L’augmentation du coût du logement est un phénomène observé dans plusieurs villes canadiennes et Montréal n’en fait pas exception. À l’intérieur même de la métropole québécoise, cette croissance s’effectue à l’échelle de certains arrondissements comme celui de Rosemont-La Petite-Patrie. En effet, l’augmentation du coût du logement y est significative et amène les chercheurs à parler de gentrification résidentielle. Cette étude approfondit la réflexion de ce processus de transformation socioéconomique du quartier en intégrant l’aspect commercial de la gentrification. En effet, depuis plusieurs années le développement commercial de la Promenade Masson est orienté vers une offre de produits de meilleure qualité, plus raffinés et plus huppés. Par différentes initiatives, les commerçants vont même jusqu’à offrir une expérience d’achat au consommateur pour créer un lien affectif entre ce dernier et le commerce. C’est ce qui nous amène à considérer le paysage alimentaire comme espace dynamique et complexe qui rejoint la conception tripartite de l’espace de David Harvey. Ainsi, nous abordons le paysage alimentaire en considérant les dimensions absolue, relative et relationnelle de ce dernier. Suivant cette mise en contexte, nous nous questionnons sur le lien entre la gentrification commerciale et l’évolution du paysage alimentaire. Aussi, ce projet de recherche identifie 1) l’évolution sociale, démographique et économique du quartier entre 1996 et 2016; 2) l’évolution des commerces alimentaires de la Promenade Masson depuis les années 2000 et 3) la mobilisation du paysage alimentaire par les consommateurs. / The increase in the cost of housing is a phenomenon observed in several Canadian cities and Montreal is no exception. Even within the Quebec metropolis, this growth is taking place in certain boroughs such as Rosemont-La Petite-Patrie. Indeed, the increase in the cost of housing is significant and leads researchers to speak of residential gentrification. This study deepens the reflection of this process of socio-economic transformation of the district by integrating the commercial aspect of gentrification. Indeed, for several years now, the commercial development of Promenade Masson has been oriented towards offering better quality, more refined and more upscale products. Through various initiatives, merchants are even going so far as to offer a shopping experience to the consumer to create an emotional link between the consumer and the business. This is what leads us to consider the food landscape as a dynamic and complex space that is in keeping with David Harvey's tripartite conception of space. Thus, we approach the food landscape by considering its absolute, relative and relational dimensions. Following this contextualization, we question the link between commercial gentrification and the evolution of the food landscape. This research project also identifies 1) the social, demographic and economic evolution of the neighbourhood between 1996 and 2016; 2) the evolution of the food stores on Promenade Masson since the 2000s and 3) the mobilization of the food landscape by consumers.

ABSTRACTThe prevalence of diabetes is increasing dramatically, incurring a major health and socioeconomic burden. Type 2 diabetes (T2D), the most prevalent form of diabetes, results from a variable combination of insulin resistance and insulin deficiency, secondary to pancreatic β-cell failure. These defects are caused by a complex interplay between genetic and environmental/ lifestyle factors. Among the latter, poor dietary quality is a crucial driver of T2D development. Although adopting healthy dietary habits is considered as a mainstay for T2D prevention, what constitutes a healthy diet remains controversial. Epidemiological studies examining the association of dietary fat quality with T2D incidence have yielded equivocal results and may suffer from confounding. On the other hand, randomized trials assessing the impact of dietary fat saturation on glucose homeostasis have major methodological shortcomings, precluding reliable conclusions. In order to elucidate this question, we compared the effects of palm oil vs olive oil on glucose homeostasis and other relevant metabolic parameters, in a mouse model of high-fat diet-induced obesity. The saturated fatty acid-rich palm oil is the most abundantly used oil worldwide. Olive oil is a staple food of the Mediterranean diet, rich in monounsaturated fatty acids and widely regarded as healthful. In this model, palm oil was not more harmful than olive oil with regard to glucose/insulin homeostasis. However, palm oil was associated with increased visceral adiposity and triglyceridemia compared to olive oil. Circulating and tissue free fatty acid (FFA) concentration and composition are determined by dietary factors, as well as genetic and metabolic factors. There is accumulating evidence indicating that increased FFA levels and/or an unbalanced FFA composition with excess palmitate, induce β-cell dysfunction and apoptosis (lipotoxicity). To characterize the mechanisms underlying lipotoxicity, we combined RNA-sequencing with proteomics of β-cells exposed to palmitate, the most prevalent SFA in humans. This cross-omics study showed that palmitate altered lipid and amino-acid metabolism, and affected amplifying pathways of insulin secretion and exocytosis. Furthermore, palmitate induced stress pathways, including mitochondrial dysfunction, oxidative stress and endoplasmic reticulum (ER) stress. ER stress is triggered when protein folding demand exceeds ER folding capacity. This response aims to restore ER homeostasis but if unresolved, it can become deleterious. Islets from T2D patients display signs of ER stress, pointing to a potentially pathogenic role of the latter.Monogenic and neonatal diabetes are rare forms of diabetes caused by single gene mutations. These forms are of particular interest, as they can serve as ‘human knockout’ models of diabetes. Recent evidence shows that there is overlap in the genetic basis of monogenic diabetes and T2D, suggesting that they may be part of a pathologic continuum. To explore the role of ER stress in diabetes pathogenesis, we studied two different genetic syndromes involving neonatal or early-onset diabetes, caused by mutations in genes related to ER function (DNAJC3 and YIPF5). Using in vitro knockdown models, we showed that ER stress elicited by impaired chaperone function (DNAJC3) or by impaired ER-to-Golgi protein transport (YIFP5) causes β-cell apoptosis. Altogether, our findings support that lipotoxic and genetic ER stress contribute to diabetes pathogenesis. Preventing or modulating ER stress thus holds anti-diabetic therapeutic potential. Future research should focus on defining optimal strategies to restore a balanced FFA profile and enhance ER function, aiming to prevent ER-stress induced β-cell failure. RésuméLa prévalence du diabète progresse constamment, posant un défi sanitaire et socioéconomique majeur. Le diabète de type 2 (DT2), la forme la plus courante de diabète, résulte de la résistance à l’insuline, en association avec un déficit insulinique dû à la défaillance des cellules β pancréatiques. Ces anomalies découlent d’une interaction complexe entre des facteurs génétiques et des facteurs liés au mode de vie. Parmi ces derniers, la qualité du régime alimentaire est un facteur crucial pour le développement du DT2. Bien que le suivi d’un régime alimentaire sain est considéré comme le pilier pour la prévention du DT2, ce qui constitue un régime sain demeure un sujet de controverse.Les études épidémiologiques examinant l’association entre la qualité de la graisse alimentaire et l’incidence du DT2 ont donné des résultats équivoques, affectés éventuellement par des facteurs confondants. En outre, les études randomisées évaluant l’impact du degré de saturation de la graisse alimentaire sur l’homéostasie du glucose comportent des limitations méthodologiques majeures. Afin d’élucider cette question, on a comparé les effets de l’huile de palme aux effets de l’huile d’olive sur l’homéostasie du glucose et d’autres paramètres métaboliques pertinents. Dans ce but, on a utilisé un modèle murin d’obésité induite par un régime riche en graisse. L’huile de palme est riche en acides gras saturés et elle est l’huile la plus utilisée globalement. L’huile d’olive est un aliment phare du régime Méditerranéen, riche en acides gras monoinsaturés et généralement reconnu comme un aliment sain. Dans notre modèle murin, la consommation d’huile de palme n’était pas plus néfaste que celle de l’huile d’olive sur l’homéostasie du glucose, la sensibilité à l’insuline et l’insulinosécrétion. Par contre, l’huile de palme était associée à une adiposité viscérale et une triglycéridémie plus élevée comparée à l’huile d’olive.La concentration et la composition des acides gras libres (AGL) sont déterminées par des facteurs alimentaires, génétiques et métaboliques. Des données abondantes démontrent que la présence des niveaux élevés d’AGL et/ou d’une composition déséquilibrée d’AGL induit la dysfonction et l’apoptose des cellules β (lipotoxicité). Pour caractériser les mécanismes sous-jacents de la lipotoxicité, on a combiné un séquençage ARN à une étude protéomique des cellules β exposées au palmitate, l’AGL saturé le plus courant chez l’homme. Cette étude conjointe a montré que le palmitate altère le métabolisme des lipides et des acides aminés, les voies d’amplification de la sécrétion d’insuline et l’exocytose. Le palmitate induit également des voies de stress cellulaires, telles que la dysfonction mitochondriale, le stress oxydatif et le stress du réticulum endoplasmique (RE). Le stress du RE est activé quand les besoins en sécrétion protéique dépassent les capacités de l’organite. Cette réponse a pour but de rétablir l’homéostasie du RE mais si le stress reste non résolu, ceci peut s’avérer délétère. Des îlots des patients avec un DT2 montrent des signes de stress du RE, évoquant un rôle potentiellement pathogénique de ce dernier.Le diabète monogénique et néonatal sont des formes rares de diabète causées par des mutations d’un seul gène. Ces formes sont particulièrement intéressantes sur le plan physiopathologique car elles représentent des ‘knockout’ humains. Des données récentes montrent que la base génétique du diabète monogénique n’est pas complètement distincte de celle du diabète de type 2 et les deux entités pourraient faire partie d’un continuum. Afin d’explorer le rôle du stress du RE dans la pathogénèse du diabète, on a étudié deux syndromes génétiques entraînant un diabète néonatal ou à début très précoce. Ces syndromes sont causés par des mutations dans des gènes impliqués dans la fonction du RE (DNAJC3 et YIPF5). En silençant ces gènes in vitro, on a montré que le stress du RE, déclenché soit par une dysfonction des chaperones (DNAJC3), soit par un retard du trafic de protéines du RE vers le Golgi (YIPF5), induit l’apoptose des cellules β.Ces résultats suggèrent que le stress du RE génétique et lipotoxique contribuent à la pathogénèse du diabète. La prévention ou modulation du stress du RE présente donc un potentiel thérapeutique anti-diabétique. Des études futures pourraient permettre de définir des stratégies optimales pour rétablir un profil d’AGL équilibré ou renforcer la fonction du RE, en vue de prévenir la défaillance des cellules β. / Doctorat en Sciences médicales (Médecine) / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Les Systèmes Agroalimentaires Localisés représentent des formes d'organisation de productionet de consommation particulières. Ils se différencient des systèmes agro-industriels dans larelation singulière qui unit les hommes, les produits et le territoire, dans la valorisation deressources spécifiques et dans des modalités de coordination géographiquement et socialementsituées. Un nombre croissant d'initiatives cherchent à les mettre en œuvre au travers descircuits courts, des circuits de proximité ou des projets alimentaires territoriaux.Nos travaux proposent d'éclairer d'un regard sociologique les mécanismes de construction deces systèmes alimentaires à partir de l'étude fine d'expériences pionnières. Nous mobilisons lescadres d'analyse déployés par la sociologie de l'innovation et de l'acteur-réseau d'une part, etpar la sociologie des réseaux d'autre part. L'expérience de la coopérative agricole Fermes deFigeac témoigne des processus d'activation du lien entre l'agriculture, l'alimentation et leterritoire, et de valorisation des ressources spécifiques. Ils se matérialisent dans les réseauxsociotechniques qui portent les circuits alimentaires territorialisés. Inspirés du modèle de lacoopération agricole, les responsables de l'organisation soutiennent l'expérimentation d'unedémarche de gouvernance alimentaire afin de coordonner les stratégies individuelles dans desstratégies coopératives pour répondre aux enjeux collectifs de développement.Les analyses révèlent les processus de traduction, de transformation et de médiation quiinterviennent au sein des organisations et à leurs frontières. Ces opérations s'avèrentnécessaires aux constructions collectives et aux coordinations des acteurs (humains et objets,individus et collectifs). Nous montrons le rôle des positions intermédiaires dans l'articulationdes stratégies et les capacités d'adaptation et d'innovation. Nous rendons également compte dela diversité et la variabilité des formes relationnelles qui accompagnent ces dynamiques.Menés dans le cadre d'une recherche-action, nos travaux s'inscrivent dans la volonté de coproductionthéorique et empirique. D'un point de vue opérationnel, nous attirons l'attentionsur l'importance des médiations (animations, documents, échanges…) dans les processuscollectifs et coopératifs et de l'indétermination (imprévisibilité) des dynamiques de changement.Nous proposons de tenir compte des réseaux secondaires et d'identifier les acteursintermédiaires (au-delà des représentants formels) dans les analyses de gouvernance alimentaireterritoriale. / Local Agri-Food System (SYAL) represents a particular form of organization of production andconsumption. SYAL differs from agro-industrial system as it encompass the singular web ofrelationship which unit people, the qualification of products and territory through the valuationof specific resources and the types of coordination that are geographically and socially situated.An increasing number of initiatives try to implement them, through short food circuits,proximity supply chains or local food projects.Our work proposes an empirical journey and a sociological theorizing of the mechanismsthrough which a particular local agri-food system has been enhanced. We mobilize theframeworks of Actor-Network-Theory (ANT) on one hand and by the Social Network Analysis(SNA) on the other hand. We took the opportunity of an in depth study of an agriculturalcooperative named “Fermes of Figeac” to decipher processes of structuration of associationbetween farming practices, food provisioning, territorial human agency and valuation'sprocesses of the specific resources. Those associations are materialized in socio-technicalnetworks, which supported territorialized food supply chain. Inspired by the foundationalmodel of agricultural cooperation, the managerial core set of the organization has experimentedan approach of food provision governance in order to transform individual strategies in cooperativestrategies with the aim to answer sustainable challenge at the local level.Analyses based on ANT and SNA methodology assess translation's, transformation's andmediation's processes that intervene within organizations and on their borders. Going beyond afunctional analysis, we also analyze the collective construction and the coordination of humanagency and objects, at both individual and collective levels. We particularly shed light on therole of intermediation positions in strategic articulations and of the capacities of adaptation andinnovation. We also report the diversity and the variability of the relational forms that sustaindynamics of change.Released in an action-research approach, our work intends to articulate theoretical andempirical production. From an operational point of view, we draw attention to mediations(animations, documents, exchanges…) in the collective and co-operative processes and to theunpredictability of dynamics of change. This leads to take into account secondary networks andto identify intermediaries (beyond the formal core set of managers) in the analysis of territorialfood governance.

La grossesse est une période de la vie d’une femme qui s’accompagne d’une augmentation des besoins nutritionnels dont la satisfaction est nécessaire à la bonne santé de la mère et de l’enfant à naître. Durant cette période, les femmes seraient plus enclines à l’adoption de pratiques alimentaires plus saines. L’objectif de ce travail de thèse était d’étudier ces différents aspects de la nutrition pendant la grossesse puis d’élaborer et d’évaluer une méthode de conseils alimentaires personnalisés et pas-à-pas afin d’améliorer l’adéquation nutritionnelle des femmes enceintes en France. Un indice de qualité nutritionnelle de l’alimentation existant : le PANDiet, a été adapté à la période de la grossesse en tenant compte des références nutritionnelles spécifiquement définies pour cette période. Il a été montré qu’en l’absence de modifications qualitatives du régime en début de grossesse, l’adéquation nutritionnelle ne pouvait pas être maintenue. Trois types de conseils alimentaires personnalisés ont alors été élaborés et se sont révélés efficaces pour améliorer la qualité nutritionnelle de l’alimentation. Cependant, plus les conseils étaient efficaces moins ils étaient acceptables par les femmes enceintes. Un compromis a donc été trouvé pour sélectionner les deux types de conseils les plus acceptables par les femmes enceintes tout en étant efficaces pour améliorer la qualité nutritionnelle de leur alimentation. Ces deux types de conseils alimentaires personnalisés, fondés respectivement sur des modifications des quantités consommées d’aliments et sur des substitutions au sein du même sous-groupe d’aliments, ont été proposés à des femmes enceintes françaises lors d’un essai randomisé contrôlé. Par ailleurs, des données qualitatives, ont permis d’identifier que ces dernières étaient à la recherche d’informations positives et crédibles concernant l’alimentation pour contribuer au bien-être de leur bébé mais aussi au leur. Durant l’essai randomisé contrôlé, l’approche proposant des recommandations alimentaires génériques associées aux conseils alimentaires personnalisés, générés pas-à-pas par notre algorithme, s’est révélée plus efficace pour améliorer la qualité nutritionnelle de l’alimentation de femmes enceintes qu’une approche proposant uniquement les recommandations génériques. Par ailleurs, selon l’étude qualitative menée auprès de participantes à l’essai randomisé contrôlé il apparaît que proposer des conseils alimentaires pendant la grossesse permet de résoudre la cacophonie informationnelle. / Pregnancy is a specific period in life characterized by an increase in nutrient needs that should be met for the health of both the mother and her baby. During this period, women would be keener on adopting healthier dietary practices. The objective of this thesis was to study these different aspects of nutrition during pregnancy and to design and evaluate a tailored, stepwise dietary advice method which aims to improve the nutrient adequacy of the diet of French pregnant women. The PANDiet score, a diet quality index, has been adapted to pregnancy by using the nutrient requirements established for this period. It has been shown that the absence of qualitative changes in a woman’s diet in the beginning of pregnancy prevented the maintenance of the nutrient adequacy. Three types of tailored dietary changes were then designed. They proved to be efficient in improving the nutrient adequacy of the diet. The more efficient the type of dietary changes was, the less acceptable it was by pregnant women. Thus, a trade-off has been considered to select the two types of dietary changes that were the most acceptable by pregnant women while showing efficiency in the improvement of the nutrient adequacy of their diet. These two types of tailored dietary changes, which respectively involved modifications of the amount consumed of foods and substitutions of foods within the same food subgroup, have been proposed to French pregnant women during a randomized controlled trial. Furthermore, qualitative data revealed that pregnant women sought for positive and trustworthy information about nutrition-related in order to contribute towards the well-being of both their baby and themselves. In the randomized controlled trial, the approach proposing tailored dietary advice, generated in a stepwise process, in addition to generic dietary guidelines proved to be more efficient in improving the nutrient adequacy of the diet of pregnant women than the approach using only generic dietary guidelines. Furthermore, according to semi-directive interviews led with some women included in the randomized controlled trial, it appeared that dietary counseling during pregnancy resulted in solving the confusion related to nutrition issues.

La friture profonde de type batch a été étudiée dans le projet FUI Fry’In (Réf. AAP17, 2014-2018) dans le but de proposer des innovations de rupture pour des friteuses batch domestiques et professionnelles. La thèse a appuyé le projet sur la maîtrise de deux effets négatifs de la friture : i) la thermo-oxydation de l’huile responsable des mauvaises odeurs et produits de dégradation ainsi que ii) la prise d’huile généralement favorisée au détriment de son égouttage. L’étude a été réalisée en combinant des mesures directes (spectroscopie et imagerie infrarouges en mode ATR, photo-ionisation, mesures DSC, imagerie rapide…) et modélisation multi-échelle (écoulement de l’huile et égouttage lors du retrait, description lagrangienne des réactions en présence d’un écoulement, couplage avec les ciné-tiques de dissolution de l’oxygène). La complexité du processus de thermo-oxydation a été réduite en considérant les hydroperoxydes comme une forme de stockage organique de l’oxygène, qui propage l’oxydation dans des régions en anoxie. Leur décomposition produit de nombreux composés de scission, dont la nature est influencée par les conditions locales de température et de concentration en oxygène. La prise d’huile a été décrite comme le bilan net entre l’huile charriée au moment du retrait et l’huile égouttée. L’égouttage a été étudié sur des barreaux métalliques et des produits réels. Il se conduit à la formation de quatre à huit gouttes en quelques secondes. Les cinétiques de drainage anisothermes ont été prédites par un modèle mécanistique. Le mécanisme spécifique de prise d’huile en cours de friture a été aussi analysé ; il se produit uniquement dans le cas des produits préfrits congelés. / Batch deep-frying has been investigated within the collaborative project FUI Fry’In (ref. AAP17, 2014-2018) with the aim of proposing breakthrough innovations for small and medium size appliances. The PhD thesis was part of the project and focused on two specific adverse effects of deep-frying on food products: oil thermo-oxidation responsible for break-down products and off-flavors, and oil pickup process usually favored relatively to oil dripping. The work was carried out by combing direct measurements (FTIR-ATR spectroscopy and imaging, photoionization, DSC measurements, fast imaging…) and multiscale modeling (oil flow and oil dripping during product re-moval, Lagrangian description of reactions in aniso-thermal flows, coupling with oxygen dissolution kinetics). The complex problem of thermo-oxidation was split into simpler mechanisms by noticing that hydroperoxides are a kind of long-lived form of or-ganic oxygen, which trigger propagation in deep re-gions under anoxia. Their decomposition lead to various scission products, which were shown to be in-fluenced by both local temperature and oxygen con-centration. Oil uptake was described as the net balance between the amount of dragged oil during product removal and oil dripping at the tips of the product. The dripping process studied on both metal-lic sticks and real products occurs in less than few seconds and leads to a formation of four to eight drop-lets. The detailed drainage kinetics in anisothermal conditions were captured and predicted with the pro-posed mechanistic models. The specific mechanism of oil uptake during the immersion stage was eluci-dated and was shown to occur only in parfried frozen products.

En raison de leurs excellentes propriétés, les polyoléfines telles que le polypropylène et le polyéthylène sont largement utilisées dans des applications d'emballage alimentaire. Cependant, tout au long de leur cycle de vie ou de la première utilisation, les polyoléfines peuvent être exposées à des milieux contaminés qui limitent leur recyclabilité en contact alimentaire. Par conséquence, le recyclage de polyoléfines au contact alimentaire nécessite des niveaux de décontamination rigoureux et donc une technologie de décontamination avancée. L’objectif de ce travail consiste dans un premier temps à étudier la faisabilité et la potentialité de l’extraction par CO2 supercritique en mode batch pour la purification de polyoléfines (extraction d’additifs et de contaminants modèles). On s’est plus particulièrement attaché à étudier l’effet des paramètres du procédé sur la cinétique de l’extraction ainsi que l’influence de l’extraction supercritique sur les comportements rhéologique et thermique des matériaux purifiés. Dans un deuxième temps, on s’est intéressé au développement d’un nouveau procédé continu d’extraction par couplage de l’extraction supercritique et l’extrusion bi-vis. Les résultats les plus importants ont montré la potentialité de l’extraction par CO2 supercritique en mode batch pour la purification de polyoléfines sans influencer significativement les propriétés de la matrice / Due to their excellent properties, polyolefins such as polypropylene and polyethylene are widely used in food packaging applications to preserve and protect foodstuffs. However, throughout their lifecycle or first use, polyolefins can be exposed to contaminated media which limit their recyclability in food contact applications. Therefore, the recycling of polyolefins into direct food contact applications requires rigorous decontamination levels and thus effective and advanced recycling technology. The objective of this work is, at first hand, to study the feasibility and the potential of supercritical CO2 extraction in batch process for the purification of polyolefins (extraction of additives and model contaminants). In the whole, we investigated the effects of process parameters and contaminant structure on the extraction kinetic, and the influence of the supercritical CO2 extraction on the rheological and thermal behaviors of the purified materials. On the other hand, we aimed at the development of a novel continuous extraction process by coupling supercritical extraction technique and twin-screw extrusion. The most significant results showed the potential of supercritical CO2 extraction in batch mode for the purification of polyolefins without influence significantly the matrix properties

Le système circadien muti-oscillant est constitué de l'horloge suprachiasmatique (SCN), l'horloge principale dans l'hypothalamus antérieur, et de nombreuses horloges périphériques. L'horloge SCN synchronise les horloges périphériques situées dans chaque organe. L'horloge SCN est une horloge circadienne auto-entretenue qui maintient les rythmes quotidiens comportementaux, physiologiques et neuroendocriniens. Les donneurs de temps (zeitgebers), tels que lumière et nourriture, sont des synchroniseurs puissants, respectivement pour le SCN et les horloges périphériques. La thèse visait à mieux comprendre les interactions entre les horloges circadiennes et le comportement alimentaire chez les espèces nocturnes. Nous avons montré dans la première et la seconde partie que l'alimentation ultradienne affecte les horloges centrales et périphériques chez la souris et le rat. Dans la première étude, nous avons conclu que l'alimentation ultradienne chez la souris a un impact majeur sur la sortie de l'horloge SCN et sur l'horloge périphérique dans le foie, tandis que dans la seconde étude, l'alimentation ultradienne chez le rat n'a eu pas d'impact sur l'horloge SCN, mais il a modifié les horloges périphériques et le métabolisme des lipides. Dans la troisième partie, nous avons montré des effets différentiels du régime alimentaire et de la restriction alimentaire temporelle sur les horloges périphériques du tissu adipeux brun et du muscle squelettique. Dans la quatrième partie, nous avons démontré un rôle du gène d'horloge Rev-erbα dans le comportement alimentaire et le métabolisme énergétique en comparant des souris porteuses d’une délétion de Rev-erbα, soit globale, soit limitée au système nerveux central. L’ensemble de ces études révèle l'interdépendance des horloges circadiennes et du comportement alimentaire, ainsi que leurs effets sur le métabolisme énergétique. / The muti-oscillatory circadian system consists of the suprachiasmatic clock (SCN) the master clock, located above the optic chiasm of the anterior hypothalamus, and many peripheral clocks. The SCN clock synchronizes the other peripheral oscillators located in each organ. The SCN clock is a self-sustaining circadian oscillator maintaining the daily behavioural, physiological, and neuroendocrine rhythms. The zeitgebers such as light and food are potent synchronizers for the SCN and other peripheral clocks. The thesis was aimed to understand different aspects of the interactions between circadian clocks and feeding behaviour in nocturnal species. We showed in the first and second parts that the ultradian feeding affects the central and peripheral clocks in mice and rats. In the first part, we concluded that the ultradian feeding in mice has major impacts on the SCN clock output and the peripheral clock in the liver, while in the second part ultradian feeding in rats does not have impact on the SCN clock but it affects peripheral clocks and lipid metabolism. In the third part, we showed the differential effects of diet and time restricted feeding in brown adipose tissue and skeletal muscle peripheral clocks. In the fourth part, we showed the role of clock gene Rev-erbα on feeding behaviour and energy metabolism by comparing between global and brain specific knock-out mice. The present studies reveal the interdependency of the circadian clocks and feeding behaviour, and their effects on whole-body metabolism.

Déterminer le régime alimentaire des gastéropodes terrestres est important étant donné leurs impacts écologiques et économiques. L’observation en nature est difficile, car les gastéropodes sont principalement actifs la nuit et sont de petite taille. De plus, l’analyse visuelle des contenus digestifs est compliquée car les gastéropodes broient leurs aliments, ne permettant pas une identification précise. L’objectif est de produire une méthode fiable et peu onéreuse pour déterminer le régime alimentaire des gastéropodes en milieu naturel. Le modèle, Arion fuscus, a été échantillonné au printemps dans quatre érablières anciennes du sud du Québec (Canada). Une approche basée sur l’ADN a été utilisée avec amplification par PCR d’un segment d’un gène chloroplastique. La diversité a été déterminée par électrophorèse sur gel non-dénaturant suivie d’un séquençage des variants d’intérêts pour identifier les plantes consommées. Pour les 52 limaces analysées, les PCR ont fonctionné avec succès et les extractions d’ADN de mêmes individus traités indépendamment ont montré les mêmes résultats sur les gels SSCP. Des résultats fiables ont été produits en quelques semaines et le nombre d’échantillons à séquencer a été limité, réduisant ainsi les coûts. Les résultats montrent une faible diversité végétale consommée (6 haplotypes) par A. fuscus; 78,8% des limaces ont uniquement consommé la même espèce de plante. Cette méthode peut permettre de meilleurs suivis des espèces consommées par les gastéropodes dans un contexte d’écologie de la conservation ou de contrôle des espèces nuisibles. / The diet of terrestrial gastropods is difficult to assess in nature because of their often-nocturnal activity and their small size. Moreover, visual analyzes of digestive contents are problematic because gastropods grind food into small particles, making visual identification unexploitable. Determining the gastropods ‘diet is nevertheless highly relevant because gastropods may have strong ecological and economic impacts. On the one hand, several species are listed endangered or critically endangered. On the opposite, numerous species are considered agricultural pests. The objective is to produce an accurate and inexpensive method to determine the diet of gastropods. More specifically, by using an approach based on PCR-amplified DNA followed by SSCP gels, it was possible to determine taxa diversity before Sanger sequencing, and thus reduce costs. We used Arion fuscus from four old maple forests sites in southern Quebec (Canada) as model to test the method. The 52 individuals’ digestive contents analyzed resulted in a successful PCR amplification and independent DNA extractions from a given individual gave the same SSCP pattern. This method produced reliable results in a few weeks and at a low cost, making it possible to sequence only a few samples to know the plant species consumed by all individuals in the study. Results revealed a low diversity of plants consumed (6 haplotypes). 78.8% of the slugs harvested in spring consumed one and the same species of plant. This method enables the monitoring of plant species consumed by gastropods in conservation and agricultural pest control.

Contexte. La mise en place d’environnements favorables à une saine alimentation est indispensable pour assurer la santé de la population, puisque celle-ci est considérée comme étant un déterminant de la santé. De ce fait, une corrélation existe entre les habitudes alimentaires, le diabète de type II et la santé cardiovasculaire. Durant de nombreuses années, les facteurs prédisposant au diabète étaient considérés essentiellement comme des choix individuels. Un nombre croissant de recherches démontrent présentement un lien entre les facteurs environnementaux, y compris l’accessibilité géographique à des choix alimentaires sains, et le diabète. Objectif. Cette étude vise à évaluer le lien entre l’environnement alimentaire et le risque de diabète de type II pour les résidents adultes de 6 régions métropolitaines du Québec. Méthodes. Un devis quantitatif comprenant des analyses transversales est utilisé. L’unité d’analyse est l’individu. Un corpus dérivé de la banque de données CARTaGENE est exploité. Pour répondre à l’objectif, un sous-échantillon composé de 8405 adultes habitant les six grandes régions métropolitaines du Québec de la cohorte CARTAGENE est utilisé. Les participants de cet échantillon ont été interrogés sur des sujets liés à leur santé et habitudes de vie. L'exposition aux commerces d’alimentation a été opérationnalisée à partir de zones tampons de 1000 mètres autour des adresses résidentielles et par des calculs de densité et de distance en utilisant les réseaux routiers. Cinq indicateurs de densité ont été calculés : densité des épiceries et des supermarchés, densité des dépanneurs, densité des restaurants-minute, nombre des dépanneurs, et ratio de restaurants-minute et dépanneurs aux supermarchés et épiceries. Trois mesures de proximité ont été calculées : distance au plus proche supermarché ou épicerie, distance au plus proche dépanneur, et distance au plus proche restaurant-minute. Des analyses de régression logistique ont été effectuées pour évaluer les associations entre ces indicateurs et le diabète de type II autodéclaré, en tenant compte des facteurs de confusion potentiels. Résultats. Nos résultats montrent l’absence de relations statistiquement significatives entre la proximité des points de vente d’aliments, les dépanneurs les plus proches et les détaillants de restauration rapide les plus proches (premiers quartiles dans chaque catégorie), et le statut individuel de diabète de type II. En revanche, l’indice de défavorisation matérielle d’un quartier était positivement et significativement associé au risque de diabète de type II. De plus, le fait de résider dans un « désert alimentaire » était le seul indicateur de l’accès géographique qui était statistiquement et significativement associé positivement au risque de diabète de type II, à la fois dans les modèles univariés (RC = 1,42 ; IC à 95 % : 1,05, 1,90) et multivariés (RC = 1,56 ; IC à 95 % : 1,12, 2,18). Conclusion. Nos résultats n’ont montré aucune relation significative entre le statut individuel de diabète de type II et la plupart des facteurs de l’environnement alimentaire. La littérature existante a montré une association significative des indicateurs socio-économiques individuels et d’un quartier avec le risque de maladie cardiométabolique, une relation que nous avons également observée dans notre étude, en ce qui concerne le type individuel de risque de diabète de type II. En outre, le fait de résider dans un « désert alimentaire » augmentait considérablement le risque individuel de diabète de type II. Nos résultats suggèrent que les mesures de santé publique pour freiner le diabète de type II devraient simultanément aborder les facteurs de risque individuels ainsi que les aspects pertinents de l’environnement alimentaire et les indicateurs socioéconomiques du quartier. / Context. Recent studies have explored the link between the accessibility to healthy food choices and population health. Specifically, there is a demonstrated association between nutritional habits and cardiovascular/metabolic disease, especially type II diabetes. Inasmuch as a significant corpus of knowledge has focused on individual factors and diabetes risk, emerging studies demonstrate that the food environment, including geographic accessibility to whole and healthy foods, potentially has an impact on individual and population type II diabetes risk. This study draws on data from CARTaGENE, a large cross-sectional province-wide study with 43,000 participants. Objective. This study aims to evaluate the association between the food environment and type II diabetes risk among adult residents across 6 metropolitan regions of Quebec. Methods. A quantitative research design is employed, whereby cross-sectional analyses are performed. The unit of analysis is the individual. A subsample of 8405 adults living in the six major metropolitan areas of Quebec of the CARTAGENE cohort was used. Participants in this sample answered questionnaires related to their health and lifestyle habits. Exposures to food environments were operationalized using 1000-meter buffer zones around residential addresses and by distance calculations using road networks. Five density indicators were calculated: density of grocery stores and supermarkets, density of convenience stores, density of fast-food restaurants, numbers of convenience stores, and ratio of fast-food restaurants and convenience stores to supermarkets and grocery stores. Three proximity measures were calculated: distance to the nearest supermarket or grocery store, distance to the nearest convenience store and distance to the nearest fast-food restaurants. Logistic regression analyses were performed to assess associations between these indicators and self-reported type II diabetes, considering potential confounders. Results. Our results showed an absence of statistically significant relationships between proximity to food outlets, closest convenient stores, and closest fast-food restaurants (first quartiles in each category), and individual type II diabetes status. In contrast, the material deprivation index of a neighborhood was positively and significantly associated with type II diabetes risk. Furthermore, residing in a “food desert” was the only indicator of geographical access that was statistically significantly positively associated with type II diabetes risk, in both univariate (OR = 1,42 ; 95 % CI : 1,05, 1,90) and multivariate (OR = 1,56 ; 95 % CI : 1,12, 2,18) models. Conclusion. Our results showed no significant relationship between individual type II diabetes status and most food environment factors. Existent literature has shown significant association of individual and neighborhood socioeconomic indicators with cardiometabolic disease risk, a relationship we also observed in our study, insofar as individual type II diabetes risk is concerned. Furthermore, residing in a ‘food desert’ significantly increased individual type II diabetes risk. Our results suggest that public health measures to curb type II diabetes should concomitantly address individual risk factors as well pertinent aspects of the food environment, along with neighborhood socioeconomic indicators.

Les systèmes de recommandation typiques tentent d'imiter les comportements passés des utilisateurs pour faire des recommandations futures. Par exemple, dans le domaine des recommandations alimentaires, ces algorithmes de recommandation apprennent généralement d'abord l'historique de consommation de l'utilisateur, puis recommandent les aliments que l'utilisateur préfère. Bien qu'il existe de nombreux systèmes de recommandation d'aliments proposés dans la littérature, la plupart d'entre eux sont généralement des applications directes des algorithmes de recommandation génériques sur des ensembles de données alimentaires. Nous pensons que pour le problème de la recommandation alimentaire, les connaissances spécifiques au domaine joueraient un rôle vital dans la réussite d'un recommandeur alimentaire. Cependant, la plupart des modèles existants n'intègrent pas ces connaissances. Pour résoudre ce problème, dans cet article, nous intégrons des facteurs liés à la santé (tels que l'IMC des utilisateurs, les changements de poids sous-jacents, les calories des aliments candidats et les variétés d'aliments) dans des modèles de recommandations alimentaires séquentielles pour les utilisateurs qui souhaitent mieux gérer leur alimentation et poids. Les changements de poids sous-jacents des utilisateurs sont également traités comme leurs objectifs ou leurs intentions (perdre, maintenir ou prendre du poids). Le modèle proposé devrait adapter en douceur le flux d'articles recommandé vers l'objectif des utilisateurs en tenant compte des préférences de consommation et des facteurs de santé antérieurs de l'utilisateur. Pour étudier les meilleures stratégies pour incorporer des facteurs de santé spécifiques à un domaine dans les recommandations alimentaires, dans cette étude, nous proposons deux approches de modélisation: la recommandation du prochain article et la recommandation du prochain panier. Ces deux méthodes prennent la séquence passée d'aliments (noms d'aliments et calories) consommés par un utilisateur comme entrée et produisent une liste classée d'aliments pour le prochain aliment (Next-item) ou le lendemain (Next-basket). En outre, les recommandations de base sont améliorées sur la base des approches de pointe de chaque approche de modélisation, qui sont respectivement GRU4Rec~\cite{GRU4Rec} et LSTM hiérarchique. Pour étudier l'impact des facteurs de santé et ajuster le modèle vers un objectif, nous construisons des sous-modèles spécifiques pour chaque groupe d'utilisateurs en fonction de l'IMC et de l'intention. À savoir, les utilisateurs sont regroupés en obèses, en surpoids, normaux, sous-pondérés selon l'IMC. Leurs données (par semaines) sont segmentées en semaines de perte/gain/maintien de poids en fonction du changement de poids au cours de la semaine. Cette dernière segmentation vise à saisir les habitudes de consommation alimentaire liées au poids, qui est traité comme l'intention sous-jacente de l'utilisateur. Un modèle général formé sur l'ensemble des données historiques mixtes devrait capturer les habitudes générales de consommation alimentaire de tous les utilisateurs, tandis qu'un sous-modèle formé sur l'ensemble spécifique de données pour l'IMC et l'intention capture celles des groupes ou semaines correspondants. Pour un utilisateur au sein d'un groupe d'IMC et avec l'intention de changer de poids, nous appliquons le sous-modèle spécifique, combiné avec le modèle général, pour la recommandation alimentaire. Nos modèles sont formés sur une grande quantité de données de comportement alimentaire d'utilisateurs réels à partir d'une application de gestion du poids, où nous pouvons observer la consommation alimentaire quotidienne et le poids corporel de plusieurs utilisateurs. Lorsque nous combinons le modèle complet général avec les modèles spécifiques à l'IMC et spécifiques à l'intention avec un coefficient approprié, nous observons des améliorations significatives par rapport aux performances du modèle général basé à la fois sur la recommandation de l'article suivant et sur la recommandation du panier suivant. De plus, les sous-modèles spécifiques à l'IMC et spécifiques à l'intention se sont avérés utiles, ce qui donne de meilleurs résultats que le modèle complet général, tandis que les sous-modèles spécifiques à l'IMC ont plus d'impact que le modèle spécifique à l'intention. En pratique, pour un utilisateur qui a l'intention de perdre du poids, le système peut appliquer le modèle de résultat Perte de poids (avec l'IMC correspondant) à l'utilisateur. Cela tend à ajuster en douceur le modèle général de recommandation vers cet objectif. En outre, le niveau d'ajustement pourrait être contrôlé par le coefficient de combinaison de modèles. En d'autres termes, avec un coefficient plus élevé, le sous-modèle spécifique aura un impact plus important sur la prédiction du classement final des aliments, ce qui implique que le système donnera la priorité à la réalisation de l'objectif de l'utilisateur plutôt qu'à l'imitation de ses habitudes alimentaires précédentes. Cette stratégie est plus efficace que de toujours recommander certains types d'aliments hypocaloriques, qui ne sont pas appréciés par l'utilisateur. L'intention est alignée sur le résultat de poids réel au lieu de l'intention indiquée par l'utilisateur. Ce dernier s'avère beaucoup moins performant dans nos expérimentations. / Typical recommender systems try to mimic the past behaviors of users to make future recommendations. For example, in the food recommendation domain, those recommenders typically first learn the user’s previous consumption history and then recommend the foods the user prefers. Although there are lots of food recommender systems proposed in the literature, most of them are usually some direct applications of generic recommendation algorithms on food datasets. We argue that for the food recommendation problem, domain-specific knowledge would play a vital role in a successful food recommender. However, most existing models fail to incorporate such knowledge. To address this issue, in this paper, we incorporate health-related factors (such as users’ BMI, underlying weight changes, calories of the candidate food items, and food varieties) in sequential food recommendation models for users who want to better manage their body weight. The users' underlying weight changes are also as treated as their goals or intents (either losing, maintaining, or gaining weight). The proposed model is expected to smoothly adapt the recommended item stream toward the users’ goal by considering the user’s previous consumption preferences and health factors. To investigate the best strategies to incorporate domain-specific health factors into food recommenders, in this study, we propose two modeling approaches: Next-item Recommendation and Next-basket Recommendation. These two methods take the past sequence of foods (food names and calories) consumed by a user as the input and produce a ranked list of foods for the next one (Next-item) or the next day (Next-basket). Besides, the basic recommendations are improved based on the state-of-the-art approaches of each modeling approach, which are GRU4Rec~\cite{GRU4Rec} and hierarchical LSTM, respectively. To investigate the impact of health factors and tune the model toward a goal, we build specific sub-models for each group of users according to BMI and intent. Namely, users are grouped into Obese, Overweighted, Normal, Underweighted according to BMI. Their data (by weeks) are segmented into weight losing/gaining/maintaining weeks according to the weight change during the week. This latter segmentation aims to capture food consumption patterns related to weight outcome, which is treated as the user's underlying intent. A general model trained on the whole mixed historical data is expected to capture the general food consumption patterns of all the users, while a sub-model trained on the specific set of data for BMI and intent captures those of the corresponding groups or weeks. For a user within a BMI group and with the intent of weight change, we apply the specific sub-model, combined with the general model, for food recommendation. Our models are trained on a large amount of eating behavior data of real users from a weight management app, where we can observe the daily food consumption and the body weight of many users. When we combine the general full-model with the BMI-specific and intent-specific models with appropriate coefficient, we observe significant improvements compared with the performance of the general model based on both Next-item Recommendation and Next-basket Recommendation. Furthermore, both BMI-specific and intent-specific sub-models have been proved useful, which achieves better results than the general full-model, while BMI-specific sub-models are more impactful than the intent-specific model. In practice, for a user who intends to lose weight, the system can apply the Losing-weight outcome model (with the corresponding BMI) to the user. This tends to smoothly adjust the general recommendation model toward this goal. Besides, the adjustment level could be controlled by the coefficient of model combination. In other words, with a larger coefficient, the specific sub-model will have a greater impact on predicting the final food ranking list, implying that the system will prioritize achieving the user's goal over mimicking their previous eating habits. This strategy is more effective than always recommending some types of low-calorie foods, which are not liked by the user. The intent is aligned with the actual weight outcome instead of the indicated intention by the user. This latter turns out to be much less successful in our experiments.