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Microbial Macroecology understanding microbial community pattems using phylogenetic and multivariate statistical tools

Barberán Torrents, Albert 07 September 2012 (has links)
El estudio de los microorganismos en cultivo puro ha propiciado el desarrollo de la genética, la bioquímica y la biotecnología. Sin embargo, la ecología ha permanecido reticente a incorporar a los microorganismos en su acervo teórico y experimental, principalmente debido a las dificultades metodológicas para observar a los microbios en la naturaleza, y como resultado de los caminos divergentes que han trazado las disciplinas de la microbiología y la ecología general. Esta tesis trata de demostrar que los patrones ecológicos de comunidades microbianas son susceptibles de ser analizados mediante la combinación de técnicas filogenéticas y herramientas de estadística multivariante. El uso de técnicas filogenéticas permite solventar, o al menos paliar, el hecho de la no independencia de los organismos vivos debido a la ascendencia común. Con la información ambiental adicional (como reflejo del determinismo abiótico) y la información espacial (como amalgama de eventos históricos y de dispersión), es posible explorar los posibles mecanismos que subyacen a la estructura y a la diversidad de las comunidades microbianas. / The study of microorganisms in pure laboratory culture has delivered fruitful insights into genetics, biochemistry and biotechnology. However, ecology has remained reluctant to incorporate microorganisms in its experimental and theoretical underpinnings mainly due to methodological difficulties in observing microorganisms in nature, and as a result of the different paths followed by the disciplines of microbiology and general ecology. In this dissertation, I argue that novel insights into microbial community patterns arise when phylogenetic relatedness are used in conjunction with multivariate statistical techniques in the context of broad scales of description.
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Applications of MALDI-TOF/MS combined with molecular imaging for breast cancer diagnosis

Chiang, Yi-Yan 26 July 2011 (has links)
The incidence of breast cancer became the most common female cancer, and the fourth cause of female cancer death. In this study, matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF/MS) have been combined with multivariate statistics to investigate breast cancer tissues and cell lines. Core needle biopsy and fine needle aspiration (FNA) are techniques largely applied in the diagnosis of breast cancer. In this study, we have established an efficient protocol for detecting breast tissue and FNA samples with MALDI-TOF/MS. With the help of statistical analysis software, we can find the lipid-derived ion signals which can be use to distinguish breast cancer tumor tissues from non-tumor parts. This strategy can differentiate normal and tumor tissue, which is potential to apply in clinical diagnoses. The analysis of breast cancer tissue is challenging as the complexity of the tissue sample. Direct tissue analyses by matrix-assisted laser desorption/ionization imaging mass spectrometry (MALDI-IMS) allows us to investigate the molecular structure and their distribution while maintaining the integrity of the tissue and avoiding the loss of signals from extraction steps. Combined MALDI-IMS with statistic software, tissues can be analyzed and classified based on their molecular content which is helpful to distinguish tumor regions from non-tumor regions of breast cancer tissue. Our result shows the differences in the distribution and content of lipids between tumor and non-tumor tissue which can be supplements of current pathological analysis in tumor margins. In this study, MALDI-TOF/MS combined with multivariate statistics were used to rapidly differentiate breast cancer cell lines with different estrogen receptor (ER) and human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) status. The protocol for efficiently detecting peptides and proteins in breast cancer cells with MALDI-TOF/MS was established, two multivariate statistics including principle component analysis (PCA) and hierarchical clustering analysis were used to process the obtaining MALDI mass spectra of six different breast cancer cell lines and one normal breast cell lines. Based on the difference of the peptide and protein profiles, breast cancer cell lines with same ER and HER-2 status were grouped in nearby region on the PCA score plot. The results of hierarchical cluster analysis also revealed high conformity between breast cancer cell protein profiles and respective hormone receptor types.
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Variation in wild stocks of the freshwater prawn Macrobrachium australiense (Holthuis, 1950): Environmental influence on external morphology.

Dimmock, Amanda January 2004 (has links)
Macrobrachium australiense is a common freshwater prawn found throughout most of eastern and inland Australia. Debate has been ongoing on the systematics of this species due to high morphological variation: past studies have relied on external morphology assessments to describe genetic relationships between populations. An individual's morphological phenotype results however, from an interplay of genetic factors, environmental, and interactions between genes and the environment. The current study examined the strength of genetic constraint on morphological traits in this species. Examination of over 1000 M. australiense museum specimens collected from across the species' extensive natural range, documented high phenotypic variation with no regional pattern of variation. Within regions, 88% of variation in morphological traits in mature males and juveniles was present between local rivers. Therefore, morphological variation is not structured at the regional level. If there is a strong genetic base to morphological variation then populations in a single river system must be evolving essentially in isolation. More intensive sampling within a single river system demonstrated high morphological variation in 600 M. australiense individuals from 18 populations within a geographically connected system. Populations separated by as little as 1km showed significant morphological differences in 50% of mature male traits. If morphological variation is primarily genetically based, then populations within a river system were evolving independently at a very fine spatial scale. This hypothesis was tested by breeding morphologically divergent populations of M. australiense in a controlled environment to isolate genetic influences on morphological variation. Low heritability for morphological traits in five divergent populations raised under identical environments established that there is no strict genetic control on morphological variation in these M. australiense populations. Morphologically homogenous offspring resulted from wild parents that had exhibited significant differences at 73% of traits examined. Therefore, the fundamental assumption that morphological variation in M. australiense is dictated by strict genetic control is not supported in these representative populations. Moreover, significant variation in 41% of morphological traits was produced by raising a single population at different environmental temperatures (28oC and 22 oC). A single homogenous stock of M. australiense should not produce morphologically divergent offspring if genetic factors are the major influence of phenotypic expression. Crossing of pure line divergent stocks resulted in hybrid offspring with significant differences in 50% of female morphological traits, whereas male offspring varied for only 31% of morphological traits. This result suggests that female morphological expression is affected more strongly by genetic factors than male offspring in this trial. The growth and maturation of external morphological traits during development in M. australiense is under limited genetic constraint, especially in the later phases of growth. Only 17% of traits varied between juvenile stocks in the last three months of development when individuals were exposed to identical environmental conditions. Maturation size was homogenous, except for females in the absence of maturing males in divergent stocks exposed to identical environmental conditions. Females were much larger in size and shape of morphological traits in the absence of mature males in the population. Thus environmental factors strongly influence phenotypic expression of external morphology in M. australiense. Past problems with the taxonomy of this species are therefore understandable as many important traits used in systematics appear to be under limited genetic control. Past evolutionary studies based on morphological diversity in this species therefore may be unreliable as the traits used to identify divergent forms may not provide a true reflection of genetic divergence.
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Caracterização do estado trófico e da qualidade da água de um sistema lagunar costeiro urbano: estudo de caso da Lagoa Rodrigo de Freitas, RJ. / Characterization of trophic state and water quality of an urban coastal lagoon ecosystem: case study of Lagoa Rodrigo de Freitas, RJ.

Rafael Rosas Oliveira 15 April 2013 (has links)
O estudo da dinâmica dos parâmetros físicos, químicos e biológicos da água em lagoas costeiras é essencial para entender o funcionamento destes ecossistemas; o que por sua vez permite o desenvolvimento de estratégias adequadas de gerenciamento e conservação de seus recursos. Neste estudo, analisou-se a qualidade da água da Lagoa Rodrigo de Freitas (Rio de Janeiro/RJ) e dos seus principais tributários. Foram utilizados os dados oriundos do projeto de monitoramento da qualidade da água realizado pela SMAC/RJ, entre dezembro de 2011 e dezembro de 2012. O objetivo precípuo foi compreender a dinâmica espacial e temporal da variação do estado trófico e da qualidade da água, assim como avaliar a exequibilidade e aplicabilidade de índices multimétricos (IQA, IET, ICE, IC, TRIX) ao projeto de monitoramento ambiental da LRF. Para tanto, foram realizadas coletas mensais e semanais da água superficial em cinco pontos amostrais, na LRF, e cinco pontos nos rios/canais. Em seguida, análises físico-químicas e biológicas foram realizadas. Os resultados obtidos mostraram relativa homogeneidade espacial e elevada variação sazonal da qualidade da água superficial. Os índices aplicados aos dados indicaram uma variação temporal representativa do estado trófico e da qualidade da água, sendo as classificações para os rios e canais diferentes às verificadas na LRF. Esta apresentou variação entre supereutrófica e hipereutrófica, já os primeiros foram mesotróficos. A qualidade da água da LRF apresentou majoritariamente entre moderada a boa. Os rios e canais foram classificados ruins e médios. Concluiu-se que diferentes modelos podem resultar em diferentes classificações de níveis de trofia e qualidade da água. Análises estatísticas de tendência indicaram estabilidade da qualidade da água, sem uma projeção representativa de melhoria da qualidade hídrica. Já análises multivariadas (RDA, PCA BEST, SIMPER, ANOSIM, MDS e CLUSTER) mostraram um elevado dinamismo da comunidade fitoplanctônica com nítida resposta às oscilações de variáveis físico-químicas específicas, apesar da dominância recorrente por cianobactérias. / The study of the dynamics of physical, chemical and biological parameters in coastal lagoons is essential to understand how these ecosystems function, which enables the development of appropriate strategies for management and conservation of its water resources. This research analyzed the water quality of the Rodrigo de Freitas lagoon (LRF), located in the city of Rio de Janeiro/RJ, and its main tributaries. Data from the Water Quality Monitoring Program conducted by Secretaria Municipal de Meio Ambiente do Rio de Janeiro between December 2011 and December 2012 were used. The main objective of this study is clarify the spatiotemporal dynamic of the variation of the trophic state and water quality of the LRF, and assess the applicability and feasibility of specific multimetric indices (IQA, IET, ICE, IC, TRIX). In order to achieving this goal, weekly and monthly surface water samplings were performed at five stations in the LRF and five stations in the rivers/channels. Physico-chemical and microbiological (bacteriological and phytoplankton) variables were analyzed in situ or in the laboratory. The results showed relative spatial homogeneity and high temporal variation of the water quality. The trophic state and water quality indices classified the rivers/channels as mostly mesotrophic and the LRF between supereutrophic and hypereutrophic. The water quality was classified between moderate to good in the LRF and medium and bad for the rivers/channels. It was concluded, therefore, that different assessment models may result in contradictory classifications of the trophic and and water quality conditions. Trend statistical analysis indicated stability of trophic conditions but without a representative prediction of improving water quality. Finally, it is emphasized that the multivariate statistical analysis (RDA, PCA BEST, SIMPER, ANOSIM, MDS and CLUSTER) demonstrated a high dynamism of the phytoplankton community in response to fluctuations in the physico-chemical characteristics, despite the recurrent dominance by cyanobacteria.
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Prédiction des performances énergétiques des bâtiments avec prise en compte du comportement des usagers / Buildings energy performance prediction including occupants' behaviours

Darakdjian, Quentin 05 July 2017 (has links)
L’amélioration continue de la performance énergétique des bâtiments a été accompagnée par un développement d’outils numériques de plus en plus performants et précis. Alors que la prise en compte des phénomènes liés aux bâtiments, aux systèmes et à la météorologie est bien maîtrisée, le comportement des occupants est modélisé de manière très simplifiée par des scénarii répétitifs et des lois déterministes. L’impact des occupants sur les consommations énergétiques dans les bâtiments performants est pourtant majeur, comme en témoigne les écarts récurrents entre les résultats prédits et mesurés. Le travail de thèse propose, par l’intermédiaire d’une plateforme multi-agents et de modèles stochastiques, une mise à jour de la prise en compte de la présence des occupants et de leurs comportements sur la gestion des ouvrants, des dispositifs d’occultation, de l’éclairage et de la température de consigne de chauffage. Le champ d’application de la plateforme concerne les bâtiments de bureaux et de logements, pour des opérations neuves et de rénovation. Les modèles de comportement des occupants sont idéalement issus de campagnes de mesures in situ, d’études de laboratoire ou d’enquêtes sociologiques. La plateforme proposée est alors co-simulée avec le logiciel EnergyPlus, afin d’étudier l’influence des modèles sur les performances énergétiques. Dans la perspective de garantie de performance énergétique, ce travail contribue à la mise à jour et à la fiabilisation des outils de prédiction. / Continuous improvement of the building energy performance is associated with the development of increasingly efficient and accurate numerical tools. While the consideration of phenomena related to buildings, systems and weather is well mastered, occupants’ behaviours are modelled in a very simplified way by repetitive scenarios and deterministic laws. The impact of occupants on energy consumption in high-performance buildings is dominant, as evidenced by the recurring gaps between predicted and measured results. The thesis demonstrates, via a multi-agent platform and stochastic models, an update on the ability to model occupants’ presence, their behaviours on windows, occultation devices, artificial lighting and heating setpoint temperatures. The application of the platform applies to office and residential buildings, for new builds and refurbishments. Occupants’ behaviour models are ideally obtained from in situ surveys, laboratory studies or sociological works. The suggested platform is then co-simulated with the EnergyPlus software, to study the influence of the models on a buildings energy performance. In the perspective of energy performance guarantees, this work contributes to the updating and reliability of prediction tools.
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Flavoromics de genótipos melhorados de mamão grupo solo: correlação entre o perfil de compostos voláteis e a qualidade sensorial / Flavoromics de genótipos melhorados de mamão grupo solo: correlação entre o perfil de compostos voláteis e a qualidade sensorial

Rocha, Renier Felinto Julião da January 2016 (has links)
ROCHA, Renier Felinto Julião da. Flavoromics de genótipos melhorados de mamão grupo solo: correlação entre o perfil de compostos voláteis e a qualidade sensorial. 2016. 79 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Tecnologia de Alimentos, Fortaleza-CE, 2016 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-05T14:44:47Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_rfjrocha.pdf: 1677317 bytes, checksum: d35b0af0203d344c70ae8754c126512b (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-05T14:45:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_rfjrocha.pdf: 1677317 bytes, checksum: d35b0af0203d344c70ae8754c126512b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T14:45:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_rfjrocha.pdf: 1677317 bytes, checksum: d35b0af0203d344c70ae8754c126512b (MD5) Previous issue date: 2016 / As variedades do mamão grupo Solo são susceptíveis a várias doenças que restringem o mercado dos frutos in natura. A Embrapa vem desenvolvendo genótipos resistentes buscando características agronômicas e sensoriais desejáveis. Assim, objetivou -se caracterizar o perfil de voláteis, compostos responsáveis pelo aroma e sabor dos alimentos, e a qualidade sensorial de genótipos do grupo Solo, visando identificar novos cultivares com potencial para lançamento no mercado. Foram analisados quatro genótipos melhorados (CPMF L47-P8, CPMF L60-08, CPMF L47-P5 e CPMF H54- 78) e uma variedade comercial (Sunrise).Para tanto, as condições de extração dos compostos pela técnica HS-SPME foram otimizadas usando um Delineamento Composto Central Rotacional (DCCR), baseado em Metodologia de Superfície de Resposta, com duas variáveis: tempo de equilíbrio (0 a 30 min) e tempo de exposição da fibra (20 a 60 min). As variáveis dependentes foram número de picos, área total e intensidade do aroma. Os voláteis foram extraídos com a fibra DVB/CAR/PDMS, separados e identificados por GC-MS. A análise sensorial foi realizada com consumidores de mamão, por meio de testes afetivos de aceitação global e aparência, diagnóstico de atributos (cor da polpa, aroma, sabor e textura) e intenção de compra. Os dados das análises de compostos voláteis foram submetidos à Análise de Componentes Principais (ACP) e Análise de Agrupamento Hierárquico (clusters), e os da análise sensorial foram submetidos à ANOVA e teste de Tukey. As duas matrizes de dados foram correlacionadas pela Regressão por Mínimos Quadrados Parciais (PLS). As melhores condições para a extração dos voláteis do mamão por HS-SPME foram 15 min de equilíbrio e 60 min de exposição da fibra. Nessas condições foram identificados 70 compostos voláteis, sendo os aldeídos os mais abundantes (em área), seguidos dos terpenos, ésteres, álcoois e lactonas. Os genótipos CPMF L60-08 e CPMF L47-P5 apresentaram perfis de voláteis semelhantes entre si e à variedade Sunrise, mas os genótipos CPMF H54-78 e CPMF L47-P8 apresentaram perfis de voláteis únicos. Quanto às características sensoriais, os genótipos CPMF L47-P8 e CPMF L47-P5 apresentaram-se semelhantes entre si, com textura mais firme e menor intensidade da cor da polpa, aroma e sabor que Sunrise, com menor aceitabilidade. O genótipo CPMF H54-78 apresentou boas características sensoriais na degustação, porém foi rejeitado quanto à aparência externa. O genótipo CPMF L60-08 apresentou alta similaridade com a variedade comercial e mesma aceitabilidade, apesar da cor da polpa menos intensa. Os resultados da correlação multivariada confirmam a superioridade do genótipo CPMF L60-08, o qual apresentou alta correlação com a variedade Sunrise e com os atributos sensoriais. O presente trabalho recomenda o genótipo CPMF L60-08 como o promissor para substituir a variedade Sunrise (não resistente a pragas e doenças), preservando o sabor e aroma característico de mamão. / As variedades do mamão grupo Solo são susceptíveis a várias doenças que restringem o mercado dos frutos in natura. A Embrapa vem desenvolvendo genótipos resistentes buscando características agronômicas e sensoriais desejáveis. Assim, objetivou-se caracterizar o perfil de voláteis, compostos responsáveis pelo aroma e sabor dos alimentos, e a qualidade sensorial de genótipos do grupo Solo, visando identificar novos cultivares com potencial para lançamento no mercado. Foram analisados quatro genótipos melhorados (CPMF L47-P8, CPMF L60-08, CPMF L47-P5 e CPMF H54-78) e uma variedade comercial (Sunrise). Para tanto, as condições de extração dos compostos pela técnica HS-SPME foram otimizadas usando um Delineamento Composto Central Rotacional (DCCR), baseado em Metodologia de Superfície de Resposta, com duas variáveis: tempo de equilíbrio (0 a 30 min) e tempo de exposição da fibra (20 a 60 min). As variáveis dependentes foram número de picos, área total e intensidade do aroma. Os voláteis foram extraídos com a fibra DVB/CAR/PDMS, separados e identificados por GC-MS. A análise sensorial foi realizada com consumidores de mamão, por meio de testes afetivos de aceitação global e aparência, diagnóstico de atributos (cor da polpa, aroma, sabor e textura) e intenção de compra. Os dados das análises de compostos voláteis foram submetidos à Análise de Componentes Principais (ACP) e Análise de Agrupamento Hierárquico (clusters), e os da análise sensorial foram submetidos à ANOVA e teste de Tukey. As duas matrizes de dados foram correlacionadas pela Regressão por Mínimos Quadrados Parciais (PLS). As melhores condições para a extração dos voláteis do mamão por HS-SPME foram 15 min de equilíbrio e 60 min de exposição da fibra. Nessas condições foram identificados 70 compostos voláteis, sendo os aldeídos os mais abundantes (em área), seguidos dos terpenos, ésteres, álcoois e lactonas. Os genótipos CPMF L60-08 e CPMF L47-P5 apresentaram perfis de voláteis semelhantes entre si e à variedade Sunrise, mas os genótipos CPMF H54-78 e CPMF L47-P8 apresentaram perfis de voláteis únicos. Quanto às características sensoriais, os genótipos CPMF L47-P8 e CPMF L47-P5 apresentaram-se semelhantes entre si, com textura mais firme e menor intensidade da cor da polpa, aroma e sabor que Sunrise, com menor aceitabilidade. O genótipo CPMF H54-78 apresentou boas características sensoriais na degustação, porém foi rejeitado quanto à aparência externa. O genótipo CPMF L60-08 apresentou alta similaridade com a variedade comercial e mesma aceitabilidade, apesar da cor da polpa menos intensa. Os resultados da correlação multivariada confirmam a superioridade do genótipo CPMF L60-08, o qual apresentou alta correlação com a variedade Sunrise e com os atributos sensoriais. O presente trabalho recomenda o genótipo CPMF L60-08 como o promissor para substituir a variedade Sunrise (não resistente a pragas e doenças), preservando o sabor e aroma característico de mamão.
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Caracterização do estado trófico e da qualidade da água de um sistema lagunar costeiro urbano: estudo de caso da Lagoa Rodrigo de Freitas, RJ. / Characterization of trophic state and water quality of an urban coastal lagoon ecosystem: case study of Lagoa Rodrigo de Freitas, RJ.

Rafael Rosas Oliveira 15 April 2013 (has links)
O estudo da dinâmica dos parâmetros físicos, químicos e biológicos da água em lagoas costeiras é essencial para entender o funcionamento destes ecossistemas; o que por sua vez permite o desenvolvimento de estratégias adequadas de gerenciamento e conservação de seus recursos. Neste estudo, analisou-se a qualidade da água da Lagoa Rodrigo de Freitas (Rio de Janeiro/RJ) e dos seus principais tributários. Foram utilizados os dados oriundos do projeto de monitoramento da qualidade da água realizado pela SMAC/RJ, entre dezembro de 2011 e dezembro de 2012. O objetivo precípuo foi compreender a dinâmica espacial e temporal da variação do estado trófico e da qualidade da água, assim como avaliar a exequibilidade e aplicabilidade de índices multimétricos (IQA, IET, ICE, IC, TRIX) ao projeto de monitoramento ambiental da LRF. Para tanto, foram realizadas coletas mensais e semanais da água superficial em cinco pontos amostrais, na LRF, e cinco pontos nos rios/canais. Em seguida, análises físico-químicas e biológicas foram realizadas. Os resultados obtidos mostraram relativa homogeneidade espacial e elevada variação sazonal da qualidade da água superficial. Os índices aplicados aos dados indicaram uma variação temporal representativa do estado trófico e da qualidade da água, sendo as classificações para os rios e canais diferentes às verificadas na LRF. Esta apresentou variação entre supereutrófica e hipereutrófica, já os primeiros foram mesotróficos. A qualidade da água da LRF apresentou majoritariamente entre moderada a boa. Os rios e canais foram classificados ruins e médios. Concluiu-se que diferentes modelos podem resultar em diferentes classificações de níveis de trofia e qualidade da água. Análises estatísticas de tendência indicaram estabilidade da qualidade da água, sem uma projeção representativa de melhoria da qualidade hídrica. Já análises multivariadas (RDA, PCA BEST, SIMPER, ANOSIM, MDS e CLUSTER) mostraram um elevado dinamismo da comunidade fitoplanctônica com nítida resposta às oscilações de variáveis físico-químicas específicas, apesar da dominância recorrente por cianobactérias. / The study of the dynamics of physical, chemical and biological parameters in coastal lagoons is essential to understand how these ecosystems function, which enables the development of appropriate strategies for management and conservation of its water resources. This research analyzed the water quality of the Rodrigo de Freitas lagoon (LRF), located in the city of Rio de Janeiro/RJ, and its main tributaries. Data from the Water Quality Monitoring Program conducted by Secretaria Municipal de Meio Ambiente do Rio de Janeiro between December 2011 and December 2012 were used. The main objective of this study is clarify the spatiotemporal dynamic of the variation of the trophic state and water quality of the LRF, and assess the applicability and feasibility of specific multimetric indices (IQA, IET, ICE, IC, TRIX). In order to achieving this goal, weekly and monthly surface water samplings were performed at five stations in the LRF and five stations in the rivers/channels. Physico-chemical and microbiological (bacteriological and phytoplankton) variables were analyzed in situ or in the laboratory. The results showed relative spatial homogeneity and high temporal variation of the water quality. The trophic state and water quality indices classified the rivers/channels as mostly mesotrophic and the LRF between supereutrophic and hypereutrophic. The water quality was classified between moderate to good in the LRF and medium and bad for the rivers/channels. It was concluded, therefore, that different assessment models may result in contradictory classifications of the trophic and and water quality conditions. Trend statistical analysis indicated stability of trophic conditions but without a representative prediction of improving water quality. Finally, it is emphasized that the multivariate statistical analysis (RDA, PCA BEST, SIMPER, ANOSIM, MDS and CLUSTER) demonstrated a high dynamism of the phytoplankton community in response to fluctuations in the physico-chemical characteristics, despite the recurrent dominance by cyanobacteria.
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Caracteriza??o de ?gua produzida na ind?stria de petr?leo para fins de descarte e otimiza??o do processo de separa??o ?leo/?gua / Characterization of produced water in the oil industry for disposal and optimization of oil water separation.

Carvalho, Patr?cia Cristina de Ara?jo Puglia de 17 March 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:01:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PatriciaCAPC_DISSERT.pdf: 2049685 bytes, checksum: 4c9ec78c3f529e6af4cdef29256d6275 (MD5) Previous issue date: 2011-03-17 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The oil industry has several segments that can impact the environment. Among these, produced water which has been highlight in the environmental problem because of the great volume generated and its toxic composition. Those waters are the major source of waste in the oil industry. The composition of the produced water is strongly dependent on the production field. A good example is the wastewater produced on a Petrobras operating unit of Rio Grande do Norte and Cear? (UO-RNCE). A single effluent treatment station (ETS) of this unit receives effluent from 48 wells (onshore and offshore), which leads a large fluctuations in the water quality that can become a complicating factor for future treatment processes. The present work aims to realize a diagnosis of a sample of produced water from the OU - RNCE in compliance to certain physical and physico-chemical parameters (chloride concentration, conductivity, dissolved oxygen, pH, TOG (oil & grease), nitrate concentration, turbidity, salinity and temperature). The analysis of the effluent is accomplished by means of a MP TROLL 9500 Multiparameter probe, a TOG/TPH Infracal from Wilks Enterprise Corp. - Model HATR - T (TOG) and a MD-31 condutivimeter of Digimed. Results were analyzed by univariated and multivariated analysis (principal component analysis) associated statistical control charts. The multivariate analysis showed a negative correlation between dissolved oxygen and turbidity (-0.55) and positive correlations between salinity and chloride (1), conductivity, chloride and salinity (0.70). Multivariated analysis showed there are seven principal components which can explain the variability of the parameters. The variables, salinity, conductivity and chloride were the most important variables, with, higher sampling variance. Statistical control charts have helped to establish a general trend between the physical and chemical evaluated parameters / A ind?stria do petr?leo possui v?rios segmentos que podem impactar o meio ambiente. Dentre eles, a ?gua de produ??o, tem ganhado destaque na problem?tica ambiental em virtude do grande volume gerado e de sua composi??o t?xica, sendo esta uma das maiores fontes de res?duos da ind?stria do petr?leo. A composi??o da ?gua de produ??o ? fortemente dependente do campo produtor. Um bom exemplo ? a ?gua produzida na Petrobras-Unidade Operacional do Rio Grande do Norte e Cear? (UO-RNCE). Uma ?nica ETE (Esta??o de Tratamento de Efluente) desta unidade recebe efluentes de 48 po?os (onshore e offshore) o que leva a grandes varia??es na qualidade da ?gua resultando em um complicador aos futuros processos de tratamento.O presente trabalho tem como objetivo realizar um diagn?stico de uma amostra da ?gua produzida proveniente da UO RNCE em observ?ncia a determinados par?metros f?sicos e f?sico-qu?micos (concentra??o em cloreto, condutividade, oxig?nio dissolvido, pH, TOG (Teor de ?leos e graxas), concentra??o em nitrato, turbidez, salinidade e temperatura). A an?lise do efluente foi realizada por meio de uma Sonda Multiparam?trica modelo MP TROLL 9500, atrav?s do Infracal TOG/TPH da Wilks Enterprise Corp Modelo HATR T (TOG) e ainda fazendo uso do condutiv?metro da Digimed, MD 31. Os dados foram tratados atrav?s de an?lise estat?stica univariada e multivariada (an?lise de componentes principais) associada os gr?ficos de controle estat?stico. A an?lise estat?stica multivariada mostrou correla??es negativas entre oxig?nio dissolvido e turbidez (-0,55) e correla??es positivas entre salinidade e cloreto (1), condutividade, cloreto e salinidade (0,70). A an?lise multivariada indicou os sete componentes principais que podem explicar a variabilidade dos par?metros. As vari?veis, salinidade, cloreto e condutividade foram as vari?veis mais importantes, ou seja, de maior vari?ncia amostral. Com gr?ficos de controle estat?stico foi poss?vel estabelecer uma tend?ncia geral entre os par?metros f?sico-qu?micos avaliados
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Flavoromics de genÃtipos melhorados de mamÃo grupo solo: correlaÃÃo entre o perfil de compostos volÃteis e a qualidade sensorial / Flavoromics de genÃtipos melhorados de mamÃo grupo solo: correlaÃÃo entre o perfil de compostos volÃteis e a qualidade sensorial

Renier Felinto JuliÃo da Rocha 21 March 2016 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / As variedades do mamÃo grupo Solo sÃo susceptÃveis a vÃrias doenÃas que restringem o mercado dos frutos in natura. A Embrapa vem desenvolvendo genÃtipos resistentes buscando caracterÃsticas agronÃmicas e sensoriais desejÃveis. Assim, objetivou-se caracterizar o perfil de volÃteis, compostos responsÃveis pelo aroma e sabor dos alimentos, e a qualidade sensorial de genÃtipos do grupo Solo, visando identificar novos cultivares com potencial para lanÃamento no mercado. Foram analisados quatro genÃtipos melhorados (CPMF L47-P8, CPMF L60-08, CPMF L47-P5 e CPMF H54-78) e uma variedade comercial (Sunrise). Para tanto, as condiÃÃes de extraÃÃo dos compostos pela tÃcnica HS-SPME foram otimizadas usando um Delineamento Composto Central Rotacional (DCCR), baseado em Metodologia de SuperfÃcie de Resposta, com duas variÃveis: tempo de equilÃbrio (0 a 30 min) e tempo de exposiÃÃo da fibra (20 a 60 min). As variÃveis dependentes foram nÃmero de picos, Ãrea total e intensidade do aroma. Os volÃteis foram extraÃdos com a fibra DVB/CAR/PDMS, separados e identificados por GC-MS. A anÃlise sensorial foi realizada com consumidores de mamÃo, por meio de testes afetivos de aceitaÃÃo global e aparÃncia, diagnÃstico de atributos (cor da polpa, aroma, sabor e textura) e intenÃÃo de compra. Os dados das anÃlises de compostos volÃteis foram submetidos à AnÃlise de Componentes Principais (ACP) e AnÃlise de Agrupamento HierÃrquico (clusters), e os da anÃlise sensorial foram submetidos à ANOVA e teste de Tukey. As duas matrizes de dados foram correlacionadas pela RegressÃo por MÃnimos Quadrados Parciais (PLS). As melhores condiÃÃes para a extraÃÃo dos volÃteis do mamÃo por HS-SPME foram 15 min de equilÃbrio e 60 min de exposiÃÃo da fibra. Nessas condiÃÃes foram identificados 70 compostos volÃteis, sendo os aldeÃdos os mais abundantes (em Ãrea), seguidos dos terpenos, Ãsteres, Ãlcoois e lactonas. Os genÃtipos CPMF L60-08 e CPMF L47-P5 apresentaram perfis de volÃteis semelhantes entre si e à variedade Sunrise, mas os genÃtipos CPMF H54-78 e CPMF L47-P8 apresentaram perfis de volÃteis Ãnicos. Quanto Ãs caracterÃsticas sensoriais, os genÃtipos CPMF L47-P8 e CPMF L47-P5 apresentaram-se semelhantes entre si, com textura mais firme e menor intensidade da cor da polpa, aroma e sabor que Sunrise, com menor aceitabilidade. O genÃtipo CPMF H54-78 apresentou boas caracterÃsticas sensoriais na degustaÃÃo, porÃm foi rejeitado quanto à aparÃncia externa. O genÃtipo CPMF L60-08 apresentou alta similaridade com a variedade comercial e mesma aceitabilidade, apesar da cor da polpa menos intensa. Os resultados da correlaÃÃo multivariada confirmam a superioridade do genÃtipo CPMF L60-08, o qual apresentou alta correlaÃÃo com a variedade Sunrise e com os atributos sensoriais. O presente trabalho recomenda o genÃtipo CPMF L60-08 como o promissor para substituir a variedade Sunrise (nÃo resistente a pragas e doenÃas), preservando o sabor e aroma caracterÃstico de mamÃo. / As variedades do mamÃo grupo Solo sÃo susceptÃveis a vÃrias doenÃas que restringem o mercado dos frutos in natura. A Embrapa vem desenvolvendo genÃtipos resistentes buscando caracterÃsticas agronÃmicas e sensoriais desejÃveis. Assim, objetivou -se caracterizar o perfil de volÃteis, compostos responsÃveis pelo aroma e sabor dos alimentos, e a qualidade sensorial de genÃtipos do grupo Solo, visando identificar novos cultivares com potencial para lanÃamento no mercado. Foram analisados quatro genÃtipos melhorados (CPMF L47-P8, CPMF L60-08, CPMF L47-P5 e CPMF H54- 78) e uma variedade comercial (Sunrise).Para tanto, as condiÃÃes de extraÃÃo dos compostos pela tÃcnica HS-SPME foram otimizadas usando um Delineamento Composto Central Rotacional (DCCR), baseado em Metodologia de SuperfÃcie de Resposta, com duas variÃveis: tempo de equilÃbrio (0 a 30 min) e tempo de exposiÃÃo da fibra (20 a 60 min). As variÃveis dependentes foram nÃmero de picos, Ãrea total e intensidade do aroma. Os volÃteis foram extraÃdos com a fibra DVB/CAR/PDMS, separados e identificados por GC-MS. A anÃlise sensorial foi realizada com consumidores de mamÃo, por meio de testes afetivos de aceitaÃÃo global e aparÃncia, diagnÃstico de atributos (cor da polpa, aroma, sabor e textura) e intenÃÃo de compra. Os dados das anÃlises de compostos volÃteis foram submetidos à AnÃlise de Componentes Principais (ACP) e AnÃlise de Agrupamento HierÃrquico (clusters), e os da anÃlise sensorial foram submetidos à ANOVA e teste de Tukey. As duas matrizes de dados foram correlacionadas pela RegressÃo por MÃnimos Quadrados Parciais (PLS). As melhores condiÃÃes para a extraÃÃo dos volÃteis do mamÃo por HS-SPME foram 15 min de equilÃbrio e 60 min de exposiÃÃo da fibra. Nessas condiÃÃes foram identificados 70 compostos volÃteis, sendo os aldeÃdos os mais abundantes (em Ãrea), seguidos dos terpenos, Ãsteres, Ãlcoois e lactonas. Os genÃtipos CPMF L60-08 e CPMF L47-P5 apresentaram perfis de volÃteis semelhantes entre si e à variedade Sunrise, mas os genÃtipos CPMF H54-78 e CPMF L47-P8 apresentaram perfis de volÃteis Ãnicos. Quanto Ãs caracterÃsticas sensoriais, os genÃtipos CPMF L47-P8 e CPMF L47-P5 apresentaram-se semelhantes entre si, com textura mais firme e menor intensidade da cor da polpa, aroma e sabor que Sunrise, com menor aceitabilidade. O genÃtipo CPMF H54-78 apresentou boas caracterÃsticas sensoriais na degustaÃÃo, porÃm foi rejeitado quanto à aparÃncia externa. O genÃtipo CPMF L60-08 apresentou alta similaridade com a variedade comercial e mesma aceitabilidade, apesar da cor da polpa menos intensa. Os resultados da correlaÃÃo multivariada confirmam a superioridade do genÃtipo CPMF L60-08, o qual apresentou alta correlaÃÃo com a variedade Sunrise e com os atributos sensoriais. O presente trabalho recomenda o genÃtipo CPMF L60-08 como o promissor para substituir a variedade Sunrise (nÃo resistente a pragas e doenÃas), preservando o sabor e aroma caracterÃstico de mamÃo.
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Zebrafish como organismo-modelo para análises de efeitos comportamentais e toxicológicas da cetamina empregando cromatografia em fase gasosa e estatística multivariada / Zebrafish as an organism-model for analysis of behavioral effects and toxicological analysis of ketamine employing gas chromatography and multivariate statistics

Eduardo Geraldo de Campos 11 March 2016 (has links)
A cetamina é uma droga amplamente utilizada e o seu uso inadequado tem sido associado à graves consequências para a saúde humana. Embora as propriedades farmacológicas deste agente em doses terapêuticas sejam bem conhecidas, existem poucos estudos sobre os efeitos secundários induzidos por doses não-terapêuticas, incluindo os efeitos nos estados de ansiedade e agressividade. Neste contexto, os modelos animais são uma etapa importante na investigação e elucidação do mecanismo de ação a nível comportamental. O zebrafish (Danio rerio) é um novo organismo-modelo, interessante e promissor, uma vez que apresenta alta similaridade fisiológica, genética e neuroquímica com seres humanos, respostas comportamentais bem definidas e rápida absorção de compostos de interesse em meio aquoso além de apresentar uma série de vantagens em relação aos modelos mamíferos tais como manutenção de baixo custo, prática e executável em espaços reduzidos. Nesse sentido, faz-se necessário a execução de ensaios comportamentais em conjunto com análises estatísticas robustas e rápidas tais como ANOVA e Métodos Multivariados; e também o desenvolvimento de métodos analíticos sensíveis, precisos e rápidos para determinação de compostos de interesse em matrizes biológicas provenientes do animal. Os objetivos do presente trabalho foram a investigação dos efeitos da cetamina sobre a ansiedade e a agressividade em zebrafish adulto empregando Testes de Claro-Escuro e Testes do Espelho e métodos estatísticos univariados (ANOVA) e multivariados (PCA, HCA e SIMCA) assim como o desenvolvimento de método analítico para determinação da cetamina em matriz biológica proveniente do animal, empregando Extração Líquido-Líquido e Cromatografia em Fase Gasosa acoplada ao Detector de Nitrogênio-Fósforo (GC-NPD). Os resultados comportamentais indicaram que a cetamina produziu um efeito significativo dose-dependente em zebrafish adulto na latência à área clara, no número de cruzamentos entre as áreas e no tempo de exploração da área clara. Os resultados das análises SIMCA e PCA mostraram uma maior similaridade entre o grupo controle e os grupos de tratamento expostos às doses mais baixas (5 e 20 mg L-1) e entre os grupos expostos às doses de 40 e 60 mg L-1. Na análise por PCA, dois componentes principais responderam por 88,74% de toda a informação do sistema, sendo que 62,59% da informação cumulativa do sistema foi descrito pela primeira componente principal. As classificações HCA e SIMCA seguiram uma evolução lógica na distribuição das amostras por classes. As doses mais altas de cetamina induziram uma distribuição mais homogênea das amostras enquanto as doses mais baixas e o controle resultaram em distribuições mais dispersas. No Teste do Espelho, a cetamina não induziu efeitos significativos no comportamento dos animais. Estes resultados sugerem que a cetamina é modulador de comportamentos ansiosos, sem efeitos indutores de agressividade. Os resultados da validação do método cromatográfico indicaram uma extração com valores de recuperação entre 33,65% e 70,89%. A curva de calibração foi linear com valor de R2 superior a 0,99. O limite de detecção (LOD) foi de 1 ng e o limite de quantificação (LOQ) foi de 5 ng. A exatidão do método cromatográfico manteve-se entre - 24,83% e - 1,258%, a precisão intra-ensaio entre 2,67 e 14,5% e a precisão inter-ensaio entre 1,93 e 13,9%. / Ketamine is a widely used drug and its inappropriate use has been associated with serious consequences for human health. Although the pharmacological properties of this agent in therapeutic doses are well known, there are few studies about the side effects induced at non-therapeutic doses, including the effects on states of anxiety and aggression. In this context, animal models are an important step in the investigation and elucidation of the mechanism of action at the behavioral level. The zebrafish (Danio rerio) is a new organism model, interesting and promising, since it presents high physiological, genetics and neurochemistry similarity in relation to humans, well-defined behavioral responses and rapid absorption of interesting compounds in an aqueous medium, apart from presents several advantages over mammalian models such as practical, low cost maintenance and executable in reduced spaces. In this sense, it is necessary to perform behavioral tests in conjunction with robust and rapid statistical analysis such as ANOVA and multivariate methods; and also the development of sensitive, accurate and rapid analytical methods to determination of compounds of interest in biological matrices from the animal. The objectives of this study were to investigate the effects of ketamine on anxiety and aggression in adult zebrafish using Light-Dark and Mirror Biting tests and univariate (ANOVA) and multivariate (PCA, HCA and SIMCA) statistical methods and to develop an analytical method for determination of ketamine in biological animal matrices using Liquid-Liquid Extraction and Gas Chromatography coupled with Nitrogen-Phosphorus Detector (GC-NPD). The behavioral results of Light-Dark Test indicated that ketamine produced a significant dose-dependent response in the latency to light area, in the number of midline crossings and in the time spent in light area. Results of SIMCA and PCA analysis showed a greater similarity between the control group and treatment groups exposed to lower doses (5 and 20 mg L-1) and between the treatment groups at doses of 40 and 60 mg L-1. In the analysis PCA, two principal components accounted for 88,74% of all the system information and 62,59% of the cumulative information of the system were described for the first principal component. The HCA and SIMCA results showed a logical evolution in the distribution of samples per class. The higher dose of ketamine induced a more homogeneous distribution of the samples while the lower doses and control resulted in more dispersed distribution. In the Mirror Test, ketamine induced no significant effect on the behavior of animals. These results suggest that ketamine is a modulator of anxious behavior without inducing aggressive effects. The results of the validation of chromatographic method indicated an extraction with recovery ranged between 33,65% to 70,89%. Calibration curve was linear with R2 value higher than 0,99. The limit of detection (LOD) was 1 ng and the limit of quantification (LOQ) was 5 ng. The accuracy of gas chromatographic method ranged between - 24,83% and - 1,258%, intra-assay precision between 2,67 and 14,5% and inter-assay precision between 1,93 and 13,9%.

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