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Reação de genótipos de soja ao mofo branco / Reaction of soybean genotupes to white moldAndrade, Gabriela Carolina Guimarães 19 June 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-06-19 / White Mold, caused by Sclerotinia sclerotiorum fungi, is, currently, one of the most
important diseases of soybean, causing considerable economic losses and is of difficult control.
The Fungi has more than 400 host species, including crops of agronomical importance as soybean,
common beans and sunflower. The dissemination is mainly accomplished by infected seeds or by
the presence of sclerotium. Genetic resistance is the most effective of plant disease control but is
not well known about the soybean varieties resistance in Brazil and the current inoculation
methods do not always have good correlation with field data. The main goals of this study were the
evaluation of the resistance of soybean genotypes in two environments, Barreira – BA and Jatai –
GO, correlate the rainfall with the variables analyzed, test two different methods, one in the
greenhouse using tooth pick and other in the laboratory using oxalic acid, as well as correlate the
data from the experiments in the fields with the greenhouse and the sensibility to the oxalic acid.
According to the data analyzed, there are differences between genotypes of soybean in respect to
the resistance of white mold. Early genotypes and more resistant to lodging were more resistant to
white mold, but showing variations in the results. There was interaction between environment and
soybean genotypes. The environment influenced meaningfully the occurrence of the disease in the
tested genotypes, where in the severity correlate negatively and meaningfully with yield, in other
words, the bigger the severity, the less the yield. The genotypes ANTA82, 2011L003 and
2011L005 had higher yields and were genetically more resistant to the disease. In respect to the
methods used for the selection of resistant genotypes to white mold, it was seen that the oxalic
acid method is an alternative for selection of resistant genotypes, since the variability of the
pathogen is not considered, using the physiological traits of the genotypes. The experiments in the greenhouse are not correlated to the experiments in the field, due to the difficulty of reproducing
equal symptoms that normally occur in the field. However, the method of the oxalic acid was
shown to be reliable to be used in the phenotype of soybean cultivars but methodology adjusts
should be done in future tests. / O mofo branco causado pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum é, atualmente, uma das
principais doenças da cultura da soja, causa prejuízos econômicos significativos e apresenta difícil
controle. O fungo possui mais de 400 espécies hospedeiras, dentre elas importantes culturas
agronômicas como a soja, o feijão e o girassol. A disseminação se dá principalmente pelas sementes infectadas ou pela presença de escleródios nas sementes. A resistência genética é a forma
mais eficaz de controle de doenças de plantas, mas no Brasil pouco se conhece sobre a resistência
genética de cultivares de soja ao mofo branco e os métodos atuais de inoculação nem sempre
apresentam correlação positiva com os dados de campo. Assim, os objetivos do presente estudo
foram avaliar a resistência de genótipos de soja em dois locais, Barreiras – BA e Jataí - GO,
correlacionar a precipitação com as variáveis analisadas, testar dois métodos de avaliação, um em
casa de vegetação pelo método do palito e outro em laboratório usando o ácido oxálico,
correlacionar os experimentos a campo com os do teste do palito em casa de vegetação e a
sensibilidade ao ácido oxálico. De acordo com os dados obtidos, existe diferença entre genótipos
de soja com relação à resistência ao mofo branco. Materiais mais precoces e resistentes ao
acamamento foram mais resistentes, mas com variações. Houve interação significativa entre local
e genótipos de soja. O local afetou, significativamente, a ocorrência da doença nos genótipos
testados, sendo que a incidência correlacionou negativamente com a produtividade, ou seja,
quanto maior incidência, menor a produtividade. Os genótipos ANTA82, 2011L003 e 2011L005
se mostraram mais produtivos e com maior resistência genética. Quanto aos métodos utilizados
para seleção de genótipos resistentes ao mofo branco, constatou-se que o método do ácido oxálico
constitui uma alternativa para seleção de genótipos resistentes, já que a variabilidade genética do
patógeno não é considerada, utilizando-se as características fisiológicas dos genótipos e mostrou
correlação positiva com os resultados obtidos em campo. Os experimentos de casa de vegetação
não correlacionaram com os experimentos de campo devido à dificuldade de reproduzir os mesmos
sintomas que ocorrem no campo. Contudo o método do ácido oxálico se mostrou como uma
alternativa viável para utilização na fenotipagem de genótipos de soja, mas alguns ajustes na
metodologia precisam ser realizados em testes futuros.
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Estudo de genes de Trichoderma harzianum associados ao micoparasitismo e seu papel no biocontrole de Sclerotinia sclerotiorum / Study of Trichoderma harzianum genes associated with mycoparasitism and its role in biocontrol of Sclerotinia sclerotiorumEriston Vieira Gomes 18 December 2015 (has links)
Fungos da espécie Trichoderma harzianum são estudados como agentes de controle biológico de fitopatógenos que habitam o solo, sendo sua estratégia um processo complexo que pode ocorrer por diferentes mecanismos ou uma combinação deles, incluindo micoparasitismo. Neste trabalho, foram analisadas consequências da deleção do gene que codifica a proteína Epl-1, descrita como elicitora de resistência em plantas nos processos de: modulação da expressão de genes envolvidos no processo de micoparasitismo de T. harzianum contra o fungo fitopatogênico Sclerotinia sclerotiorum; estabelecimento do processo de micoparasitismo; interação entre T. harzianum e plantas de feijão comum. Os resultados mostram que a deleção do gene epl-1 alterou a modulação da expressão de todos os genes relacionados ao processo de micoparasitismo analisados. Além disso, Epl-1 apresentou um papel no processo de modulação de expressão desses genes em T. harzianum, no reconhecimento da própria parede celular e da parede de diferentes hospedeiros, na interação com fitopatógenos hospedeiros, no processo de formação de estruturas de micoparasitismo, bem como na indução de resistência local e sistêmica em plantas de feijão comum / Fungal species Trichoderma harzianum, are studied as soilborne plant pathogens biological control agent and its strategy is a complex process, which can occur by different mechanisms or a combination thereof, including mycoparasitism. In this work, the consequences of epl-1 gene deletion, which encoding for Epl-1 protein, described as plants resistance elicitor, were analyzed on: modulation of gene expression involved in T. harzianum mycoparasitism process against phytopathogenic fungus Sclerotinia sclerotiorum; mycoparasitism establishment process and T. harzianum interaction with bean plants. The results showed that epl-1 encoding gene deletion altered the expression modulation of all analyzed genes related to mycoparasitism process. Furthermore, Epl-1 presented a role in modulating expression of these genes in the process of self and host cell wall recognition; the interaction with host plant pathogens in formation of mycoparasitism structures as well as local and systemic resistance in beans plants
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Análise da diversidade genética em populações de Sclerotinia sclerotiorum / Analysis of genetic diversity in populations of Sclerotinia sclerotiorumNASCIMENTO, Lucas Breseghelo do 31 August 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-08-31 / The fungus Sclerotinia sclerotiorum is among the most successful pathogens, omnivores, and without specific hosts, is considered one of the most important fungal pathogens in the world. Is distributed in all producing regions, temperate, subtropical or tropical. The fungus produces resistant structures called sclerotia on the surface and within tissues colonized, they returned to the soil with crop residues and are responsible for the survival of the fungus in the same area for up to eight years. The objectives of this study were to quantify the variability within and between populations of the fungus S. sclerotiorum in bean and soybean crops in different producing places of those varieties. 46 isolates were collected of S. sclerotiorum in six locals of grain production in different regions of Brazil. The sites chosen were Monte Carmelo-MG, Formosa-GO, Lucas do Rio Verde-MT, Montividiu-GO, Londrina, PR and Santo Antonio de Goiás-GO. All areas of the original host of the gathering was the bean with the exception of Londrina-PR in which the host was soybeans. A population study of the fungus through RAPD markers using 13 primers was carried out for the analysis of genetic variability of the fungus. In parallel, tests were also made for the the Mycelial compatibility groups among isolates and test production of hydrolytic enzymes. The statistical analysis was performed using the Arlequin software, which indicated variability among populations of 16.94% and 83.06% within populations. Were found 10 mycelial compatibility groups without specific populations .Enzyme activities performed indicated significant differences within the populations of all enzymes, a comparison between populations also showed significant differences among populations in polygalacturonases, 1,3-β-glucanase and xylanase. The results indicate a high level of variability within populations and low variability among populations / O fungo Sclerotinia sclerotiorum está entre os fitopatógenos mais bem sucedidos, onívoros e sem hospedeiros definido, é considerado um dos patógenos fúngicos mais importantes no mundo. Está distribuído em todas as regiões produtoras, sejam elas temperadas, subtropicais ou tropicais. O fungo produz estruturas de resistência denominadas escleródios, na superfície e no interior dos tecidos colonizados. Estes retornam ao solo com os resíduos da cultura e são responsáveis pela sobrevivência do fungo na mesma área por até 8 anos. Os objetivos desse trabalho foram quantificar a variabilidade intra e inter populacional do fungo S. sclerotiorum em culturas de feijão e soja de diferentes localidades produtoras dessas espécies. Para isso foram coletados 46 isolados de S. sclerotiorum de seis locais de produção de grãos em diferentes regiões do Brasil. Os locais escolhidos foram Monte Carmelo-MG, Formosa-GO, Lucas do Rio Verde-MT, Montividiu-GO, Londrina-PR e Santo Antonio de Goiás-GO em todas as áreas o hospedeiro de origem da coleta foi o feijoeiro, com exceção de Londrina-PR, na qual o hospedeiro foi soja. Foi feito um estudo populacional do fungo através de marcadores do tipo RAPD com a utilização de 13 primers para a análise da variabilidade genética do fungo. Paralelamente também foram feitos testes para a formação de grupo de compatibilidade micelial entre os isolados e testes de produção de enzimas hidrolíticas. A análise estatística dos dados se deu através do programa Arlequin, o qual indicou variabilidade de 16,94% entre populações e 83,06% dentro de populações. Foram formados 10 grupos de compatibilidade micelial sem especificidade de populações. As atividades enzimáticas realizadas indicaram diferenças significativas dentro de populações de todas as enzimas. A comparação entre populações também indicou diferenças significativas entre populações nas enzimas poligalacturonases, 1,3-β-glucanase e xilanase. Os resultados indicaram baixo nível de variabilidade entre populações e alta variabilidade dentre as populações.
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Análise da diversidade genética em populações de Sclerotinia sclerotiorumNascimento, Lucas Breseghelo do 31 August 2010 (has links)
Submitted by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-03-03T12:52:10Z
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Previous issue date: 2010-08-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The fungus Sclerotinia sclerotiorum is among the most successful pathogens, omnivores, and without specific hosts, is considered one of the most important fungal pathogens in the world. Is distributed in all producing regions, temperate, subtropical or tropical. The fungus produces resistant structures called sclerotia on the surface and within tissues colonized, they returned to the soil with crop residues and are responsible for the survival of the fungus in the same area for up to eight years. The objectives of this study were to quantify the variability within and between populations of the fungus S. sclerotiorum in bean and soybean crops in different producing places of those varieties. 46 isolates were collected of S. sclerotiorum in six locals of grain production in different regions of Brazil. The sites chosen were Monte Carmelo-MG, Formosa-GO, Lucas do Rio Verde-MT, Montividiu-GO, Londrina, PR and Santo Antonio de Goiás-GO. All areas of the original host of the gathering was the bean with the exception of Londrina-PR in which the host was soybeans. A population study of the fungus through RAPD markers using 13 primers was carried out for the analysis of genetic variability of the fungus. In parallel, tests were also made for the the Mycelial compatibility groups among isolates and test production of hydrolytic enzymes. The statistical analysis was performed using the Arlequin software, which indicated variability among populations of 16.94% and 83.06% within populations. Were found 10 mycelial compatibility groups without specific populations .Enzyme activities performed indicated significant differences within the populations of all enzymes, a comparison between populations also showed significant differences among populations in polygalacturonases, 1,3-β-glucanase and xylanase. The results indicate a high level of variability within populations and low variability among populations. / O fungo Sclerotinia sclerotiorum está entre os fitopatógenos mais bem sucedidos, onívoros e sem hospedeiros definido, é considerado um dos patógenos fúngicos mais importantes no mundo. Está distribuído em todas as regiões produtoras, sejam elas temperadas, subtropicais ou tropicais. O fungo produz estruturas de resistência denominadas escleródios, na superfície e no interior dos tecidos colonizados. Estes retornam ao solo com os resíduos da cultura e são responsáveis pela sobrevivência do fungo na mesma área por até 8 anos. Os objetivos desse trabalho foram quantificar a variabilidade intra e inter populacional do fungo S. sclerotiorum em culturas de feijão e soja de diferentes localidades produtoras dessas espécies. Para isso foram coletados 46 isolados de S. sclerotiorum de seis locais de produção de grãos em diferentes regiões do Brasil. Os locais escolhidos foram Monte Carmelo-MG, Formosa-GO,
Lucas do Rio Verde-MT, Montividiu-GO, Londrina-PR e Santo Antonio de Goiás-GO em todas as áreas o hospedeiro de origem da coleta foi o feijoeiro, com exceção de Londrina-PR, na qual o hospedeiro foi soja. Foi feito um estudo populacional do fungo através de marcadores do tipo RAPD com a utilização de 13 primers para a análise da variabilidade genética do fungo. Paralelamente também foram feitos testes para a formação de grupo de compatibilidade micelial entre os isolados e testes de produção de enzimas hidrolíticas. A análise estatística dos dados se deu através do programa Arlequin, o qual indicou
variabilidade de 16,94% entre populações e 83,06% dentro de populações. Foram formados 10 grupos de compatibilidade micelial sem especificidade de populações. As atividades enzimáticas realizadas indicaram diferenças significativas dentro de populações de todas as enzimas. A comparação entre populações também indicou diferenças significativas entre populações nas enzimas poligalacturonases, 1,3-β-glucanase e xilanase. Os resultados indicaram baixo nível de variabilidade entre populações e alta variabilidade dentre as populações.
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Estudo da intera????o in vitro de Sclerotinia sclerotiorum com diferentes hospedeirosMaximiano, Mariana Rocha 18 June 2015 (has links)
Submitted by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-06-02T12:47:54Z
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Previous issue date: 2015-06-18 / Sclerotinia sclerotiorum, the causal agent of white mold, is a plant pathogenic fungus that has a characteristic feature, production of sclerotia, resistance structures that can be viable for up to 10 years in the soil, with ability to initiate a new cycle of infection under favorable conditions. The disease control methods are based on integrated management practices, including biological and chemical control. The proteomic study of this interaction may be a strategy for studying this pathosystem, however, the small amount of mycelium produced during the infectious process in vivo greatly limits the study of this pathosystem using this strategy. The main goals of this work were the development and validation of a culture medium that would partially mimic the host and allow the production of large amounts of micelium for in vitro studies of this pathosystem. For this purpose, a protocol was established for the production of culture media prepared with leaf extract of the hosts. These media were inoculated with sclerotia of the monosporic isolate SS 200 of S. sclerotiorum and the differential expression of effectors and candidate effectors of virulence of the fungus was evaluated by qPCR. The results showed that a large amount of micelia grew in the media and effector genes and candidate effector genes were induced in these media. These results indicate that the proposed culture media can be used to study the in vitro interaction between S. sclerotiorum and several plant hosts and that they can be useful especially in proteomic studies. / Sclerotinia sclerotiorum, agente causal do mofo branco, ?? um fungo fitopatog??nico que possui uma caracter??stica marcante, a produ????o de escler??dios, estruturas de resist??ncia que podem ser vi??veis por at?? 10 anos no solo, com capacidade de iniciar um novo ciclo de infec????o em condi????es favor??veis. Os m??todos de controle da doen??a baseiam-se em pr??ticas de manejo integrado, incluindo controle biol??gico e qu??mico. O estudo prote??mico desta intera????o pode ser uma estrat??gia para o estudo deste patossistema, entretanto, a pequena quantidade de mic??lio produzido pelo pat??geno durante o processo infeccioso in vivo limita bastante o estudo deste patossistema utilizando esta estrat??gia. Os objetivos deste trabalho foram o desenvolvimento e valida????o de um meio de cultura que mimetizasse parcialmente o hospedeiro e permitisse a produ????o de grande quantidade de massa micelial para estudos in vitro desse patossistema. Para tal, foi estabelecido um protocolo para a produ????o de meios de cultura, preparados a partir de extratos foliares dos hospedeiros. Estes meios foram inoculados com escler??dios do isolado monosp??rico de S. sclerotiorum SS 200 e a express??o diferencial de genes efetores e candidatos a efetores de virul??ncia do fungo foi avaliada por qPCR. Os resultados mostraram que em todos os meios testados houve crescimento de grande quantidade de massa micelial e que os meios foram capazes de induzir a express??o de genes efetores e candidatos a efetores. Portanto, os resultados indicam que os meios propostos podem ser usados no estudo da intera????o in vitro de S. sclerotiorum com v??rios hospedeiros, especialmente em estudos prote??micos.
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Interactions between Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, Bradysia coprophila Lintner (dark-winged fungus gnat) and mycoparasitic fungiAnas, Osama January 1988 (has links)
No description available.
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Interactions between Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, Bradysia coprophila Lintner (dark-winged fungus gnat) and mycoparasitic fungiAnas, Osama January 1988 (has links)
Sclerotinia sclerotiorum is a pathogen of crops grown in the muck soil regions of Quebec. Soil baiting tests indicated that the sclerotia of S. sclerotiorum are attacked and destroyed by the larvae of Bradysia coprophila and mycoparasites. Sclerotia with rinds partially damaged by the larvae were found to be more susceptible to mycoparasitism by Trichoderma viride. Increasing the organic matter content and porosity of soils resulted in increased damage to sclerotia when larvae were present. Studies conducted to determine if larvae could be reared on diets of various fungi and plant tissue showed that mycelia and sclerotia of S. sclerotiorum were the most successful food sources, followed by mycelia and sclerotia of Botrytis porri and Rhizoctonia solani. Adults produced on mycelia and sclerotia of Sclerotinia minor, Fusarium solani f. sp. pisi, and Botrytis cinerea seldom were fertile. Larvae generally failed to survive when reared on cultures of Trichoderma viride. Larval development occurred on all plants inoculated with the above pathogens but failed to occur on noninoculated healthy plants. Salivary gland secretions of the larvae were found to inhibit the germination of sclerotia. Analyses of the secretion determined that it contains 4.3% protein and had chitinase activity. Mechanically damaged and undamaged sclerotia exhibited an increase in eruptive mycelial germination when treated with 1.5 $ mu$g ml$ sp{-1}$ chitinase but germination decreased at 50, 100 and 150 $ mu$g ml$ sp{-1}$ chitinase concentrations. Noneruptive mycelial germination and carpogenic germination occurred when sclerotia were treated with acetate buffer and distilled water.
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Effects of covering composted vegetable wastes on quality of compost, quality and composition of leachate, and survival of plant pathogensParé, Monique. January 1997 (has links)
Composting trials were undertaken to study the feasibility of using crucifer or carrot residues with straw or sawdust for composting. Compost temperature and moisture were monitored regularly, and compost samples were analyzed for physico-chemical characteristics at the beginning in the fall, before turning in spring, and at the end of each composting cycle. A geotextile cover was tested. Compost leachate volumes were measured throughout the two composting cycles. In addition, the leachate was submitted to phytotoxicity tests and physico-chemical analyses. Selected phytopathogens were introduced in the compost in order to assess their potential for survival during the composting process. Three pathogens having resistant survival structures were included: Plasmodiophora brassicae, Fusarium oxysporum f.sp. cucumerinum , and Sclerotinia sclerotiorum. Greenhouse growth trials were performed with compost-enriched media and a commercial mix. (Abstract shortened by UMI.)
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Herstellung, Expression und Charakterisierung von rekombinanten Antikörpern und Immuntoxinen gegen Phoma lingam, Sclerotinia sclerotiorum und Verticillium dahliaeDorfmüller, Simone. Unknown Date (has links) (PDF)
Techn. Hochsch., Diss., 2002--Aachen.
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Amostragem sequencial de sementes de soja e feijão na detecção de Sclerotinia sclerotiorumBallaris, Alessandra de Lourdes [UNESP] 10 February 2014 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2014-02-10Bitstream added on 2014-06-13T18:40:35Z : No. of bitstreams: 1
000755380.pdf: 1446040 bytes, checksum: 68388d851035743262279c6845346dbd (MD5) / Tendo em vista a elevação de áreas produtoras de sementes de feijão e de soja infectadas por Sclerotinia sclerotiorum e a recomendação do cumprimento do nível de tolerância zero para este agente patogênico na comercialização de sementes, o trabalho teve por o objetivo verificar a eficiência de um plano de amostragem sequencial para sementes de feijão e da soja, na detectação de S. sclerotiorum. Deste modo, primeiramente foi avaliada a heterogeneidade das amostras dos lotes dos cultivares de para as cultivares de feijão, cultivares Pérola (sementes C1), Pérola (“sementes salvas”) e Bolinha (“sementes salvas”), e de soja, cultivar IAC-Foscarin (sementes C1) pelos testes dos valores H e R e, concomitantemente verificada a qualidade fisiológica e sanitária utilizando-se métodos descritos pelas Regras para Análise de Sementes (BRASIL, 2009). Para testar a presença ou ausência do patógeno foi realizada a verificação da distribuição do mesmo através do modelo binomial positivo, utilizando-se para este fim, o número de sementes infectadas naturalmente e recuperadas pelos testes Neon-S e Rolo de Papel. A eficiência do teste Neon-S, foi obtida para diferentes níveis de infecção (1:100, 1:200, …,1:1000), variando-se a proporção de 1 a 10 sementes por porção fixa analisada. Para a caracterização das amostras, a análise estatística para cada teste foi feita, em delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância e as médias dos tratamentos foram comparadas pelo teste de Tukey (P ≤ 0,05) de probabilidade. O plano de amostragem sequencial foi aplicado variando-se o tamanho da... / Given the elevation of producing areas of bean seeds and infected by Sclerotinia sclerotiorum and soybean recommendation of compliance with level zero tolerance for this pathogen in the marketing of seeds, the study was aimed to verify the efficiency of a plan sequential sampling for seed beans and soybeans in S. sclerotiorum detection list. Thus, first the heterogeneity of samples of lots of cultivars to cultivars of beans, Perola (seeds C1 ), Perola ( saved seed ) and Bolinha ( saved seed ), and soybean was evaluated, IAC - Foscarin (seeds C1) for values tests of H and R, concomitantly observed physiological and sanitary quality using methods described in the Rules for Seed Analysis (BRAZIL, 2009). To test for the presence or absence of the pathogen to check the distribution thereof was performed using the positive binomial model, using for this purpose the number of seed naturally infected and recovered by Neon-S and Roll Paper tests. The efficiency of Neon- S test was obtained for different levels of infection (1:100 , 1:200 , ..., 1:1000), varying the ratio 1 to 10 seeds per flat portion analyzed. For the characterization of samples, statistical analysis for each test was taken in a completely randomized design with four replications. Data were subjected to analysis of variance and the treatment means were compared by Tukey test (P ≤ 0,05) probability. The sequential sampling method was applied by varying the sample size from 100 to 1000 seeds at intervals of 100 seeds for different cultivars analyzed. The sampling sequence of beans seeds and soybean for detection of Sclerotinia sclerotiorum in the mycelial form was efficient, since 800 and 1.000 seeds are evaluated considering incidences of 0,01 and 0,005 % , respectively. Methods Neon-S and Roll Paper tests were sensitive in the detection of Sclerotinia sclerotiorum mycelial seed and soya beans.
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