Titre de l'écran-titre (visionné le 5 septembre 2023) / Introduction : Le syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA) a été décrit pour la première fois en 1967 par Ashbaugh et ses collègues. Depuis, deux définitions majeures ont fait le jour dans le but d'homogénéiser les critères diagnostiques pour améliorer la recherche et ultimement offrir de meilleurs soins aux patients. Le SDRA a une faible incidence, mais une mortalité évaluée entre 30 et 60 %, donc doit faire l'objet d'une mobilisation de l'entièreté de l'équipe médicale. Cela dit, le traitement n'est qu'un traitement de soutien pour l'instant et la recherche clinique vise à trouver des solutions pour aider à améliorer la survie des patients. Cette revue systématique avec méta-analyse typique et en réseau bayésien visait à étudier l'efficacité des bloqueurs neuromusculaires dans le syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA) à réduire la mortalité. Méthodes : Les bases de données Medline, Embase, Cochrane Central et Web of Science ont été interrogées le 1er octobre 2021. Seuls les essais cliniques randomisés comparant les bloqueurs neuromusculaires à n'importe quel comparateur dans le traitement du SDRA ont été inclus. Le critère de jugement principal était la mortalité. Les critères de jugement secondaires étaient les jours passés sans ventilation mécanique, la durée du séjour aux soins intensifs (USI) et les différentes complications rapportées. Les résultats entre les niveaux de sédation ont été examinés avec une méta-analyse en réseau de type bayésienne. Résultats : Nous avons inclus 6 essais compilant un total de 1 557 patients. Les bloqueurs neuromusculaires comparativement à n'importe quel comparateur dans le traitement du SDRA ont montré une réduction de la mortalité (Rapport de risques (RR) 0,79 [IC à 95 %, 0,62 à 0,99]). Aucune différence dans les jours passés sans ventilation mécanique (Différence de moyennes (DM) 0,68 [IC à 95 %, -0,50 à 1,85]) ou la durée de séjour en USI (DM 0,77 [IC à 95 %, -2,99 à 4,54]) n'a été trouvée. Une méta-analyse en réseau de type bayésienne n'a révélé aucune différence de mortalité lors de l'utilisation d'une sédation légère par rapport à une sédation profonde dans le SDRA (Rapport de cotes (RC) 0,58 [95 % CrI, 0,07 à 4,46]). Conclusion : Les bloqueurs neuromusculaires réduisent en toute sécurité la mortalité. La sédation légère a un impact similaire sur le taux de mortalité que la sédation profonde qui, elle, comporte un certain fardeau pour les patients. Un essai de non-infériorité comparant les deux niveaux de sédation serait justifié compte tenu de la valeur ajoutée de la sédation légère. / Introduction : Acute respiratory distress syndrome (ARDS) was first described in 1967 by Ashbaugh and colleagues. Since then, two major definitions have emerged with the aim of standardizing diagnostic criteria to improve research and ultimately provide better patient care. ARDS has a low incidence, but a mortality estimated between 30 and 60%, so the entire medical team must be mobilized. That said, treatment is only supportive at this time and clinical research is aimed at finding solutions to help patient survival. This systematic review with typical and Bayesian network meta-analysis aimed to investigate the effectiveness of neuromuscular blocking agents in acute respiratory distress syndrome (ARDS) in reducing mortality. Methods : Medline, Embase, Cochrane Central and Web of Science were queried on October 1st, 2021. Randomized clinical trials comparing neuromuscular blockers to any comparator in treating ARDS were included. Primary outcome was mortality. Secondary outcomes were ventilator-free days, intensive care (ICU) length of stay (LOS) and complications. Results between sedation levels were examined with a Bayesian Network Meta-analysis method. Results : We included 6 trials compiling a total of 1557 patients. Neuromuscular blockers compared to any comparator in treating ARDS showed a reduction in mortality (Risk Ratio (RR) 0.79 [95% CI, 0.62 to 0.99]). No difference in ventilator-free days (Mean Differences (MD) 0.68 [95% CI, -0.50 to 1.85]) or ICU LOS (MD 0.77 [95% CI, -2.99 to 4.54]) were found. A Bayesian Network Meta-analysis yielded no difference in mortality when using light sedation compared to heavy sedation in ARDS. (Odd Ratio (OR) 0.58 [95% CrI, 0.07 to 4.46].) Conclusion : Neuromuscular blockers safely reduce mortality. Light sedation potentially has a similar impact on mortality as heavy sedation that carries some burden. A non-inferiority trial comparing both sedation levels may be warranted considering the added value of light sedation.

Thèse ou mémoire avec insertion d'articles / L'hormonothérapie adjuvante (HA) quotidienne prescrite pour 5 à 10 ans à la suite d'un cancer du sein est associée à une réduction du risque de récidive et de mortalité. Une équipe multidisciplinaire a développé le programme SOIE (Soutien, Outils, Information, Entraide) afin d'améliorer l'expérience des femmes avec l'HA et l'adhésion à ce traitement. Le programme a été testé dans une étude-pilote quant à sa faisabilité, son acceptabilité et son potentiel d'efficacité. Ce mémoire a pour objectif d'évaluer les effets du programme sur l'intention et les autres facteurs psychosociaux susceptibles d'influencer l'adhésion à l'HA qu'il cible, 3 mois après l'entrée à l'étude. L'étude-pilote est un essai contrôlé randomisé à deux bras parallèles. Au total, 106 femmes ayant reçu une première prescription d'HA ont été recrutées, 52 assignées au groupe intervention et 54 au groupe contrôle. Des modèles d'équation d'estimation généralisée ont permis de comparer les patrons de changement des scores des facteurs psychosociaux entre les groupes dans le temps. La valeur-p de l'interaction groupe*temps a été utilisée pour tester les différences entre les deux groupes. Le calcul du d de Cohen a permis d'estimer la taille d'effet. Les analyses à 3 mois indiquent que le programme SOIE n'a pas d'effet sur l'intention d'adhérer mais a le potentiel d'améliorer les connaissances des femmes sur l'HA (différence des moyennes dans le temps: 1,23; valeur-p groupe*temps=0,01; d de Cohen=0,42) et de les préparer à mieux planifier la gestion des difficultés liées à l'HA (0,48; valeur-p=0,02; d=0,45). Une tendance dans l'amélioration de leur perception du soutien social (0,34; valeur-p=0,08; d=0,28), notamment celui des professionnels de la santé (0,33; valeur-p=0,10; d=0,24) a également été observée. Les analyses après 12 mois de suivi et un volet qualitatif en cours guideront les décisions quant à l'évaluation à plus large échelle du programme. / Daily adjuvant endocrine therapy (AET) prescribed for 5 to 10 years following breast cancer is associated with a reduced risk of recurrence and mortality. A multidisciplinary team developed the SOIE (Soutien, Outils, Information, Entraide) program to improve women's experience with AET and treatment adherence. The program was first pilot-tested to assess its feasibility, acceptability, and potential efficacy. The purpose of this master thesis is to assess the program effects on intention to adhere and other psychosocial factors hypothesized to influence AET adherence, 3 months after study entry. This is a pilot two-arm parallel randomized controlled trial. Overall, 106 women were recruited, 52 randomly assigned to the intervention group and 54 to the control group. Generalized estimating equation models were used to compare patterns of change in psychosocial factors scores between two groups over time with a p-value estimate of the group-by-time interaction. Cohen's d was used to estimate the effect size. 3-month analyses indicate that, early in their treatment trajectory, the SOIE program did not have an effect on intention. However, the program has the potential to improve women's knowledge about AET (difference in means over time: 1.23; group*time p-value=0.01; Cohen's d=0.42) and prepare them to cope with AET-related difficulties through better coping planning (0.48; p-value=0.02; d=0.45). Tendency of improvement in perception of social support (0.34; p-value=0.08; d=0.28), especially support from health professionals (0.33; p-value=0.10; d=0.24) was also observed. 12-month follow-up analysis and an ongoing qualitative study will help guide decisions regarding a larger-scale evaluation of the program

La psychose se caractérise par d’importants déficits cognitifs limitant le fonctionnement et le rétablissement des patients. La mémoire de source, permettant l’identification de l’origine du souvenir, est atteinte tout au long du continuum d’évolution de la psychose : du risque génétique à la chronicité de la maladie. Les troubles de mémoire de source seraient également reliés à la présence et la gravité des symptômes psychotiques. Ainsi, des auteurs soulèvent l’hypothèse selon laquelle la mémoire de source serait un précurseur cognitif de la psychose et donc, une cible potentielle d’intervention précoce. Pourtant, les connaissances actuelles concernant l’intervention sur la mémoire de source dans les troubles psychotiques restent limitées, justifiant l’importance de dresser un premier portrait des interventions pertinentes pour moduler ces processus. Le présent mémoire doctoral vise dans un premier temps, à relever les études portant sur des interventions non pharmacologiques ayant évalué l’effet sur la mémoire de source en début d’évolution de psychose et dans un deuxième temps, à discuter de celles démontrant une amélioration de son fonctionnement. Une recension systématique a permis d’identifier treize études, dont trois interventions bénéfiques soit, le programme d’entraînement de la mémoire autobiographique REMAu, le programme d’entraînement métacognitif MST, ainsi que la stimulation magnétique transcrânienne répétée de la jonction temporo-pariétale. Ce mémoire présente une réflexion clinique et des recommandations afin de guider les interventions en début d’évolution de psychose et les futures études sur le développement de programmes ciblant la mémoire de source. / Psychosis is characterized by severe cognitive deficits that prevent functional recovery. Source memory, allowing the retrieval of contextual details characterizing the origin of memories, is shown to be altered all along the continuum of psychosis from asymptomatic to chronic stages. The source memory impairments are also associated with the presence and severity of the psychotic symptoms. Thus, previous studies suggest that source memory could be considered as a cognitive precursor of psychosis and a relevant target of intervention in early course of the pathology. There is an actual need to further our knowledge on the rehabilitation of source memory in early psychosis. It may be necessary to first draw a portrait of available interventions that can modulate source memory processes. This thesis aims to systematically review studies on non-pharmacological interventions in early course of psychosis which reported outcomes on source memory and then, to identify different interventions which support its functioning. A systematic review identified thirteen studies, from with three revealed a significant effect on source memory. Two programs which trained memory and metamemory, the Autobiographical Reminiscence Therapy (REMAu) and the Metacognitive Training (MST), as well as repetitive transcranial magnetic stimulation of temporoparietal junction appeared beneficial. This thesis presents encouraging findings on the impact of available interventions on source memory. Preliminary clinical recommendations are provided on effective intervention for source memory impairments in the early course of psychosis as well as guidance for the development of source memory intervention programs.

Les découpeurs d'images sont devenus des équipements essentiels dans le domaine de l'astronomie, particulièrement pour la spectroscopie intégrale de champ. La conception et l'usinage des découpeurs d'images, principalement du miroir découpeur qui en est la pièce centrale, est complexe et présente de nombreux défis techniques. Suivant sa fabrication, la caractérisation des découpeurs d'images est donc capitale afin de s'assurer que le dispositif rencontre les spécifications établies. Dans le cadre du développement de GIRMOS¹ (un spectrographe infrarouge multi-objets destiné aux télescopes jumeaux de 8,1 m de l'Observatoire Gemini), qui emploie la technologie des découpeurs d'images, il devient ainsi primordial de mettre en place une procédure pour en assurer la caractérisation. Dans ce contexte, l'objectif de ce projet de maîtrise est d'élaborer une méthodologie permettant de caractériser et de valider des découpeurs d'images. Les travaux présentés dans ce mémoire détaillent les concepts entourant les découpeurs d'images avancés et mettent de l'avant l'ensemble des tests nécessaire à la caractérisation du miroir découpeur. De plus, le développement d'un outil de caractérisation pour les pupilles intermédiaires, soit un banc de tests, y est décrit. Afin de valider la méthodologie établie, la série de tests métrologiques est menée sur un prototype de miroir découpeur. En comparant les résultats expérimentaux avec les résultats des simulations et la théorie, il a été possible de conclure que la méthodologie établie permet de caractériser partiellement le découpeur d'images. En effet, des améliorations restent à faire sur le banc de tests afin d'augmenter la précision de ce dernier. De surcroît, certains tests identifiés dans la méthodologie n'ont pu être mis en œuvre notamment dû au fait que les miroirs pupille et les miroirs fente n'avaient pas encore été fabriqués. Ces tests n'ayant pu être menés, il n'est pas possible de conclure que la méthodologie permet de valider le découpeur d'images menant à une l'atteinte partielle de l'objectif. / Image slicers have become essential equipment in the field of astronomy, particularly for Integral Field Spectroscopy. The design and manufacture of an image slicer, mainly the slicer mirror, which is the central part, is complex and presents many technical challenges. Following its fabrication, the characterization of an image slicer is therefore essential to ensure that the device meets the established specifications. As part of the development of GIRMOS² (a multi-object infrared spectrograph for twin 8.1 m telescopes of the Gemini Observatory), which uses image slicer technology, it becomes essential to set up a procedure to ensure its characterization. In this context, the objective of this master's project is to develop a methodology to characterize and validate image slicers. The work presented in this master's thesis details the concepts surrounding advanced image slicers and highlights all the tests necessary for the characterization of slicer mirrors. In addition, the development of a characterization tool for intermediate pupils, namely a test bench, is described therein. To validate the established methodology, a series of metrological tests are carried out on a slicer mirror prototype. By comparing the experimental results with the results of the simulations and the theory, it was possible to conclude that the established methodology allows to partially characterize the image slicer. Indeed, improvements remain to be made on the test bench to increase the accuracy of the latter. In addition, certain tests identified in the methodology could not be implemented, in particular since the pupil mirrors and the slit mirrors had not yet been manufactured. As these tests could not be carried out, it is impossible to conclude that the methodology allows to validate the image slicer leading to a partial achievement of the objective.

Le diabète est associé à une réduction de la masse des cellules β. Par conséquent, la régénération des cellules β est un champ d'étude important. Nous avons testé l'hypothèse selon laquelle le GLP-1, un médicament anti-diabète, stimule la differentiation de cellules progénitrices en cellules β matures (néogenèse) et étudié les mécanismes impliqués dans le processus. Nos résultats indiquent que le GLP-1 induit l'expression de marqueurs spécifiques à la cellule β (Pdxl, Glut2 et le gène de l'insuline) dans un modèle de cellules progénitrices (lignée AR42J). Cette action est précédée de l'expression de Ngn3, un gène contrôlant la differentiation des cellules endocrines du pancréas au cours du développement embryonnaire. De plus, notre étude suggère que la voie Pi3k et Hnf1-α/Hnf3-β participent à l'effet du GLP-1. Nos résultats pourraient mener à la découverte de cibles moléculaires permettant l'expansion de la masse de cellules β

L'arrêt cardiorespiratoire extrahospitalier (ACEH) est un problème complexe, associé à une mortalité importante et ayant un impact profond sur la communauté. Les interventions permettant de renverser ce processus s'articulent autour d'un concept appelé « chaîne de survie » à l'intérieur duquel chaque maillon revêt une importance déterminante sur la progression du traitement. Plusieurs interventions répertoriées dans la littérature démontrent l'existence d'opportunités d'amélioration des issues rencontrées par les victimes d'ACEH, notamment au sein des premiers maillons de la chaîne. Plus spécifiquement, un recours rapide au défibrillateur externe automatisé (DEA) par les premiers témoins est l'intervention associée au nombre de sujets à traiter le plus avantageux pour l'atteinte d'une issue favorable. Au Québec, la formation de base en réanimation cardiorespiratoire (RCR) et l'acquisition d'un DEA sont obligatoires pour les établissements d'enseignement secondaire depuis novembre 2019. Puisque les établissements d'enseignement primaire ne sont pas encore tenus de respecter de telles exigences en matière de formation et d'acquisition de matériel de réanimation, ces sites représentent des secteurs où l'amélioration est possible. Dans le cadre de l'étude au cœur de ce mémoire, les écoles primaires de la région de la Capitale-Nationale ont été sondées pour identifier les principales barrières à l'utilisation efficace et sécuritaire du DEA. La formation inadéquate ou inexistante du personnel des établissements d'enseignement primaire sondés est la principale barrière identifiée (46% des écoles répondantes). Cependant, il est possible de combler ce déficit de formation par l'entremise d'une capsule d'enseignement ciblée. En mesurant les performances des intervenants en milieu scolaire, nous avons démontré une amélioration significative de la qualité de la séquence de défibrillation (passant de 53% à 92%, p < 0,001) et du délai avant le premier choc lors d'un scénario simulant un ACEH (passant de 66 secondes à 47 secondes, p < 0,01). Ces travaux s'inscrivent dans une lignée d'études identifiant des stratégies de consolidation des premiers maillons de la chaîne de survie comme l'éducation citoyenne à la reconnaissance de l'ACEH et à la dispensation de soins immédiats en réanimation et les programmes d'accès public à la défibrillation. / Out-of-hospital cardiac arrest (OHCA) is a complex problem associated with significant mortality and profoundly impacts the community. Interventions to reverse this process revolve around the "chain of survival" in which every link is critical to treatment progression. Several interventions listed in the literature demonstrate the existence of opportunities for improving outcomes encountered by OHCA victims, particularly within the first links in the chain. More specifically, it appears that rapid use of an automated external defibrillator (AED) by bystanders is the intervention associated with the most advantageous number needed to treat to achieve a favourable outcome. In the province of Québec, basic training in cardiorespiratory resuscitation (CPR) and acquisition of an AED have been mandatory for high schools since November 2019. However, because the elementary schools are not yet required to meet those obligations regarding training and device acquisition, they represent an area of improvement. In the study presented herein, elementary schools in the Capitale-Nationale region were surveyed to identify the main barriers to the efficient and safe use of the AED. For the elementary schools surveyed, the main barrier identified is staff inadequate or non-existent training (46% of responding schools). However, filling this training gap through a targeted educational module is possible. By measuring the performance of school staff members, we have demonstrated a significant improvement in the quality of the defibrillation sequence (from 53% to 92%, p < 0,001) and the time to first shock during a simulated OHCA scenario (from 66 seconds to 47 seconds, p < 0,01). This work contributes to identifying strategies aiming at consolidating the first links in the chain of survival, such as civic education on the recognition of OHCA and the provision of basic life support, and public access defibrillation programs.

Les recherches ont démontré l’efficacité du traitement pharmacologique et du traitement psychologique pour le trouble d’anxiété généralisée (TAG). Des guides de pratique ont été conçus afin de répertorier les traitements basés sur les données probantes (TBDP) pour les troubles mentaux dont le TAG. Des sondages auprès des professionnels de la santé mentale ont révélé que l’un des obstacles perçus pour l’utilisation des TBDP serait la présence de comorbidité psychologique et/ou somatique chez les patients atteints d’un TAG. Les professionnels sur le terrain auraient la croyance que leurs patients ont plus de comorbidité que les patients dans les études expérimentales et qu’ainsi les TBDP seraient peu applicables parce que non adaptés à leur réalité. En vue de vérifier cet obstacle perçu, ce mémoire vise à vérifier si les praticiens dans un service de santé et services sociaux de 1ère ligne prescrivent moins de traitements basés sur les données probantes (TBDP) auprès des patients atteints d’un TAG lorsqu’il y a présence de comorbidité somatique et/ou psychologique. Un portrait des proportions de TBDP effectuées auprès de 52 patients qui avaient un diagnostic de TAG a été tracé. Soixante-et-onze pourcent des patients ont reçu un TBDP. Les analyses statistiques n’ont pas démontré de différence statistiquement significative dans la probabilité de recevoir un TBDP chez les personnes avec ou sans comorbidité (rapport de cotes : 0,98 ; intervalles de confiance à 95% [0,25 – 3,8]). La comorbidité ne serait pas un obstacle à la prescription d’un TBDP pour le TAG. Ces résultats pourraient s’expliquer par une démarche de dissémination des TBDP pour le TAG réalisée préalablement dans l’établissement étudié.

Cette thèse se situe dans le cadre général de la détection d’objets. Elle porte plus particulièrement sur la détection de véhicules dans les images aériennes de grandes dimensions. Le principal obstacle à l’obtention d’une détection robuste des véhicules est la grande variété de leurs apparences. Dans un premier temps, nous avons abordé le cadre théorique de la détection et identifié une approche prometteuse, l’analyse locale de scène. Par le biais de détecteurs, nous avons limité l’analyse aux seules régions susceptibles de contenir des véhicules. De là, nous avons extrait les informations locales caractéristiques des véhicules afin d’entraîner des Séparateurs à Vaste Marge (en anglais Support Vector Machine, SVM). Cette première chaîne de traitement nous a permis d’obtenir de multiples détections par véhicule. Dans un deuxième temps, nous avons regroupé automatiquement les multiples détections à l’aide de l’algorithme Affinity Propagation(AP). Des contraintes spatiales ont été introduites afin de garantir que le regroupement se fasse dans le respect des dimensions des véhicules. Finalement, l’extraction des véhicules a été effectuée en utilisant les informations relatives à l’orientation et la forme des véhicules présentes dans l’image. Afin de pallier certaines faiblesses que présente la première chaîne de traitement, nous avons développé une seconde chaîne de traitement. Tout d’abord, nous avons procédé à la sélection de régions saillantes susceptibles de contenir les véhicules. Ensuite, nous avons sur-segmenté l’image afin d’obtenir des régions uniformes en couleur de dimensions inférieures à celles des véhicules, les superpixels. De là, nous avons extrait les informations locales et globales relatives à ces superpixels et entraîné à nouveau des SVM en mode classification. À l’issue de cette deuxième chaîne de traitement, nous avons augmenté significativement notre capacité de détection. Finalement, dans le dernier chapitre de cette thèse, nous avons proposé un nouvel algorithme destiné à sélectionner les régions saillantes de l’image. Cet algorithme est spécialement conçu pour traiter des images aériennes. De plus, il présente de nombreux avantages comparativement aux méthodes concurrentes existantes.

Thèse en cotutelle : « Université Laval, Québec, Canada, Philosophiæ doctor (Ph. D.) et Universidad de La Rioja Logrono, Espagne » / Les antibiotiques ont été largement utilisés comme promoteurs de croissance et prophylactiques pour prévenir les maladies dans l'élevage de volailles. En raison de l'urgence de la prévention de la propagation des bactéries multirésistantes, de nombreux gouvernements ont interdit leur utilisation comme facteurs de croissance. Malheureusement, ces mesures ne sont pas universellement appliquées et, comme effet secondaire, l'incidence des infections à Clostridium perfringens associées à l'entérite nécrotique (EN) a augmenté dans les pays où elles ont été interdites. En outre, des C. perfringens résistants apparaissent, mais comme ce microorganisme ne fait pas l'objet de programmes de surveillance, davantage d'informations sont nécessaires pour comprendre pleinement son profil de résistance. Tout cela souligne la nécessité de rechercher et de mettre en œuvre de nouvelles approches pour éviter l'utilisation d'antibiotiques chez les volailles. Les bactéries productrices de bactériocines (BAC+), capables d'inhiber la croissance de C. perfringens, constituent une bonne approche. Les entérocoques se caractérisent par la production de bactériocines (entérocines) et peuvent donc être utilisés à cette fin. Cependant, ces genres contiennent souvent des facteurs de virulence et des mécanismes de résistance aux antibiotiques. Par conséquent, en raison de leur dualité en tant que pathogènes commensaux et opportunistes, une caractérisation plus approfondie de ces bactéries est nécessaire. C'est pourquoi l'utilisation de leurs entérocines pourrait être une approche encore meilleure et plus réaliste. Cette thèse tente de répondre à cette question en développant trois objectifs principaux. Le premier objectif était de caractériser au niveau génomique une collection d'isolats de C. perfringens provenant de volailles touchées par la NE. À cette fin, vingt isolats ont été caractérisés par séquençage du génome entier (WGS) et les données relatives à leur résistome, virulome, plasmidome, gènes de toxines et typage de séquences multilocus ont été analysés. Les résultats ont montré que les gènes tet (associés à la résistance à la tétracycline) étaient les gènes de résistance les plus fréquemment détectés et, fait intéressant, deux isolats portaient le gène erm (T) associé à la résistance à l'érythromycine, qui n'a été signalé que chez d'autres bactéries Gram-positifs. Douze des isolats ont été toxinotypés comme étant de type A et sept comme étant de type G. D'autres facteurs de virulence codant pour des hyaluronases et des sialidases, ainsi que des plasmides, ont été fréquemment détectés. Les types de séquences ont révélé une grande variabilité des isolats et de nouvelles combinaisons alléliques ont été trouvées. Parmi les isolats, C. perfringens MLG7307 présentait des caractéristiques uniques, même en l'absence du gène conservateur colA, ce qui suggère que cet isolat pourrait appartenir à une nouvelle classification. Dans l'ensemble, les résultats obtenus permettent de mieux comprendre les caractéristiques génomiques de C. perfringens et de mieux appréhender ce pathogène. Le deuxième objectif était de cribler et de caractériser les souches d'entérocoques d'origine avicole ayant une activité antimicrobienne contre C. perfringens. À cette fin, une collection de 251 entérocoques provenant de volailles a été criblée pour son activité antimicrobienne contre la collection de C. perfringens et des BAC+ ont été sélectionnées pour effectuer une analyse WGS en termes de profil de résistance aux antimicrobiens, de virulence, de plasmidome et de typage de séquences multilocus. Selon les résultats obtenus, des entérocoques potentiellement inoffensifs ont été sélectionnés pour tester la survie digestive dans les conditions de la volaille. Parmi tous les entérocoques, E. faecium X2893 et X2906 étaient les candidats les plus prometteurs pour des études ultérieures en tant que cultures protectrices pour l'élevage de volailles. Les deux souches appartiennent au type de séquence ST722, portent les gènes codant pour l'entérocine A et l'entérocine B, n'ont pas de gènes de résistance acquis, ne portent pas de plasmides, portent le gène acm impliqué dans la colonisation de l'hôte et ont montré des taux de survie élevés dans des conditions digestives in vitro chez la volaille. Ils sont donc de bons candidats pour être utilisés comme cultures protectrices dans des études à venir. Le dernier objectif était de produire et de purifier des entérocines ayant une activité contre la collection de C. perfringens et d'autres bactéries pathogènes pour la volaille. Les entérocines A, B, P, SEK4 et L50 ont été obtenues par synthèse peptidique en phase solide assistée par micro-ondes et leur activité antimicrobienne a été évaluée contre la collection de C. perfringens et d'autres bactéries pertinentes. Des combinaisons de ces entérocines, en fonction de leurs mécanismes d'action, ont été évaluées pour obtenir une synergie. Les résultats ont montré que les deux peptides de L50 étaient les plus actifs contre C. perfringens, L50A étant plus actif. Ces peptides ont également montré le spectre le plus large, étant actifs même contre Campylobacter coli ATCC 33559 et Pseudomonas aeruginosa ATCC 27855. Toutes les combinaisons testées ont montré une synergie ou une synergie partielle. Cette étude renforce l'idée d'utiliser les entérocines seules et en combinaisons synergiques pour inhiber la croissance de C. perfringens et d'autres agents pathogènes comme une alternative prometteuse aux antibiotiques dans le secteur de la volaille. En conclusion, l'utilisation d'entérocoques BAC+, et en particulier de leurs entérocines, représente une alternative très intéressante aux antibiotiques dans le secteur de la volaille. D'autres perspectives sur ce sujet pourraient inclure l'optimisation de la production d'entérocines et des études plus détaillées (toxicité, dégradation enzymatique, etc.), afin de s'assurer que leur utilisation est sûre. Les prochaines étapes pourraient également inclure des modèles d'infection in vivo afin d'évaluer leur efficacité dans la prévention de l'infection par C. perfringens. / Antibiotics have been widely used in therapeutic, prophylaxis and growth promotion in poultry farming. Due to the urgency of preventing the spread of multi-drug resistant bacteria, many governments have banned the use of antibiotics for growth promotion and are calling for a general reduction of these agents in food production, requiring alternatives to preserve human and animal health. Clostridium perfringens infections associated with necrotic enteritis (NE) are one of the major threats of the poultry sector. Antibiotic resistance in C. perfringens is emerging, but as this microorganism is not subject to surveillance programmes, more information is needed to fully understand its antibiotic resistance profile. All this underlines the need to deepen in the control of NE associated to C. perfringens in the poultry sector reducing the use of antibiotics. Bacteriocin-producing (BAC+) bacteria, capable of inhibiting the growth of C. perfringens provide a good approach. Enterococci are characterized by the production of bacteriocins (enterocins) and can therefore be used for this purpose. However, these genera often contain virulence factors and antibiotic resistance mechanisms. Hence, due to their duality as commensal and opportunistic pathogen, a deep characterisation of these BAC+ enterococci is required. For this reason, the use of their enterocins instead could be an even better and more realistic approach. This thesis attempts to address this issue through the development of three main objectives. The first objective was to characterise at the genomic level a collection of C. perfringens isolates from poultry affected by NE. To this end, twenty isolates were characterised by whole genome sequencing (WGS) and data on their resistome, virulome, plasmidome, toxin genes and multilocus sequence typing were analysed. The results showed that the tet genes (associated with tetracycline resistance) were the most common resistance genes detected and, interestingly, two isolates carried the erm(T) gene associated with erythromycin resistance, which has only been reported in other Gram-positive bacteria. Twelve of the isolates were toxinotyped as type A and seven as type G. Other virulence factors encoding hyaluronases and sialidases and plasmids, were frequently detected. Identified sequence types revealed a high variability of the isolates and new allelic combinations were found. Among the isolates, C. perfringens MLG7307 showed unique characteristics, even lacking the housekeeping gene colA, suggesting that this isolate could belong to a newspecies/variant. Overall, the results obtained provide insights into the genomic characteristics of C. perfringens and a better understanding of this pathogen. The second objective was to screen and characterise for safety enterococcal strains of poultry origin with antimicrobial activity against C. perfringens. To this end, a collection of 251 enterococci from poultry was screened for antimicrobial activity against the C. perfringens collection and BAC+ strains were selected to perform WGS analysis in terms of the resistome, virulence, plasmidome and multilocus sequence typing. According to the results obtained, potentially harmless selected enterococci were also tested for digestive survival under poultry conditions. Among all enterococci, E. faecium X2893 and X2906 were the most promising candidates for further studies as protective cultures for poultry farming. Both strains belong to sequence type ST722, carry the genes encoding enterocin A and enterocin B, have no acquired resistance genes, do not carry plasmids, contain the acm gene involved in host colonisation and showed high survival rates under in vitro poultry digestive conditions. They are therefore good candidates for use as protective cultures in future studies. The last objective was to produce and purify enterocins with activity against the C. perfringens collection and other relevant bacterial poultry pathogens. Enterocins A, B, P, SEK4 and L50 were obtained by microwave- assisted solid-phase peptide synthesis and their antimicrobial activity was evaluated against the C. perfringens collection and other relevant bacteria. Combinations of these enterocins, according to their mechanisms of action, were evaluated to achieve synergy. The results showed that the two peptides from L50 were the most active against C. perfringens, with L50A being more active. These peptides also showed the broadest spectrum, being active even against Gram-negative Campylobacter coli ATCC 33559 and Pseudomonas aeruginosa ATCC 27855. All combinations tested showed synergy or partial synergy. This study strengthens the idea of using enterocins alone and in synergistic combinations to inhibit the growth of C. perfringens and other pathogens as a promising alternative to antibiotics in the poultry sector. In conclusion, the use of BAC+ enterococci, and especially their enterocins, represents a very attractive alternative to antibiotics in the poultry sector. Further perspectives on this topic could include the optimisation of enterocin production and more detailed studied (toxicity, enzymatic degradation, etc), to ensure that their use is safe. Also, next steps can includen vivo infection models to assess their efficacy in preventing C. perfringens infection in poultry production. / Los antibióticos se han utilizado ampliamente en terapéutica, profilaxis y como promotores del crecimiento en producción aviar. Dada la necesidad urgente de prevenir la propagación de bacterias multirresistentes, muchos gobiernos han prohibido su uso como promotores del crecimiento en producción animal, y urgen en la necesidad de reducir de forma general el uso de antibióticos en este sector, requiriendo alternativas para preservar la salud humana y animal. Las infecciones por Clostridium perfringens asociadas con enteritis necrótica (EN) han aumentado en los últimos años en el sector avicola y suponen un gran problema, que exige una vigilancia estrecha. La resistencia a antibióticos esta aumentando en C. perfringens, pero como este microorganismo no está sujeto a programas de vigilancia, se necesita más información para conocer a fondo su perfil de resistencia. Todo esto resalta la necesidad de investigar en el control de la EN asociada a C. perfringens, aplicando nuevos enfoques para reducir el uso de antibióticos en producción aviar. Las bacterias productoras de bacteriocinas (BAC+), capaces de inhibir el crecimiento de C. perfringens, suponen un buen enfoque. Los enterococos destacan por la producción de bacteriocinas (enterocinas) y, por tanto, pueden utilizarse con este fin. Sin embargo, con frecuencia los enterococos contienen factores de virulencia y mecanismos de resistencia a los antibióticos. De ahí que, debido a su dualidad como comensales y patógenos oportunistas, sea necesario caracterizarlos exhaustivamente. Así pues, el uso de sus enterocinas podría ser un enfoque aún mejor y más realista. Esta tesis intenta abordar esta problemática mediante el desarrollo de tres objetivos principales. El primer objetivo fue caracterizar a nivel genómico una colección de aislados de C. perfringens procedentes de aves de corral afectadas por NE. Para ello, se caracterizaron veinte cepas mediante secuenciación del genoma completo (WGS) y se analizaron datos sobre su resistoma, viruloma, plasmidoma, genes de toxinas y tipificación molecular. Los resultados mostraron que los genes tet (asociados a la resistencia a la tetraciclina) eran los más frecuentes y fue de interés la detección de dos aislados que portaban el gen erm(T), asociado a la resistencia a la eritromicina, que sólo se ha descrito previamente en otras bacterias Gram-positivas. Doce de los aislados fueron toxinotipados como tipo A y siete como tipo G. También se detectaron con frecuencia otros factores de virulencia que codifican hialuronasas y sialidasas, así como plásmidos. El tipado molecular reveló una gran variabilidad de los aislados, hallándose incluso nuevas combinaciones alélicas. Entre los aislados, C. perfringens MLG 7307 mostró características únicas, careciendo del gen « housekeeping » colA, lo que sugiere que podría pertenecer a una nueva especie/variedad. En su conjunto, los resultados obtenidos permiten conocer mejor las características genómicas de C. perfringens y profundizar en el estudio de este patógeno. El segundo objetivo fue caracterizar los enterococos de origen aviar con actividad antimicrobiana frente a C. perfringens para garantizar su seguridad. Para ello, se examinó la actividad antimicrobiana de una colección de 251 enterococos de origen aviar frente a la colección de C. perfringens y se seleccionaron cepas BAC+ para realizar análisis de secuenciación masiva (WGS) y determinar así su resistoma, viruloma, plasmidoma y realizar la tipificación molecular. Posteriormente, se analizó la supervivencia digestiva en condiciones aviares de los enterococos potencialmente inocuos seleccionados. De entre todos los enterococos, E. faecium X2893 y X2906 fueron los candidatos más prometedores para futuros estudios como cultivos protectores. Ambas cepas pertenecen al linaje ST722, son portadoras de los genes codificantes de la enterocina A y la enterocina B, no tienen genes de resistencia a antibióticos adquiridos, no portan plásmidos, poseen el gen acm implicado en la colonización del hospedador y mostraron elevadas tasas de supervivencia in vitro bajo condiciones digestivas aviares. Por lo tanto, son buenos candidatos para se utilizados como cultivos protectores en estudios posteriores. El último objetivo fue producir y purificar enterocinas con actividad antimicrobiana contra la colección de C. perfringens y otros patógenos relevantes. Las enterocinas A, B, P, SEK4 y L50 se obtuvieron mediante síntesis peptídica en fase sólida asistida por microondas y se evaluó su actividad antimicrobiana frente a la colección de C. perfringens y otros patógenos. Se evaluaron diferentes combinaciones de estas enterocinas, seleccionadas según sus mecanismos de acción, para lograr sinergias. Los resultados mostraron que los dos péptidos de la enterocina L50 eran los más activos contra C. perfringens, siendo L50A el más activo. Estos péptidos también mostraron el espectro más amplio, siendo activos incluso frente a las bacterias Gram-negativas Campylobacter coli ATCC 33559 y Pseudomonas aeruginosa ATCC 27855. Todas las combinaciones estudiadas mostraron sinergia o sinergia parcial. Este estudio consolida la idea de emplear enterocinas solas y en combinaciones sinérgicas para inhibir el crecimiento de C. perfringens y otros patógenos como alternativa prometedora a los antibióticos en el sector avícola. En conclusión, el uso de enterococos BAC+, y especialmente de sus enterocinas, representa una alternativa muy atractiva a los antibióticos en el sector avícola. Entre las perspectivas futuras sobre este tema podrían figurar la optimización de la producción de enterocinas y estudios más detallados (toxicidad, degradación enzimática, etc.), para garantizar que su uso sea seguro. Asimismo, los próximos pasos pueden incluir modelos de infección in vivo para evaluar su eficacia en la prevención de la infección por C. perfringens.

Le cancer de la prostate (CaP) est le cancer le plus diagnostiqué chez les hommes au Canada. La curiethérapie HDR combinée à la radiothérapie externe (EBRT) et l'hormonothérapie (ADT) constitue une excellente approche thérapeutique pour traiter le CaP à risque intermédiaire et élevé. Le traitement par irradiation ciblée (HDR-BT ou EBRT) livre une dose suffisamment élevée de radiations vers les cellules cancéreuses pour les éradiquer en entraînant des cassures dans l'ADN. Ces dommages mènent les cellules à activer les voies de réparation d'ADN. Cependant, lorsque les dommages sont excessifs et irréparables, les cellules arrêtent le processus de réparation. Elles se dirigent vers la mort cellulaire en activant les voies apoptotiques. D'autre part, la suppression androgénique (ADT) peut activer l'apoptose ou la sénescence cellulaire dépendamment de durée de traitement. Il y a donc plusieurs voies de signalisation qui peuvent être possiblement activées à la suite du traitement HDR-BT/ EBRT avec ou sans hormonothérapie (ADT) Le but de ce projet est de comprendre la réponse cellulaire au traitement par HDR/ EBRT, ainsi qu'illustrer l'impact de l'ajout l'ADT sur cette réponse. Notre approche expérimentale consiste à évaluer l'expression et l'activation des marqueurs liés aux dommages et de réparation d'ADN γ-H2AX, DNA-PKcs et la recombinase Rad51, et mesurer aussi l'expression de Ki67 et p53, ainsi que les marqueurs apoptotiques Bax et PUMA, et le marqueur de senescence p16[exposant INK4] dans les biopsies de 22 patients avant, et après traitement avec HDR/ EBRT (avec ou sans ADT) en utilisant les techniques d'immunohistochimie (IHC) et immunofluorescence (IF). Nos résultats montrent que le traitement par radiations (HDR-BT/ EBRT) a permis d'activer la voie de réparation c-NHEJ. Cependant, cette voie est bloquée probablement à cause de l'activation de l'apoptose. En outre, il a été constaté que l'hormonothérapie additionnelle a induit la sénescence cellulaire après avoir inhibé la voie de réparation c-NHEJ.