Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2018-03-19T19:52:37Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Ricardo Plácido.pdf: 2011039 bytes, checksum: 3b8c66a0bf2439ba819c15103f0ac07d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-19T19:52:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Ricardo Plácido.pdf: 2011039 bytes, checksum: 3b8c66a0bf2439ba819c15103f0ac07d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-06-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The birdwatching is one of the activities of ecotourism that grows the most in the world and at Brazil, country which shows to have great bird species diversity. Protected area‟s (PA) are privileged areas for this modality of ecotourism since they protect habitats and species of interest for the bird watchers. In this work, we developed a methodological protocol to evaluate the viability of bird observation in the protected areas of the Amazon forest. The protocol is based on evaluating the attractiveness levels of bird species recorded at the protected area‟s, the infrastructure conditions and services offered by the management, and, also, the main conditions of the municipalities near the units to host the birdwatchers. The protocol was applied in the Area of Relevant Ecological Interest (AREI) Japiim-Pentecoste located at the State of Acre. A total of 266 bird species were recorded in this a PA, of which 65 and 24 species were evaluated in having a attractiveness index, for birding, ranging from medium to high levels. There is a set of available trails that cross through the PA main areas opened by residents for their agroextractivist labours. The managing body of the protected area however, does not offer any infrastructure or facility to support visitation. The municipalities close to the PA are Mâncio Lima and Cruzeiro do Sul, and the latter offers a wide range of hotels and rental possibilities to support the bird watching activity. Few accommodation and transportation services were available in Mâncio Lima, although the municipality was located closer to the PA easing access to it. The protocol was efficient for a quick and simple analysis of the potential to the practice of bird observation in PA‟s. However, some aspects such as the diminution of subjectivity in the evaluation of the attractiveness of each species can be improved. We believe that the protocol developed in this study can be applied in other Amazon forest's PA‟s to evaluate the potential of these protected areas for the promotion of ecotourism based on birdwatching. / A prática da observação de aves é um dos ramos do ecoturismo que mais cresce no mundo e no Brasil, país com grande diversidade de espécies de aves. Unidades de conservação (UC‟s) são espaços privilegiados para esta atividade de ecoturismo já que protegem hábitats e espécies de interesse dos observadores de aves. Neste trabalho desenvolvemos um protocolo metodológico para avaliar a viabilidade da prática de observação de aves em unidades de conservação na Amazônia. O protocolo se baseia em avaliar os níveis de atratividade das espécies de aves registradas na unidade de conservação, as condições de infraestrutura e serviços oferecidos pela gestão e as condições básicas dos municípios próximos às unidades para recepcionar observadores de aves. O protocolo foi aplicado na Área de Relevante Interesse Ecológico (ARIE) Japiim-Pentecoste localizada no Estado do Acre. Foram registradas 266 espécies de aves nesta unidade de conservação, das quais 65 e 24 espécies foram avaliadas como de médio e alto índice de atratividade para observadores de aves. Existe um conjunto de trilhas disponíveis que cruzam pelos principais ambientes da unidade que foram abertas por moradores para as suas atividades agroextrativistas. O órgão gestor da unidade, no entanto, não oferece nenhuma infraestrutura ou facilidade de apoio à visitação. Os municípios próximos à unidade são Mâncio Lima e Cruzeiro do Sul, sendo que este último oferece uma ampla gama de hotéis e possibilidades de aluguel de veículos para suporte à atividade de observação de aves. Poucos serviços de acomodação e transporte estavam disponíveis em Mâncio Lima, apesar do município se localizar mais próximo da UC facilitando o acesso à mesma. O protocolo se mostrou eficiente para uma análise rápida e simples do potencial da prática de observação de aves em unidades de conservação. Entretanto, alguns aspectos como a diminuição da subjetividade na avaliação dos atrativos de cada espécie podem ser aperfeiçoados. Acreditamos que o protocolo desenvolvido neste estudo pode ser aplicado em outras unidades de conservação da Amazônia para avaliar o potencial destas áreas protegidas na promoção do ecoturismo baseado na observação de aves.

Submitted by Jorge Cativo (jorge.cativo@inpa.gov.br) on 2018-08-23T17:24:34Z No. of bitstreams: 2 Dissertação de mestrado_JulianaBonanomi.pdf: 1856337 bytes, checksum: 32f8d3df86090bb82e49bcd561c1750e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-23T17:24:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação de mestrado_JulianaBonanomi.pdf: 1856337 bytes, checksum: 32f8d3df86090bb82e49bcd561c1750e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2013-11-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Central Amazonia hydrography influences the structure of the local vegetation forming two distinct environments called as plateaus and lowlands. Also there are areas of secondary forests due to recent human activities. To understand how the topographic variations, secondary forest and dead standing trees influences the occurrence of species of nocturnal birds we used autonomous recorder for data occupancy and detection of species at a large spatial scale.The study was conducted in the Área de Relevante Interesse Ecológico, ARIE), under the Project Biological Dynamics of Fragmented Forests (Projeto Dinâmica Biológica de Fragmentos Florestais, PDBFF), located 70 km north of the city of Manaus, Amazonas state, Brazil. Occupancy of each species was estimated using maximum likelihood models. The principal conclusions of this study are: (1) local elevation influences the occupancy of three species of owl and one species of nightjar; (2) secondary forest areas negative influences the occupancy of two species and positive influences the occupancy of four species; (3) does not seem obvious that dead trees standing influence probabiliadade occupation of nocturnal birds; (4) there werea strong negative effect of moonlight on the detection of owl Lophostrix cristata and the nightjars Hydropsalis albicollis and Lurocalis semitorquatus. Nevertheless, moonlight seems to have a positive effect on the detection of potoo Nyctibius griseus. The method of autonomous recording was efficient to detect nocturnal birds in in high spatial and temporal scale. / Na Amazônia Central a hidrografia local influencia na estrutura da vegetação formando dois ambientes bem distintos, denominados platôs e baixios. Há também áreas de florestas secundárias, devido a atividade antrópica recente. Para entender como as variações topográficas, floresta secundária e árvores mortas em pé influenciam na ocorrência das espécies de aves noturnas, usamos gravadores autônomos para obter dados da ocorrência das espécies em grande escala espacial. A porcentagem de iluminação da lua foi usada como variavél ambiental para calcular a detecção das espécies. O estudo foi conduzido na Área de Relevante Interesse Ecológico (ARIE), do Projeto Dinâmica Biológica de Fragmentos Florestais (PDBFF), localizada a 70 Km ao Norte de Manaus, Brasil. A ocupação das espécies foi estimada através de máxima verossimilhança e as principais conclusões do estudo foram:(1) a topografia do local influencia a ocupação de quatro espécies de corujas e uma espécie de bacurau.;(2) a floresta secundária influencia positivamente na ocupação de quatro espécies; (3) o luar tem efeito positivo na detecção da coruja Megascopswatsonii e do bacurau Lurocalis semitorquatus. Porém o luar tem efeito positivo na detecção do urutau Nyctibius griseus e negativo na detecção de Nyctibius leucopterus. Os método de gravação autônoma foi eficiente para amostrar áreas em grande escala espacial e temporal.

Patógenos associados a aves migratórias podem causar doenças em aves domésticas. As aves de subsistência são possíveis fontes de disseminação destes patógenos pela ausência de biossegurança na criação e pelo contato com aves silvestres. A região do Parque Nacional da Lagoa do Peixe (PNLP), no Rio Grande do Sul, se caracteriza como um importante sítio de aves migratórias. Devido a isto, é possível uma interface entre aves migratórias e aves de subsistência criadas na região. A influenza aviária (AI) é a principal doença associada a aves migratórias que afeta o sistema respiratório, sendo estas os principais disseminadores do vírus. Estudos prévios indicam que há risco de introdução de um vírus de AI de alta patogenicidade (HPAIV) na região. Porém, o padrão e impacto do espalhamento deste patógeno na região é desconhecido, visto a ausência de relatos. Cabe ressaltar que outras enfermidades respiratórias, como a Doença de Newcasle (ND) e a micoplasmose por Mycoplasma gallisepticum (MG), também são associadas a aves migratórias e podem causar doenças em aves domésticas. Neste contexto, o objetivo deste trabalho é realizar um inquérito epidemiológico de doenças respiratórias associadas a aves migratórias em aves de subsistência e propor um modelo de espalhamento de HPAIV na região do PNLP. Com esta finalidade, realizamos uma avaliação (i) da presença de anticorpos contra AI, ND e MG nas aves de subsistência por ELISA, (ii) da presença dos agentes de AI e ND por RT-PCR em tempo real nas aves de subsistência, (iii) dos possíveis fatores de risco associados aos patógenos e (iv) das consequências da introdução de HPAIV na região através de um modelo matemático de espalhamento. Nas propriedades de aves de subsistência amostradas da região, foi detectada a presença de anticorpos contra AI, ND e MG na frequência de 4,2%, 87,5% e 58,3%, respectivamente. Todas as amostras foram negativas no RT-PCR em tempo real realizado para AI e ND. A avaliação de fatores de risco foi possível nas propriedades soropositivas para ND e MG, possibilitando realizar-se a primeira análise de fatores de risco para estes agentes em aves de subsistência no Brasil. Para ND, o risco foi maior nas propriedades nas quais os criadores adotam a prática de reposição própria para manter a criação (PR=1,64; 95% IC: 1,11 – 2,42). Além disso, o aumento na distância das granjas em relação ao estuário da Laguna do Peixe diminui o risco para ND (PR=0,94; 95% IC: 0,90 – 0,99). Já para MG, foram considerados fatores de risco a prática de confinar as aves (PR = 3,40, 95% IC: 1,93 – 5,99) e a interação entre a “troca de aves ou ovos com outros produtores e vizinhos possuírem aves” (PR = 2,16, 95% IC: 1,24 – 3,76). Nas simulações da modelagem matemática de espalhamento de HPAIV na região, a maioria das propriedades se tornaria infectada até o 30º dia de infecção. Além disso, na média das simulações, a infecção atingiria em torno de 80 a 90% das propriedades, alcançando até 30 km de distância do caso índice. Os resultados indicam a circulação de patógenos associados a aves migratórias na região do PNLP. Devido à detecção destes nas aves de subsistência, estas podem ser consideradas sentinelas destes agentes na região. Além disso, os dados obtidos incrementam o conhecimento sobre o espalhamento e a dinâmica dessas doenças em propriedades com aves de subsistência, bem como sobre os indicadores de risco para ocorrência. Estes dados podem ser utilizados para o estabelecimento de medidas de biossegurança e de manejo adequados para este tipo de criação e de programas de monitoria visando à contenção da disseminação de patógenos. / Pathogens associated with migratory birds can cause disease in domestic birds. Backyard poultry are possible source of pathogens dissemination due to the lack of biosecurity measures and the contact with wild birds. The region of Lagoa do Peixe National Park (PNLP), in Rio Grande do Sul state, Brazil, is characterized as an important site for migratory birds. Thus, it is a possible interface place for migratory and backyard birds. Avian influenza (AI) is the most important respiratory disease associated with migratory birds, the main virus disseminating agents. Previous studies have indicated a risk for introduction of higly pathogenic avian influenza virus (HPAIV) in PNLP region. However, the impact and spreading pattern of AI virus in this region is unknown due to the lack of disease reports. It is noteworthy that other respiratory diseases, such Newcastle Disease (ND) and micoplasmosis due to Mycoplasma gallisepticum (MG), are also associated with migratory birds and can cause disturbances in domestic poultry. In this context, the aims of this work are to perform an epidemiological survey of respiratory diseases associated with migratory birds in backyard poultry and to propose a model of HPAIV spreading in PNLP region. For this, it was evaluated (i) the presence of antibodies against AI, ND and MG in backyard poultry by ELISA, (ii) the presence of AI and ND virus in backyard poultry by real time RT-PCR, (iii) the potential risk factors associated with these pathogens, and (iv) the consequences of HPAIV introduction in PNLP region using a mathematical model of virus spreading. In the sampled properties, frequency of antibodies against AI, ND and MG were 4.2%, 87.5% and 58.3%, respectively. All samples were negative for AI and ND in real time RT-PCR analysis. The first evaluation of risk factors associated to ND or MG in backyard poultry from Brazil was performed in this work. For ND, the risk was increased in the properties in which farmers used their own replacement poultry to restock their flock (PR=1.64; 95% CI: 1.11–2.42). Furthermore, the increasing distance of the household flock to the “Laguna do Peixe” estuary is associated with decreasing NDV seropositivity (PR=0.94; 95% CI: 0.90 – 0.99). For MG, seropositivity was significantly associated with bird confinement (PR = 3.40, 95% CI: 1.93 – 5.99) and with interaction between “poultry/egg exchange and neighbors have poultry” (PR = 2.16, 95% CI: 1.24 – 3.76). In the simulations from the mathematical model of HPAIV spreading in PNLP region, most of the properties of this region would become infected up to 30 days outbreak beginning. Moreover, the infection would affect about 80 to 90% of the properties from the region, reaching up to 30 km distance from the index case. The results showed the circulation of pathogens associated with migratory birds in PNLP region. Since these pathogens were detected in backyard poultry, these birds can be considered sentinels for these agents in this region. Additionally, the data obtained improve the knowledge on spreading and dynamics of these diseases in properties with backyard poultry, as well as on potential risk factors. The set of these results can be useful to development of adequate biosecurity procedures for backyard flocks and surveillance programs to avoid pathogen dissemination.

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Describe la biología reproductiva del ave endémica Geositta peruviana, “Minero peruano” en la Zona Reservada Lomas de Ancón, departamento de Lima, Perú. Se tomaron datos de aspectos reproductivos: periodo reproductivo (incubación y periodo de polluelos dentro del nido), características de nidos, éxito reproductivo, cuidado parental y distribución de nidos. Para obtener estos datos, se realizaron visitas mensuales al área de estudio entre noviembre del 2016 y noviembre del 2017, en búsqueda de actividad reproductiva. Se utilizaron dos cámaras sonda de tres y cinco metros de longitud para inspeccionar los nidos y evaluar el número de huevos y polluelos, siendo más frecuente la inspección durante la temporada reproductiva. Se desenterraron cuatro nidos abandonados para describir su contenido. La temporada reproductiva se extendió de mayo a octubre, coincidiendo con la época de mayor humedad en lomas. Fueron monitoreados 43 nidos, siendo los nidos túneles excavados de tipo cavidad/con túnel/simple/plataforma. La longitud promedio de los túneles fue de 259.9 ± 38.5 cm (n=43). Al final del túnel se encontró una cámara de incubación con material de origen vegetal, animal y antrópico. El tamaño promedio de puesta fue 3.27 ± 0.58 huevos (n=31). El periodo promedio de incubación fue de 15.1 ± 0.74 días (n=8). Las medidas promedio de los huevos fueron de 20.7 x 16.2 mm (n=6), y el periodo promedio de polluelos dentro del nido fue de 25.6 ± 2.89 días (n=23). Se tiene certeza que al menos seis parejas realizaron hasta un tercer intento reproductivo, siendo las dos primeras exitosas. Se observó que la pareja trabaja junta durante el periodo de incubación y del cuidado de polluelos. Del total de nidos monitoreados el 23.8% no tuvieron éxito, mientras que 76.2% tuvieron al menos un polluelo saliendo del nido. Las causas del fracaso fueron el abandono durante la incubación, la no eclosión de huevos y la depredación de polluelos dentro del nido por Athene cunicularia, “Lechuza terrestre”. / Tesis

Los Spheniscidae constituyen un grupo de aves buceadoras y no voladoras que habitan los mares australes y cuya historia evolutiva estaría en estrecha relación con las corrientes de aguas frías. En el pasado, sin embargo, habrían habitado aguas más cálidas que en la actualidad, habiendo cambiado sus requerimientos ecológicos en estos últimos 55 Ma. Su origen, se remontaría al Cretácico, siendo la Antártida un sitio altamente probable como centro de origen, en tanto exhibe la mayor diversidad simpátrica y los registros más antiguos del grupo, correspondientes al Paleoceno tardío. Su historia estaría marcada por una especialización temprana, una proliferación de especies seguida por extinciones y finalmente un reemplazo por las 17 especies vivientes. Este estudio constituye además, el primero en integrar a las especies fósiles y a las actuales en un mismo análisis, y del que se desprende claramente la utilidad de los caracteres esqueletarios en la sistemática del grupo. Se evidencia además, el patrón estructural exhibido en cada grupo, demostrando una similitud más estrecha entre las especies registradas en América del Sur y las actuales que con las de Antártida- Nueva Zelanda- Australia, que constituirían un grupo con una historia evolutiva diferente y más relacionada con los taxones ancestrales.

Entre septiembre de 1999 y agosto de 2002, se estudió la dinámica espacial y temporal de los ensambles de aves de dos unidades de vegetación del Parque Nacional El Palmar, provincia de Entre Ríos. Los objetivos generales de este trabajo fueron: (1) analizar la variación espacio-temporal de los ensambles de aves de dos unidades de vegetación de las provincias fitogeográficas del espinal y paranaense, (2) evaluar cómo se relacionan las variaciones del ensamble de aves con las características de la vegetación a escala local y del paisaje, (3) analizar la relación entre dichas características y las variaciones estacionales en la estructuración de los ensambles de aves, y (4) analizar las variaciones en la estructura del ensamble de aves entre años a partir de la ocurrencia de una sequía pronunciada. Las variaciones observadas en la selva en galería en riqueza específica, abundancia total, riqueza y abundancia de residentes anuales y estivales, abundancia de granívoros terrestres (GT), insectívoros de follaje (IF), insectívoro-frugívoros (I-Fr) e insectívoros de vuelo corto (IVC), y abundancias de 6 especies, podrían corresponder a variaciones del ambiente debidas al clima, principalmente precipitaciones, y la fenología de la vegetación y los recursos asociados disponibles para las aves. La sequía imperante durante el primer año de estudio parece haber afectado negativamente a la avifauna de la selva en galería durante la primera etapa reproductiva, probablemente por el descenso en los niveles de recursos tróficos, aumentando durante la primera etapa no reproductiva con el aumento de las precipitaciones. La alternancia de períodos favorables y períodos desfavorables haría que las aves se distribuyan diferencialmente en el espacio, probablemente en respuesta a variaciones espaciales en la oferta de recursos alimenticios. Estos patrones están en concordancia con la hipótesis de “cuello de botella” en la estructuración de las comunidades de aves. Las diferencias, tanto entre sitios de selva como entre sitios de palmar, fueron mayores en los años húmedos que en el año seco. Durante los momentos de sequía la oferta de recursos podría ser igualmente baja en sitios con diferente complejidad estructural. A diferencia de la selva en galería, el ensamble de aves del ambiente de palmar mostró fluctuaciones interanuales de menor magnitud en muchos de los componentes del ensamble [i.e. número de especies totales, de residentes anuales y de residentes estivales, abundancia de residentes estivales, abundancia de GT, IF, I-Fr y frugívoros (Fr)], excepto en la abundancia total y de residentes anuales, similares a los de la selva. Un evento de sequía en el palmar no es tan estresante para la avifauna como en la selva en galería. La selva en galería es más dependiente del agua que el palmar. En el palmar, la mejora en las condiciones ambientales, debidas al aumento de las precipitaciones, y consecuentemente del aumento de los recursos, se relacionó sólo con el aumento de la abundancia de las residentes anuales y de dos especies, y no se observó a nivel de los gremios. Los patrones hallados para este ambiente parecen apoyar más a la hipótesis de “equilibrio dinámico” de las comunidades. La riqueza, densidad total y de gremios en las dos unidades de vegetación estudiadas, se relacionaron con el porcentaje de cobertura del dosel arbóreo, con el número de especies de árboles, y con la composición vegetal, con tendencias similares en esas relaciones en ambas unidades de vegetación. Esas relaciones indican que las situaciones con mayor cobertura y diversidad de vegetación arbórea presentaron mayor abundancia y diversidad de aves. En el palmar, existió un gradiente desde los palmares con alta proporción de pastos, chilcas y helechos hasta palmares con sotobosque arbóreo conformado por especies de los bosques del espinal y de la selva en galería. La estructura y composición de la vegetación se correlacionaron de manera similar con la abundancia, riqueza y composición de las aves de palmar, tanto en los períodos reproductivos como en los no reproductivos. En la selva en galería, en cambio, durante los períodos reproductivos, los sitios de mayor similitud en la estructura de la vegetación también presentaron mayor similitud en la estructura del ensamble de aves; mientras que en los no reproductivos, la similitud en la composición de aves se correlacionó con la composición de la vegetación. El sitio ubicado en la costa del Río Uruguay representa un extremo en el gradiente de composición y se diferencia claramente del resto por la abundancia de IF, I-Fr y Fr. Las diferencias de composición específica de la vegetación podrían determinar variaciones temporales en la oferta de los recursos que expliquen los cambios en los patrones de diferenciación entre sitios observados para la selva en galería entre períodos reproductivos y no reproductivos. Analizadas en conjunto, las variables que caracterizan a la vegetación a nivel local y del paisaje resultaron explicativas para representar los patrones de variación de la riqueza total y la abundancia de diferentes gremios. En los períodos reproductivos, la riqueza total es mayor en las situaciones de baja cobertura herbácea ubicadas en áreas de palmares semidensos, y en los no reproductivos los mayores valores corresponden a situaciones de alta cobertura y riqueza de árboles cerca de la costa del Río Uruguay. Entre situaciones de similar cobertura de árboles, presentan menor riqueza de aves aquellas rodeadas de palmares abiertos y pastizales respecto de las que están rodeadas por palmares semidensos y bosques del espinal. Las diferencias entre selva y palmar en riqueza total y abundancia por gremios, queda explicada por las variables vegetacionales a escala local y del entorno. Los gremios IF, I-Fr y Fr presentaron patrones de distribución similares que reflejan una relación positiva con las situaciones de mayor desarrollo de la vegetación arbórea pero con diferencias entre momentos del año. En los períodos reproductivos las variables vegetacionales locales fueron las más importantes, y en los no reproductivos la presencia de bosques del espinal y selvas en el entorno, presentando una asociación específica con la selva ubicada en la costa del Río Uruguay en dicha época del año. La composición de la vegetación fue un factor muy importante también para el gremio IF en primara/verano en ambos unidades de vegetación, y en otoño/invierno en la selva en galería. EL gremio IVC se asoció negativamente con la cobertura herbácea a nivel local y del paisaje en los períodos reproductivos y una asociación más específica con la cobertura y riqueza de árboles en los períodos no reproductivos. Ese cambio se refleja en un menor contraste entre la selva y el palmar en otoño-invierno. El gremio GT presentó siempre una asociación positiva con la cobertura herbácea que resulta equivalente a la diferenciación entre selva y palmar. No todas las especies incluidas en un gremio responden de la misma manera a las variables del hábitat seleccionadas. Esto destaca la importancia de las respuestas individualistas de las especies, o la respuesta hacia otros factores no estudiados.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ciências Fisiológicas, Programa de Pós Graduação em Biologia Animal, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-06-09T15:58:32Z No. of bitstreams: 1 2015_RosanadeSouzaRezende.pdf: 2098998 bytes, checksum: 55916650ffd3d9b506af9ecc6284fe69 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-06-14T19:50:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_RosanadeSouzaRezende.pdf: 2098998 bytes, checksum: 55916650ffd3d9b506af9ecc6284fe69 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-14T19:50:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_RosanadeSouzaRezende.pdf: 2098998 bytes, checksum: 55916650ffd3d9b506af9ecc6284fe69 (MD5) / Neste estudo, buscamos preencher lacunas de conhecimento que envolve as espécies de Sicalis em dois aspectos principais: (I) reconstruímos as relações filogenéticas de dez das doze espécies descritas para o gênero e (II) realizamos uma abordagem filogeográfica de S. flaveola, buscando identificar se as subespécies descritas correspondem a populações geneticamente diferenciadas, auxiliando assim na revisão taxonômica e na conservação desta espécie. A filogenia do gênero Sicalis foi realizada com um número mais abrangente de indivíduos e de locais de coleta por taxa do que estudo previamente publicado. Além disso, o processo temporal de diversificação das espécies deste gênero foi investigado por meio de datação molecular. No segundo capítulo, procurou-se identificar o padrão filogeográfico de S. flaveola, investigando a distribuição das linhagens genéticas das cinco subespécies descritas: S. f. flaveola, S. f. valida, S. f. koenigi, S. f. brasiliensis e S. f. pelzelni, além de identificar a presença de Unidades de Manejo (MUs) presentes nesta espécie. Ambos os estudos foram baseados na análise de dois marcadores moleculares: um mitocondrial (ND2; 1041 pb) e outro nuclear (FIB5; 569 pb). Conforme previamente observado, as reconstruções filogenéticas indicam que o gênero Sicalis é polifilético, uma vez que S. citrina agrupou em clado distinto das demais espécies do gênero. Além disso, com exceção de S. citrina, todas as espécies estudadas deste gênero também foram recuperadas como polifiléticas, possivelmente em decorrência de erros de identificação e eventuais eventos de hibridação. Com base na datação molecular, observa-se que o gênero Sicalis surgiu há aproximadamente 15 milhões de anos atrás, no Mioceno, enquanto que a maioria dos eventos de especiação dentro deste gênero ocorreram ainda no Plioceno. As análises filogeográficas indicam que as cinco subespécies de S. flaveola podem ser divididas em três haplogrupos: Grupo I: S. f. brasiliensis do norte e do sul; Grupo II: S. f. pelzelni do norte, S. f. flaveola e S. f. valida e Grupo III: S. f. pelzelni do sul e S. f. koenigi). S. f. brasiliensis parece ser o grupo mais antigo, do qual possivelmente partiram eventos de expansão em direções opostas (norte e sul) dando origem aos Grupos II e III, respectivamente. S. f. brasiliensis se mostrou um grupo monofilético, enquanto S. f. pelzelni se mostrou polifilético. S. f. valida e S. f. flaveola não são distinguíveis geneticamente. Desta forma, os dados obtidos ressaltam a necessidade de ampla revisão taxonômica das espécies deste gênero, inclusive ao nível de subespécies. E ainda, a ausência de concordância entre os dados genéticos e morfológicos sugere que medidas de manejo e conservação para S. flaveola devem ser adotadas com cautela, especialmente a soltura na natureza de animais apreendidos pelos órgão de combate aos crimes contra a fauna. / In this study, we sought to fill knowledge gaps surrounding the species of the genus Sicalis on two main aspects: (I) reconstructing the phylogenetic relationships of ten of the twelve species described for this genus and (II) realizing a phylogeographic analysis with S. flaveola, seeking to identify if the subspecies described correspond to genetically different populations, thereby assisting in the taxonomic revision and conservation of this species. The phylogeny of the genus Sicalis was performed with a larger number of individuals and more collection sites than study previously published. Furthermore, the temporal process of diversification of the species of this genus was investigated by molecular dating. In the second chapter, we seek to identify the phylogeographic pattern in S. flaveola investigating the distribution of genetic lineages of the five subspecies described: S. f. flaveola, S. f. valida, S. f. koenigi, S. f. brasiliensis and S. f. pelzelni), and identify management units (MUs) present in this species. Both studies were based on analysis of two molecular markers: a segment of mtDNA (ND2; 1041 bp) and a segment of nuclear genome (FIB5; 569 bp). As previously noted, the phylogenetic reconstructions indicate that Sicalis genus is polyphyletic, since S. citrina grouped in distinct clade from other species of the genus. Moreover, with the exception of S. citrina, all species of this genus were also recovered as polyphyletic, possibly due to misidentification or eventually hybridization events. Based on molecular dating, it is observed that the genus Sicalis had originated about 15 million years ago in the Miocene, while most speciation events within this genus yet occurred in Pliocene. The phylogeographical analyzes indicate that the five subspecies of S. flaveola can be divided into three haplogroups: Group I: S. f. brasiliensis from the north and south; Group II: S. f. pelzelni from the north, S. f. flaveola and S. f. valida and Group III: S. f. pelzelni from the south and S. f. koenigi). S. f. brasiliensis seems to be the oldest group, which possibly left expansion events in opposite directions (north and south) giving rise to Groups II and III, respectively. S. f. brasiliensis showed a monophyletic group, while S. f. pelzelni seems to be poliphyletic. S. f. valida and S. f. flaveola are not genetically distinguishable. Thus, our data highlight the need for comprehensive taxonomic revision of the species of this genus, including in subspecies levels. And yet, the absence of agreement between the genetic and morphological data suggests that management and conservation measures for S. flaveola should be taken with caution, especially the release back into the nature birds seized by the organization responsible to combat wildlife crimes.

Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T11:33:07Z No. of bitstreams: 2 diego_pereira_vaz.pdf: 503298 bytes, checksum: 2a066b7e12af1198d4017ca294e7033b (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T11:35:48Z (GMT) No. of bitstreams: 2 diego_pereira_vaz.pdf: 503298 bytes, checksum: 2a066b7e12af1198d4017ca294e7033b (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T11:36:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 diego_pereira_vaz.pdf: 503298 bytes, checksum: 2a066b7e12af1198d4017ca294e7033b (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-05T11:36:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 diego_pereira_vaz.pdf: 503298 bytes, checksum: 2a066b7e12af1198d4017ca294e7033b (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2013 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A inclus?o de enzimas na alimenta??o de frangos de corte tem sido relatada como forma de melhorar a digestibilidade dos nutrientes da dieta e o desempenho das aves. Dois experimentos foram conduzidos com o objetivo de avaliar o efeito da inclus?o de diferentes n?veis de um complexo enzim?tico composto por fitase, protease, xilanase, ?-glucanase, celulase, amilase e pectinase, em dietas ? base de milho e farelo de soja, sobre os par?metros de produ??o de frangos de corte e metabolizabilidade dos nutrientes. Foram utilizados 800 aves, de um dia de idade, da linhagem cobb 500, distribu?das segundo um delineamento inteiramente casualizado, com cinco n?veis de inclus?o de complexo enzim?tico (0; 0,100; 0,200; 0,300 e 0,400 kg/ton), com seis repeti??es de 20 aves cada, no experimento de produ??o, e quatro repeti??es de 10 cada ave, no experimento de metabolismo. No experimento de produ??o, foram avaliados at? os 42 dias de idade das aves o ganho em peso, o consumo de ra??o, a convers?o alimentar, os pesos dos ?rg?os digestivos (proventr?culo, moela, p?ncreas e f?gado), o pH e comprimento intestinal (duodeno, jejuno, ?leo e ceco) e a umidade da cama aos 21 e 42 dias. N?o foram observados efeitos significativos (P>0,05) da inclus?o dos diferentes n?veis do complexo enzim?tico nos par?metros de desempenho, pH e comprimento intestinal, pesos dos ?rg?os digestivos e na umidade da cama. No experimento de metabolismo realizado de 15 a 25 dias, foram determinados o coeficientes de metabolizabilidade da mat?ria seca, da prote?na bruta, extrato et?reo, c?lcio e f?sforo, e foi calculada a reten??o de nitrog?nio, c?lcio e f?sforo. O coeficiente de metabolizabilidade do extrato ?tereo foi influenciado de forma quadr?tica e linear decrescente (P<0,01), a maior metabolizabilidade do extrato et?reo foi sem suplementa??o enzim?tica. O coeficiente de metabolizabilidade do c?lcio e do f?sforo foram influenciados de forma quadr?tica e linear crescente (P<0,01), resultando no aumento da reten??o de c?lcio em 21,39% e de f?sforo em 9,56%, reduzindo a excre??o de f?sforo para o ambiente pelas aves. A inclus?o de n?veis crescentes de complexo enzim?tico promove uma maior reten??o de c?lcio e f?sforo pelos frangos de corte, por?m, n?o suficientes para influenciar a produ??o das aves. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2013. / ABSTRACT The inclusion of enzymes in feed for broilers has been reported as a way to improve the digestibility of nutrients and performance birds. Two trials were conducted to evaluate the effect of different inclusion levels of an enzyme complex consisting of phytase, protease, xylanase, beta-glucanase, cellulase, amylase and pectinase in diets based on corn and soybean meal on production parameters of broilers and metabolization of nutrients. We used 800 birds a day old Cobb 500 lineage, distributed according to a completely randomized design with five levels of inclusion of enzyme complex (0, 0.100, 0.200, 0.300 and 0.400 kg/ton), with six replicates of 20 birds each experiment in production and four replicates of 10 birds in each experiment metabolism. In trial production were evaluated up to 42 days of age the birds weight gain, feed intake, feed conversion, weights of digestive organs (proventriculus, gizzard, liver and pancreas), pH and intestinal length (duodenum, jejunum, ileum and cecum) and litter humidity at 21 and 42 days. No significant effects were observed (P>0.05) the inclusion of different levels of the enzyme complex on performance parameters, pH and intestinal length, weight of digestive organs and litter moisture. In the metabolism experiment performed 15 to 25 days were determined coefficients metabolization of dry matter, crude protein, ether extract, calcium and phosphorus , and calculated the retention of nitrogen, calcium and phosphorus. The metabolization coefficient ethereal extract was quadratically affected and decreased linearly (P<0.01), the highest metabolizable ethereal extract was without enzyme supplementation. The coefficient of metabolizable calcium and phosphorus were affected quadratic and linear increase (P<0.01) resulting in increased retention of 21.39% calcium and 9.56% phosphorus, reducing the excretion of phosphorus to the environment by birds. The increased levels of the enzyme complex promotes greater retention of calcium and phosphorus for broilers, but not enough to influence the production of poultry.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2008. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-09-15T18:50:43Z No. of bitstreams: 1 Dissert_Nadinni Sousa.pdf: 1213291 bytes, checksum: b14e6a609e21ef90455888484b23e735 (MD5) / Approved for entry into archive by Luis Felipe Souza Silva(luis@bce.unb.br) on 2009-09-21T18:31:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissert_Nadinni Sousa.pdf: 1213291 bytes, checksum: b14e6a609e21ef90455888484b23e735 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-09-21T18:31:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissert_Nadinni Sousa.pdf: 1213291 bytes, checksum: b14e6a609e21ef90455888484b23e735 (MD5) Previous issue date: 2008 / Compreender quais são as pressões seletivas que determinam o tamanho de ninhada é essencial para entender as estratégias de história de vida das espécies. Manipulações do tamanho de ninhadas são consideradas a ferramenta principal para se testar a influência de fatores tais como disponibilidade de alimento, risco de predação e aumento do esforço reprodutivo na limitação do tamanho da ninhada. Para avaliar a importância da limitação de alimento aos ninhegos, do risco da predação e do gasto energético com a incubação como pressões seletivas influenciando o tamanho da ninhada foram manipuladas ninhadas de Elaenia chiriquensis nos anos de 2006 e 2007 na Estação Ecológica de Águas Emendadas/ DF. Essa espécie é tipicamente tropical apresentando tamanho de ninhada comum de dois ovos (controle). Foram criados dois tratamentos experimentais: (1) 40 ninhadas aumentadas (três ovos) e (2) 35 ninhadas reduzidas (um ovo). A disponibilidade de alimento para os ninhegos foi avaliada por meio da taxa de entrega de alimento feita pelos pais no ninho, pelo crescimento e tempo de permanência dos ninhegos e pelo número de filhotes produzidos por ninhada bem sucedida. A probabilidade de predação foi analisada pelo programa MARK, em que as variáveis tamanho de ninhada e idade do ninho/ninhego foram avaliadas quanto à predição da taxa de sobrevivência diária. A capacidade de incubação foi avaliada por meio do tempo que a fêmea passa no ninho incubando, pelo sucesso de eclosão e pelo período de incubação. A disponibilidade de alimento para os ninhegos foi menor em ninhadas aumentadas, pois o crescimento desses foi negativamente associado ao aumento da ninhada, independentemente do fato da taxa de entrega de alimento por filhote ter sido a mesma entre ninhadas aumentadas e controle. O menor crescimento dos ninhegos encontrado neste estudo aparentemente não esteve relacionado à limitação de alimento no meio. O número de filhotes produzidos por ninhada bem sucedida teve uma tendência a aumentar com o tamanho da 2 ninhada, indicando que possíveis mortes por inanição não predominaram em ninhadas aumentadas. A disposição dos pais em aumentar o esforço reprodutivo proporcionalmente às demandas dos ninhegos é indicada como sendo o fator influenciando a disponibilidade de alimento para os ninhegos desta espécie. O aumento da ninhada ou da idade dos ninhegos não afetou o risco de predação do ninho, tanto separadamente na fase de ninhego quanto na incubação, apesar do aumento da atividade dos pais no ninho com o tamanho da ninhada e com o crescimento dos ninhegos. Os custos energéticos com incubação não foram refletidos na fase de incubação, pois a porcentagem de tempo despendido pela fêmea no ninho durante a incubação, o sucesso de eclosão e o período de incubação não foram afetados com o aumento da ninhada. As manipulações indicaram que existe um custo maior de se incubar e criar uma ninhada maior, apesar de E. chiriquensis ser capaz de incubar um ovo extra. Além disso, os resultados encontrados neste estudo não corroboram a hipótese clássica de risco de predação proposta por Skutch (1949). Os resultados revelam que o tamanho ideal da prole desta espécie está em parte limitado pela disponibilidade dos pais em alimentar os filhotes, o que pode ocasionar em menor sobrevivência desses no período pós-ninho. ____________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The study of the selective pressures that determine clutch size is essential to understand lifehistory strategies. Brood manipulation studies are the standard tools for testing the influence of food availability, nest predation risk and increasing parental effort on limitation of clutch size. In order to assess the relative importance of food limitation to the nestlings, nest predation risk and energetic demands of incubation as selective pressures influencing clutch size, we manipulated clutch sizes of Elaenia chiriquensis from 2006 to 2007 in “Estação Ecológica de Águas Emendadas”, DF. This species represents the typical tropical species with a small clutch size of two eggs (control). We created two experimental treatments: (1) 40 enlarged clutches (three eggs), and (2) 35 reduced clutches (one egg). We assessed food availability to the nestlings by monitoring food delivery rates to the nest, nestling growth, nestling period, and number of fledglings produced by successful nests. We calculated nest predation probabilities with the program MARK, in which predictive variables included clutch size and age of the nest/nestlings. We assessed the female’s ability to incubate an enlarged clutch through nest attendance, hatching success and incubation period. Food availability to nestlings was lower in enlarged than control clutches because nestling growth was related to increasing clutch size, despite the fact that food delivery rates per nestling were the same between enlarged and control clutches. However, reduced nestling growth appeared to be unrelated to food limitation. The number of fledglings produced in successful nests increased marginally with clutch size, which indicates that deaths due to starvation were not more frequent in enlarged broods than control ones. We suggest that parents were unwilling to increase parental effort proportionally to nestling energetic demands. Nest predation risk was not affected by clutch size or nestling age, although enlarged clutches and nests with older chicks experienced more parental activity to feed the nestlings. Energetic costs with 4 incubation were not evident during the incubation stage since clutch enlargement did not affect nest attendance, hatching success and incubation period. Our results do not support Skutch’s nest predation hypothesis (1949) and indicate that E. chiriquensis is able to incubate an extra egg. However, it is not possible to determine the consequences of increased incubation effort upon parental fitness. Instead, our results indicate that clutch size is in part limited by parental availability to feed young, which can cause an increase in fledgling mortality rates.