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Uso de características espectrais para detecção precoce da antracnose e murcha-de-fusário em feijoeiro-comum / Use of spectral characteristics for early detection of anthracnose and fusarium wilt in common beansPrado, Eduardo Vicente do 21 December 2015 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-07-08T13:23:46Z
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Previous issue date: 2015-12-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente trabalho pretende testar a hipótese de que é possível detectar precocemente doenças fúngicas em feijoeiro, utilizando reflectâncias foliares. Para isso, foram feitas análises diárias do comportamento espectral de folhas infectadas com os fungos Colletotrichum lindemuthianum ou Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli, causadores da antracnose e murcha-de-fusário, respectivamente, construção de classificadores baseados em redes neurais artificiais para detecção de folhas infectadas, teste de modelos existentes (índices de vegetação) e seleção de comprimentos de onda mais representativos para a detecção das folhas infectadas e nível de conídios por mililitros, utilizando análise por componentes principais. Foram implantados dois experimentos em casa de vegetação. Os dois experimentos (um de antracnose e um de murcha-de-fusário) foram instalados em casa de vegetação, em Viçosa, Minas Gerais. As cultivares de feijão foram Rudá (carioca), RBS Supremo (preto) e Vermelhinho (vermelho). Nestes experimentos, as concentrações de conídios/mL foram: para a antracnose [zero (controle), 1,2 x 10 4 (baixa), 1,2 x 10 5 (média) e 1,2 x 10 6 (alta) conídios/mL]; e para a murcha-de-fusário [zero (controle), 1,0 x 10 4 (baixa), 1,0 x 10 5 (média) e 1,0 x 10 6 (alta) conídios/mL]. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado (DIC), com seis repetições para cada doença. Cada experimento foi repetido duas vezes. Medidas de reflectância hiperespectral foram obtidas por espectrorradiômetro com resolução de 1nm. A faixa útil de leitura utilizada foi entre 400 e 900 nm. Para as medidas das reflectâncias foliares utilizou-se uma sonda de contato, que possui uma lâmpada de halogênio integrada de 100 W, que foi ligada 90 minutos antes de cada coleta de dados para sua estabilização. A calibração do espectrorradiômetro utilizando a referência do branco, com placa de Spectralon, foi feita no início de cada coleta de dados e depois a intervalos regulares de 15 minutos. O tempo de medida de cada leitura foi ajustado para 544 ms, sendo que cada coleta de reflectância, em cada folha, foi a média de 10 leituras efetuadas pelo espectrorradiômetro. As severidades da antracnose e da murcha-de-fusário foram avaliadas, diariamente, por interpretação visual por pesquisador experimentado nesta atividade. Dos dados de reflectância foram retiradas cinco bandas espectrais: azul (440 – 510 nm), verde (520 – 590 nm), vermelho (630 – 685 nm), red edge (690 – 730 nm) e infravermelho próximo (760 – 850 nm). Análise por componentes principais foi aplicada aos dados dessas cinco bandas para uma redução da dimensão dos dados originais, com o primeiro componente principal de cada banda espectral foram gerados os valores dos escores, que serviram como vetores de entrada da rede neural artificial. A acurácia da classificação foi feita pelo índice Kappa. A discriminação das folhas infectadas e sadias obteve índice Kappa de 0,36 a 0,53 e exatidão global de 81,3% a 85,4%, um dia após a inoculação do fungo C. lindemuthianum e três dias antes dos primeiros sintomas da doença tornarem-se visíveis. Medidas de reflectâncias e índices de vegetação provenientes de reflectâncias hiper e multiespectrais foliares foram utilizados nos dois experimentos. Os índices de vegetação utilizados foram NDVI, DVI, GNDVI, MCARI, RDVI e TCARI. O classificador mais eficiente utilizou o índice DVI multiespectral como variável de entrada e dois neurônios na camada escondida. Esse classificador obteve coeficiente Kappa de 0,32 e exatidão global de 79,3%. O classificador detectou a antracnose três dias antes que os primeiros sintomas característicos se tornassem visíveis. Os resultados indicaram que o uso de dados hiperespectrais não apresentou melhora significativa na classificação, quando comparado com dados multiespectrais. O classificador não detectou folhas infectadas com o fungo F. oxysporum f. sp. phaseoli precocemente. O classificador se mostrou eficiente na discriminação, depois que os primeiros sintomas se tornaram visíveis. O classificador obteve coeficiente Kappa de 0,21 na classificação um dia após o surgimento dos primeiros sintomas característicos da doença. Os resultados nos dois experimentos indicaram que as mudanças nas respostas espectrais, relacionados com cada doença, são dependentes do comprimento de onda. O método de seleção de variáveis baseado em análise por componentes principais e os índices de vegetação com base em medidas hiperespectrais apresentaram melhor desempenho. A região espectral do red edge apresentou os comprimentos de onda que melhor discriminaram folhas infectadas para ambas as doenças. Os resultados das combinações dos índices DVI com GNDVI, MCARI ou TCARI mostraram maior sensibilidade na detecção de folhas infectadas e níveis de severidade para as duas doenças. / This paper aims to test the hypothesis that it is possible to detect early fungal diseases in bean plants using leaf reflectance. We made daily analysis of the spectral behavior of the leaves infected with Colletotrichum lindemuthianum or fungi Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli, causing anthracnose and fusarium wilt, respectively, construction of a classifier based on artificial neural networks for the detection of infected leaves, test existing models (Vegetation Index) and selecting the most representative wavelengths for the detection of infected leaves and severity level using principal component analysis. Two experiments were implanted in a greenhouse. The two experiments (one of anthracnose and a wilt fusarium) were installed in a greenhouse, located on the premises of the Agricultural Research Corporation of Minas Gerais - EPAMIG, Regional Unit Epamig Zona da Mata (UREZM) and on the premises of the Federal University of Viçosa (UFV), in Viçosa, Minas Gerais. The bean cultivars used in both experiments were Rudá (carioca trade group), RBS Supremo (black trade group) and Vermelhinho (red trade group). In these experiments, th three concentrations of conidia/mL were to anthracnose [zero (control), 1.2 x 10 4 (low), 1.2 x 10 5 (medium) and 1.2 x 10 6 (high) conidia/mL]; and for Fusarium wilt [zero (control), 1.0 x 10 4 (low), 1.0 x 10 5 (medium) and 1.0 x 10 6 (high) conidia / mL]. The experimental design was completely randomized (DIC), with four treatments and six repetitions for each disease. Each experiment was repeated twice. Hyperspectral reflectance measurements were obtained by spectroradiometer with a resolution of 1 nm. Useful range of used reading was between 400 and 900 nm. For reflectance measurements of leaf used a contact probe, which features an integrated halogen lamp of 100 W, which was connected 90 minutes before each data collection for stabilization. The calibration of the spectroradiometer using the white reference plate with Spectralon, was taken at the beginning of each data collection and later at regular intervals of 15 minutes. The measuring time for each reading was set to 544 ms, and each collection reflectance in each leaf was the average of 10 readings performed by the spectroradiometer. The severities of anthracnose and fusarium wilt were evaluated, daily, for visual interpretation by researcher experienced in this activity. From the reflectance data were taken five spectral bands: blue (440 - 510 nm), green (520 - 590 nm), red (630 - 685 nm), red edge (690 - 730 nm) and near infrared (760 - 850 nm). Principal component analysis was applied to the data of these five bands for a reduction in the size of the original data, with the first principal component of each spectral band were generated the score values, which served as input vectors of artificial neural network. The classification accuracy was taken by Kappa index. The discrimination of infected and healthy leaves obtained Kappa index 0.36 to 0.53 and overall accuracy of 81.3% to 85.4%, a day after the inoculation of the fungus C. lindemuthianum and three days before the first symptoms of disease become visible. Reflectance measurements and vegetation indices from hyper and multispectral reflectance leaf were used in both experiments. Vegetation indices used were NDVI, DVI, GNDVI, MCARI, RDVI and TCARI. The most efficient classifier used the DVI multispectral index as input variable and two neurons in the hidden layer. This classifier obtained Kappa coefficient of 0.32 and overall accuracy of 79.3%. The classifier detected anthracnose three days before the first characteristic symptoms become visible, for the three cultivars. The results indicated that the use of hyperspectral data showed no significant improvement in ranking when compared with multispectral data. The classifier does not detect the leave infected with the fungus F. oxysporum f. sp. phaseoli early. The classifier was efficient in discrimination after the first symptoms become visible. The classifier obtained Kappa coefficient value of 0.21 in the classification one day after the appearance of the first symptoms characteristic of the disease. The results of the two experiments indicated that the changes in spectral responses, associated with each disease, are dependent on the wavelength. The variable selection method based on principal component analysis and vegetation indices based on hyperspectral measurements showed better performance. The spectral region of red edge presented wavelengths that best discriminated infected leaves of both diseases. The results of the combinations of the indices DVI with DVI, MARI or TCARI showed greater sensitivity in detecting infected leaves and severity levels for the two diseases.
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Análise proteômica diferencial da interação incompatível entre o feijão-de-corda e o fitopatógeno Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz. & Sacc / Differential incompatible interaction between bean-to-string and pathogen Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz proteomic analysis. & SaccMoura, Hudson Fernando Nunes January 2013 (has links)
MOURA, Hudson Fernando Nunes. Análise proteômica diferencial da interação incompatível entre o feijão-de-corda e o fitopatógeno Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz. & Sacc. 2013. 107 f. Dissertação (Mestrado) - Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2013. / Submitted by Eric Santiago (erichhcl@gmail.com) on 2016-05-23T12:39:52Z
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Previous issue date: 2013 / Cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] belongs to the family Fabaceae and is widely used in food as a source of protein, carbohydrates, vitamins and minerals. Among the main features of cowpea, its high protein content and good tolerance to conditions of low water availability in soils, high temperatures and relative tolerance to salinity conditions typical of semi-arid regions of northeastern Brazil, are some of which can be cited. However, despite the considerable capacity of tolerance to different stress conditions, the productivity of cowpea is threatened by the action of various pathogens, among which stand out as major causes of fungal diseases of this crop, the example of Anthracnose as a result of infection by C. gloeosporioides, characterized by reddish-brown spots on the leaf veins that can be extended by all organs of the host plant. Fortunately, the cowpea has cultivars that have different characteristics of resistance against C. gloeosporioides, regarding the activation of plant defenses in incompatible interactions said, given that the pathogen is unable to resolve the infection. From this premise, it is worth mentioning that most of the mechanisms of plant resistance to pathogens is related to the differential gene expression of proteins that act as markers of defense in response to infection. Thus, this study proposes a differential proteomic analysis of the incompatible interaction (resistance) between plants of cowpea genotype BR3, and isolated LPVD-1, the fungus C. gloeosporioides in order to identify potential protein markers for the determinants of this resistance pathossystem. By using the approach 2D-PAGE in addition with mass spectrometry ESI-Q-TOF MS / MS, we have identified 118 differentially expressed proteins, whereas proteins overexpressed (102) and down-expressed (16), involved in various cellular processes, such as : energy metabolism, photosynthesis, protein and nucleic acids metabolism, stress response, cellular transport, redox homeostasis, signaling and defense, with emphasis on expression of PR-10 proteins (pathogenesis-related), remorina and ascorbate peroxidase that had significant alterations at all time points tested. These findings demonstrate the complexity of the mechanisms involved in plant resistance and assist in directing the programs of genetic improvement of this crop against fungal attack. Furthermore, it’s promoting the understanding of the biochemical and physiological interconnections arising from incompatible plant-fungus interaction. / O feijão-de-corda [Vigna unguiculata (L.) Walp.] pertence à família Fabaceae e é bastante utilizado na alimentação humana como fonte de proteínas, carboidratos, vitaminas e minerais. Dentre as principais características do feijão-de-corda, seu elevado conteúdo proteico e a boa tolerância às condições de baixa disponibilidade de água nos solos, altas temperaturas e relativa tolerância à salinidade, condições típicas das regiões semi-áridas do nordeste do Brasil, são algumas das que podem ser citadas. Entretanto, apesar da considerável capacidade de tolerância às diferentes condições de estresses, parte da produtividade do feijão-de-corda é ameaçada pela ação de diversos fitopatógenos, dentre os quais se destacam os fungos como maiores causadores de patologias desta cultura, a exemplo da Antracnose, resultado da infecção por C. gloeosporioides, caracterizada por manchas marrom-avermelhadas nas nervuras foliares que podem se prolongar por todos os órgãos da planta hospedeira. Felizmente, o feijão-de-corda possui cultivares que apresentam características diferenciadas de resistência, frente ao C. gloeosporioides, no que concerne à ativação das defesas da planta em interações ditas incompatíveis, haja vista que o patógeno não consegue deliberar a infecção. Partindo dessa premissa, é válido mencionar que grande parte dos mecanismos de resistência de plantas aos patógenos está relacionada com a expressão gênica diferencial de proteínas que funcionariam como marcadores de defesa em resposta à infecção. Nesse sentido, esse estudo propõe a análise proteômica diferencial da interação incompatível (resistência) entre plantas de feijão-de-corda, genótipo BR3, e o isolado LPVD-1, do fungo C. gloeosporioides a fim de identificar possíveis marcadores proteicos determinantes da resistência para esse patossistema. Por meio da utilização da abordagem Eletroforese Bidimensional em combinação com Espectrometria de Massas ESI-Q-TOF MS/MS, foram identificadas 118 proteínas diferencialmente expressas, considerando proteínas superexpressas (102) e subexpressas (16), envolvidas em diversos processos celulares, tais como: Metabolismo energético, fotossíntese, metabolismo de proteínas e ácidos nucleicos, resposta ao estresse, transporte celular, homeostase redox, sinalização e defesa, com destaque para expressão das proteínas PR-10 (relacionada à patogênese), Remorina e Ascorbato peroxidase que apresentaram alterações significativas em todos os tempos experimentais testados. Esses achados demonstram a complexidade dos mecanismos envolvidos durante a resistência vegetal e auxiliam no direcionamento dos programas de melhoramento genético dessa cultura frente ao ataque de fungos. Além de favorecerem o entendimento das interconexões bioquímicas e fisiológicas que decorrem da interação incompatível planta-fungo.
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Determinação do perfil cromatográfico e avaliação da atividade do extrato etanólico de Achillea millefolium sobre Colletotrichum gloeosporioides / DETERMINATION OF CROMATOGRAPHIC PROFLE AND EVALUATION OF THE ACTIVITY OF EXTRACT ETHANOLIC Achillea millefolium ON Colletotrichum gloeosporioidesDuque, Fernanda Farias 27 February 2013 (has links)
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Fernanda Farias Duque.pdf: 807222 bytes, checksum: 0c1dd87b5f8f95ab1e7791bac3f4860c (MD5)
Previous issue date: 2013-02-27 / A Achillea millefolium, conhecida como mil-folhas ou aquiléia, é uma planta da família Asteraceae e possui atividade como antibacteriana, antifúngica, antitumoral, cicatrizante, antioxidante e antiedematosa. O objetivo deste trabalho foi determinar o perfil cromatográfico e avaliar a atividade fungicida in vitro do extrato etanólico de A. millefolium sobre Colletotrichum gloeosporioides causador da antracnose em frutos de mamão. Partes da planta foram coletadas em dois meses diferentes e separadas em flores, folhas e ramos. Os bioensaios foram realizados com os extratos etanólicos secos, obtido por técnica de maceração e concentrado em evaporador rotativo sob pressão reduzida. Estes extratos foram submetidos a cromatografia preparativa em camada delgada (CCD) sendo obtidas cinco frações. Estas frações
foram diluídas, separadamente, em 150μL de DMSO e incorporada em BDA. Após solidificação do meio, um disco de 0,6cm de diâmetro com o fungo foi colocado no centro da placa de petri e incubado a 28 ± 2°C. Após crescimento avaliou-se o crescimento radial do micélio. O delineamento experimental utilizado foi análise fatorial e as médias foram comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. A
atividade antifúngica foi evidenciada contra C. gloeosporioides sendo que as frações F4 e F5 de folha e flor coletadas em outubro tiveram a maior porcentagem de inibição do crescimento micelial. O perfil cromatográfico das frações do extrato foi realizado através de analises utilizando HPLC-DAD e GC-MS. Através das análises utilizando HPLC e GC da folha coletada em outubro foi possível detectar a presença de ácido cumárico, ácido ferúlico e rutina nas frações F4 e F5 / The Achillea millefolium, known as mil-folhas or aquilea, is a plant of the Asteraceae family and possesses activity as antibacterial, antifungal, antitumor, healing, antioxidant and antiedematosa. The aim of this study was to determine the elution profile and evaluate the in vitro antifungal activity of the ethanol extract of A. millefolium on Colletotrichum gloeosporioides causing anthracnose on papaya fruits.
Parts of the plant were collected in two different months and separated into flowers, leaves and branches. Bioassays were performed with dry ethanolic extracts obtained by maceration technique and concentrated in a rotary evaporator under reduced pressure. These extracts were subjected to preparative thin layer chromatography (TLC) was obtained five fractions. These fractions were diluted separately in 150μL
of DMSO and incorporated in BDA. After solidification of the medium, a disc of 0.6 cm diameter with the fungus was placed in the center of a petri dish and incubated at 28 ± 2°C. After growth evaluated the radial growth of the mycelium. The experimental design was factorial analysis and the means were compared by Tukey test at 5% probability. The antifungal activity was observed against C. gloeosporioides whereas
fractions F4 and F5 of leaf and flower collected in october had the highest percentage of mycelial growth inhibition. The chromatographic profile of the fractions of the extract was performed by analysis using HPLC-DAD and GC-MS. Through
analysis using HPLC and GC leaf collected in october was possible to detect the presence of coumaric acid, ferulic acid and rutin in fractions F4 and F5
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Bioprospecção de macroalgas marinhas e plantas aquáticas para o controle da antracnose (Colletotrichum lindemuthianum) do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.)Abreu, Guilherme Fernandes de January 2005 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2013-07-16T00:34:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1
260989.pdf: 556735 bytes, checksum: d4e21055c33e628d5e6ec0a6b64fcd4a (MD5) / Realizou-se bioprospecção de espécies de macroalgas marinhas e plantas aquáticas com o objetivo de encontrar pelo menos um extrato eficiente para o controle da antracnose (Colletotrichum lindemuthianum) do feijoeiro. Para tanto, foram coletadas e identificadas 17 espécies de macroalgas marinhas: Acanthophora spicifera, Bostrychia sp., Bryothamnion seaforthii, Bryothamnion triquetrum, Centroceras clavulatum, Cheilosporum sagittatum, Codium isthmocladum, Codium sp., Enteromorpha sp., Enteromorpha lingulata, Gracilaria tepocensis, Hypnea spinella, Lithophyllum sp., Petalonia sp., Sargassum stenophyllum, Ulva lactuca, Ulva fasciata; e duas espécies de plantas aquáticas: Lemna sp. e Spartina juncea. Posteriormente, o material foi seco em estufa e os compostos foram extraídos em etanol e concentrados por evaporação. Os extratos foram testados in vitro, avaliando a influência sobre o índice de velocidade de crescimento micelial (IVCM) em meio de cultura, sobre a germinação de conídios e o padrão de germinação conidial (PGC) de C. lindemuthianum, em lâminas escavadas. Em ambos os testes, a concentração utilizada foi de 50 mg peso seco/ mL. Realizaram-se também testes em casa-devegetação onde os extratos foram testados por meio de pulverizações preventivas em plantas de feijoeiro cv. Uirapuru com posterior inoculação dessas plantas com uma suspensão de C. lindemuthianum (1,2x106 conídios/ mL). Para a verificação do efeito local e residual, plantas tratadas foram inoculadas 4 horas e 7 dias após o tratamento, respectivamente, e foram avaliadas as plantas inteiras. Para a verificação do efeito sistêmico, plantas tratadas foram inoculadas 7 dias após o tratamento e somente o trifólio não tratado foi avaliado. A severidade da antracnose foi avaliada aos 5 e 11 dias após inoculação. O extrato de H. spinella apresentou forte ação sobre o crescimento vegetativo de C. lindemuthianum, reduzindo o IVCM em 74% comparado à testemunha. Os extratos de Lemna sp. e S. stenophyllum inibiram a germinação de conídios de C. lindemuthianum em 100% e 99%, respectivamente. Nos testes in vivo, verificou-se que sob efeito local o extrato de B. seaforthii reduziu 35% a severidade da antracnose aos 11 d.a.i.. Embora sem apresentar efeito local, o extrato de Ulva fasciata reduziu 24% a severidade da antracnose aos 11 d.a.i. sob efeito residual e 42% a severidade da antracnose aos 5 d.a.i. sob efeito sistêmico. A indução de resistência foi considerada para explicar a redução de doença pelo extrato de Ulva fasciata. Dados de avaliações in vitro não correlacionaram com os dados obtidos nos experimentos com plantas.
bioprospecting work was performed with species of marine macroalgae and
aquatic plants, in order to screen at least an extract able to control the bean anthracnose. For that, it was collected and identified 17 marine macroalgae species, i.e. Acanthophora spicifera, Bostrychia sp., Bryothamnion seaforthii, Bryothamnion triquetrum, Centroceras clavulatum, Cheilosporum sagittatum, Codium isthmocladum, Codium sp., Enteromorpha sp., Enteromorpha lingulata, Gracilaria tepocensis, Hypnea spinella, Lithophyllum sp., Petalonia sp., Sargassum stenophyllum, Ulva lactuca, Ulva fasciata as well as two aquatic plant species, i.e. Lemna sp. and Spartina juncea. Thereafter, these species were dried in a chamber and, their compounds were extracted with ethanol and concentrated by solvent evaporating. The extracts were tested in vitro for evaluating the effect of them on the mycelial growth velocity index (IVCM) in culture medium and the conidial germination as well as the pattern of conidial germination (PGC) of C. lindemuthianum in well slides. The extract concentration used in both tests was always 50 mg dry wheight/ mL. Experiments were also carried out under greenhouse conditions where bean plants cv. Uirapuru were previously sprayed with the extracts and inoculated with a conidial suspension of C. lindemuthianum (1,2x106 conidia/ mL). To verify the presence of local effect and residual effect, treated plants were inoculated 4 hours and 7 days after treatment, respectively, and whole plants were evaluated. To investigate the systemic effect, treated plants were treated 7 days after treatment, but the disease was evaluated only on the non-treated uppermost three-leaflet leaf. Anthracnose severity was determined on 5th and 11th day after inoculation (dai). The extract of H. spinella presented a strong action towards the mycelial growth of C. lindemuthianum, reducing the IVCM by 74% when compared to the control. The extracts of Lemna sp. and S. stenophyllum inhibited the fungus conidial germination by 100% and 99%, respectively. In greenhouse tests the B. seaforthii revealed local effect, reducing the disease severity by 35% on the 11 dai. Although without showing local effect, the extract of Ulva fasciata reduced the anthracnose severity on the 11th dai by 24% in whole plants and on the 5th dai systemically by 42% as well. The induction of resistance was taken in consideration to explain the disease severity reduction by the extract of Ulva fasciata. In vitro data did not correlate with those obtained
from greenhouse experiments.
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Extratos vegetais: potencial elicitor de fitoalexinas e atividade antifúngica em antracnose do cajueiroCarvalho, Paulo Roberto Santos [UNESP] 28 April 2010 (has links) (PDF)
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carvalho_prs_dr_jabo.pdf: 817782 bytes, checksum: f660ce8f19f225b54d401b2637051704 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Plantas e extratos vegetais podem apresentar ação antifúngica e de indução de defesa em função da presença de compostos com características elicitoras. Nesse sentido, foram objetivos do trabalho avaliar o efeito antifúngico dos extratos brutos aquosos de alecrim pimenta, nim e urtiga sobre Colletotrichum gloeosporioides; o potencial como elicitores de fitoalexina e o efeito de controle da antracnose em folhas destacadas de cajueiro. Os extratos brutos aquosos em três concentrações (5%, 10% e 15%) foram adicionados ao meio de cultura BDA para avaliar a ação sobre o crescimento micelial e esporulação e ao substrato Ágar-água para avaliar o efeito na germinação dos conídios e formação de apressórios. O potencial elicitor foi investigado em mesocótilos estiolados de sorgo e cotilédones de soja, determinando a capacidade elicitora das fitoalexinas deoxiantocianidina e gliceolina, respectivamente. Alecrim pimenta a 10% e 15% inibiu totalmente o crescimento micelial de C. gloeosporioides, a esporulação e germinação dos conídios. Nim inibiu parcialmente o crescimento micelial, esporulação e germinação dos conídios de forma proporcional à concentração usada. Urtiga estimulou o crescimento micelial, mas inibiu parcialmente a esporulação e a germinação. Apressórios não foram formados na presença dos três extratos brutos aquosos. Apenas alecrim pimenta a 15% mostrou potencial elicitor de deoxiantocianidina em sorgo. Já em soja foi observado potencial elicitor de gliceolina, embora com acentuada variação, tanto pelos três extratos brutos aquosos quanto pelas concentrações estudadas. O controle da antracnose em folhas destacadas de cajueiro foi observado em todas as concentrações dos extratos de alecrim pimenta e nim e, com urtiga a 15%. O maior efeito de controle foi proporcionado, igualmente, pelas concentrações do extrato de alecrim pimenta / The use of plant extracts have shown antifungal and induction of defense due to the presence of compounds with characteristics elicitors. Therefore, the goals were to evaluate the antifungal effect of aqueous extracts of rosemary pepper, neem and nettle on Colletotrichum gloeosporioides and the potential as elicitors of phytoalexin and the effect of control of anthracnose in detached leaves of cashew plant. The extracts of three concentrations (5, 10 and 15%) were added to the culture medium to evaluate the effect on the mycelial growth and sporulation or to the water-agar substrate to evaluate the effect on conidial germination and apressoria formation. The potential elicitor was investigated in etiolated sorghum mesocotyl and soybean cotyledons, determining the ability of the phytoalexin elicitor deoxyanthocyanidin and gliceollin respectively. Rosemary Pepper 10 and 15% completely inhibited the mycelial growth of C. gloeosporioides and sporulation and germination. Nim partially inhibited the mycelial growth, sporulation and spore germination in proportion to the concentration used. Nettle stimulated mycelial growth, but partially inhibited the sporulation and germination. Appressoria were not formed in the presence of the three extracts. Only rosemary pepper 15% showed potential elicitor of deoxyanthocyanidin in sorghum. In soybean, potential elicitor of gliceolina, although with marked variation, was observed so the three extracts as the concentration. Control of anthracnose in detached leaves of cashew plant was observed at all concentrations of extracts of rosemary pepper and neem and nettle to 15%. The biggest effect of control was provided equally by the concentrations of the extract of rosemary pepper
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Avaliação de doenças em maracujazeiro azedo : reação de genótipos e validação de escalas diagramáticasCosta, Anne Pinheiro 21 March 2018 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2018. / Submitted by Robson Amaral (robsonamaral@bce.unb.br) on 2018-05-14T18:00:25Z
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Previous issue date: 2018-05-14 / O maracujazeiro azedo (Passiflora edulis) é a principal espécie do gênero cultivada no Brasil e apresenta grande importância econômica, social e nutricional. Muitas doenças afetam esta cultura, como a antracnose (Colletotrichum gloeosporioides), bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae - Xap), septoriose (Septoria passiflorae), verrugose (Cladosporium spp.) e virose do endurecimento dos frutos (VEF) (Cowpea aphid-borne mosaic virus - CABMV). A identificação de fontes de resistência e o desenvolvimento de ferramentas adequadas para a quantificação da severidade das doenças são essenciais para o desenvolvimento de materiais resistentes. Portanto, os objetivos deste estudo foram: avaliar a reação de genótipos de maracujazeiro azedo a isolados de Xap (UnB-1392 e UnB-1393) e CABMV (UnB-FAL e UnB-Pipiripau), inoculados mecanicamente nas mesmas plantas, em épocas distintas, sob cultivo protegido; e elaborar e validar escalas diagramáticas para a avaliação da severidade da antracnose, bacteriose, septoriose e verrugose em frutos e folhas do maracujazeiro azedo. Todos os genótipos foram moderadamente suscetíveis à VEF, independentemente da ordem de inoculação dos isolados. Todos os genótipos mostraram-se suscetíveis à bacteriose quando os isolados foram inoculados na estação chuvosa. Quando inoculados na estação seca, MAR20#10, MAR20#41 e Rosa Intenso foram moderadamente resistentes à bacteriose (UnB-1393), enquanto os genótipos remanescentes mostraram-se moderadamente suscetíveis. As escalas diagramáticas propostas permitiram quantificar as severidades das doenças de forma acurada e precisa, aumentando a concordância entre os valores estimados e os valores reais. O aumento da acurácia foi detectado pela redução nos erros constantes e sistemáticos. Por sua vez, o aumento da precisão foi verificado pelo incremento dos coeficientes de determinação, pela redução dos erros absolutos e pelo aumento da reprodutibilidade das estimativas entre pares de avaliadores. A análise de correlação de concordância de Lin confirmou os incrementos da acurácia e precisão detectados pela análise de regressão linear. O uso das escalas diagramáticas desenvolvidas e validadas neste estudo proporcionará melhores avaliações da severidade das doenças, auxiliando os melhoristas e fitopatologistas nas avaliações e seleções de genótipos de maracujazeiro azedo resistentes às doenças em frutos e folhas. / Yellow passion fruit (Passiflora edulis) is the main species from Passiflora cultivated in Brazil
and presents economic, social, and nutritional importance. Many diseases affect this crop, such as anthracnose (Colletotrichum gloeosporioides), bacterial spot (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae - Xap), septoriosis (Septoria passiflorae), scab (Cladosporium spp.), and passion fruit woodiness disease (PWD) (Cowpea aphid-borne mosaic virus - CABMV). Identification of disease resistance sources and development of adequate tools to quantify disease severity are essential for developing resistant plant materials. Therefore, the objectives of this study were to evaluate the reaction of passion fruit genotypes to Xap (UnB-1392 and UnB-1393) and CABMV (UnB-FAL and UnB-Pipiripau) isolates, which were mechanically inoculated on the same plants, in distinct dates, under protected cultivation; and to elaborate and validate diagrammatic scales for severity assessments of anthracnose, bacterial spot, septoriosis, and scab in fruits and leaves of yellow passion fruit. All genotypes were moderately susceptible to PWD, regardless the inoculation sequence of the isolates. All genotypes were susceptible to the bacterial spot when the isolates were inoculated in the wet season. When inoculated in the dry season, MAR20#10, MAR20#41, and Rosa Intenso were moderately resistant to the bacterial spot (UnB-1393), whereas the remaining genotypes were moderately susceptible. The proposed diagrammatic scales allowed accurate and precise quantification of disease severity, increasing the concordance between estimated and actual values. The increased accuracy was detected by the reduction of the constant and systematic errors. Moreover, the increased precision was verified by the increase of the coefficient of determination, by the reduction of the absolute errors, and by the increase of the reproducibility between pairs of evaluators. Lin's concordance correlation coefficient confirmed the increases in accuracy and precision detected by the linear regression analysis. The utilization of the diagrammatic scales developed and validated in this study will provide better quality evaluations of the severity of the diseases, assisting plant breeders and pathologists during evaluations and selection of yellow passion fruit genotypes resistant to diseases in fruits and leaves.
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Avaliação do uso de ozônio e de outros tratamentos alternativos para a conservação do mamão papaia (Carica papaya L.)Kechinski, Carolina Pereira January 2007 (has links)
Devido à alta perecibilidade do mamão papaia (Carica papaia L.), estudos póscolheita, com foco nas boas práticas de estocagem e transporte, são importantes na cadeia de comercialização desse fruto. O uso de ozônio (O3) tem sido recomendado como um tratamento alternativo aos compostos clorados tradicionais para o controle de podridões de diversos frutos. Nesse contexto o presente trabalho tem como objetivos: estudar o efeito do (O3) e de outros tramentos alternativos no intuito de eliminar a antracnose (Colletotrichum gloeosporioides Penz) no mamão papaia armazenado em câmaras ozonizadas em concentrações de 0 a 0,5 ppm de ozônio; avaliar a sanitização superficial desse fruto através da imersão em água ozonizada em concentrações de 0 a 4 ppm de O3 durante 30 e 60 segundos e otimizar o tratamento hidrotérmico em temperaturas de 45 a 65 ºC por períodos de 30 a 60 segundos. O uso de (O3) em concentrações entre 0,2 e 0,5 ppm, em câmara ozonizada, resultou em mamões com manchas na casca do fruto por possível oxidação de componentes da parede celular. Foi observado ainda que a imersão das frutas em água ozonizada em concentrações de 1 a 4 ppm de O3 não foi efetiva na eliminação da antracnose, razão pela qual foi necessário o uso do tratamento hidrotérmico prévio ao uso do (O3), sendo que os melhores resultados obtidos foram nas temperaturas próximas de 55ºC por 1 minuto. O uso de ozônio não afetou a superfície cuticular dos mamões enquanto que o tratamento hidrotérmico proporcionou um recobrimento das fissuras naturais do fruto. O aumento da concentração de ozônio de 2 para 4 ppm proporcionou uma perda de mais de 40% do conteúdo de Vitamina C. O ozônio não alterou o grau de maturação (ratio) e cor dos frutos. / Postharvest studies are important for marketing chain of papaya fruit (Carica papaya L.) with focus on good agricultural practices for storage and transportation due to the high perishibility of this fruit. The use of ozone (O3) has been recommended as an alternative treatment to traditional chlorine compounds for the control of several decay organisms. Within that the present work objectivated study the effects of O3 and other alternative treatments to control antracnose (Colletotrichum gloeosporioides Penz) on the papaya fruit stored in chambers with ozone concentrations of 0 to 0.5 ppm; evaluate the superficial healthyness of papayas by immersion in ozone water at concentrations of 0 to 4 ppm for 30 to 60 seconds; optimize the hydrothermal treatment at temperatures of 45 to 65°C for periods of 30 to 60 seconds. The use of O3 at concentrations of 0.2 and 0.5 ppm in ozoned chamber result in spots on the fruit epidermis by the possible oxidation of cell wall components. It was noted, however, that immersion in ozoned water of the fruits at concentrations of 1 to 4 ppm of O3 were not effective in the removal of antracnose. So it is necessary to use hydrothermal treatments before the use of O3. Best results were obtained an temperatures close to 55°C for 1 minute. The use of ozone did not affect the fruit cuticular surface, while the hydrothermal treatment provided the recovering of the natural fissures of the fruit. The increased ozone concentration from 2 to 4 ppm provided a loss of more than 40% of the Vitamin C content. Ozone did not affect the degree of ripening (ratio) and the skin color of the papayas.
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Caracterização molecular e patogênica de isolados de Colletotrichum spp. associados a sintomas de antracnose em mangueirasSouza, Andressa de [UNESP] 28 February 2011 (has links) (PDF)
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souza_a_me_jabo.pdf: 1098095 bytes, checksum: 90c36824f4f63db09ab3ab57ecb91613 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A mangueira (Mangifera indica L.) conta com diversos problemas de ordem fitossanitária, destacando-se como um dos mais importantes, a antracnose, causada na maioria das vezes pelo fungo C. gloeosporioides. Dada a importância comercial dessa doença, esse trabalho teve por objetivo realizar a caracterização genética e patogênica de uma população de isolados de Colletotrichum spp. oriundos de tecidos com sintomas de antracnose de diferentes variedades e órgãos das plantas de manga, dos principais municípios produtores do Estado de São Paulo, além de compará-los geneticamente com isolados obtidos de citros. O sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2 possibilitou a identificação de 183 isolados de uma população obtida de mangueiras como C. gloeosporioides, com exceção de apenas um deles, o qual foi identificado como C. acutatum. Já os isolados de citros, sendo três obtidos de folhas assintomáticas e dois de flores com sintomas de podridão, foram classificados em C. gloeosporioides e C. acutatum, respectivamente. Os resultados obtidos mediante o emprego de marcadores fAFLP indicaram uma alta variabilidade genética entre isolados de uma mesma população e a ocorrência de fluxo gênico. Além disso, tais resultados corroboraram aqueles obtidos pelo sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, por agruparem os isolados do estudo segundo a sua espécie. Os isolados representativos da população, inclusive aqueles obtidos de citros, de ambas as espécies de Colletotrichum, causaram sintomas típicos de antracnose quando inoculados em folhas de mangueiras „Palmer‟ e „Tommy Atkins‟, indicando que, provavelmente, não há especificidade de hospedeiros para essas espécies / The mango crop (Mangifera indica L.) is attacked by several diseases and in this context, the anthracnose is one of the most important. This disease is caused by the fungus C. gloeosporioides in most situations. Due to economic importance of the anthracnose on mango, the aim of this study was to analyze the genetic and pathogenic variability of Colletotrichum spp. isolates obtained from different organs and varieties of mango plants with anthracnose symptoms, and from different municipalities of São Paulo State that are among the major producers of mango. The isolates from mango were also compared with isolates obtained from citrus. Sequencing of ITS1-5.8S-ITS2 region from 183 isolates obtained from mango allowed the identification of them as C. gloeosporioides, however, one of them, was identified as C. acutatum. The isolates from citrus, obtained from syptomless leaves and flowers with rot symptoms, were identified as C. gloeosporioides and C. acutatum, respectively. The results obtained by applying fAFLP markers indicated high level of genetic variability among isolates within population and the occurrence of gene flow. Moreover, these results corroborated those achieved by sequencing of the ITS1-5.8S-ITS2 region, because the isolates were grouped according to its species. Representative isolates of the population, including those obtained from citrus, belonging to both species of Colletotrichum, caused typical symptoms of anthracnose disease on mango leaves of Palmer and Tommy Atkins varieties, indicating the lack of host specificity for these species
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Silício no controle de Colletotrichum lindemuthianum em feijoeiro / Silicon in the control of Colletotrichum lindemuthianum in bean plantVedovatto, Felipe 16 February 2017 (has links)
The bean plant anthracnose is caused by fungus Colletotrichum lindemuthianum (Sacc& Magnus) Scribner, which is considered one of the main diseases that attacks the culture, which might cause losses and final productivity decrease and one of the most used alternative of control is the chemical and genetic induction of resistance. The use of silicon in agriculture presents many benefits, such as: decrease of toxicity by metals, relief of saline stress and lack of water, increase of resistance to strong winds, increase of resistance to pathogens and insects, among others. Thus, the present paper has the aim of evaluating the effect of silicon as inductor of resistance to anthracnose in bean plant, by using different sources in the seeds’ coating. It was used four sources of silicon: ash of carbonized rice hull, dust of rock commercial product Potenccy® , the commercial product Supa Sílica, Agrichem® and the commercial product Silicon SiO2, Rigrantec®. It was conducted two experiments: in experiment 1 it was tested the silicon sources applied in seeds of culture IPR Graúna, susceptible to anthracnose, through sanitary and physiological evaluation of seeds and it was carried out the histological analysis of seedlings and tegument of the seeds to detect the presence of silicon. The silicon source which presented the best answers to the anthracnose control, in experiment 1, was used in experiment 2, that was performed in the field, with two cultures of bean susceptible to anthracnose (IPR Graúna and IPR Uirapuru), where it was assessed the emergency and symptoms in the seedlings. It was possible to identify silicates in the primary leaves of bean seedlings, deriving from silicon source Silicon SiO2, Rigrantec®. The application of silicon reduces the negative effect of inoculation with Colletotrichum lindemuthianum in bean seeds. / A antracnose do feijoeiro é causada pelo fungo Colletotrichum lindemuthianum (Sacc & Magnus) Scribner, sendo considerada uma das principais doenças que atacam a cultura, podendo ocasionar perdas e diminuição da produtividade final e uma das alternativas de controle mais utilizadas é a indução química e genética de resistência. O uso do silício na agricultura apresenta vários benefícios, tais como: diminuição de toxidez por metais, alívio do estresse salino e da falta de água, aumento da resistência a ventos fortes, aumento da resistência a patógenos e insetos, entre outros. Diante disso, o presente trabalho tem como objetivo avaliar o efeito do silício como indutor de resistência à antracnose do feijoeiro, utilizando diferentes fontes no recobrimento de sementes. Foram utilizadas quatro fontes de silício: cinza de casca de arroz carbonizada, pó de rocha produto comercial Potenccy®, o produto comercial Supa Sílica, Agrichem® e o produto comercial Silicon SiO2, Rigrantec®. Foram conduzidos dois experimentos: no experimento 1 foram testadas as fontes de silício aplicadas em sementes da cultivar IPR Graúna, suscetível a antracnose, através da avaliação sanitária e fisiológica das sementes, e foi realizada a análise histológica das plântulas e do tegumento das sementes para detectar a presença de silício. A fonte de silício que apresentou as melhores respostas para o controle da antracnose, no experimento 1, foi utilizada no experimento 2, que foi realizado em campo, com duas cultivares de feijão suscetíveis a antracnose (IPR Graúna e IPR Uirapuru), onde foram avaliadas a emergência e sintomas nas plântulas. Foi possível identificar silício nas folhas primárias de plântulas de feijão, somente para o tratamento com silício oriundo do produto comercial Silicon SiO2, Rigrantec®. A aplicação de silício reduz efeito negativo da inoculação com Colletotrichum lindemuthianum nas sementes de feijão.
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Ocorrência do gorgulho conotrachelus psidii (coleoptera: curculionidae) e manejo das principais doenças e pragas na goiabeira serrana acca sellowiana com ênfase na homeopatia / Ocurrence of Conotrachelus psidii (Coleoptera: Curculionidae) weevil, and pest and diseases management of feijoa Acca Sellowiana, with emphasis in homeopathyBohneberger, Ariane Luckmann 19 August 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-08-19 / The feijoa Acca sellowiana is a native specie from Planalto Serrano Catarinense region and it has high potential to be developed as cash crop, besides its ecological function in the ecosystem. In another hand, pest and diseases has been common under cultivated conditions but not confirmed in the natural conditions as well. The main problems point out were fruit fly Anastrepha sp., Conotrachelus sp. weevil, and anthracnose Colletotrichum gloeosporioides. The objective of this work was to study the entomofauna of feijoa, with focus on Conotrachelus sp., fruit fly and anthracnose, and their management strategies throughout homoeopathic preparations and traps. Samples of adults of weevil were sent to expertise for identification. Feijoa fruits from monoculture systems and natural ecosystems were collected and weevil damage was assessed. The weevil dissemination into orchard was studied on trees at different spacing with and without obstacle around the trunk. Population fluctuation of fruit fly and other entomofauna species on feijoa were monitored by traps with grape juice at 20% installed inside the monoculture orchard and natural ecosystem capões in the Planalto Serrano Catarinense region. The effect of homoeopathic preparations on entomofauna was evaluated throughout homoeopathic traps. Bio-essays were conducted under controlled conditions to verified the attractiveness of homoeopathic preparations to weevil by treated bags with feijoa fruits under free choice arena. The fungus Beauveria bassiana e Metarhizium anisopliae were tested for biological control to weevil, by spraying spore suspension over adults and keeping in box under room conditions. Homoeopathic preparations were evaluated for controlling feijoa leaf diseases under field conditions in completely randomised design. Results confirmed the identity of feijoa weevil as Conotrachelus psidii, the same specie that occur on Psidium guajava. The weevil C. psidii does not move upside trunk and its damage is higher on feijoa monoculture orchard than natural ecosystems. Fruit fly was also more trapped in feijoa monoculture orchard. Homeopathic preparation of Silicea 30CH repelled weevil C. psidii. The entomopathogenic fungus B. bassiana e M. anisopliae were not effective to control C. psidii. Tannin homoeopathic preparation at 30CH increased the attractiveness of grape juice traps. Carbo vegetabilis at 30CH reduced the incidence of anthracnose and Capnodium sp. on feijoa leaves. The progenies from Uruguay and Brazil showed genetic resistance sources for using to manage anthracnose and cercosporiose diseases under field conditions / A goiabeira serrana Acca sellowiana é uma espécie nativa do Planalto Serrano Catarinense e apresenta alto potencial para a exploração comercial dos frutos, além de exercer sua função ecológica nos ecossistemas associados. Por outro lado, distúrbios bióticos têm se manifestado, quer nos sistemas naturais de ocorrência ou nos pequenos cultivos. Como principais causas destes distúrbios têm sido citados a mosca-das-frutas Anastrepha sp., o gorgulho Conotrachelus sp e a antracnose Colletotrichum gloeosporioides. O objetivo do trabalho foi estudar a flutuação da entomofauna ocorrente, a identidade, a disseminação e o manejo do gorgulho, a freqüência de ocorrência da mosca-das-frutas, bem como o efeito de preparados homeopáticos no manejo do gorgulho, mosca-das-frutas e antracnose. Adultos do gorgulho foram encaminhados à especialista, para a confirmação da espécie. Frutos oriundos de monocultivo e capões foram coletados e contado o número de furos por gorgulho. Para estudar a disseminação do gorgulho, foi instalado ensaio em pomar com três espaçamentos de planta com presença ou não de obstáculo físico no tronco. Frascos caça mosca, contento suco de uva a 20% como isca atrativa, foram instalados no pomar de monocultivo e em três capões da região do Planalto Serrano Catarinense, para avaliar a flutuação populacional da mosca-das-frutas e a entomofauna associada à goiabeira serrana. No pomar de monocultivo, foi instalado experimento com frascos caça mosca, para avaliar o efeito de preparados homeopáticos na atratividade de mosca-das-frutas, quando adicionados ao atrativo alimentar. Para avaliar a atividade dos tratamentos na repelência do gorgulho, foram conduzidos ensaios no laboratório, aplicando preparados homeopáticos sobre sacos contendo frutos de goiabeira serrana e outro sobre os frutos, colocando-os em arenas de livre escolha com gorgulhos. Os fungos Beauveria bassiana e Metarhizium anisopliae foram testados, em ensaio, para o controle do gorgulho. Os tratamentos foram aspergidos sobre gorgulho postos em caixas gerbox, avaliando-se a mortalidade e infecção no final do ensaio. Seis preparados homeopáticos foram aplicados, em delineamento inteiramente casualizado, no pomar de goiabeira serrana e avaliou-se a incidência de doenças foliares em ramos amostrados. Os resultados mostram que o gorgulho da goiabeira serrana é Conotrachelus psidii, o mesmo da goiabeira comum Psidium guajava. A disseminação do gorgulho não ocorre via fuste e é mais eficiente em plantas com copas mais próximas e mais baixas. A incidência e severidade de danos do gorgulho é mais alta nos frutos de goiabeira serrana cultivada em monocultivo do que nos capões. De mesma forma, o número de mosca-das-frutas foi maior no monocultivo do que nos capões. A homeopatia de Silicea 30CH mostrou ação repelente ao gorgulho. Os fungos entomopatogênicos B. bassiana e M. anisopliae não foram eficientes para o controle do adulto do gorgulho. A homeopatia de Tanino 30CH aumentou a atratividade dos frascos caça moscas. Carbo vegetabilis 30CH, apesar de não diferir significativamente da testemunha, mostrou menor incidência de antracnose e fumagina nas folhas de goiabeira serrana. As progênies mostraram diferença significativa na incidência de antracnose, cercosporiose e fumagina, havendo reação de resistência em progênies brasileiras
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