Leptospirosis is a zoonosis of worldwide occurrence, with a large distribution and significant social, economic and health impact, high incidence and significant percentage of hospitalizations, and complementary, high lethality. Objective: To analyze the temporal trend of the incidence of leptospirosis according to the rainfall indices in the State of Santa Catarina, according to seasonality, from 2005 to 2015. Methods: Ecological study of time series, considering the prevalence of leptospirosis, rainfall indices and the demographic density, between 01/01/2005 and 12/31/2015. The information was obtained from the DATASUS, ANA/CIRAM and IBGE databases. Leptospirosis incidence rates, relative incidence excess, Pearson correlation coefficient, angular coefficient from the linear regression adjustment, and the significance level of 5%, were performed. The distribution of leptospirosis cases, rainfall indexes, rainfall cases / index ratios, stratified by month of occurrence was presented. Results: There were 5,274 cases of leptospirosis, with an annual average of 479 cases, ranging from 341 (2013) to 982 (2008). The monthly average in the period was 439 cases, ranging from 211 in August to 770 in January. The mean rate of leptospirosis in the period was 7.03 cases per 100 thousand habitants. The average rainfall index for the period was 158.68 mm, varying from 111.46 mm (2006) to 196.97 mm (2015). The lowest indexes were detected in August, with a mean of 124.9mm, the highest occurring in January, with a mean of 213,20mm. A positive correlation between leptospirosis rates and rainfall levels over the period from January to December (r = 0.68, p = 0.023) points to a positive temporal association between rainfall and disease cases. Conclusion: The disease occurred throughout the year and presented a clear seasonality. The highest pluviometric indexes occurred in the months of October to March. The analysis of the temporal trend of the incidence of leptospirosis in the State of Santa Catarina verified that the disease acquires an epidemic character, associated to the period of greatest rainfall. / Submitted by João Ghizzo Filho (joao.ghizzo@unisul.br) on 2017-11-07T19:17:57Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TRABALHO 2.pdf: 3428725 bytes, checksum: 920185acbf0783a30bcf0e9e077da798 (MD5) / Rejected by Caroline Correa da Cruz (caroline.cruz@unisul.br), reason: Está faltando a ficha catalográfica na versão final do trabalho, bem como a informação da linha de pesquisa na folha de rosto do trabalho (segunda página). Qualquer dúvida estamos à disposição. on 2017-11-08T10:05:51Z (GMT) / Submitted by João Ghizzo Filho (joao.ghizzo@unisul.br) on 2017-12-12T19:22:41Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TRABALHO_final_12_12_2017.pdf: 2474041 bytes, checksum: ed5a184214c1118b415c189ad0ae9bfd (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Correa da Cruz (caroline.cruz@unisul.br) on 2017-12-13T11:32:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TRABALHO_final_12_12_2017.pdf: 2474041 bytes, checksum: ed5a184214c1118b415c189ad0ae9bfd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-13T11:32:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TRABALHO_final_12_12_2017.pdf: 2474041 bytes, checksum: ed5a184214c1118b415c189ad0ae9bfd (MD5) Previous issue date: 2017 / A leptospirose é uma zoonose de ocorrência mundial, com ampla distribuição e significativo impacto social, econômico e sanitário, alta incidência, com percentual significativo de internações, e alta letalidade. Objetivo: Analisar a tendência temporal da incidência de leptospirose, de acordo com os índices pluviométricos no Estado de Santa Catarina, conforme a sazonalidade, no período de 2005 a 2015. Métodos: Estudo ecológico de séries temporais, com dados sobre leptospirose, índices pluviométricos e a população do Estado, entre 01/01/2005 e 31/12/2015. As informações foram obtidas dos bancos de dados do DATASUS, ANA/CIRAM e IBGE. Analisadas as taxas de incidência de leptospirose, o excesso relativo da incidência, o coeficiente de correlação de Pearson (r), o coeficiente angular (β), a partir do ajuste da regressão linear, e o nível de significância de 5% (p<0,05). Foi apresentada a distribuição dos casos de leptospirose, dos índices pluviométricos, da razão casos/índices pluviométricos, estratificados por mês de ocorrência. Resultados: Foram registrados 5.274 casos de leptospirose, com média anual de 479 casos, variando de 341(2013) a 982 (2008). A média mensal no período foi de 439 casos, com variação de 211, nos meses de agosto, a 770, nos meses de janeiro. A taxa média de leptospirose no período foi de 7,03 casos por 100 mil habitantes. O índice pluviométrico médio para o período foi de 158,68 mm, tendo variado de 111,46 mm (2006) a 196,97 mm (2015). Os índices mais baixos foram detectados nos meses de agosto, com média de 124,9 mm, os mais elevados ocorreram nos meses de janeiro, com média de 213,20 mm. Uma correlação positiva entre as taxas de leptospirose e os níveis pluviométricos, ao longo do período, janeiro a dezembro (r=0,68; p=0,023), aponta para uma associação temporal positiva entre quantidade de chuva e casos de doença. Conclusão: A doença ocorreu o ano todo e apresentou nítida sazonalidade. Os maiores índices pluviométricos ocorreram nos meses de outubro a março. A análise da tendência temporal da incidência de leptospirose no Estado de Santa Catarina verificou que a doença adquire um caráter epidêmico, no período de maior pluviosidade.

Submitted by Alexandre Sousa (alexandre.sousa@incqs.fiocruz.br) on 2014-11-13T16:54:59Z No. of bitstreams: 1 Mestrado_Liliane.pdf: 3975589 bytes, checksum: b28cad812013dd5908acfaa1941f39a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-13T16:54:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mestrado_Liliane.pdf: 3975589 bytes, checksum: b28cad812013dd5908acfaa1941f39a0 (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Programa de Pós-Graduação em Vigilância Sanitária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Corynebacterium ulcerans têm sido cada vez mais responsáveis por quadros de difteria zoonótica, além de outras infecções de humanos e de animais de companhia, incluindo cães. Uma vez que animais de companhia assintomáticos são capazes de transmitir o patógeno para os humanos em áreas urbanas e que escassas são as investigações sobre o potencial de virulência e o relato de casos dessas zoonoses em países em desenvolvimento, nesse sentido o presente estudo teve como objetivo o isolamento, caracterização e avaliação do potencial de virulência de amostras de C. ulcerans oriundas de animais domésticos domiciliados na área metropolitana do Rio de Janeiro. Os dados indicaram a presença de C. ulcerans em diferentes municípios. Além de humanos e de animais de abrigo, foram isoladas amostras não produtoras de toxina diftérica de cães assintomáticos domiciliados. As amostras isoladas (BR-AD41 e BR-AD61) apresentaram moderada sensibilidade a penicilina G e resistência a clindamicina. Os sistemas de fenotipagem Api-Coryne e Vitek 2 não permitiram a correta identificação de C. ulcerans em algumas oportunidades. Os microrganismos foram inicialmente caracterizados quanto à espécie e a presença do gene tox pela técnica de PCR multiplex. A confirmação do diagnóstico foi feita pelo sequenciamento dos genes 16S rRNA e rpoB. A relação genética entre amostras isoladas de humanos e cães assintomáticos no Rio de Janeiro (Brasil) foram analisadas pela técnica de eletroforese de campo pulsado (PFGE). Dentre os cinco pulsotipos demonstrados, os perfis IV e V exibindo ≥85% de similaridade foram expressos pelas amostras BR-AD41 e BR-AD61 de cães residentes em um mesmo município. A heterogeneidade dos pulsotipos indicaram endemicidade de C. ulcerans no Rio de Janeiro. Independente da capacidade de produção de toxina diftérica, o potencial de virulência para humanos de amostras de C. ulcerans foi evidenciado pela habilidade de produzir biofilme em superfícies abióticas inclusive catéteres de poliuretano e a presença de gene rpb que codifica a toxina Shiga-like. C. ulcerans mostrou capacidade de aderir, invadir e sobreviver no interior de células epiteliais humanas em níveis variados, independente da presença de TD. Adicionalmente, a afinidade de C. ulcerans ao fibrinogênio (Fbg), fibronectina (Fn) e colágeno tipo I de humanos e a capacidade de causar rede de fibrina e lesões cutâneas em murinos foram também demonstradas. Concluindo, potencial patogênico de natureza multifatorial foi demonstrado para amostras de C. ulcerans que também podem ser encontradas colonizando a população de cães domiciliados e portanto em contato estreito com o homem na região metropolitana do Rio de Janeiro. / Corynebacterium ulcerans have been increasingly responsible for zoonotic diphtheria and other infections in humans and companion animals, including dogs. Since asymptomatic pets are able to transmit the pathogen to humans in urban areas and there are few investigations about virulence factors and case reports of this emerging zoonosis in development countries, this study aimed the isolation, identification and detection of candidate virulence factors of C. ulcerans isolates from domestic animals living in the metropolitan area of Rio de Janeiro. Data indicated the ocurrence of C. ulcerans in different cities. Besides humans and dog shelter, sample of non-toxigenic isolates were detected from asymptomatic companion dogs. The isolates (BR-AD41 e BR-AD61) showed moderate susceptibility to penicillin G and resistance to clindamycin. In some cases, a correct identification of C. ulcerans by the phenotypic assays API-Coryne and Vitek 2 was not conceivable. Species and toxigenicity of micro-organisms were initially characterized by a multiplex PCR assay. The diagnoses confirmation was made by 16S rRNA and rpoB genes sequencing. The genetic relationship between human and asymptomatic dogs isolates was analyzed by pulsed-fiel gel electrophoresis (PFGE) assay. Among the five types classified, the types IV and V exhibited similarity ≥85% and were expressed by BR-AD41 and BR-AD61 isolates of companion dogs living in the same neighborhood. Heterogeneity of PFGE types indicated endemicity of C. ulcerans in Rio de Janeiro metropolitan area. Despite the ability of diphtheria toxin (DT) production, the virulence potential of C. ulcerans to humans was demonstrated by biofilm formation over abiotic surfaces, including polyurethane catheter and by the presence of rpb gene coding Shiga-like. Moreover, C. ulcerans demonstrated the ability to adhere to and survive within human epithelial cells at various levels, despite DT production. C. ulcerans affinity to human fibrinogen (Fbg), fibronectin (Fn) and type I collagen and formation of fibrinous skin lesions in mice were also observed. In conclusion, a multifactorial nature of the pathogenic potential was also demonstrated for C. ulcerans colonizing companion dogs in close contact to humans in the Rio de Janeiro metropolitan area.

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

A raiva bovina continua sendo uma importante zoonose. A ocorrência de casos confirmados da doença no meio rural é um problema atual de saúde pública, sendo mais relevante quando se consideram os casos de raiva huma na que ocorreram nos últimos anos no país. Este projeto teve por objetivo estudar a situação da raiva bovina no município de Guaxupé - MG, consideran do: a presença do morcego hematófago no município; o nível de conhecimento dos produtores/empregados rurais sobre a raiva; a vacinação contra a raiva bovina; a notificação de casos da doença junto ao Instituto Mineiro Agro pecuário (IMA); os casos confirmados de raiva animal. Quanto à metodologia, fo ram realizados: um levantamento de dados secundários junto ao IMA e junto à Vigilância Epidemiológica da Gerência Regional de Alfenas - MG, da qual faz parte o município de Guaxupé; a apli cação de um questionário sobre a raiva bovina junto a uma amostra de produtores/empregados rurais do município. Foi feita uma estratificação da amostra em dois grupos, sendo o questionário aplicado em 35 pequenas e médias propriedades e em cinco grandes propriedades. De acordo com os dados do IMA, durante o período de 1999 a 2003, foram realizados 34 exames laboratoriais para diagnóstico da raiva, entre eles, 10 foram conside rados positivos, sendo oito da espécie bovina e dois da espécie eqüina. Com relação ao conhecimento de produto res/empregados rurais sobre a raiva, constatou-se que 74,3% consideram o veterinário como uma importante fonte de informação; 85% procuram o veterinário se houver um animal doente; 97,5% conhecem a importância da vacinação; 72,5% indicaram a salivação aumentada do animal como sintoma característico da doença; 58,3% indicaram o carbúnculo como doença que se confunde com a raiva; 90,0% afirmaram ser o morcego hematófago o transmissor da doença; 57,1% afirma ram aplicar algum tipo de produto em mordeduras por morcegos; 92,5% afirmaram ter conhecimento da presen ça do morcego em sua propriedade; 17,5% afirmaram ter tido caso confirmado de raiva na propriedade; 53% apontaram galpões de secador de café como abrigo para os morcegos; 90% afirmaram vacinar o rebanho durante as campanhas de vacinação. Com relação aos dados da Vigilância Epidemiológica, entre os anos de 2000 e 2006, ocorreram 587 casos de agressão por animais no município de Guaxupé. Desses casos, 24,3% ocorreram com crianças de até nove anos de idade; 91,5% ocorreram na zona urbana; 82,9% dos ferimentos foram por mordedura; 49,0% foram nas mãos; em 78,2% dos casos a espécie agressora era a canina; ocorreu apenas um caso de raiva canina com diagnós tico laboratorial e quatro casos de raiva animal com diagnóstico clínico. Esses estudos permitiram concluir que ainda é atual a necessidade de manter todas as ações que visam o controle da raiva, especialmente a vacinação; é importante a realização de um trabalho de consci entização com relação aos casos de agressão por animais, especialmente os cães. / Bovine rabies continues to be an important zoonosis. The occurrence of confirmed cases of the disease in the rural environment is a current public health problem, which is even more relevant when the cases of human rabies that occurred in the last few years are considered. The objective of the present project was to study the situation of bovine rabies in the municipality of Guaxupé - MG, on the basis of the presence of blood-sucking bats in the municipality, the level of knowledge of rural producers/employe es about rabies, the vaccination against bovine rabies, the notification of cases of the disease to the \"Instituto Mineiro Agropecuário\" (IMA), and the confirmed cases of animal rabies. The methodology consisted of a survey of secondary data at IMA and at the Epidemiological Surveillance of the Regional Management of Alfenas - MG, to which the municipality of Guaxupé belongs, and the application of a questionnaire about bovine rabies to a sample of rural producers/employees of the municipality. The sample was stratified into two groups, with the questionnaire being applied to 35 small and medium-sized properties and to 05 large properties. According to IMA data, 34 laboratory exams for the diagnosis of rabies were performed during the period from 1999 to 2003. Of these, 10 were considered to be positive, 08 of them involving cattle and 02 involving horses. Regarding the knowledge of rural producers/employe es about rabies, 74.3% were found to consider the veterinary to be an impor tant source of information; 85% called a veterinary when an animal was sick, 97.5% were aware of the importance of vaccination, 72.5% indicated that incre ased animal salivation is a characteristic symptom of the disease, 58.3% indica ted that carbuncle is a disease often confused with rabies, 90.0% stated that blood-sucking bats are the transmitters of the disease, 57.1% stated that they applied some type of product to bat bites, 92.5% stated that they were aware of the presence of bats on their property, 17.5% stated that they had a confirmed case of rabies on their property, 53% pointed out that coffee-drying barns are a shelter for bats, and 90% stated that they vaccinated the herd during vaccination campaigns. Regarding the data of Epidemiological Surveillance, 587 cases of aggression by animals occurred between 2000 and 2006 in the municipality of Guaxupé. Of these, 24.3% involved children up to 09 years of age, 91.5% occurred in the urban zone, 82.9% of the wounds were bites, 49.0% were in the hands, in 78.2% of cases the aggressing species was the canine one, and there was only one case of canine rabies with a laboratory diagnosis, plus 04 cases of animal rabies with a clinical diagnosis. These studies led to the conclusion that there still is the need to maintain all actions aiming at the control of rabies, especially vaccination, and that it is important to conduct awareness-raising work regarding cases of aggression by animals, especially dogs.

Orientador: Simone Baldini Lucheis / Resumo: A leptospirose é uma zoonose de grande impacto mundial na saúde animal e saúde pública. Esta doença tem como agente infeccioso as espiroquetas do gênero Leptospira spp., com espécies patogênicas e não patogênicas. Em animais de produção como os bovinos o quadro clínico manifesta-se geralmente com falhas reprodutivas, como abortos e infertilidade, ocasionando prejuízo econômico nas fazendas, além de representar risco à saúde dos trabalhadores que lidam direta ou indiretamente com os animais. Com o intuito de avaliar o estado sanitário da leptospirose nos bovinos reprodutores de centrais de receptoras de embrião e fazendas de cria da região de Bauru, foram analisadas 400 amostras de sangue e soro destes animais mediante os seguintes testes diagnósticos: cultura em meio de Fletcher, técnica de Soroaglutinação Microscópica (SAM) e Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR). Os resultados indicaram todas as culturas negativas à visualização de formas espiroquetideas. Porém, a análise sorológica mediante SAM, indicou soroprevalência de 83% (331/400); sendo que o sorovares mais frequentes pertencem ao sorogrupo Sejroe (Hardjoprajitno (71,6%), HardjoCTG (62,8%), Wolffi (60,1%) e Hardjo (45,6%). Á PCR de sangue, encontraram-se três (0,7%, 3/400) animais positivos, os quais foram negativos à SAM, indicando estarem na fase aguda da doença. À PCR do sêmen, encontraram-se três (8,1%, 3/37) animais positivos, indicando a probabilidade de transmissão sexual de leptospirose nas fazendas de cria.... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Leptospirosis is a worlwide zoonosis of great impact in animal and public health. The etiological agent of this disease are spirochetes of genus Leptospira spp., classified in pathogenic and nonpathogenic species. In farm animals, such as cattle, the clinical presentation involves reproductive failure, like abortion and infertility, causing economical loses in farms, furthermore represents a health risk for workers who keep direct or indirect contact with these animals. Aiming to evaluate the sanitary state of leptospirosis in reproductive cattle of enbryo receptors centers and meet cattle farms of Bauru, 400 blood samples were analysed with three diagnostic tests: Cultured in Fletcher medium, Microagglutination test (MAT) and Polymerase Chain Reaction (PCR). Results shown all cultures negative to visualization of spirochetes forms. However, serological analysis indicated a prevalence of 83% (331/400), with greater frequency of serovars from serogroup Sejroe (Hardjoprajitno (71.6%), HardjoCTG (62.8%) and Hardjo (45. 6%)). Blood PCR showed three (0.7%, 3/400) positive animals, who were also negative to MAT, concluding they were in the acute phase of the disease. PCR of semen showed three (8.1%, 3/37) positive animals, suggesting the chance of leptospirosis´ sexual transmission in the meet farms evaluated. High percentage of positive animals to serogroup Sejroe in MAT, as to the high titles observed, showed concordance to several other studies performed in cattle from Brazil a... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

A raiva bovina continua sendo uma importante zoonose. A ocorrência de casos confirmados da doença no meio rural é um problema atual de saúde pública, sendo mais relevante quando se consideram os casos de raiva huma na que ocorreram nos últimos anos no país. Este projeto teve por objetivo estudar a situação da raiva bovina no município de Guaxupé - MG, consideran do: a presença do morcego hematófago no município; o nível de conhecimento dos produtores/empregados rurais sobre a raiva; a vacinação contra a raiva bovina; a notificação de casos da doença junto ao Instituto Mineiro Agro pecuário (IMA); os casos confirmados de raiva animal. Quanto à metodologia, fo ram realizados: um levantamento de dados secundários junto ao IMA e junto à Vigilância Epidemiológica da Gerência Regional de Alfenas - MG, da qual faz parte o município de Guaxupé; a apli cação de um questionário sobre a raiva bovina junto a uma amostra de produtores/empregados rurais do município. Foi feita uma estratificação da amostra em dois grupos, sendo o questionário aplicado em 35 pequenas e médias propriedades e em cinco grandes propriedades. De acordo com os dados do IMA, durante o período de 1999 a 2003, foram realizados 34 exames laboratoriais para diagnóstico da raiva, entre eles, 10 foram conside rados positivos, sendo oito da espécie bovina e dois da espécie eqüina. Com relação ao conhecimento de produto res/empregados rurais sobre a raiva, constatou-se que 74,3% consideram o veterinário como uma importante fonte de informação; 85% procuram o veterinário se houver um animal doente; 97,5% conhecem a importância da vacinação; 72,5% indicaram a salivação aumentada do animal como sintoma característico da doença; 58,3% indicaram o carbúnculo como doença que se confunde com a raiva; 90,0% afirmaram ser o morcego hematófago o transmissor da doença; 57,1% afirma ram aplicar algum tipo de produto em mordeduras por morcegos; 92,5% afirmaram ter conhecimento da presen ça do morcego em sua propriedade; 17,5% afirmaram ter tido caso confirmado de raiva na propriedade; 53% apontaram galpões de secador de café como abrigo para os morcegos; 90% afirmaram vacinar o rebanho durante as campanhas de vacinação. Com relação aos dados da Vigilância Epidemiológica, entre os anos de 2000 e 2006, ocorreram 587 casos de agressão por animais no município de Guaxupé. Desses casos, 24,3% ocorreram com crianças de até nove anos de idade; 91,5% ocorreram na zona urbana; 82,9% dos ferimentos foram por mordedura; 49,0% foram nas mãos; em 78,2% dos casos a espécie agressora era a canina; ocorreu apenas um caso de raiva canina com diagnós tico laboratorial e quatro casos de raiva animal com diagnóstico clínico. Esses estudos permitiram concluir que ainda é atual a necessidade de manter todas as ações que visam o controle da raiva, especialmente a vacinação; é importante a realização de um trabalho de consci entização com relação aos casos de agressão por animais, especialmente os cães. / Bovine rabies continues to be an important zoonosis. The occurrence of confirmed cases of the disease in the rural environment is a current public health problem, which is even more relevant when the cases of human rabies that occurred in the last few years are considered. The objective of the present project was to study the situation of bovine rabies in the municipality of Guaxupé - MG, on the basis of the presence of blood-sucking bats in the municipality, the level of knowledge of rural producers/employe es about rabies, the vaccination against bovine rabies, the notification of cases of the disease to the \"Instituto Mineiro Agropecuário\" (IMA), and the confirmed cases of animal rabies. The methodology consisted of a survey of secondary data at IMA and at the Epidemiological Surveillance of the Regional Management of Alfenas - MG, to which the municipality of Guaxupé belongs, and the application of a questionnaire about bovine rabies to a sample of rural producers/employees of the municipality. The sample was stratified into two groups, with the questionnaire being applied to 35 small and medium-sized properties and to 05 large properties. According to IMA data, 34 laboratory exams for the diagnosis of rabies were performed during the period from 1999 to 2003. Of these, 10 were considered to be positive, 08 of them involving cattle and 02 involving horses. Regarding the knowledge of rural producers/employe es about rabies, 74.3% were found to consider the veterinary to be an impor tant source of information; 85% called a veterinary when an animal was sick, 97.5% were aware of the importance of vaccination, 72.5% indicated that incre ased animal salivation is a characteristic symptom of the disease, 58.3% indica ted that carbuncle is a disease often confused with rabies, 90.0% stated that blood-sucking bats are the transmitters of the disease, 57.1% stated that they applied some type of product to bat bites, 92.5% stated that they were aware of the presence of bats on their property, 17.5% stated that they had a confirmed case of rabies on their property, 53% pointed out that coffee-drying barns are a shelter for bats, and 90% stated that they vaccinated the herd during vaccination campaigns. Regarding the data of Epidemiological Surveillance, 587 cases of aggression by animals occurred between 2000 and 2006 in the municipality of Guaxupé. Of these, 24.3% involved children up to 09 years of age, 91.5% occurred in the urban zone, 82.9% of the wounds were bites, 49.0% were in the hands, in 78.2% of cases the aggressing species was the canine one, and there was only one case of canine rabies with a laboratory diagnosis, plus 04 cases of animal rabies with a clinical diagnosis. These studies led to the conclusion that there still is the need to maintain all actions aiming at the control of rabies, especially vaccination, and that it is important to conduct awareness-raising work regarding cases of aggression by animals, especially dogs.

Les Norovirus (NoV), appartenant à la famille des Caliciviridae, sont une cause majeure dépidémies et de cas sporadiques de gastroentérites hautement contagieuses chez lhomme. Leur transmission emprunte la voie fécale-orale et ils sont à l'origine dune part importante des toxi-infections humaines d'origine alimentaire, en particulier dues à la consommation de mollusques bivalves. Ils possèdent un génome constitué dARN monocaténaire de polarité positive et sont classeés par analyse de proximité génétique en cinq génogroupes, contenant chacun plusieurs génotypes. Un problème majeur réside dans lincapacité à multiplier facilement les NoV en culture de cellules. La RT-PCR est devenue la méthode de choix pour leur détection dans les échantillons de matières fécales, les denrées alimentaires et les prélèvements effectués dans lenvironnement. Il est important de disposer de techniques à la fois sensibles et permettant également la détection dun large panel de NoV. La quantification de la charge virale est possible par lutilisation des techniques de RT-PCR en temps réel et est primordiale pour non seulement déterminer le niveau de contamination dun prélèvement, mais également pour étudier et caractériser la pathogénie de linfection à NoV. Des NoV ont été détectés dans diverses espèces animales, dont lespèce bovine. Ces découvertes ont soulevé d'importantes questions sur une éventuelle transmission zoonotique et l'existence d'un réservoir animal pour les NoV. La caractérisation moléculaire des deux prototypes de NoV bovins, nommément le virus Newbury2 et le virus Jena, a révélé qu'ils étaient génétiquement proches et associés aux NoV humains. Parmi les hypothèses évoquées, les animaux pourraient être soit des porteurs passifs de NoV, soit infectés de manière active par ces virus, responsables dès lors d'une zoonose. Caractériser les NoV circulant chez lhomme et les espèces animales est intéressant dans le but détudier leurs voies de transmission et léventuel passage inter-espèce de ces virus. Un mécanisme important d'évolution des NoV est la recombinaison, dun grand intérêt dans létude des NoV, générant des modifications du génome viral aboutissant à la création dun génome « chimère » à partir de deux génomes parentaux différents. Elle crée ainsi de la variation génétique et par là lémergence de nouveaux virus. En effet, il est bien documenté que la recombinaison se produit souvent parmi les NoV et contribue à la diversité génétique de ces virus ainsi quà lapparition de nouvelles épidémies. La prévalence des souches de NoV recombinants peut être sous-estimée par le fait que la caractérisation des NoV est habituellement basée sur le séquençage partiel du gène de lARN polymérase-ARN dépendante uniquement, alors quidéalement il faudrait séquencer différentes parties du génome, principalement lARN polymérase-ARN dépendante et la protéine de capside, pour identifier de tels virus. Il est important de déterminer précisément l'implication exacte de la recombinaison sur lévolution des NoV afin de comprendre les mécanismes dévolution des souches et l'avantage sélectif conféré pour certaines dentre elles. Etudier ce mécanisme permettra de mieux comprendre lavantage sélectif observé pour certains NoV et aidera à élucider les voies de transmission des NoV. Létude de ces deux points (transmission zoonotique et virus recombinants) est primordiale. En effet, le franchissement de la barrière despèce affecterait à la fois l'épidémiologie et l'évolution de ces virus, et compliqueraient également la capacité au développement dun vaccin ou dun traitement. Dans d'autres espèces animales, comme les chevaux ou les oiseaux, aucun NoV na été détecté à ce jour mais ces dernières années, des NoV ont été décrits dans de nombreuses espèces animales (chien, lion, mouton). Cela laisse donc présager dune gamme despèce cible encore plus étendue. Ce travail sinscrit dans le cadre de létude des voies de transmission des NoV avec comme objectif, après la mise au point de méthodes rapides et sensibles de détection et de quantification, dapporter un éclaircissement aux questions importantes relatives à lévolution des NoV et à leur catégorie dhôte. Dans un premier temps, la RT-PCR conventionnelle a été utilisée afin de détecter les NoV dans les espèces humaine et bovine. Ensuite, une RT-PCR utilisant la technologie SYBR Green a été développée et utilise un contrôle interne constitué dARN ajouté au même tube. Ce test est capable de détecter des NoV humains et bovins appartenant aux génogroupes I, II et III et permet de faire la distinction entre les NoV et le contrôle interne par lanalyse des courbes de dissociation. Une dilution 10 fois des échantillons sest révélée la méthode de choix pour lever les inhibitions. Afin de pouvoir confirmer directement le résultat et de permettre la quantification des NoV, une RT-PCR en temps réel utilisant la technologie TaqMan a été développée. Elle utilise un contrôle interne dARN et un standard dARN. De façon très intéressante, cette méthode peut détecter les NoV humains appartenant au génogroupes I, II et bovins du génogroupe III. Les inhibitions furent efficacement levées par une dilution 10 fois de léchantillon ou lajout de sérum albumine bovine au mix de RT-PCR. Ces deux RT-PCR en temps réel ont montré une sensibilité supérieure comparée à la RT-PCR conventionnelle. Avec pour objectif de comprendre les voies de transmission des NoV, la situation en Belgique a été investiguée et des NoV humains et bovins ont été détectés et analysés par séquençage partiel. Des NoV appartenant à différents génogroupes ont été détectés : GI et GII chez lhomme et GIII chez les bovins. Par analyse de la proximité génétique, les NoV bovins se sont révélés de génotype GIII.2 et les NoV humains de différents génotypes, mais majoritairement de génotype GII.4. Ces analyses ont permis également lidentification dune co-infection et de deux recombinants naturels, ces derniers étant proches de génotypes différents en fonction de la région du génome analysée (polymérase ou capside). L'identification de zones privilégiées pour la recombinaison dans la région située à la jonction de l'ORF (open reading frame) 1 et de lORF2 confirme l'importance de cette région dans ce phénomène. Afin détudier lévolution des NoV bovins, un NoV bovin détecté en Belgique fut séquencé complètement (Bo/B309/2003/BE) et comparé à la souche originale Newbury2 (isolée dans les années 80). Dune part, cette études a permis daboutir à la mise au point et la validation doutils permettant la détection et létude les NoV humains et animaux, tant pour leur pathogénie, que leur évolution ou leurs voies de transmission. Dautre part, basée sur le panel déchantillons recueillis durant cette étude, lanalyse phylogénétique des NoV détectés va dans le sens des études réalisées dans dautres pays tendant à montrer que les NoV bovins constituent un groupe de virus distincts, différents des NoV humains. Cela suggère que les NoV bovins ne représentent pas un risque pour la santé humaine. Néanmoins, la possibilité dune infection zoonotique ou dun réservoir animal ne peut pas être exclue vu la proximité de séquence entre les NoV humains et animaux et aussi la relation étroite et proche entre les populations humaines et les élevages danimaux. La détection dune co-infection et de deux recombinants naturels démontre les possibilités dévolution des NoV et limportance dune analyse complète de leur génome pour leur caractérisation. Ce travail a été pionnier dans létude des NoV au laboratoire et a ouvert la voie à dautres sujets de recherche sur les NoV et à de nouvelles thèses de doctorat, notamment sur létude de linteraction NoV-hôte (NoV dans lespèce bovine) et létude de la recombinaison des NoV in vitro (NoV murins).

Stuttgart, Univ., Diss., 2006. / Enth. Zeitschriftenartikel aus: Virology ; 345 (2006) S. 502 - 508; PNAS ; 102 (2005) S. 7982 - 7987; Tierärztliche Umschau ; 59, (2004) S. 521 - 527; Gene Therapy ; 14 (2007) S. 613 - 620.

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-02Bitstream added on 2014-08-13T18:01:12Z : No. of bitstreams: 1 000735335_20150730.pdf: 387998 bytes, checksum: 90b73134fb9fe938fabafd23bf57f2a5 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-08-03T12:20:49Z: 000735335_20150730.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-03T12:22:15Z : No. of bitstreams: 1 000735335.pdf: 2101391 bytes, checksum: 83c797b7f26be5cfdcc0cb1f891aa84c (MD5) / Salmonella spp. e Leptospira spp., agentes zoonóticos de relevância em saúde pública, apresentam ocorrência mais frequente nas regiões tropicais e possuem no meio aquático uma forma viável de sobrevivência e transmissão. Este trabalho teve o objetivo de pesquisar a presença de Salmonella spp. e Leptospira spp. em Phrynops geoffroanus (cágados-de-barbicha) e a presença de Salmonella spp. no ambiente (Córrego Cerradinho em Jaboticabal-SP), no qual os animais foram capturados. A partir das amostras de sangue e suabes de cloaca de P. geoffroanus e de amostras de água e sedimento do córrego, foram feitos cultivos microbiológicos para pesquisa de Salmonella spp. O soro de P. geoffroanus foi utilizado para pesquisa de anticorpos anti-Leptospira spp. pela técnica de soroaglutinação microscópica (SAM). A técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) foi utilizada para verificar a presença de Leptospira spp. nas amostras de lavado estomacal e cloacal. Diversos sorotipos de Salmonella spp. foram isolados nas amostras do Córrego Cerradinho e nos suabes cloacais de P. geoffroanus residentes nesse ambiente. Nem sempre os sorotipos de Salmonella spp. encontrados em ambiente e em P. geoffroanus foram os mesmos. Os testudines aquáticos foram positivos para Leptospira spp., e foram detectados também anticorpos contra o agente. Concluiu-se que a presença dos agentes, tanto nos animais como no ambiente aquático, pode representar um risco para a saúde pública / Salmonella spp. e Leptospira spp., zoonotic agents of public health relevance, have higher occurrence in tropical regions and present in the aquatic environment, a viable survival and transmission way. This study aimed to investigate the presence of Salmonella spp. and Leptospira spp. in Phrynops geoffroanus (geoffroy’s side-necked turtle) and the presence of Salmonella spp. in the environment (Cerradinho Stream, Jaboticabal-SP), where animals were captured. From blood samples and cloacal swabs of P. geoffroanus and samples of water and sediment from the stream, microbiological cultures for Salmonella spp. were performed. The serum of P. geoffroanus was used to detect antibodies anti-Leptospira spp. by microscopic agglutination test (MAT). Polymerase chain reaction (PCR) technique was used to verify the presence of Leptospira spp. in samples of gastric and cloacal lavage. Several serotypes of Salmonella spp. were isolated in samples of Cerradinho stream and cloacal swabs of P. geoffroanus residents in this environment. The serotypes of Salmonella spp. found in the environment and in P. geoffroanus were not always the same. The freshwater testudines were positive for Leptospira spp., and antibody against the agent were detected. It was concluded that the presence of agents, in both animals and aquatic environment, may represent a risk to public health