- / -

- / -

- / -

- / -

Το ηλεκτροεγκεφαλογράφημα (ΗΕΓ) είναι μια καταγραφή διαφορών δυναμικού στο τριχωτό της κεφαλής που προέρχονται από τη βιοηλεκτρική δραστηριότητα του εγκεφάλου. Με ιστορία άνω των 70 ετών, η αξία του ΗΕΓ σαν κλινική εξέταση είναι δεδομένη, με σημαντικό πλεονέκτημα το γεγονός ότι είναι μια μη επεμβατική μέθοδος. Ωστόσο, το πλήθος των ιστών που παρεμβάλλονται ανάμεσα στον εγκέφαλο και το τριχωτό της κεφαλής, σε συνδυασμό με το μικρό ύψος των εγκεφαλικών ρυθμών (τάξης μV) κάνουν τις ΗΕΓ καταγραφές επιρρεπείς σε πλήθος παρασίτων εξωεγκεφαλικής προέλευσης (artifacts). Όσον αφορά την κλινική εξέταση το πρόβλημα των artifacts είναι αντιμετωπίσιμο σε κάποιο βαθμό. Άλλωστε, για την κλινική εξέταση έχουν λογική μια απαίτηση ακινησίας και ηρεμίας του εξεταζομένου, που δεν είναι όμως πάντα δυνατή, σε ηλεκτρομαγνητικά θωρακισμένο χώρο, το κόστος του οποίου είναι αποσβέσιμο σε μακροπρόθεσμο χρονικό ορίζοντα. Σε τελική ανάλυση, η διάρκεια καταγραφής ενός ΗΕΓ μπορεί να επιμηκυνθεί τόσο όσο χρειάζεται ο κλινικός ιατρός ώστε να εξάγει ασφαλή διάγνωση. Τέτοιου είδους περιορισμοί όμως, μάλλον φαντάζουν εκτός λογικής σε φιλόδοξες εμπορικές εφαρμογές στον τομέα του Brain Computer Interface. Οι λύσεις σε αυτόν τον τομέα πρέπει να είναι φθηνές, να δουλεύουν ικανοποιητικά στο συνηθισμένο οικιακό ή εργασιακό περιβάλλον και να μην περιορίζουν τον χρήστη. Η προσέγγιση λοιπόν δεν πρέπει να είναι τόσο στον περιορισμό των artifacts, όσο στην αναγνώριση και αφαίρεσή τους. Στην παρούσα εργασία η αφαίρεση των artifacts προσεγγίζεται σαν ένα πρόβλημα Τυφλού Διαχωρισμού Σημάτων. Εφαρμόζονται τεχνικές Ανάλυσης Ανεξαρτήτων Συνιστωσών με σκοπό το διαχωρισμό των artifacts σε ξεχωριστές Ανεξάρτητες Συνιστώσες κάνοντας εύκολη στη συνέχεια την αφαίρεση τους Η παραπάνω προσέγγιση εκτός της προαναφερθείσας εφαρμογής στον τομέα του Brain Computer Interface, έχει σαφώς και κλινική αξία. Θα μπορούσε να εφαρμοστεί για παράδειγμα σε μη συνεργάσιμους ασθενείς (π.χ. μικρά παιδιά) ή σε θορυβώδη εξωτερικά περιβάλλοντα αποσυνδέοντας το ηλεκτροεγκεφαλογράφημα από την απαίτηση ενός καλά ελεγχόμενου, ηλεκτρομαγνητικά θωρακισμένου χώρου. / --

Η παρεμπόδιση της μόλυνσης ενός κυττάρου από τον HIV επιτυγχάνεται ή με αναστολή της αλληλεπίδρασης της ιικής gp120 με τους CD4 υποδοχείς των κυττάρων, είτε παρεμποδίζοντας τη δράση της gp41 ή τέλος αποτρέποντας τη σύζευξη της gp120 με τους CXCR4 και CCR5 υποδοχείς των χημειοκινών. Ο ρόλος όμως των χημειοκινών και των υποδοχέων τους στη διαδικασία μετάδοσης σημάτων, μέσω των οποίων ενεργοποιούνται αποπτωτικοί μηχανισμοί υγιών, μη μολυσμένων από τον HIV κυττάρων, καθιστά την gp120-CCR5/CXCR4 αλληλεπίδραση ιδιαίτερα θελκτικό επιστημονικά στόχο για το σχεδιασμό αναστολέων του κύκλου αναπαραγωγής του ιού. Σύμφωνα με πλήθος ανοσολογικών, φυσικοχημικών και δομικών μελετών η PND V3 περιοχή της gp120 και το εξωκυττάριο αμινο-τελικό πεπτιδικό τμήμα του CCR5 συνυποδοχέα αποτελούν τις κυρίως εμπλεκόμενες περιοχές στην αλληλεπίδραση των δύο πρωτεϊνών. Η μεταβλητότητα της PND V3 ακολουθίας και ο συσχετισμός της με την υιοθετούμενη διαμόρφωση, η σύνδεση της θέσης και του είδους των αμινοξέων με την ένταση της αλληλεπίδρασης και η συνάρτηση του ιικού τροπισμού με τη βιολογικά ενεργή διαμόρφωση των πεπτιδίων αποτελούν θεμελιώδη στάδια στη διαδικασία κατανόησης του μηχανισμού αλληλεπίδρασης της gp120 με τον CCR5 κυτταρικό συνυποδοχέα και των παραγόντων που την καθορίζουν. Προς αυτή την κατεύθυνση εστιάστηκε και το ενδιαφέρον της διατριβής έχοντας ως πρωτογενείς στόχους την αποτίμηση των καθοριστικών παραγόντων της αλληλεπίδρασης χρησιμοποιώντας πεπτιδικά τμήματα των πρωτεϊνών, τον προσδιορισμό του είδους της και την επίλυση της δομής των συγκεκριμένων τμημάτων μέσω Φασματοσκοπίας Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού. Όπως ήταν αναμενόμενο για ελεύθερα, μικρά σε μέγεθος μόρια που είναι διαλυμένα σε νερό, τα PND V3 πεπτίδα εμφάνισαν την ιδιότητα της διαμορφωτικής ελευθερίας αλλά παρουσίασαν σημαντικό αριθμό NOE συζεύξεων, γεγονός το οποίο επέτρεψε τη σύγκλισή τους προς μία συγκεκριμένη διαμόρφωση. Η διαμόρφωση τύπου U, η οποία είχε παρατηρηθεί στις κρυσταλλικές δομές συμπλόκων της gp120, διατηρείται ανεξαρτήτως της παρουσίας του CCR5. Τα αποτελέσματα των πειραμάτων της φασματοσκοπίας NMR υποδεικνύουν την ύπαρξη ασθενούς ηλεκτροστατικής αλληλεπίδρασης μεταξύ των PND V3 πεπτιδίων και του CCR5Nt. Η συμμετοχή των πεπτιδικών τμημάτων του CCR5Nt στην αλληλεπίδραση αυξάνει προοδευτικά και φαίνεται να είναι ανάλογη του αριθμού των θετικά φορτισμένων αμινοξέων της ακολουθίας των PND V3 πεπτιδίων και προφανέστατα εξαρτώμενη από την κατιονική τους δύναμη. Τα συμπεράσματα της διατριβής σε συνδυασμό με εκείνα που παράγονται από πλήθος βιολογικών, βιοχημικών και φυσικοχημικών μελετών παράγουν νέα δεδομένα, τα οποία δύναται να χρησιμοποιηθούν στον ορθολογικό σχεδιασμό αναστολέων με αυξημένη συγγένεια δέσμευσης στον συνυποδοχέα CCR5. / The obstruction of a cell infection by HIV is succeeded either by inhibiting the interaction between the viral gp120 and the CD4 cell receptors or by preventing the gp41 action and deterring the conjuction of gp120 with the CXCR4 and CCR5 chemokine receptors. The role that chemokines and their receptors play at the process of signal transmission, through which the apoptotic mechanisms of non HIV infected cells are activated, appoints the gp120-CCR5/CXCR4 interaction as a highly attractive scientific target for the design of HIV-1 life cycle inhibitors. According to numerous immunological, physicochemical and structural studies the PND V3 region of gp120 and the extracellular N-terminal peptide fragment of CCR5 coreceptor constiture the primary regions that are involved in the interactions of occurring between the two proteins. The sequence variation of the PND V3 region and its correlation with the adopted conformation, the dependence of the position and type of amino-acid with the intensity of the interaction and the linkage of viral tropism with the peptides biologically active conformation comprise fundamental stages in the process of understanding the mechanism of gp120 – CCR5 interaction and the elements that designate it. The thesis interest was oriented towards this direction while its primary targets were the evaluation of the interaction determinants by using peptide fragments, the designation of the interaction type and the calculation of the specific peptides structures through the use of Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy. As expected for free peptides in solution, the peptides representing the PND V3 region of gp120 exhibit conformational flexibility, but they exhibited a large number of NOEs which allowed convergence to a specific conformation. The PND V3 peptides retain the U-turn conformation observed in the crystal structures of gp120 complexes independently of CCR5 presence. The interaction of different regions of the CCR5Nt peptide is gradually increasing proportionally to the positive charge increase in the V3 peptides. The data demonstrate that the PND V3 and CCR5Nt peptide sequences have propensities for interaction and that their binding and selectivity is determined by simple electrostatic attraction mechanisms. The thesis conclusions combined to those extracted by many biological, biochemical and physicochemical studies bring forth new data that can be used in the rational design of inhibitors that will exhibit increased binding affinity for CCR5 co-receptor.

Η διπλωματική αυτή εργασία ασχολείται με την μέτρηση και την ανάλυση της ακουστικής, καθώς και της ηλεκτροακουστικής εγκατάστασης του Συνεδριακού Κέντρου του Πανεπιστημίου Πατρών. Συγκεκριμένα μελετήθηκαν οι τιμές των κυριότερων ακουστικών παραμέτρων, όπως προέκυψαν από ακουστικές και ηλεκτροακουστικές μετρήσεις, που διεξήχθησαν στην κύρια αίθουσα Ι1. Ωστε να εξαχθούν χρήσιμα συμπεράσματα για την καταλληλότητα της αίθουσας για μουσική και ομιλία. Στη συνέχεια έγινε προσομοίωση της αίθουσας και ανάλυση της ακουστικής της, σύμφωνα με την απορροφητικότητα των επιφανειών και σύμφωνα με την θέση της πηγής στη σκηνή, μέσω του λογισμικού Catt Acoustic. Τέλος στα πλαίσια της εργασίας δημιουργήθηκε και ένας ηλεκτρονικός οδηγός, του ηλεκτροακουστικού συστήματος του αμφιθεάτρου Ι1 και των πολλαπλών δυνατοτήτων που αυτό παρέχει. / The subject of this diploma thesis is the study of the Conference Center’s main hall (I1).The main purpose was to draw useful conclusions of the main hall’s suitability for concerts and speeches and to accurately predict its acoustic behaviour. In practice, acoustic and electroacoustics measurements took place, in order to specify the unique acoustic parameters. With the use of the simulation software program Catt -Acoustic a detailed model of the hall was produced and was later differentiated, as far the absorption of the surfaces and the effect of the source’s place on the stage. Furthermore an application was created, in order to show the main hall’s multiple capabilities and also to behave as a digital guide for its electroacoustic system.

- / -

- / -

Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η μελέτη της επίδρασης των εισροών στην ποιότητα του εδάφους των καλλιεργειών, στο οροπέδιο της κοινότητας Ομαλών στη νήσο Κεφαλληνία, μέσω της αξιοποίησης των στοιχείων που προκύπτουν από την δομή και την περιγραφή του συγκεκριμένου αγροτικού οικοσυστήματος. Η μελέτη έγινε σε βιολογικούς και συμβατικούς ελαιώνες και αμπελώνες και διήρκησε 1 χρόνο. Κατά την διάρκεια του χρόνου αυτού, πραγματοποιήθηκαν δειγματοληψίες από τα υπό μελέτη εδάφη και προσδιορίσθηκαν χημικές και βιολογικές ιδιότητες. Συγκεκριμένα προσδιορίστηκαν το pH, η Ικανότητα Ανταλλαγής Κατιόντων, η οργανική ουσία, η Ηλεκτρική αγωγιμότητα, ο φώσφορος, τα ανταλλάξιμα κατιόντα K, Na και Mg, το ολικό άζωτο, το βόριο τα νιτρικά και η εδαφική αναπνοή. Για την αξιοποίηση των αποτελεσμάτων των εδαφολογικών αναλύσεων ήταν απαραίτητη η γνώση των καλλιεργητικών πρακτικών που εφαρμόζονται στα αγροτεμάχια καθώς και οι ποσότητες των εισροών σε αυτά. Για το σκοπό αυτό πραγματοποιήθηκαν συνεντεύξεις σε αγρότες της περιοχής με την χρήση ερωτηματολογίων ανοιχτού τύπου. Από τα ερωτηματολόγια προέκυψε ότι η υψηλότερη ενεργειακή εισροή στο εδαφικό υποσύστημα είναι η κοπριά τόσο στην περίπτωση της βιολογικής καλλιέργειας όσο και συμβατικής καλλιέργειας ελιάς και αμπέλου. Η εντατική χρήση υψηλών ποσοτήτων κοπριάς συμβάλλει στην βελτίωση των χημικών και βιολογικών ιδιοτήτων του εδάφους αλλά εγκυμονεί κινδύνους για την ποιότητα του. / In the following research the effects of agroecosystem inputs on soil quality of crops at plateau Omala of Cephalonia island via the exploitation of elements that result through the study of the structure and the description of particular agroecosystem, were studied. The research had a duration of above 1 year, in which samplings from the soil and their chemical and biological attributes were not only realized but also evaluated concretely pH,Cation Exchange Capacity, organic matter, Electrical Conductivity, the phosphor, Exchangeable Cations K, Na and Mg, total N, NO3, the boron and the microbial rate, were measured. For the exploitation of results of soil analysis it was essential to have obtain knowledge of farming practices that is applied in the farmyards as well as the quantities of inputs. This aim was realised through interviews with farmers of the region with the use of open type questionnaires. The result of these questionnaires was that the higher energy input in the soil subsystem is manure. The intensive use of high quantities of manure contributes to the improvement of the chemical and biological attributes of soil but gestates dangers for soil quality.