Made available in DSpace on 2014-07-29T15:29:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Monica Canedo.pdf: 1399065 bytes, checksum: d8dbbf45d1c8e0d832e311c7d2c9c8f7 (MD5) Previous issue date: 2011-03-02 / Background: Actually the Chlamydia trachomatis is responsible for the major number of cases of sexual transmitted bacterial infections. The likelihood of tubal damage in infertile women is associated to the evidence of chlamydia infection. Objectives: To evaluate the ability of indirect immunofluorescence for Chlamydia trachomatis on tubal occlusion and to establish the cutoff point (best sensitivity and specificity) of antibodies IgG titres (indirect immunofluorescence) to detect tubal occlusion (ROC curve). Methodology: This is a retrospective study with 204 electronic records of patients attended at a university and private infertility center in the city of Goiania, in the period of 2006 to 2009. Patients had 17 to 47 years old. To evaluate the risk of tubal occlusion the patients were divided into two groups: patients exposed to chlamydia (significant IFI &#8805; 1:16) e unexposed (no significant IFI < 1:16). It was verified patients who had the disease (tubal occlusion) and not sick (without tubal occlusion) in the hysterosalpingography. For the calculations the Chi-square (&#967;2) were used, corrected to small samples (Fisher Exact Test) when necessary. The p chosen level was 0.05. The ROC curve was calculated with BioEstat® software, using the standard methodology. This study was submitted and approved by Ethics Committee of Hospital Clinics of the Federal University of Goias.Results: Of the 72 patients with significant titres, 34 (47,2%) showed the occurrence of tubal occlusion. In relation the 132 patients with no significant titres, only 18 (13,7%) had tubal occlusion (p < 0,001). We also observed a progressive increase in the levels of antibodies and the likelihood of tubal occlusion (p < 0,001). The best cutoff point of the ROC curve with the titre was 1:64. However, we believe that we can continue using a cutoff titre to &#8805; 1:16 by interfering little in sensitivity and specificity and because it is currently used in the Clinical Laboratory of Hospital Clinics. Conclusions: The results indicate that serology for Chlamydia trachomatis (indirect immunofluorescence) is valid for screening of tubal damage. We also showed that the best cutoff (ROC) indirect immunofluorescence to detect tubal occlusion is 1:64, but between 1:16 and 1:64 there is a slight change in sensitivity and specificity. / Introdução: Atualmente, a Chlamydia trachomatis é responsável pelo maior número de casos de infecções bacterianas sexualmente transmissíveis. A probabilidade de lesão tubária em mulheres inférteis é relacionada com evidência de infeccção passada por clamídia. Objetivos: Avaliar a capacidade da imunofluorescência indireta para Chlamydia trachomatis em rastrear obstrução tubária e estabelecer o ponto de corte (melhor sensibilidade e especificidade) de títulos de anticorpos IgG imunofluorescência indireta) para detectar obstrução tubária (curva ROC). Métodos: Este é um estudo retrospectivo com 204 prontuários eletrônicos de pacientes atendidas em um centro universitário e particular de infertilidade na cidade de Goiânia, no período de 2006 a 2009, com faixa etária entre 17 e 47 anos. Para avaliar o risco de obstrução tubária as pacientes foram divididas em dois grupos: pacientes expostas à clamídia (IFI significativa &#8805; 1:16) e não expostas (IFI não significativa < 1:16). Verificou-se então, as pacientes que tiveram a doença (obstrução tubária) e não doentes (sem obstrução tubária) na histerossalpingografia. Para os cálculos foi utilizado o teste Qui-quadrado (&#967;2), corrigido para pequenas amostras (teste Exato de Fisher) quando necessário. O nível de p escolhido foi 0,05. A curva ROC foi calculada com o programa BioEstat® utilizando a metodologia usual. Este estudo foi submetido e aprovado pelo Comitê de Ética do Hospital das Clínicas da Universidade Federal de Goiás. Resultados: Das 72 pacientes com titulação significativa, 34 (47,2%) apresentaram a ocorrência de obstrução tubária. Em relação as 132 pacientes com titulação não significativa, somente 18 (13,7%) apresentaram obstrução tubária (p < 0,001). Foi observado também um aumento progressivo entre os níveis de anticorpos e a probabilidade de obstrução tubária (p < 0,001). O melhor ponto de corte na curva ROC foi com a titulação de 1:64. Porém, consideramos que pode-se continuar utilizando como ponto de corte a titulação &#8805; 1:16, por interferir pouco na sensibilidade e especificidade e por ser a atualmente utilizada no Laboratório Clínico do Hospital das Clínicas. Conclusões: Os resultados deste estudo revelaram que a sorologia para Chlamydia trachomatis (imunofluorescência indireta) é válida para rastreamento de lesão tubária. Verificamos ainda que o melhor ponto de corte (curva ROC) da imunofluorescência indireta em detectar obstrução tubária é 1:64, mas, entre 1:16 e 1:64 há uma discreta mudança na sensibilidade e especificidade do teste.

Orientador: Sérgio Roberto Peres Line / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-22T18:59:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Urioste_EduardoArcanjo_M.pdf: 1274507 bytes, checksum: 0f7136d4dabaf0e810ad2bdf1b2ee815 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Estima-se que cada indivíduo carregue cerca de 120 a 430 variantes raras em regiões UTRs (Abecasis et al, 2012). Apesar da tolerância a variação na região 5' UTR, a patofisiologia de várias doenças está ligada a mutações na mesma (Cazzola & Skoda, 2000; Reynolds, 2002; Chatterjee & Pal, 2009; Wethmar et al 2010), sendo necessário o entendimento a determinação dos mecanismos regulatórios. O objetivo deste trabalho é descobrir assinaturas genéticas encontradas no contexto genômico de mutações pontuais de região 5' UTR que permitam prever o impacto funcional de outras variações pontuais na mesma região. As mutações, causadora de doença, foram selecionadas do banco de dados do Human Gene Mutation Database (HGMD) (Stenson et al, 2008); e os polimorfismos, de impacto funcional desconhecido, foram obtidos no banco de dados NHLBI Grand Opportunity Exome Sequencing Project (ESP), sendo originados do trabalho de Tenessen et al (2012). No total foram utilizadas 235 mutações e 21.542 polimorfismos. Para as variações foram calculados parâmetros de variação da estabilidade da estrutura secundária do contexto das variações (??Gfolding), presença de sítios de ligação de fatores de transcrição (JASPAR), tipo de variação (transição/transversão, tipoV), distância do início da sequência codificante (DiSC), distância do início de transcrição (DiTr) e conservação filogenética por distância de Levenshtein do contexto (Lev). A estatística foi calculada pelos testes de Wilcoxon e Binomial. A partir destes foram gerados modelos de regressão logísticos analisados através de curva ROC. Os parâmetros ??Gfolding máximo, tipoV, DiSC, e Lev permitiram a distinção significativa (? = 0,05) entres os polimorfismos e as mutações permitindo modelos explicativos, mas incompletos (área da Curva ROC 0, 772). ??Gfolding max. indicou uma relação entre as mutações e entre estruturas secundárias mais estáveis geradas pelas mesmas. Os parâmetros Lev e tipoV sugerem a origem das mutações como resultantes de hotspots. O parâmetro DiSC indicou regiões com provável funcionalidade. Apesar de não ter sido possível estabelecer relação causal entre os parâmetros e o impacto funcional das variações, encontrou-se correlações importantes / Abstract: It is estimated that each individual carries about 120 to 430 rare variante in the UTR regions (Abecasis et al, 2012). Despite the increased tolerance towards variations in 5' UTR region, the patho-phisiology of several diseases is linked to its mutations (Cazzola & Skoda, 2000; Reynolds, 2002; Chatterjee & Pal, 2009; Wethmar et al 2010). Therefore it is necessary the understanding and the determination of the regulatory elements. The objective of this study is the discovery of genetic signatures found in the genomic context of disease causing point mutations in 5' UTR, thus allowing the prediction of the functional impact of other point variations in the same region. The disease causing mutations were selected from Human Gene Mutation Database (HGMD) (Stenson et al, 2008). The polymorphisms of unknown functional impact were obtained from the NHLBI Grand Opportunity Exome Sequencing Project (ESP), originated from the work of Tenessen et al (2012). A total of 235 mutations and 21,542 polymorphisms were used. For each variation, parameters related with the differences of the variation's context folding stability (??Gfolding), presence of transcription factor binding sites (JASPAR), type of variation (transition/transversion, tipoV), distance from coding sequence start (DiSC), distance from transcription start site (DiTr) and phylogenetic conservations by distance of Levenshtein from wild type to variant context (Lev). The statistical test was done by Wilcoxon and Binomial. Logistical regressions models were generated from the parameters and its performance was evaluated by a ROC curve. The parameters maximal ??Gfolding, tipoV, logarithm of DiSC and Lev allowed a significant distinction (? = 0,05) between the groups, generating models of reasonable explanation but incomplete (area under the ROC curve 0,772). Maximal ??Gfolding showed a relationship between mutations and stable secondary structures generated by them. Lev and tipoV suggested the origin of the mutation from hotspots. The DiSC parameter identified regions with possible functionality. While it was not possible to establish any clear causal relationship between the parameters and the functional impact of the variations, important correlations were found / Mestrado / Histologia e Embriologia / Mestre em Biologia Buco-Dental

La mémoire prospective (MP) est la capacité de se souvenir d’exécuter une action dans le futur. La MP se distingue de la mémoire rétrospective (MR) notamment par le fait que la récupération du souvenir doit être auto-initiée alors qu’on est occupé par une autre tâche. L’objectif principal de cette thèse est de mieux comprendre la communauté et la spécificité des processus mnésiques et de contrôle impliqués dans les situations de MP par rapport aux situations de MR comme une tâche de reconnaissance. La démarche est d’imbriquer une action planifiée dans des tâches dont la demande mnésique et la difficulté sont contrôlées. Nous étudions ainsi l’interférence réciproque entre la MP et la MR. Nous étudions également les stratégies de maintien en fonction de la présence ou non d’un indice d’exécution. Les données comportementales montrent que l’action est exécutée plus rapidement sans indice d’exécution qu’avec indice, ce qui suggère un maintien actif sans indice. La MR interfère avec les performances de MP. Les mesures du modèle DPSD de la MR montrent qu’imbriquer une action planifiée dans une tâche de reconnaissance module le contrôle de la décision de reconnaissance et que le maintien actif interfère avec la familiarité. Enfin les résultats électrophysiologiques montrent une positivité pariétale modulée à la fois par la récupération d’une action planifiée et par une tâche classique de reconnaissance. Ces résultats suggèrent 1) une communauté des processus mnésiques en MP et en MR, mais 2) qu’être dans un mode de fonctionnement plus contrôlé est une spécificité de la MP, et que 3) le maintien actif est une caractéristique importante de la MP. / Prospective memory (PM) refers to the ability to remember to perform an action at some point in the future. Prospective memory is distinct from retrospective memory (RM) particularly because retrieval of the memory must be self-initiated while being engaged in an ongoing task. The main goal of this thesis was to better understand shared and specific memory and control processes involved in PM situations compared to RM situations (e.g., a recognition task). Our approach was to use tasks whose memory demand and difficulty were controlled and in which an intended action was embodied. This allows to study the mutual interference between PM and RM. We also studied maintenance strategies while manipulating the presence of an execution cue. Behavioural data showed that execution of the intended action was faster without than with a cue: this suggests active maintenance without an execution cue. RM interferes with PM performance. Measurements of the DPSD model showed that the embodiment of an intended action in a recognition task influences the control of the recognition decision, and that active maintenance interferes with familiarity. Finally, electrophysiological data show a parietal positivity modulated by the retrieval of an intended action and by a recognition task. These results support the idea that 1) PM and RM share common memory processes, but 2) that PM specifically forces a more controlled operating mode, and that 3) active maintenance is an important characteristic of PM.

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.

Ce travail a eu pour objectif de proposer des méthodes statistiques pour évaluer et comparer les capacités prédictives de divers outils pronostiques. Le Brier score et principalement les courbes ROC dépendant du temps ont été étudiés. Tous deux dépendent d'un temps t, représentant un horizon de prédiction. Motivé par les applications à la prédiction de la démence et des données de cohortes de personnes âgées, ce travail s'est spécifiquement intéressé à des procédures d'inférence en présence de données censurées et de risques concurrents. Le risque concurrent de décès sans démence est en effet important lorsque l'on s'intéresse à prédire une démence chez des sujets âgés. Pour obtenir des estimateurs consistants, nous avons utilisé une méthode appelée “Inverse Probability of Censoring Weighting” (IPCW). Dans un premier travail, nous montrons qu'elle permet d'étendre simplement les estimateurs pour données non censurées et de prendre en compte une censure éventuellement dépendante de l'outil pronostique étudié. Dans un second travail, nous proposons des adaptations pour les situations de risques concurrents. Quelques résultats asymptotiques sont donnés et permettent de dériver des régions de confiance et des tests de comparaison d'outils pronostiques. Enfin, un troisième travail s'intéresse à la comparaison d'outils pronostiques dynamiques, basés sur des marqueurs longitudinaux. Les mesures de capacités pronostiques dépendent ici à la fois du temps s auquel on fait la prédiction et de l'horizon de prédiction t. Des courbes de capacités pronostiques selon s sont proposées pour leur évaluation et quelques procédures d'inférence sont développées, permettant de construire des régions de confiance et des tests de comparaison de ces courbes. L'application des méthodes proposées a permis de montrer que des outils prédictifs de la démence basés sur des tests cognitifs ou des mesures répétées de ces tests ont de bonnes capacités pronostiques. / The objective of this work is to develop statistical methods that can be used to evaluate and compare the prognostic ability of different prognostic tools. To measure prognostic ability, mainly the time-dependent ROC curve is studied and also the Brier score for a prediction horizon t. Motivated by applications where the aim is to predict the risk of dementia in cohort data of elderly people, this work focuses on inference procedures in the presence of right censoring and competing risks. In elderly populations death is a highly prevalent competing risk. To define consistent estimators of the prediction ability measures, we use the inverse probability of censoring weighting (IPCW) approach. In our first work, we show that the IPCW approach provides consistent estimators of prediction ability based on right censored data, even when the censoring distribution is marker-dependent. In our second work, we adapt the estimators to settings with competing risks. Asymptotic results are provided and we derive confidence regions and tests for comparing different prognostic tools. Finally, in a third work we focus on comparing dynamic prognostic tools which use information from repeated marker measurements to predict future events. The prognostic ability measures now depend on both the time s at which predictions are made and on the prediction horizon t. Curves of the prognostic ability as a function of s are developed for the evaluation of dynamic risk predictions. Inference procedures are adapted and so are confidence regions and tests to compare the curves. The applications of the proposed methods to cohort data show that the prognostic tools that use cognitive tests, or repeated measurements of cognitive tests, have high prognostic abilities.

Introdução: luto complicado é caracterizado pela procura persistente pelo falecido, tristeza e dor emocional intensos em resposta à morte de ente querido. Luto complicado é frequentemente pouco reconhecido e subtratado. O Texas Inventory Revised of Grief (TRIG) é um instrumento de alta confiabilidade e validade na medida de avaliação do luto. Nosso objetivo foi traduzir, adaptar e validar o TRIG para Português do Brasil e verificar se o mesmo, em uma população enlutada, é capaz de distinguir entre os que têm e os que não tem luto complicado assim como identificar quais elementos da escala contribuem para isso. Métodos: o trabalho foi realizado em duas etapas: a) tradução e adaptação transcultural do TRIG para o português do Brasil e b) estudo em corte transversal para análise da confiabilidade e validação desse instrumento. Participantes: 165 pacientes adultos foram recrutados de: a) Ambulatório de Luto do Departamento e Instituto de Psiquiatria - Universidade de São Paulo, b) Ambulatório de convênio e Particulares no mesmo departamento e, c) Colegas de trabalho que perderam um ente querido. Todos os pacientes foram entrevistados com o TRIG e de acordo com critérios clínicos, 69 dos 165 pacientes enlutados foram diagnosticados com luto complicado. Resultados: quanto à tradução e adaptação transcultural, o TRIG foi traduzido para o português, feito a retrotradução para o inglês e adaptado à cultura local. Esse processo foi realizado por dois psiquiatras bilíngues. A confiabilidade e consistência interna do instrumento foram medidos pelo coeficiente de Alpha de Cronbach que alcançou 0,735 para parte I e 0,896 para a parte II do instrumento. A sensibilidade, especificidade e ponto de corte para identificar enlutados com e sem luto complicado foram medidos pela Curva ROC. Viu-se que usando o ponto de corte encontrado de 104 (escore total das partes I, II, III + variáveis psicográficas), é possível classificar corretamente 71,3% dos indivíduos com e sem luto complicado. A validação do instrumento foi realizada pela análise fatorial exploratória e confirmatória. Pela regressão logística demonstrou-se que nível educacional, idade do falecido, idade do enlutado, perda de filho(a) e morte do tipo inesperada são fatores de risco para luto complicado. Nossos resultados também sugerem que religião pode influenciar luto complicado. Conclusões: a versão traduzida e adaptada do TRIG para o português é confiável e válida como medida do luto tanto quanto a versão original. O TRIG foi capaz de distinguir pacientes com e sem luto complicado. Nós sugerimos o uso do TRIG com ponto de corte igual a 104 para identificar enlutados com luto complicado / Background: Complicated grief is characterized by persistent yearning for the deceased, intense sorrow and emotional pain in response to death causing significant distress. Complicated grief is often underrecognized and under treated. The Texas Revised Inventory of Grief (TRIG) is a questionnaire that has been demonstrated to have high validity and reliability in the assessment of complicated grief. Our objective was to translate, adapt, and validate the TRIG to Brazilian Portuguese and to verify whether the TRIG, in a bereaved population, is able to distinguish between those with and those without complicated grief and to identify which elements in the scale contribute to this. Methods: Two stages: a) cross-culture adaptation of a questionnaire, and b) crosssectional study of reliability and validity. Setting and Participants: 165 adult patients were recruited from a) the Grief Outpatient Clinic at the Department and Institute of Psychiatry - University of São Paulo, b) private practice at the same department, and c) co-workers who have lost a loved one. All the patients were interviewed with the TRIG. According to clinical criteria 69 of 165 bereaved patients were presenting complicated grief. Results: Cross-culture adaptation: the TRIG was translated from American English, then back-translated and finally compared with the Brazilian Portuguese version by two bilingual psychiatrists. Reliability: the Cronbach\'s alpha coefficients (internal consistency) of the TRIG scales were 0,735 (part I) and 0,896 (part II). Sensitivity, specificity as well as cutoff points to identify complicated and non-complicated grief, were measured using the ROC curve Using the total score of 104 (part I + part II + Part III + psychographics variables), we can correctly classify 71.3% of individuals with and without complicated grief. The construct validity was assessed by exploratory factor analysis and confirmatory analysis. Furthermore, by logistic regression, our study demonstrated that a low education level, age of the deceased and age of the bereaved, loss of a son or daughter, and unexpected death were all risk factors for complicated grief. Our results also suggest that religion may influence complicated grief. Conclusions: The TRIG adapted to Brazilian Portuguese is as reliable and valid as the original version. In the evaluation of Brazilian bereaved, it was able to distinguish individuals with and without complicated grief. And, we suggest a cut-off value of 104 for complicated grief

Ziel: Die Studie zielte auf die Beurteilung von klinischer Information und Röntgenthorax jeweils alleine und in Kombination für Unterscheidung der invasiven pulmonalen Aspergillose von seinen pulmonalen Differentialdiagnosen. Design: Zur Evaluierung der diagnostischen Leistungen wurde eine Receiver Operating Characteristic Studie angewandt. Methodik: Die diagnostischen Leistungen der alleinigen Klinik, des alleinigen Röntgenthorax und der Kombination von Klinik und Röntgenthorax wurden ermittelt. An der Studie nahmen jeweils acht mit Aspergillose erfahrene Internisten und Radiologen teil. Dazu wurde eine aus 25 gesicherten Fällen mit Aspergillose und 25 differentialdiagnostischen Fällen bestehende Sammlung zusammengestellt. Die Fälle der multizentrischen Studie wurden verblindet, randomisiert und auf einer Fall-CD-ROM präsentiert. Ergebnisse: Die Internisten erreichten mittels alleiniger Klinik die höchste diagnostische Leistung und sie zeigten die größte Variabilität in ihrer Gruppe. Durch die zusätzliche Verfügbarkeit von Röntgenbildern, veränderte sich ihre diagnostische Leistung nicht. Die Radiologen konnten durch zusätzlich zum Röntgenthorax verfügbare klinische Informationen ihre diagnostische Leistung signifikant erhöhen. Schlussfolgerungen: Die klinischen Angaben hatten für die Differentialdiagnose der Aspergillose für Internisten und Radiologne eine hohen diagnostischen Wert. Radiologen brauchen deshalb einen kompletten Zugang zu den spezifischen klinischen Informationen. Der Röntgenthorax zeigte für die radiologisch charakteristischen Aspergillosen und für die Differentialdiagnosen eine hohe Aussagekraft. Als Basis in der diagnostischen Bildgebung sollte sich der Diagnostiker der Stärken und Limitationen dieser konventionellen Bildgebung bewußt sein. / Objective: The role of clinical information and chest film alone and combined for the discrimination between invasive pulmonary aspergillosis (IPA) and its differential diagnoses in human immunodeficiency virus (HIV) infection was studied. Design: Receiver operating characteristics (ROC) methodology was employed to determine separate diagnostic performances. Methods: The diagnostic performance of clinical information and chest film alone and in combination was studied separately for 8 internists and 8 radiologists with regular exposure to HIV and IPA patients. The multicenter ROC case sample consisted of 25 patients with proven IPA and 25 with other proven pulmonary disease entities typical for HIV. The cases were blinded, randomized and presented on a CD-ROM using HTML. Results: With clinical information alone internists achieved the highest diagnostic performance in the discrimination between IPA and its differential diagnoses. Viewing the chest films did not contribute to their performance. The radiologist's performance on the basis of viewing the chest film alone increased significantly when clinical information was supplied. Conclusion: For internists with regular exposure to HIV patients chest films do not provide information essential for the verification or differentiation of potential IPA. Radiologists with regular exposure to HIV patients need full access to the clinical data to reach a comparable performance. Chest films hold relevant information and contribute to the determination of cases with characteristic radiological appearance. Close cooperation between internists and radiologists is mandatory in challenging cases.

A análise de dados de sobrevivência tem sido tradicionalmente baseada no modelo de regressão de Cox (COX, 1972). No entanto, a suposição de taxas de falha proporcionais assumida para esse modelo pode não ser atendida em diversas situações práticas. Essa restrição do modelo de Cox tem gerado interesse em abordagens alternativas, dentre elas os modelos dinâmicos que permitem efeito das covariáveis variando no tempo. Neste trabalho, foram revisados os principais modelos de sobrevivência dinâmicos com estrutura aditiva e multiplicativa nos contextos não paramétrico e semiparamétrico. Métodos gráficos baseados em resíduos foram apresentados com a finalidade de avaliar a qualidade de ajuste desses modelos. Uma versão tempo-dependente da área sob a curva ROC, denotada por AUC(t), foi proposta com a finalidade de avaliar e comparar a qualidade de predição entre modelos de sobrevivência com estruturas aditiva e multiplicativa. O desempenho da AUC(t) foi avaliado por meio de um estudo de simulação. Dados de três estudos descritos na literatura foram também analisados para ilustrar ou complementar os cenários que foram considerados no estudo de simulação. De modo geral, os resultados obtidos indicaram que os métodos gráficos apresentados para avaliar a adequação dos modelos em conjunto com a AUC(t) se constituem em um conjunto de ferramentas estatísticas úteis para o próposito de avaliar modelos de sobrevivência dinâmicos nos contextos não paramétrico e semiparamétrico. Além disso, a aplicação desse conjunto de ferramentas em alguns conjuntos de dados evidenciou que se, por um lado, os modelos dinâmicos são atrativos por permitirem covariáveis tempo-dependentes, por outro lado podem não ser apropriados para todos os conjuntos de dados, tendo em vista que estimação pode apresentar restrições para alguns deles. / Analysis of survival data has been traditionally based on the Cox regression model (COX, 1972). However, the proportionality of the hazards required by this model may not be attended for many practical situations. This restriction of the Cox model has generated interest in alternative approaches, among them dynamic models that allow covariates with time-varying effect. In this work, the main dynamic survival models with additive and multiplicative structures were revised under the nonparametric and semiparametric settings. Graphical methods based on residuals were presented in order to evaluate the goodness-of-fit of these models. A time-dependent version of the area under the ROC curve, denoted by AUC(t), was proposed to evaluate and compare the predictive accuracy of additive and multiplicative survival models. The performance of the AUC(t) was evaluated by means of a simulation study. Data from three studies described in the literature were also analyzed to illustrate or complement the scenarios that were considered in the simulation study. Overall, the results indicate that the graphical methods presented to assess the goodness-of-fit of the models together with the AUC(t) provide a useful set of statistics tools for the purpose of evaluating dynamic survival models in the nonparametric and semiparametric settings. Moreover, applying this set of tools in some data sets showed that on the one hand dynamic models are attractive because they allow time-dependent covariates, but on the other hand they may not be appropriate for all data sets since estimation may present restrictions for some of them.

Orientador: Francisco José Teixeira-Neto / Resumo: Objetivo – Determinar a acurácia diagnóstica da variação da pressão de pulso (ΔPP) mensurada em artéria periférica na predição de diferentes aumentos no volume sistólico induzidos por um desafio volêmico em cães. Metodologia – Foram incluídos 39 cães, fêmeas (19,3 ± 3,6 kg) submetidas à ovariohisterectomia eletiva. A anestesia foi mantida com isoflurano sob ventilação mecânica controlada a volume (volume corrente 12 mL/kg; pausa inspiratória durante 40% do tempo inspiratório; relação inspiração:expiração 1:1,5). O débito cardíaco foi obtido através da técnica de termodiluição transpulmonar (cateter na artéria femoral) e o ΔPP foi mensurado através de um cateter posicionado na artéria podal dorsal. A fluido-responsividade (FR) foi avaliada através da administração de um (n = 21) ou dois (n = 18) desafios volêmicos com solução de Ringer Lactato (RL, 20 mL/kg durante 15 minutos), antes do procedimento cirúrgico. A análise da curva “receiver operating characteristics” (ROC) e a zona de incerteza diagnóstica (“gray zone”) do ΔPP foram empregadas para avaliar a habilidade do índice preditivo em discriminar os respondedores ao último desafio volêmico. A fluido-reponsividade foi definida por diferentes porcentagens de aumento no índice de volume sistólico (IVS) mensurado pela técnica de termodiluição transpulmonar (IVS>10%, IVS>15%, IVS>20% e IVS>25%). Resultados – O número de respondedores ao último desafio volêmico foi de 25 (IVS>10%), 21 (IVS>15%), 18 (IVS>20%) e 14 (IVS>25%). A á... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Objective – To determine the accuracy of pulse pressure variation (PPV) measured from a peripheral artery to predict different percent increases in stroke volume induced by a fluid challenge in dogs. Methods – Were included 39 adult bitches (19.3 ± 3.6 kg) undergoing ovariohysterectomy. Anesthesia was maintained with isoflurane under volumecontrolled ventilation (tidal volume 12 mL kg-1 ; inspiratory pause during 40% of inspiratory time; inspiration:expiration ratio 1:1.5). Cardiac output was obtained by transpulmonary thermodilution (femoral artery catheter) and PPV was measured from a dorsal pedal artery catheter. Fluid responsiveness (FR) was evaluated by a fluid challenge with lactated Ringer´s solution (LRS, 20 mL kg-1 over 15 minutes) administered once (n = 21) or twice (n = 18) before surgery. Receiver operating characteristics (ROC) curve analysis and the zone of diagnostic uncertainty (gray zone) of PPV cutoff thresholds were employed to evaluate the ability of PPV to discriminate responders to the last fluid challenge, defined by different percentage increases in stroke volume index (SVI) measured by transpulmonary thermodilution (SVI>10% to SVI> 25%, with 5 % increments). Results – Number of responders to the last fluid challenge were 25 (SVI>10%), 21 (SVI>15%), 18 (SVI>20%), and 14 (SVI>25%). The area under the ROC curve (AUROC) of PPV was 0.897 (SVI>10%), 0.968 (SVI>15%), 0.923 (SVI>20%), and 0.891 (SVI>25%) (p <0.0001 from AUROC = 0.5). Gray zones of PPV cutoff ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Aprendizado supervisionado tem sido principalmente utilizado para classificação. Neste trabalho são mostrados os benefícios do uso de rankings ao invés de classificação de exemplos isolados. Um rankeador é um algoritmo que ordena um conjunto de exemplos de tal modo que eles são apresentados do exemplo de maior para o exemplo de menor expectativa de ser positivo. Um ranking é o resultado dessa ordenação. Normalmente, um ranking é obtido pela ordenação do valor de confiança de classificação dado por um classificador. Este trabalho tem como objetivo procurar por novas abordagens para promover o uso de rankings. Desse modo, inicialmente são apresentados as diferenças e semelhanças entre ranking e classificação, bem como um novo algoritmo de ranking que os obtém diretamente sem a necessidade de obter os valores de confiança de classificação, esse algoritmo é denominado de LEXRANK. Uma área de pesquisa bastante importante em rankings é a análise ROC. O estudo de árvores de decisão e análise ROC é bastante sugestivo para o desenvolvimento de uma visualização da construção da árvore em gráficos ROC. Para mostrar passo a passo essa visualização foi desenvolvido uma sistema denominado PROGROC. Ainda do estudo de análise ROC, foi observado que a inclinação (coeficiente angular) dos segmentos que compõem o fecho convexo de curvas ROC é equivalente a razão de verossimilhança que pode ser convertida para probabilidades. Essa conversão é denominada de calibração por fecho convexo de curvas ROC que coincidentemente é equivalente ao algoritmo PAV que implementa regressão isotônica. Esse método de calibração otimiza Brier Score. Ao explorar essa medida foi encontrada uma relação bastante interessante entre Brier Score e curvas ROC. Finalmente, também foram explorados os rankings construídos durante o método de seleção de exemplos do algoritmo de aprendizado semi-supervisionado multi-descrição CO-TRAINING / Supervised learning has been used mostly for classification. In this work we show the benefits of a welcome shift in attention from classification to ranking. A ranker is an algorithm that sorts a set of instances from highest to lowest expectation that the instance is positive, and a ranking is the outcome of this sorting. Usually a ranking is obtained by sorting scores given by classifiers. In this work, we are concerned about novel approaches to promote the use of ranking. Therefore, we present the differences and relations between ranking and classification followed by a proposal of a novel ranking algorithm called LEXRANK, whose rankings are derived not from scores, but from a simple ranking of attribute values obtained from the training data. One very important field which uses rankings as its main input is ROC analysis. The study of decision trees and ROC analysis suggested an interesting way to visualize the tree construction in ROC graphs, which has been implemented in a system called PROGROC. Focusing on ROC analysis, we observed that the slope of segments obtained from the ROC convex hull is equivalent to the likelihood ratio, which can be converted into probabilities. Interestingly, this ROC convex hull calibration method is equivalent to Pool Adjacent Violators (PAV). Furthermore, the ROC convex hull calibration method optimizes Brier Score, and the exploration of this measure leads us to find an interesting connection between the Brier Score and ROC Curves. Finally, we also investigate rankings build in the selection method which increments the labelled set of CO-TRAINING, a semi-supervised multi-view learning algorithm