Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-01-29Bitstream added on 2014-06-13T19:37:30Z : No. of bitstreams: 1 000754192.pdf: 1331701 bytes, checksum: 9e037a2c30442e3120292b8c1b097b07 (MD5) / A podridão de Sclerotinia, causada pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum, tem ocasionado perdas significativas em culturas agrícolas de importância econômica ao redor do mundo, dentre elas a soja. Considerando que o tratamento de sementes é uma medida de manejo eficaz no controle de patógenos, é justificável o estudo de produtos químicos para esta modalidade de aplicação, visando ao controle da doença e, também, melhor desenvolvimento inicial da cultura, reduzindo o tempo de exposição a fungos e insetos presentes no solo. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito do tratamento de sementes com fungicidas e inseticida, isolados e em mistura, sobre a qualidade sanitária e fisiológica de sementes de soja infectadas por S. sclerotiorum. Foi utilizado um lote da cultivar M7908RR com 20% de infecção pelo fungo. Os tratamentos [produto químico (dosagem mL ou g p.c/100Kg de sementes)] foram compostos por: tiofanato metílico + fluazinam (180); tiofanato metílico + fluazinam + acetamipride (180 + 100); tiofanato metílico + fluazinam + acetamipride (180 + 200); tiofanato metílico + fluazinam (215); tiofanato metílico + fluazinam + acetamipride (215 + 100); tiofanato metílico + fluazinam + acetamipride (215 + 200); acetamipride (100); acetamipride (200); carbendazin + thiram (200); carboxina + thiram (300); fludioxonil + metalaxil-M (100); piraclostrobina + tiofanato metílico + fipronil (200). A testemunha foi constituída de 2 sementes não tratadas. Após o tratamento químico, as sementes foram analisadas quanto às qualidades sanitária (métodos do papel filtro e de incubação em substrato semi-seletivo – Neon) e física - fisiológica (germinação, teor de água, primeira contagem de germinação, envelhecimento acelerado, comprimento de plântulas, índice de velocidade de germinação, altura e massa seca de plantas). Também foi avaliada a incidência do fungo... / The Sclerotinia rot, caused by Sclerotinia sclerotiorum, has been caused losses significant at agricultural crops with economic importance around the world, among them soybean. Whereas seed treatment is a measure of effective management to pathogens control, it is justifiable to study chemicals for this type of application, aimed at controlling the disease and also better initial crop development, reducing of the exposure time to fungi and insects in the soil. Thus, the present study aimed to evaluate the effect of seed treatment with fungicides and insecticides, alone and in combination, on the health and physiological quality of soybean seeds infected by S. sclerotiorum. It was used a batch of variety M7908RR with 20% fungus infection. The treatments [ chemical (dose mL ou g c.p./100kg of the seed) ] were composed of: thiophanate methyl + fluazinam (180), thiophanate methyl + fluazinam + acetamiprid (180 + 100), thiophanate methyl + fluazinam + acetamiprid (180 + 200), thiophanate methyl + fluazinam (215), thiophanate methyl + acetamiprid + fluazinam (215 + 100), thiophanate methyl + acetamiprid + fluazinam (215 + 200), acetamiprid (100), acetamiprid (200), carbendazim + thiram (200); carboxin + thiram (300); fludioxonil + metalaxyl-M (100); pyraclostrobin + thiophanate methyl + fipronil (200). The witness was consisted of untreated seeds. After chemical treatment, the seeds were analyzed for their health qualities (filter methods and the incubation on semi-selective substrate - Neon) and physical - physiological (germination, moisture content, first count of the germination, senescent acceleration, seedling length, index of germination speed, height and dry matter of the plant). Also it was analyzed the incidence of the fungus in plants, at the greenhouse. The fungicides treatments, alone or in mixture with insecticide reduced the incidence of S. sclerotiorum soybean seeds; the insecticide ...

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-02T18:54:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 429906 bytes, checksum: 0b67805b081bf9b6884b7dce27e092c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-02T18:54:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 429906 bytes, checksum: 0b67805b081bf9b6884b7dce27e092c3 (MD5) Previous issue date: 2005-05-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O mofo-branco, causado por Sclerotinia sclerotiorum, é uma das doenças mais destrutivas do feijoeiro em Minas Gerais, especialmente nos plantios irrigados do outono-inverno. O controle da doença é mais eficiente com a adoção de medidas integradas, visando, principalmente, à redução do inóculo do patógeno no solo. O objetivo deste trabalho foi estudar a associação de estratégias de controle do mofo-branco do feijoeiro em área irrigada, incluindo o controle biológico, a redução da freqüência de irrigação e da densidade de plantio e a aplicação de fungicida. Foram realizados dois experimentos em um campo experimental da Universidade Federal de Viçosa infestado de escleródios de S. sclerotiorum, entre os meses de maio e agosto de 2004. Em cada experimento, foi montado um fatorial 2 x 2 x 3 x 4, com dois regimes de irrigação (semanal e quinzenal), duas densidades de plantio (6 e 12 sementes/m), três estratégias de aplicação de produtos/agentes de controle biológico (aplicação do fungicida fluazinam, aplicação de Trichoderma spp. e testemunha sem aplicação) e quatro repetições. Não foi observado efeito significativo dos diferentes regimes de irrigação sobre o desenvolvimento do mofo-branco e sobre a produtividade do feijoeiro, em decorrência do regime de chuvas atípico ocorrido durante a execução do experimento. Maior severidade da doença foi observada no tratamento com densidade de plantio de 12 plantas/m, em comparação com a densidade de 6 plantas/m. Alguns componentes da produtividade foram maiores no tratamento com densidade de 6 plantas/m, comparado com 12 plantas/m. Esses resultados confirmam a viabilidade da redução da densidade de plantas em áreas infestadas por escleródios de S. sclerotiorum no controle do mofo-branco. O fungicida fluazinam destacou-se no controle da doença e ao proporcionar ganhos de produtividade, em comparação com a aplicação de Trichoderma spp. e com o tratamento sem a aplicação do fungicida e dos antagonistas. / Common beans are staple food in Brazil. Bean diseases caused by soilborne pathogens, like white mold by Sclerotinia sclerotiorum, have increased in the last years, especially during the “winter season”, in the irrigated areas, because the growers do not properly manage the irrigation, leading to high relative humidity and soil moisture conditions. No single treatment provides a satisfactory disease management, but some practices used simultaneously may be effective to control white mold. The objective of this work was to study the association of control strategies of bean white mold in an irrigated area, including biological control, plant density adjustments, water management and fungicide application. Two field experiments were carried out on May-August 2004 in an experimental field of the Federal University of Viçosa, MG, Brazil. This field is naturally infested with sclerotia of S. sclerotiorum. The trials were conducted as a 2 x 2 x 3 x 4 factorial in the randomized complete-block design: two irrigation frequencies (seven und 14 days), two plant densities (rows spaced 0.5 m apart with 6 or 12 plants/m), three disease control treatments (no control, application of fluazinam, application of Trichoderma spp.) and four replications. No significantly effect of the irrigation frequencies was observed either on the disease development or on the bean yield, probably due the untypical rain occurred during the experiments. Higher disease severity was observed in the plant density 12 plants/m, compared with 6 plants/m. Some yield components were higher in the plant density 6 plants/m, compared with 12 plants/m. These results confirm the viability of using lower plant density in sclerotia infested fields to control bean white mold. The fungicide fluazinam was efficient to control the disease and to improve the bean yield, compared to the treatments with no application of fungicide and application of Trichoderma spp. / Dissertação importada do Alexandria

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O desenvolvimento de tecnologias de produção e o melhoramento genético da cultura da soja foram essenciais para a elevada produção nacional e expansão das fronteiras agrícolas. Os programas de melhoramento têm como objetivo a obtenção de genótipos produtivos e resistentes às pragas e doenças, como o mofo branco, causado pelo Sclerotinia sclerotiorum. Pesquisas têm apontado que a base genética da soja brasileira é estreita, evidenciando a importância dos estudos de diversidade genética com a finalidade de auxiliar a escolha de genitores para hibridação. Outro ponto importante é a seleção de linhagens superiores, pois a maioria dos caracteres alvos no melhoramento da soja é de natureza quantitativa. Nessa perspectiva, informações sobre correlações entre caracteres e análise de trilha auxiliam o melhorista na definição das estratégias de melhoramento. Uma vez selecionadas, as linhagens superiores são lançadas como novas cultivares, tornando fundamentais as informações acerca do manejo da cultura, como o tamanho adequado da população de plantas. Nesse contexto, os objetivos deste estudo foram avaliar a divergência genética de soja com diferentes níveis de resistência ao mofo branco; estudar as correlações entre os caracteres e análise de trilha; e avaliar a influência da densidade de semeadura em genótipos de soja em relação à produtividade de grãos e os caracteres morfo-agronômicos. Realizaram-se dois experimentos em condições de campo, na fazenda experimental Capim Branco da Universidade Federal de Uberlândia. No primeiro, avaliaram-se 24 genótipos de soja, em delineamento de blocos completos casualizados com três repetições. Verificou-se existência de variabilidade genética para todos os caracteres agronômicos. Os genótipos UFU B7, UFU B14, UFU B16, Msoy-6101 e UFU B5 foram classificados como genótipos de ciclo precoce e os genótipos UFU B1, UFU B3, UFU B8 e UFU B16 apresentaram elevada produtividade de grãos. Quanto ao comprimento da lesão de S. sclerotiorum, foram classificados como resistentes os genótipos UFU B1, UFU B2, UFU B3, UFU B4, UFUS 7910, UFU B6, UFU B7, UFU B9 e UFU 20. Pelo método de Tocher e UPGMA, os genótipos foram distribuídos em quatro grupos. O número de dias para floração foi o caráter que mais contribuiu com a diversidade genética. Os estudos das correlações fenotípicas e genotípicas e a análise de trilha identificaram o número de vagens com três grãos com maior efeito favorável na produção de grãos. No segundo experimento, foram avaliados os genótipos UFUS LVR, UFUS 7910 e UFUS 8301 nas densidades populacionais (12; 14; 16; 18 pl m-1) em delineamento de blocos completos casualizados com quatro repetições. Observaram-se interações significativas entre os genótipos e as densidades para a maioria dos caracteres. Para os três genótipos, houve redução na produtividade de grãos com o aumento da densidade de semeadura. A densidade de 16 pl m-1 favoreceu os caracteres agronômicos e a obtenção de produtividade de grão superiores para o genótipo UFUS LVR. A cultivar UFUS 7910 apresentou caracteres agronômicos favoráveis e melhor produtividade de grãos em densidade de semeadura de 12 pl m-1. A cultivar UFUS 8301 apresentou número de vagem e produtividade superiores nas densidades 12 e 14 pl m-1. / Currently, due to the agro-industrial complex established in the country, soy is among the main crops of Brazilian agribusiness. The production technologies development and genetic improvement of those species have led to expansion of agricultural frontiers and increase of the national yield. Breeding programs have aimed to obtain genotypes that are also productive and resistant against pests and diseases, such as white mold caused by Sclerotinia sclerotiorum. The narrow genetic basis of Brazilian soybean has being pointed by researches that highlight the importance of genetic diversity studies with the purpose of assisting selection of parents aiming hybridizations. Selection of superior lines is another important point since the majority of target features in soybean breeding have a quantitative nature. From this perspective, information on correlations between characters and path analysis helps to improve breeding strategies definition. Once superior lines are selected, they are released as new cultivars. In addition, knowledge about crop management, such as the adequate size related to plant population density, is fundamental. In this context, this study aimed to evaluate the soybean genetic divergence regarding different levels of resistance to white mold; to study correlations between characters and path analysis and to evaluate influence of sowing density on grain yield and on morph agronomic features of soybean. Two experiments were carried out under field conditions in the Capim Branco farm of the Federal University of Uberlândia. The first experiment was make up by 24 soybean genotypes evaluated in a randomized complete block design with three replicates. All agronomic traits has shown genetic variability. Genotypes UFU B7, UFU B14, UFU B16, Msoy-6101 and UFU B5 were verified as early-cycle; UFU B1, UFU B3, UFU B8 and UFU B16 genotypes have showed high grain yield. Genotypes UFU B1, UFU B2, UFU B3, UFU B4, UFUS 7910, UFU B6, UFU B7, UFU B9 and UFU 20 were resistant regarding the length of lesion caused by S. sclerotiorum. The Genotypes were placed within four groups by the Tocher and UPGMA methods. Feature that most contributed to genetic diversity was the number of days to the blooming. Phenotypic and genotypic correlations and path analysis have indicated the number of pods with three grains as the feature of better effect on grains yield. In the second experiment genotypes UFU LVR, UFUS 7910 and UFUS 8301 were evaluated regarding population densities by a randomized complete block, design with four replications (12, 14, 16, 18 pl m-1). Interactions between genotypes and densities were significant for most characters. Plants height at maturity with increasing sowing density was reduced for cultivar UFUS 7910, as well for the three genotypes, there was a reduction in grain yield with increasing sowing density. Regarding UFUS LRV line, the most indicated plant population density is between 12 and 16 pl m-1. Recommended population density for UFUS 7910 is 12 pl m-1. In relation to the sowing of UFUS 8301 is indicated population sizes between 12 to 14 pl m-1. / Dissertação (Mestrado)

Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-09-18T13:05:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1544966 bytes, checksum: 2d7c99e531dd25f2d0e04968d8f3fedf (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-18T13:05:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1544966 bytes, checksum: 2d7c99e531dd25f2d0e04968d8f3fedf (MD5) Previous issue date: 2018-02-19 / Sclerotinia sclerotiorum, agente causal do mofo branco ou podridão de sclerotinia, infecta espécies de interesse agronômico, tais como aquelas destinadas à produção de grãos, fibras e hortaliças. Este estudo foi conduzido para avaliar: a variabilidade genética do patógeno; a sensibilidade aos fungicidas tiofanato-metílico (TM), fluazinam e procimidone de 238 isolados de S. sclerotiorum coletados em diferentes hospedeiros e regiões no Brasil; e a estabilidade fenotípica de isolados resistentes. Os marcadores microssatélites (SSR) e os grupos de compatibilidade micelial foram utilizados para acessar a estrutura genética da população. Vinte e dois MCGs e 53 genótipos foram identificados. A maioria dos isolados (67,7 %) foi classificado como MCG 1 ou 2. Sete grupos genéticos foram identificados. A população foi estruturada por MCG e não houve evidência de acasalamento aleatório. A população como um todo possui estrutura genética clonal. A sensibilidade aos fungicidas TM, fluazinam e procimidone foi avaliada com doses discriminatórias. O crescimento micelial de nove isolados resistentes e um isolado sensível ao TM foi avaliado durante 10 gerações. A taxa de crescimento de seis isolados resistentes reduziu com o passar das gerações. Não houve resistência a fluazinam ou procimidone. Treze isolados coletados na cultura do feijoeiro nos municípios de Cabeceira Grande (8 isolados) e Unaí (5 isolados), Minas Gerais, foram resistentes ao TM. A resistência ao TM foi causada pela substituição de leucina por fenilalanina no códon 240 do gene da β- tubulina (L240F). Isolados resistentes a TM foram encontrados apenas em uma região. Isolados resistentes coletados em Cabeceira Grande têm adaptabilidade reduzida. Em síntese, no Brasil predominam clones de S. sclerotiorum fortemente determinados por MCG, constataram-se isolados resistentes ao TM e para manejo do mofo branco, recomenda-se o uso de fungicidas com diferentes modo de ação. / Sclerotinia sclerotiorum causes white mold or sclerotinia stem rot and affects important crops such as grains, fibers and vegetables. This study was conducted to assess the genetic variability; the sensitivity to thiophanate-methyl (TM), fluazinam and procymidone of 238 isolates of S. sclerotiorum from different hosts and regions in Brazil; and the phenotypic stability of fungicide resistant isolates. Microsatellites (SSR) and mycelium compatibility groups (MCG) markers were used to assess the genetic structure of the population. Twenty-two MCGs and 53 multilocus genotypes (MLG) were identified. Most isolates (67.7 %) were distributed in either MCG 1 or 2. Seven genetic groups were detected. The population has a clonal structure largely determined by MCGs and there was no evidence of random mating. Fungicide sensitivity was assessed using the discriminatory doses for TM, fluazinam and procymidone. The stability of nine isolates TM-resistant and one sensitive was assessed after 10 transfers in culture medium without fungicide. Mycelial growth rate of six TM-resistant isolates reduced with successive transfers. There was no evidence of resistance to fluazinam or procymidone. Thirteen isolates collected in common bean fields in the municipalities of Cabeceira Grande (8 isolates) and Unaí (5 isolates), Minas Gerais state, were resistant to TM. The resistance was associated with the L240F mutation in the β-tubulin gene. Resistance to TM seems to be localized; and there is evidence for a fitness cost in resistant isolates.

Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-05-17T18:08:43Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) GRAZIELIREIS.pdf: 586825 bytes, checksum: d9fe7325ce01e3245acd93da28a6e58a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-17T18:08:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) GRAZIELIREIS.pdf: 586825 bytes, checksum: d9fe7325ce01e3245acd93da28a6e58a (MD5) Previous issue date: 2013-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The detection, transmission and control of Sclerotinia sclerotiorum associated with soybean seeds were as studied under laboratory conditions. The experiments were conducted in the laboratory of Phytopathology UFGD in the Dourados - MS. Aiming to evaluate the seed - seedling transmission of the pathogen, soybean seed artificially inoculated with the pathogen were mixed with healthy seeds, establishing five levels of incidence (0 , 2 , 4 , 8 and 10% ). The seeds were sown in soil + sand in plastic boxes , marking the position of the inoculated seeds. We evaluated the percentage of emergence at 7 and 15 days after sowing. The fungus was observed in all inoculated seedlings derived from seeds, even those who had no symptoms of disease. On the inoculated plants immediately adjacent to, the presence of the pathogen was about 39 % of them at 22 ° C and 16.4% at 27 ° C. In the second position, the average percentage of presence of the fungus was 23.35% and 8.75% to 22 to 27 ° C, respectively. Lots of seeds produced and marketed in Mato Grosso do Sul in 2008/2009 and 2009/2010 harvests in were analyzed for sanity by the method of the paper roll. The frequency of S. sclerotiorum ranged from 1.2% to 11.1% in 2008/2009 and 1% to 9.1% in the 2009/ 2010 harvest, whereas the incidence in 2008/2009 was between 0.25% and 0.75% in the 2009/2010 crop was 0.25%. to 1.5% Studying the in vitro susceptibility of S. sclerotiorum to fungicides: benzalkonium chloride, captan, fluazinam, fluopiram, iprodione, procymidone and thiophanate methyl in six concentrations (0.1, 0.5, 1, 2.5, 5 and 10 mg. mL-1) and five replicates, we observed lower growth rate with the use of the fungicide procymidone 0.1 μg.mL-1. From 1 μg.mL-1 the fluazinam and procymidone completely inhibited the mycelial growth and consequently the production of sclerotia of the fungus. At higher doses, the fungicides captan, fluopiram, iprodione and thiophanate methyl were effective in inhibiting the growth of S. sclerotiorum reaching 100% inhibition in miceliogênica germination, while the fungicide benzalkonium chloride inhibited only 16 % of the pathogen development without affecting the production of sclerotia. / Avaliou-se detecção, transmissão e controle de Sclerotinia sclerotiorum associados a sementes de soja. Os experimentos foram conduzidos no laboratório de Fitopatologia da UFGD em Dourados-MS. Com o objetivo de avaliar a transmissão semente-plântula do patógeno, sementes de soja inoculadas artificialmente com o patógeno foram misturadas a sementes sadias, estabelecendo-se cinco níveis de incidência (0, 2, 4, 8 e 10%). As sementes foram semeadas em solo + areia, em caixas plásticas, marcando-se a posição das sementes inoculadas. Avaliou-se a porcentagem de emergência aos 7 e 15 dias após a semeadura. O fungo foi observado em todas as plântulas oriundas de sementes inoculadas, mesmo naquelas que não apresentavam sintomas da doença. Nas plantas imediatamente ao lado das inoculadas, detectou-se a presença do patógeno em cerca e 39% delas à temperatura de 22° C, e 16,4% a 27° C. Nas plantas em segunda posição, a porcentagem média de presença do fungo foi de 23,35% e 8,75%, para 22 e 27° C, respectivamente. Lotes de sementes de soja produzidas e comercializadas no Mato Grosso do Sul nas safras 2008/09 e 2009/10 foram analisados quanto à sanidade pelo método do rolo de papel. A frequência de S. sclerotiorum variou de 1,2% a 11,1% na safra 2008/09 e 1% a 9,1% na safra 2009/10, enquanto que a incidência na safra 2008/09 ficou entre 0,25% e 0,75% e na safra 2009/10 foi de 0,25% a 1,5%. Estudando a sensibilidade in vitro de S. sclerotiorum aos fungicidas: cloreto de benzalcônio, captana, fluazinam, fluopiram, iprodiona, procimidona e tiofanato metílico em seis concentrações (0,1; 0,5; 1; 2,5; 5 e 10 μg.mL-1) e cinco repetições, observou-se menor taxa de crescimento com o uso do fungicida procimidone a 0,1 μg.mL-1. A partir de 1 μg.mL-1 os fungicidas fluazinam e procimidone inibiram por completo o crescimento micelial e por consequência a produção de escleródios do fungo. Em doses superiores, os fungicidas captana, fluopiram, iprodiona e tiofanato metílico, mostraram-se eficientes em inibir o desenvolvimento de S. sclerotiorum alcançando 100% de inibição na germinação miceliogênica, enquanto o fungicida cloreto de benzalcônio inibiu em apenas 16% o desenvolvimento do fitopatógeno, não afetando a produção de escleródios.

Sclerotinia sclerotiorum, a fungal pathogen of over 400 plant species has been estimated to cost UK based farmers approximately £20 million per year during severe outbreak (Oerke and Dehne 2004). S. sclerotiorum disease incidence is difficult to predict as outbreaks are often sporadic. Ascospores released from the fruiting bodies or apothecia can be dispersed for tens of kilometres. This makes disease control problematic and with no S. sclerotiorum resistant varieties available, growers are forced to spray fungicides up to three times per flowering season in anticipation of the arrival of this devastating disease. This thesis reports the development of the first infield S. sclerotiorum biosensor which aims to enable rapid detection of airborne ascospores, promoting a more accurate disease risk assessment and fungicide spraying regime. The sensor is designed to detect the presence of oxalic acid, the main pathogenicity factor secreted during early S. sclerotiorum ascospore germination. Upon electrochemical detection of this analyte in the biosensor, a binary output is relayed to farmer to warm him of a disease risk. This project focused on the development of a nutrient matrix which was designed to be contained within the biosensor. The role of this matrix was to promote the growth of captured airborne S. sclerotiorum ascospores and induce high levels of oxalic acid secretion. The use of the designed biological matrix to promote oxalic acid production was tested during three field trials in S. sclerotiorum artificially inoculated fields. This thesis describes the use of contemporary pathogenomics technologies to further investigate candidate genes involved in pathogenicity alongside the secretion of oxalic acid. A pre-described bioinformatics pipeline was used to predict the S. sclerotiorum secretome to identify potential effector proteins as well as explore proteins which are unique to S. sclerotiorum to be used as other novel targets for detection. GFP tagged constructs were designed to investigate the expression of the putative targets for S. sclerotiorum detection. The transcriptomes of wild type and oxalic acid deficient S. sclerotiorum strains during infection as well as during a saprotrophic stage were investigated. This study provided expression support for not only some of the unannotated genes identified in the putative secretome, but some candidate genes speculated to be involved in infection.

Sclerotinia sclerotiorum causes white mold and severe yield losses of pea. 484 accessions from the Pisum core collection were screened for resistance using a mini-agar plug technique. 49, 41, and 13 accessions were identified with partial resistance based on lesion expansion inhibition (LEI), nodal transmission inhibition (NTI), and both traits combined, respectively. A genetic linkage map based on F2 DNA from the cross, Lifter/PI240515, was developed with 78 markers on 9 linkage groups (LG) spanning 734 cM. Two quantitative trait loci (QTL) were identified based on phenotypic data from F2:3 and F3:4 families. A single QTL on LGIII explained 34.1% of the phenotypic variation for LEI, while a second QTL on LGII(b) explained 2.5% of the phenotypic variation for NTI. This is the first report of QTL for S. sclerotiorum resistance in pea which will be useful in development of resistant pea varieties.

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Neste estudo foi acessada a diversidade taxonômica e potencial biológico de actinobactérias isoladas de três biomas brasileiros com atividade antagônica contra Sclerotinia sclerotiorum. No total, 354 isolados foram obtidos da Coleção de Microrganismos de Importância Agrícola e Ambiental (CMAA) da Embrapa - Meio Ambiente. A atividade antagônica contra S. sclerotiorum foi avaliada por meio de ensaio in vitro. Foram selecionados 55 isolados, que apresentaram alguma porcentagem de inibição do crescimento de S. sclerotiorum. A identificação e análise da diversidade dos isolados, usando o gene 16S rRNA, demonstrou que 49 isolados são pertences ao genêro Streptomyces, quatro ao genêro Micromonospora, um a Kocuria e um a Actinomadura. Todas as actinobactérias apresentaram compatibilidade com bactérias benéficas do solo, exceto o isolado Caat P8 35. Três isolados, 1AS2a, Caat P5 55 e Caat P8 79, inibiram tanto o crescimento micelial quanto a germinação de escleródios de S. sclerotiorum. Os isolados Bc V1 06 e 3AS4 apresentaram hidrólise dos meios de fósforo orgânico e inorgânico. Com a ideia de conhecer o possível mecanismo de ação para solubilização de fósforo, o extrato aquoso do isolado 3AS4 foi submetido à análise de HPLC e o perfil cromatográfico obtido foi similar ácido glucônico. A avaliação desse isolado em casa de vegetação evidenciou diferenças na altura das plantas de soja, após seis semanas, quando inoculadas com a 3AS4. A relação Parte-aérea/Raiz foi significativamente maior quando adicionado o fósforo junto com a actinobactéria. Plantas sem adição de fósforo e com o isolado 3AS4 evidenciaram desenvolvimento similar na Parte-aérea/Raiz quando comparadas com plantas inoculadas com 40 kg ha-1 de PR e SPT. A avaliação da atividade enzimática evidenciou nove isolados capazes de hidrolisar quitina e laminarina como único substrato, sendo que três deles, 1AS2a, Caat P5 55 e Caat P8 79, foram avaliados quantitativamente, para a atividade enzimática quitinase (β 1-4 -Nacetilglucosaminidase) os resultados foram 0.03, 0.22 e 0.16 UI respectivamente, e a atividade glucanase (β 1-3-glucanase) foi 0.23, 0.25 e 0.26 UI respectivamente. Extratos orgânicos das actinobacterias obtidos com diclorometano (26) e acetato de etila (15) demostraram inibição do crescimento do fungo, somente o isolado 1AS2a apresentou inibição na concentração de 165 μg.mL-1. Estudos espectrométricos revelaram a prescença de um composto da família das bafilomicinas como principal composto ativo. A anotação do genoma do isolado 1AS2a revelou a presença de 33 operons gênicos envolvidos em vias biossínteticas para produção de compostos antimicrobianos, nos quais um deles, apresentou 100% de similaridade para operon de sintese de bafilomicina. Estudos taxonômicos mostraram que as características filogenéticas, morfológicas e químicas do isolado 1AS2c são consistentes com o gênero Streptomyces. Entretanto, algumas diferenças no perfil taxonômico, Hibridização DNA:DNA e análise de Multilocus confirmou o isolado 1AS2cT como linhagem tipo para uma nova espécie de Streptomyces, para qual o nome Streptomyces rhizosphaericola sp. nov. Com os resultados obtidos podemos afirmar: 1. Biomas brasileros possuem uma grande diversidade taxonômica e funcional 2. Os isolados de Actinobacteria posuem capacidade antagonica contra o fungo S. sclerotiorum 3. O isolado 3AS4 posui a capacidade de solubilização de fósforo e estimulação de crescimento vegetal do em condições de casa de vegetação 4. A efetiva produção de compostos antifúngicos do isolado 1AS2a, revelados diante o uso combiando de ferramentas espectroscopicas e bioinformaticas. Considerando todo isso, existe um enorme potencial de biocontrole em isolados de Actinobactérias de diferentes biomas do Brasil que podem ser uma nova opcão para uso na agricultura. / In this study, the taxonomic diversity and biological potential of actinobacteria isolated from different Brazilian biomes with antagonistic activity against Sclerotinia sclerotiorum were accessed. In total, 354 isolates were obtained from the Embrapa - Environment Collection of Microorganisms of Agricultural and Environmental Importance (CMAA). The antagonistic activity against S. sclerotiorum was evaluated by in vitro assay. In total, 55 isolates were obtained, all isolates showed some percentage of visible growth inhibition against S. sclerotiorum. The identification and analysis of the diversity of the isolates using the 16S rRNA gene showed that 49 isolates belong to the Streptomyces genus, 4 isolates belonging to the genus Micromonospora, 1 isolated to the genus Kocuria and 1 isolated to the genus Actinomadura. All the actinobacteria showed compatibility with the soil beneficial bacteria evaluated except the isolate Caat P8 35. Three isolates, 1AS2a, Caat P555 and Caat P8 79 inhibited both mycelia and S. sclerotiorum sclerotia. The isolates Bc V1 06 and 3AS4 showed hydrolysis using organic and inorganic phosphorus media. In order to know the possible mechanism of action for solubilization of phosphorus, the aqueous extract of the 3AS4 isolate was submitted to HPLC analysis, the chromatographic profile obtained was similar to gluconic acid. Greenhouse evaluation showed differences in height of soybean plants after 6 weeks when inoculated with 3AS4. The Shoot/Root ratio was significantly higher when the phosphorus was added along with the actinobacteria. Plants with no phosphorus addition and with 3AS4 showed similar development in the Shoot/Root when compared to inoculated plants with 40 kg.ha-1 of PR and SPT. The evaluation of the enzymatic activity evidenced nine isolates efficient of hydrolyzing chitin and laminarin as the only carbon substrate, three of them; 1AS2a, Caat P5 55 e Caat P8 79 isolates (β-1-4-N-acetylglucosaminidase) was 0.03, 0.22 and 0.16 IU respectively, however, glucanase activity (β-1-3-glucanase) was 0.23, 0.25 and 0.26 IU respectively. Organic extracts of the actinobacteria obtained with dichloromethane (26) and ethyl acetate (15) demonstrated inhibition of fungus growth, only the 1AS2a isolate presented inhibition at the concentration of 165 μg.mL-1. Spectrometric studies have revealed the presence of a compound of the bafilomycins family as the main active compound. The annotation of the genome of the 1AS2a isolate revealed the presence of 33 gene operons involved in biosynthetic pathways for the production of antimicrobial compounds, in which one of them presented 100% similarity to the bafilomycin synthesis cluster. Taxonomic studies have shown that the phylogenetic, morphological and chemical characteristics of the 1AS2c isolate are consistent with the genus Streptomyces. However, some differences in the taxonomic profile, DDH and Multilocus analysis confirmed the isolated 1AS2cT as a type strain for Streptomyces, for which the name Streptomyces rhizosphaericola sp. Nov. With the results obtained we can corroborate: 1. Brazilian biomes possess a great taxonomic and functional diversity 2. Detection of the antagonism of Actinobacteria isolates against S. sclerotiorum fungus 3. Phosphorus solubilization and plant growth stimulation of 3AS4 isolate under conditions of greenhouse 4. The effective antifungal compounds production of the 1AS2a isolate, revealed in the combining use of spectroscopic and bioinformatics tools. Considering all this, there is an enormous potential for biocontrol in isolates of Actinobacteria from different Brazilian biomes that may be a new option for use in agriculture.