Resumo: A família Rivulidae inclui atualmente 240 espécies válidas, sendo distribuídas desde o sul da Flórida (EUA) até o sul da Patagônia (Argentina). Dentro da família Rivulidae, o gênero de peixes anuais mais especioso é Simpsonichthys, compreendendo 56 espécies válidas. Devido sua ampla distribuição e a ocorrência de variação morfológica entre as espécies do gênero, foi sugerido a divisão deste grupo em cinco subgêneros: Xenurolebias, Ophthalmolebias, Simpsonichthys, Spectrolebias e Hypsolebias. Buscando levantar as primeiras informações genéticas para o gênero, o objetivo do trabalho foi inferir as relações filogenéticas do grupo na tentativa de testar a hipótese de divisão de Simpsonichthys em cinco subgêneros. Para tanto, indivíduos pertencentes ao gênero Simpsonichthys foram coletados ao longo de riachos costeiros da bacia do Leste do Brasil e tiveram seu DNA genômico extraído para a realização da reação de PCR, com o intuito de amplificar os genes de interesse (ATPase 8/6 e RAG-2). Os produtos de PCR obtidos com o gene mitocondrial (ATPase 8/6) foram sequênciados e as análises filogenéticas foram realizadas pelos métodos Neighbour-Joining e Máxima Parcimônia, com 1000 réplicas de bootstrap, utilizando o modelo evolutivo Kimura-2- Parâmetros. Os resultados obtidos permitem inferir que a hipótese de divisão de Simpsonichthys é válida, e que o gênero é subdividido em sete subgêneros distintos. A topologia obtida apresentou dois clados, sendo o clado I composto pelo subgênero Hypsolebias, grupo S. magnificus, e o II contendo os subgêneros Hypsolebias, grupos S. flammeus (IIA), S. notatus (IIB) e S. antenori (IID), Simpsonichthys (IIC), Spectrolebias (IIE) e Ophtalmolebias (IIF). As relações filogenéticas observadas foram: o clado I como grupo irmão de todo o clado II, e dentro do segundo clado... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The family Rivulidae currently comprises 240 valid species, being distributed from southern Florida (USA) to the southern Patagonia (Argentina). Within the family Rivulidae, the genus of annual fish that is more specious is Simpsonichthys, comprising 56 valid species. Due to the wide distribution and occurrence of morphological variation among species of the genus, it was suggested to divide this group into five subgenus: Xenurolebias, Ophthalmolebias, Simpsonichthys, Spectrolebias and Hypsolebias. Seeking to raise the first genetic information for the genus, the aim of this study was to infer the phylogenetic relationships of the group in order to test the hypothesis of the division of Simpsonichthys into five subgenus. So, individuals belonging to the genus Simpsonichthys were collected along coastal streams of the East Brazilian basin and had their genomic DNA extracted to perform the PCR reaction to amplify the genes of interest (ATPase 8/6 and RAG-2). The PCR products (ATPase 8/6) were subjected to sequencing and phylogenetic analysis were performed by methods Neighbour-Joining and Máximum Parcimony, with 1000 bootstrap replicates, using the evolutionary model Kimura-2-Parameters. The results obtained allow us to infer that the hypothesis of division of Simpsonichthys is valid, and that the genus is divided into seven distinct subgenus. The topology obtained showed two clades, the clade I is composed of the subgenus Hypsolebias, group S. magnificus, and the II containing the subgenus Hypsolebias groups S. flammeus (IIA), S. notatus (IIB) and S. antenori (IID), Simpsonichthys (IIC), Spectrolebias (IIE) and Ophtalmolebias (IIF). Phylogenetic relationships observed were: the clade I, composed by subgenus Hypsolebias (S. magnificus), appears as sister group of clade II, and within the... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Anderson Luis Alves / Coorientador: Patrícia P. Parise-Maltempi / Banca: Maria Rita de Cascia Barreto Netto / Banca: Marcio Cesar Chiachio / Mestre

Orientadora: Maria Benincasa Vidotti / Co-orientadora: Angeles Manresa / Banca: Ana Claudia Barana / Banca: Vanildo Luiz Del Bianchi / Banca: Mariana Carina Frigieri / Banca: Janete Apparecida Desiderio / Resumo: Lipoxigenases são enzimas que catalizam a oxido-redução de ácidos graxos poliinsaturados que contém em sua estrutura um ou mais grupos cis 1,4- pentadieno, produzindo hidroperóxidos através da incorporação de um oxigênio molecular. Durante anos a presença de lipoxigenase foi considerada exclusivamente eucariótica, presente em mamíferos, plantas, pequenos invertebrados marinhos e fungos. A função biológica dessas enzimas tem sido amplamente estudada. Porém, pouco tem sido descrito em organismos procariotos. O presente estudo teve por objetivos clonar e caracterizar bioquimicamente duas lipoxigenases de Shewanella woodyi ATCC 51908, caracterizar os produtos de reação destas enzimas e realizar um estudo filogenético e estrutural, comparando-as com lipoxigenases de eucariotos e procariotos. Parâmetros enzimáticos dessas enzimas foram descritos. A influência do pH e temperatura na atividade catalítica foram estudadas. Também foi determinado a preferência por substrato e o efeito da adição de vários íons divalentes que podem interferir na atividade catalítica. A enzima SWPrecLox de S. woodyi apresentou temperatura e pH ótimos de 31ºC e 8,0, respectivamente. Demonstrou afinidade por ácido linoleico, com uma Km de 0,47 mM e Vmax de 2,78 mmols min-1 mg-1. A enzima SWAracLOX teve ácido araquidônico como substrato preferente, com valores de Km 0,20 mM e Vmax 1,6 mmols min-1 mg-1. Atividade ótima foi alcançada com 27ºC e pH 7,0. A partir das estruturas moleculares das lipoxigenases de Plexaura homomalla e Pseudomonas aeruginosa, foram criados hipotéticos modelos estruturais de SWPrecLOX e SWAracLOX. / Abstract: Lipoxygenases are enzymes that catalyze the oxido-reduction of polyunsaturated fatty acids in their structure that contains one or more groups cis 1,4- pentadiene, producing hydroperoxides from the incorporation of molecular oxygen. For years, the presence of lipoxygenases was considered a eukaryotic feature, present in mammals, plants, small marine invertebrates and fungi. The present study aimed to clone and characterize biochemically two lipoxygenases from Shewanella woodyi ATCC 51908, characterize the reaction products of these enzymes and conduct a phylogenetic and structural analysis, comparing them with eukaryotes and prokaryotes lipoxygenases. The biological function of these lipoxygenases has been widely studied. However, only few have been described in prokaryotes. Enzymatic parameters of these enzymes have been described. The influence of the pH and the temperature on the catalytic activity has been studied. Also has been studied the substrate preference and the effect of the addition of several divalent cations that can enhance or eliminate the catalytic activity. The enzyme SWPrecLox of S. woodyi showed temperature and pH optimum were 31 ºC and 8,0, respectively. Demonstrated substrate affinity for linoleic acid, with Km 0,47 mM and Vmax 2,78 mmols min-1 mg-1. The enzyme SWAracLox has arachidonic acid as preferred substrate, with Km 0,20 mM and Vmax 1,6 mmols min-1 mg-1. Optimum activity was reached at 27 ºC and pH 7,0. From the molecular structures of lipoxygenase Plexaura homomalla and Pseudomonas aeruginosa, were created a hypothetical structural model of the SWPrecLox and SWAracLox. / Doutor

Resumo

Orientador : Prof. Dr. Rodrigo de Almeida Teixeira / Co-orientadora : Profª. Drª. Laila Talarico Dias / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia. Defesa: Curitiba, 28/03/2016 / Inclui referências : f. 51-57 / Área de concentração : Meio ambiente, melhoramento e modelagem animal / Resumo: As características lineares de tipo (CLT) têm potencial para serem utilizadas para identificar vacas com potencial para altas produções ao longo da vida produtivada vaca. O objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos e analisar as relações entre as CLT e os dados de produção ajustados aos 305 dias durante a primeira lactação e com os dados de lactações acumuladas durante toda a vida produtiva da vaca. Foram comparadas duas populações de vacas: um banco de dados da população geral de animais do Estado do Paraná e, um segundo conjunto de dados, correspondente ao grupo de vacas que produziram acima de 35.000 kg de leite na vida produtiva (vacas vitalícias). As informações analisadas são pertencentes ao banco de dados da Associação Paranaense dos Criadores da Raça Holandesa do Paraná, de lactações completas encerradas entre 2000 e 2014. As análises de variância foram realizadas usando-se o programa SAS/STAT versão 9.4e, para estimar valores de herdabilidade e correlações entre os dados de produção etipo utilizou-se o programa MTDFREML. Os valores estimados de herdabilidade para leite, gordura e proteína na primeira lactação foram, respectivamente, 0,34 ± 0,011,0,39 ± 0,011 e 0,24 ± 0,010 para a população geral e, de 0,54 ± 0,027, 0,43 ± 0,028e 0,39 ± 0,025, respectivamente, para as vacas vitalícias. Para a produção acumulada, a herdabilidade para leite, gordura e proteína foram, respectivamente, 0,04 ± 0,005, 0,05 ± 0,005 e 0,05 ± 0,005 para a população geral e 0,10 ± 0,017,0,06 ± 0,015 e 0,11 ± 0,018, respectivamente, para as vacas vitalícias. Para as CLT, a herdabilidade para a população geral variou de 0,06 a 0,39. Para as vacas vitalícias, a herdabilidade variou entre 0,08 a 0,36. O sistema mamário e a garupa são os compostos que vão responder melhor à seleção direta na população de vacas vitalícias. As correlações genéticas entre as 23 CLT e a produção na primeira lactação variaram entre -0,13 a 0,10 na população geral e -0,27 a 0,42 na populaçãode vacas vitalícias, indicando que a população de vacas vitalícias apresentou maior correlação entre produção de leite na primeira lactação e CLT. As correlações genéticas entre as CLT e a produção acumulada variaram entre -0,30 a 0,22 na população geral e -1,00 a 0,30 na população de vacas vitalícias. Fêmeas com melhor escore de angulosidade apresentaram produções mais altas. Palavras-chave: Correlação. Herdabilidade. Longevidade. Produção acumulada.Vaca vitalícia. / Abstract: With the aim of search for linear type traits (LTT) that allow identify cows with potential for high production over the productive life, during the first lactation, production data adjusted to 305 days in first lactation and accumulated lactations inproductive life were used, and also linear type classification data, belonging to the Breeders Association of Holstein Cattle of Paraná, for the period 2000-2014 to estimate heritability and correlations between data production and type. Analyses were performed using SAS / STAT version 9.4 and MTDFREML programs. Analyzes were performed using single-trait and two-trait for LTT and milk production by comparing two populations of cows: cows that produced over 35.000 kg milk in their productive life (lifetime cows) and the general population. The heritability for milk, fatand protein in first lactation were, respectively, 0.34 ± 0.011, 0.39 ± 0.011 and 0.24 ±0.010 for the general population and 0.54 ± 0.027, 0.43 ± 0.028 and 0 , 39 ± 0.025, respectively, for the population of lifetime cows. For the accumulated production, the heritabilities for milk, fat and protein were respectively 0.04 ± 0.005, 0.05 ± 0.005 and 0.05 ± 0.005 for the general population and 0.10 ± 0.017, 0.06 ± 0.015 and 0.11 ±0.018, respectively, for the population of lifetime cows. For LTT, the heritability for the general population ranged from 0.06 to 0.39 and for lifetime cows, heritability ranged from 0.08 to 0.36. The genetic correlations among the 23 LTT and production in the first lactation ranged from -0.13 to 0.10 in the general population and -0.27 to 0.42 in the population of lifetime cows, indicating that the population of lifetime cows presented an increased correlation among milk production in first lactation and LTT.The genetic correlations among LTT and cumulative production traits ranged from -0.30 to 0.22 in the general population and -1.00 to 0.30 in the population of lifetime cows. The mammary system and rump are the compounds that will respond better to direct selection in the population of lifetime cows. For the general population, the mammary system and dairy strength could get a genetic gain by selection. Femaleswith greater angularity, presented higher production. Keywords: Correlation. Heritability. Lifetime production. Longevity.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-01Bitstream added on 2014-06-13T19:08:39Z : No. of bitstreams: 1 ponzetto_jm_me_rcla_parcial.pdf: 242120 bytes, checksum: 9ee242141ffd7b601c1d33861b554267 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-25T13:01:09Z: ponzetto_jm_me_rcla_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-25T13:03:26Z : No. of bitstreams: 1 000696856_20151201.pdf: 232016 bytes, checksum: 5f65468f370a6873831529b66b3a00d9 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-12-01T09:08:36Z: 000696856_20151201.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-01T09:09:26Z : No. of bitstreams: 1 000696856.pdf: 1828460 bytes, checksum: dd52594af21a629a302fead3bdf5696b (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A família Rivulidae inclui atualmente 240 espécies válidas, sendo distribuídas desde o sul da Flórida (EUA) até o sul da Patagônia (Argentina). Dentro da família Rivulidae, o gênero de peixes anuais mais especioso é Simpsonichthys, compreendendo 56 espécies válidas. Devido sua ampla distribuição e a ocorrência de variação morfológica entre as espécies do gênero, foi sugerido a divisão deste grupo em cinco subgêneros: Xenurolebias, Ophthalmolebias, Simpsonichthys, Spectrolebias e Hypsolebias. Buscando levantar as primeiras informações genéticas para o gênero, o objetivo do trabalho foi inferir as relações filogenéticas do grupo na tentativa de testar a hipótese de divisão de Simpsonichthys em cinco subgêneros. Para tanto, indivíduos pertencentes ao gênero Simpsonichthys foram coletados ao longo de riachos costeiros da bacia do Leste do Brasil e tiveram seu DNA genômico extraído para a realização da reação de PCR, com o intuito de amplificar os genes de interesse (ATPase 8/6 e RAG-2). Os produtos de PCR obtidos com o gene mitocondrial (ATPase 8/6) foram sequênciados e as análises filogenéticas foram realizadas pelos métodos Neighbour-Joining e Máxima Parcimônia, com 1000 réplicas de bootstrap, utilizando o modelo evolutivo Kimura-2- Parâmetros. Os resultados obtidos permitem inferir que a hipótese de divisão de Simpsonichthys é válida, e que o gênero é subdividido em sete subgêneros distintos. A topologia obtida apresentou dois clados, sendo o clado I composto pelo subgênero Hypsolebias, grupo S. magnificus, e o II contendo os subgêneros Hypsolebias, grupos S. flammeus (IIA), S. notatus (IIB) e S. antenori (IID), Simpsonichthys (IIC), Spectrolebias (IIE) e Ophtalmolebias (IIF). As relações filogenéticas observadas foram: o clado I como grupo irmão de todo o clado II, e dentro do segundo clado... / The family Rivulidae currently comprises 240 valid species, being distributed from southern Florida (USA) to the southern Patagonia (Argentina). Within the family Rivulidae, the genus of annual fish that is more specious is Simpsonichthys, comprising 56 valid species. Due to the wide distribution and occurrence of morphological variation among species of the genus, it was suggested to divide this group into five subgenus: Xenurolebias, Ophthalmolebias, Simpsonichthys, Spectrolebias and Hypsolebias. Seeking to raise the first genetic information for the genus, the aim of this study was to infer the phylogenetic relationships of the group in order to test the hypothesis of the division of Simpsonichthys into five subgenus. So, individuals belonging to the genus Simpsonichthys were collected along coastal streams of the East Brazilian basin and had their genomic DNA extracted to perform the PCR reaction to amplify the genes of interest (ATPase 8/6 and RAG-2). The PCR products (ATPase 8/6) were subjected to sequencing and phylogenetic analysis were performed by methods Neighbour-Joining and Máximum Parcimony, with 1000 bootstrap replicates, using the evolutionary model Kimura-2-Parameters. The results obtained allow us to infer that the hypothesis of division of Simpsonichthys is valid, and that the genus is divided into seven distinct subgenus. The topology obtained showed two clades, the clade I is composed of the subgenus Hypsolebias, group S. magnificus, and the II containing the subgenus Hypsolebias groups S. flammeus (IIA), S. notatus (IIB) and S. antenori (IID), Simpsonichthys (IIC), Spectrolebias (IIE) and Ophtalmolebias (IIF). Phylogenetic relationships observed were: the clade I, composed by subgenus Hypsolebias (S. magnificus), appears as sister group of clade II, and within the... (Complete abstract click electronic access below)

Resumo: Com a crescente demanda do campo da restauração ecológica, questões até então não discutidas vêm surgindo, tal como a importância da introdução da variabilidade genética em matrizes de sementes. Informações sobre a estrutura genética populacional e características ecológicas podem ajudar a definir as melhores matrizes para a coleta de sementes e assim garantir o sucesso de futuras áreas restauradas. Com a inserção de novos genótipos em áreas restauradas através das matrizes de sementes, evita-se a ausência de fluxo gênico e possíveis consequências genéticas como efeito gargalo de garrafa, deriva genética, perda de 'fitness', disrupção do sistema reprodutivo, entre outros. Assim, este estudo realizou uma avaliação genético-populacional de duas espécies arbóreas pioneiras (Sapium glandulatum e Schizolobium parahyba) para verificar a variabilidade genética destas espécies em áreas de regeneração natural, plantio e mata avançada. Utilizando o espaçador intergênico trnS-trnG do DNA de cloroplasto, avaliamos populações compostas por 27 indivíduos de S. glandulatum e 26 indivíduos de S. parahyba, distribuídos igualmente entre áreas de mata avançada, regeneração natural e plantio. Não houve variação na sequência de nucleotídeos nas duas espécies. Os resultados encontrados apontam para um possível efeito fundador nas áreas restauradas onde há dominância reprodutiva de poucos indivíduos. A formação histórica da Floresta Atlântica pode ser considerada como fator fundamental para entender a baixa diversidade genética encontrada em organismos da porção sul deste bioma. Estudo posteriores, com outros marcadores com taxas de mutação conhecidamente mais elevadas, além de um aumento do tamanho amostral, poderão detectar variabilidade nas populações estudadas.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-03-04Bitstream added on 2014-06-13T20:00:06Z : No. of bitstreams: 1 almeida_iro_me_botib.pdf: 1159803 bytes, checksum: 8b692d8d747287b1fa84a1b81e1c3540 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Este projeto de pesquisa teve como objetivo analisar o desenvolvimento de embriões provenientes dos cruzamentos interespecíficos entre as espécies de teleósteos neotropicais, pintado (Pseudoplatystoma corruscans) e jandiá (Leiarius marmoratus). As coletas foram realizadas no Centro Nacional de Pesquisa e Conservação de Peixes Continentais - CEPTA/ICMBIO, Pirassununga – SP e na Piscicultura Muriti, Nova Mutum – MT. A reprodução foi feita através de indução hormonal, utilizando extrato bruto de hipófises de carpa. Os ovos foram incubados em incubadoras verticais e coletados desde o momento da fertilização até a eclosão das larvas. Os ovos dos parentais P. corruscans e L marmoratus e seus híbridos, são esféricos, demersais, córion nítido e espaço perivitelínico pequeno após a hidratação, não sendo observada a presença de gota de óleo na vesícula vitelínica durante todo o desenvolvimento embrionário. A média do espaço perivitelínico do L. marmoratus foi de 215,9μm, do P. corruscans foi de 352,5μm, do híbrido I foi de 561μm e do híbrido II foi de 247,2μm. O diâmetro médio do ovo do L. marmoratus foi de 589,6μm, do P. corruscans foi de 867,3μm, do híbrido I foi de 765,3μm e do híbrido II foi de 581μm. O período de incubação do P. corruscans e do híbrido I foi de 13 horas, à temperatura média de 28,7°C respectivamente. Já para o L. marmoratus e do híbrido II foi de 14 horas para o parental e 12 horas para o híbrido, a uma temperatura média de 28,3°C. Sendo estabelecidos os seguintes estágios embrionários: zigoto, clivagem, gástrula, organogênese e eclosão e estes divididos em fases. O estágio de clivagem foi dividido nas fases de 2, 4, 8, 16, 32, 64 células e na fase de mórula. O estágio de gástrula apresentou as fases de 25%, 50%, 75%, 90% e 100% do movimento morfogenético de epibolia e o estágio de organogênese... / The main of this research project was analyze the embryos development from the inter-specific crossing between the neotropical teleostei species, pintado (Pseudoplatystoma corruscans) e jandiá (Leiarius marmoratus). The samples were realized in the National Research and Conservation Nucleus of Continental Fishes – CEPTA/ICMBIO, Pirassununga – SP in the Buriti Fish Farming, Nova Mutum – MT. The reproduction was made through the hormonal induction, using gross extract of pituitary from carpa. The eggs were incubated in vertical incubators and collected since the fertilization time until the larval hatching. The eggs of the parents P. corruscans e L. marmoratus and their hybrids, are spherical, demersal, distinct chorion and small perivitelline space after the hydration without observation of the presence of drop oil in the vitelline vesicle during all embryonic development. The mean of the perivitelline space of the L. marmoratus was 215,9μm, in the P. corruscans was 352,5μm, in the hybrid I was 589,6μm and 247,2μm in the hybrid II. The mean diameter of the egg in L. marmoratus was 589,6μm, in P. corruscans was 867,3μm, in the híbrido I was 765,3μm and 581μm in the hybrid II. The incubation period of P. corruscans and the híbrido I was 13 hours , in the mean temperature of 28,7°C. However in L. marmoratus and Hybrid II was 14 hours for the parental and 12 hours for the hybrid in the mean temperature of 28,3°C. It was established the following embryonic stages: zygote, cleavage, gastrula, organogenesis and hatching and this divided in phases. The cleavage stage was divided in the phases 2, 4, 8, 16, 32, 64 cells and in the morula phase. The gastrula stage showed the phases 25%, 50%, 75%, 90% and 100% of morphogenetic movements of epiboly and the organogenesis stage was divided in the neurula, segmentation and larval phases... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-25Bitstream added on 2014-06-13T19:18:38Z : No. of bitstreams: 1 mehanna_mn_me_botib.pdf: 704117 bytes, checksum: 7f41f23c47d6efbfb7cdff064584bd65 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo deste trabalho é analisar as espécies do gênero Trichomycterus presentes na sub bacia do rio Cuiabá, drenagem do rio Paraguai, através de analises morfológicas e moleculares, e um breve ensaio sobre o complexo de espécies T. brasi/iensis através de análises moleculares. Os resultados obtidos foram divididos em duas partes: na primeira parte são apresentados os resultados das análises morfológicas e moleculares dos exemplares de Trichomycterus, e uma análise da morfologia externa de T. johnsoni; e na segunda parte são apresentadas as análises moleculares de alguns espécimes que pertencem ao complexo de espécies T. brasi/iensis. Foram identificadas quatro novas espécies, T. sp. n1, T. sp. n2, T. sp. n3, T. sp. n4 que divergem entre elas pelo seguintes conjuntos de caracteres, respectivamente: Número de odontóideos na placa pré-opercular (9 versus 20-22 versus 17-18 versus 14); número de odontóideos na placa inter-opercular (16-17 versus 27-31 versus 21-25 versus 22-25); T. sp. n1 diverge de seus congêneres pelo número de raios na nadadeira peitoral (i+6 versus i+5). O número de raios da nadadeira anal permite diferenciar T. sp. n1 (ii+4) de T. sp. n2 (ii+5) e T. sp. n3 (ii+5) e T. sp. n4 (ii+6), sendo essa caráter compartilhado entre T. sp. n2 e T. sp. n3. As espécies compartilham o número de raios da nadadeira dorsal (ii+7), o número de raios da nadadeira caudal (i+11 +i), e o número de raios na nadadeira pélvica. Com relação aos canais laterosensorias, T. sp. n1 e T. sp. n3 apresentaram a ausência do canal infra-orbital i1 e i3. Nas análises osteológicas, a única variação encontrada entre as espécies citadas (com exceção de T. sp. n4) foi a formação da nadadeira pélvica, em relação a estruturas dos ossos pélvicos e do processo mesial. Nas análises moleculares foi amplificado e sequenciado parte do gene mitocondrial Citocromo... / The objective of this work is analyze the Trichomycterus species presents in the Cuiabá river sub basin, Paraguay river drainage, through morphologic and molecular analyze, and make a briefing essay species complex of T. brasi/iensis with molecular analyses. The results had been divided in two parts: in the first part are presented the results of the morphologic and molecular analyses of Trichomycterus, and an analysis of the external morphology of T. johnsoni; e in the second part is presented the molecular analyses of some specimens that comprise to the species complex of T. brasiliensis. The species had been identified to four new species, T. sp. n1, T. sp. n2, T. sp. n3 and T. sp. n4, that they diverge between them for the following characters: Number of odontodes in the opercular plate (9 versus 20-22 versus 17-18 versus 14); number of odontodes in the Interopercular plate (16-17 versus 27-31 versus 21-25 versus 22-25); T. sp. n1 diverge of ali species for the number of rays in the pectoral fins (i+6 versus i+5). The number of rays of the anal fins allows differente in T. sp. n1 (ii+4) of T. sp. n2 (ii+5) and T. sp. n3 (ii+5) and T. sp. n4 (ii+6), being this character shared between T. sp. n2 and T. sp. n3. Ali species share the number of rays of the dorsal fins (ii+ 7), the number of caudal fins rays (i+11 +i), and the number of the pelvic fins rays. With regard to the laterosensory canais, T. sp. n1 and T. sp. n3 had presented the absence of the infra-orbital canais i1 and i3. In the osteology analyses, the only variation of ali species cited (with exception of T. sp. n4) was the pelvic fins, where the variation of the pelvic bones structures and the mesial process diverge between them. In the molecular analyses it was amplified and sequence part of the mitochondrial gene Citocromo Oxidase I sub-unit, and was elaborated a matrix with 634 pb. The dendogram with method UPGMA with... (Complete abstract click electronic access below)

O conhecimento sobre a história evolutiva de uma espécie é essencial para obter insights sobre processos que contribuíram para os padrões atuais de distribuição e diversidade dessa espécie. Entender a evolução de uma espécie envolve a compreensão de sua história demográfica, estruturação populacional e também os mecanismos envolvidos na adaptação local. Neste contexto, os avanços em genômica e tecnologia de sequenciamento de DNA estão revolucionando o entendimento da história evolutiva das espécies, pois possibilitam o desenvolvimento de plataformas de genotipagem de alto rendimento, facilitando o uso de análises multilocus para identificar as regiões genômicas responsáveis pela adaptação local e trazendo uma visão detalhada sobre a história demográfica e a estrutura de populações. Além disso, estes dados permitem a identificação de loci responsáveis ou associados com adaptações locais e compreender as estratégias de adaptação que possibilitam algumas plantas sobreviverem em diferentes condições ambientais. Eugenia uniflora L. é uma espécie pertencente à família Myrtaceae e que apresenta uma ampla distribuição ao longo dos domínios da Floresta Atlântica (DFA). Popularmente conhecida como pitanga ou cereja-brasileira, E. uniflora é bastante versátil e cresce em vários habitats diferentes, ocorrendo como um arbusto ou árvore pequena em ambientes arenosos de restinga na planície costeira, próximo ao oceano e também no sul do Brasil apresenta-se como árvore, em ambientes de mata ciliar. Essas características, aliadas ao fato de que esta espécie seja uma das espécies-chave presentes em diferentes regiões fitogeográficas que integram a DFA, fazem com que ela seja um excelente modelo para estudos de variação adaptativa. Dessa forma, a presente dissertação teve como objetivo o estudo da variação genética adaptativa em populações naturais de E. uniflora. Para isso, foram selecionados 30 genes candidatos envolvidos em diferentes vias de sinalização com as respostas ao estresse abiótico, através da análise do transcriptoma da folha de E. uniflora. As sequências desses genes foram amplificadas por PCR em 96 indivíduos provenientes de populações de ambientes contrastantes. Os fragmentos amplificados foram submetidos ao sequenciamento usando plataforma de Sequenciamento de Nova Geração para a identificação e genotipagem de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polimorphism). Após a análise do sequenciamento, um total de 381 SNPs, distribuídos em 16 genes foram identificados e genotipados em 84 indivíduos. A análise de FST outlier revelou dois loci sob seleção positiva, um no gene que codifica uma dehidrina e outro no gene que codifica uma Lea14-A, genes estes previamente reportados estarem envolvidos com estresse de resposta à seca em plantas. / The knowledge about the evolutionary history of a species is essential to gain insight into processes that contributed to the current patterns of distribution and diversity of this species. It involves the understanding of demographic history, population structure and also the mechanisms involved in local adaptation. In this context, advances in genomics and DNA sequencing technology are revolutionizing the understanding of the evolutionary history of the species, as they allow the development of high-throughput genotyping platforms, facilitating the use of multilocus analysis to identify genomic regions responsible for local adaptation. It also gives detailed insight into the demographic history and population structure. Furthermore, these data allow the identification of loci responsible for or associated with local adaptations and comprises adaptation strategies that enable some plants to survive in different environmental conditions. Eugenia uniflora L. is a species belonging to Myrtaceae family, wide distributed over the Atlantic Forest Domain (AFD). Popularly known as Pitanga or Brazilian-cherry, it is quite versatile and grows in distinct habitats, occurring as a shrub or small tree in sandy environments (Restinga) on the coastal plain near the ocean and as a tree in southern Brazil (riparian forest). These characteristics, combined with the fact that this species is one of the key species present in different phytogeographic regions of the AFD, make this species an excellent model for studies of adaptation. Thus, the present work aims to study the adaptive genetic variation in natural populations of E. uniflora. For this, we selected 30 candidate genes involved in different signaling pathways with the responses to abiotic stress by transcriptome analysis of E. uniflora. The sequences of these genes were amplified by PCR in 96 individuals from populations of different environments. The amplified fragments were subjected to sequencing using Next Generation Sequencing platform for the identification and genotyping of SNP markers (Single Nucleotide Polymorphism). After sequencing analysis, a total of 381 SNPs spread on 16 genes were identified and genotyped in 84 individuals. The FST outlier analysis revealed two loci under positive selection, one present in a gene encoding a dehydrin and another in a gene encoding a Lea14-A. These two genes were previously reported to be involved in drought stress response in plants.

Um dos principais reguladores da síntese proteica é o fator 2 do início da tradução de eucariotos (eIF2), formado por três subunidades não idênticas: a, β, e y. As funções citoplasmáticas da subunidade β, essenciais à integridade do processo, estão relacionadas à presença de dois domínios conservados: um deles composto por três blocos de seis a oito resíduos de lisinas e localizado na região amino terminal; e o outro constituído por quatro cisteínas que formam um motivo dedo de zinco localizado na região carboxiterminal. Em Saccharomyces cerevisiae, a expressão de eIF2β desprovido dos blocos de lisinas foi capaz de inibir o crescimento celular. Entretanto, até o momento não são relatados dados em células de mamíferos. Além de sua fundamental função na regulação do processo de síntese proteica no citoplasma, alguns estudos têm demonstrado que as três subunidades de eIF2 apresentam localização nuclear, mas essa também é uma questão ainda pouco explorada. Os resultados apresentados nessa tese mostram que a expressão de eIF2β desprovido dos blocos de lisinas causa uma redução acentuada na síntese proteica e, consequentemente, uma significativa diminuição da proliferação e viabilidade de células humanas. As análises da distribuição subcelular demonstram que eIF2β selvagem superexpresso está localizado no citoplasma, mas é capaz de translocar para o núcleo e acumular no nucléolo de maneira dependedente de ligação a RNA. Tanto os blocos de lisinas, quanto os resíduos de cisteínas mostram-se essenciais à retenção nucleolar de eIF2β. Além disso, sua exportação nuclear é mediada pela exportina CRM1 e é dependente de sua região amino terminal. Considerando os dados obtidos nesse trabalho, pode-se concluir que a ausência dos blocos de lisinas em eIF2β apresenta um efeito antiproliferativo em célula humanas e que a proteína eIF2β deve desempenhar funções no nucléolo relacionadas a algum processo que envolva ligação a RNA. Nesse contexto, podese observar também que, tal como o eIF2β, vários outros eIFs apresentam localização nuclear e participam em diferentes processos que ocorrem no núcleo, e que podem estar relacionados a um mecanismo de checagem da qualidade de mRNAs recém-sintetizados. Assim, os diferentes eIFs atuam em processos vitais à célula no núcleo e, nesse compartimento, também são importantes à regulação da expressão gênica. / The eukaryotic initiation factor 2 (eIF2) is one of the main regulatory molecules in the protein synthesis. It is composed by three non identical subunits a, β, and y: The cytoplasmic functions of the β subunit, that are essential to the integrity of the process, are related to the presence of two conserved domains: one of them composed of three stretches of six to eight lysine residues and located in the amino-terminal region, and the other consisting of four cysteines that form a zinc finger motif located in the carboxyl-terminal portion. In Saccharomyces cerevisiae, the expression of recombinant eIF2β without of the polylysine stretches was able to inhibit cell proliferation, however no data are reported in mammalian cells so far. Additionaly to its fundamental role in regulating the process of protein synthesis in the cytoplasm, some studies have shown that eIF2 may act in the nucleus, but this issue is also still underexplored. Our results indicate a strong reduction in protein synthesis and consequently a significant decrease in cell proliferation and viability when the eIF2β without polylysine stretches is expressed in human cells. Analysis of cellular distribution of eIF2β indicates that it is located in the cytoplasm, but can translocate to the nucleus and accumulate in the nucleolus in a RNA-dependent manner. Both polylysine stretches and cysteine residues are essential for nucleolar retention of this factor. The eIF2β nuclear exclusion is mediated by exportin CRM1 and is dependent of its amino-terminal region. In conclusion, the results presented here show that the absence of polylysine stretches in human eIF2β has an antiproliferative effect in human cells and that the eIF2β protein should play a role related to some processes involving RNA in the nucleolus. In this context, we can also observe that, like eIF2β, others eIFs also present nuclear localization and participate in different processes in the nucleus which can de related to proofreading mechanism of newly synthesized mRNAs. In this way, several eIFs play a role in vital cellular processes in the nucleus and, in this compartment they also are important to regulation of gene expression.