CRUZ, M. A. Avaliação de redes neurais competitivas em tarefas de quantização vetorial: um estudo comparativo. 2007. 119 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Teleinformática) – Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2007. / Submitted by Marlene Sousa (mmarlene@ufc.br) on 2016-04-04T19:17:47Z No. of bitstreams: 1 2007_dis_macruz.pdf: 2517117 bytes, checksum: adcb9ff5b0dbd38bb2c584d29fbb70df (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa(mmarlene@ufc.br) on 2016-04-06T19:13:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_dis_macruz.pdf: 2517117 bytes, checksum: adcb9ff5b0dbd38bb2c584d29fbb70df (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-06T19:13:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_dis_macruz.pdf: 2517117 bytes, checksum: adcb9ff5b0dbd38bb2c584d29fbb70df (MD5) Previous issue date: 2007-09-06 / The main goal of this master thesis was to carry out a comparative study of the performance of algorithms of unsupervised competitive neural networks in problems of vector quantization (VQ) tasks and related applications, such as cluster analysis and image compression. This study is mainly motivated by the relative scarcity of systematic comparisons between neural and nonneural algorithms for VQ in specialized literature. A total of seven algorithms are evaluated, namely: K-means, WTA, FSCL, SOM, Neural-Gas, FuzzyCL and RPCL. Of particular interest is the problem of selecting an adequate number of neurons given a particular vector quantization problem. Since there is no widespread method that works satisfactorily for all applications, the remaining alternative is to evaluate the influence that each type of evaluation metric has on a specific algorithm. For example, the aforementioned vector quantization algorithms are widely used in clustering-related tasks. For this type of application, cluster validation is based on indexes that quantify the degrees of compactness and separability among clusters, such as the Dunn Index and the Davies- Bouldin (DB) Index. In image compression tasks, however, a given vector quantization algorithm is evaluated in terms of the quality of the reconstructed information, so that the most used evaluation metrics are the mean squared quantization error (MSQE) and the peak signal-to-noise ratio (PSNR). This work verifies empirically that, while the indices Dunn and DB or favors architectures with many prototypes (Dunn) or with few prototypes (DB), metrics MSE and PSNR always favor architectures with well bigger amounts. None of the evaluation metrics cited previously takes into account the number of parameters of the model. Thus, this thesis evaluates the feasibility of the use of the Akaike’s information criterion (AIC) and Rissanen’s minimum description length (MDL) criterion to select the optimal number of prototypes. This type of evaluation metric indeed reveals itself useful in the search of the number of prototypes that simultaneously satisfies conflicting criteria, i.e. those favoring more compact and cohesive clusters (Dunn and DB indices) versus those searching for very low reconstruction errors (MSE and PSNR). Thus, the number of prototypes suggested by AIC and MDL is generally an intermediate value, i.e nor so low as much suggested for the indexes Dunn and DB, nor so high as much suggested one for metric MSE and PSNR. Another important conclusion is that sophisticated models, such as the SOM and Neural- Gas networks, not necessarily have the best performances in clustering and VQ tasks. For example, the algorithms FSCL and FuzzyCL present better results in terms of the the of the reconstructed information, with the FSCL presenting better cost-benefit ratio due to its lower computational cost. As a final remark, it is worth emphasizing that if a given algorithm has its parameters suitably tuned and its performance fairly evaluated, the differences in performance compared to others prototype-based algorithms is minimum, with the coputational cost being used to break ties. / Esta dissertação tem como principal meta realizar um estudo comparativo do desempenho de algoritmos de redes neurais competitivas não-supervisionadas em problemas de quantização vetorial (QV) e aplicações correlatas, tais como análise de agrupamentos (clustering) e compressão de imagens. A motivação para tanto parte da percepção de que há uma relativa escassez de estudos comparativos sistemáticos entre algoritmos neurais e não-neurais de análise de agrupamentos na literatura especializada. Um total de sete algoritmos são avaliados, a saber: algoritmo K -médias e as redes WTA, FSCL, SOM, Neural-Gas, FuzzyCL e RPCL. De particular interesse é a seleção do número ótimo de neurônios. Não há um método que funcione para todas as situações, restando portanto avaliar a influência que cada tipo de métrica exerce sobre algoritmo em estudo. Por exemplo, os algoritmos de QV supracitados são bastante usados em tarefas de clustering. Neste tipo de aplicação, a validação dos agrupamentos é feita com base em índices que quantificam os graus de compacidade e separabilidade dos agrupamentos encontrados, tais como Índice Dunn e Índice Davies-Bouldin (DB). Já em tarefas de compressão de imagens, determinado algoritmo de QV é avaliado em função da qualidade da informação reconstruída, daí as métricas mais usadas serem o erro quadrático médio de quantização (EQMQ) ou a relação sinal-ruído de pico (PSNR). Empiricamente verificou-se que, enquanto o índice DB favorece arquiteturas com poucos protótipos e o Dunn com muitos, as métricas EQMQ e PSNR sempre favorecem números ainda maiores. Nenhuma das métricas supracitadas leva em consideração o número de parâmetros do modelo. Em função disso, esta dissertação propõe o uso do critério de informação de Akaike (AIC) e o critério do comprimento descritivo mínimo (MDL) de Rissanen para selecionar o número ótimo de protótipos. Este tipo de métrica mostra-se útil na busca do número de protótipos que satisfaça simultaneamente critérios opostos, ou seja, critérios que buscam o menor erro de reconstrução a todo custo (MSE e PSNR) e critérios que buscam clusters mais compactos e coesos (Índices Dunn e DB). Como conseqüência, o número de protótipos obtidos pelas métricas AIC e MDL é geralmente um valor intermediário, i.e. nem tão baixo quanto o sugerido pelos índices Dunn e DB, nem tão altos quanto o sugerido pelas métricas MSE e PSNR. Outra conclusão importante é que não necessariamente os algoritmos mais sofisticados do ponto de vista da modelagem, tais como as redes SOM e Neural-Gas, são os que apresentam melhores desempenhos em tarefas de clustering e quantização vetorial. Os algoritmos FSCL e FuzzyCL são os que apresentam melhores resultados em tarefas de quantização vetorial, com a rede FSCL apresentando melhor relação custo-benefício, em função do seu menor custo computacional. Para finalizar, vale ressaltar que qualquer que seja o algoritmo escolhido, se o mesmo tiver seus parâmetros devidamente ajustados e seus desempenhos devidamente avaliados, as diferenças de performance entre os mesmos são desprezíveis, ficando como critério de desempate o custo computacional.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-04-24Bitstream added on 2014-06-13T20:43:14Z : No. of bitstreams: 1 corsi_ac_dr_rcla.pdf: 19258710 bytes, checksum: 0157a7f16ce90a75605ecb038dde69ef (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Este trabalho teve como propósito estudar a compartimentação morfoestrutural DO Triângulo Mineiro, apoiando-se em análises geomorfológicas e geológicas para fins hidrogeológicos. A metodologia adotada baseou-se na análise de drenagem, análise do relevo e na análise estrutural. A configuração morfoestrutural da região do Triângulo Mineiro é ditada principalmente pelo arranjo de lineamentos orientados segundo a direção NW-SE para a bacia do rio Paranaíba e segundo a direção EW e NS para a bacia do rio Grande, associadas à reativação de descontinuidades do pré- Cambriano durante o Terciário, configurando um mosaico de blocos. Na região foram reconhecidos oito compartimentos morfoestruturais, subdivididos internamente em sub-compartimentos. Essa compartimentação afeta toda a coluna litoestratigráfica, tanto do ponto de vista da distribuição em área, quanto de sua espessura. Neste quadro foram individualizadas as depressões de Gurinhatã, Comendador Gomes, Limeira D Oeste entre outras, que apresentam maiores espessuras de sedimentos, sendo locais indicados para explotação do aqüífero Bauru. No entanto para o aqüífero Serra Geral, contemplou-se que os alinhamentos de direção NW-SE coincidem com os melhores dados de vazão. O período Terciário tem uma importância fundamental para a região, tanto na sedimentação da Formação Nova Ponte e depósitos correlatos, quanto no tectonismo deformador responsável pela configuração da paisagem atual. / The aim of this work is to study morphostructural compartmentalization based on geomorphologic and geological analyses. The methodology used was based on analyses of drainage, relief and in the structural features in the Triângulo Mineiro region. The morphostructural configuration of the Paranaíba River basin in this region is controlled mainly by underlying NW-SE discontinuities in the Precambrian basement that were reactivated during the Tertiary. In the case of the Grande River basin, the basement structures reactivated in the Tertiary are oriented EW and NS. In the area, eight main morphostructural compartments were recognized, each of which can be subdivided into sub-compartments. These compartments affect the whole litostratigraphic column in terms of its areal distribution as well as its local thickness. This being the case, the Gurinhatã, Comendador Gomes and Limeira D Oeste depressions developed, along with other smaller local thick sediment accumulations, which are suitable for local exploitation of the Bauru aquifer. In the Serra Geral aquifer, however, it was determined that the NW-SE structural features are associated with the highest water yields. The Tertiary period has a fundamental importance for the area, both in terms of the sedimentation of the Nova Ponte Formation and chrono-correlated deposits, as well as in the tectonic deformation responsible for the configuration of the current landscape.

Orientador: João Tadeu Ribeiro Paes / Banca: Maria de Lourdes da Graça Macoris / Banca: Francisco Anaruma Filho / Resumo: A dengue, doença infecciosa aguda, causada por um vírus da família Flaviviridae e transmitida aos humanos pela picada dos mosquitos do gênero Aedes, é considerada um dos principais problemas de saúde pública no mundo. O Aedes aegypti é o único vetor conhecido nas Américas e no Brasil está presente nos 26 estados e no distrito federal. A indisponibilidade de uma vacina que imunize a população contra os quatro sorotipos da dengue restringe a prevenção da doença ao controle do vetor. Isto é feito por aplicações de inseticidas químicos, porém o uso frequente em altas doses tem selecionado populações resistentes do mosquito. Diante dessa situação há necessidade de se buscar produtos alternativos que tenham efeito nestas populações. Diversos estudos demonstraram que os óleos essenciais de Syzygium aromaticum e Citrus sinensis apresentam pronunciada atividade larvicida, assim, este trabalho teve por objetivo avaliar o potencial destes produtos como alternativa de controle larvicida para populações de A. aegypti resistentes ao organofosforado temephos e verificar o efeito da associação deste inseticida aos óleos essenciais sobre a atividade larvicida. Avaliou-se também, a influência dos óleos essenciais na oviposição do vetor quando presentes nos sítios de postura. A comparação da atividade larvicida nas populações resistentes e suscetíveis foi realizada por meio das concentrações letais obtidas em ensaios de dose-resposta, seguindo metodologia proposta pela Organização Mundial da Saúde. Para avaliar o efeito da associação dos óleos essenciais ao temephos comparou-se a atividade larvicida das associações com a do temephos e o efeito no comportamento de oviposição foi avaliado pela comparação do número de ovos colocados nos sítios de postura, contendo soluções dos óleos essenciais em relação aos contendo somente água. Os resultados revelaram que os óleos essenciais exerceram atividade ... / Abstract: Dengue fever an acute infectious disease caused by Flaviviridae family virus, transmitted to humans by the mosquitoes bite of Aedes genus. It is considered one of the most public health problems in the world. The Aedes aegypti is the only known vector in the Americas and in Brazil is present in 26 states and the federal district. The unavailability of a vaccine to immunize people against the four dengue serotypes restricted the disease prevention to the vector control. The control is done by chemical insecticides application, but the frequent use in high doses, have selected resistant mosquito populations. In front of this situation, it is necessary to seek for alternative products that have effect on these populations. Several studies demonstrated that Syzygium aromaticum and Citrus sinensis essential oils have larvicidal activity, so the aim of this study was to evaluate the potential of the essencial oils as an alternative to control A. aegypti larvae resistant to the organophosphate temephos and analyze the effect of this insecticide and essencial oils association on the larvicidal activity. It was evaluated too the influence of essencial oils on vector oviposition, when present on the posture sites. The larvicidal activity was assessed by dose-response tests, according to the methodology proposed by the World Health Organization. To evaluate the effect of essential oils associatiate with temephos, the larvicidal associations activity was compared with the temephos. The effect on oviposition behavior was evaluated comparing the number of eggs in laying sites containing essential oils in relation to the number of eggs in laying sites containing only water. The results demonstrated that essential oils had larvicidal activity in resistant and susceptible to temephos populations, being an alternative to resistance management. The association of temephos and essential oils had an antagonist ... / Mestre

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-08-13T13:13:43Z No. of bitstreams: 1 Efrain Naftali Lopes Soares.pdf: 1363404 bytes, checksum: 70c685c51c55f213e2bd66802f377933 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-13T13:13:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Efrain Naftali Lopes Soares.pdf: 1363404 bytes, checksum: 70c685c51c55f213e2bd66802f377933 (MD5) Previous issue date: 2018-02-16 / The arboviruses transmitted by Culicidae of the genus Aedes, Dengue (DENV), Chikungunya (CHIKV) and Zika virus (ZIKV), have recently been considered a major public health challenge. New monitoring methodologies for the knowledge of vulnerable areas for the transmission of arboviruses have been used and the oviposition traps (OVITRAMPAS) have been sensitive to the knowledge of these areas, associated with favorable conditions. The use of georeferencing through the construction of maps is another tool that allows visualizing the distribution, concentration and incidence of health problems. Therefore, the present work had as objective to know areas vulnerable to presence through the use of oviposition traps and georeferencing in the municipality of Agrestina, PE. For egg collection, oviposition traps were used in 35 georeferenced points, distributed in seven neighborhoods, as a biweekly collection, from May 2016 to April 2017. The climatic data of temperature, humidity and rainfall were correlated as the (IPO), Egg Density Index (IDO) and Vector Density Index (IDV) for the classification of areas between control, alert and risk. After these steps Kernel themed maps were constructed for the knowledge of the areas of greatest vector infestation. A total of 44,936 eggs were collected. Throughout the study period, the rates of infestation showed variations between control, alert and risk zones. Regarding the climatic factors, rain was the factor that contributed significantly to the vector infestation and through the thematic maps the spatial distribution of the areas of higher transmission to the arboviruses was verified. The oviposition traps, associated with the analysis of climatic factors, as well as the use of entomological indexes and the application of georeferencing tools, indicate good strategies for the knowledge of control of areas vulnerable to arbovirus transmission. / Os culicídeos do gênero Aedes, estão envolvidos na transmissão das arboviroses Dengue (DENV), a Chikungunya (CHIKV) e o Zika vírus (ZIKV) e ultimamente são consideradas um grande desafio para a saúde pública. Novas metodologias de monitoramento para o conhecimento de áreas vulneráveis para a transmissão das arboviroses vêm sendo utilizadas e as armadilhas de oviposição (OVITRAMPAS), tem se mostrado sensível ao conhecimento dessas áreas, associadas aos determinantes sociais em saúde. O uso do georreferenciamento, através da construção de mapas é outra ferramenta que permite visualizar, a distribuição, concentração e incidência dos agravos em saúde. Diante disso, o presente trabalho buscou estudar a distribuição espacial do Ae. aegypti no conhecimento de áreas vulneráveis para o controle vetorial e possibilidade de transmissão de arboviroses (Dengue Zika, Chikungunya) no município de Agrestina, Pernambuco. Para a coleta de ovos, utilizou-se armadilhas de oviposição em 35 pontos georreferenciados, distribuídos em sete pontos, com coleta quinzenal, no período de Maio de 2016 a Abril de 2017. Os dados climáticos de temperatura, umidade e pluviosidade foram coletados através da Agência Pernambucana de Águas e Climas (APAC) e Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA), sendo correlacionados com o número de ovos presentes nas ovitrampas e aplicados os índices entomológicos de Positividade de Ovitrampas (IPO), Índice de Densidade de Ovos (IDO) e o Índice de Densidade Vetorial (IDV) para a classificação das áreas entre, controle, alerta e risco. Após essas etapas foram construídos mapas temáticos de Kernel para o conhecimento das áreas de maior infestação vetorial. Foram coletados 44.936 ovos. Em todo período do estudo os índices de infestação apresentaram variações entre as zonas de controle, alerta e risco. No que se refere aos fatores climáticos, a umidade foi o fator que contribuiu de forma significativa para a infestação vetorial e através dos mapas temáticos verificou-se a distribuição espacial do Aedes aegypti. As armadilhas de oviposição, associada a análise dos fatores climáticos, bem como a utilização dos índices entomológicos e a aplicação das ferramentas de georreferenciamento, sinalizam boas estratégias para o conhecimento de controle de áreas vulneráveis a transmissão das arboviroses.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:05:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1800_1.pdf: 966444 bytes, checksum: ab2d1d73e5179a8e16442fa325514e9b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / A malária representa grave problema mundial de saúde pública. Estima-se sua incidência em 400 milhões de casos anuais principalmente nas regiões tropicais e subtropicais. Este projeto avaliou aspectos eco-epidemiológicos da malária em Roraima, onde há grande diversidade de ecossistemas naturais. Inicialmente é descrita a carta anofélica do estado, com 12 espécies identificadas e dos ecossistemas ocupados por elas. Em dois ecossistemas, floresta e savana, foram realizados testes imunológicos para determinar a prevalência de infecção em mosquitos adultos para identificar vetores locais. Uma área de estudo situa-se num projeto de assentamento na floresta tropical de alta transmissão de malária. A segunda encontra-se na beira da mata ciliar característica dos cursos hídricos da savana. Durante um ano, coletamos larvas e adultos de anofelinos, determinando e caracterizando criadouros potenciais; analisamos variações na densidade dos mosquitos, e estudamos a variação sazonal da idade das populações de mosquitos, duração do ciclo gonotrófico, capacidade de dispersão e horário de picada. Também calculamos curvas de sobrevivência e analisamos técnicas de determinação etária das espécies. Foi analisada a variação da distribuição das larvas ao longo do ano e sua resposta ao desmatamento. A prevalência de infecção em mosquitos adultos implicou An. albitarsis s.l., além de An. darlingi, como transmissor. As taxas de sobrevivência se correlacionaram bem com os registros da literatura, mesmo sendo estes discrepantes. Houve aumento da longevidade durante a estação seca na floresta, correlacionado com aumento da malária, e queda durante a época de chuvas. Houve diferenças na duração do ciclo gonotrófico de An. darlingi encontrado na floresta em comparação com o da savana. Formas imaturas de An. darlingi se agregaram próximo a residências, mas o desmatamento exerceu papel negativo sobre seus criadouros. Construções de reservas hídricas proporcionaram redutos para An. darlingi, permitindo sua sobrevivência durante a seca e transmissão de malária durante todo o ano, mas apenas nos seus arredores, devido à limitada dispersão da espécie em condições naturais. Observaram-se picos de densidade de An. darlingi e An. albitarsis s.l. no fim da estação seca, na floresta, e durante as chuvas, na savana. An. albitarsis s.l. na savana também apresentou aumento de densidade correlacionado com as chuvas. Esses dados foram correlacionados com os de densidade larvária e de paridade para criar um modelo de transmissão de malária distinto para dois locais com diferentes tipos de drenagem hídrica. Finalmente, descrevemos a ocorrência de um parasito de mosquitos sem relato prévio na América Latina, presumivelmente com efeitos deletérios sobre o desenvolvimento ovariano de fêmeas de An. darlingi

Orientador: Arício Xavier Linhares / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T23:41:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Franco_CarolineSiqueira_M.pdf: 1657929 bytes, checksum: 0b27568a919b921d3ae68ae3161f87fd (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A febre maculosa brasileira (FMB) é uma doença infecciosa aguda transmitida através da picada de carrapatos infectados com Rickettsia rickettsii Brumpt 1922. O carrapato Amblyomma cajennense Fabricius 1787 (Acari: Ixodidae) é um dos principais vetores no Brasil. Contudo, outras espécies de carrapatos podem ser vetores da doença e parasitar humanos. Neste estudo, procurou-se avaliar a competência vetorial de Ornithodoros mimon Kohls 1969 (Acari: Argasidae) em laboratório após ser infectado experimentalmente com a cepa Taiaçu de Rickettsia rickettsii, utilizando coelhos domésticos como modelo animal. Primeiramente, os carrapatos foram separados em grupos de acordo com seu estágio de desenvolvimento (larva, ninfa 2 e adulto). Na segunda etapa, dois coelhos foram utilizados como grupo tratamento, e foram inoculados com a Rickettsia, e um coelho foi usado como controle. Os carrapatos utilizados foram separados em lotes, de acordo com o coelho e dia em que foram alimentados. Na terceira etapa, novos coelhos sadios foram infestados com os carrapatos usados na segunda etapa, para verificar se houve transmissão. Carrapatos que tiveram contato com a bactéria foram macerados e inoculados em duas cobaias, e uma terceira cobaia foi infestada com carrapatos que foram alimentados em coelho infectado. PCR com os primers gltA e ompA (R. rickettsii), ftsZ (Wolbachia sp.), 28S (eucarioto) foi realizado, para avaliar se os carrapatos se tornaram infectados. Sequenciamento de amostras foram amplificadas com os primers ompA e 28S. Além da Reação de Imunofluorescência Indireta (RIFI), que foi realizada com o soro dos coelhos para verificar a presença de infecção. Os dois coelhos que foram inoculados com Rickettsia rickettsii apresentaram picos de febre. Um dos coelhos apresentou resultado positivo na RIFI e o outro morreu no décimo sexto dia após a inoculação. Os coelhos que foram infestados com carrapatos que foram alimentados em coelho infectado não apresentaram febre e nenhum outro sintoma da doença. As cobaias que foram inoculadas com carrapatos e a cobaia que foi infestada com carrapatos não demonstraram nenhum sintoma da doença. Das amostras amplificadas com o primer gltA apenas uma amostra foi positiva. A PCR das amostras de carrapatos usando o primer ompA não apresentou o resultado esperado, provavelmente devido a presença do DNA da bactéria Wolbachia sp. A sequência gerada, com amostras que foram amplificadas com o primer 28S, foi o DNA do carrapato. A PCR com o primer ftsZ não amplificou nenhum DNA. Portanto, conclui-se que O. mimon não se tornou infectado com a Rickettsia rickettsii, e não representa risco para a saúde pública / Abstract: The Brazilian Spotted Fever (BSF) is an acute infectious disease transmitted by the bite of ticks infected with Rickettsia rickettsii Brumpt 1922. The tick Amblyomma cajennense Fabricius 1787 (Acari: Ixodidae) is one of the main vectors in Brazil. However, other species of ticks can be vectors of this disease and parasitize humans. This study aimed to evaluate the vector competence of Ornithodoros mimon Kohls 1969 (Acari: Argasidae) in the laboratory after being experimentally infected with the Taiaçu strain of Rickettsia rickettsii, using domestic rabbits as the animal models. Firstly, the ticks were separated into groups according to their developmental stage (larva, nymph 2 and adult). Secondly, two rabbits were used as treatment group, and were inoculated with the Rickettsia, and one rabbit was used as control. The ticks were separated into batches according to the rabbit and the day they were fed. New healthy rabbits were infested with the ticks used in the second experiment, to verify the occurrence of transmission. Ticks that had contact with the bacteria were macerated and inoculated into two guinea pigs, and a third guinea pig was infested with ticks that were fed on infected rabbits. PCR with gltA e ompA primers (R. rickettsii), ftsZ (Wolbachia sp.), 28S (eukaryotic) was performed, to assess if the ticks become infected. Sequencing of the samples was amplified with the primers ompA and 28S. In addition, the Immunofluorescence Assay (IFA) was performed with serum of rabbits to verify the presence of infection. The two rabbits that were inoculated with Rickettsia rickettsii presented peaks of fever. One rabbit presented a positive result in the IFA and the other died on the sixteenth day after inoculation. The rabbits that were infested with ticks that were fed on infected rabbits, showed no fever and no other symptoms of the disease. The guinea pigs that were inoculated with ticks and the guinea pig that was infested with ticks showed no symptoms of the disease. Of the samples only one of all samples amplified with the primer gltA was positive. The PCR samples of ticks using the primer ompA did not yield the expected result, probably due to the presence of the DNA of the bacteria Wolbachia sp. The sequence generated, with samples that were amplified with the primer 28S, it was the DNA of the tick. PCR performed with the primer ftsZ did not amplify any DNA. Therefore, we concluded that O. mimon did not become infected with R. rickettsii, and do not represent risk to public health / Mestrado / Relações Antrópicas, Meio Ambiente e Parasitologia / Mestra em Biologia Animal

Em algumas regiões, como nos municípios de Corumbá e Ladário, no Estado de Mato Grosso do Sul, existem evidências ecológicas e epidemiológicas de que Lutzomyia (Lutzomyia) cruzi (Mangabeira, 1938) seja a principal responsável pela transmissão do protozoário Leishmania (Leishmania) infantum Nicolle, 1908 (ou subespécie de L. (L.) infantum chagasi Cunha & Chagas, 1937 segundo alguns autores), agente etiológico da leishmaniose visceral (LV). A ausência de Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis (Lutz & Neiva, 1912), principal vetor do parasito, reforçam esta hipótese. Este estudo teve por objetivo avaliar os parâmetros e estimar a capacidade vetorial de Lu. cruzi para L. (L.) infantum e Leishmania (Leishmania) amazonensis Lainson & Shaw, 1972. Para este último, apenas foram avaliados os parâmetros, sem a estimativa numérica da capacidade vetorial. A avaliação da capacidade vetorial foi realizada a partir de experimentos laboratoriais (infecção experimental) e de campo (atratividade aos flebotomíneos). Por intermédio da infecção experimental de Lu. cruzi pelo parasito, foi possível estimar a expectativa de sobrevida diária de fêmeas infectadas (estimativa vertical e laboratorial), avaliar o período de incubação extrínseco do parasita e obter duração do ciclo gonotrófico. Para a avaliação da competência vetorial do inseto, foram realizadas tentativas de transmissão experimental e natural de Leishmania, a partir de fêmeas provenientes de colônia cujos indivíduos foram alimentados durante o xenodiagnóstico e de fêmeas selvagens capturadas em campo, respectivamente. A distribuição sazonal de Lu. cruzi foi avaliada por meio da instalação semanal de armadilhas luminosas no peridomicílio de cinco residências na área urbana do Município de Corumbá. Variáveis meteorológicas obtidas junto ao Centro de Monitoramento do Tempo, do Clima e dos Recursos Hídricos de Mato Grosso do Sul, índices radiométricos calculado a partir de imagens de resolução espacial (GeoEye) e o percentual de cobertural vegetal foram utilizados neste estudo. Os resultados obtidos permitiram estimar a capacidade vetorial de Lu. cruzi para L. (L.) infantum, que foi de 0,24, ou seja, espera-se que a população de fêmeas da área produzam 0,24 novas infecções viii por dia de exposição de uma infecção. A competência vetorial de Lu. cruzi para L. (L.) infantum e L. (L.) amazonensis, via picada, foi demonstrada por meio de transmissão natural e experimental dos parasitos, respectivamente. Também foi identificada a infecção natural de Lu. cruzi por L. (L.) amazonensis. Com relação à distribuição mensal, embora não tenha sido observada a presença de associação entre essas espécies e as variáveis ambientais de vegetação e clima, foi possível observar picos elevados populacionais na estação chuvosa e picos menores na estação seca. O padrão da distribuição sazonal das espécies de flebotomíneos demonstrado neste estudo foi determinado basicamente pelos espécimes de Lu. cruzi capturados, uma vez que eles representam 93,94 por cento . A variação mensal demonstrou que a espécie Lu. cruzi tem grande plasticidade, tendo sido observada em todos os meses de coleta. / In some regions such as in the municipalities of Corumbá and Ladário in Mato Grosso do Sul state, there are ecological and epidemiological evidence that Lutzomyia (Lutzomyia) cruzi (Mangabeira, 1938) is the vector of Leishmania (Leishmania) infantum Nicolle, 1908 (or subspecies of L. (L.) infantum chagasi Cunha & Chagas, 1937 according to some authors), the etiologic agent of visceral leishmaniasis (VL). The absence of Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis (Lutz & Neiva, 1912), the main vector of the parasite, supports this hypothesis. This study aimed to evaluate the parameters and estimate the vectorial capacity of Lu. cruzi for L. (L.) infantum and Leishmania (Leishmania) amazonensis Lainson & Shaw, 1972. For the latter, only parameters was evaluated without numerical estimation of the vectorial capacity. The evaluation of the vectorial capacity was carried out from laboratory experiments (experimental infection) and field (attractiveness to sandflies). Through experimental infection by the parasite, it was possible to estimate the expected daily survival of infected females (vertical and laboratory estimate), evaluate the extrinsic incubation period of the parasite and get the length of gonotrophic cycle. To evaluate the insect vector competence, attempts have been made of experimental and natural transmission of Leishmania from females from colony whose subjects were fed for xenodiagnosis and wild females captured in the field, respectively. Monthly and seasonal distribution of Lu. cruzi was evaluated by weekly installation of light traps in the peridomicile of five residences in the urban area of the Municipality of Corumbá. Meteorological variables obtained from the Weather Monitoring Center, Climate and Water of Mato Grosso do Sul Resources, radiometric indices calculated from spatial resolution images (GeoEye) and the percentage of plant cobertural were used in this study. Results allowed estimating the vectorial capacity of Lu. cruzi for L. (L.) infantum, which was 0.24, i.e., it is expected that the female population in the region produce 0.24 new infections per day of exposure to an infection. Vector competence of Lu. cruzi for L. (L.) infantum and L. (L.) amazonensis by biting, was demonstrated by natural and experimental transmission of both parasites, respectively. Natural infection of Lu. cruzi by L. (L.) amazonensis was identified. Regarding the monthly x distribution, there was no significant association between of sandflies and the environmental and climate variables. It was observed high peaks population in the rainy season and lower peaks in the dry season. The pattern of seasonal distribution of species of sand flies demonstrated in this study was determined primarily by Lu. cruzi specimens, since this species represent 93.94 per cent of the total captured. The monthly change showed that Lu. cruzi species has great plasticity and has been observed in all months of collection.

Em algumas regiões, como nos municípios de Corumbá e Ladário, no Estado de Mato Grosso do Sul, existem evidências ecológicas e epidemiológicas de que Lutzomyia (Lutzomyia) cruzi (Mangabeira, 1938) seja a principal responsável pela transmissão do protozoário Leishmania (Leishmania) infantum Nicolle, 1908 (ou subespécie de L. (L.) infantum chagasi Cunha & Chagas, 1937 segundo alguns autores), agente etiológico da leishmaniose visceral (LV). A ausência de Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis (Lutz & Neiva, 1912), principal vetor do parasito, reforçam esta hipótese. Este estudo teve por objetivo avaliar os parâmetros e estimar a capacidade vetorial de Lu. cruzi para L. (L.) infantum e Leishmania (Leishmania) amazonensis Lainson & Shaw, 1972. Para este último, apenas foram avaliados os parâmetros, sem a estimativa numérica da capacidade vetorial. A avaliação da capacidade vetorial foi realizada a partir de experimentos laboratoriais (infecção experimental) e de campo (atratividade aos flebotomíneos). Por intermédio da infecção experimental de Lu. cruzi pelo parasito, foi possível estimar a expectativa de sobrevida diária de fêmeas infectadas (estimativa vertical e laboratorial), avaliar o período de incubação extrínseco do parasita e obter duração do ciclo gonotrófico. Para a avaliação da competência vetorial do inseto, foram realizadas tentativas de transmissão experimental e natural de Leishmania, a partir de fêmeas provenientes de colônia cujos indivíduos foram alimentados durante o xenodiagnóstico e de fêmeas selvagens capturadas em campo, respectivamente. A distribuição sazonal de Lu. cruzi foi avaliada por meio da instalação semanal de armadilhas luminosas no peridomicílio de cinco residências na área urbana do Município de Corumbá. Variáveis meteorológicas obtidas junto ao Centro de Monitoramento do Tempo, do Clima e dos Recursos Hídricos de Mato Grosso do Sul, índices radiométricos calculado a partir de imagens de resolução espacial (GeoEye) e o percentual de cobertural vegetal foram utilizados neste estudo. Os resultados obtidos permitiram estimar a capacidade vetorial de Lu. cruzi para L. (L.) infantum, que foi de 0,24, ou seja, espera-se que a população de fêmeas da área produzam 0,24 novas infecções viii por dia de exposição de uma infecção. A competência vetorial de Lu. cruzi para L. (L.) infantum e L. (L.) amazonensis, via picada, foi demonstrada por meio de transmissão natural e experimental dos parasitos, respectivamente. Também foi identificada a infecção natural de Lu. cruzi por L. (L.) amazonensis. Com relação à distribuição mensal, embora não tenha sido observada a presença de associação entre essas espécies e as variáveis ambientais de vegetação e clima, foi possível observar picos elevados populacionais na estação chuvosa e picos menores na estação seca. O padrão da distribuição sazonal das espécies de flebotomíneos demonstrado neste estudo foi determinado basicamente pelos espécimes de Lu. cruzi capturados, uma vez que eles representam 93,94 por cento . A variação mensal demonstrou que a espécie Lu. cruzi tem grande plasticidade, tendo sido observada em todos os meses de coleta. / In some regions such as in the municipalities of Corumbá and Ladário in Mato Grosso do Sul state, there are ecological and epidemiological evidence that Lutzomyia (Lutzomyia) cruzi (Mangabeira, 1938) is the vector of Leishmania (Leishmania) infantum Nicolle, 1908 (or subspecies of L. (L.) infantum chagasi Cunha & Chagas, 1937 according to some authors), the etiologic agent of visceral leishmaniasis (VL). The absence of Lutzomyia (Lutzomyia) longipalpis (Lutz & Neiva, 1912), the main vector of the parasite, supports this hypothesis. This study aimed to evaluate the parameters and estimate the vectorial capacity of Lu. cruzi for L. (L.) infantum and Leishmania (Leishmania) amazonensis Lainson & Shaw, 1972. For the latter, only parameters was evaluated without numerical estimation of the vectorial capacity. The evaluation of the vectorial capacity was carried out from laboratory experiments (experimental infection) and field (attractiveness to sandflies). Through experimental infection by the parasite, it was possible to estimate the expected daily survival of infected females (vertical and laboratory estimate), evaluate the extrinsic incubation period of the parasite and get the length of gonotrophic cycle. To evaluate the insect vector competence, attempts have been made of experimental and natural transmission of Leishmania from females from colony whose subjects were fed for xenodiagnosis and wild females captured in the field, respectively. Monthly and seasonal distribution of Lu. cruzi was evaluated by weekly installation of light traps in the peridomicile of five residences in the urban area of the Municipality of Corumbá. Meteorological variables obtained from the Weather Monitoring Center, Climate and Water of Mato Grosso do Sul Resources, radiometric indices calculated from spatial resolution images (GeoEye) and the percentage of plant cobertural were used in this study. Results allowed estimating the vectorial capacity of Lu. cruzi for L. (L.) infantum, which was 0.24, i.e., it is expected that the female population in the region produce 0.24 new infections per day of exposure to an infection. Vector competence of Lu. cruzi for L. (L.) infantum and L. (L.) amazonensis by biting, was demonstrated by natural and experimental transmission of both parasites, respectively. Natural infection of Lu. cruzi by L. (L.) amazonensis was identified. Regarding the monthly x distribution, there was no significant association between of sandflies and the environmental and climate variables. It was observed high peaks population in the rainy season and lower peaks in the dry season. The pattern of seasonal distribution of species of sand flies demonstrated in this study was determined primarily by Lu. cruzi specimens, since this species represent 93.94 per cent of the total captured. The monthly change showed that Lu. cruzi species has great plasticity and has been observed in all months of collection.

[pt] Nos últimos anos, vários mecanismos permitem medir campos vetoriais reais, provendo uma compreensão melhor de fenômenos importantes, tais como dinâmica de fluidos ou movimentos de fluido cerebral. Isso abre um leque de novos desafios a visualização e análise de campos vetoriais em muitas aplicações de engenharia e de medicina por exemplo. Em particular, dados reais são geralmente corrompidos por ruído, dificultando a compreensão na hora da visualização. Esta informação necessita de uma etapa de remoção de ruído como pré-processamento, no entanto remoção de ruído normalmente remove as descontinuidades e singularidades, que são fundamentais para a análise do campo vetorial. Nesta dissertação é proposto um método inovador para remoção de ruído em campo vetorial baseado em caminhadas aleatórias que preservam certas descontinuidades. O método funciona em um ambiente desestruturado, sendo rápido, simples de implementar e mostra um desempenho melhor do que a tradicional técnica Gaussiana de remoção de ruído. Esta tese propõe também uma metodologia semi-automática para remover ruído, onde o usuário controla a escala visual da filtragem, levando em consideração as mudanças topológicas que ocorrem por causa da filtragem. / [en] In recent years, several devices allow to measure real vector fields, leading to a better understanding of fundamental phenomena such as fluid dynamics or brain water movements. This gives vector field visualization and analysis new challenges in many applications in engineering and in medicine. In particular real data is generally corrupted by noise, puzzling the understanding provided by visualization tools. This data needs a denoising step as preprocessing, however usual denoising removes discontinuities and singularities, which are fundamental for vector field analysis. In this dissertation a novel method for vector field denoising based on random walks is proposed which preserves certain discontinuities. It works in a unstructured setting; being fast, simple to implement, and shows a better performance than the traditional Gaussian denoising technique. This dissertation also proposes a semi-automatic vector field denoising methodology, where the user visually controls the filtering scale by validating topological changes caused by classical vector field filtering.

Introdução: A leishmaniose visceral (LV) é um importante problema de saúde pública no Brasil, com cerca 3000 mil casos notificados anualmente. Nos últimos anos, a LV tem ampliado sua distribuição em vários estados do país, associada principalmente aos processos socioambientais, antrópicos e migratórios. A LV é causada pela infecção com Leishmania infantum chagasi, transmitida, principalmente, por Lutzomyia longipalpis (Diptera: Psychodidae). Este flebotomíneo apresenta ampla distribuição nas Américas, todavia, evidências sugerem que se constitui em um complexo de espécies crípticas. A dinâmica de transmissão da LV é modulada por fatores ecológicos locais que influenciam a interação entre populações do patógeno, do vetor e dos hospedeiros vertebrados. Portanto, o estudo das variáveis associadas a esta interação pode contribuir para elucidar aspectos dos elos epidemiológicos e contribuir para a tomada de decisões em saúde pública. Objetivo: Avaliar parâmetros relacionados à capacidade vetorial da população de Lu. longipalpis presente em área urbana do município de Panorama, estado de São Paulo. Métodos: Foram realizadas capturas mensais durante 48 meses para avaliar a distribuição espaço-temporal de Lu. longipalpis e investigar a circulação de Le. i. chagasi. Também foram realizados os seguintes experimentos com o vetor: captura-marcação-soltura-recaptura para estimar a sobrevida da população e a duração do seu ciclo gonotrófico, a atratividade dos hospedeiros mais frequentes em áreas urbanas, a proporção de repasto em cão, infecção experimental e competência vetorial. Resultados: Observou-se que no município de Panorama, Lu. longipalpis apresentou as frequências mais elevadas na estação chuvosa (entre outubro e março), maior densidade em áreas com presença de vegetação e criação de animais domésticos, locais aonde também foi demonstrada a circulação natural de espécimes de Lu. longipalpis infectados com Le. i. chagasi. Além disto, foi corroborado que a população de Lu. longipalpis apresentou hábito hematofágico eclético, altas taxas de sobrevivência e que foi competente para transmitir o agente da LV. Nos experimentos de laboratório foi evidenciada a heterogeneidade na infecção de fêmeas de Lu. longipalpis desafiadas a se alimentarem em cães comprovadamente infectados por L. i. chagasi e o rápido desenvolvimento do parasita neste vetor natural. Conclusões. As observações do presente estudo corroboram a capacidade vetora de Lu. longipalpis para transmitir a Le. i. chagasi e ressaltam a importância da espécie na transmissão do agente etiológico da LV. Ações de manejo ambiental, educação e promoção à saúde são recomendadas às autoridades municipais para diminuir o risco potencial de infecção na população humana e canina, considerando-se o elevado potencial vetor de Lu. longipalpis e a presença de condições que favorecem a interação dos componentes da tríade epidemiológica da LV. / Introduction: Visceral leishmaniasis (VL) is an important public health problem in Brazil, where annually about 3000 cases are notified. In the later years VL has spread through some states, associated mainly to environmental, anthropic and migratory process. Visceral leishmaniasis is caused by the infection with Leishmania infantum chagasi transmitted by the sand fly species Lutzomyia longipalpis (Diptera: Psychodidae). This species have a broad distribution in the Americas, however, there are evidences suggesting that it constitutes a cryptic species complex. The VL transmission dynamic is modulated by focal ecological factors that influence the pathogen-vector-host interactions. Thus, the analyses of variables associated to this interaction could contributes to elucidate the epidemiological links and to the public health decision-making. Objective: To evaluate parameters related to the vectorial capacity of Lutzomyia longipalpis in the Panorama municipality, São Paulo state, Brazil. Methods: Monthly captures of sand flies were undertaken during 48 months to evaluate the spatial and temporal distribution of Lu. longipalpis and its natural infection with Le. i. chagasi. Experiments of capture-mark-release-recapture to estimate the population survival, the gonotrophic cycle duration and the attractiveness of the most frequent host to Lu. longipalpis were also performed. Additionally experiments to evaluate the blood feeding rate of Lu. longipalpis on dog, experimental infection and the vectorial competence were undertaken. Results: In the Panorama municipality, Lu. longipalpis presents the highest frequencies during the rainy season (October - March) with high densities in areas with vegetation near to the domiciles and with the animal husbandry. In this areas was also demonstrated the circulation of sand flies naturally infected with Le. i. chagasi. Besides, it was corroborated that Lu. longipalpis presents eclectic haematophagic habit, high survival rates and it is competent to transmit Le. i. chagasi. It was also observed the heterogeneity of the female infection rates after them take the blood meal on infected dogs and a short time to complete the extrinsic incubation period. Conclusions: the observations of this study corroborate the vectorial capacity of Lu. longipalpis and reinforce the epidemiological importance of this species in the transmission of Le. i. chagasi. Considering the high vectorial efficiency of Lu. longipalpis and the presence of conditions favoring the interaction of the VL ecological components (competent vectors, infected hosts and susceptible humans), environmental management as well as educational and health promotion measures are recommended to the municipality authorities to reduce the potential risk of human infections.