Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã e Falo da BV (estes últimos pela via materna). / The new reproduction technologies like embryo transfer and in vitro fertilization brought to animal breeding researchers, and producers, a growing interest in the selection of females, which was a subject not well explored before, when the focus used to be only on evaluation and selection of males. The beef cattle industry is becoming more competitive each year, and the producers must think about all the aspects and details that can affect the production process. The PMGRN-USP (Nelore Breeding Program of the São Paulo University) studies a large number of traits to be used as selection criteria. Among these traits, there is stayability, which has a great economic importance. The aim of this project was to analyze the trait stayability, with a Bayesian approach, in a Nelore cattle population. Firstly, the implementation used two lengths of Gibbs chain (225 or 550 thousand), two periods of burn-in (25 or 50 thousand) and two thinning intervals (at each 1000 or 250 rounds). The cows were classified as 0 (failure, or less than three calves until six years of age), or 1 (success, or at least 3 calves until six years of age). The data were, or were not, restricted for NEP (Effective Number of Progeny), for number of sires in the contemporary group (GC), and for lack of variability in the contemporary group. Three different definitions of GC were tested. The software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models) was used, under an univariate sire-maternal grandsire model to get the (co)variance components, the heritability estimate and the solutions to each sire (that are used to get the Expected Progeny Differences - EPD). The results showed a low serial correlation in the samples, small differences among heritability estimates and a high rank correlation among the EPD estimates of the 4180 sires evaluated. The implementation 225000/25000/1000 was adopted to the subsequent analysis. The comparison between the heritability estimates obtained under the threshold model and the linear model didn’t show any advantage to the first. The analysis under linear models could be preferred because of its reduced processing time in large data sets, needing only a transformation of the heritability estimates to the underlying scale. The comparisons, under linear model adjusted to the underlying scale, between the standard stayalility (0 or 1) and the alternative (obtained from the perception of the fertility differences among the cows classified as 1) showed a variation in the position of a considerable number of sires in the rank, maybe because the alternative trait gets some additional variation among sires. 4180 sires were classified in a rank and the genealogies of the 42 best sires (or TOP 1%, or the ones with stayability EPD greater than 57,6%) were studied to identify major families and evaluate the genetic variation of stayability. Besides of Karvardi Imp (a bull very present as an ascendant (2, 3 or 4 generations) of the dams of the TOP1% sires), another founder sires with influence among the TOP1% were Godhavari Imp (via Kurupathy and Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã, and Falo da BV (the last two via maternal).

Tesis por compendio / [ES] La tesis tiene como objetivo principal el estudio del gas radón y sus descendientes. El radón es un gas radiactivo presente en la naturaleza que puede filtrarse en las viviendas y que se ha asociado con un mayor riesgo de cáncer de pulmón. A pesar de que existen regulaciones y recomendaciones para controlar la concentración de radón en el aire interior, es necesario hacer mediciones del factor de equilibrio, un parámetro esencial en la evaluación del riesgo de exposición al radón, y de las concentraciones de sus descendientes que pueden variar en diferentes situaciones y entornos. Por lo tanto, es fundamental comprender en profundidad el factor de equilibrio y las concentraciones de los descendientes y cómo pueden variar en diferentes ubicaciones y circunstancias. Esto implica, para el desarrollo de esta tesis, la toma de muestras de aire en el interior, la medición de la concentración de radón y de sus productos de desintegración, y la evaluación de factores ambientales, centrándose en la humedad relativa, y otros factores que podrían influir en la concentración del radón y sus descendientes en el ambiente interior. Con estos datos se desarrolla un modelo dosimétrico para el cálculo de la dosis por inhalación. Para comprender la variabilidad del factor de equilibrio en diferentes condiciones, se emplearán análisis estadísticos y se desarrollarán modelos matemáticos que integren los datos recopilados de las mediciones y los factores ambientales evaluados. Además, se considerará el uso de las mascarillas faciales como una posible medida factor que pueda influir en la reducción de la dosis por inhalación de los descendientes del radón. Se realizarán mediciones específicas con y sin mascarillas faciales para evaluar su impacto. / [CA] La tesi té com a objectiu principal l'estudi del gas radó i els seus descendents. El radó és un gas radiactiu present en la naturalesa que pot filtrar-se en les llars i que s'ha associat amb un major risc de càncer de pulmó. Tot i que existeixen regulacions i recomanacions per controlar la concentració de radó en l'aire interior, és necessari fer mesures del factor d'equilibri, un paràmetre essencial en l'avaluació del risc d'exposició al radó, i de les concentracions dels seus descendents que poden variar en diferents situacions i entorns. Per tant, és fonamental comprendre en profunditat el factor d'equilibri i les concentracions dels descendents i com poden variar en diferents ubicacions i circumstàncies. Això implica, per al desenvolupament d'aquesta tesi, la presa de mostres d'aire a l¿interior, la mesura de la concentració de radó i dels seus productes de decaïment, i l'avaluació de factors ambientals, centrant-se en la humitat relativa, i altres factors que podrien influir en la concentració del radó i els seus descendents en l'ambient interior. Amb aquestes dades es desenvolupa un model dosimètric per al càlcul de la dosi per inhalació. Per comprendre la variabilitat del factor d'equilibri en diferents condicions, s'emplearan anàlisis estadístics i es desenvoluparan models matemàtics que integren les dades recopilades de les mesures i els factors ambientals avaluats. A més, es considerarà l'ús de les mascaretes facials com una possible mesura que puga influir en la reducció de la dosi per inhalació dels descendents del radó. Es realitzaran mesures específiques amb i sense mascaretes facials per a avaluar el seu impacte. / [EN] The main objective of this thesis is the study of radon gas and its decay products. Radon is a radioactive gas present in nature that can seep into homes and has been associated with an increased risk of lung cancer. Although there are regulations and recommendations to control the concentration of radon in indoor air, measurements of the equilibrium factor, an essential parameter in the assessment of the risk of radon exposure, and of the concentrations of its decay products that can vary in different situations and environments, are necessary. Therefore, it is essential to thoroughly understand the equilibrium factor and the concentrations of the decay products and how they can vary in different locations and circumstances. To develop this thesis, it is necessary to take indoor air samples, measure the concentration of radon and its decay products, and evaluate environmental factors, focusing on relative humidity, and other factors that could influence the concentration of radon and its decay products in the indoor environment. With this data, a dosimetric model is developed for the calculation of inhalation doses. To understand the variability of the equilibrium factor in different conditions, statistical analyses will be used, and mathematical models that integrate the data collected from the measurements and the evaluated environmental factors will be developed. In addition, the use of face masks will be considered as a possible factor that may influence the reduction of inhalation doses of radon decay products. Specific measurements will be taken with and without face masks to evaluate their impact. / Martínez Ferri, JE. (2023). Estudio del factor de equilibrio y cálculo de dosis aplicados al gas radón [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/196830 / Compendio

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Les femelles parasitoïdes exploitant un agrégat d’hôtes doivent ajuster leurs comportements en fonction des facteurs environnementaux auxquels elles sont soumises, dont la présence de compétiteurs dans l’environnement. L’objectif de cette étude est de mesurer les impacts de la compétition sur les stratégies d’exploitation d’agrégats chez deux espèces de parasitoïdes non agressives. Les espèces Trichogramma pintoi et T. minutum (Hymenoptera : Trichogrammatidae), des parasitoïdes d’œufs de lépidoptères, furent utilisées et leurs temps de résidence dans l’agrégat, leurs mécanismes de prise de décision et le sexe des descendants alloués furent mesurés en l'absence de compétition et en situation de compétition directe et indirecte, intra- et interspécifique. Trichogramma pintoi privilégie une stratégie générale basée uniquement sur la qualité perçue de l’agrégat. À l’inverse, T. minutum privilégie une stratégie adaptée au type de la compétition (directe ou indirecte) et à la nature des compétiteurs (intra ou interspécifiques), sans égards à la qualité de l’agrégat. La distinction de ces deux stratégies amène des perspectives de recherche intéressantes sur les impacts de la compétition à l’échelle du paysage, et est d’un intérêt certain pour ceux voulant améliorer l’efficacité des programmes et des élevages de masse utilisés en lutte biologique. / Female parasitoids must adjust their behavior in response to different environmental factors when foraging for hosts. One of the most important factors they must cope with is the presence of competitors in their environment. The objective of this study is to measure the effects competition has on the foraging strategies of non-aggressive parasitoids. We used the species Trichogramma pintoi and T. minutum (Hymenoptera: Trichogrammatidae), two egg parasitoids of lepidoteran species. We measured patch residence times, patch-leaving mechanisms and progeny sex allocation of females foraging alone, and of females foraging under direct or indirect, intra- or interspecific competition. Trichogramma pintoi females favoured a general strategy entirely based on the perceived quality of the patch, whereas T. minutum females favoured a strategy that was adapted to the type of competition (direct or indirect) and to the nature of the competitors (intra- or interspecific) they were subjected to, with no regards for the quality of the patch. The distinction between these two strategies brings forth interesting research opportunities regarding the effects of competition at the landscape level, and should be of interest for biological control practitioners wishing to increase the efficacy of biological control programs and of commercial mass rearings.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:13:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Jorge_Ferreira.pdf: 520002 bytes, checksum: 2bd34704d262bc96ce3fdcb3168e5c2e (MD5) Previous issue date: 2009-03-27 / The objective was to evaluate the effects of the year (sample size, genealogy and data structure), mother-offspring link proportion (mother-offspring pairs, both with weaning weights), inclusion (M2) or not (M1) of the genetic direct-maternal covariance in the model, the direct-maternal correlation (C) magnitude and the direct and maternal genetic variance ratio (R) on the (co)variance estimates on weaning weight of beef cattle. The effects of the correlation (C) and variance ratio (R) were significant on the estimate of direct genetic variance ( ) (P<0,05, P<0,001, respectively), maternal genetic variance ( ) (P<0,001) and direct-maternal genetic covariance ( ) (P<0,001). The year influenced significantly (P<0,01) the estimates of and was not significant on and . The effect of the mother-offspring link proportion (E) was significant (P<0,0001) on the estimate of , , , and , being not significant on . In the model with zero direct-maternal covariance, and were underestimated when the direct-maternal correlation was negative, and overestimated when it was positive. Accurate and precise estimates of genetic variances and covariances of traits under maternal effect deserve detailed study and intensified, since these estimates may be influenced by the nature and composition of data, direct-maternal genetic correlation model used and applied. However, these facts may contribute to mistaken conclusions that are not referenced. These results are indicatives of the potential reliability and accuracy of the estimates on real data, although it is known that its magnitudes may differ, due to additional bias, like inherent errors of data gathering process and information flow from the herds. / Objetivou-se avaliar os efeitos do ano (tamanho amostral, genealogia e estrutura dos dados), da proporção de elos mãe-progênie (pares mãe-filho ambos com registro), da inclusão (M2) ou não (M1) da covariância genética direta-maternal no modelo, da magnitude da correlação genética direta-maternal (C) e da razão entre as variâncias genéticas direta e maternal (R) sobre as estimativas para peso à desmama em bovinos de corte. Os efeitos da correlação (C) e razão entre variâncias (R) resultaram significativos sobre as estimativas da variância genética direta (P<0,05, P<0,001, respectivamente), maternal ( ) (P<0,001) e da covariância genética direta-maternal ( ) (P<0,001). O ano influenciou significativamente (P<0,01) as estimativas de , e não foi significativo sobre e . O efeito da proporção de elos mãe-progênie (E) foi significativo (P<0,0001) sobre as estimativas de , , , e , não sendo significativo sobre . No modelo com covariância direta-maternal zerada e foram subestimadas quando a correlação genética direta-maternal foi negativa, e superestimadas quando a mesma foi positiva. Estimativas acuradas e precisas das (co)variâncias de características sob efeito maternal merecem estudos intensificados e detalhados, uma vez que, essas estimativas podem ser influenciadas pela natureza e composição dos dados, correlação genética direta-maternal e modelo aplicado. Estes resultados provem indicativos sobre a confiabilidade e precisão potenciais das estimativas sobre dados reais, embora se saiba que suas magnitudes possam diferir, devido a causas adicionais de viés, como erros vinculados ao processo de coleta e fluxo das informações dos rebanhos

At low doses, relevant to nuclear incidents and accidental releases of radioactivity, the detriment of radiation extends beyond direct effects. This thesis investigates genomic instability, a subclass of non-targeted effects where damage and lethality is transmitted vertically and expressed in the progeny of cells many generations after initial radiation exposure. Through a series of experiments using clonogenic assay of human and fish cell culture, studies described in this thesis describe lethal mutations, hyper radiosensitivity and increased radioresistance – processes involving repair mechanisms that dictate survival in cells exposed to low doses. Further study investigates the difference in the relative biological effect of alpha particle radiation compared to what is expected at high doses. Results demonstrate increased radioresistance in a human cell line while also revealing increased lethality in a fish cell line confirming the need for consideration of dose-dependence as well as variance in behaviors of different cell lines and species. It is hoped the conclusions of this thesis will inspire the creation of protocols with greater attention to the indirect consequences of exposure to radiation at doses relevant to nuclear incidents and accidents. / Thesis / Master of Science (MSc)