Made available in DSpace on 2014-06-12T15:05:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1821_1.pdf: 1487090 bytes, checksum: e28a3f5d882d211cc83f1c6a40fd8ae4 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Este trabalho estudou a biologia da avifauna do Refúgio Ecológico Charles Darwin, fragmento de 60 ha de Mata Atlântica, no município de Igarassu, Pernambuco. Objetivando obter informações acerca das espécies desse bioma, foram realizadas observações entre agosto de 1996 e julho de 1997 e capturas mensais utilizando redes de neblina, de julho de 2003 a junho de 2004. Entre observações, capturas, recapturas e recuperações, foram registradas 151 espécies (31 famílias) para a área, onde 456 aves de 53 espécies e 25 famílias foram capturadas com redes ornitológicas. Foram recuperadas 10 espécies (tempo de anilha de seis a oito anos). O número de capturas foi maior nos meses mais quentes. A maioria das espécies capturadas (52,8%) teve freqüência de ocorrência menor que 25%, sendo Manacus manacus (Linnaeus, 1766), Arremon taciturnus (Hermann, 1783), Neopelma pallescens (Lafresnaye, 1853) e Turdus leucomelas Vieillot 1818 as mais freqüentes. Houve correlação significativa entre médias de massa corpórea e comprimento da asa e tarso e diâmetro do tarso relacionado ao sexo do indivíduo, e de mudas com estação do ano. O maior período com muda associada à placa de incubação foi de março a maio (pico em maio). Os achados fortalecem a imprevisibilidade dos efeitos das alterações ambientais na estrutura da comunidade de aves em longo prazo. Mantém-se afirmativo que os desequilíbrios populacionais possam vir a aumentar as chances de extinção, sendo necessárias novas alternativas para a proteção da biodiversidade, sobretudo em fragmentos florestais. PALAVRAS CHAVE. Avifauna, ecologia, fragmentação

Made available in DSpace on 2018-08-01T22:56:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_7256_Thamírys Vianelli Maurício.pdf: 591545 bytes, checksum: 752a10c38843897f9e52bc5236ccc993 (MD5) Previous issue date: 2015-07-17 / Com o objetivo de avaliar diferentes níveis de arginina e lisina digestível em dietas para codornas japonesas em postura, bem como analisar o efeito antagônico entre esses aminoácidos, foram utilizadas 880 codornas com peso médio inicial de 180g aos 140 dias de idade. Distribuídas nas unidades experimentais em delineamento inteiramente casualizado. O estudo contou com dois ensaios, no primeiro foram utilizados cinco níveis crescentes de arginina digestível (1,148; 1,256; 1,364; 1,472; 1,580%) sob um nível fixo de lisina digestível de 1,083%, correspondendo à relação arginina: lisina digestível de 1,06; 1,16; 1,26; 1,36 e 1,46, o segundo ensaio foi caracterizado por um esquema fatorial (3x2), composto por três níveis de lisina digestível (1,083; 1,183; 1,283%) e dois níveis de arginina digestível (1,472 e 1,580%). Portanto, o primeiro ensaio foi composto por cinco tratamentos e o segundo de seis, ambos com dez repetições cada. No primeiro ensaio não foi verificado efeito significativo (P>0,05) dos níveis de arginina e lisina digestível a exceção da variável ovos comercializáveis (OC), em que, foi verificado efeito linear decrescente (P=0,009) de acordo com a equação: Ŷ = -3,4444X + 103,1342, r²= 0,94, sendo o melhor nível de arginina observado o de 1,148%. No segundo ensaio nenhuma das características em análise foram afetadas (P>0,05) pelos níveis de lisina e arginina digestíveis em estudo. Concluiu-se que o nível de arginina digestível que proporciona os melhores índices produtivos é o de 1,148% e que a melhor relação de lisina e arginina digestível para os parâmetros analisados foi 1,36:1,00.

Patógenos associados a aves migratórias podem causar doenças em aves domésticas. As aves de subsistência são possíveis fontes de disseminação destes patógenos pela ausência de biossegurança na criação e pelo contato com aves silvestres. A região do Parque Nacional da Lagoa do Peixe (PNLP), no Rio Grande do Sul, se caracteriza como um importante sítio de aves migratórias. Devido a isto, é possível uma interface entre aves migratórias e aves de subsistência criadas na região. A influenza aviária (AI) é a principal doença associada a aves migratórias que afeta o sistema respiratório, sendo estas os principais disseminadores do vírus. Estudos prévios indicam que há risco de introdução de um vírus de AI de alta patogenicidade (HPAIV) na região. Porém, o padrão e impacto do espalhamento deste patógeno na região é desconhecido, visto a ausência de relatos. Cabe ressaltar que outras enfermidades respiratórias, como a Doença de Newcasle (ND) e a micoplasmose por Mycoplasma gallisepticum (MG), também são associadas a aves migratórias e podem causar doenças em aves domésticas. Neste contexto, o objetivo deste trabalho é realizar um inquérito epidemiológico de doenças respiratórias associadas a aves migratórias em aves de subsistência e propor um modelo de espalhamento de HPAIV na região do PNLP. Com esta finalidade, realizamos uma avaliação (i) da presença de anticorpos contra AI, ND e MG nas aves de subsistência por ELISA, (ii) da presença dos agentes de AI e ND por RT-PCR em tempo real nas aves de subsistência, (iii) dos possíveis fatores de risco associados aos patógenos e (iv) das consequências da introdução de HPAIV na região através de um modelo matemático de espalhamento. Nas propriedades de aves de subsistência amostradas da região, foi detectada a presença de anticorpos contra AI, ND e MG na frequência de 4,2%, 87,5% e 58,3%, respectivamente. Todas as amostras foram negativas no RT-PCR em tempo real realizado para AI e ND. A avaliação de fatores de risco foi possível nas propriedades soropositivas para ND e MG, possibilitando realizar-se a primeira análise de fatores de risco para estes agentes em aves de subsistência no Brasil. Para ND, o risco foi maior nas propriedades nas quais os criadores adotam a prática de reposição própria para manter a criação (PR=1,64; 95% IC: 1,11 – 2,42). Além disso, o aumento na distância das granjas em relação ao estuário da Laguna do Peixe diminui o risco para ND (PR=0,94; 95% IC: 0,90 – 0,99). Já para MG, foram considerados fatores de risco a prática de confinar as aves (PR = 3,40, 95% IC: 1,93 – 5,99) e a interação entre a “troca de aves ou ovos com outros produtores e vizinhos possuírem aves” (PR = 2,16, 95% IC: 1,24 – 3,76). Nas simulações da modelagem matemática de espalhamento de HPAIV na região, a maioria das propriedades se tornaria infectada até o 30º dia de infecção. Além disso, na média das simulações, a infecção atingiria em torno de 80 a 90% das propriedades, alcançando até 30 km de distância do caso índice. Os resultados indicam a circulação de patógenos associados a aves migratórias na região do PNLP. Devido à detecção destes nas aves de subsistência, estas podem ser consideradas sentinelas destes agentes na região. Além disso, os dados obtidos incrementam o conhecimento sobre o espalhamento e a dinâmica dessas doenças em propriedades com aves de subsistência, bem como sobre os indicadores de risco para ocorrência. Estes dados podem ser utilizados para o estabelecimento de medidas de biossegurança e de manejo adequados para este tipo de criação e de programas de monitoria visando à contenção da disseminação de patógenos. / Pathogens associated with migratory birds can cause disease in domestic birds. Backyard poultry are possible source of pathogens dissemination due to the lack of biosecurity measures and the contact with wild birds. The region of Lagoa do Peixe National Park (PNLP), in Rio Grande do Sul state, Brazil, is characterized as an important site for migratory birds. Thus, it is a possible interface place for migratory and backyard birds. Avian influenza (AI) is the most important respiratory disease associated with migratory birds, the main virus disseminating agents. Previous studies have indicated a risk for introduction of higly pathogenic avian influenza virus (HPAIV) in PNLP region. However, the impact and spreading pattern of AI virus in this region is unknown due to the lack of disease reports. It is noteworthy that other respiratory diseases, such Newcastle Disease (ND) and micoplasmosis due to Mycoplasma gallisepticum (MG), are also associated with migratory birds and can cause disturbances in domestic poultry. In this context, the aims of this work are to perform an epidemiological survey of respiratory diseases associated with migratory birds in backyard poultry and to propose a model of HPAIV spreading in PNLP region. For this, it was evaluated (i) the presence of antibodies against AI, ND and MG in backyard poultry by ELISA, (ii) the presence of AI and ND virus in backyard poultry by real time RT-PCR, (iii) the potential risk factors associated with these pathogens, and (iv) the consequences of HPAIV introduction in PNLP region using a mathematical model of virus spreading. In the sampled properties, frequency of antibodies against AI, ND and MG were 4.2%, 87.5% and 58.3%, respectively. All samples were negative for AI and ND in real time RT-PCR analysis. The first evaluation of risk factors associated to ND or MG in backyard poultry from Brazil was performed in this work. For ND, the risk was increased in the properties in which farmers used their own replacement poultry to restock their flock (PR=1.64; 95% CI: 1.11–2.42). Furthermore, the increasing distance of the household flock to the “Laguna do Peixe” estuary is associated with decreasing NDV seropositivity (PR=0.94; 95% CI: 0.90 – 0.99). For MG, seropositivity was significantly associated with bird confinement (PR = 3.40, 95% CI: 1.93 – 5.99) and with interaction between “poultry/egg exchange and neighbors have poultry” (PR = 2.16, 95% CI: 1.24 – 3.76). In the simulations from the mathematical model of HPAIV spreading in PNLP region, most of the properties of this region would become infected up to 30 days outbreak beginning. Moreover, the infection would affect about 80 to 90% of the properties from the region, reaching up to 30 km distance from the index case. The results showed the circulation of pathogens associated with migratory birds in PNLP region. Since these pathogens were detected in backyard poultry, these birds can be considered sentinels for these agents in this region. Additionally, the data obtained improve the knowledge on spreading and dynamics of these diseases in properties with backyard poultry, as well as on potential risk factors. The set of these results can be useful to development of adequate biosecurity procedures for backyard flocks and surveillance programs to avoid pathogen dissemination.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / En ninguna parte del mundo quedan hábitats naturales y aves completamente a salvo, los peligros varían y Chile no es la excepción. Aun cuando distintas instituciones y organizaciones trabajan para proteger la ornitofauna del país, un número importante de especies se encuentran dentro de alguna categoría de amenaza. Por otra parte, y a pesar del estudio profesional y sistemático generado desde hace décadas sobre la ecología de las aves, se debe seguir trabajando para disminuir el déficit de información existente en algunas áreas de la ornitología. Sin embargo el levantamiento de esta información deja de ser de exclusiva responsabilidad de profesionales y expertos desde el momento en que identificamos al ser humano como participante activo en la estructura, procesos, y composición de casi todos los ecosistemas del planeta. En este contexto, la educación ambiental y la participación ciudadana se transforman en herramientas capaces de mejorar la efectividad de las distintas estrategias de protección y uso sustentable de la biodiversidad. La presente memoria de título consistió en el diseño e implementación de un sitio web que recopila información, a través de una encuesta electrónica, acerca de la biodiversidad y distribución de aves de San José de Maipo, comuna ubicada al sur oriente de la Región Metropolitana de Santiago. Esta herramienta, en primera instancia, actúa como facilitador en el ámbito de la educación ambiental y se espera en el futuro, colabore en la generación de planes de conservación y políticas públicas de esta zona de gran importancia ecológica. Durante los meses enero de 2014 y enero de 2015, a través de la plataforma www.faunadelcajon.uchile.cl, se registraron 33 fotografías de aves avistadas en el Cajón del Maipo. Aun cuando la cantidad de datos recopilada es baja para generar planes de conservación o mapas de riqueza de fauna, el sitio es una herramienta útil en el ámbito de educación ambiental. Sin embargo, se debe seguir trabajando en la difusión del proyecto, en modificaciones al sitio -que no necesariamente aumenten las 5293 visitas, sino que mejoren la calidad de estas visitas- en la búsqueda de autoridades que respalden y financien este proyecto; y en la búsqueda de otros métodos que contribuyan a la educación ambiental y al empoderamiento de la comunidad “cajonina” con su entorno natural

Tesis entregada a la Universidad de Chile en cumplimiento parcial de los requisitos para optar al grado de Magíster en Ciencias Biológicas. / El origen del vuelo en Aves está marcado tanto por disminuciones significativas en tamaño corporal como por el aumento en tamaño relativo de las extremidades anteriores. No obstante, previo al origen del vuelo, la evolución de ambos caracteres pudo estar asociada mediante de un patrón alométrico evolutivo negativo para las extremidades anteriores de terópodos. Esta relación ha sido descrita para la mayor parte de Theropoda, perdiéndose en la base de Aves (desde Archaeopteryx lithographica), clado donde se describen en su lugar isometrías o alometrías positivas tanto evolutivas como ontogenéticas. No obstante, las publicaciones donde estas alometrías han sido descritas no corrigen apropiadamente la no-independencia estadística presente entre especies emparentadas. Además, a pesar de que se ha sugerido, ningún estudio a la fecha ha evaluado formalmente la posibilidad de la pérdida del patrón de alometría evolutiva negativa para extremidades anteriores en otros taxa pertenecientes a Theropoda. Del mismo modo la posible relación entre el patrón alométrico evolutivo negativo para extremidades anteriores y un patrón equivalente en la ontogenia no ha sido discutida. En el presente estudio se procedió a re-evaluar el patrón alométrico evolutivo negativo para extremidades anteriores en Theropoda, además de posibles desviaciones respecto a este, utilizando datos de longitudes de húmero y fémur correspondientes a 163 especímenes distribuidos en 108 géneros, incorporando variabilidad intraespecífica, incerteza filogenética y dos modelos evolutivos alternativos a las correcciones filogenéticas utilizadas en los análisis realizados. Mediante estos análisis se recuperaron valores de alometría negativa para el conjunto de los terópodos no-avianos encontrándose además que Coelophysoidea, Ornithomimosauria y Oviraptorosauria presentan diferencias significativas respecto al patrón alométrico general bajo ambos modelos evolutivos, exhibiendo isometría. Se encontró alometría evolutiva negativa para extremidades anteriores en Dromaeosauridae, corroborando que, probablemente, este patrón alométrico evolutivo estaba presente en formas cercanas a Aves. Al revisar la evidencia publicada respecto a alometrías negativas ontogenéticas para extremidades anteriores en Theropoda se encontraron patrones similares a los patrones alométricos evolutivos obtenidos, del mismo modo esta correspondencia se encontró en Aves y otros clados cercanos a Theropoda permitiendo proponer que, además de una órbita y caja craneana expandidas, la paedomorfosis observada en el origen de Aves incluyó extremidades anteriores proporcionalmente mayores como otro rasgo juvenil. / The origin of flight in Aves is marked both by significant decreases in body size and by the increase in relative forelimb size. However, before the origin of flight, the evolution of both characteristics may have been coupled through a pattern of negative forelimb evolutive allometry in Theropoda. This pattern was lost at the origin of Aves (since Archaeopteryx lithographica), clade where isometry or positive allometry has been described instead for both: the phylogeny and ontogeny. However, the publications where these allometries have been described do not properly correct for the statistical non-independence present among related species. Furthermore, even though it has been suggested, no study has formally tested if other taxa in Theropoda show loss of the negative allometric pattern as well. Similarly, the possible relation between the negative forelimb evolutive allometric pattern and an equivalent ontogenetic one has not been discussed. In the present study we re-evaluated the negative forelimb allometric pattern found in the evolution of Theropoda and tested for significate deviations from it using femur and humerus lengths from 163 specimens representing 108 genera, we also incorporated intraspecific variation, phylogenetic uncertainty and two alternative evolutionary models to the phylogenetic corrections used in the analyses. We recovered an evolutionary negative forelimb allometry for all non-avian theropods; we also identified that Coelophysoidea, Ornithomimosauria and Oviraptorosauria show significative differences from the general allometric pattern presenting isometry. We found evolutionary negative forelimb evolutive allometry in Dromaeosauridae showing that this pattern was, most likely, still present in forms close to Aves. Upon reviewing published evidence for ontogenetic negative forelimb allometry in Theropoda we found similar patterns to the ones obtained through our analysis, we also observed similarities between ontogenetic and evolutive forelimb allometric patterns described for Aves and other taxa close to Theropoda suggesting that, in addition to an expanded orbit and braincase, the paedomorphosis observed at the origin of birds probably included proportionally larger arms as another juvenile trait. / Proyecto Anillo ACT172099 y Fondecyt 1150906. / Julio 2019

Orientador: Euclides Braga Malheiros / Coorientador: Edney Pereira da Silva / Coorientador: Nilva Kazue Sakomura / Banca: Rafael Neme / Banca: Silvana Martinez Baraldi Artoni / Resumo: A eficácia de um programa nutricional depende do conhecimento a respeito do potencial genético de crescimento da ave, por ser esta a forma racional de calcular as exigências nutricionais e predizer o consumo de alimento. Neste sentido, os modelos fatoriais integrados as curvas de crescimento de aves auxilia no estabelecimento ou avaliação de programas alimentares específicos. Por serem modelos dinâmicos, possibilitam calcular a ingestão de acordo com o padrão de crescimento da linhagem ao longo do tempo. Tradicionalmente, a avaliação da composição corporal é feita por abate comparativo que impossibilita o acesso rápido às informações e inviabiliza o estudo das variações das caraterísticas estudadas no decorrer do tempo no mesmo animal. Uma alternativa é a técnica de absorciometria por duplo feixe de raios-X (DXA) que permite avaliar in vivo a composição corporal das aves em tempo real sem a necessidade de sacrifica-la, conciliando interesses sociais e científicos. Com base nisso, objetivou-se neste trabalho descrever o potencial de crescimento do corpo e componentes corporais de poedeiras Dekalb e Lohmann (White e Brown) meio da função Gompertz, com a composição corporal tomado pela técnica DXA nas mesmas aves no decorrer do crescimento. Foram utilizadas 360 poedeiras das linhagens Lohmann e Dekalb distribuídas em delineamento inteiramente ao acaso, com quatro tratamentos (linhagens) e seis repetições com 15 aves. As aves foram alojadas em galpão experimental dotado de gaiola... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The efficacy of a nutritional program depends on knowledge about the bird's genetic potential for growth, since this is the rational way of calculating nutritional requirements and predicting food consumption. In this sense, the factorial models integrated the growth curves of birds assists in the establishment or evaluation of specific food programs. Because they are dynamic models, they make it possible to calculate the feed intake according to the growth pattern of the lineage over time. Traditionally the evaluation of the body composition is made by comparative slaughter, impossibility the quick access to the information and to study the variations of the characteristics studied in the course of time in the same animal. An alternative is the X-ray absorptiometry technique (DXA) that allows in vivo evaluation of the body composition of the birds without the need to sacrifice them reconciling social and scientific interests. Based on this, the objective of this work was to describe the growth potential of the body and body components of laying hens Dekalb and Lohmann (White and Brown) through of the Gompertz function, with the body composition taken by the DXA technique in the same birds during the growth. A total of 360 laying hens of the Lohmann and Dekalb strains were used in a completely randomized design, with four treatments (strains) and six replicates of 15 birds. The birds were housed in experimental shed with cages in pyramidal system and with automated temperatur... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

A família Ramphastidae é composta por aves conhecidas popularmente como tucanos e araçaris, endêmicas da região Neotropical. Possui cerca de 33 espécies, distribuídas tradicionalmente em seis gêneros. Neste trabalho, foi proposta uma hipótese filogenética para a família com base em caracteres siringeais. A siringe é o órgão responsável pelos sons vocais das aves e constitui-se de uma modificação do tubo respiratório, que inclui elementos esqueléticos cartilaginosos, membranas, músculos e nervos. Para tal, foram analisadas 18 espécies de cinco gêneros e codificados 46 caracteres siringeais, analisados segundo a metodologia cladística. Além do mais, foram incluídos simultaneamente nesta análise representantes da tradicional família Capitonidae, tidos na literatura como grupo-irmão de Ramphastidae. O resultado desta análise revelou três árvores igualmente parcimoniosas com 92 passos, índice de consistência igual a 0, 73 e índice de retenção igual a 0,88. O monofiletismo da família foi verificado e sustentado por sete sinapomorfias e aponta os Capitonidae neotropicais como parafiléticos. A topologia do cladograma obtida corrobora a inclusão de Baillonius bailloni em Pteroglossus, como proposto em estudos com base em dados moleculares. Com esta inclusão, todos os gêneros estudados são monofiléticos, sendo as relações encontradas entre eles a seguinte: Aulacorhynchus (Ramphastos (Pteroglossus + Selenidera), o que concorda em muitos aspectos com estudos prévios. A siringe também revelou a relação das espécies do gênero Pteroglossus, apesar do baixo índice de Bremer, no consenso estrito: (P. beauharnaesii, P. bitoquatus, P. azara (P. incriptus (P. viridis (P. bailloni (P aracari (P. pluricinctus, P. castanotis), sendo que a superespécie de P. aracari proposta por Haffer (1974) é a única corroborada como monofilética / The family Ramphastidae is represented by the commonly known toucans, toucanets and aracaris, and is endemic to the Neotropics. Around 33 species, distributed in six traditional genera, are recognized. In this research study, a phylogenetic hypothesis for representatives of this family based on syringeal characters was tested. The syrinx is the organ responsible for the vocal sounds of birds and consists of modifications of the respiratory tract, that include skeletal cartilaginous elements, membranes, muscles and nerves. Data from 19 species distributed in five genera were analysed and 46 syringeal characters were coded, based on Cladistic principles. The data matrix also included representatives of the traditional family Capitonidae, sister group of Ramphastidae. The results showed three equally parsimonious trees, with a length of 92, consistency index of 0.73 and retention index of 0.88. The monophyly of the family was confirmed and supported by seven synapomorphies, but the Neotropical barbets were indicated as paraphyletic. The topology of the cladogram corroborates the inclusion of Baillonius bailloni in the genus Pteroglossus, as proposed in previous molecular studies. With this inclusion, all genera are monoplyletic, with the following relationships: Aulacorhynchus (Ramphastos (Pteroglossus + Selenidera), which is partially congruent with previous studies. The syringeal data also clarified the relationships among the species of Pteroglossus, even though the Bremer index was low in strict consensus: (P. beauharnaesii, P. bitoquatus, P. azara (P. incriptus (P. viridis (P. bailloni (P. aracari (P. pluricinctus, P. castanotis). The superspecies P. aracari proposed by Haffer is the only one confirmed as a monophyletic group.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-11-08T18:17:47Z No. of bitstreams: 1 DIS_NATALIA_SIMONI_PORZIO_COMPLETO.pdf: 1305415 bytes, checksum: f2d6d598a934529f25f9812fea079cd2 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-11-08T18:18:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DIS_NATALIA_SIMONI_PORZIO_COMPLETO.pdf: 1305415 bytes, checksum: f2d6d598a934529f25f9812fea079cd2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-08T18:18:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_NATALIA_SIMONI_PORZIO_COMPLETO.pdf: 1305415 bytes, checksum: f2d6d598a934529f25f9812fea079cd2 (MD5) Previous issue date: 2017-03-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Acoustical signals are the main form in which birds communicate, and they are used to attract mates, defend territories, alarm others from predators and recognize each other, being than an important feature on speciation process. Then, song is extremely important, especially in Oscines, a group of birds that have a widely types of songs, singular for each species. Many studies have been shown that the vocal tract act as a constrict factor on song structure, besides body size. Beak gape, size and bite force are known as a limiting factors of note rate, frequency bandwidth and maximum/minimum frequencies, in which larger beaks produces narrow sounds with lower note rates. Our study had two objectives related of Oscine birds (of the genus Sporophila): the first one (chapter I) was to analyze the evolution of beak volume and song structure and verify the existence of song constriction and coevolution between them. The other objective (discussed in chapter II) was to test the relation between beak volumes and bite force with the song structure of three sympatric species of Sporophila, and try to infer how they organize their songs to avoid the acoustic overlap due their coexistence. In the chapter I we analyze territorial songs of 47 males from 11 species of Sporophila, representatives of Neotropical Oscines (Thraupidae). We found that frequency bandwidth and maximum frequency had a negative relation with beak volume, besides that, minimum frequency showed a trend for the same pattern. Beak volume, note rate and minimum frequency demonstrated to have a phylogenetic signal, which suggest that closely related species had beak morphology aand song structure more similar then lesser related species. Our results corroborate literature, in which beak volume acts as a limiter for song structure and also that this character can coevolve with birdsong. However, other variables did not present a constriction by the beak volume, what suggest that there is much to discover about this relation in songbirds yet. It is interesting to test the phylogenetic influence besides morphological characters, since this feature can be influencing song structure more than song constrainers. In chapter II, we selected S. beltoni, S. caerulescens and S. hypoxantha as a model of large, medium and small species respectively. These three species used to occur in the same habitat where they breed in northern of Rio Grande do Sul, Brazil. Adult that were observed and recorded were captured, had they beak measured and pass though bite force test. We found that S. beltoni and S. hypoxantha had more differences among song parameters, in which the first one presents the larger beak among the three species evaluated, and the second the smallest beak. The highest relation between strength/beak size and song was observed in S. caerulescens in which frequency bandwidth and minimum/maximum frequencies presented a positive relationship with bite force and beak size, showing that this feature do not limit song on this taxa against that other studies have shown. Concerning to the use of acoustical space, the greatest differences found were related with note rate and song duration. These factors should be some features used to avoid the song overlap on nature. In general terms our study shows that the limitation of sound per characters of the beak it is not a rule in Oscines, although there is a negative relationship between song variation and beak size when more species are add to the model. With these results we belive that it is important to know how changes in morphology of all vocal tract can affect song structure and how morphologic and acoustic features had evolved through their phylogenetic history, because understand this is essential to better comprise the speciation process among these groups. / A principal forma de comunica??o das aves ? por meio de sinais ac?sticos, ? atrav?s deles que elas atraem parceiros, defendem territ?rios e se reconhecem. Com isso, o canto ? extremamente importante no processo de especia??o, em particular nas aves Oscines, um grupo que tem amplos tipos de canto, singulares a cada esp?cie. Sabe-se que o trato vocal atua como modulador na estrutura do som; caracter?sticas do bico podem atuar como fatores limitantes influenciando a taxa de notas, largura de banda e frequ?ncias, no qual bicos maiores produzem sons com menor taxa de notas e com frequ?ncias mais restritas. O nosso trabalho teve dois objetivos relacionados a um grupo de aves Oscines (Sporophila), o primeiro (cap?tulo I) foi analisar a evolu??o do volume do bico e da estrutura do canto para verificar a exist?ncia de limita??es e coevolu??o entre os mesmos. No segundo (cap?tulo II) testamos a rela??o entre volume do bico e a capacidade de mordida com a estrutura do canto de tr?s esp?cies simp?tricas de Sporophila spp., al?m de verificar como estas aves organizam seus cantos para evitar a sobreposi??o deles no ambiente. No cap?tulo I analisamos cantos territoriais representando 11 esp?cies de Sporophila. Encontramos que a largura de banda e m?xima frequ?ncia tiveram rela??o negativa com o volume do bico; al?m disso, a frequ?ncia m?nima apresentou uma tend?ncia para o mesmo padr?o. O volume do bico, taxa de notas e frequ?ncia m?nima demonstraram ter sinal filogen?tico, sugerindo que esp?cies proximamente relacionadas apresentem essas vari?veis mais similares. Nossos resultados mostram que o volume do bico atua como limitador na estrutura do canto al?m de indicar que esse fator pode coevoluir com o canto destas aves, corroborando a literatura. Entretanto, a frequ?ncia dominante, taxa de notas e dura??o do canto n?o apresentaram limita??o pelo volume do bico, o que sugere que ainda existem muitas informa??es sobre o tema para serem descobertas. Assim ? interessante que se teste a influ?ncia filogen?tica, al?m dos caracteres morfol?gicos sobre as caracter?sticas do canto em aves Oscines. No segundo cap?tulo n?s selecionamos S. beltoni, S. caerulescens e S. hypoxantha como modelos de esp?cie grande, m?dia e pequena respectivamente. Estes tr?s t?xons costumam coexistir e se reproduzir nas mesmas ?reas no sul do Brasil e foram amostrados concomitantemente no nordeste do Rio Grande do Sul. Machos adultos foram observados e gravados e ap?s foram capturados, tiveram seus bicos medidos e passaram pelo teste de press?o de mordida em campo. N?s encontramos que S. beltoni e S. hypoxantha s?o as esp?cies que mais divergem em par?metros ac?sticos, sendo que a primeira apresenta bico mais volumoso dentre as tr?s esp?cies. A maior rela??o entre for?a/tamanho do bico e o canto foi observada em Sporophila caerulescens na qual a largura de banda e frequ?ncia m?xima/m?nima do canto apresentaram rela??o positiva com a for?a e o tamanho do bico, evidenciando que este car?ter n?o limita o som deste t?xon ao contr?rio do que outros estudos t?m mostrado. Referente ? ocupa??o do espa?o ac?stico, as maiores diferen?as encontradas foram relacionadas ?s vari?veis de tempo do canto e taxa de notas. Cogita-se que estes podem ser alguns dos fatores usados para evitar a sobreposi??o dos cantos na natureza. Em termos gerais nosso estudo mostra que a limita??o do canto por caracteres do bico n?o ? uma regra geral em Oscines embora exista uma rela??o negativa entre varia??es no canto e tamanho do bico quando mais esp?cies s?ao adicionadas ao modelo. Com esses resultados n?s acreditamos que ? interessante seguir pesquisando sobre os fatores ?limitadores do canto? j? que n?o existe um padr?o generalizado para aves canoras. ? importante conhecer como as mudan?as na morfologia de todo o trato vocal podem alterar a estrutura do som das aves e como caracteres morfol?gicos e ac?sticos evolu?ram atrav?s da sua hist?ria filogen?tica, j? que este entendimento ? essencial para melhor compreender o processo de especia??o destes grupos.

Submitted by Ana Damasceno (ana.damasceno@unipampa.edu.br) on 2017-04-24T18:19:17Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Pintura cromossômica multidirecional no genoma de synallaxis frontalis (passeriformes, furnariidae).pdf: 883991 bytes, checksum: 31114ee6ec5eb33e14eb5784908a20fc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T18:19:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Pintura cromossômica multidirecional no genoma de synallaxis frontalis (passeriformes, furnariidae).pdf: 883991 bytes, checksum: 31114ee6ec5eb33e14eb5784908a20fc (MD5) Previous issue date: 2017-03-24 / Durante o processo evolutivo os cariótipos das espécies se transformaram seguindo princípios nem sempre conhecidas, gerando uma imensa diversidade cromossômica. Sendo assim, o presente trabalho teve como objetivo compreender a evolução cariotípica de uma espécie da família Furnariidae, Synallaxis frontalis, popularmente conhecido como Petrim. A metodologia utilizada para alcançarmos nosso objetivo foi a citogenética clássica (coloração com giemsa e bandeamento C) e molecular (Hibridização in situ fluorescente) de sondas do gene ribossomal 18S e sondas cromossômicas de Gallus gallus (GGA) e Leucopternis albicollis (LAL). A coloração com giemsa permitiu inferirmos que a espécie estudada apresenta um típico cariótipo para os passeriformes, com 82 cromossomos, sendo a maioria deles microcromossomos. Entretanto observou-se a presença de heteromorfismos na morfologia do primeiro e terceiro pares autossômicos. O bandeamento C demonstrou que a heterocromatina constitutiva está localizada principalmente nas regiões centromérica/pericentromérica dos macrocromossomos e microcromossomos e, em praticamente todo o cromossomo sexual W. Os sítios ribossomais foram encontrados em um par de microcromossomos, assim como a maioria das espécies basais. A pintura cromossômica com sondas de GGA mostrou que os cromossomos ancestrais 1 e 2 estão fissionados, enquanto que a hibridização dos cromossomos correspondentes ao GGA 3-10 mostraram o mesmo padrão proposto para o suposto ancestral das aves. As hibridizações com sondas de LAL confirmaram os resultados obtidos com GGA e permitiram a identificação de vários rearranjos intracromossômicos no cromossomo 1 (GGA1q) e no cromossomo 3 (GGA2q). As inversões no cromossomo 1 de Synallaxis frontalis foram similares às inversões já descritas para passeriformes, entretanto, esta espécie apresentou uma inversão extra, responsável pelo heteromorfismo neste cromossomo. De forma similar, no cromossomo 3, a inversão encontrada também foi responsável pelo heteromorfismo. Essas informações são importantes para melhor compreender a organização genômica e evolução cromossômica das aves, especialmente para a subordem Suboscines. / During the evolutionary process the karyotypes of the species were transformed following system not always known, generating an immense chromosomic diversity. Thus the present work aimed to understand the karyotype evolution of a species of the Furnariidae family, Synallaxis frontalis, popularly known as Petrim. The methodology used to reach our aim was classical cytogenetics (giemsa and Cbanding) and molecular (fluorescence in situ hybridization) with 18S ribosomal gene probes and chromosome probes of Gallus gallus (GGA) and Leucopternis albicollis (LAL). The giemsa staining allowed us to infer that the species studied presented a typical karyotype for birds, with 82 chromosomes, most of them microchromosomes. However, the presence of heteromorphisms in the morphology of the first and third autosomal pairs was observed. C-banding demonstrated that constitutive heterochromatin is located primarily in the centromeric/pericentromeric regions of macrochromosomes and microchromosomes and in practically the entire size of the W chromosome. The ribosomal sites were found in a pair of microchromosomes, as in the most of the basal species. The chromosome painting with GGA probes showed that the ancestral chromosomes 1 and 2 are fissioned, whereas the hybridization of the chromosomes corresponding to the GGA 3-10 showed the same standard proposed for the supposed ancestor of the birds. Hybridizations with LAL probes confirmed the results obtained with GGA and allowed the identification of several intrachromosomal rearrangements on chromosome 1 (GGA1q) and chromosome 3 (GGA2q). The inversions on chromosome 1 of Synallaxis frontalis were similar to the inversions already described for Passeriformes, however, this species presented an extra inversion, responsible for the heteromorphism in this chromosome. Similarly, on chromosome 3, the inversion found was also responsible for heteromorphism. This information is important to better understand the genomic organization and chromosomal evolution of birds, particularly for Suboscine. / SUMÁRIO 1 INTRODUÇÃO ....................................................................................................... 13 1.2 Importância da citogenética em aves .......................................................... 14 1.2 Genes Ribossomais .................................................................................... 15 1.3 Pintura cromossômica em aves .................................................................. 16 1.4 Família Furnariidae ..................................................................................... 16 2 OBJETIVOS ........................................................................................................... 20 2.1 Objetivo geral .............................................................................................. 20 2.1 Objetivos específicos .................................................................................. 20 3 CAPÍTULO 1 - Multidirectional chromosome painting in the genome of Synallaxis frontalis (Passeriformes, Furnariidae) reveals high chromosomal reorganization, involving fissions and inversions ............................................................................... 21 3.1 Abstract ....................................................................................................... 22 3.2 INTRODUCTION ........................................................................................ 23 3.3 MATERIAL AND METHODS ....................................................................... 24 3.3.1 Samples and Chromosome Preparations ........................................ 24 3.3.2 Classical Cytogenetics .................................................................... 25 3.3.3 Fluorescent in situ hybridization ...................................................... 25 3.4 RESULTS ................................................................................................... 25 3.4.1 Classical Cytogenetics .................................................................... 25 3.4.2 FISH experiments ............................................................................ 26 3.5 DISCUSSION .............................................................................................. 32 4 CONCLUSÃO ......................................................................................................... 40 REFERÊNCIAS ......................................................................................................... 41

O gênero Aratinga Spix, 1824 tradicionalmente inclui 21 espécies de periquitos neotropicais que ocorrem desde o Centro até o extremo Sul da América, caracterizados por cauda comprida, pontiaguda e plumagem predominantemente verde. Vários autores têm questionado o monofiletismo do gênero primariamente com base nos resultados de estudos moleculares. Silveira et al. (2005) e Remsen et al. (2013) foram os primeiros a sugerir uma divisão do gênero baseada na análise de plumagem. No presente estudo apresentamos pela primeira vez uma revisão taxonômica completa e uma hipótese filogenética para o gênero Aratinga sensu Peters (1937) com base em caracteres osteológicos e de plumagem. Além disso, as hipóteses filogenéticas com base na morfologia foram comparadas com os resultados dos estudos moleculares. Após a revisão taxonômica, 37 taxóns, em contraste com as 21 espécies anteriormente reconhecidas, foram considerados espécies filogenéticas sem ambiguidade e usados como táxons terminais na análise filogenética. O gênero Aratinga sensu Peters (1937), com base na morfologia, foi dividido em quatro gêneros distintos, Aratinga, Eupsittula, Thectocercus e Psittacara. A análise com base em caracteres unicamente osteológicos não conseguiu recuperar as relações entre os quatro gêneros propostos após a revisão taxonômica, enquanto a análise com caracteres de plumagem resultou em uma resolução um pouco melhor, recuperando o monofiletismo de Eupsittula. Por fim, a combinação de conjuntos de dados melhorou a resolução, recuperando o monofiletismo de Thectocercus e Eupsittula e confirmando a relação próxima de C. carolinensis com o gênero Aratinga. No geral, tal como sugerido pela revisão taxonômica e por estudos moleculares, os caracteres morfológicos não suportam o monofiletismo do gênero. / The genus Aratinga Spix, 1824 traditionally includes 21 species of neotropical parakeets that range from Central to the extreme South of America, characterized by long, pointed tail and mostly green plumage. Several authors have questioned the monophyly of the genus mainly based on results of molecular studies. Silveira et al. (2005) and Remsen et al. (2013) first suggested a splitting of the genus based on plumage analysis. This study proposes, for the first time, a complete taxonomic revision and a phylogenetic hypothesis for the genus Aratinga based on osteological and plumage characters. Moreover, resulting phylogenetic hypotheses based on morphology were compared with molecular studies findings. Based on the analysis of morphology, 37 taxa, in opposition to the 21 traditionally recognized, could be unambiguously diagnosed and were used as terminal taxa in the phylogenetic analysis. The genus Aratinga sensu Peters (1937) was split into four distinct genera: Aratinga, Eupsittula, Thectocercus and Psittacara. Osteological characters alone failed to recover the relationships among the four genera proposed after the taxonomic revision, whereas plumage characters resulted in a slightly better resolution, recovering the monophyly of Eupsittula. Combining datasets improved resolution, recovering the monophyly of Thectocercus and Eupsittula, and confirming the close relationship of C. carolinensis with the genus Aratinga. Overall, as suggested by the taxonomic revision and molecular studies, morphological characters do not support the monophyly of the genus.