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[pt] EMPREGO DA REAÇÃO DE CICLOADIÇÃO 1,3-DIPOLAR CATALISADA POR COBRE PARA A OBTENÇÃO DE NOVOS 1,2,3-TRIAZÓIS COM AÇÃO ANTICÂNCER EM LINHAGENS DE GLIOBLASTOMA E ANTILEISHMANIAL IN VITRO / [en] USE OF THE COPPERCATALYZED 1,3-DIPOLAR CYCLOADDITION REACTION TO OBTAIN NEW 1,2,3- TRIAZOLES WITH ANTICANCER ACTION IN GLIOBLASTOMA AND ANTILEISHMANIAL LINES IN VITRO

VERÔNICA DINIZ DA SILVA 29 April 2020 (has links)
[pt] Diante da importância terapêutica dos 1,2,3-triazóis e da versatilidade da reação de cicloadição 1,3-dipolar de Huisgen catalisada por cobre (reação CuAAC), o presente trabalho propõe a síntese de novos 1,2,3-triazóis-1,4-dissubstituídos abordando-se o conceito de hibridização molecular que associa ao núcleo triazólico outros grupos farmacofóricos privilegiados. Os compostos sintetizados foram divididos em duas séries e avaliados quanto ao potencial anticâncer, antileishmanial e distúrbios do sistema do nervoso central. Para obtenção da primeira série de triazóis utilizou-se como precursores aril azidas preparadas a partir de anilinas e éter propargílicos obtidos a partir de fenóis. A etapa chave da reação de CuAAC levou a obtenção dos 1,2,3-triazóis-1,4-dissubstituídos com rendimentos entre 50 e 85 porcento. Os compostos obtidos foram avaliados em diferentes linhagens celulares de glioblastoma (GBM, U87), incluindo linhagens celulares humanas altamente resistentes como a GBM02, GBM95, onde os compostos 2,2- (4,4-((1,3-phenilenebis(oxi))bis(methileno))bis(1H-1,2,3-triazol-4,1diyl))dibenzaldeído e (E)-4-metil-N-(2-(4-(fenoximetil)-1H-1,2,3triazolil)benzilideno)benzenosulfonohidrazida foram os mais ativos, com IC50 de 28,7 e 30,3 uM, respectivamente. Também foram avaliados nas linhagens de câncer de pulmão e próstata (A549, 22Rv1), entretanto, os compostos analisados não apresentaram atividade frente a estas linhagens celulares. Para a síntese da segunda série de compostos híbridos, tais quais os a-hidroxi-1,2,3-triazóis e benzocromenostriazóis, utilizou-se como materiais de partida aril azidas, preparadas através de ácidos aril borônicos e álcoois propargílicos, preparados a partir de benzaldeídos comerciais. A reação CuAAC na presença de metóxido de sódio levou a obtenção dos novos a-hidroxi-1,2,3-triazóis com rendimentos entre 35 e 75 porcento. A partir dos a-hidroxi-1,2,3-triazóis obtidos, realizou-se a reação de ativação C-H catalisada por paládio para obtenção benzocromenos-triazóis com rendimentos entre 35 e 40 porcento. Esses compostos foram avaliados como inibidores do transportador de glicina (Gly T1), transportadores relacionados a distúrbios neurológicos, e o composto (2-bromofenil)(1-(4-bromofenil)-1H-1,2,3-triazol-4-il)metanol apresentou 42porcento de inibição e IC50 de 13 uM, sendo este o melhor resultado de toda a série. Os compostos obtidos foram avaliados quanto a atividade antileishmanial (L. amazonenses), sendo que os compostos 2,2-(4,4-((1,3- phenilenebis(oxi))bis(methileno))bis(1H-1,2,3-triazol-4,1diyl)) dibenzaldeído e (E)-4-metil-N-(2-(4-(fenoximetil)-1H-1,2,3triazolil)benzilideno) benzenosulfonohidrazida apresentaram os melhores resultados, com IC50 de 8,85 e 8,81 uM, respectivamente. Todos os compostos sintetizados foram caracterizados por técnicas de espectroscopia de ressonância magnética nuclear (RMN), infravermelho (IV) e espectrometria de massas (CG-MS). / [en] In view of the therapeutic importance of 1,2,3-triazoles and the versatility of the copper-catalyzed Huisgen 1,3-dipolar cycloaddition (CuAAC), the present work proposes the synthesis of new compounds containing 1,2,3-triazoles-1,4-disubstituted derivatives by addressing the concept of molecular hybridization to obtain various triazole-containing compounds associated with other privileged pharmacophoric groups. The compounds synthesized were divided into two series and evaluated for their anticancer potential, as antileishmanial and central nervous system disorders. In order to the first series of triazoles, aryl azides were prepared from commercial anilines and propargylic ethers were obtained from commercial phenols. The key step of the CuAAC reaction afforded of 1,2,3-triazoles-1,4-disubstituted 50 - 85 percent in yields. All compounds were evaluated in different glioblastoma cell lines (GBM), including highly resistant human cell lines such as GBM02, GBM95, in which compounds 2,2-(4,4-((1,3 henylenebis(oxy))bis(methylene))bis(1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl))dibenzaldehyde and (E)-4-methyl-N-(2-(4-(phenoxymethyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)benzylidene)benzenesulfonohydrazide were the most active, with IC50 of 28.7 and 30.3 uM, respectively. The triazole derivatives were also evaluated for the lung and prostate cancer strains (A549, 22Rv1), however, the compounds analyzed did not show activity in these cell lines. For the synthesis of the second series of hybrid compounds such as a-hydroxy-1,2,3-triazoles and benzochromenes-triazoles, aryl azides were prepared from aryl boronic acids and the propargylic alcohols from commercial benzaldehydes. The CuAAC reaction in the presence of sodium methoxide provided the novel a-hydroxy-1,2,3-triazoles in 35 and 75 percents yields. The a-hydroxy-1,2,3-triazoles, were aplied palladium-catalyzed intermolecular (C-O) cyclization reaction and provided benzocromenes-triazoles in 35-40 percent yields. These compounds were evaluated as inhibitors of glycine transporter (Gly T1), which are related to neurological disorders. Therefore, compound (2-bromophenyl) (1-(4-bromophenyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methanol showed the best result with 42 percent of inhibition and IC50 of 13 uM. All compounds were avaluated for antileishmanial activity (L. amazonenses), compounds 2,2-(4,4-((1,3-phenylenebis(oxy))bis(methylene))bis(1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl))dibenzaldehyde and (E)-4-methyl-N-(2-(4-(phenoxymethyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)benzylidene)benzenesulfonohydrazide presented the best results, with IC50 de 8,85 e 8,81 uM, respectively. All the compounds synthesized were characterized by nuclear magnetic resonance (NMR), infrared (FTIR) spectroscopy and mass spectrometry (GC-MS) techniques.
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Studies of Platinum Polyynyl Complexes: Elaboration of Novel "Click" Cycloadducts and Fluorous and Polygon Based Platinum Polyyndiyl Systems

Clough, Melissa Catherine 1985- 14 March 2013 (has links)
The major directions of this dissertation involve (1) the syntheses and characterization of molecular polygons incorporating sp1hybridized carbon linkers and L2Pt corners (L2 = cis-1,3-diphosphine), (2) the development of protected carbon chain complexes featuring fluorous phosphine ligands and (3) click reactions of metal terminal polyynyl complexes and further metallations of the resulting triazole rings. A brief overview is provided in Chapter I. Chapter II details the syntheses of molecular squares containing bidendate diphosphine ligands of the formula R2C(CH2PPh2)2 where R = Me, Et, n-Bu, n-Dec, Bn, and p-tolCH2 (general designation dppp*), in which the R2 groups are intended to circumvent the solubility issues encountered by others. Their syntheses involve double substitutions of the dimesylate compounds R2C(CH2OMs)2 using KPPh2. Building blocks of the formulae (dppp*)PtCl2 and (dppp*)Pt((C≡C)2H)2 are synthesized and characterized, including one crystal structure of the latter. The target complexes are accessed by reactions of (dppp*)PtCl2 with (dppp*)Pt((C≡C)2H)2 under Sonogashira type conditions. Six new squares of the formula [(R2C(CH2PPh2)2)Pt(C≡C)2]4 are characterized including two crystal structures. Further topics include approaches to higher homologues and cyclocarbon synthesis. Chapter III focuses on carbon chain complexes bearing fluorous phosphine ligands of the formula P((CH2)mRfn)3 (Rfn = (CF2)n-1CF3; m/n = 2/8, 3/8, and 3/10). Precursors of the formula trans-(C6F5)((Rfn(CH2)m)3P)2PtCl are synthesized and characterized, including one crystal structure, which reveals phase separation of the fluorous and non-fluorous domains. Reactions with butadiyne give trans-(C6F5)((Rfn(CH2)m)3P)2Pt(C≡C)2H. Oxidative homocouplings afford the target complexes trans,trans-(C6F5)((Rfn(CH2)m)3P)2Pt(C≡C)4(C6F5)(P((CH2)mRfn)3)2Pt. Cyclic voltammetry indicates irreversible oxidations of the title compounds, in contrast to partially reversible oxidations of non-fluorous analogues. Chapter IV focuses on multimetallic complexes achieved by click reactions in metal coordination spheres. The copper catalyzed click reaction between trans-(C6F5)(p-tol3P)2Pt(C≡C)2H (1) and (η5-C5H4N3)Re(CO)3 affords the bimetallic 1,2,3-triazole trans-C6F5)(p1tol3P)2PtC≡CC=CHN((η51C5H4)Re(CO)3)N=N. Further reactions with Re(CO)5OTf and Re(CO)5Br give trimetallated adducts, which represent the first species of this type. An alternative route to a trimetallic complex involves the twofold cycloaddition of the diazide (η5-C5H4N3)2Fe and 1, giving (η5-C5H4NN=N-C(trans-(C≡C)Pt(Pp-tol3)2(C6F5)=CH)2Fe. The crystal structures of the di and trimetallic complexes are compared, but attempts to achieve a fourth metallation involving the =CH groups are unsuccessful. However, when the triazolium salt [trans-(C6F5)(p-tol3P)2PtC≡CC=CHN(CH2C6H5)N=N(Me)]+ I– is treated with Ag2O and [Rh(COD)Cl]2, a =CRh adduct is obtained. The success of =CH metallation is correlated to the 1H NMR chemical shift, indicative of an electronic effect.
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Funcionalização de 2-(S)-isopropil-pirimidinonas através de reações de Suzuki-Miyaura, Sonogashira e cicloadição azida-acetileno: síntese de derivados triazólicos e precursores de β-aminoácidos / Functionalization of 2-(S)-isopropyl pyrimidinones through reactions Suzuki-Miyaura, Sonogashira and azideacetylene cycloaddition: synthesis of triazole derivatives and precursors of β-amino acids

Amaral, Mônica Franco Zannini Junqueira 13 August 2010 (has links)
Nesta monografia foram desenvolvidas metodologias sintéticas para a funcionalização das 2-(S)-isopropil-5-iodo-pirimidinonas, utilizando a reação de acoplamento cruzado de Suzuki-Miyaura e a reação de cicloadição azida-acetileno com cobre, através de estratégias simples e eficientes que permitiram a preparação de uma série de compostos com grande diversidade estrutural. Inicialmente descreve-se a síntese da 2-(S)-isopropil-5-iodo-pirimidinona (S)- 3, a partir da (S)-asparagina enantiomericamente pura 1, um aminoácido barato e de fácil acesso, produzindo na primeira etapa o 2-(S)-isopropil-peridropirimidinona-6- ácido carboxílico (2S,6S)-2, que reagindo com diacetoxiiodo benzeno/iodo e BF3.OEt2, gera a pirimidinona (S)-3. Em seguida, preparou-se uma série de 2-(S)-isopropil-5-aril-pirimidinonas (S)- 6a-q e 2-(S)-isopropil-5-alquinil-pirimidinonas (S)-7a-q, através da reação de acoplamento cruzado de Suzuki-Miyaura, sob catálise de paládio, utilizando aril- (4aq) e alquiniltrifluoroboratos de potássio (5a-q), respectivamente. Desta forma sintetizou-se uma variedade de pirimidinonas com alterações programadas de substituintes na posição 5 do anel, com rendimentos de 15% a 95%. Ainda a fim de obter algumas pirimidinonas com substituintes acetilênicos alquílicos 9a-f, utilizou-se a metodologia de acoplamento de Sonogashira. Em todos os casos obtiveram-se bons rendimentos. Dando sequência ao projeto, sintetizou-se as 2-(S)-isopropil-pirimidinonas funcionalizadas na posição C5 com anéis triazólicos substituídos na posição N1 (S)- 11a-k, através da reação de cicloadição azida-acetileno utilizando CuI como fonte de cobre e ondas ultra-sônicas como fonte de energia. Preparou-se diversos compostos, todos com rendimentos variando de 79% a 87% em 5 minutos de reação. Por último, através da redução da dupla ligação endocíclica dos compostos (S)-6a, 6b, 6g, 6l e 6n e posterior hidrólise utilizando radiação microondas proporcionou a obtenção de α-aril β-aminoácidos altamente enantioenriquecidos. / This monograph shows the development of a synthetic methodology for the functionalization of 2-(S)-isopropyl-5-iodo-pyrimidinones using either Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions or cycloaddition reactions of azide-acetylenes with copper, through a simple and efficient pathway enabling the preparation of a series of structurally diverse compounds. This paper begins by describing the synthesis of 2-(S)-isopropyl-5-iodopyrimidinones (S)-3, from enantiomerically pure (S)-asparagine 1. This inexpensive and readily available amino acid forms 2-(S)-isopropyl-perhidropyrimidinone-6- carboxylic acid (2S, 6S)-2, which is reacted with DIB / iodine and BF3·OEt2 to form pyrimidinone (S)-3. Using palladium-catalyzed Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions, a series of 2-(S)-isopropyl-5-arylpyrimidinones (S)-6a-q and 2-(S)-isopropyl-5- alkynylpyrimidinones (S)-7a-q were prepared using potassium aryl- (4a-q) and alkynyltrifluoroborates (5a-q), respectively. With this reaction, a variety of pyrimidinones with different substituents at position 5 of the ring were synthesized, with yields ranging from 15% to 95%. The Sonogashira coupling reaction was used to prepare pyrimidinones with alkyl acetylenic substituents (S)-9a-f, giving good yields in all cases. 2-(S)-Isopropylpyrimidinones were then functionalized in the C5 position with N1 (S)-11a-k substituted triazole rings. These functionalizations were performed by the cycloaddition of azide-acetylenes using CuI and ultrasonic waves, which provided enough energy to reduce the reaction time to only five minutes. Several different variations of this compound were prepared, all with yields between 78% and 87%. Finally, the endocyclic double bonds in compounds (S)-6a, 6b, 6g, 6l and 6n were reduced, followed by a hydrolysis using microwave radiation to afford the highly enantioenriched α-aryl β-amino acids.
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Antichagásicos potenciais: planejamento e síntese de bioisósteros 1,2,4-triazólicos do hidroximetilnitrofural e análogos / Potential antichagasic agents: design and synthesis of 1,2,4-triazolic hydroxymethylnitrofurazone bioisosteres and analogues

Silva, Fredson Torres 12 December 2014 (has links)
A doença de Chagas, parasitose causada pelo Trypanosoma cruzi, é doença prevalente na América Latina. Estima-se que cerca de 10 milhões de pessoas estão sob o risco de infecção e, em 2008, registraram-se mais de 10 mil óbitos devido à doença. Os únicos dois fármacos disponíveis na terapêutica, nifurtimox e benznidazol, são mais eficazes no tratamento da doença no início da fase aguda. Entretanto, a fase crônica da doença não possui tratamento. O nitrofural (NF), fármaco antimicrobiano, destaca-se por possuir atividade contra o T. cruzi, porém, apresenta toxicidade. Seu derivado hidroximetilado, o hidroximetilnitrofural (NFOH), por sua vez, mostrou maior atividade antichagásica e menor toxicidade. Ante a necessidade de novos fármacos antichagásicos, a existência de alvos terapêuticos promissores como a 14α-esterol desmetilase (CYP51) e a cruzaína e mediante utilização do bioisosterismo como ferramenta de modificação molecular, realizou-se a triagem virtual de 144 ligantes análogos do NFOH pelo método de docking com o programa GOLD para a CYP51 de T. cruzi. Adicionalmente, realizou-se estudo qualitativo dos campos de interação moleculares (MIFs) com o programa GRID para a enzima humana e do parasita, homólogas entre si, estudo que revelou 9 resíduos de aminoácidos no sítio ativo da enzima parasitária que podem ser explorados no planejamento de inibidores seletivos. Neste trabalho, obtiveram-se 5 compostos inéditos, caracterizados por determinação da faixa de fusão, análise elementar, técnicas de espectroscopia no infravermelho, espectroscopia de ressonância magnética nuclear de 1H,13C, HSQC, HMBC, HETCOR e NOESY, e a atribuição dos sinais foi realizada com o auxílio de técnicas de modelagem molecular. Testaram-se 4 compostos contra a forma amastigota de T. cruzi em células da linhagem U2OS. Todos os compostos apresentaram atividade da ordem de micromolar e índices de seletividade satisfatórios. O composto LAPEN-2901 teve sua estrutura elucidada por cristalografia de raios X, apresentou toxicidade duas vezes menor que o NFOH e potência semelhante à do composto de referência benznidazol, porém menor eficácia. Os resultados obtidos ressaltam a importância de grupos nitro, 1,2,4-triazólicos e tiossemicarbazônicos para o planejamento de derivados eficazes no tratamento da fase crônica da doença de Chagas. / Chagas disease, parasitosis caused by Trypanosoma cruzi, is a disease that predominates in Latin America. It is estimated that 10 million people are under the risk of infection and, in 2008, more than 10 thousand deaths were registered. The only two drugs available in the therapeutics, nifurtimox and benznidazole, showed to be more effective in the acute phase of the disease. However, there is no choice for the chronic phase. Nitrofurazone (NF), an antimicrobial drug, has activity against T. cruzi, although being toxic. Its hydroxymethyl derivative, the hydroxymethylnitrofurazone (NFOH), showed to be more active and less toxic than the prototype. Considering the need for new antichagasic drugs, the existence of promising new therapeutic targets, as 14α-esterol demethylase and cruzain, and by employing the bioisosterism approach, a virtual screening using T. cruzi CYP51 was performed for 144 NFOH analogues. Additionaly, a qualitative molecular interaction field study was performed, revealing 9 aminoacids in the parasitic enzyme relevant for selectivity. Five novel compounds were synthesized, characterized by melting range, elemental analysis, IR spectroscopy, 1H and 13C NMR as well as HSQC, HMBC, HETCOR and NOESY experiments, in which the signal assigning were aided using molecular modeling techniques Four compounds were tested against T. cruzi amastigotes in infected U2OS cells. All compounds were sufficiently selective towards T. cruzi and showed trypanomicidal activity in low micromolar range. The compound LAPEN-2901 had its structure determined using X-ray crystallography and showed lower toxicity than NFOH and potency similar to benznidazole, but lower efficacy. These results highlight the importance of the 1,2,4-triazolic, thiosemicarbazonic and nitro group moieties for designing new efficient compounds for the chronic phase of Chagas disease.
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Antichagásicos potenciais: planejamento e síntese de bioisósteros 1,2,4-triazólicos do hidroximetilnitrofural e análogos / Potential antichagasic agents: design and synthesis of 1,2,4-triazolic hydroxymethylnitrofurazone bioisosteres and analogues

Fredson Torres Silva 12 December 2014 (has links)
A doença de Chagas, parasitose causada pelo Trypanosoma cruzi, é doença prevalente na América Latina. Estima-se que cerca de 10 milhões de pessoas estão sob o risco de infecção e, em 2008, registraram-se mais de 10 mil óbitos devido à doença. Os únicos dois fármacos disponíveis na terapêutica, nifurtimox e benznidazol, são mais eficazes no tratamento da doença no início da fase aguda. Entretanto, a fase crônica da doença não possui tratamento. O nitrofural (NF), fármaco antimicrobiano, destaca-se por possuir atividade contra o T. cruzi, porém, apresenta toxicidade. Seu derivado hidroximetilado, o hidroximetilnitrofural (NFOH), por sua vez, mostrou maior atividade antichagásica e menor toxicidade. Ante a necessidade de novos fármacos antichagásicos, a existência de alvos terapêuticos promissores como a 14α-esterol desmetilase (CYP51) e a cruzaína e mediante utilização do bioisosterismo como ferramenta de modificação molecular, realizou-se a triagem virtual de 144 ligantes análogos do NFOH pelo método de docking com o programa GOLD para a CYP51 de T. cruzi. Adicionalmente, realizou-se estudo qualitativo dos campos de interação moleculares (MIFs) com o programa GRID para a enzima humana e do parasita, homólogas entre si, estudo que revelou 9 resíduos de aminoácidos no sítio ativo da enzima parasitária que podem ser explorados no planejamento de inibidores seletivos. Neste trabalho, obtiveram-se 5 compostos inéditos, caracterizados por determinação da faixa de fusão, análise elementar, técnicas de espectroscopia no infravermelho, espectroscopia de ressonância magnética nuclear de 1H,13C, HSQC, HMBC, HETCOR e NOESY, e a atribuição dos sinais foi realizada com o auxílio de técnicas de modelagem molecular. Testaram-se 4 compostos contra a forma amastigota de T. cruzi em células da linhagem U2OS. Todos os compostos apresentaram atividade da ordem de micromolar e índices de seletividade satisfatórios. O composto LAPEN-2901 teve sua estrutura elucidada por cristalografia de raios X, apresentou toxicidade duas vezes menor que o NFOH e potência semelhante à do composto de referência benznidazol, porém menor eficácia. Os resultados obtidos ressaltam a importância de grupos nitro, 1,2,4-triazólicos e tiossemicarbazônicos para o planejamento de derivados eficazes no tratamento da fase crônica da doença de Chagas. / Chagas disease, parasitosis caused by Trypanosoma cruzi, is a disease that predominates in Latin America. It is estimated that 10 million people are under the risk of infection and, in 2008, more than 10 thousand deaths were registered. The only two drugs available in the therapeutics, nifurtimox and benznidazole, showed to be more effective in the acute phase of the disease. However, there is no choice for the chronic phase. Nitrofurazone (NF), an antimicrobial drug, has activity against T. cruzi, although being toxic. Its hydroxymethyl derivative, the hydroxymethylnitrofurazone (NFOH), showed to be more active and less toxic than the prototype. Considering the need for new antichagasic drugs, the existence of promising new therapeutic targets, as 14α-esterol demethylase and cruzain, and by employing the bioisosterism approach, a virtual screening using T. cruzi CYP51 was performed for 144 NFOH analogues. Additionaly, a qualitative molecular interaction field study was performed, revealing 9 aminoacids in the parasitic enzyme relevant for selectivity. Five novel compounds were synthesized, characterized by melting range, elemental analysis, IR spectroscopy, 1H and 13C NMR as well as HSQC, HMBC, HETCOR and NOESY experiments, in which the signal assigning were aided using molecular modeling techniques Four compounds were tested against T. cruzi amastigotes in infected U2OS cells. All compounds were sufficiently selective towards T. cruzi and showed trypanomicidal activity in low micromolar range. The compound LAPEN-2901 had its structure determined using X-ray crystallography and showed lower toxicity than NFOH and potency similar to benznidazole, but lower efficacy. These results highlight the importance of the 1,2,4-triazolic, thiosemicarbazonic and nitro group moieties for designing new efficient compounds for the chronic phase of Chagas disease.
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Síntese de peptídeo modificado contendo grupo 1,2,3-triazol 1,4-dissubstituído / Synthesis of modified peptide containing 1,4-disubstituted 1,2,3- triazole group

Lima, Milena Moreira 28 June 2013 (has links)
Peptídeos são biomoléculas que apresentam extensa variedade estrutural e funcional, atuando em diversos processos biológicos relevantes. Estas moléculas são amplamente utilizadas na terapêutica, constituindo, atualmente, um campo investigativo bastante promissor para o desenvolvimento de novos fármacos, especialmente no desenvolvimento de vacinas sintéticas. Os avanços científicos relacionados às técnicas de identificação, análise e purificação tem estimulado diversas pesquisas na busca por fármacos baseados em peptídeos, os quais podem ser obtidos a partir de fontes naturais ou por métodos químicos (em solução ou em fase sólida), enzimático ou combinação de ambos (semi-síntese) e via tecnologia do DNA recombinante. Entretanto, devido às limitações próprias dos peptídeos naturais, tais como, suscetibilidade proteolítica, toxicidade e baixa biodisponibilidade, torna-se necessária a síntese de peptídeos modificados. Como a função biológica de um peptídeo é definida por sua conformação estrutural, a inserção de modificação em uma estrutura peptídica deve ser capaz de manter ou estabilizar esta conformação estrutural. O desenvolvimento de novas e eficientes rotas de síntese de peptídeos modificados torna-se necessário para superar as limitações relacionadas à suscetibilidade proteolítica, toxicidade e baixa biodisponibilidade, afim de contribuir para novas estratégias terapêuticas, em especial no desenvolvimento de vacinas. Desta forma, a inserção de grupo 1,2,3-triazol tem fornecido propriedades físicoquímicas desejáveis no desenvolvimento de fármacos. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um método de síntese de peptídeos contendo grupo 1,2,3-triazol 1,4- dissubstituído, como o peptídeo 1, o qual é constituído por dezesseis resíduos de treonina e um grupo 1,2,3-triazol 1-4-dissubstituído entre os resíduos Thr8 e Thr9 (NH2-(Thr)7-Thr-(ciclo 1,2,3-triazol 1,4-dissubstituído)-Thr-(Thr)7-OH). Adicionalmente, devido à semelhança com mucinas de T. cruzi, as quais apresentam rica composição em resíduos de treonina, 1 poderá ser empregado na preparação de peptideomiméticos destas mucinas e no desenvolvimento de vacinas relacionadas à processos infecciosos causados por T. cruzi. A preparação de 1 envolveu uma associação entre síntese de peptídeo em fase sólida e reações de ciclo-adição azido-alcino 1,3 dipolar catalisada por cobre (I) (CuAAC). Inicialmente, o método utilizado foi padronizado a partir da síntese do modelo dipeptídeo de treonina (8), cuja ligação peptídica foi substituída pelo grupo 1,2,3-triazol 1,4- dissubstituído (NHFmoc-Thr-(ciclo 1,2,3-triazol 1,4 dissubstituído)-Thr-OH). A estratégia via CuAAC conduziu à obtenção do dipeptídeo modificado em excelente rendimento (98%) e permitiu estabelecer as condições a serem empregadas na obtenção do peptídeo mais complexo de cadeia longa 1. A reação de CuAAC gerou o peptídeo 1 com rendimento bruto satisfatório (70%). A obtenção de 1 foi confirmada pela análise de Ressonância Magnética Nuclear de próton (RMN 1H), a qual permitiu identificar a presença do grupo 1,2,3-triazol 1,4-dissubstituído. Adicionalmente, análises posteriores por espectrometria de massas (ESI-MS) sugerem a obtenção do peptídeo 1. / Peptides are biomolecules which present great structural and functional variety, acting in several biological processes. These molecules are widely used in therapeutics, and recently represent a very promising field for development of novel drugs, specially on synthetic vaccines. Scientific advances related to identification techniques, analysis and purification stimulate researches in attempt to produce peptides-based drugs, which can be extracted from natural sources or chemically synthesized (in liquid or solid phase), enzymatic process or both (semi-synthesis) and recombinant DNA technology. However, due to limitations concerning natural peptides, such as, proteolytic liability, toxicity and low bioavailability, becomes necessary the synthesis of modified peptides. Being biological function of a peptide defined by its structural conformation, adding a modification in a peptide structure must be able to maintain or stabilize it. The development of novel and efficient synthetic route of modified peptides is necessary to overcome the limitations related to proteolytic liability, toxicity and low bioavailability, to contribute with novel therapeutic strategies, mostly development of vaccines. So, adding a 1,2,3-triazole group can afford desirable chemical-physical properties in drug discovery. The objective was develop a method to synthesize peptides containing 1,4-disubstituted 1,2,3-triazole group, such as peptide 1, which is constituted by sixteen threonine residues and one 1,4 disubstituted 1,2,3-triazole group (NH2-(Thr)7-Thr-(1,4- disubstituted 1,2,3-triazole cycle)-Thr-(Thr)7-OH). Moreover, due to the similarity with T. cruzi mucins that present great composition of threonine, 1 can be employed in development of vaccines related to infectious processes caused by T. cruzi. The preparation of 1 envolved an association between the solid-phase synthesis of peptide and reactions of copper(I)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC). Initially, the method was standardized from synthesis of threonine dipeptide (8), whose peptide bond was replaced by 1,4-disubstituted 1,2,3-triazole group (NHFmoc-Thr-(1,4-disubstituted 1,2,3-triazole cycle)-Thr-OH). The strategy via CuAAC gave the modified dipeptide in good yield (98%) and allowed to establish the conditions to prepare the more complex peptide with long chain 1. The CuAAC reaction gave the peptide 1 with good yield (70%). Compound 1 was confirmed by NMR proton analysis which showed the presence of 1,4-disubstituted 1,2,3-triazole group. Additionally, further analysis of mass spectrometry (ESI-MS) suggest the achievement of peptide 1.
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Exploring Key Orientations of Small Molecules to Disrupt Protein-protein Interactions

Ko, Eunhwa 2012 May 1900 (has links)
Protein-protein interactions (PPIs) are attractive targets because of their therapeutic potential. One approach to design small molecules that can disrupt the PPIs is to use structural information of proteins. With this approach, triazole-based peptidomimetics that mimic beta-turn hot-spot regions in neurotrophins were synthesized. The monovalent mimics were assembled into bivalent mimics via a combinatorial method. Three different bivalent mimics were prepared for different studies. Bivalent mimics with long-linkers bound to TrkA or TrkC receptor and showed partial antagonism for the receptors. Other mimics were conjugated with cytotoxic compounds and they were used for TrkC targeted drug delivery. The last group of bivalent mimics previously showed targeted delivery effects for pancreatic cancer cells. In this study, we synthesized Eu-chelated bivalent mimics to perform a competitive binding assay for pancreatic cancer cells. Previous research in our group focused on design of secondary structures' mimics on rigid scaffolds as "minimalist mimics." We sought to establish structural design criteria for the minimalist mimics, and we wanted to propose that sets of such compounds could mimic local pairs of amino acids in any secondary structures as "universal peptidomimetics." Thus, we designed five compounds, such as oxazoline-, pyrrole-, dyine- "kinked" and "linear" bistrizole-based peptidomimetics, and performed molecular modelings, DFT calculations, and QMD for them to validate our hypothesis. On the concepts of "minimalist mimics" and "universal peptidomimetics," we developed the C alpha ? C beta vector matching program to evaluate preferred orientations of C alpha - C beta coordinates for secondary structures. We applied the program to omegatides and pyrrolinone-pyrrolidine oligomers. The compounds matched better with strands than for helices. We expanded the C alpha ? C beta vector matching idea to a method that ranks preferred conformations of small molecules on any combination of three interface side-chains in all structurally characterized PPIs. We developed a PDB mining program (explores key orientation, EKO) to do this, and EKO applied to pyrrolinone-pyrrolidine oligomers to find targets. EKO found several interesting targets, such as AICAR Tfase, GAPDH, and HIV-1 protease. HIV-1 dimerization inhibition and Zhang-Poorman kinetic assays were performed to validate our hypothesis, and the results showed that pyrrolinone-pyrrolidine derivatives inhibited HIV-1 dimerization.
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Ligands Électroactifs Multifonctionnels et Chiralité Hélicoïdale dans les Tétrathiafulvalènes

Biet, Thomas 23 November 2012 (has links) (PDF)
Ce travail s'articule autour de deux grands axes : les ligands électroactifs et la chiralité hélicoïdale dans les tétrathiafulvalènes, avec l'élaboration de TTF-triazoles, TTF-bis(bis-oxazolines) et de TTF-hélicènes. La synthèse de TTF-triazoles via deux stratégies de click chemistry, CuAAC et RuAAC, a permis d'obtenir une bibliothèque de ligands électroactifs mono- et polydentates dont les structures cristallines sont reportées ainsi que l'étude théorique des TTF-mono-triazoles. La capacité de ces ligands à coordiner a été testée avec la synthèse et la caractérisation structurale de complexes de métaux de transition. Aussi, nous avons développé la synthèse d'un TTF-bis(bis-oxazoline) chiral et étudié sa coordination ainsi que son activité dans des réactions de catalyse homogène énantiosélective. Dans une seconde partie, nous présentons la synthèse de nouveaux précurseurs hélicoïdaux : les TTF-hélicènes, incluant les études théoriques et expérimentales de leurs propriétés chiroptiques. Plus particulièrement, une étude du dichroïsme circulaire en fonction de l'état redox du TTF a permis de mettre en évidence un phénomène de switch chiroptique pour ces composés. Enfin, une ouverture sur les complexes dithiolènes a été faite avec la synthèse et caractérisation de deux complexes de platine (II) (bipyridine) (hélicènedithiolate), les premiers complexes dithiolènes hélicoïdaux.
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Synthèse et évaluation de nouveaux nucléosides ciblant l'hépatite C dans un système réplicon

Joubert, Nicolas 20 December 2006 (has links) (PDF)
Le virus de l'hépatite C est un problème de santé publique majeur, puisque 180 millions de personnes sont chroniquement infectées dans le monde, et sont susceptibles de présenter une cirrhose ou un cancer du foie. Un seul traitement a été approuvé, à base de Ribavirine et d'interféron alpha, mais il permet de traiter moins de 50 % des personnes infectées, et présente de nombreux effets secondaires. Devant ce constat, il parait urgent d'aboutir à une polythérapie plus adaptée. En dépit du succès des nucléosides en chimie antivirale, visant plusieurs enzymes clefs intervenant dans la réplication virale, peu d'entre eux ont été conçus pour viser l'ARN polymérase ARN dépendante nécessaire au VHC. Dans cette optique, de nouveaux dérivés carbocycliques de la Ribavirine, et des dérivés nucléosidiques du type 5-haloéthynyl- ou 5-(1,2-dihalo)vinyluracile, ont été synthétisés en utilisant deux méthodes : la réaction de Sonogashira et la cyclisation 1,3-dipolaire. Ce sont des outils puissants de la chimie organique qui permettent l'accès à de nouvelles structures nucléosidiques et la réalisation de modifications chimiques ultérieures. Les nouveaux composés ainsi préparés ont été testés pour leur activité antivirale.
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Preparação e Avaliação da Atividade Catalítica de Polímeros de Condensação de Metilpiridinas e Tereftalaldeído em Reações de Nitroaldol e Cicloadição Heterodipolar [3+2] / Preparation and evaluation of catalytic activity condensation polymers of methyl pyridines and terephthalaldehyde in nitroaldol reactions and heteropolar [3+2] cycloaddition reactions

Cristiane Aragão de Souza Bastardis 09 March 2015 (has links)
Nesse estudo, foram preparadas bases poliméricas derivadas de 2,6-dimetilpiridinas e tereftaladeído utilizando a 2,4,6-trimetilpiridina como agente de reticulação. As resinas foram sintetizadas sob aquecimento convencional e purificadas por precipitação em metanol, apresentando rendimentos variando de 59 a 95%. Os copolímeros produzidos foram caracterizados por análise termogravimétrica (TGA), ressonância nuclear magnética de núcleo de hidrogênio (RMN-1H) e espectroscopia na região do infravermelho com técnica de ATR (FTIR - ATR), além de sua atividade básica. A capacidade catalítica do material produzido foi avaliada em reações nitroaldólicas, do tipo Henry, tanto em aquecimento convencional quanto com o uso de reator de micro-ondas. Não sendo observada atividade catalítica significativa para as resinas testadas, nestas reações. O material polimérico produzido também foi testado como suporte para cobre na catálise de reações de cicloadição heterodipolar do tipo [3+2] com benzilazida e propiolato de etila, para a formação de triazóis, processadas em reator de micro-ondas e sob aquecimento convencional. A reação mostrou-se regiosseletiva e processos de reciclo do catalisador se mostrou eficiente em reações consecutivas / In this study, polymeric bases from 2,6-dimethylpyridines and terephthaladehyde using 2,4,6-trimethylpyridine as crosslinking agent were prepared. The resins were synthesized under conventional heating, and purified by precipitation in methanol, with yields ranging 59-95%. The produced copolymers were characterized by thermogravimetric analysis (TGA), proton nuclear magnetic resonance (1H-NMR), infrared spectroscopy by attenuated total reflection (FTIR - ATR) and basic activity. The catalytic ability of the material produced was evaluated in nitroaldol reactions (Henry reactions) as both conventional heating and a microwave reactor. Catalytic activity was not observed for the tested resins in these reactions. The polymeric material produced was also tested as an activator in Heterodipolar [3 + 2] cycloaddition reactions, with benzyl azide and ethyl propiolate to the formation of triazoles, performed in microwave reactor and conventional heating. The reaction proved to be regioselective and recycling processes of the catalyst is efficient in consecutive reactions

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