Les travaux de recherche effectués dans le cadre de cette thèse ont été guidés par le manque d’information et une compréhension limitée des mécanismes épidémiologiques à l’origine de l’émergence et de la diffusion de la grippe aviaire hautement pathogène, souche H5N1 en Chine du Sud, aussi reconnue comme l’épicentre potentiel de l’émergence des virus influenza aviaires à caractères pandémiques. <p>Dans ce cadre, des données spatio-temporelles relatives aux foyers de la maladie ainsi que des données de surveillance virologiques (isolement du virus effectué dans le cadre du système de surveillance nationale) ont été collectées sur une période de quatre ans et analysées afin d’éxplorer les facteurs de risque relatifs à l’émergence et persistence de la maladie dans certaine zones de production du sud de la Chine. Les analyses ainsi effectuées ont permis d’identifier, à travers l’utilisation de méthodes statistiques robustes ayant fait leur preuve dans le domaine de la santé ou de l’écologie (la régression logistique classique et les arbres de regression logistique), des facteurs de risque liés à certains types de production de volailles (canards élevés en plein air, zones riches en eau et par extension associées à la riziculture) ou des facteurs associés à l’activité humaine. A travers une représentation cartographique des facteurs ainsi identifiés, des cartes de risque ont été produites permettant ainsi de visualiser d’une part les zones à haut risque de persistence de l’infection virale et d’autre part les zones vulnérables à l’apparition de foyers de la maladie, donnant aux autorités nationales la possibilité de mieux cibler leurs politiques de surveillance et de contrôle. <p>Dans un second temps, notre étude s’est portée sur les marchés à volailles traditionnels du sud de la Chine qui représentent un risque permanent de persistence, d’évolution et de diffusion des virus influenza aviaires, ainsi qu’un risque important en matière de santé publique. La dynamique de ces marchés et les liens qui les unissent ont été étudiés à travers des outils d’analyse empruntés à la sociologie tels que l’Analyse des Réseaux Sociaux (Social Network Analysis). Grace à cette approche, l’importance de l’hygiène de ces marchés et notamment du nettoyage et de la désinfection des cages dans la persistence du virus a été mise en évidence. Enfin, des enquêtes effectuées auprès des vendeurs de volailles ont permis d’identifier l’origine et la destination des animaux vendus et de reconstruire des réseaux plus ou moins intriqués de liens commerciaux qui unissent ces marchés entre eux dans trois provinces du sud de la Chine. L’analyse de ces réseaux et de leurs configurations ont permis d’identifier des marchés à plus haut risque de persistence de l’infection du fait de leur position centrale au sein de ces réseaux. De même qu’il est indispensable de cibler la surveillance et le contrôle de la maladie dans des zones écologiquement favorables à la persistence des virus influenza aviaires, cette étude révèle l’importance de certaines pratiques hygiéniques et commerciales dans la persistence de la maladie et la nécessité de cibler la surveillance et le contrôle au niveau de certains de ces marchés situés au centre d’un réseau dense et connecté, pour pouvoir in fine mieux contrôler la maladie au niveau national.<p> / Doctorat en Sciences agronomiques et ingénierie biologique / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Abstract In the Swedish Kingdom, of which Finland was a part until the 19th century, the parish burial records specified the cause of death earlier than other European countries. Using the information contained in 1.2 million death records from 234 different parishes, the impact of the main infectious diseases inflicted upon the Finnish population, during the period 1749–1850, is analyzed. The study is focused on the temporal and geographical distribution of three of the main epidemics; gastroenteritis, malaria and smallpox. The Industrial Revolution, the Demographic Transition and the Bacteriological Era only arrived to Finland at the end of the 19th century. The population analyzed, living at a time prior those changes, was therefore rural, scattered and with high birth and mortality rates. It was, therefore, helpless in front of many illnesses. Infectious diseases were the main cause of death, especially among children. One sixth of all analyzed deaths can be attributed to these three causes of death studied. Acute gastroenteritis generated mortality, constantly in its endemic areas (southeast of the country and Ostrobothnian coast) and also in the form of large epidemics, accompanying other factors affecting the population, such as war or famine. Smallpox was endemic in the country and caused periodic epidemic peaks which generated high mortality among children. The most densely populated areas acted as reservoirs from which the disease spread outwards the rest of the country. The generalization of the practice of vaccination, from the first decades of the 19th century, modified both the spatiotemporal distribution of the epidemics and the age distribution of smallpox mortality. Under the period studied, malaria was endemic in the southwest of Finland, being of most importance in the Åland Islands. The temporal variations in the incidence of this disease do not seem to be related to crises in the population, but rather due to environmental factors. The above causes of death greatly influenced the modulation of mortality in 18th and 19th century Finland. / Resumen En el Reino de Suecia, al que pertenecía Finlandia hasta el siglo XIX, los registros parroquiales de enterramiento especificaban la causa de muerte más tempranamente que en otros países de Europa. Utilizando la información contenida en 1,2 millones de registros de defunción, provenientes de 234 parroquias diferentes, se analiza el impacto de las enfermedades infecciosas en la población de Finlandia entre 1749 y 1850. Se estudia en especial la distribución temporal y geográfica de las mayores epidemias de gastroenteritis aguda, viruela y paludismo. Ni la revolución industrial ni la transición demográfica ni la era bacteriológica llegaron a Finlandia hasta finales del siglo XIX. La población en la época de estudio era, por tanto, rural, dispersa, con altos índices de natalidad y mortalidad y estaba indefensa ante la mayor parte de las dolencias. Las enfermedades infecciosas eran la principal causa de muerte, especialmente entre los niños. Al conjunto de las tres causas de muerte estudiadas, gastroenteritis, viruela y paludismo, puede atribuirse un sexto del total de las muertes analizadas. La gastroenteritis aguda causaba una importante mortalidad de manera constante en sus áreas endémicas (sureste del país y costa de Ostrobotnia) y una mortalidad catastrófica, en forma de grandes epidemias, en coincidencia con alteraciones en la población tales como guerras o hambrunas. La viruela era endémica en el país y se manifestaba en forma de picos epidémicos periódicos que generaban gran mortalidad entre los niños. Las zonas más densamente pobladas actuaban como reservorios desde los cuales la enfermedad se expandía al resto del país. La generalización del uso de la vacuna a partir de las primeras décadas del siglo XIX modificó tanto la distribución espaciotemporal de las epidemias como su perfil de mortalidad por edades. El paludismo era endémico en el suroeste de Finlandia durante el periodo de estudio, siendo especialmente importante en las Islas åland. Las variaciones en la importancia de esta enfermedad no parecen responder a crisis en la población sino a factores ambientales. Las causas de muerte estudiadas modularon de manera importante la mortalidad general de la Finlandia de los siglos XVIII y XIX. / Tiivistelmä Ruotsin kuningaskunnassa, johon Suomi 1800-luvulle saakka kuului, hautauksia koskevissa kirkonkirjoissa spesifioitiin kuolinsyy aikaisemmin kuin muissa Euroopan maissa. Tässä tutkimuksessa analysoidaan 234 eri kunnasta peräisin olevaa 1,2 miljoonan henkilön kuolintilastoon sisältyvää informaatiota infektiosairauksien vaikutuksesta Suomen väestöön vuosien 1749 ja 1850 välillä. Erityisesti tutkitaan akuutin mahasuolitulehduksen, isonrokon ja malarian merkittävimpien epidemioiden ajallista ja maantieteellistä levinneisyyttä. Teollinen vallankumous kuin myöskään väestöllinen muutos tai bakteriologinen aikakausi eivät saapuneet Suomeen 1800-luvun loppuun mennessä. Tutkittavan aikakauden väestö oli siten maaseudulla elävää, hajanaista, sillä oli korkea syntyvyys ja kuolleisuus ja se oli suojaton suurinta osaa sairauksia vastaan. Infektiosairaudet olivat pääasiallisin kuolinsyy, erityisesti lasten keskuudessa. Tämän kolmen tutkitun kuolinsyyn joukon, mahasuolitulehduksen, isonrokon ja malarian, voidaan katsoa aiheuttaneen kuudenneksen analysoitujen kuolemien kokonaismäärästä. Akuutti mahasuolitulehdus aiheutti tasaisesti merkittävän kuolleisuuden yleisillä esiintymisalueillaan (maan kaakkoisosa ja Pohjanmaan rannikko) ja katastrofaalisen kuolleisuuden suurten epidemioiden muodossa samanaikaisesti sellaisten väestössä tapahtuvien muutosten kuten sotien tai nälänhädän kanssa. Isorokko oli maassa yleisesti esiintyvää ja ilmeni jaksottaisten epidemiahuippujen muodossa, jotka aiheuttivat suuren kuolleisuuden lasten keskuudessa. Tiheimmin asutetut alueet toimivat reserveinä, joista sairaus levisi loppuun osaan maata. Rokotuksen käytön yleistyminen 1800-luvun ensimmäisistä vuosikymmenistä lähtien muutti niin epidemioiden alueellista ja ajallista levinneisyyttä kuin sen kuolleisuusprofiilia ikäluokittain. Malaria oli yleisesti esiintyvää Lounais-Suomessa, ja tutkittavana aikakautena se oli erityisen merkittävää Ahvenanmaan saaristossa. Muutokset tämän sairauden merkittävyydessä eivät vaikuta vastaavan väestökriisejä vaan ilmastollisia tekijöitä. Tutkitut kuolinsyyt muuttivat merkittävästi kuolleisuutta 1700- ja 1800-lukujen Suomessa.

This study explores the utilisation of spatial technologies as a tool to analyse and combat crime. The study deals specifically with remote sensing and its potential for being integrated with geographical information systems (GIS). The integrated spatial approach resulted in the understanding of land use class behaviour over time and its relationship to specific crime incidents per police precinct area. The incorporation of spatial technologies to test criminological theories in practice, such as the ecological theories of criminology, provides the science with strategic value. It proves the value of combining multi-disciplinary scientific fields to create a more advanced platform to understand land use behaviour and its relationship to crime. Crime in South Africa is a serious concern and it impacts negatively on so many lives. The fear of crime, the loss of life, the socio-economic impact of crime, etc. create the impression that the battle against crime has been lost. The limited knowledge base within the law enforcement agencies, limited logistical resources and low retention rate of critical staff all contribute to making the reduction of crime more difficult to achieve. A practical procedure of using remote sensing technology integrated with geographical information systems (GIS), overlaid with geo-coded crime data to provide a spatial technological basis to analyse and combat crime, is illustrated by a practical study of the Tshwane municipality area. The methodology applied in this study required multi-skilled resources incorporating GIS and the understanding of crime to integrate the diverse scientific fields into a consolidated process that can contribute to the combating of crime in general. The existence of informal settlement areas in South Africa stresses the socio-economic problems that need to be addressed as there is a clear correlation of land use data with serious crime incidents in these areas. The fact that no formal cadastre exists for these areas, combined with a great diversity in densification and growth of the periphery, makes analysis very difficult without remote sensing imagery. Revisits over time to assess changes in these areas in order to adapt policing strategies will create an improved information layer for responding to crime. Final computerised maps generated from remote sensing and GIS layers are not the only information that can be used to prevent and combat crime. An important recipe for ultimately successfully managing and controlling crime in South Africa is to strategically combine training of the law enforcement agencies in the use of spatial information with police science. The researcher concludes with the hope that this study will contribute to the improved utilisation of spatial technology to analyse and combat crime in South Africa. The ultimate vision is the expansion of the science of criminology by adding an advanced spatial technology module to its curriculum. / Criminology / D.Litt. et Phil. (Criminology)

This study explores the utilisation of spatial technologies as a tool to analyse and combat crime. The study deals specifically with remote sensing and its potential for being integrated with geographical information systems (GIS). The integrated spatial approach resulted in the understanding of land use class behaviour over time and its relationship to specific crime incidents per police precinct area. The incorporation of spatial technologies to test criminological theories in practice, such as the ecological theories of criminology, provides the science with strategic value. It proves the value of combining multi-disciplinary scientific fields to create a more advanced platform to understand land use behaviour and its relationship to crime. Crime in South Africa is a serious concern and it impacts negatively on so many lives. The fear of crime, the loss of life, the socio-economic impact of crime, etc. create the impression that the battle against crime has been lost. The limited knowledge base within the law enforcement agencies, limited logistical resources and low retention rate of critical staff all contribute to making the reduction of crime more difficult to achieve. A practical procedure of using remote sensing technology integrated with geographical information systems (GIS), overlaid with geo-coded crime data to provide a spatial technological basis to analyse and combat crime, is illustrated by a practical study of the Tshwane municipality area. The methodology applied in this study required multi-skilled resources incorporating GIS and the understanding of crime to integrate the diverse scientific fields into a consolidated process that can contribute to the combating of crime in general. The existence of informal settlement areas in South Africa stresses the socio-economic problems that need to be addressed as there is a clear correlation of land use data with serious crime incidents in these areas. The fact that no formal cadastre exists for these areas, combined with a great diversity in densification and growth of the periphery, makes analysis very difficult without remote sensing imagery. Revisits over time to assess changes in these areas in order to adapt policing strategies will create an improved information layer for responding to crime. Final computerised maps generated from remote sensing and GIS layers are not the only information that can be used to prevent and combat crime. An important recipe for ultimately successfully managing and controlling crime in South Africa is to strategically combine training of the law enforcement agencies in the use of spatial information with police science. The researcher concludes with the hope that this study will contribute to the improved utilisation of spatial technology to analyse and combat crime in South Africa. The ultimate vision is the expansion of the science of criminology by adding an advanced spatial technology module to its curriculum. / Criminology and Security Science / D.Litt. et Phil. (Criminology)