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Análise da diversidade genética em erva baleeira (Varronia curassavica Jacq.) baseada no marcador ISSR / Genetic diversity analysis of Varronia curassavica Jacq. accessions by using ISSR markers

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Varronia curassavica Jacq. is a medicinal and aromatic plant from Brazil, with significant
economic importance. Studies on genetic diversity in Active Germplasm Banks (AGB) are
essential for conservation and breeding programs. The aim of this study was to analyze the
genetic diversity of V. curassavica accessions of the Active Germplasm Bank of Medicinal
and Aromatic Plants of the Federal University of Sergipe, using the Inter Simple Sequence
Repeat (ISSR) molecular marker. DNA was extracted from 28 individuals by the CTAB 2%
method. Twenty-four primers were tested, and 14 of them were polymorphic and informative,
resulting in 149 bands amplified with 97,98% polymorphism. The Unweighted Pair Group
Method with Arithmetic Mean divided the accessions into Cluster I and II. In the Jaccard
similarity matrix, variation ranged between 0,24 and 0,78. The pairs of accessions VCUR-
001/VCUR-503, VCUR-001/VCUR-504 and VCUR-104/VCUR-501 showed higher diversity
(0,24), and the pair of accessions VCUR-402/VCUR-403 showed medium diversity (0,78).
Twenty-eight accessions were divided into three distinct clusters, according to the Structure
analysis. According to the Principal Component Analysis (PCA), the first principal
component accounted for 13,19% of the total variance, and the second principal component
accounted 9,38% of the total variance. The genetic diversity of the Active Germplasm Bank
of UFS is low to medium, and it requires expansion. VCUR-802 accession is the most
suitable for selection in breeding program of this species, since it clearly represents all the
diversity present in the germplasm Bank. / A erva baleeira (Varronia curassavica Jacq.) é uma planta medicinal e aromática nativa do
Brasil, com importância econômica relevante. Estudos de diversidade genética em Bancos
Ativos de Germoplasma são essenciais em programas de conservação e melhoramento
genético. O objetivo do presente estudo foi analisar a diversidade genética dos acessos de V.
curassavica do Banco Ativo de Germoplasma de Plantas Medicinais e Aromáticas da
Universidade Federal de Sergipe através do marcador molecular Inter Simple Sequence
Repeat (ISSR). Foi extraído DNA de 28 indivíduos, através do método CTAB 2%. Foram
testados 24 primers, onde 14 deles foram polimórficos e informativos, resultando em 149
bandas amplificadas com 97,98% de polimorfismo. O método de agrupamento da Média
Aritmética Não Ponderada dividiu os acessos em dois Grupos, I e II. Na matriz de
similaridade de Jaccard houve variação de 0,24 a 0,78. Os pares de acessos VCUR-
001/VCUR-503, VCUR-001/VCUR-504 e VCUR-104/VCUR-501, apresentaram maior
diversidade (0,24) e os pares VCUR-402/VCUR-403, apresentaram média diversidade (0,78).
Houve a separação dos 28 acessos em três grupos distintos, de acordo com a análise do
Structure. Conforme a Análise de Componente Principal (ACP), o componente principal
primário representou 13,19% da variância total, e o componente principal secundário
representou 9,38% da variância total. A diversidade genética do Banco Ativo de
Germoplasma de erva-baleeira da UFS é de baixa a média, sendo necessária sua ampliação. O
acesso VCUR-802 é o mais indicado para seleção em programa de melhoramento dessa
espécie, por representar claramente toda diversidade presente no BAG.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:ri.ufs.br:riufs/3019
Date26 February 2016
CreatorsBrito, Fabiany de Andrade
ContributorsBlank, Arie Fitzgerald
PublisherUniversidade Federal de Sergipe, Pós-Graduação em Agricultura e Biodiversidade, UFS, Brasil
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFS, instname:Universidade Federal de Sergipe, instacron:UFS
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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