Spelling suggestions: "subject:"sintase"" "subject:"sintetase""
1 |
Caracterização da diversidade microbiana da Praia dos Anjos - Arraial do Cabo - RJ através de metagenômicaCuadrat, Rafael Ricardo de Castro January 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-03-04T14:01:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2
rafael_cuadrat_ioc_dout_2014.pdf: 4008307 bytes, checksum: f638f1e7b8458c6f20d884b710ddaf75 (MD5)
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
Previous issue date: 2016-02-23 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Os ambientes marinhos cobrem cerca de 70% da superfície do planeta. Esses habitats apresentam uma grande variabilidade de temperatura, pressão e salinidade, abrigando uma vasta biodiversidade microbiana, pertencentes aos 3 domínios da vida (Archaea, Bacteria e Eukarya). Estes microrganismos representam até 98% da produção primária destes ambientes representando grande potencial para exploração e descoberta de novos compostos naturais de interesse para a indústria farmacêutica e da biotecnologia. Entretanto, apenas cerca de 1% dos microrganismos podem ser cultivados com as técnicas atuais utilizando-se meios de cultura em laboratório. Com objetivo de contornar esta limitação, estudos de metagenômica vem sendo conduzidos para analisar amostras de diferentes ambientes, incluindo ambientes aquáticos como rios, lagos e regiões costeiras ou de oceano aberto. No presente estudo, foram avaliados a diversidade taxonômica e o potencial metabólico de uma amostra (fracionada em duas por filtração, nomeadas: amostra E \2013 retida na membrana de 0,8 \03BCm e amostra P \2013 retida na membrana de 0,22 \03BCm) coletada na Praia dos Anjos (Arraial do Cabo \2013 RJ), um ambiente de grande interesse por ser afetado pelo fenômeno da ressurgência, além de sofrer impacto antrópico (turismo e pesca). Foram também triados genes do metabolismo secundário (PKS e NRPS) de microrganismos através de pirosequenciamento do DNA total da comunidade
Um total de 651.083 e 542.647 sequências de nucleotídeos (reads) foram obtidas das amostras P e E, respectivamente. As sequências obtidas foram analisadas através de similaridade com bancos de sequências públicas (Genbank) utilizando o pacote BLAST e o programa MEGAN para classificação taxonômica baseada no algoritmo do Último Ancestral Comum (LCA). O filo mais abundante nas duas amostras foi Proteobacteria, seguido por Bacteroidetes e Cyanobacteria (este último principalmente na amostra E). Membros do clado Roseobacter (principalmente gêneros Roseobacter e Ruegeria) foram encontrados em alta abundância nas duas amostras, porém a dominância é maior na amostra P (representando até 29% dos gêneros identificados). Através de modelos HMM (do inglês \201CHidden Markov Models\201D), foram triadas sequências de domínios conservados ceto-acil sintase - KS e domínio de condensação \2013 C, de enzimas PKS e NRPS, respectivamente. Um total de 84 sequências de KS e 46 sequências de domínio C foram encontradas nas duas amostras, mostrando o potencial deste ambiente para a descoberta de novos compostos de interesse para a indústria
Adicionalmente, a abundância e diversidade de bactérias aeróbias fotossintetizantes anoxigênicas (AAP) no metagenoma de Arraial do Cabo e em metagenomas públicos do projeto GOS foi investigada através de uma metodologia in silico utilizando perfis de modelos ocultos de markov (pHMM) para triar os genes do núcleo de reação da fotossíntese anoxigênica (pufM e pufL), além do gene bchX, e através destes estimar a abundância e diversidade de AAPs em metagenomas. A amostra de maior abundância em AAPs foi a amostra P de Arraial do Cabo, com aproximadamente 23,88% do total de células presentes na amostra. Das 10 amostras do GOS mais abundantes em AAPs, 8 (80%) foram obtidas de regiões próximas a linha do equador. Foi possível classificar as sequências de pufM em filogrupos, mostrando alta abundância do filogrupo G (clado das Roseobacter) em Arraial do Cabo. Este filogrupo se mostrou o mais cosmopolita, presente em 11 das 12 (91,66%) amostras analisadas. Os resultados nos permitiram concluir que o ambiente estudado foi afetado pelo fenômeno da ressurgência, e a amostra foi coletada após o bloom do fictoplanton / The marine environments cover ~70% of the Earth's surface. These habitats
present great variability
of temperature, pressure and salinity, harboring a wide range
of microorganisms from the three domains of life (Archaea, Bacteria and Eukarya)
which are responsible for ~98% of the marine primary production. This huge
biodiversity represents a great potent
ial, as its exploration allows us to discover new
enzymes for industrial use. However, only ~1% of the
environmental
microorganism
can be cultivated using culture
-
dependent approaches. To overcome this limitation,
metagenomics studies have been conducted u
sing samples for different
environments, including aquatic
ones
like costal seawater, deep seawater, open
ocean waters and freshwater from rivers and lagoons. In this work, we explore the
taxonomic diversity and the metabolic potential (to find new natural
compounds
produced by PKS and NRPS enzymes) of the Praia dos Anjos (Angel's Beach), in
Arraial do Cabo, Rio de Janeiro, Brazil
by
pyrosequencing its metagenome. The
sample was fractionated by filtration in 2 membranes to separate the eukaryotic
(sample E)
from prokaryotic communities (sample P).
A total of 651,083 and 542,647
reads were obtained for samples P and E, respectively.
The obtained sequences
were analyzed by similarity using the BLAST package and the MEGAN program,
applying the Last Common Ancest
ral (LCA) algorithm. The MG
-
RAST pipeline was
used to annotate the genes from the community.
The most abundant bacterial phylum present in both samples was
Proteobacteria, followed by Bacteroidetes and Cyanobacteria (mainly on sample E).
Members of
the Ros
eobacter
clade (
Roseobacter
and
Ruegeria
genus) was
abundant in both samples, but in larger abundance on sample P (up to 29% of
identified genus)
.
The keto
-
acyl synthase (KS) domains from PKSs and condensation domain
(C) from NRPS were screened using pHMMs
approach. A total of 84 KS sequences
and 46 C sequences were obtained from both samples, showing the potential of this
environment
for the
discover
y of
new compounds.
The aerobic anoxygenic
phototrophs bacteria (AAP) are
photoheterotrophic
microorganisms
that play
important roles on biogeochemical cycles.
In oceans, this group is wide
ly
distributed,
however,
its
abundance and
relevance
in carbon fixation is poorly understood.
In the
present work, with the aim to estimate the abundance and diversity of AAPs
in the
metagenome from Arraial do Cabo, an
in silico
approach using Hiden Markov Models
profiles
(pHMM) was developed to screen core genes of anoxygenic photosynthesis (
pufM
and
pufL
), in addition to chlorophyllide reductase subunit X gene (bchX). The
met
agenomes from Global Ocean Sample Expedition (GOS) was also screened with
comparative purposes. The most abundant sample was sample P from Arraial do
Cabo, with ~23.88% of total cells
in the sample
. The 10 most abundant samples from
GOS, in addition to the
2 samples from Arraial do Cabo, were selected to assembl
y
,
ORF extraction and phylogenetic analysis of
pufM
genes. From the 10 GOS
samples, 80% were collected in sites close to the Equador.
It w
as possible to classify
the most of sequences in phylogroups,
showing a high abundance of phylogroup G
(
Roseobacter
clade) in Arraial do Cabo samples. This phylogroup was the most
ubiquitous, present on 11 from 12
(
91.66%)
assembled
samples.
|
2 |
Avaliação do efeito da analgesia preemptiva sobre os eventos inflamatórios e níveis de citocinas pró-inflamatórias (TNF-α E IL-1β) em cirurgias de terceiros molares inferiores / Effect of preemptive analgesia on tissue levels of interleukin-1 beta and tumor necrosis factor alpha in third molar surgery: a triple-blinded randomized placebo-controlled studyAlbuquerque, Assis Filipe Medeiros January 2016 (has links)
ALBUQUERQUE, Assis Filipe Medeiros. Avaliação do efeito da analgesia preemptiva sobre os eventos inflamatórios e níveis de citocinas pró-inflamatórias (TNF-α E IL-1β) em cirurgias de terceiros molares inferiores. 2016. 96 f. Dissertação (Mestrado em Odontologia) - Faculdade de Farmácia, Odontologia e Enfermagem, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2016-02-26T13:55:16Z
No. of bitstreams: 1
2016_dis_afmalbuquerque.pdf: 12790761 bytes, checksum: 47c88fafa0d7a457a1634159873f6347 (MD5) / Approved for entry into archive by denise santos(denise.santos@ufc.br) on 2016-02-26T14:05:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1
2016_dis_afmalbuquerque.pdf: 12790761 bytes, checksum: 47c88fafa0d7a457a1634159873f6347 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-26T14:05:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2016_dis_afmalbuquerque.pdf: 12790761 bytes, checksum: 47c88fafa0d7a457a1634159873f6347 (MD5)
Previous issue date: 2016 / The surgery for removal of third molars constitutes a com
monly performed procedure in
dentistry, and is associated with varying degrees of postoperative pain, which can significantly
affect the quality of life of patients. Considering the maximum benefit to the patient undergoing
an operation, the preemptive ana
lgesia has been the pharmacological strategy widely
researched in recent decades. This study aimed to evaluate the pre
-
emptive analgesia effect on
the levels of proinflammatory cytokines
(
TNF
-
α
e
IL
-
1
β
)
following mandibular third molar
surgery. A unicentric, triple
-
blind, randomized, placebo
-
controlled study was conducted with
36 patients undergoing surgical removal of mandibular third molars. All volunteers were
allocated randomly to recei
ve either etoricoxib 120 mg, ibuprofen 400 mg or placebo 1 hour
preoperatively, and inflammatory events were evaluated. There was significant difference
between groups with respect to pain scores (p <0.001). Both etoricoxib and ibuprofen reduced
pain score
s compared to placebo (p <0.05). The TNF
-
α
dose consumed by the placebo group showed no statistically significant difference (p = 0.127) from time 0 ' to time 30'
minutes
,
whereas both ibuprofen and etoricoxib showed significant reduction between times. The IL
-
1
β
dosage consumed by the placebo gr
oups
and etoricoxib
showed no significant variation;
however, the ibuprofen group showed a significant reduction (p = 0.038) of IL
-
1
β
levels from
time 0
’
to time 30
’
. As a conclusion, both TNF
-
α
and IL
-
1
β
levels and the inflammatory events
in surgeries for
removal of third molars showed to be inversely proportional to the NSAID's
COX
-
2 selectivity used preemptively. Moreover, TNF
-
α
and IL
-
1
β
showed a significant
reduction in clinical parameters related to inflammatory events compared to the placebo group. / A cirurgia para remoção de terceiros molares constitui-se um procedimento frequentemente realizado em odontologia, estando associado a variados graus de dor pós-operatória, podendo afetar a qualidade de vida dos pacientes. Considerando o benefício máximo ao paciente submetido a uma cirurgia, insere-se a analgesia preemptiva como estratégia farmacológica amplamente pesquisada nas últimas décadas. O objetivo do presente estudo foi avaliar o efeito da analgesia preemptiva sob os efeitos inflamatórios e sob os níveis de citocinas pró-inflamatórias (TNF-α e IL-1β) em cirurgias de terceiros molares inferiores. Foi realizado um estudo unicêntrico, triplo-cego, randomizado, placebo-controlado, com 36 pacientes submetidos à remoção cirúrgica de terceiros molares mandibulares (n=72) que foram randomicamente alocados para receber etoricoxibe 120 mg, ibuprofeno 400mg ou placebo 1 hora pré-operatoriamente, e os eventos inflamatórios (dor, edema e abertura bucal) foram avaliados. Houve diferença significativa entre os grupos com relação aos escores de dor (p<0,001). Etoricoxibe e ibuprofeno reduziram os escores de dor em relação ao placebo (p<0,05). A dosagem de TNF-α do grupo placebo não mostrou diferença estatisticamente significante (p=0,127) do tempo 0’ para o tempo 30’ minutos, enquanto que o ibuprofeno e o etoricoxibe mostraram redução significativa entre os tempos. A dosagem de IL-1β dos grupos placebo e etoricoxibe não mostraram variação significativa, porém, no grupo ibuprofeno houve redução significante (p=0,038) dos níveis do tempo 0` para o tempo 30`. Como conclusão do estudo, os níveis de TNF-α e IL-1β, bem como os eventos inflamatórios em cirurgias para remoção de terceiros molares inferiores, mostraram-se inversamente proporcionais à seletividade COX-2 do AINE utilizado preemptivamente, e estes apresentaram redução significativa dos parâmetros clínicos referentes aos eventos inflamatórios em comparação ao grupo placebo.
|
3 |
Determinació de l'estructura tridimensional de la glicogen sintasa de "Pyrococcus abyssi"Horcajada Garro, Cristina 20 July 2005 (has links)
Les glicogen i midó sintases són glicosiltransferases que catalitzen la transferència de residus glucosil a l'extrem no reductor d'una cadena creixent d'un glucà α-1,4, retenint la configuració del carboni anomèric del sucre transferit. Aquest procès és central en el metabolisme energètic de la majoria d'èssers vius.En aquest treball presentem l'estructura cristal·logràfica de la glicogen sintasa de Pyrococcus abyssi (PaGS). Aquest enzim és termoestable i presenta una activitat màxima a 80ºC i és capaç d'utilitzar indistintament ADPG i UDPG com a donadors de glucosil. La PaGS forma de cossos d'inclusió en totes les condicions d'expressió en E.coli assajades. Amb el mètode de renaturalització en columna hem aconseguit que la PaGS es replegui correctament i ens ha permès obtenir la quantitat de proteïna pura necessària per encetar estudis de cristal·lització i de caracterització en solució.D'altra banda, el domini C-terminal de la PaGS s'expressa de forma soluble i la seva purificació ens ha permès disposar de quantitat suficient de proteïna per a realitzar estudis de cristal·lització. Aquest domini és monomèric tant en solució com en el cristall. La resolució de l'estructura del domini C-terminal a 1.7 Å a partir de reemplaçament molecular utilitzant el domini homòleg de la GS d'Agrobacterium tumefaciens (AtGS) ha permès utilitzar-lo com a model inicial per a resoldre l'estructura de la PaGS a 2.8 Å.La PaGS és un trímer tant en solució com en el cristall, amb una disposició triangular plana. Cadascuna de les seves subunitats està formada per dos dominis αβα tipus plegament de Rossmann separats per un solc molt profund on es troba el centre catalític de l'enzim. L'estructura global és molt similar a la de la resta d'estructures resoltes del grup GT-B que actuen amb retenció de la configuració anomèrica. La trimerització de la PaGS implica exclusivament els dominis N-terminals de l'enzim, quedant els dominis C-terminals lliures per a poder realitzar la transició d'obertura i tancament necessària per a la catàlisi.El domini C-teminal conté la cavitat d'unió a nucleòtid, mentre que la majoria d'interaccions amb l'oligosacàrid acceptor es produeixen a través de residus del domini N-terminal. L'elevada similitud del centre actiu entre les GS i les GP suggereix que ambdues operen a través d'un mecanisme catalític similar, si be no idèntic.L'estructura de la PaGS i la seva comparació amb l'estructura de l'AtGS ofereixen les bases per a entendre l'especificitat de les GS eucariotes per UDPG, com a substrat donador de glucosil, i la promiscuïtat de les GS d'arqueons per unir tant UDPG com ADPG.La localització d'una molècula de glucosa en la superfície de la PaGS i la comparació amb les GP eucariotes permeten suggerir un possible lloc d'emmagatzematge del glicogen en les GS.
|
4 |
Hexabromoacetona como agente tribromoacetilante de álcoois e como mediadora na conversão de ácidos carboxílicos em amidas, na presença de trifenilfosfinaKolling, Rosane January 2009 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciencias Fisicas e Matematicas. Programa de Pós-Graduação em Química / Made available in DSpace on 2012-10-24T17:13:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1
264141.pdf: 4020815 bytes, checksum: 8589710a3e652d57800037e984f5dc6d (MD5) / Neste trabalho, a HBA foi testada como agente tribromoacetilante de álcoois e como mediadora na conversão de ácidos carboxílicos em amidas, na presença de trifenilfosfina, a partir de reações com aminas. A HBA, não disponível comercialmente, foi preparada pelo método de Gilbert e caracterizada por p.f., IV, RMN de 13C e cristalografia de raios-X. A reação de HBA com álcoois, na presença de DMF, levou à formação dos respectivos tribromoacetatos de alquila apenas para álcoois pouco impedidos estericamente (metanol, etanol, n-propanol, n-butanol, n-pentanol, álcool iso-amílico) com rendimentos entre 55 % e 65 %, dependendo da estrutura do álcool. Os produtos, obtidos na forma de óleos incolores, foram caracterizados por IV, RMN de 1H e RMN de 13C. O método de tribromoacetilação de álcoois por HBA pode ser considerado bom comparando-se com outros reportados na literatura. As reações de ácidos carboxílicos (aromáticos e alifáticos) com aminas (aromáticas e alifáticas), mediadas por HBA, na presença de trifenilfosfina, levou à obtenção de amidas, em suaves condições, com rendimentosBR-FIUSC de 53 % a 90 %. As amidas, em sua maioria, sólidas e conhecidas, foram caracterizadas por p.f., IV e RMN de 1H. O método de obtenção de amidas mediadas por HBA tem grande aplicabilidade em função, principalmente, das suaves condições.
|
5 |
Exploração da diversidade de policetídeo sintases (PKSs) ambientaisCuadrat, Rafael Ricardo de Castro January 2010 (has links)
Submitted by Tatiana Silva (tsilva@icict.fiocruz.br) on 2013-01-25T17:22:15Z
No. of bitstreams: 1
rafael_r_c_cuadrat_ioc_bcm_0020_2010.pdf: 3574577 bytes, checksum: 65d8a71b5e600c5b8c4651cfa407aa78 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-01-25T17:22:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1
rafael_r_c_cuadrat_ioc_bcm_0020_2010.pdf: 3574577 bytes, checksum: 65d8a71b5e600c5b8c4651cfa407aa78 (MD5)
Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz.Instituto Oswaldo Cruz. Rio de janeiro, RJ, Brasil / O uso abusivo de antibióticos nos últimos tempos tem causado o surgimento de cepas multi-resistentes, inclusive em relação às moléculas de última geração, como por exemplo as cepas
de Staphylococcus aureusresistentes à Vancomicina. Isto torna importante abusca por novas
moléculas com ação antimicrobiana. A indústria farmacêutica, durante décadas, tem
trabalhado com a modificação química dos produtos naturais (produzidos a partir de
microorganismos cultivados) na tentativa de aumentar a potência destes compostos, para
torná-los eficazes contra as cepas resistentes aos atuais fármacos. Porém, a descoberta de
novos compostos naturais se mostra mais eficiente emenos onerosa do que a modificação de
compostos já conhecidos. Entretanto, estudos vêm demonstrando que somente uma pequena
porcentagem (1%-10%) dos microrganismos presentes na natureza pode ser isolada e mantida
em meios de cultura artificiais, fazendo com que estes isolados e suas respectivas moléculas
sejam sempre “redescobertos”, limitando o desenvolvimento de novos fármacos. Contudo,
abordagens moleculares como a metagenômica e ferramentas de bioinformática têm sido
utilizadas combinadamente para o acesso direto ao DNA dos microrganismos não cultiváveis.
Através da clonagem de fragmentos de DNA ambiental e posterior triagem por hibridização,
PCR e sequenciamento, podemos obter informações referentes a genes que codificam
moléculas de interesse biotecnológico e farmacológico, como por exemplo: lipases, esterases,
celulases, quitinases, policetídeo sintases, etc. As famílias de genes que codificam as enzimas
PKSs (polyketides synthases) e halogenases flanqueadoras são consideradas de interesse
biotecnológico pois são produzidas no metabolismo secundário de diversos organismos e são
fundamentais para a síntese de compostos antimicrobianos e antitumor. Visando a
identificação e análise da variabilidade das PKSs, é interessante que se utilize amostras de
DNA de ambientes com alta diversidade genética, como é o caso dos ambientes marinhos
costeiros. Trabalhos preliminares realizados por nosso grupo mostram considerável
diversidade em águas superficiais marinhas, composta por fungos, dinoflagelados,
cianobactérias e actinobactérias não cultivados. O objetivo deste trabalho é analisar a
diversidade de PKSs em ambientes marinhos, realizando inferências sobre evolução e
filogenia destas enzimas. Foi possível sequenciar 5novas regiões KS de PKS tipo I iterativa e
modular, além de constatar uma grande diversidade de PKS nos bancos de dados ambientais
estudados. / Overuse of antibiotics in recent times has caused the emergence multi-resistents strain,
including some molecules of last generation, such as strains of Staphylococcus aureus
resistant to Vancomycin. This makes it important tosearch for new molecules with anti-microbial activity. The pharmaceutical industry, for decades, has worked with the chemical
modification of natural products (produced from cultivated microorganisms) in an attempt to
increase the potency of these compounds to make them effective against strains resistant to
current drugs. However, the discovery of new natural compounds is more efficient and less
costly than the modification of compounds known. However, research has shown that only a
small percentage (1% -10%) of microorganisms in nature can be isolated and kept in artificial
culture medium, making these isolates and their molecules are always "rediscovered" by
limiting the development of new drugs. However, molecular approaches such as metagenomic
and bioinformatics tools have been used in combination for direct access to the DNA of non-cultivable microorganisms. By cloning DNA fragmentsand subsequent environmental
screening by hybridization, PCR and sequencing, we can obtain information about the genes
that encode molecules of pharmacological and biotechnological interest, for example, lipases,
esterases, cellulases, chitinases, polyketide synthases, etc. The families of genes that encode
enzymes PKSs (polyketides synthases) and flanking halogenases are considered of
biotechnological interest because they are producedin the secondary metabolism of different
organisms and are essential for the synthesis of antimicrobial compounds and antitumor. For
the identification and analysis of variability of PKSs, it is interesting to use DNA samples
from environments with high genetic diversity, as is the case of coastal marine environments.
Preliminary work performed by our group show considerable diversity in marine surface
waters, composed of fungi, dinoflagellates, cyanobacteria and uncultured actinobacteria. The
objective of this study is to analyze the diversityof PKSs in marine environments, making
inferences about evolution and phylogeny of these enzymes. It was possible to sequence 5 new
regions of KS type I iterative and modular, and seea great diversity of PKSs in environmental
databases studied.
|
6 |
Diversidade e atividade antimicrobiana de bactérias isoladas de esponjas marinhas / Diversity and antimicrobial activity of bacteria isolated from marine spongesMantovani, Cristina Kampus 05 April 2011 (has links)
Orientador: Fabiana Fantinatti-Garboggini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-18T12:39:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Mantovani_CristinaKampus_M.pdf: 1137189 bytes, checksum: 2db8a522e2d39a0ae80a5e302d4d79e8 (MD5)
Previous issue date: 2011 / Resumo: Nas últimas décadas um grande número de compostos de interesse biotecnológico, como por exemplo, citotoxinas, agentes antifúngicos, antimicrobianos, antivirais e anticancerígenos têm sido isolados de esponjas marinhas. Entretanto, estudos comprovam que, em muitos casos, os compostos ativos desses animais são oriundos de micro-organismos associados, que podem compor até 60% do volume tecidual das esponjas. A presente proposta teve por objetivo a caracterização taxonômica da diversidade de bactérias cultiváveis associadas às esponjas coletadas no litoral norte do estado de São Paulo, Brasil, e a avaliação da atividade antimicrobiana a partir de extratos orgânicos brutos dessas bactérias. Um total de 86 bactérias foi recuperado das esponjas Axinella corrugata, Dragmacidon reticulata, Chelonaplysilla erecta e Petromica citrina utilizando diferentes meios de cultivo. A diversidade das bactérias foi caracterizada utilizando dados de morfologia, ARDRA (Amplified Ribossomal Restriction Analysis) e sequenciamento do gene RNA ribossomal 16S, cuja análise permitiu a identificação de membros pertencentes aos filos Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes e Firmicutes num total de 15 gêneros distintos. O gênero Pseudovibrio foi o único presente em todas as esponjas amostradas, e os gêneros Bacillus, Ruegeria, Vibrio, Staphylococcus e Erythrobacter estavam presentes em mais de uma esponja. A esponja Dragmacidon reticulata apresentou a maior diversidade bacteriana, englobando oito diferentes gêneros, dentre eles, um representate do gênero Cyclobacterium, o qual até onde se sabe, foi isolado pela primeira vez de uma esponja marinha. O gênero Bacillus esteve presente em três esponjas, mas na Petromica citrina, endêmica do Brasil, o gênero ficou representado em 74% dos isolados obtidos. Este estudo foi o primerio relato sobre a diversidade de bactérias cultiváveis da esponja Petromica critrina. Todos os isolados foram avaliados quanto à presença ou ausência dos fragmentos dos genes PKS (Polyketide Synthases) e NRPS (Non Ribossomal Peptide Synthetases), visando à investigação do potencial biotecnológico das bactérias, e mais da metade delas apresentaram pelo menos um dos genes estudados. Uma triagem da atividade antimicrobiana utilizando o método da difusão em bloco de ágar demonstrou que 21 isolados foram promissores para produção de antimicrobianos. Destes isolados foram obtidos os extratos orgâncios brutos, os quais foram testados quanto à determinação da concentração inibitória mínima contra oito micro-organismos indicadores. Um total de 13 extratos orgânicos brutos, em sua maioria respresentantes do gênero Bacillus, demonstraram ação contra o micro-organismo Bacillus subtilis ATCC 6051 e um deles demonstrou ação contra o micro-organismo Escherichia coli ATCC 11775. A numerosa inibição de estirpes de Bacillus por outros Bacillus sugere que a atividade possa ser gerada por bacteriocinas, polipeptídeos produzidos pela via ribossomal que atuam na inibição de crescimento de grupos próximos de micro-organismos. Sua possível função no meio ambiente é prover vantagem seletiva através da eliminação de um competidor relativamente próximo. Ainda, um representante do gênero Exiguobacterium apresentou atividade antimicrobiana contra B. subtilis, resultado este não descrito até o presente na literatura / Abstract: In recent decades a large number of compounds of biotechnological interest, such as cytotoxins, antifungal, antimicrobial, antiviral and anticancer substances have been isolated from marine sponges, however, studies show that, in many cases, the active compounds are actually produced by associated microorganisms, which can comprise up to 60% of the volume of sponge tissue. This proposal aimed to characterize the taxonomic diversity of culturable bacteria associated with sponges collected in the northern coast of São Paulo, Brazil, and to evaluate the antimicrobial activity from crude organic extracts of these bacteria. A total of 86 bacteria were recovered from sponges the Axinella corrugata, Dragmacidon reticulata, Petromica citrina and Chelonaplysilla erecta using different culture media. The diversity of bacteria was characterized using data from morphology, ARDRA (Amplified Ribossomal Restriction Analysis) and sequencing of 16S ribosomal RNA gene, whose analysis allowed the identification of members belonging to the phyla Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes and Firmicutes, in a total of 15 distinct genera. The genus Pseudovibrio was the only one present in all sponges sampled, and the genera Bacillus, Ruegeria, Vibrio, Staphylococcus and Erythrobacter were present in more than one sponge sampled. The sponge Dragmacidon reticulata showed the highest bacterial diversity, encompassing eight different genera, among which the genus Cyclobacterium, which, as far as is known, was first isolated from a marine sponge. The genus Bacillus was present in three sponges, but in Petromica citrina, endemic to Brazil, the genus accounted for 74% of the isolates. This study was the first report on the diversity of culturable bacteria from the sponge Petromica critrina. All isolates were evaluated for the presence or absence of NRPS (non ribossomal peptide synthetases) and PKS (polyketide synthase) genes in order to investigate the biotechnological potential of bacteria, and over half of the isolates had at least one of these genes. A screening of antimicrobial activity using the diffusion agar disk method showed that 21 isolates were promising for the production of antibiotics. Crude organic extracts from these isolates were produced and tested against eight indicator microorganisms to determine the minimum inhibitory concentration (MIC). A total of 13 crude organic extracts, most of the genus Bacillus, showed inhibitory activity against the microorganism Bacillus subtilis ATCC 6051, and one of them showed activity against the microorganism Escherichia coli ATCC 11775. The large inhibition of Bacillus strains to other Bacillus strains suggests that the activity can be generated by bacteriocins produced through ribosomal polypeptides that inhibit close groups of microorganisms. Its possible role in the environment is to provide a selective advantage by eliminating a relatively close competitor. Still, a representative of the genus Exiguobacterium showed antimicrobial activity against B. subtilis, which was not described in the literature up to date / Mestrado / Microbiologia / Mestre em Genética e Biologia Molecular
|
7 |
Investigação genética e funcional da produção de compostos antimicrobianos por bactérias oriundas da Antártica = Genetic and functional evaluation of production of antimicrobial compounds by bacteria from Antarctica / Genetic and functional evaluation of production of antimicrobial compounds by bacteria from AntarcticaFrança, Paula, 1987- 26 August 2018 (has links)
Orientadores: Fabiana Fantinatti Garboggini, Marta Cristina Teixeira Duarte / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-26T21:03:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Franca_Paula_M.pdf: 7905078 bytes, checksum: 6735b6d77cec7c206090abaa6e56fdfc (MD5)
Previous issue date: 2015 / Resumo: Os micro-organismos associados ao continente Antártico apresentam populações diversas e metabolicamente ativas, porém o potencial farmacológico dos compostos obtidos pelos micro-organismos é pouco conhecido. As bactérias são importante fonte de compostos utilizados atualmente como antimicrobianos, e as principais vias de biossíntese de muitos antibióticos são catalisadas pelos genes PKS (Polyketide Synthases) e NRPS (Non Ribosomal Peptide Synthetases). O presente estudo teve como objetivo a avaliação genética e funcional da produção de compostos antimicrobianos obtidos de bactérias isoladas na Baía do Almirantado, Antártica, a identificação taxonômica das bactérias que apresentaram tal potencial e a identificação do perfil químico dos compostos antimicrobianos. O total de 153 bactérias foi isolado do ambiente antártico, 127 isolados apresentaram pelo menos um dos genes PKSI, PKSII e NRPS. Estes foram identificados através do sequenciamento parcial do gene RNA ribossomal 16S e pertencem a 28 gêneros distintos, sendo representantes dos Filos Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria e Bacteroidetes. A avaliação funcional da produção de antimicrobianos foi realizada com o total de 76 isolados dos quais 30 isolados formaram halos de inibição frente a micro-organismos testes. Os extratos brutos obtidos foram avaliados quanto à concentração inibitória mínima (MIC) frente a oito micro-organismos não virulentos, e 18 extratos brutos apresentaram atividade inibitória, onde se destaca o extrato denominado E131, obtido da bactéria do gênero Streptomyces, que apresentou atividade bacteriostática frente S. aureus e M. luteus, e atividade bactericida frente a C. albicans e B. subtilis. Frente a micro-organismos isolados de amostras clínicas, 11 extratos brutos apresentaram atividade inibitória frente a quatro cepas de Neisseria meningitides, com MIC dos extratos brutos variando de 0,0313 mg.mL-1 até 2,0 mg.mL-1. O extrato E46, obtido da bactéria Pseudoalteromonas sp., destacou-se quanto à atividade inibitória observada frente às quatro cepas avaliadas. Frente à cepa B4, destacam-se a atividade antimicrobiana dos extratos brutos obtido das bactérias Pseudoalteromonas sp. e Pseudomonas azotoformans CUG12536. Frente à cepa YUSA, destaca-se a atividade antimicrobiana observada pelo extrato bruto obtido da bactéria Marinilactibacillus sp., cuja atividade antimicrobiana foi relatada pela primeira vez neste gênero de bactéria. Os extratos brutos possuem em sua composição, compostos cuja atividade antimicrobiana é conhecida, como ácidos graxos e compostos cuja atividade antimicrobiana não está descrita na literatura. Os testes de fracionamento dos extratos frente a solventes de diferentes polaridades indicou que os extratos brutos são solúveis, em sua maioria, a solvente polar. Portanto, as bactérias isoladas da Antártica produzem compostos de interesse farmacológico e podem ser utilizadas como fonte de novos compostos. Tais resultados enfatizam a necessidade de mais estudos de bactérias associadas a ambientes extremos, como a Antártica / Abstract: Microorganisms associated with the Antarctic continent have various and metabolically active populations, but the pharmacological potential of compounds obtained by micro-organisms is poorly understood. Bacterias are an important source of compounds currently used as antimicrobial, major biosynthetic pathways of many antibiotics are catalyzed by the PKS genes (Polyketide Synthases) and NRPS (Non Ribosomal Peptide Synthetases). This study had the objective to genetic and functional evaluation of the antimicrobial activity of bacteria isolated in Admiralty Bay, Antarctica, and the taxonomic identification of bacteria that had such potential and identification of the chemical profile of antimicrobial compounds. The total of 153 bacteria was isolated from Antarctic environment, among the isolates, 127 isolates showed at least one of the genes PKSI, PKSII and NRPS. These were identified by partial sequencing of 16S ribosomal RNA gene and belong to 28 different genera, with representatives of the phyla Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria and Bacteroidetes. The functional evaluation of the production of antibiotic was conducted with a total of 76 isolates including 30 isolates that formed inhibition halos against test microorganisms. The crude extracts were evaluated as the minimum inhibitory concentration (MIC) against eight non-virulent microorganisms, and 18 crude extracts showed activity, highlighting the so-called E131 extract, obtained from bacteria of the genus Streptomyces, which showed bacteriostatic activity against S. aureus and M. luteus, and bactericidal activity against C. albicans and B. subtilis. Faced with microorganisms isolated from clinical samples, 11 crude extracts showed inhibitory activity against four strains of Neisseria meningitides, with MIC ranging from 0.0313 mg.mL-1 to 2.0 mg.mL-1. The E46 extract obtained from the bacterium Pseudoalteromonas sp., stood out as the inhibitory activity observed across the four evaluated strains. Faced with the strain B4, stand out the antimicrobial activity of crude extracts obtained from bacteria Pseudoalteromonas sp. and Pseudomonas azotoformans CUG12536. Against YUSA strain, Marinilactibacillus sp. crude extract showed antimicrobial activity, which was the first reported in this bacterial genus. The extracts have in their composition, antimicrobial compounds whose activity is known, such as fatty acids, and compounds whose antimicrobial activity is not described in the literature. Fractionation tests of extracts using solvents of different polarities, indicated that the crude extracts are soluble mostly the polar solvent. Therefore, the bacteria isolated from the Antarctic produce compounds of pharmacological interest and can be used as a source of novel compounds. These results highlight the need for more studies of bacteria associated with extreme environments, such as Antarctica / Mestrado / Microbiologia / Mestra em Genética e Biologia Molecular
|
8 |
"Caracterização molecular de cianobactérias brasileiras e distribuição de genes de produtos naturais" / Molecular characterization of Brazilian cyanobacteria and distribution of natural products genesSilva, Caroline Souza Pamplona da 27 June 2006 (has links)
O espaço intergênico (IGS) juntamente com suas subunidades flanqueadoras (cpcB) e (cpcA) do operon do ficocianina foi usado para identificar linhagens de cianobactérias. Dentro do domínio Bacteria somente as cianobactérias possuem o operon da ficocianina e a região cpcBA-IGS é suficientemente variável para diferenciar linhagens desses microrganismos. No presente estudo 25 linhagens de cianobactérias isoladas de diversos locais brasileiros foram caracterizadas usando a seqüência cpcBA-IGS. DNA genômico foi extraído das ordens Chroococcales (oito linhagens), Oscillatoriales (duas linhagens), Nostocales (onze linhagens) e Stigonematales (quatro linhagens). Os oligonucleotídeos iniciadores PCβF/PCαR, específicos para a seqüência cpcBA-IGS, foram usados para amplificar fragmentos de DNA de aproximadamente 685 pb. Os produtos da PCR foram clonados, seqüenciados e as seqüências foram comparadas pela análise BLAST. Todas as seqüências de Microcystis e também as seqüências de Radiocystis fernadoi SPC736, Planktothrix mougeotii SPC788, Geitlerinema splendidum SPC923, Microchaete investiens CENA64 e Gloeotrichia UFV-B2 mostraram identidades com seqüências do GenBank. Entretanto, nenhuma identidade foi encontrada para as seqüências restantes. As relações filogenéticas das seqüências de cpcBA-IGS foram investigadas junto com outras seqüências de cianobactéria do Genbank usando a análise Neighbour Joining". A topologia da árvore foi congruente com outras árvores de cianobactérias, com exceção de todas as seqüências sem identidades no GenBank, as quais formaram um agrupamento separado. Os dados das seqüências de cpcBA-IGS analisadas confirmam que as cianobactéria heterocitadas formam um grupo monofilético. Estudos anteriores realizados com linhagens de cianobactéria mostraram que estes microrganismos são uma fonte rica de produtos naturais. No presente estudo conduzido com 59 linhagens de cianobactérias, sendo a maioria isolada de ambientes brasileiros, isto foi confirmado. Para alcançar esse objetivo, dois conjuntos de iniciadores degenerados foram usados para produzir seqüências amplificadas por PCR das sintetases de peptídeos não-ribossômicos (NRPSs), e de sintases policetídeos (PKSs) modulares, as quais são enzimas multifuncionais envolvidas na produção de produtos naturais. O sistema híbrido NRPS/PKS também foi amplificado por PCR usando uma combinação de iniciadores de NRPS e de PKS. Essa abordagem molecular mostrou a presença de genes de NRPS e de PKS em 93% e 81% linhagens de cianobactérias, respectivamente. Genes de NRPS/PKS foram encontrados em 87% das cianobactérias examinadas. Numa tentativa de atribuir funções a oito fragmentos de PKS identificados por PCR, estas seqüências foram clonadas, seqüenciadas e analisadas filogeneticamente. As seqüências de PKSs da Microcystis aeruginosa NPCD1 e Fischerella CENA62 mostraram correlação com a síntese de sideróforo e de microcistina, respectivamente. Todas as 59 linhagens foram analisadas para a produção do microcistinas e 20 linhagens apresentaram resultados positivos. Para a maioria das linhagens potencialmente produtoras de microcistinas os produtos de PCR esperados de NRPS, PKS e NRPS/PKS foram amplificados. A produção de sideróforos foi testada em 28 linhagens e somente cinco produziram resultados positivos. Em três linhagens produtoras de sideróforos todos os três sistemas moleculares analisados estavam presentes. Estes resultados serão altamente valiosos na exploração futura de cada peptídeo dessas cianobactérias e para a elucidação da bioatividade de tais produtos naturais. / The intergenic spacer (IGS) together with its flanking subunits  (cpcB) and  (cpcA) of the phycocyanin operon has been used to identify cyanobacterial strains. Within the Bacteria domain only cyanobacteria present phycocyanin operon and the cpcBA-IGS region is variable enough to differentiate strains of these microorganisms. In the present study 25 cyanobacterial strains isolated from several Brazilian locations were characterized using the cpcBA-IGS sequence. Genomic DNA was extracted from the orders Chroococcales (eight strains), Oscillatoriales (two strains), Nostocales (eleven strains) and Stigonematales (four strains). The primers PCβF/PCαR targeting the cpcBA-IGS sequence were used to amplify DNA fragments of approximately 685 bp. The PCR products were cloned, sequenced and the sequences were compared by BLAST analysis. All Microcystis sequences and also sequences from Radiocystis fernadoi SPC736, Planktothrix mougeotii SPC788, Geitlerinema splendidum SPC923, Microchaete investiens CENA64 and Gloeotrichia UFV-B2 showed identities with sequences from GenBank. However, no identities were found for the remaining sequences. Phylogenetic relationships of the cpcBA-IGS sequences were investigated together with other cyanobacterial sequences from Genbank using the Neighbour Joining analysis. The tree topology was congruent with previous cyanobacterial trees, except for all sequences with no identities in the GenBank, which formed a separated cluster. The cpcBA-IGS sequences analysis data confirm that heterocyte-forming cyanobacteria are a monophyletic group. Previous studies carried out with cyanobacterial strains showed that these microorganisms are a rich source of natural products. This has been confirmed in the present study conducted with 59 cyanobacterial strains, with the majority of them isolated from Brazilian environment. To reach this goal, two sets of degenerate primers were used to generate PCR amplification sequences of nonribosomal peptide synthetases (NRPSs) and modular polyketide synthases (PKSs), which are multifunctional enzymes implicated in natural products production. Also, NRPS/PKS hybrid system was PCR amplified by using a combination of NRPS and PKS primers. This molecular approach revealed the presence of NRPS and PKS genes in 93% and 81% cyanobacterial strains, respectively. NRPS/PKS genes were found in 87% of cyanobacteria examined. In an attempt to attribute functions to eight PCR identified PKS fragments, these sequences were cloned, sequenced and phylogenetically analyzed. PKSs sequences of Microcystis aeruginosa NPCD1 and Fischerella CENA62 showed correlation with the synthesis of siderophore and microcystin, respectively. All 59 strains were analyzed for microcystin production and 20 strains presented positive results. For the majority of potentially producing-microcystin strains expected PCR products of NRPS, PKS and NRPS/PKS were amplified. The siderophores production was tested in 28 strains and only five gave positive results. In three producing-siderophore strains all three molecular systems analyzed were present. These results will be highly valuable for further exploring each of these cyanobacterial peptides and for elucidating the bioactivity of such natural products.
|
9 |
"Caracterização molecular de cianobactérias brasileiras e distribuição de genes de produtos naturais" / Molecular characterization of Brazilian cyanobacteria and distribution of natural products genesCaroline Souza Pamplona da Silva 27 June 2006 (has links)
O espaço intergênico (IGS) juntamente com suas subunidades flanqueadoras (cpcB) e (cpcA) do operon do ficocianina foi usado para identificar linhagens de cianobactérias. Dentro do domínio Bacteria somente as cianobactérias possuem o operon da ficocianina e a região cpcBA-IGS é suficientemente variável para diferenciar linhagens desses microrganismos. No presente estudo 25 linhagens de cianobactérias isoladas de diversos locais brasileiros foram caracterizadas usando a seqüência cpcBA-IGS. DNA genômico foi extraído das ordens Chroococcales (oito linhagens), Oscillatoriales (duas linhagens), Nostocales (onze linhagens) e Stigonematales (quatro linhagens). Os oligonucleotídeos iniciadores PCβF/PCαR, específicos para a seqüência cpcBA-IGS, foram usados para amplificar fragmentos de DNA de aproximadamente 685 pb. Os produtos da PCR foram clonados, seqüenciados e as seqüências foram comparadas pela análise BLAST. Todas as seqüências de Microcystis e também as seqüências de Radiocystis fernadoi SPC736, Planktothrix mougeotii SPC788, Geitlerinema splendidum SPC923, Microchaete investiens CENA64 e Gloeotrichia UFV-B2 mostraram identidades com seqüências do GenBank. Entretanto, nenhuma identidade foi encontrada para as seqüências restantes. As relações filogenéticas das seqüências de cpcBA-IGS foram investigadas junto com outras seqüências de cianobactéria do Genbank usando a análise Neighbour Joining. A topologia da árvore foi congruente com outras árvores de cianobactérias, com exceção de todas as seqüências sem identidades no GenBank, as quais formaram um agrupamento separado. Os dados das seqüências de cpcBA-IGS analisadas confirmam que as cianobactéria heterocitadas formam um grupo monofilético. Estudos anteriores realizados com linhagens de cianobactéria mostraram que estes microrganismos são uma fonte rica de produtos naturais. No presente estudo conduzido com 59 linhagens de cianobactérias, sendo a maioria isolada de ambientes brasileiros, isto foi confirmado. Para alcançar esse objetivo, dois conjuntos de iniciadores degenerados foram usados para produzir seqüências amplificadas por PCR das sintetases de peptídeos não-ribossômicos (NRPSs), e de sintases policetídeos (PKSs) modulares, as quais são enzimas multifuncionais envolvidas na produção de produtos naturais. O sistema híbrido NRPS/PKS também foi amplificado por PCR usando uma combinação de iniciadores de NRPS e de PKS. Essa abordagem molecular mostrou a presença de genes de NRPS e de PKS em 93% e 81% linhagens de cianobactérias, respectivamente. Genes de NRPS/PKS foram encontrados em 87% das cianobactérias examinadas. Numa tentativa de atribuir funções a oito fragmentos de PKS identificados por PCR, estas seqüências foram clonadas, seqüenciadas e analisadas filogeneticamente. As seqüências de PKSs da Microcystis aeruginosa NPCD1 e Fischerella CENA62 mostraram correlação com a síntese de sideróforo e de microcistina, respectivamente. Todas as 59 linhagens foram analisadas para a produção do microcistinas e 20 linhagens apresentaram resultados positivos. Para a maioria das linhagens potencialmente produtoras de microcistinas os produtos de PCR esperados de NRPS, PKS e NRPS/PKS foram amplificados. A produção de sideróforos foi testada em 28 linhagens e somente cinco produziram resultados positivos. Em três linhagens produtoras de sideróforos todos os três sistemas moleculares analisados estavam presentes. Estes resultados serão altamente valiosos na exploração futura de cada peptídeo dessas cianobactérias e para a elucidação da bioatividade de tais produtos naturais. / The intergenic spacer (IGS) together with its flanking subunits  (cpcB) and  (cpcA) of the phycocyanin operon has been used to identify cyanobacterial strains. Within the Bacteria domain only cyanobacteria present phycocyanin operon and the cpcBA-IGS region is variable enough to differentiate strains of these microorganisms. In the present study 25 cyanobacterial strains isolated from several Brazilian locations were characterized using the cpcBA-IGS sequence. Genomic DNA was extracted from the orders Chroococcales (eight strains), Oscillatoriales (two strains), Nostocales (eleven strains) and Stigonematales (four strains). The primers PCβF/PCαR targeting the cpcBA-IGS sequence were used to amplify DNA fragments of approximately 685 bp. The PCR products were cloned, sequenced and the sequences were compared by BLAST analysis. All Microcystis sequences and also sequences from Radiocystis fernadoi SPC736, Planktothrix mougeotii SPC788, Geitlerinema splendidum SPC923, Microchaete investiens CENA64 and Gloeotrichia UFV-B2 showed identities with sequences from GenBank. However, no identities were found for the remaining sequences. Phylogenetic relationships of the cpcBA-IGS sequences were investigated together with other cyanobacterial sequences from Genbank using the Neighbour Joining analysis. The tree topology was congruent with previous cyanobacterial trees, except for all sequences with no identities in the GenBank, which formed a separated cluster. The cpcBA-IGS sequences analysis data confirm that heterocyte-forming cyanobacteria are a monophyletic group. Previous studies carried out with cyanobacterial strains showed that these microorganisms are a rich source of natural products. This has been confirmed in the present study conducted with 59 cyanobacterial strains, with the majority of them isolated from Brazilian environment. To reach this goal, two sets of degenerate primers were used to generate PCR amplification sequences of nonribosomal peptide synthetases (NRPSs) and modular polyketide synthases (PKSs), which are multifunctional enzymes implicated in natural products production. Also, NRPS/PKS hybrid system was PCR amplified by using a combination of NRPS and PKS primers. This molecular approach revealed the presence of NRPS and PKS genes in 93% and 81% cyanobacterial strains, respectively. NRPS/PKS genes were found in 87% of cyanobacteria examined. In an attempt to attribute functions to eight PCR identified PKS fragments, these sequences were cloned, sequenced and phylogenetically analyzed. PKSs sequences of Microcystis aeruginosa NPCD1 and Fischerella CENA62 showed correlation with the synthesis of siderophore and microcystin, respectively. All 59 strains were analyzed for microcystin production and 20 strains presented positive results. For the majority of potentially producing-microcystin strains expected PCR products of NRPS, PKS and NRPS/PKS were amplified. The siderophores production was tested in 28 strains and only five gave positive results. In three producing-siderophore strains all three molecular systems analyzed were present. These results will be highly valuable for further exploring each of these cyanobacterial peptides and for elucidating the bioactivity of such natural products.
|
10 |
Estudo dos efeitos da terapia combinada orlistat / cisplatina / 5-fluorouracil / paclitaxel em linhagem metastática de carcinoma espinocelular de língua / Effects of combined therapy Orlistat / Cisplatin/ 5-Fluorouracil / Paclitaxel in metastatic lineage of squamous cell carcinoma of the tongueMoreira, Fernanda dos Santos, 1986- 24 August 2018 (has links)
Orientador: Edgard Graner / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-24T18:26:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Moreira_FernandadosSantos_M.pdf: 1478167 bytes, checksum: 57f6f26580823a79292af5a274beaa2d (MD5)
Previous issue date: 2014 / Resumo: A ácido graxo sintase (FASN) é a principal enzima envolvida na lipogênese neoplásica e apontada como uma oncoproteína metabólica por favorecer o crescimento e sobrevivência das células tumorais, nas quais sua expressão é em geral elevada. Vários são os compostos capazes de inibir a atividade de FASN, dentre eles o orlistat (Xenical®), que possui efeitos antineoplásicos em cânceres de mama e próstata e nos melanomas. O carcinoma espinocelular (CEC) representa aproximadamente 90% de todas as neoplasias malignas que acometem a cavidade oral, sendo diagnosticado em estágios avançados em grande parte dos casos. Nestes pacientes, geralmente com metástases, é realizada uma abordagem sistêmica com agentes quimioterápicos como a cisplatina, o 5-fluorouracil (5-FU) e o paclitaxel, de maneira isolada ou combinada. Este trabalho tem como objetivo investigar in vitro se cisplatina, 5-FU ou paclitaxel potencializam o efeito antitumoral do orlistat no CEC oral. Para isto, células de CEC de língua altamente metastáticas (SCC-9 LN1) foram tratadas com estas drogas isoladamente ou combinadas com orlistat e avaliadas com relação às taxas de apoptose e necrose, progressão do ciclo celular e secreção de VEGFA e VEGFA165b. As maiores taxas de apoptose foram encontradas com o uso da combinação de orlistat com paclitaxel, após 48 horas de tratamento. Com relação ao ciclo celular, houve acúmulo de células na fase S com a combinação de orlistat com cisplatina e na fase G2 com a combinação de orlistat com paclitaxel. O tratamento das células SCC-9 LN1 com os agentes quimioterápicos reduziu a secreção dos fatores VEGFA e VEGFA165b, em comparação ao tratamento com orlistat isolado ou em combinação. Em conjunto, estes resultados mostram a existência de sinergismo na combinação de orlistat com paclitaxel com evidente potencialização do efeito pró-apoptótico nas células derivadas de CEC oral metastático / Abstract: Fatty acid synthase (FASN) is the main enzyme involved in the neoplastic lipogenesis. The expression of FASN is elevated in many tumor cells, suggesting a role as a metabolic oncoprotein, with the ability to promote growth and survival of tumor cells. There are several compounds that inhibit FASN activity, including orlistat. Orlistat has evident antineoplastic effects in breast and prostate cancers, as well as melanomas. Oral squamous cell carcinoma (OSCC), corresponds to approximately 90% of all cancers that affect the oral cavity, and is diagnosed in advanced stages in most cases. Distant metastases of OSCC are systemically treated with chemotherapeutic agents, such as cisplatin, 5-fluorouracil (5-FU) and paclitaxel. This study aims to investigate the in vitro antitumor effect of orlistat combined with cisplatin, 5-FU and/or paclitaxel in OSSC cells. Highly metastatic tongues squamous cell carcinoma cells (SCC-9-LN1) were treated with these drugs separately or combined with orlistat, in concentrations close to their respective IC50. Next, the cultures were evaluated regarding the rates of cell death (apoptosis and necrosis), cell cycle progression and the secretion VEGFA and VEGFA165b. The highest rate of apoptosis was observed with the combination of orlistat and paclitaxel, after 48 hours of treatment. Cell cycle analysis assay demonstrate as an accumulation of cells SCC-9 LN1 in the S phase, after incubation with the combination of orlistat with cisplatin, and in the G2 phase with orlistat plus paclitaxel. The 5-FU alone, promoted accumulation of cells in the G1/S. Additionally, secretion of VEGFA and was VEGFA165b was inhibited in SCC-9-LN1cells by the combined treatments. These results demonstrate the synergism existence of the mixture orlistat and paclitaxel with potentiation of their pro-apoptotic effects in SCC-9 LN1 cells / Mestrado / Estomatologia / Mestra em Estomatopatologia
|
Page generated in 0.0685 seconds