Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-04-06T17:05:06Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-dissertação-EvônioBarrosCampeloJunior.pdf: 1895687 bytes, checksum: 45a651f79dfdcc2ce3328e3201f91911 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-06T17:05:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-dissertação-EvônioBarrosCampeloJunior.pdf: 1895687 bytes, checksum: 45a651f79dfdcc2ce3328e3201f91911 (MD5) Previous issue date: 2012-12-27 / Desde 1967, momento do seu surgimento no mundo científico, o GB vírus C (GBV-C) permanece conhecido como vírus indolente, todavia não obstante,pesquisas têm reveladoadespeito da ausência de vinculação do GBV-C com alguma doença, que a associação entre o GBV-C e HIV promove uma progressão mais lenta na doença pelo HIV em indivíduos coinfectados. Essa interaçãoteriacomo mecanismo a competição com o vírus da imunodeficiência humana (HIV) na ligação aos correceptores CCR5 e CXCR4 edessa formatem sidoobjeto de análise com intuito de promover a compreensão da dinâmica imunológica do HIV. Portanto, admitindoaimportância do GBV-C na pandemia de HIV/aids, esse trabalho determinou a prevalência da infecção pelo GBV-Cem pessoas vivendo com HIV/aids acompanhadas noServiço de Doenças Infecciosas e Parasitárias do HC-UFPE, verificou o perfil sócio-demográficoda população, identificou fatores de riscoe fez a associação entre a contagem de linfócitos TCD4 e a infecção peloGBV-C.Representou um estudode corte transversal, analisado como caso-controle, no qual a presença do GBV-C RNA foi investigada em249 pessoas vivendo com HIV/aids, de acordo com a demanda espontânea do ambulatório de Doenças Infecciosas e Parasitárias HC-UFPE,no período de junho adezembro de 2011 e que preenchiam os critérios de inclusão. Foram coletadas amostras de sangue de cada participante, os quais também assinaram um termo de consentimento livre e esclarecido e responderam questionário elaborado especificamente para a pesquisa. Adetecção do RNA do GBV-C foi realizado por PCR (Reação em CadeiadaPolimerase).O resultado da pesquisa indicou uma prevalência de 24,3%, compatível com outros estudos nacionais e internacionais,indicou o perfil sócio-demográfico, apontoua via parenteral como a mais prevalente na infecção pelo GBV-Ceassociou a contagem de linfócitos T CD4 e a infecção peloGBV-C,em pessoas vivendo com HIV/aids na fase inicial da infecção. Também a discussão apontou a necessidade de realização de trabalhos de coorte para melhor compreensão de fatores implicados na transmissão do GBV-C. / Since 1967, the time of its emergence in the scientific world, the GB virus C (GBV-C) virus remains known as indolent, but nevertheless, research has revealed despite the absence of binding of GBV-C with some disease, the association between GBV-C and HIV promotes a slower progression in HIV disease in coinfected individuals. This interaction mechanism would compete with the human immunodeficiency virus (HIV) in binding to CCR5 and CXCR4coreceptorsand thus has been the subject of analysis in order to promote understanding of the dynamics of HIV immune.Therefore, admitting the importance of GBV-C in the HIV/AIDS pandemic, this study estimated the prevalence of GBV-C infection in people living with HIV/AIDS followed in the Service of Infectious and Parasitic HC-UFPE, there the socio-demographic profile of the population, identified risk factors and made the association between CD4 count and GBV-C infection.Represented a cross-sectional study, analyzed as case-control study in which the presence of GBV-C RNA was investigated in 249 people living with HIV/AIDSat the outpatient of Infectious and Parasitic Diseases HC-UFPE, between June and December 2011 and who met the inclusion criteria. Blood samples were collected from each participant, who also signed a consent form and a questionnaire developed specifically for research. Detection of GBV-C RNA was performed by PCR (Polymerase Chain Reaction).The result of the survey indicated a prevalence of 24.3%, consistent with other national and international studies, said the socio-demographic profile, pointed the parenteral route as the most prevalent in the GBV-C infection and associated with CD4 count and GBV-C infection in people living with HIV/AIDS in the early phase of infection. Also the discussion pointed to the need to perform cohort studiesto better understand the factorsinvolvedinthe transmission of GBV-C.

Orientadores: Florencio Cecilia Menegal, Miriam Dupas Hubinger / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-23T11:20:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kajiyama_Tatumi_D.pdf: 11072315 bytes, checksum: 44e34c5235e84badcd3e2981ddcb6ef0 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: Este trabalho objetivou simular e avaliar o desempenho de secadores de leito deslizante concorrente, contracorrente e misto. Para tanto, foi melhorado e utilizado o "software" desenvolvido por HUBINGER (1994). As avaliações foram feitas em nível de consumo energético e preservação de qualidade do produto final seco. Estudaram-se como índice de qualidade as perdas de ácido ascórbico e o escurecimento não-enzimático. As pesquisas foram feitas em 4 etapas e são apresentadas nos capítulos de II a V desta tese. Em primeiro plano, no capítulo II, estão apresentados o estudo da simulação, desempenho e otimização energética de um secador misto. A secagem foi simulada com proteína texturizada de soja tipo R-NR 3007 da Nutrimental. É uma pesquisa que deu continuidade aos trabalhos de TELIS (1988), TELIS & MENEGALLI (1988), HUBINGER (1994), HUBINGER & MENEGALLI (1989, 1992a, 1992b, 1993, 1994). Dos estudos realizados concluiu-se que a eficiência térmica no secador é máxima quando os valores adotados da temperatura de entrada de ar no secador e a vazão de ar na secção contracorrente são menores e o comprimento na secção contracorrente é máxima dentro das faixas de condições de operação estudadas. A exposição do capítulo m é o resultado do estudo enfocado na influência da cinética de secagem sobre a eficiência energética. O secador neste item foi misto e o produto, proteína texturizada de soja. Foi estudada também a influência da taxa de secagem sobre o tamanho do secador. O estudo mostrou que a eficiência térmica do processo independe da natureza do sólido, ou seja de sua cinética de secagem mantidos a vazão de sólido e o grau de secagem para condições operacionais fixas desde que varie o comprimento do secador proporcionalmente a esta nova constante cinética. Nos capítulos IV e V estão apresentados os estudos de 3 tipos de secadores, tendo como produto um "alimento-modelo". Estudaram-se a destruição de ácido ascórbico e o escurecimento não-enzimático. Comparou-¬se o desempenho dos secadores em termos de perdas de qualidade e energia térmica. As degradações do ácido ascórbico e escurecimento não-enzimático são menores para as temperaturas de entrada de ar e vazões de ar no secador mais baixas e independem das vazões de ar de reciclo nos três tipos de secadores estudados. O secador concorrente apresentou os melhores índices de retenção de qualidade e o contracorrente a pior performance nesse sentido. O secador misto apresentou nas condições ótimas de operação, melhor desempenho na eficiência térmica, desempenho próximo ao de secador concorrente nas perdas de ácido ascórbico, desempenho intermediário no escurecimento não-enzimático entre concorrente e contracorrente. A produtividade do secador misto foi 1,85 vezes maior que os concorrente e contracorrente. Tem a desvantagem do sistema ser mais complexo na construção que concorrente e contracorrente / Abstract: The subject of the present research is to simulate and evaluate the perfomance of moving bed dryers with the following flow configurations: counter-current, concurrent and mixed flow. Operation conditions consisted of different inlet air temperatures, air recycle ratio, air flow rate and length of the dryer. The research is presented in 4 parts, from Chapter II to V of this thesis. Firstly in Chapter II, simulation, performance and energy optimization of mixed flow dryer are presented. The drying was simulated for texturized soybean protein. The study of drying kinetic influence over energy eficiency has been presented in Chapter III, as well as the influence over the size of the dryer. Three kinds of dryers are presented in Chapter IV and V, having as a product a "model" food. Ascorbic acid destruction and browning have been studied and the performance of dryers concerning quality indexes and thermal energy have also been compared / Doutorado / Doutor em Engenharia de Alimentos

Orientadores: Pedro Luis Onofrio Volpe, Marcia Miguel Castro Ferreira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-26T20:54:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Antunes_AlexandreMartinez_D.pdf: 6666519 bytes, checksum: 416fbaf9897c156af205245c6247a048 (MD5) Previous issue date: 2000 / Doutorado

Foram preparados eletrocatalisadores PtRu/C e PtSn/C utilizando feixe de elétrons para a redução dos íons metálicos em solução. Neste procedimento submeteu-se ao feixe de elétrons, sob agitação, soluções de água/etileno glicol (EG) e água/2- propanol, ambas contendo íons dos metais precursores e o suporte de carbono. Foram variadas as razões volumétricas água/2-propanol e água/etileno glicol, a razão atômica entre os metais, o tempo de irradiação e a taxa de dose. Os eletrocatalisadores obtidos foram caracterizados por análise de raios X por energia dispersiva (EDX), por difração de raios X (DRX), por voltametria cíclica (VC) e por espectroscopia Mössbauer. A atividade destes eletrocatalisadores na oxidação eletroquímica do metanol e do etanol foi avaliada por voltametria cíclica e cronoamperometria, utilizando a técnica do eletrodo de camada fina porosa, e pelas curvas de polarização obtidas em células a combustível unitárias operando diretamente com metanol e etanol. Os eletrocatalisadores PtRu/C preparados no meio reacional água/etileno glicol(EG) apresentaram razões atômicas diferentes das razões atômicas nominais. Os resultados sugerem que parte dos íons Ru(III) presentes no meio reacional não foram reduzidos. Os materiais obtidos apresentaram a fase cúbica de face centrada (cfc) da Pt e suas ligas e tamanhos de cristalito na faixa de 2 a 3 nm. Os eletrocatalisadores PtRu/C preparados em água/2- propanol apresentaram razões atômicas Pt:Ru similares às razões nominais. Os materiais obtidos apresentaram as fases cfc da platina e suas ligas e tamanhos de cristalito entre 3 e 4 nm. Os eletrocatalisadores PtSn/C preparados no meio reacional água/EG e água/2-propanol apresentaram razões atômicas Pt:Sn similares às razões nominais. Os materiais obtidos apresentaram as fases cfc da platina com tamanho de cristalitos na faixa de 2 a 4 nm e SnO2 (cassiterita). Os estudos sobre a oxidação eletroquímica de metanol e etanol mostraram que foi possível obter materiais com atividades similares e/ou superiores às atividades dos eletrocatalisadores comerciais PtRu/C (E-TEK) e PtSn/C (BASF), tidos como referência na área. / PtRu/C and PtSn/C electrocatalysts were prepared using electron beam irradiation. The metal ions were dissolved in water/2-propanol and water/ethylene glycol solutions and the carbon support was added. The resulting mixtures were irradiated under stirring. The effect of water/ethylene glycol and water/2-propanol (v/v) ratio, Pt:Ru and Pt:Sn atomic ratios, the irradiation time and dose rate were studied. The obtained materials were characterized by Energy dispersive analysis of X-rays (EDX), X-ray diffraction (XRD), cyclic voltammetry (CV) and Mössbauer spectroscopy. The electro-oxidation of methanol and ethanol were studied by cyclic voltammetry and chronoamperometry using the thin porous coating technique. The electrocatalysts were also tested on the Direct Methanol and Ethanol Fuel Cells. PtRu/C electrocatalysts prepared in water/ethylene glycol showed Pt:Ru atomic ratios different from the nominal ones. The results suggested that part of the Ru(III) ions were not reduced. The obtained materials showed the face-centered cubic (fcc) structure of Pt and Pt alloys with crystallite sizes of 2-3 nm. PtRu/C electrocatalysts prepared in water/2-propanol showed Pt:Ru atomic ratios similar to the nominal ones. The obtained materials also showed the fcc structure of platinum and platinum alloys with crystallite sizes of 3-4 nm. PtSn/C electrocatalysts prepared in water/ethylene glycol and water/2-propanol showed Pt:Sn atomic ratios similar to the nominal ones. The obtained materials showed the platinum (fcc) phase with crystallite sizes in the range of 2 - 4 nm and a SnO2 (cassiterite) phase. The obtained PtRu/C and PtSn/C electrocatalysts showed similar or superior performance for methanol and ethanol electro-oxidation compared to commercial PtRu/C (E-TEK) and PtSn/C (BASF) electrocatalysts.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:01:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3788_1.pdf: 702720 bytes, checksum: bc4a0f4ac532f594aa3c60b71c963230 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nesta dissertação trabalhamos com três classes de distribuições de probabilidade, sendo uma já conhecida na literatura, a Classe de Distribuições Generalizadas Beta (Beta-G) e duas outras novas classes introduzidas nesta tese, baseadas na composição das distribuições Pareto e Weibull com a classe de distribuições discretas power series. Fazemos uma revisão geral da classe Beta-G e introduzimos um caso especial, a distribuição beta logística generalizada do tipo IV (BGL(IV)). Introduzimos distribuições relacionadas `a BG L(IV) que tamb´em pertencem `a classe Beta-G, como a beta-beta prime e a beta-F. Introduzimos a classe Pareto power series (PPS), que ´e uma mistura de distribui¸c oes Pareto com pesos definidos pela distribui¸c ao power series, e apresentamos algumas de suas propriedades. Introduzimos a classe Weibull power series (WPS), cujo processo de constru¸c ao ´e similar ao da classe PPS. Apresentamos algumas de suas propriedades e aplica¸c ao a um banco de dados reais. Distribui¸c oes nesta classe t em aplica¸c ao interessante a dados de tempo de vida devido `a variedade de formas da fun¸c ao de risco. Para as classes PPS e WPS, fizemos uma simula ¸c ao para avaliar m´etodos de sele¸c ao de modelo. A distribui¸c ao pareto ´e um caso especial limite da distribui¸c ao PPS, assim como a distribui¸c ao Weibull ´e um caso especial limite da distribui¸c ao WPS.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:06:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6325_1.pdf: 625989 bytes, checksum: 2ffe5c1286d5c1c844743745a64ab8d3 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Cromossomos meióticos e mitóticos de Zophobas aff. confusus e Nyctobates gigas (Tenebrionidae) foram estudados através de coloração convencional, bandeamento C, coloração com nitrato de prata e os fluorocromos CMA3 e DAPI. Zophobas aff. confusus apresentou 2n=20 (9+Xyp) e cromossomos meta-submetacêntricos. Nyctobates gigas exibiu 2n=18 (8+neoXY) e cromossomos metacêntricos, submetacêntricos e acrocêntricos. O bandeamento C revelou grandes blocos de heterocromatina constitutiva (HC) pericentroméricos em todos os cromossomos de ambas as espécies. Contudo, os resultados obtidos com o CMA3 e com o DAPI revelaram variação interespecífica quanto à composição da HC. Os dois fluorocromos marcaram a HC de Z. aff. confusus, entretanto o DAPI apresentou uma coloração mais brilhante. Os blocos CMA3 pericentroméricos de N. gigas foram de tamanhos similares àqueles detectados pelo bandeamento C. Blocos DAPI não foram detectados nessa espécie. A coloração com nitrato de prata revelou uma RON localizada no bivalente Xyp de Z. aff. confusus e uma RON autossômica em N. gigas. Na primeira espécie o bivalente sexual mostrou marcação durante a prófase I da meiose até a metáfase I. A prata também marcou as regiões de HC em N. gigas

Orientadores: Nelson Adami Andreollo, Rachel Lewinsohn / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-24T21:46:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ramos_AlminoCardoso_M.pdf: 4903090 bytes, checksum: 6057a2c23cba847dee93e93e3d5e7dbe (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: O câncer é atualmente a segunda causa de morte nos países desenvolvidos. Embora tenham sido obtidos alguns avanços no seu tratamento, o prognóstico da doença ainda está longe de ser satisfatório. Apesar do câncer de esôfago não estar entre os mais freqüentes, sendo a quarta neoplasia que mais acomete o aparelho digestivo do homem, seu estudo é muito importante, principalmente por duas razões: atinge as pessoas numa das funções mais importantes para a manutenção da vida, a nutrição; e as taxas de incidência são muito similares às de mortalidade, demonstrando a ineficiência do tratamento. A melhora desta realidade pode ser conseguida de duas maneiras: diagnóstico e tratamento precoce e prevenção. Assim, a procura de substâncias que possam interferir na carcinogênese, impedindo o aparecimento de tumores, parece ser uma idéia atrativa. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da vitamina C na inibição da carcinogênese esofágica experimental induzida pela dietilnitrosamina (DEN). Foram estudados 240 ratos da raça Wistar todos machos, com peso médio de 155g e três meses de idade. Os animais foram acondicionados em gaiolas com cinco ratos cada, recebendo água e alimentação ad libitum. As drogas eram colocadas na água, sendo a DEN usada na dosagem de l0mg/kg/dia e a vitamina C, na de 1290mg/kg/dia. Para melhor estudo dos efeitos destas substâncias, os animais foram divididos em grupos segundo a droga ou drogas que receberiam: grupo I, controle, somente água nos sete dias da semana; grupo II, vitamina C nos sete dias da semana; grupo III, DEN três dias por semana e água nos outros quatro dias; grupo IV, DEN três dias por semana e vitamina C nos outros quatro dias; grupo V, DEN e vitamina C juntos no mesmo frasco, por três dias, e água nos outros quatro dias; e grupo VI, DEN e vitamina C juntos no mesmo frasco, por três dias, e vitan1ina C nos outros quatro dias. Cada grupo foi dividido em subgrupos de 10 animais, segundo o tempo de observação (T), sendo o sacrifício dos animais realizado em quatro diferentes T: 90, 120, 150 e 180 dias. A seguir, o esôfago era removido e avaliado macro e microscopicamente, para a identificação de tumores. A análise dos resultados mostrou que nos grupos I, II e nos T90 e T 120 dos grupos III, IV, V e VI não ocorreu a formação de nenhum tipo de tumor. No T150, na análise macroscópica, foram encontradas 10 le~ões no grupo III (1 lesão por animal) e sete lesões no grupo IV (0,7 lesão por animal), não ocorrendo nenhuma lesão nos grupos V e VI. Na análise microscópica foram identificadas seis lesões no grupo m (0,6 lesão por animal) e cinco no grupo IV (0,5 lesão por animal), não ocorrendo nenhuma lesão nos grupos V e VI. No T180, na análise macroscópica, foram encontradas 48 lesões no grupo m (4,8 lesões por animal);"31 lesões no grupo IV (3,1 lesões por animal); cinco lesões no grupo V (0,5 lesão por animal) e uma lesão no grupo VI (O, 1 lesão por animal). Na análise microscópica foram identificadas 23 lesões no grupo m (2,3 lesões por animal); 17 lesões no grupo IV (1,7 lesões por animal); três lesões no grupo V (0,3 lesão por animal) e uma lesão no grupo VI (O, 1 lesão por animal). Houve diferença significativa entre os grupos em relação à formação de tumores, verificando-se no grupo m o maior índice de neoplasias. Nos grupos que receberam vitamina C como inibidor (grupos IV, V e VI) ocorreu menor incidência de tumores, sendo o melhor efeito inibidor observado nos grupos que receberam a vitamina C e o DEN no mesmo frasco (grupo V e VI). Dessa forma, pode-se concluir que a vitamina C apresentou efeito inibidor do aparecimento de tumores de esôfago induzidos experimentalmente com a DEN, com melhores resultados quando as drogas eram dadas conjuntamente / Abstract: Cancer is today the second death cause in developed countries. In spite of the fact that certain advances have been obtained in the course of its treatment, the prognosis of this disease is still far from being satisfactory. Although esophageal cancer is not among the most frequent kinds of cancer actually it is the fourth neoplasia to affect man's digestive system - its studies are very important, basically for two reasons: first, this type of cancer affects people in their most natural life proceeding: nutrition; second, its occurrence rates are quite similar to those of mortality, clearly demonstrating the inefficiency of the treatment. However, two procedures may change this terrifying picture: early diagnosis and prevention. So, the search for substances that may interfere with the carcinogenesis keeping away the possibilities of new tumors looks like a very attractive idea. The aim of this report was to evaluate the inhibiting effect of vitamin C in the experimental esophageal carcinogenesis induced by diethylnitrosamine (NDEA). Were employed 240 male Wistar rats, all of them with approximately 155 gr. of weight and three months old. The animals were kept in cages with five rats each and fed with food and water ad libitum. Drugs were dissolved in water. Dosages were: NDEA: 10mg. / kg. / day and vitamin C: 1,290 mg. / kg. / day. The animals were divided into different groups according to the drug/drugs they would be given, for a better study of the drug effects Group I, control, only water, seven days a week; Group II, only vitamin C, seven days a week; Group III, NDEA, three days a week and water, the other four days; Group IV, NDEA, three days a week and vitamin C, the other four days; Group V, NDEA and vitamin C together in the same bottle, three days a week and only water, the other four days; Group VI, NDEA and vitamin C together in the same bottle, three days and vitamin C, the other from days. Every group was subdivided into other smaller groups of ten animals each, according to the observation time (T). The animals were sacrificed in four different times, 90, 120, 150 and 180 days. After the elapsed time, each animal was sacrificed and its esophagus was macro/microscopically evaluated to identify any tumors. As final results, in the groups I and 11 and in T90 and T120 of groups III, IV, V and VI there was no occurrence of any kind of tumor. The macroscopic studies in T 150 showed ten lesions in the group III (0.1 lesion per animal) and seven lesions in the group IV (0.7 lesion per animal), and no lesion the in the groups V and VI. The microscopic studies showed six lesions in the group III (O.6Iesion per animal) and five lesions in the group IV (OA lesion per animal), and no lesion in the groups V and VI. The macroscopic studies in T180 showed 48 lesions in the group III (4.8 lesions per animal), 31lesions in the group IV (3.1IesiolÍs per animal), 5 lesions in the group V (0.5 ,lesion per animal) and only one lesion in the group VI (0.1 lesion per animal). the microscopic studies identified 23 lesions in the group III (2.3 lesions per animal), 17 lesions in the group IV (1.7 lesions per animal), 3 lesions in the group V (0.3 lesion per animal) and only one lesion in the group VI (0.1 lesion per animal). The analysis of such results shows that there were significant differences among the groups towards the occurrence of tumors. On the other hand, group III was the one that showed the highest rate of neoplasias. Therefore, the analysis of the results demonstrated that vitamin C administered together with diethylnitrosamine (NDEA) showed an inhibiting effect over the occurrence of tumors in animals / Mestrado / Mestre em Cirurgia

Ph.D.

Helicases perform vital roles in the cell by unwinding D N A to make it accessible for the essential processes of replication, transcription and repair. In Caenorhabditis elegans, the DOG- 1 helicase-like protein is required for polyG/polyC-tract (G/C-tract) maintenance, as dog-l animals have a mutator phenotype characterized by deletions that initiate in G/C-tracts. DOG-1 may unwind secondary structures that form in polyguanine D N A during lagging strand replication. In order to more completely understand the role of dog-1, genetic interactors were identified, dog-1 functionally interacts with the him-6/BLM helicase. Absence of recombinational repair-implicated proteins in the dog-1 background, including HIM-6/BLM, RAD-51, BRD-1/BARD1 and HIM-9/XPF, as well as the trans-lesion synthesis polymerases polKMD po/7 increased the frequency of animals with G/C-tract deletions, indicating that these pathways are important mechanisms for repair at G/C-tracts in the absence of DOG-1. These data support the hypothesis that persisting D N A secondary structures can cause replication fork stalling, which can be resolved by deletion-free or deletion-prone mechanisms. DOG-1 has highest sequence identity to human BR1P1/FANCJ, which is mutated in patients from the Fanconi Anemia (FA) subgroup J. D N A damage sensitivity experiments indicated that, like chicken F A N C J cells, dog-1 mutants were not significantly sensitive to DNA damage from X-ray or UV-irradiation, but were extremely hypersensitive to the D N A interstrand cross-linking agent UVA-activated trimethylpsoralen. Thus, DOG-1 appears to have a conserved role in cross-link repair and is the C. elegans F A N C J homolog. Characterization of the dog-1/FANCJ-relatsd helicase, Jrh-1, revealed that mutants for this putative helicase are moderately sensitive to cross-linking agents, dog-1 jrh-1 double mutants displayed a synthetic lethal phenotype characterized by excessive recombination intermediates and mitotic catastrophe in the germline. However, absence of JRH-1 did not have any effect on G/C-tract deletions, indicating that JRH-1 does not have a redundant function with DOG-1 at G/C-tracts. Absence of JRH-1 reduced the fitness of eTl and nTl translocation hétérozygotes, but not translocation homozygotes, jrh-1 was synthetically lethal with him-6/BLM and with the endonuclease mus-81, suggesting a possible role for JRH-1 in regulating the balance between different types of repair. / Medicine, Faculty of / Medical Genetics, Department of / Graduate

Tolking och tillgodogörande av datastrukturer, organiserad information ochprogramkodsfiler förekommer frekvent i arbete med mjukvaruutveckling. Dennainformation är lagrad i textbaserad form och dess förståelse kräver stornoggrannhet och tidsinvestering från utvecklarens sida. I syfte att försöka förenklaprocessen beskriver detta examensarbete utvecklingen av en prototyp till ettverktygsprogram, vilket automatiserar tolkning av XML-data och källkodsfiler förprogrammeringsspråken C och C++. Programmet skapar och presenterar sedanen visuell graf av den undersökta strukturen. Algoritmen klarar av att presenteragodtyckligt stora XML-filer samt ett begränsat antal samtidigt inlästakällkodsfiler. Effekterna på tolkningens tidsåtgång och dess tillförlitlighet harutvärderats i en undersökning bland studenter inom mjukvaruutveckling.Resultatet visade på en viss mätbar ökning i antalet korrekta slutsatser somanvändaren drog efter att ha studerat datasammanhanget grafiskt jämfört meddess ursprungliga textform. Tidsåtgången mättes inte mer noggrant än subjektivthos användarna, av vilka en övervägande andel ansåg att tiden förkortades medden grafiska representationen till deras hjälp. Examensarbetet visar attanvändandet av detta eller motsvarande verktyg kan öka tillgodogörandet avdatastrukturer genom att både höja graden av tillförlitligheten hos dennainformation och samtidigt minska tidsåtgången. Däremot är den kvantifierbaravinsten av dessa resultat inte statistiskt säkerställd till en högre grad. / Interpretation and assimilation of data structures, organized information andsource code files are frequently occuring during software development. This kindof information is stored in text-based form and its understanding requires greatthoroughness and investment in time from the developer's part. This thesisdescribes the development of a utility program prototype, which automates theparsing of XML data and source code files from the programming languages Cand C++, in purpose of trying to simplify the interpretation process. The programcreates and presents a visual graph of the structure found, using an algorithmwhich can present arbitrary large XML files as well as a limited number ofconcurrent source code files. The effects on the interpretation time and itsreliablity has been evaluated in a survey among software development students.The result showed a certain increase in the number of correct conclusions fromthe participants' side after studying the visual representation compared to itsorignial text-based form. The amount of time used was not measured other thansubjectively by the users themselves, of which a predominant proportionconsidered a reduction in needed time when using the graphical representation.The thesis shows that the use of this or an equivalent utility can enhance theassimilation of data structures by increasing the rate of reliabilty whilesimultaneously decreasing the needed amount of time. Still, the quantifyable gainsof these results remains statistically largely uncertain.