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A genetic and ecophysiological comparison of co-occuring indigenous (Perna perna) and invasive (Mytilus galloprovincialis) intertidal mussels

Zardi, G I January 2006 (has links)
The Mediterranean mussel Mytilus galloprovincialis is the most successful marine invasive species in South Africa. Its presence has had significant ecological consequences on the intertidal communities of the west coast. On the south coast, M galloprovincialis co-exists and competes with the indigenous intertidal mussel Perna perna in the lower balanoid zone, where they show partial habitat segregation. The upper and the lower mussel zones are dominated by M. galloprovincialis and P. perna respectively while they co-occur in the mid zone. In this thesis M. galloprovincialis and P. perna are compared in terms of their population genetics and their ecophysiology. The success of an invader depends on its ability to react to new environmental factors, especially when compared to indigenous species. The distribution and diversity of intertidal species throughout the world are strongly influenced by periodic sand inundation and hydrodynamic stress. Occupying the lower intertidal zone, P. perna is more strongly influenced by sand (burial and sand in suspension) than M. galioprovincialis. Despite this, P. perna is more vulnerable to the effects of sand, showing higher mortality rates under experimental conditions in both the laboratory and the field. M. galioprovincialis has longer labial palps than P. perna, indicating a better ability to sort particles. This, and a higher tolerance to anoxia, explains its lower mortality rates when exposed to burial or suspended sand. Habitat segregation is often explained by physiological tolerances, but in this case, such explanations fail. The ability of a mussel to withstand wave-generated hydrodynamic stress depends mainly on its byssal attachment strength. The higher attachment strength of P. perna compared to M. galioprovincialis and of solitary mussels compared to mussels living within a bed (bed mussels) can be explained by more and thicker byssal threads. M galloprovincialis also has a wider shell, is subjected to higher hydrodynamic loads than P. perna and shows a higher theoretical probability of dislodgement, this is borne out under field conditions. The attachment strength of both species increased from higher to lower shore, in parallel to a gradient of a stronger wave action. Monthly measurements showed that P. perna is always more strongly attached than M. galloprovincialis and revealed seasonal fluctuations of attachment strength for both species in response to wave height. The gonad index of both species was negatively cross-correlated with attachment strength. The results are discussed in the context of the evolutionary strategy of the alien mussel, which directs most of its energy to fast growth and high reproductive output, apparently at the cost of reduced attachment strength. This raises the prediction that its invasive impact will be more pronounced at sites subjected to low or moderate wave action at heavily exposed sites. The potential of a species for invasion is also determined by the ability of the invader to disperse. Population genetics provide indirect information about dispersal through a direct measurement of gene flow. The low genetic divergence (measured as mtDNA) of M. galloprovincialis confirms its recent arrival in South Africa. In contrast, the population genetics structure of P. perna revealed strong divergence on the south-east coast, resulting in a western lineage (straddling the distributional gap of the Benguela System), and an eastern lineage, with an overlap region of the two on the south coast between Kenton-on-Sea and Haga Haga. This genetic disjunction may be caused by Agulhas Current acting as an oceanographic barrier to larval dispersal, or by different environmental selective forces acting on regional populations. Over the last ten years, M. galloprovincialis has shown a decrease or cessation of its spread to the east in exactly the region of the genetic disjunction in P. perna, again suggesting either an oceanographic barrier to larval dispersal, or increasing selection driven by sharp gradients in environmental conditions.
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What limits an invasive biotic and abiotic effects on the distribution of the invasive mussel mytilus galloprovincialis on the South African coastline

Hall, Madison January 2015 (has links)
No description available.
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Análise tecnológica e sócio-econômica do cultivo de moluscos bivalves em sistema familiar na baía da Ilha Grande, Angra dos Reis, RJ

Moschen, Fernando Vitor de Abreu [UNESP] 30 January 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-09-27T13:40:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-01-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-09-27T13:45:34Z : No. of bitstreams: 1 000540833.pdf: 1077434 bytes, checksum: b5e088eaeeaa383a803380f3898f84e0 (MD5) / A maricultura realizada junto às famílias tradicionais de pescadores artesanais da Baía da Ilha Grande foi introduzida no ano de 1996, pelo Projeto de Desenvolvimento Sustentável da Baía da Ilha Grande, executado pela Prefeitura Municipal de Angra dos Reis. Foram instaladas 20 fazendas marinhas que cultivam o mexilhão Perna perna e a vieira Nodipecten nodosus, espécies nativas que possuem grande potencial, tanto zootécnico como de mercado. Neste estudo buscou-se descrever o estado da arte, as tecnologias de cutivo e ações voltadas para a malacocultura da região, realizando-se um diagnóstico tecnológico e sócioeconômico dos maricultores familiares da Baía da Ilha Grande e identificando as tecnologias de produção de mexilhões e vieiras utilizadas pelos produtores. Com o conjunto de informações coletadas foi possível realizar uma análise econômica do cultivo de mexilhões e vieiras na região. Foram analisados três sistemas de cultivos chamados de Sistema A (4 long-lines, com capacidade para produção de 3.030 kg de mexilhões e 7500 unidades de vieiras), B (6 long-lines, com produção de 4.545 kg de mexilhões e 11.250 unidades de vieiras) e C (18 long-lines, com produção de 15.150 kg de mexilhões e 30.000 unidades de vieiras. Os sistemas A se mostrou inviável economicamente quando se inclui nos custos a cobrança do ICMS sobre os produtos comercializados. Ao não se considerar a cobrança deste imposto, este sistema apresentou viabilidade econômica. Os sistemas B e C se mostraram viáveis economicamente independente da cobrança de imposto. A receita mensal obtida variou de R$ 888,03 (Sistema A) a R$ 3.799,57(Sistema C). / Mariculture started as an activity among traditional fishermen families of Ilha Grande bay in 1996 through the Sustainable Development Project. This project, executed by the City council of Angra dos Reis, consisted of the installation of 20 marine farms. The species cultivated were the mussel Perna perna and the scallop Nodipecten nodosus, native species in the region with excellent potential with regards to zoo-technical performance and market-value. This study attempts to describe the state-of-the-art of shellfish culture in the region, through a socioeconomical survey, identifying production technologies of mussels and scallops being used by each producer. With the information and data gathered, it was possible to make an economical analysis of mussel and scallop culture in the region. Three culture configurations were analyzed: System A - composed of 4 long-lines, with production capacity of 3.030 of shell-on mussels and 7.500 units of scallops. System B - composed of 6 long-lines, with production capacity of 4.545 kg of shell-on mussel and 11.250 units of scallop. System C - composed of 18 long-lines with production capacity of 15.150 kg of mussels and 30.000 units of scallops. System A showed to be economically unfeasible after payment of local taxes (ICMS) upon marketed products. Nonetheless, this system showed feasibility if the taxes weren't applied. Systems B and C showed economically feasibility independently of the payment of taxes. The monthly gains varied between R$888,03 and R$3.799,57 according to the system.
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Análise tecnológica e sócio-econômica do cultivo de moluscos bivalves em sistema familiar na baía da Ilha Grande, Angra dos Reis, RJ /

Moschen, Fernando Vitor de Abreu. January 2007 (has links)
Orientadora: Maria Inez Espagnoli Geraldo Martins / Banca: Maria Madalena Zocoller Borba / Banca: Marcos Bastos Pereira / Banca: João Batista Kochenborger Fernandes / Banca: Rose Meire Vidotti. / Resumo: A maricultura realizada junto às famílias tradicionais de pescadores artesanais da Baía da Ilha Grande foi introduzida no ano de 1996, pelo Projeto de Desenvolvimento Sustentável da Baía da Ilha Grande, executado pela Prefeitura Municipal de Angra dos Reis. Foram instaladas 20 fazendas marinhas que cultivam o mexilhão Perna perna e a vieira Nodipecten nodosus, espécies nativas que possuem grande potencial, tanto zootécnico como de mercado. Neste estudo buscou-se descrever o estado da arte, as tecnologias de cutivo e ações voltadas para a malacocultura da região, realizando-se um diagnóstico tecnológico e sócioeconômico dos maricultores familiares da Baía da Ilha Grande e identificando as tecnologias de produção de mexilhões e vieiras utilizadas pelos produtores. Com o conjunto de informações coletadas foi possível realizar uma análise econômica do cultivo de mexilhões e vieiras na região. Foram analisados três sistemas de cultivos chamados de Sistema A (4 long-lines, com capacidade para produção de 3.030 kg de mexilhões e 7500 unidades de vieiras), B (6 long-lines, com produção de 4.545 kg de mexilhões e 11.250 unidades de vieiras) e C (18 long-lines, com produção de 15.150 kg de mexilhões e 30.000 unidades de vieiras. Os sistemas A se mostrou inviável economicamente quando se inclui nos custos a cobrança do ICMS sobre os produtos comercializados. Ao não se considerar a cobrança deste imposto, este sistema apresentou viabilidade econômica. Os sistemas B e C se mostraram viáveis economicamente independente da cobrança de imposto. A receita mensal obtida variou de R$ 888,03 (Sistema A) a R$ 3.799,57(Sistema C). / Abstract: Mariculture started as an activity among traditional fishermen families of Ilha Grande bay in 1996 through the Sustainable Development Project. This project, executed by the City council of Angra dos Reis, consisted of the installation of 20 marine farms. The species cultivated were the mussel Perna perna and the scallop Nodipecten nodosus, native species in the region with excellent potential with regards to zoo-technical performance and market-value. This study attempts to describe the "state-of-the-art" of shellfish culture in the region, through a socioeconomical survey, identifying production technologies of mussels and scallops being used by each producer. With the information and data gathered, it was possible to make an economical analysis of mussel and scallop culture in the region. Three culture configurations were analyzed: System A - composed of 4 long-lines, with production capacity of 3.030 of shell-on mussels and 7.500 units of scallops. System B - composed of 6 long-lines, with production capacity of 4.545 kg of shell-on mussel and 11.250 units of scallop. System C - composed of 18 long-lines with production capacity of 15.150 kg of mussels and 30.000 units of scallops. System A showed to be economically unfeasible after payment of local taxes (ICMS) upon marketed products. Nonetheless, this system showed feasibility if the taxes weren't applied. Systems B and C showed economically feasibility independently of the payment of taxes. The monthly gains varied between R$888,03 and R$3.799,57 according to the system. / Doutor
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Avaliação de novos processos de limpeza para quantificação de pireno em amostra de mexilhão / Evaluation of new cleaning processes for quantification of pyrene in samples of mussels

Priscila Mendonça de Andrade 27 February 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPA) constituem um grupo de poluentes ambientais persistentes são moléculas com dois ou mais anéis aromáticos condensados, pouco solúveis em água e estão presentes no ambiente como resultante de processos naturais e também de atividades antrópicas; desta forma, os HPA podem ser encontrados em diversas matrizes ambientais. No presente trabalho foram utilizados mexilhões da região de Búzios, no Estado do Rio de Janeiro. Esse organismo foi selecionado devido à facilidade de acumulação de HPA nos tecidos, decorrente das propriedades hidrofóbicas dos HPA. O presente projeto teve como objetivo estudar um novo material de limpeza capaz de minimizar os compostos interferentes da matriz. Os cartuchos de SPE Florisil 5 g, são convencionalmente usados na limpeza de amostras de organismos, porém para diminuir os custos foram testados outros materiais adsorventes que pudessem ser eficientes na remoção dos interferentes presentes nos tecidos de mexilhão. Sendo assim, na etapa de limpeza conhecida como clean-up, foi estudada a recuperação do pireno após a extração por micro-ondas através de duas abordagens diferentes; a) utilização de cartuchos de SPE comerciais de 5 g de Florisil; b) cartuchos preenchidos com argila comercial K-10 bentonite, simulando os cartuchos comerciais. A recuperação e eficiência dos procedimentos de limpeza foram testadas e comparadas. A clean-up com argila K-10 apresentou uma recuperação de até 77% de pireno, sendo eficiente na remoção de compostos de colesteróis; confirmando a eficiência do material escolhido para a limpeza da amostra. A técnica de Cromatografia Gasosa e detecção por Espectrometria de Massas (GC-MS) foi aplicada para identificação e quantificação do contaminante pireno no extrato finaa / Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAH) are a group of persistent environmental pollutants are molecules containing two or more condensed aromatic rings, little soluble in water and are present in the environment as a result of natural processes and human activities; in this way, the HPA can be found in various environmental matrices. In this work we used mussels in Búzios, Rio de Janeiro State. That body was selected due to the ease of accumulation of HPA in the tissues, due to the hydrophobic properties of HPA. This project aimed to study a new cleaning material able to minimize interfering compounds of the array. The 5 g Florisil SPE cartridges, are conventionally used in the cleaning of samples of organisms, however for lower costs have been tested other adsorbent materials which could be effective in the removal of the present in the tissues of mussels interfering. Therefore, in step of cleaning known as clean-up, recovery of pyrene was studied after extraction by microwave through two different approaches; a) use of commercial SPE cartridges 5 g of Florisil; b) cartridges filled with K-10 clay bentonite commercial, simulating the commercial cartridges. Recovery and efficiency of cleaning procedures were tested and compared. The clean-up with K-10 clay presented a recovery of up to 77% of pyrene, being effective in removing compounds of cholesterols; confirming the efficiency of the chosen material for cleaning of the sample. The technique of gas chromatography and detection by mass spectrometry (GC-MS) was applied for identification and quantification of contaminant pyrene in the final extract
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Avaliação dos aportes de hidrocarbonetos à Lagoa dos Patos (RS - Brasil)

Barbosa, Clarissa del Rosso January 2005 (has links)
Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós-Graduação em Oceanografia Física, Química e Geológica, Instituto de Oceanografia, 2005. / Submitted by Cristiane Silva (cristiane_gomides@hotmail.com) on 2013-01-28T13:00:22Z No. of bitstreams: 1 2005_Clarissa.pdf: 932306 bytes, checksum: d0a0723040516baf65fd6c7e051026cc (MD5) / Approved for entry into archive by Bruna Vieira(bruninha_vieira@ibest.com.br) on 2013-06-13T18:29:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2005_Clarissa.pdf: 932306 bytes, checksum: d0a0723040516baf65fd6c7e051026cc (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-13T18:29:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2005_Clarissa.pdf: 932306 bytes, checksum: d0a0723040516baf65fd6c7e051026cc (MD5) Previous issue date: 2005 / Levels and sources of hydrocarbons to Patos Lagoon and nearshore area were assessed analyzing 28 sediment and 3 mussel(Perna perna) samples. The sediments presented total hydrocarbon levels between 0.12 and 51.6 μg g-1 dry weight (dry wt) (n=18); total aliphatic hydrocarbons betw een 0.12 and 130.0 μg g-1 dry wt (n=28) and Σn-C 14-C35 between 0.01 and 15.0 μg g -1 dry wt (n=28). In general, these levels were lower than those found in other locations considered as heavily polluted. Most samples, in special those distant from the sources, presented a biogenic profile, characteristic from higher plant waxes and, in a less extent, from algae. Sediments with higher aliphatic hydrocarbons values and petrogenic profiles were associated to in puts from industrial and domestic effluents and shipping activities associated to the cities of Rio Grande and Porto Alegre and to the run off of the Lagoons drainage bas in. Petroleum biomarkers (terpanes and steranes) and linear alkyl-benzenes (LABs) analyzed in eight samples from the surrounding of Rio Grande city confirmed hydrocarbons contamination from oil usage (recent and weathered) and domestic efluents in the stations located in the main municipal sewage discharge, refinery and dry docking. The highest PAH levels (Σ24 PAHs) (41-11792 ng g-1 dry wt), which were st udied only in the area adjacent Rio Grande city, were in the same range as those found in other areas considered moderately to heavily contaminated. A petrogenic an d pyrolitic PAHs mixture is present in most of the samples, occasionally with a petrogenic predomination and usually with both petrogenic and pyrolitic signatures. In the sediments, PAHs with high molecular weight (from 4 to 6 rings) predominated, while in the Perna perna mussels PAHs with 2 to 3 rings and its alkyl homologues predominated; indicating low to moderately petrogenicinputs. The comparasion with the International Mussel Watch (1992) results indicated that PAH contamination have not increased in the studied area. / Os níveis e fontes de hidrocarbonetos à Lagoa dos Patos e costa adjacente foram avaliados através da análise de 28 amostras de sedimento superficial e 3 de mexilhões Perna perna. Os sedimentos apresentaram níveis de hidrocarbonetos totais entre 0,12 e 51,6 μg g-1 (peso seco) (n=18), hidrocarbonetos alifáticos totais entre 0,12 e 130,0 μg g-1(peso seco) (n=28) eΣn-C14-C35 entre 0,01-15,0 μg g-1(peso seco) (n=28), sendo geralmente mais baixos que concentrações informadas para áreas altamente contaminadas. A maioria das amostras, em especial as distantes das fontes diretas de aportes, apresentaram perfis característicos de aportes biogênicos de plantas terrestres e, em menor escala de algas. Os sedimentos com maiores valores de hidrocarbonetos alifáticos, e que apresentaram perfis característicos de aportes por óleo, estiveram associados a efluentes domésticos e industriais e a atividades náuticas do entorno da cidade do Rio Grande, a aportes da cidade de Porto Alegre e à drenagem da Lagoa dos Patos. Os biomarcadores de petróleo (terpanos e esteranos) e os alquil-benzenos lineares (L ABs) analisados em oito estações no entorno da cidade de Rio Grande, confirmaram os aportes de óleo (recente e intemperizado) e de efluentes domésticos nos sedimentos próximos ao efluente principal de esgoto doméstico de Rio Grande, da Refinaria de Petróleo e do Posto Náutico. As concentrações mais elevadas de HPAs (Σ24HPAs) (41-11792 ng g-1 peso seco), analisados somente nos sedimentos do entorno da cidade, são comparáveis com áreas moderada a altamente contaminadas ao redor do mundo. Uma mistura de HPAs de origem petrogênica e pirolítica está presente na maioria das amostras, ocasionalmente com uma predominância petrogênica e, usualmente, com ambas assinaturas petrogênica e pirolítica. Nos sedimentos predominaram HPAs de alto peso molecular (de 4-6 anéis), enquanto que nos mexilhões Perna perna a predominância foi de compostos HPAs de 2-3 anéis com seus homólogos metilados,indicando aportes baixos a moderados de origem petrogênica. A comparação com um estudo realizado em 1992 (International Mussel Watch), indica que não houve um incremento significativo nos níveis de contaminação para a região.
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Bioacumulacao e eliminacao de mercurio (sup(203)Hg) no mexilhao (Perna perna, Linne, 1758) .Modelo cinetico para avaliar o risco de ingestao no homem

MALAGRINO, WALDIR 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:48:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T13:56:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 09455.pdf: 4871108 bytes, checksum: cdb33a154f97f7b1de400d0a95b20a24 (MD5) / Tese (Doutoramento) / IPEN/T / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP
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Otimização da análise por ativação neutrônica instrumental para o estudo de homogeneidade dentro do frasco de materiais de referência de origem marinha / Optimization of instrumental neutron activation analysis for the within-bottle homogeneity study of reference materials of marine origin

SILVA, DANIEL P. da 10 November 2017 (has links)
Submitted by Marco Antonio Oliveira da Silva (maosilva@ipen.br) on 2017-11-10T12:40:31Z No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2017-11-10T12:40:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / A utilização de materiais de referência tem sido crescente em laboratórios químicos, uma vez que são importantes para a validação de métodos analíticos. Tais materiais são em geral importados, o que demanda altos investimentos financeiros para adquiri-los, e, portanto, impacta na não utilização dos mesmos por muitos laboratórios nacionais. A certificação de um material de referência é um processo complexo que pressupõe oferecer ao usuário valores atribuídos às propriedades de interesses no material. Neste processo, deve ser realizada a verificação da homogeneidade do material nos frascos. No presente estudo, foi realizado o estudo de homogeneidade dentro do frasco para os elementos K, Mg, Mn, Na e V em dois materiais de referência certificados de origem marinha: o material de referência de mexilhão, produzido no Laboratório de Ativação Neutrônica (LAN) do IPEN - CNEN/SP e o material de referência de tecido de ostra produzido no exterior. Para tanto, os elementos foram determinados por Análise por Ativação Neutrônica Instrumental, com massas variando entre 1 e 250 mg e estimou-se a massa mínima que variou de 0,015 g para Na no material de referência de mexilhão a 0,100 g para V nos dois materiais de referência. / Dissertação (Mestrado em Tecnologia Nuclear) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Detecção de enterobactérias e vírus entéricos em frutos do mar no Estado de São Paulo / Detection of enterobacteria and enteric viruses in seafood in the State of São Paulo

Andrea Vásquez García 08 August 2018 (has links)
As bactérias patogênicas em moluscos bivalves podem ser agentes causadores de doenças como a gastroenterite e responsáveis por vários surtos de origem alimentar, representado um risco para os consumidores. Os vírus entéricos são a causa mais comum de surtos de gastroenterites não bacteriana em humanos no mundo e podem ser encontrados nas águas utilizadas no cultivo de moluscos bivalves. Este estudo teve como objetivo avaliar a contaminação de mexilhões (Mytella falcata) e ostras (Crassostrea brasiliana) provenientes do Complexo Estuarino Lagunar de Cananéia-Iguape, Estado de São Paulo, por bactérias (coliformes totais, coliformes termotolerantes, patotipos de Escherichia coli), por astrovírus e norovírus humanos. Um total de 150 amostras de moluscos bivalves (75 ostras e 75 mexilhões) foram coletadas de junho de 2016 a fevereiro de 2017. A estimativa de coliformes totais nos tecidos das ostras variou de 14,1 a 154,5 número mais provável (NMP)/g e de coliformes termotolerantes de 3,0 a 48,6 NMP/g, enquanto que para as amostras de mexilhões, os coliformes totais variaram de 97,4 a 1300 NMP/g e coliformes termotolerantes de 3,6 a 927 NMP/g. E. coli foi detectada em 24 amostras (16%), em concentrações variando entre <3 e >927 NMP/g. Quatro amostras (17%) foram identificadas com Escherichia coli enteropatogênica (EPEC), apresentando o gene eae por PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) e RFLP (Polimorfismo no Comprimento de Fragmentos de Restrição), e os amplicons positivos foram sequenciados. As porcentagens de similaridade relativas ao gene phoA de E. coli, para as cinco amostragens realizadas no estudo, apresentaram valores iguais ou superiores a 88,6%. As sequências de EPEC agruparam-se em diferentes clados com outras sequências do Brasil, Suíça e Uruguai, exibindo similaridade de 57,7 e 97,1% quando comparadas umas as outras. Quando comparadas a outras sequências de referência depositadas no GenBank, a similaridade variou entre 56,2 e 95,4%. Estes resultados são os primeiros a indicar a presença de EPEC em moluscos bivalves no Brasil. Astrovírus não foram identificados nas amostras de moluscos analisadas neste estudo. Norovírus (NoV) foi identificado em 21 (14%) das amostras, sendo 38% de mexilhões e 62% de ostras. As amostras de NoV genogrupo II (GII) foram agrupadas num clado único, juntamente com outras sequências de NoV GII, sendo mais próximas filogeneticamente de sequências originárias do Brasil, Japão e México, com similaridade de 93,8 a 96,6% do que com as outras sequências homólogas. A triagem de moluscos bivalves para coliformes, E. coli e presença de vírus entéricos significativos para a saúde pode ajudar na prevenção de surtos entre os consumidores e contribuir para a melhoria do ambiente estuarino. / The pathogenic bacteria in bivalve molluscs are causative agents of diseases such as gastroenteritis and responsible for several food-borne outbreaks, representing a risk to consumers. Enteric viruses are the most common cause of outbreaks of non-bacterial gastroenteritis in humans in the world and can be found in waters used in the cultivation of bivalve molluscs. The objective of this study was to evaluate the contamination of mussels (Mytella falcate) and oysters (Crassostrea brasiliana) from the estuarine complex Lagunar of Cananéia-Iguape, State of São Paulo, by bacteria (total coliforms, thermotolerant coliforms, Escherichia coli) and by human astroviruses and noroviruses. A total of 150 samples of bivalve molluscs (75 oysters and 75 mussels) were collected from June 2016 to February 2017. The total coliform estimate in oyster tissues varied from 14.1 to 154.5 most probable number (MPN)/g and thermotolerant coliforms from 3.0 to 48.6 MPN/g, whereas for mussel samples, total coliforms ranged from 97.4 to 1300 MPN/g and thermotolerant coliforms from 3.6 to 927 MPN/g. E. coli was detected in 24 samples (16%) at concentrations ranging from <3 to >927 NMP/g. Four (17%) were identified with enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), presenting the gene eae by PCR (Polymerase Chain Reaction) and RFLP (Restriction fragment length polymorphism), and the positive amplicons were sequenced. The percentages of similarity relative to the phoA gene of E. coli, for the five samplings carried out in the study, presented values equal or superior to 88.6%. The EPEC sequences were grouped in different clades with other sequences from Brazil, Switzerland and Uruguay, exhibiting similarity of 57.7 and 97.1% when compared to each other. When compared to other reference sequences deposited in GenBank, the similarity ranged from 56.2 to 95.4%. These results are the first to indicate the presence of EPEC in bivalve molluscs in Brazil. Astroviruses were not identified in the mollusk samples analyzed in this study. Norovirus (NoV) was identified in 21 (14%) of the samples, representing 38% of mussels and 62% of oysters. NoV genogroup II (GII) samples were clustered in a single clade, along with other NoV GII sequences, keeping phylogenetically closest to sequences originating in Brazil, Japan and Mexico, with similarity of 93.8 to 96.6% than with the other homologous sequences. The screening of bivalve molluscs for coliforms, E. coli and the presence of enteric viruses significant to health can help preventing outbreaks among consumers and contribute to the improvement of the estuarine environment.
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Isolamento e detecção molecular do Toxoplasma gondii (Nicolle e Manceaux, 1909) de moluscos bivalves marinhos comercializados no mercado de peixes do Município de Santos no Estado de São Paulo / Isolation and molecular detection of Toxoplasma gondii (Nicole and Manceaux, 1909) from marine bivalves shellfish from the Fish Market in Santos city, São Paulo state, Brazil

Patricia de Oliveira Esmerini 19 February 2009 (has links)
A toxoplasmose é uma zoonose de distribuição mundial. O Toxoplasma gondii infecta o Homem e a maioria dos animais homeotérmicos. A ingestão de oocistos esporulados é uma das formas de transmissão desse protozoário. Oocistos de T. gondii podem esporular na água do mar e manter a infectividade por até seis meses. Moluscos bivalves podem filtrar e reter oocistos de T. gondii da água do mar em condições experimentais. O objetivo deste trabalho foi investigar a presença de T. gondii em ostras (Crassostrea rhizophorae) e mariscos (Mytella guayanensis) em condições naturais. Um total de 300 ostras e 300 mariscos foram adquiridos no Mercado de Peixes do município de Santos no estado de São Paulo no período de 05/03/2008 a 29/08/08 e divididos em 60 grupos de cinco ostras e 20 grupos de 15 mariscos. Para o isolamento do parasita, cinco camundongos foram inoculados oralmente com homogenados dos tecidos de cada grupo de ostras ou mariscos. Para a detecção molecular, o DNA dos tecidos dos mariscos foi extraído pelo método de fenol-clorofórmio e o das ostras, pelo método de isotiocianato de guanidina, Em seguida, foi realizada a nested-PCR (Reação em Cadeia pela Polimerase) baseada na amplificação de um fragmento de 155pb do gene B1 de T. gondii. A genotipagem das amostras de T. gondii detectadas foi feita usando a PCR-RFLP (Polimorfismo de Comprimento de Fragmentos de DNA gerados por Enzimas de Restrição) usando os marcadores SAG1, SAG2, SAG3, BTUB, GRA6, c22-8, c29-2, L358, PK1, CS3 e Apico. Não houve isolamento do parasita pelo bioensaio em camundongos. Nos grupos de mariscos, o T. gondii não foi detectado pela n-PCR e, nos grupos de ostras, houve detecção do T. gondii em dois grupos (3,3%). Não foi possível a genotipagem das amostras de T. gondii detectadas. O presente estudo permitiu concluir que ostras da espécie Crassostrea rhizophorae podem filtrar e reter oocistos de T. gondii e que o ambiente marinho do litoral do estado de São Paulo encontra-se contaminado com oocistos desse parasita. Assim, o consumo de ostras cruas pode representar uma potencial via de transmissão de T. gondii para o Homem e para os animais marinhos. / Toxoplasmosis is a worldwide zoonosis. Toxoplasma gondii is widely prevalent in humans and other mammals. This protozoan parasite can be transmitted by ingestion of sporulated oocysts. T. gondiioocysts can sporulate in seawater and retain their infectivity for at least six months. Experimentally, bivalve mollusks can filter and retain T. gondii oocysts from the seawater. The aim of this study was to investigate the presence of T. gondii in oysters (Crassostrea rhizophorae) and mussels (Mytella guayanensis) in natural conditions. A total of 300 oysters and 300 mussels were acquired from the Fish Market in Santos city, São Paulo state, from March 2008 to August 2008, and divided in 60 groups of five oysters and 20 groups of 15 mussels. To isolate the parasite, five mice were orally inoculated with tissue homogenates from each group of oysters or mussels. For molecular detection of T. gondii, DNA from mussels was extracted using a standard phenol-chloroform method and DNA from oysters was extracted using the guanidine isothiocianate method. A nested-PCR (Polymerase Chain Reaction) based on the amplification of a 155bp fragment from B1 gene of T. gondii was then performed. Eleven PCR-RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) markers including SAG1, SAG2, SAG3, BTUB, GRA6, c22-8, c29-2, L358, PK1, CS3 e Apico were used to genotype positive samples. There was no isolation of the parasite by bioassay in mice. T. gondii was not detected in the groups of mussels by n-PCR. There was detection of T. gondii by n-PCR in two groups of oysters (3.3%). Genotyping of these two positive samples was not successful. The results indicate that oysters of the species Crassostrea rhizophorae, the commonest species from the coast of São Paulo, can filter and retain T. gondii oocysts and that the marine environment of the coast of São Paulo state is contaminated with oocysts of this parasite. The ingestion of raw oysters can represent a potential transmission source of T. gondii to humans and marine mammals.

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